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Doctorado en Ciencia Animal Tesis Caracterización fenotípica y genotípica de cepas de Campylobacter fetus aisladas de rodeos bovinos Por: María Laura Chiapparrone Facultad de Ciencias Veterinarias U.N.C.P.B.A. 2018 Doctorado en Ciencia Animal Tesis Caracterización fenotípica y genotípica de cepas de Campylobacter fetus aisladas de rodeos bovinos Por: María Laura Chiapparrone Director: Dra. María del Carmen Catena Co directores: Dr. Pedro Soto, M. Sc. Fernando Paolicchi Facultad de Ciencias Veterinarias U.N.C.P.B.A. Miembros del Jurado Dr. Heriberto Fernández Jaramillo Dra. Marta Mollerach Dedicatoria A mis padres Agradecimientos “... Y siempre supe que apenas una carilla jamás me alcanzaría para agradecer todo lo vivido a tantas personas que estuvieron y que están a mi lado. Más allá de que me olvidaría de tantas personas y de tantas cosas... De las ayudas, de los consejos, de los hechos, de las palabras, de las presencias, de las compañías, de las ausencias, de las esperas, de los apuros, de los entendimientos, de las conversaciones, de las experiencias transmitidas, vividas, compartidas, aprendidas, ganadas y perdidas... Y de tantos momentos, de tantos segundos, minutos, horas, días, meses y años que me hicieron crecer no sólo como profesional sino también como persona. En los distintos lugares con su gente: en Tandil, en Balcarce, en Buenos Aires, en Mar del Plata... Cada lugar al que fui, con toda persona que compartí. Ojalá todos y cada uno de ustedes pudieran ver reflejado el andar de su camino en una parte de la vida como yo lo hago en este momento... ¿Y qué me queda de todos los momentos, los lugares y las personas? Lo mejor... Ojalá todos y cada uno de ustedes puedan vivir de los que les gusta, de su pasión, de aquello que los hace feliz... Ojalá todos y cada uno de ustedes tengan al lado personas como las que yo tengo... De esas que te saludan con un beso, un abrazo y una sonrisa cuando llegas cada mañana a tu trabajo, cuando salís al pasillo... De esas que se alegran de verte... De esas que te abren la puerta con una sonrisa y la mejor predisposición cuando te acercas con una inquietud, con un pedido, con un problema... De esas que te transmiten su experiencia sin pedir nada a cambio... De esas que confían en vos... De esas que te hacen dudar... De esas que te hacen pensar... De esas que te hacen sentir... De esas que te muestran otra parte de la vida... De esas que por fortuna tengo en mi vida y que son tantas que no quiero nombrarlas porque no me perdonaría olvidarme de una de ellas. Pero siempre comenzamos a vivir estas experiencias por grandes personas que nos empujan, nos sostienen y de ellas sé que no me olvidaría... Mi agradecimiento a María por su recibimiento, oportunidad, paciencia, entendimiento, tolerancia y por seguir a pesar de todos y todo... A Pedro por su gran sabiduría, experiencia, contención, presencia y ejemplo... A Fer por su oportunidad, presencia, flexibilidad, entendimiento y por su “modo tan divertido y particular de ver las cosas”... A Gina por su eterna, inolvidable y entrañable presencia, compañía, contención, sabiduría y conocimiento... A Juli, Clau y Caro por entender tantas ausencias, por enseñarme a compartir de manera tan feliz cada uno de nuestros días... A Clau, Ale y todos los que formaron y forman parte del laboratorio por compartir tantos días... A Peter por su humor, humildad, compañía y gran amistad... A Edgardo por su gran dedicación, paciencia y compromiso... A Mario, Mati y todos los que colaboraron a campo... A Agus por su ayuda con “mirada molecular”... A Clau Morsella por su capacidad de trabajo, responsabilidad y predisposición... A Ale Velilla por tanto esfuerzo conjunto... A Fabi por su ayuda, paciencia y persistencia... A Ine por su atención siempre tan dedicada, responsable y su gran amistad... A los evaluadores por sus devoluciones tan dedicadas y detalladas. A Belén por acompañarme y ayudarme con su enorme amistad de tantos años... A todos gracias por cada momento compartido... A mi gran familia de sangre y de corazón a la cual está dedicado cada uno de los logros de mi vida porque siempre están incondicionalmente, me sostienen, me acompañan... A mis amigos, los de ayer y los de hoy. A todas y cada una de las personas que estuvieron, están y estarán... Y a mí... Siempre me voy a agradecer a mí misma permitirme vivir esta experiencia y crecer junto con ella, comienzo de tantas experiencias más...” GRACIAS RESUMEN Campylobacter fetus subsp. venerealis y Campylobacter fetus subsp. fetus son agentes causales de la campylobacteriosis genital bovina (CGB), una de las enfermedades reproductivas más importantes en los rodeos bovinos de Argentina. Hasta la actualidad, se han realizado escasos estudios sobre el comportamiento de ambas subespecies de C. fetus en los rodeos bovinos. Lo antedicho, probablemente se deba a que el diagnóstico de rutina de la CGB se realiza por inmunofluorescencia directa (IFD) a partir de muestras de esmegma prepucial por su rapidez, bajo costo, sensibilidad y especificidad, pero sin la identificación microbiológica de las cepas. Además, los conjugados que se emplean en esta técnica, no diferencian entre C. fetus subsp. fetus y C. fetus subsp. venerealis. Por lo tanto, se carece de información sobre la presencia de ambas subespecies a nivel regional. El cultivo microbiológico sigue siendo la técnica de referencia, sin embargo la alta contaminación de algunas muestras clínicas, sumado al costo de un equipamiento adecuado y el tiempo que requiere el cultivo y la posterior caracterización por pruebas bioquímicas, determinan que el diagnóstico microbiológico no se realice en forma rutinaria. En las últimas décadas se han desarrollado y puesto a punto técnicas de biología molecular para optimizar la identificación y la caracterización de C. fetus. La aplicación de nuevas técnicas permitirá complementar los resultados obtenidos por las pruebas tradicionales, caracterizar los perfiles fenotípicos y genotípicos de las cepas, determinar su influencia en la patogenia de la enfermedad, el grado de homología entre ellas y finalmente, contribuir con estudios epidemiológicos que analicen el comportamiento de las cepas en los rodeos a través de los años. El objetivo de la presente tesis doctoral fue caracterizar parámetros fenotípicos y genotípicos de cepas de C. fetus aisladas del tracto reproductor y de abortos bovinos de la provincia de Buenos Aires. El documento se divide en cuatro capítulos, correspondiendo cada uno de los objetivos particulares propuestos. En el Capítulo I se realiza la identificación de las cepas de C. fetus del cepario constituido a partir de los ceparios de C. fetus pertenecientes a los laboratorios de Bacteriología (EEA-INTA Balcarce) y Microbiología Clínica y Experimental de la Facultad de Ciencias Veterinarias (UNCPBA) conformados por primoaislamientos de muestras de esmegma prepucial, mucus cérvico vaginal y abortos, conservados a -80 °C. La identificación de C. fetus se realizó mediante IFD y pruebas bioquímicas convencionales. De un total de 159 aislamientos registrados en ambas instituciones entre los años 1999 y 2014, se seleccionaron 95 cepas indígenas de C. fetus de los ceparios citados. Los criterios de selección considerados fueron: año de aislamiento, muestras clínicas de origen y localización geográfica, los cuales permitieron los estudios de distribución temporal y espacial que se desarrollaron en los capítulos siguientes. Para la identificación bioquímica de género, especie y subespecie bacteriana, las cepas fueron descongeladas y cultivadas. Posteriormente, se realizó la descripción de la morfología de colonias y bacteriana mediante tinciones y observaciónen fresco por microscopía de campo oscuro. La inmunomarcación de las cepas se realizó por IFD. La identificación de especie y subespecie bacteriana se realizó mediante pruebas bioquímicas de rutina de nuestro laboratorio. Conjuntamente, se utilizó un sistema comercial miniaturizado de identificación para bacterias del género Campylobacter, Arcobacter y Helicobacter de origen humano. La morfología de las colonias y bacteriana de todas las cepas, fueron compatibles con las descriptas para las especies de Campylobacter. La IFD y las pruebas bioquímicas de rutina permitieron clasificar todas las cepas dentro de la especie C. fetus. Por pruebas bioquímicas, se diferenciaron ambas subespecies. La totalidad de las cepas analizadas presentaron fluorescencia positiva. Las pruebas de producción de SH2 en sustratos sensibilizados y de tolerancia a la glicina, fueron definitorias en la determinación de la subespecie bacteriana y para el biotipo intermedius de C. fetus subsp. venerealis. Por pruebas bioquímicas convencionales, 50 cepas (52,6%) fueron clasificadas como C. fetus subsp. fetus, 40 (42,1%) como C. fetus subsp. venerealis y 5 (5,3%) como C. fetus subsp. venerealis biotipo intermedius. El sistema miniaturizado comercial no permitió la diferenciación de algunas cepas de ambas subespecies: seis cepas (6,3%) no pudieron ser caracterizadas. Sesenta y ocho (76,4%) fueron identificadas como C. fetus subsp. venerealis y 21 (23,6%) clasificadas como C. fetus subsp. venerealis/C. fetus subsp. fetus. Los resultados de la identificación de especie