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Por la acuaporina solo pasa agua neutra (H2O), pero no agua protonada (H3O+). Si no fuera así, el pH de la célula cambiaría sin control. Para impedir el paso de agua protonada o de otros cationes, el canal de la acuaporina posee cargas positivas en su parte central que repelen a la carga positiva del H3O+ impidiendo su entrada. Hoy se conocen unas 200 acuaporinas distintas pertenecientes a tejidos de mamíferos, invertebrados, microorganismos y plantas Acuaporinas