y subespecie bacteriana por pruebas bioquímicas y el sistema comercial, fueron comparables para 89 cepas. Se registraron coincidencias para 32 cepas identificadas como C. fetus subsp. venerealis por ambas metodologías. De las 21 cepas clasificadas como C. fetus subsp. venerealis/C. fetus subsp. fetus por el sistema comercial, 15 se correspondieron con C. fetus subsp. fetus y seis con C. fetus subsp. venerealis por pruebas bioquímicas. La limitante del sistema comercial para identificar cepas de C. fetus subsp. fetus, no permitió comparar los resultados para esta subespecie. En el Capítulo II, se caracterizan los parámetros de patogenicidad de C. fetus mediante la capacidad de adherencia y citopatogenicidad. Como modelos de estudio se utilizaron cultivos celulares primarios de útero y vagina bovina y la línea celular MDBK. Las monocapas con semiconfluencia celular, fueron desafiadas con las cepas. Para los cultivos primarios se seleccionaron 35 cepas (13 cepas de C. fetus subsp. venerealis, dos de C. fetus subsp. venerealis biotipo intermedius y 20 de C. fetus subsp. fetus) en base a: el año de aislamiento, la muestra clínica de origen, la localidad geográfica y la subespecie bacteriana. Los cultivos de células MDBK fueron desafiados con la totalidad de las cepas. El inóculo fue establecido en una DO610 de 0,8. La incubación se realizó de acuerdo al objetivo del ensayo: evaluación de la capacidad de adherencia (3 h) y efecto citopatogénico (48-72 h). La adherencia bacteriana se observó por tinción de Giemsa y fueron puestas a punto las técnicas de inmunocitoquímica y microscopía electrónica de barrido para confirmar y caracterizar la adherencia de C. fetus. Se calcularon los indicadores: porcentaje de adherencia a células y número de bacterias adheridas por célula. Para la comparación de los cultivos primarios y células MDBK, las cepas fueron utilizadas como bloques para las variables observadas. El efecto de los cultivos se evaluó mediante un análisis de variancia (ANOVA) con un diseño en bloques. Los resultados permitieron confirmar la capacidad de adherencia de C. fetus a las células uterinas, vaginales y MDBK como así también la aplicabilidad de las técnicas empleadas. El 100% de las cepas fueron adherentes. Los porcentajes de adherencia fueron significativamente mayores para los cultivos primarios en relación a la línea MDBK. Contrariamente, el número de C. fetus por célula fue significativamente mayor para las células MDBK. La aplicación de las técnicas de inmunocitoquímica y microscopía electrónica de barrido permitieron confirmar y caracterizar la adherencia de C. fetus. Para la evaluación del efecto citopatogénico de C. fetus en células uterinas, vaginales bovinas y MDBK, se registraron alteraciones citoplasmáticas, nucleares y muerte celular. Las alteraciones citoplasmáticas fueron evaluadas mediante la observación en fresco y tinción de Giemsa. El coeficiente de distensión celular (F<1,3) en células desafiadas y controles, se determinó con la aplicación del programa Image Pro. La actividad mitótica y las alteraciones nucleares mediante tinción DAPI. La observación de los cultivos celulares en fresco y por tinción de Giemsa, permitió establecer una secuencia de hallazgos: granulación del citoplasma, vacuolización citoplasmática, redondeamiento y distensión celular, condensación nuclear y muerte celular con desprendimiento de la monocapa. Las alteraciones se observaron en el 100% de las cepas analizadas para ambos cultivos. La distensión celular fue significativamente mayor en cultivos primarios y la citopatogenicidad en células uterinas. La evaluación de la actividad mitótica en los cultivos de células MDBK, permitió identificar los distintos estadios del ciclo celular, con detenimiento en interfase y profase en los cultivos desafiados respecto a los controles. En los núcleos de células MDBK desafiadas con 17 cepas, se registraron modificaciones compatibles con efectos apoptóticos. El desarrollo y la implementación de los modelos de estudio in vitro permitieron profundizar los conocimientos referentes a la adherencia y el efecto citopatogénico de C. fetus, considerando la importancia de los aspectos éticos, económicos, de bienestar animal y de practicidad. Para evaluar la asociación lineal entre los parámetros de patogenicidad de C. fetus en los cultivos celulares, se calculó el coeficiente de correlación de Pearson y de Spearman, utilizando el procedimiento PROC CORR del SAS V9.3 (SAS Institute, Cary, NC, USA). Se consideraron como relevantes aquellas correlaciones ≥ 0,5. El análisis de las correlaciones de los parámetros de patogenicidad evaluados en cultivos primarios y células MDBK, permitió obtener resultados similares por ambos métodos. Las correlaciones entre los parámetros de patogenicidad fueron positivas, significativas y de distinta magnitud. La mayor correlación en los tres cultivos se registró entre el porcentaje de adherencia y de citopatogenicidad. En el Capítulo III se caracterizaron los perfiles moleculares de C. fetus. La caracterización de los perfiles proteicos de las cepas se realizó mediante electroforesis en geles de poliacrilamida con dodecil sulfato de sodio (SDS-PAGE). Los extractos bacterianos de las 95 cepas fueron obtenidos según la metodología de Laemmli (1970). Las corridas se realizaron en un sistema homogéneo en gel de poliacrilamida al 10% (Brooks et al., 1996). Los perfiles moleculares proteicos fueron visualizados por coloración con Coomassie Blue. El análisis proteico se basó en la detección del polipéptido mayor que se correspondería con la microcápsula. Ochenta y siete (91,6%) cepas de C. fetus presentaron bandas del polipéptido mayor con variabilidad de pesos moleculares que se ubicaron en un rango de 100 a 117 kDa. La variabilidad para las cepas de casos intrarodeo fue menor. La tipificación genotípica de las cepas de C. fetus, mediante una reacción en cadena de la polimerasa (PCR). La puesta a punto, se realizó teniendo en cuenta el protocolo descripto por Schulze et al. (2006) basado en el trabajo de Hum et al. (1997) modificando las condiciones de reacción y termociclado (Henegariu et al., 1997). Se emplearon los primers MG3F - MG4R para la detección de la especie C. fetus y los primers VenSF - VenSR para ladiferenciación de la subespecie de C. fetus subsp. venerealis (Hum et al., 1997). A partir de los cultivos puros de las cepas en estudio, se realizaron suspensiones bacterianas con una DO610 0,1. La extracción de ADN se realizó por ebullición. Como controles negativos se utilizaron cepas de C. jejuni, C. coli, C. hyointestinalis, C. bubulus y E. coli. La PCR permitió tipificar la totalidad de las cepas en estudio, dentro de la especie C. fetus y diferenciar ambas subespecies: C. fetus subsp. venerealis 49 (51,6%) y C. fetus subsp. fetus 46 (48,4%). Las cepas de casos intrarodeo fueron tipificadas dentro de la misma subespecie. No se observaron amplificaciones inespecíficas ni resultados positivos para microorganismos estrechamente relacionados. La caracterización y subtipificación de las cepas de C. fetus, se realizó por análisis de polimorfismos genéticos a partir de la aplicación de electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE - SmaI). Para la implementación de la técnica, se seleccionaron 28 cepas en base a los parámetros descriptos anteriormente. Se aplicó el protocolo para la subtipificación molecular de C. jejuni elaborado por el Centro para el Control y la Prevención de las Enfermedades (CDC) en el marco de la Red PulseNet América Latina y el Caribe para la subtipificación de Campylobacter spp. La interpretación de los resultados se realizó de acuerdo a lo descripto por Tenover et al. (1995). La observación y el registro fotográfico de los geles se realizaron en el fotodocumentador BioRad Gel DOC EQ System y software Quantity One. La comparación de los perfiles de PFGE (PFPs) se realizó visualmente. Para la interpretación de los datos y la elaboración de los dendogramas, se utilizó el programa informático Bionumerics v.5.1 (Applied Maths). Con el objetivo de determinar la relación genética entre las cepas de C. fetus seleccionadas en esta tesis y cepas de C. fetus, C. coli y C. jejuni, se seleccionaron aislamientos pertenecientes a la Red PulseNet. Los perfiles de PFGE obtenidos para C. fetus presentaron fragmentos incluidos en un amplio rango de tamaño y con una distribución homogénea. La homología interespecie entre C. fetus, C. coli y C. jejuni fue 40 - 50% e intraespecie para C. fetus > 70%. La PFGE – SmaI permitió identificar 19 PFPs para las 28 cepas de C. fetus. En el Capítulo IV se relacionaron los parámetros fenotípicos y genotípicos analizados en los capítulos anteriores, con los datos de origen de las cepas de C. fetus y entre sí. La distribución temporal y por muestra clínica de origen de las subespecies de C. fetus fueron analizadas mediante las herramientas de gráfico en el programa Excel. La distribución espacial se evaluó mediante el programa SatScan V9.3 tomando como unidad de localización geográfica al centroide del partido de origen de las cepas. La visualización espacial de las cepas se realizó mediante mapas gráficos utilizando el software QGis 2.10.1. Para la visualización de la distribución espacial de los parámetros de patogenicidad se consideraron los mayores y menores porcentajes de adherencia y de citopatogenicidad para cada subespecie bacteriana. El efecto del origen y de la subespecie de C. fetus sobre los parámetros de patogenicidad, se analizó mediante un ANOVA. Para evaluar la asociación lineal entre los parámetros observados en los distintos cultivos celulares en relación a la muestra clínica de origen y las subespecies, se calculó el coeficiente de correlación de Pearson y de Spearman. En el período de tiempo analizado se registró la presencia de ambas subespecies de C. fetus con un predominio de C. fetus subsp. fetus en siete años. El mayor número de cepas de C. fetus subsp. fetus fueron aisladas de fetos y de C. fetus subsp. venerealis de hembras y toros. Se observa una distribución temporal homogénea para el porcentaje de adherencia de las cepas en los diferentes cultivos. En células MDBK, los porcentajes fueron menores en relación a los cultivos primarios. La distribución del número de C. fetus por célula fue homogénea, si bien en la mayoría de los años los mayores valores se registraron en los cultivos de células MDBK. Los porcentajes de citopatogenicidad de las cepas fueron superiores al 50% y el F > 1,3 en todos los años de estudio. La subespecie bacteriana no tuvo efecto significativo sobre los parámetros de patogenicidad evaluados. La mayor patogenicidad se observó en las cepas de origen fetal y la menor en las aisladas de toros. Las correlaciones entre los parámetros de patogenicidad fueron positivas y significativas. La adherencia y el efecto citopatogénico se correlacionaron independientemente del número de bacterias adheridas por célula, principalmente para las cepas aisladas de fetos y hembras. La presencia del polipéptido mayor fue independiente de los datos de origen de las cepas. La distribución temporal de las cepas con el polipéptido mayor fue homogénea en todos los años. Al evaluar la distribución espacial, no se observó ninguna tendencia de distribución definida. El polipéptido se observó en 46 cepas aisladas de fetos, 30 de hembras y 11 de toros. En cambio, las cepas que no presentaron el polipéptido fueron aisladas de muestras de fetos (3) y hembras (5). La subespecie bacteriana no tuvo asociación significativa sobre los parámetros de patogenicidad. La mayor patogenicidad se observó en las cepas de origen fetal y la menor en las aisladas de toros. Las subespecies bacterianas, los parámetros de patogenicidad y la presencia del polipéptido mayor de las cepas no registraron tendencias de distribución temporal ni geográfica. Los resultados de la distribución temporal, espacial y por muestra clínica de origen para las cepas caracterizadas por PCR, fueron similares a los obtenidos por pruebas bioquímicas. Los PFPs de C. fetus no se relacionaron con el año de aislamiento, la localización geográfica y la muestra clínica de origen de las cepas en estudio. El porcentaje de similitud para la especie C. fetus fue > 70%. El porcentaje intrasubespecie para C. fetus subsp. venerealis (13 cepas) fue > 80% y sólo tres fueron 100% homólogas y para C. fetus subsp. fetus (15 cepas) > 70%, ocho fueron indistinguibles bajo esta metodología. Los resultados confirman la utilidad de la PFGE – SmaI como una herramienta molecular de alto poder discriminatorio a nivel de subespecie para C. fetus. Para C. fetus subsp. venerealis, sólo dos cepas aisladas de mucus cérvico vaginal fueron indiferenciables bajo esta metodología. En las cepas aisladas de toros las homologías registradas fueron < 75% y para los fetos < 70%. Para C. fetus subsp. fetus, tres cepas aisladas de feto fueron indistinguibles. En las cepas aisladas de hembras las homologías fueron < 70% y en toros <75%. Los PFPs registrados para ambas subespecies en los casos intrarodeo se correspondieron tanto con cepas homólogas como heterólogas. Para evaluar el grado de concordancia entre los resultados obtenidos por pruebas bioquímicas y la PCR para caracterizar las subespecies, se realizó el test de Mc Nemar y se estimó el coeficiente Kappa mediante el procedimiento PROC FREQ del SAS V.9.12 (SAS, Institute Inc., Cary, NC, USA). Para la subespecie C. fetus subsp. venerealis, fueron identificadas por pruebas bioquímicas 45 cepas (47,4%) y por PCR 49 (51,6%). Para C. fetus subsp. fetus por pruebas bioquímicas 50 cepas (52,6%) y por PCR 46 (48,4%). El test de Mc Nemar no detectó diferencias significativas (p=0,1573) y el coeficiente Kappa fue de 0,8319 indicando una alta concordancia entre ambas técnicas. El bajo número de cepas procesadas por PFGE limitó la asociación de los PFPs con la presencia del polipéptido mayor. Los parámetros fenotípicos y genotípicos considerados en la presente tesis, no se relacionaron entre sí. Finalmente, se concluye que las cepas de C. fetus actuantesen los rodeos bovinos poseen diferencias fenotípicas y genotípicas. Palabras clave: Campylobacter fetus, caracterización fenotípica, caracterización genotípica, bovinos, adherencia, citopatogenicidad, perfil proteico, reacción en cadena de la polimerasa (PCR), electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE), distribución temporal, distribución espacial. SUMMARY Campylobacter fetus subsp. venerealis and Campylobacter fetus subsp. fetus are the etiological agents of bovine genital campylobacteriosis (BGC), one of the most important reproductive diseases in Argentinean herds. Presently, there are scarce studies on the behavior of both subspecies of C. fetus in bovine herds. This is probably due to the fact that routine diagnosis of BGC is performed by direct immunofluorescene (DIF) of preputial smegma samples since it is rapid, inexpensive, sensitive and specific. However, this test does not provide information on the microbiological identification of the strains. Furthermore, the antibody conjugates used in this technique do not differentiate between C. fetus subsp. fetus and C. fetus subsp. venerealis. Therefore, there is no information about the presence of both subspecies at the regional level. Microbiologic culture is still the reference technique. Nevertheless, the high contamination of some clinical samples, the cost of proper equipment, the time required for the culture and the further characterization by biochemical tests determine that microbiological diagnosis is not routinely performed. In the last decades, molecular biology techniques have been developed and set to optimize the identification and characterization of C. fetus. The adoption of new techniques will allow the complementation of the results obtained by traditional tests, the characterization of the phenotypic and genotypic profiles of the strains, the determination of their influence on the pathogeny of the disease, the degree of homology between strains and, finally it will contribute to epidemiological studies for the analysis of the behavior of the strains in the herds throughout the years. The objective of this doctoral thesis was to characterize the phenotypic and genotypic parameters of C. fetus strains isolated from the bovine reproductive tract and from bovine abortions in Buenos Aires province. The document is divided into four chapters, each one corresponding to the proposed particular objectives. In Chapter I it is described the identification of C. fetus strains from the strain collection integrated by collections of C. fetus belonging to the laboratories of Bacteriology (EEA-INTA Balcarce) and Clinical and Experimental Microbiology of the Faculty of Veterinary Sciences (UNCPBA), which is comprised by prime-isolations from preputial smegma, cervico-vaginal mucus and abortion samples stored at -80 °C. The identification of C. fetus was done by DIF and conventional biochemical tests. Ninety-five indigenous C. fetus strains of the mentioned collections, out of 159 isolates recorded by both institutions between 1999 and 2014, were selected. Criteria considered for selection were: year of isolation, clinical samples of origin and geographic location, which allowed the studies on temporal and spatial distribution developed in the following chapters. For the biochemical identification of bacterial genus, species and subspecies, the strains were thawed and cultured. Then, the description of colony and bacterial morphology was done by staining and fresh observation by dark field microscopy. The immunemarcation of the strains was done by DIF. The identification of bacterial species and subspecies was performed by biochemical tests routinely performed in our laboratory. At the same time, a miniaturized commercial system for the identification of bacteria of the genus Campylobacter, Arcobacter and Helicobacter of human origin was used. Colony and bacterial morphology of all strains was compatible with that of the species of Campylobacter. DIF and routine biochemical tests allowed the classification of all the strains within the species C. fetus. By biochemical tests both subspecies were differentiated. All strains analyzed presented positive fluorescence. Tests of SH2 production in sensitized substrates and glycine tolerance were defining for the determination of bacterial subspecies and for the biotype intermedius of C. fetus subsp. venerealis. By conventional biochemical tests, 50 strains (52.6%) were classified as C. fetus subsp. fetus, 40 (42.1%) as C. fetus subsp. venerealis and 5 (5.3%) as C. fetus subsp. venerealis biotype intermedius. The miniaturized commercial system did not allow the differentiation of some strains of both subspecies: six strains (6.3%) could not be characterized. Sixty-eight (76.4%) were identified as C. fetus subsp. venerealis and 21 (23.6%) were classified as C. fetus subsp. venerealis/C. fetus subsp. fetus. The results of the identification of bacterial species and subspecies by biochemical tests and the commercial system were comparable for 89 strains. Coincidences were recorded for 32 strains identified as C. fetus subsp. venerealis by both methodologies. Of the 21 strains classified as C. fetus subsp. venerealis/C. fetus subsp. fetus by the commercial system, 15 coincided with C. fetus subsp. fetus and six with C. fetus subsp. venerealis by biochemical tests. The limitation of the commercial system to identify strains of C. fetus subsp. fetus, did not allow the comparison of the results for this subspecies. In chapter II, the parameters of pathogenicity of C. fetus by its capacity of adherence and cytopathogenicity are characterized. As model of study, primary cell cultures of bovine uterus and vagina and the cell line MDBK were used. The semi-confluent cell monolayers were challenged with the strains. For primary cultures, 35 strains were selected (13 C. fetus subsp. venereal strains, two C. fetus subsp. venerealis biotype intermedius and 20 C. fetus subsp. fetus) based on: year of isolation, clinical sample of origin, geographic location and bacterial subspecies. MDBK cultures were challenged with all the strains. The inoculum was established at an OD610 of 0.8. The incubation was performed according to the objective of the experiment: evaluation of the capacity of adherence (3h) and cytopathogenic effect (48-72 h). Bacterial adherence was observed by Giemsa staining and the immunocytochemical and scanning electron microscopy techniques were optimized to confirm and characterize the adherence of C. fetus. The following indicators were calculated: percentage of adherence to the cells and number of bacteria adhered per cell. For the comparison of the primary cultures and MDBK cells, the strains were used as blocks for the observed variables. The effect of the cultures was evaluated by variance analysis (ANOVA) with a block design. The results allowed the confirmation of the capacity of adherence of C. fetus to uterine, vaginal and MDBK cells as well as the applicability of the employed techniques. The 100% of the strains were adherent. In relation to MDBK cells, the percentages of adherence for the primary cultures were significantly higher. On the contrary, the number of C. fetus per cell was significantly higher for MDBK cells. The application of immunocytochemistry and scanning electron microscopy allowed the confirmation and characterization of the adherence of C. fetus. The evaluation of the cytopathogenic effect of C. fetus in bovine uterine and vaginal cells and MDBK cells revealed cytoplasmic and nuclear alterations and cell death. Cytoplasmic alterations were evaluated by fresh observation and by Giemsa staining. The coefficient of cell distension (F<1.3) in challenged and control cells was determined by the applicationof the ImagePro software. Mitotic activity and nuclear alterations were evaluated by DAPI staining. The observation of cell cultures in fresh and by Giemsa staining allowed the establishment of a sequence of findings: cytoplasm granulation and vacuolization, cell rounding and distension, nuclear condensation and cell death with detachment of the monolayer. Alterations were observed in 100% of the analyzed strains for both cultures. Cell distension was significantly higher in primary cultures and cytopathogenicity was higher in uterine cells. The evaluation of the mitotic activity in MDBK cell cultures allowed the identification of the different stages of the cell cycle, halting in interphase and prophase in the challenged cultures with respect to controls. In the nuclei of MDBK cells challenged with 17 strains modifications compatibles with apoptotic effects were recorded. The development and the implementation of in vitro models of study deepened the understanding about adherence and cytopathogenic effect of C. fetus, considering the importance of ethic, economic, animal welfare and practical aspects. To evaluate the lineal association between the parameters of pathogenicity of C. fetus in the cell cultures, Pearson and Spearman correlation coefficients were calculated using the PROC CORR procedure of SAS V9.3 (SAS Institute, Cary, NC, USA). Correlations ≥ 0.5 were considered relevant. The analysis of the correlations of the pathogenicity parameters evaluated in primary cultures and MDBK cells allowed the gathering of similar results by both methods. Correlations between the parameters of pathogenicity were positive, significant and of different magnitude. The highest correlation in the three cultures was recorded between the percentage of adherence and cytopathogenicity. In Chapter III, the molecular profiles of C. fetus were characterized. The characterization of the protein profiles of the strains was performed by dodecyl-sodium sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE). Bacterial extracts of the 95 strains were obtained according to the methodology of Laemmli (1970). Runnings were performed in a homogeneous system in 10% polyacrylamide gels (Brooks et al., 1996). The molecular protein profiles were visualized by Coomassie Blue staining. Protein analysis was based on the detection of the major polypeptide which would correspond to the microcapsule. Eighty-seven (91.6 %) strains of C. fetus presented bands of the major polypeptide with variations in the molecular weights in a range of 100 to 117 kDa. The variability for the strains of intra-herd cases was lower. Genotyping of the strains of C. fetus was done by polymerase chain reaction (PCR). The optimization was performed according to the protocol described by Schulze et al. (2006), based on the work of Hum et al. (1997) and modifying the reaction and thermocycling conditions (Henegariu et al., 1997). Primers MG3F - MG4R were used for the detection of species of C. fetus and primers VenSF – VenSR for the differentiation of the subspecies of C. fetus subsp. venerealis (Hum et al., 1997). Suspensions with an OD610 0.1were obtained from the pure cultures of the strains under study. DNA extraction was done by boiling. As negative controls C. jejuni, C. coli, C. hyointestinalis, C. bubulus and E. coli strains were used. PCR allowed the typing of all the strains under study within the species C. fetus and the differentiation of both subspecies: 49 (51.6%) C. fetus subsp. venerealis and 46 (48.4%) C. fetus subsp. fetus. Strains of intra-herd cases were typified within the same subspecies. Unspecific amplifications or positive results for closely related microorganisms were not observed. The characterization and subtyping of the strains of C. fetus was done by the analysis of genetic polymorphisms by the application of pulsed-field gel electrophoresis (PFGE - SmaI). For the implementation of the technique, 28 strains were selected according to the previously described parameters. The protocol for the molecular subtyping of C. jejuni developed by the Centers for Disease Control and Prevention (CDC) in the frame of the Latin American and Caribbean Net PulseNet for the subtyping of Campylobacter spp. was used. The interpretation of the results was done according to the description by Tenover et al. (1995). The observation and photographic record of the gels were performed by photo documentation using the BioRad Gel DOC EQ System and Quantity One software. The comparison of the PFGE profiles (PFPs) was visually done. For data interpretation and dendograms elaboration, the computer software Bionumerics v.5.1 (Applied Maths) was used. With the aim of determining the genetic relation among C. fetus strains selected in this thesis and C. fetus, C. coli and C. jejuni strains, isolates belonging to the Net PulseNet were selected. The PFGE profiles obtained for C. fetus presented fragments included in a wide range of size and with homogeneous distribution. Interspecies homology among C. fetus, C. coli and C. jejuni was 40 – 50% and intraspecies homology for C. fetus was > 70%. PFGE – SmaI allowed the identification of 19 PFPs for the 28 C. fetus strains. In Chapter IV, the phenotypic and genotypic parameters analyzed in the previous chapters were related with the data of origin of the strains of C. fetus and were also related between them. Temporal and by clinical sample of origin distribution of the subspecies of C. fetus were analyzed by the graphic tools in Excel software. Spatial distribution was evaluated by the SatScan V9.3 software, using the centroid of the district of origin of the strains as geographic location unit. The spatial visualization of the strains was done by graphic maps using the QGis 2.10.1 software. For the visualization of the spatial distribution of the parameters of pathogenicity, the highest and lowest percentages of adherence and cytopathogenicity for each bacterial subspecies were considered. The effect of the origin and of C. fetus subspecies on the parameters of pathogenicity was analyzed by ANOVA. To evaluate the lineal association between the parameters observed in the different cell cultures in relation to the clinical sample of origin and the subspecies, the Pearson and of Spearman coefficients of correlation were calculated. In the period of time analyzed, the presence of both subspecies of C. fetus with predominance of C. fetus subsp. fetus in seven years was recorded. The highest number of C. fetus subsp. fetus strains was isolated from fetuses and in the case of C. fetus subsp. venerealis from females and bulls. A homogeneous temporal distribution is observed for the percentage of adherence of the strains to the different cultures. In MDBK cells, the percentages were lower in relation to primary cultures. The distribution of the number of C. fetus per cell was homogeneous even when, in most of the years, the highest values were recorded in MDBK cell cultures. The percentages of cytopathogenicity of the strains were higher to 50% and F was > 1.3 during all years of study. The bacterial subspecies had no significant effect on the evaluated parameters of pathogenicity. The highest pathogenicity was observed for the strains of fetal origin and the lowest for those strains isolated from bulls. Correlations between parameters of pathogenicity were positive and significant. There was correlation for adherence and cytopathogenic effect, independently of the number of bacteria adhered per cell, particularly for the strains isolated from fetuses and females. The presence of the major polypeptide was not dependent on the data of origin of the strains. The temporal distribution of the strains with the major polypeptide was homogeneous during all the years. When evaluating the spatial distribution, a definedtendency on the distribution was not observed. The polypeptide was observed in 46 strains isolated from fetuses, 30 from females and 11 from bulls. In contrast, strains that did not have the polypeptide were isolated from fetuses (3) and females (5) samples. The bacterial subspecies had no significant effect on the parameters of pathogenicity. The highest pathogenicity was observed for the strains of fetal origin and the lowest for those isolated from bulls. Bacterial subspecies, parameters of pathogenicity and the presence of the major polypeptide of the strains did not show tendencies on the temporal or geographic distribution. For the strains characterized by PCR, the results of temporal, spatial distribution and clinical sample of origin were similar to those obtained by biochemical tests. The PFPs of C. fetus were not related with the year of isolation, geographic location and clinical sample of origin of the strains under study. The percentage of similarity for the species C. fetus was > 70%. The percentage of intra subspecies for C. fetus subsp. venerealis (13 strains) was > 80% and only 3 were 100% homologous. For C. fetus subsp. fetus (15 strains) it was > 70% and eight strains were indistinguishable by this methodology. The results confirm the usefulness of PFGE– SmaI as a molecular tool of high discriminatory power at the level of subspecies for C. fetus. For C. fetus subsp. venerealis, only two strains isolated from cervico-vaginal mucus were non- differentiable under this methodology. In the strains isolated from bulls the homologies recorded were < 75% and for fetuses < 70%. For C. fetus subsp. fetus, three strains isolated from fetuses were undistinguishable. In the strains isolated from females the homologies were < 70% and in bulls < 75%. The recorded PFPs for both subspecies in intra-herd cases were coincident for the homologous as well as the heterologous strains. To evaluate the degree of concordance between the results obtained by biochemical tests and PCR for the characterization of subspecies, the Mc Nemar test was performed and the Kappa coefficient was estimated by PROC FREQ procedure of SAS V.9.12 (SAS, Institute Inc., Cary, NC, USA). For the subspecies C. fetus subsp. venerealis, 45 strains (47.4%) were identified by biochemical tests and 49 (51.6%) by PCR. For C. fetus subsp. fetus 50 strains (52.6%) were identified by biochemical tests and 46 (48.4 %) by PCR. By Mc Nemar test significant differences were not detected (p=0.1573) and the Kappa coefficient was 0.8319, indicating a high concordance between both techniques. The low number of strains analyzed by PFGE limited the association of PFPs with the presence of the major polypeptide. The phenotypic and genotypic parameters considered in this thesis are not related between them. Finally, it is concluded that the strains of C. fetus circulating in bovine herds have phenotypic and genotypic differences. Key words: Campylobacter fetus, phenotypic characterization, genotypic characterization, bovines, adherence, cytopathogenicity, protein profile, polymerase chain reaction (PCR), pulse- field gel electrophoresis (PFGE), temporal distribution, spatial distribution. ÍNDICE GENERAL Introducción general ........................................................................................................................ 1 Hipótesis .......................................................................................................................................... 3 Objetivos generales y particulares ................................................................................................... 4 Capítulo I. Identificación de cepas de Campylobacter fetus aisladas del tracto reproductor y de abortos en rodeos bovinos ............................................................................................................... 5 Sección 1. Colección de cepas de Campylobacter fetus .............................................................. 6 1.1.1 Introducción .................................................................................................................... 6 1.1.2 Materiales y métodos .................................................................................................... 18 1.1.3 Resultados ..................................................................................................................... 19 1.1.4 Discusión ...................................................................................................................... 26 1.1.5 Conclusiones ................................................................................................................. 27 Sección 2. Identificación bioquímica de género, especie y subespecie bacteriana .................... 28 1.2.1 Introducción .................................................................................................................. 28 1.2.2 Materiales y métodos .................................................................................................... 35 1.2.3 Resultados ..................................................................................................................... 41 1.2.4 Discusión ...................................................................................................................... 59 1.2.5 Conclusiones ................................................................................................................. 61 Capítulo II. Caracterización de parámetros de patogenicidad de Campylobacter fetus ................ 62 2.1 Introducción ......................................................................................................................... 63 2.2 Materiales y métodos ........................................................................................................... 82 Sección 1. Evaluación de la capacidad de adherencia de Campylobacter fetus en células uterinas bovinas, vaginales bovinas y MDBK ........................................................................... 91 2.1.1 Materiales y métodos .................................................................................................... 91 2.1.2 Resultados ..................................................................................................................... 94 2.1.3 Discusión .................................................................................................................... 107 2.1.4 Conclusiones ............................................................................................................... 108 Sección 2. Evaluación del efecto citopatogénico de Campylobacter fetus en células uterinas bovinas, vaginales bovinas y MDBK ...................................................................................... 109 2.2.1 Materiales y métodos .................................................................................................. 109 2.2.2 Resultados ................................................................................................................... 112 2.2.3 Discusión .................................................................................................................... 134 2.2.4 Conclusiones ............................................................................................................... 135 Sección 3. Comparación de los parámetros de patogenicidad de Campylobacter fetus en cultivos primarios y células MDBK ........................................................................................ 136 2.3.1 Materiales y métodos .................................................................................................. 136 2.3.2 Resultados ...................................................................................................................136 2.3.3 Discusión .................................................................................................................... 138 2.3.4 Conclusiones ............................................................................................................... 138 Capítulo III. Caracterización de los perfiles moleculares de Campylobacter fetus ..................................................................................................................................................... 139 Sección 1. Caracterización de los perfiles proteicos de cepas de Campylobacter fetus: electroforesis en geles de poliacrilamida con dodecil sulfato de sodio (SDS-PAGE) ............. 140 3.1.1 Introducción ................................................................................................................ 140 3.1.2 Materiales y métodos .................................................................................................. 145 3.1.3 Resultados ................................................................................................................... 146 3.1.4 Discusión .................................................................................................................... 152 3.1.5 Conclusiones ............................................................................................................... 152 Sección 2. Tipificación genotípica. Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) .................. 153 3.2.1 Introducción ................................................................................................................ 153 3.2.2 Materiales y métodos .................................................................................................. 165 3.2.4 Discusión .................................................................................................................... 172 3.2.5 Conclusiones ............................................................................................................... 173 Sección 3. Caracterización y subtipificación de las cepas de Campylobacter fetus por análisis de polimorfismos genéticos: electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE) ........................ 174 3.3.1 Introducción ................................................................................................................ 174 3.3.2 Materiales y métodos .................................................................................................. 182 3.3.3 Resultados ................................................................................................................... 187 3.3.4 Discusión .................................................................................................................... 196 3.3.5 Conclusiones ............................................................................................................... 197 Capítulo IV. Relación entre los parámetros fenotípicos, genotípicos y los datos de origen de las cepas de Campylobacter fetus ..................................................................................................... 198 4.1 Introducción ....................................................................................................................... 199 Sección 1. Distribución témporo-espacial y por muestra clínica de origen de los parámetros fenotípicos de Campylobacter fetus ......................................................................................... 214 4.1.1. Distribución de las subespecies de Campylobacter fetus identificadas por pruebas bioquímicas .......................................................................................................................... 215 4.1.2. Distribución de los parámetros de patogenicidad de Campylobacter fetus ............... 219 4.1.3. Distribución del polipéptido mayor de Campylobacter fetus .................................... 242 Discusión ............................................................................................................................. 244 Conclusiones ........................................................................................................................ 246 Sección 2. Distribución témporo-espacial y por muestra clínica de origen de los parámetros genotípicos de Campylobacter fetus ........................................................................................ 247 4.2.1. Distribución de las cepas de Campylobacter fetus caracterizadas genotípicamente por PCR ...................................................................................................................................... 248 4.2.2. Distribución de los PFPs de las cepas de Campylobacter fetus subtipificadas por PFGE ................................................................................................................................... 248 Discusión ............................................................................................................................. 258 Conclusiones ........................................................................................................................ 259 Sección 3. Relación entre los parámetros fenotípicos y genotípicos de Campylobacter fetus ................................................................................................................................................. 260 4.3.1. Relación entre la caracterización bioquímica y genotípica de Campylobacter fetus 261 4.3.2. Relación entre los parámetros de patogenicidad y la caracterización genotípica de Campylobacter fetus ............................................................................................................ 265 4.3.3. Relación entre la presencia del polipéptido mayor y la caracterización genotípica de Campylobacter fetus ............................................................................................................ 266 4.3.4. Relación entre los PFPs y la caracterización genotípica de Campylobacter fetus .... 266 4.3.5. Relación entre PFPs y la presencia del polipéptido mayor de Campylobacter fetus 266 4.3.6. Análisis de los parámetros fenotípicos y genotípicos para las cepas de Campylobacter fetus caracterizadas por PFGE ............................................................................................. 266 Discusión ............................................................................................................................. 269 Conclusiones ........................................................................................................................ 270 Conclusión general ...................................................................................................................... 271 Anexo .......................................................................................................................................... 273 Referencias bibliográficas ........................................................................................................... 283 1 INTRODUCCIÓN GENERAL La identificación de nuevas especies de Campylobacter como patógenos humanos, ha reforzado la importancia del género en medicina veterinaria en los últimos 15 años. La importancia zoonótica de especies como C. coli, C. jejuni y C. fetus subsp. fetus y los avances en el área de la biología molecular, han incrementado los conocimientos referentes a la taxonomía, la epidemiología y la patogénesis de dichas bacterias. En particular, estudios relacionados con la virulencia y los modelos experimentales que ayuden a dilucidar los mecanismos patogénicos hasta el momento desconocidos. La especie C. fetus ha sido estudiada desde principios del siglo pasado. En el caso de los C. fetus de origen reproductivo, se han realizado escasos estudios referentes al comportamiento de la especie en los rodeos bovinos. Campylobacterfetus subsp. venerealis y Campylobacter fetus subsp. fetus son causales de la campylobacteriosis genital bovina (CGB), una de las enfermedades infecciosas reproductivas presentes en los rodeos bovinos de Argentina. La alta incidencia de las enfermedades de la reproducción limita la eficiencia reproductiva con disminución de los porcentajes de preñez hasta el 25%. La CGB es una enfermedad de transmisión venérea, en la hembra bovina se caracteriza por producir infertilidad por muerte embrionaria con incremento en el número de servicios necesarios para obtener un ternero, alargamiento del ciclo estral y ocasionalmente, abortos esporádicos desde el quinto mes de gestación, mientras que el toro es portador y diseminador de la enfermedad. En la actualidad, el diagnóstico de rutina de la CGB se realiza a partir de muestras de esmegma prepucial por inmunofluorescencia directa (IFD) por su rapidez, sensibilidad, especificidad y bajo costo, sin la identificación microbiológica de las cepas. Los conjugados que se emplean no diferencian entre C. fetus subsp. venerealis y C. fetus subsp. fetus, ya que ambas subespecies son antigénicamente similares. Por lo tanto, se carece de información sobre la presencia y distribución de las subespecies a nivel regional. El cultivo microbiológico continúa siendo la técnica de referencia. Sin embargo, variables como la contaminación de las muestras clínicas, el equipamiento necesario para el cultivo e identificación, el tiempo que requiere el desarrollo de un cultivo hasta su identificación, entre otros, determina que esta técnica no se realice en forma rutinaria. 2 La caracterización fenotípica de C. fetus, ha llevado a la discusión por parte de diferentes autores. La diferenciación bioquímica de ambas subespecies se basa en una única prueba de tolerancia al 1% de glicina. Chang and Ogg (1971) han demostrado que esta prueba puede no ser fiable para la separación de las subespecies, porque dicha tolerancia puede ser por transducción o mutación adquirida. Además, se han descripto variantes de C. fetus subsp. venerealis glicina- tolerantes (denominadas biovar "intermedius") aunque algunas evidencias sugieren que estos resultados podrían deberse a una inadecuada normalización de las pruebas bioquímicas. De la misma manera, se han registrado cepas de C. fetus subsp. fetus sensibles a la glicina. Por otro lado, existen escasos estudios referentes a otras técnicas de caracterización fenotípicas que permitan contribuir a la diferenciación de las subespecies. La ausencia de la identificación genoespecífica no permite conocer las características de las cepas indígenas presentes en nuestros rodeos bovinos. En las últimas décadas se han desarrollado y puesto a punto técnicas de biología molecular para optimizar la identificación y caracterización de cepas de C. fetus. El desarrollo y la aplicación de nuevas técnicas moleculares no sólo permitirá complementar los resultados obtenidos por las pruebas tradicionales sino también profundizar el estudio de las cepas presentes en nuestros rodeos y así determinar la influencia de los perfiles fenotípicos y genotípicos de las cepas regionales en la patogenia de la enfermedad y finalmente, contribuir con estudios epidemiológicos que analicen el comportamiento de las cepas en los rodeos a través de los años y determinar el grado de homología entre las cepas. Al considerar la tendencia de los estudios registrada en la bibliografía consultada y por nuestro grupo de investigación, en la presente tesis doctoral se caracterizaron fenotípica y genotípicamente cepas de C. fetus aisladas de rodeos bovinos con antecedentes de fallas reproductivas de nuestro país. A futuro, la evaluación de los aspectos citados anteriormente permitiría mejorar los métodos diagnósticos, los inmunógenos presentes en el mercado actual y conocer más acerca de la epidemiología de esta enfermedad para rediseñar planes de control tendientes a la erradicación de la enfermedad. 3 Hipótesis Las cepas de Campylobacter fetus actuantes en los rodeos bovinos poseen diferencias fenotípicas y genotípicas. 4 Objetivos generales y particulares Objetivo general Caracterizar parámetros fenotípicos y genotípicos de cepas de Campylobacter fetus de diferentes orígenes. Objetivos particulares I. Identificar cepas de Campylobacter fetus aisladas del tracto reproductor y de abortos de rodeos bovinos. II. Caracterizar parámetros de patogenicidad de las cepas de Campylobacter fetus en estudio: capacidad de adherencia y citopatogenicidad. III. Determinar los perfiles moleculares de las cepas de Campylobacter fetus. IV. Determinar si los parámetros fenotípicos y genotípicos evaluados se relacionan con el origen de las cepas. 5 CAPÍTULO I Identificación de cepas de Campylobacter fetus aisladas del tracto reproductor y de abortos en rodeos bovinos 6 CAPÍTULO I Sección 1 Colección de cepas de Campylobacter fetus 1.1.1 INTRODUCCIÓN Breve reseña histórica de la taxonomía de Campylobacter fetus El género Campylobacter por muchos años presentó una gran confusión taxonómica basada en la amplia diversidad de los hábitats de los microorganismos que lo componen, sus características de crecimiento y la inercia en los sistemas de identificación, actuando estos factores como obstáculos para la apropiada identificación y nomenclatura Penner (1988). McFadyean and Stockman (1913) describen un “vibrio” responsable de abortos en ovejas preñadas en el año 1906: “...comma shaped, but long spirilla forms, apparently consisting of several commas joined end to end, were also present. In hanging drops these organisms were actively motile...”. A partir de la inoculación experimental de este microorganismo en vacas preñadas, se logró reproducir el aborto. Luego, Smith (Smith, 1918) recuperó un “espirilo” microaerófilo de terneros abortados, sosteniendo que el mismo era idéntico al descripto por McFadyean y Stockman. El mismo fue designado por Smith y Taylor como Vibrio fetus, debido al predominio de las bacterias en forma de “coma” sobre la de espirilo, principalmente en cultivo jóvenes (Smith, 1919; Smith and Taylor, 1919). La asignación del microorganismo en estudio al género Vibrio no fue satisfactoria, ya que Vibrio fetus se diferenciaba en algunos aspectos fenotípicos y genotípicos de otras especies del mismo género como V. cholerae (Véron, 1966). El género Vibrio comprende bacterias que fermentan la glucosa (Hugh and Leifson, 1953) y en su ADN contienen entre un 40 y 53% de guanina y citosina (G + C), mientras que las del género Campylobacter son asacarolíticas y el porcentaje de G + C varía entre 29 y 36% (Sebald and Veron, 1963; Véron, 1966; Vandamme et al., 2005; Terzolo and Catena, 2007). Por esta razón, Sebald y Véron en el año 1963 propusieron un nuevo género denominado Campylobacter que incluye la especie Campylobacter fetus (Sebald and Veron, 1963). La diferenciación taxonómica de las especies de Campylobacter se redefinió en 1973 al discriminar las bacterias incluidas dentro del género en función de su reacción a la enzima 7 catalasa y la producción de ácido sulfhídrico (SH2) (Veron and Chatelain, 1973). Como resultado, se definieron tres grupos: cepas catalasa positivas y SH2 negativas que incluía a C. fetus, cepas catalasa y SH2 positivas como C. coli y C. jejuni, cepas catalasa y SH2 negativa como C. sputorum. Clasificación anterior Clasificación actual Smibert Florent Smith and Taylor Veron and Chatelain Smibert C. fetus var. intestinalis V. fetus var. intestinalis V. fetus C. fetus subsp. fetus C. fetus subsp. fetus C. fetus subsp. fetus V. fetus var. venerealis V. fetus C. fetus subsp. venerealis C. fetus subsp. venerealis Tabla N° 1.1.1. Esquema de la evolución histórica de la nomenclaturade Campylobacter fetus. Adaptado de Penner (1988). En 1991, Vandamme et al. introdujeron el género Campylobacter en la superfamilia VI ARNr en base a los estudios de hibridación, una de las técnicas que más aportes realizó dentro de la familia Campylobacteraceae (Vandamme and De Ley, 1991), la cual incluye tres géneros: Campylobacter, Arcobacter y Sulfurospirillum. Los dos primeros, asociados a enfermedades en humanos y animales, mientras que Sulfurospirillum con bacterias ambientales. Si bien inicialmente el género Arcobacter fue denominado para incluir cepas aerotolerantes de Campylobacter, luego se demostró que poseen diferentes perfiles de ADN-ARNr (Vandamme et al., 1991). En los últimos años, para contribuir a clarificar algunos aspectos de importancia, se ha avanzado en el estudio de la constitución genética del género. El desarrollo de nuevas metodologías de estudio para los caracteres fenotípicos y genotípicos, determinó que el género Campylobacter sufra continuas modificaciones debido a la incorporación de nuevas especies, como así también, a la reasignación de algunos microorganismos a otros géneros con características compartidas. Actualmente el género Campylobacter se incluye en la Clase V Epsilonproteobacteria, Orden I Campylobacterales, Familia I Campylobacteraceae (Vandamme et al., 2005). 8 Imagen N° 1.1.1. Árbol filogenético de la familia Campylobacteraceae basado en el porcentaje de similitud de la secuencia 16S rARN. Wassenaar and Newell (2006) adaptado de Vandamme (2000) Características generales del género Campylobacter El nombre Campylobacter deriva de una palabra griega que significa “bacilo curvo”. Las campylobacterias son bacterias con morfología curva, espiralada o en forma de “S”, Gram negativas, no formadoras de esporas y miden entre 0,5 a 8 µm de largo y 0,2 a 0,5 µm de ancho. Generalmente tienen un solo flagelo polar o uno en cada extremo cuyo largo puede superar en 9 hasta tres veces el tamaño de la célula. La motilidad de la bacteria es rápida y característica en forma de “tirabuzón”. Son de crecimiento relativamente lento de hasta 6 días, asacarolíticos y generalmente, bioquímicamente no reactivos (Sebald and Veron, 1963; Penner, 1988; Vandamme et al., 2005; Terzolo and Catena, 2007). Con respecto a los requisitos atmosféricos y si bien la mayoría de las bacterias incluidas en el género son microaerófilas, existe un espectro de crecimiento óptimo que se extiende desde condiciones anaeróbicas hasta necesidades y tolerancia al oxígeno (O2) en otros casos. Del mismo modo, hay un amplio rango de temperaturas que se extiende desde los 15 °C para C. cryoaerophila hasta los 41 a 42 °C para C. jejuni, C. coli y C. laridis (C. lari). Por otra parte, las especies y subespecies incluidas, varían su crecimiento en relación a la temperatura óptima (Penner, 1988; Carter, 2004; Vandamme et al., 2005; Terzolo and Catena, 2007). El género incluye actualmente 34 especies y 14 subespecies confirmadas (http://www.bacterio.net/campylobacter.html), 10 se consideran de interés en microbiología veterinaria, de las cuales C. fetus, y C. jejuni son comúnmente aisladas en el diagnóstico de enfermedades reproductivas. Si bien ambas han demostrado ser causantes de abortos bovinos esporádicos, la especie de mayor relevancia es C. fetus. Las especies C. hyointestinalis y C. sputorum se consideran comensales del tracto digestivo y reproductor (Penner, 1988; Terzolo and Cipolla, 1992; Quinn et al., 2002; Carter, 2004; Vandamme et al., 2005; Terzolo and Catena, 2007). Especie Campylobacter fetus La especie C. fetus se divide en dos subespecies: C. fetus subespecie fetus y C. fetus subespecie venerealis (Florent, 1959; Veron and Chatelain, 1973; Penner, 1988; Carter, 2004; Vandamme et al., 2005; Terzolo and Catena, 2007). Por pruebas de hibridación se ha confirmado que entre ambas subespecies hay una estrecha relación ya que tienen similar contenido de guanina y citosina (G+C) en su ADN (Veron and Chatelain, 1973; Harvey and Greenwood, 1983; Roop II et al., 1984; Penner, 1988; On, 1996; Carter, 2004; Vandamme et al., 2005; Terzolo and Catena, 2007). Harvey and Greenwood (1983) señalaron que no habría base genética para la división de la especie en subespecies. Además, ambas subespecies son aglutinables en un antisuero contra el mismo serotipo (Veron and Chatelain, 1973; On, 1996; Terzolo and Catena, 2007). Las primeras secuencias completas del genoma de C. fetus subsp. fetus (82-40) y C. fetus subsp. venerealis (84-112) se conocieron en el 2006 (número de acceso al GenBank NC_008599) y 2011, respectivamente (Chaudhuri and Pallen, 2006). http://www.bacterio.net/campylobacter.html 10 van Bergen et al. (2005a) analizaron 140 aislamientos de C. fetus por Multilocus Sequence Typing (MLST). La especie fue genéticamente homogénea y estable, comparada con otras especies del género. En total, se identificaron 14 tipos de secuencias (STs), con una baja diversidad genética basada en 22 sitios con 3.312 nucleótidos. Existe una mayor variabilidad en los STs de C. fetus subsp. fetus con respecto a C. fetus subsp. venerealis. El ST 4 sólo se asoció a C. fetus subsp. venerealis. La elevada similitud observada entre ambas subespecies condujo a considerar a C. fetus subsp. venerealis como un clon bovino de C. fetus subsp. fetus. Las dos subespecies de C. fetus están adaptadas al tracto genital bovino. El toro es portador y diseminador de la enfermedad por transmisión venérea, el principal hábitat de C. fetus son las criptas prepuciales. Las secreciones genitales de las vacas que abortaron y aquellas hembras portadoras de la bacteria en el área cérvico vaginal, los fetos abortados, la placenta y el intestino, también son fuentes de infección (Clark, 1971; Smibert, 1978; Ware, 1980; Hoffer, 1981; Coid and Fox, 1983; Garcia et al., 1983; Hum, 1987; Penner, 1988; Eaglesome and Garcia, 1992; Carter, 2004; BonDurant, 2005; Joens et al., 2010; Terzolo and Catena, 2007). C. fetus subsp. fetus también puede ingresar a través de la ingestión de alimentos y/o agua contaminada con heces y ser aislado a partir de muestras de intestino y todo material contaminado con heces (Easterbrooks and Plastridge, 1952; Clark, 1971; Smibert, 1978; Ware, 1980; Hoffer, 1981; Coid and Fox, 1983; Garcia et al., 1983; Hum, 1987; Penner, 1988; Eaglesome and Garcia, 1992; Joens et al., 2010; BonDurant, 2005; Vandamme et al., 2005; Terzolo and Catena, 2007). Si bien por muchos años la única subespecie reconocida como causa infrecuente de infecciones en seres humanos fue C. fetus subsp. fetus, se han reportado casos por C. fetus subsp. venerealis y C. fetus subsp. testudinum. La bibliografía cita infecciones sistémicas asociadas con meningitis, pericarditis, peritonitis, salpingitis, artritis, celulitis y abscesos en seres humanos con condiciones predisponentes como inmunosupresión, entre otras (Righter et al., 1983; Francioli et al., 1985; Penner, 1988; Kubota et al., 1993; Sauerwein et al., 1993; Wilhelm et al., 1996; Chuman et al., 2003; Patrick et al., 2013; Iraola et al., 2015; Wagenaar et al., 2014; Escher et al., 2016; van Samkar et al., 2016; Yen-Hung et al., 2017). Si bien C. fetus es aislado comúnmente de rumiantes, principalmente bovinos y ovinos, también se han identificado cepas de diversas especies de reptiles (Wang et al., 2013) genéticamente divergentes de cepas de origen humano, representando incluso un grupo taxonómico distinto (Tu et al., 2005; Dingle et al., 2010). 11 Fitzgerald et al. (2014) al analizar 58 cepas aisladas de humanos y 55 de reptiles, describieron una nueva subespecie para 13 cepas a la que denominaron C. fetus subsp. testudinum. Los resultados obtenidos a partir de técnicas de ribotipificación (16S rARN), desorción/ionización mediante láser asistida por matriz - acoplada a un analizadortiempo de vuelo (MALDI-TOF MS), electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE), polimorfismos en la longitud de fragmentos amplificados (AFLP), hibridación ADN-ADN y la secuenciación completa del genoma, han demostrado que estas cepas están relacionadas con la especie C. fetus pero se diferencian claramente de las subespecies descriptas hasta el momento (Imagen N° 1.1.2). Si bien la diferenciación fenotípica por pruebas convencionales aún no es clara, por MALDI-TOF MS se identificaron múltiples biomarcadores fenotípicos que distinguirían a C. fetus subsp. testudinum de las subespecies reconocidas de C. fetus. En la actualidad no se han reportado aislamientos de esta nueva subespecie para las cepas de bovinos. Li et al. (2016) reportaron un caso de peritonitis bacteriana espontánea causada por Campylobacter fetus subsp. testudinum en una persona con cirrosis hepática. 12 Imagen N° 1.1.2. Dendograma de correlación entre especies del género Campylobacter (coeficiente de Pearson - UPGMA). (Fitzgerald et al., 2014) 13 Las muestras clínicas enviadas de rutina a los laboratorios de diagnóstico para el aislamiento de C. fetus incluyen: esmegma prepucial, semen criopreservado, mucus cérvico vaginal, placenta, líquido abomasal y órganos parenquimatosos de fetos abortados, siendo de elección el pulmón. Las técnicas para la toma de muestra de esmegma prepucial incluyen el raspaje, el lavado y la aspiración, las muestras de mucus se toman por aspirado con jeringa de Cassou y vainas de inseminación artificial generalmente en el momento de realizar la palpación transrectal o cuando se detectan fallas reproductivas tempranas (Terzolo et al., 1992; Terzolo and Catena, 2007). La técnica utilizada para la recolección de muestras impacta en los resultados del aislamiento. Tedesco et al. (1977) demostraron que el éxito en la detección de C. fetus y el grado de contaminación, se correlacionarían con el método de muestreo mediante la técnica de raspado, aspiración y lavado. Para el primer parámetro evaluado los valores obtenidos fueron de 71,4%, 36% y 25,8%, mientras que para el segundo 33,9%, 63% y 83,9%, respectivamente. Del análisis de los resultados y en concordancia con otros trabajos (Shepler et al., 1963; Clark et al., 1974; Hum et al., 1994; Hum et al., 2009; Chaban et al., 2013), se concluye que el raspaje constituye una de las técnicas de muestreo que otorgarían mayores probabilidades de obtener un resultado positivo a la detección de C. fetus y asimismo, un menor nivel de contaminación. Actualmente, la OIE (2012) incluye todas las opciones como parte del procedimiento recomendado. La naturaleza de crecimiento lento de C. fetus y el potencial desarrollo de los contaminantes presentes en las muestras, determinan que el uso de medios de transporte y enriquecimiento (TEM) sea esencial si las muestras no serán procesadas en el laboratorio el mismo día de su recogida, caso contrario podrán ser transportadas en PBSs. Dentro de los TEMs descriptos se destacan el Caldo Brucella semisólido, Cary-Blair (Garcia et al., 1984; Terzolo et al., 1992; Hum et al., 1994; Monke et al., 2002), Clark (Clark et al., 1974), de Lander (Lander, 1990b) y Thomann Transporte y Enriquecimiento (TTE) (Harwood et al., 2009). El medio de Lander ha sido modificado por Hum et al. (2009) con el objetivo de reducir la concentración de polimixina B debido a las sensibilidades demostradas por algunas cepas de C. fetus subsp. venerealis. El protocolo actual de la OIE recomienda el uso de TEM de Lander para el transporte de los aislamientos de campo para el cultivo de C. fetus subsp. venerealis (OIE, 2012). Para su envío al laboratorio, las muestras deben conservarse a temperatura de refrigeración entre 4 y 10 °C, protegerse de la luz (OIE, 2012) y con atmósfera circundante para ayudar al crecimiento de las bacterias microaerofílicas (Monke et al., 2002). La técnica de IFD para C. fetus es la herramienta utilizada para el diagnóstico de rutina de la campylobacteriosis genital bovina, a partir de muestras de esmegma prepucial. También se 14 puede utilizar en muestras de mucus cérvico vaginal y líquido abomasal pre enriquecidas. La técnica fue evaluada por varios autores considerando el límite de detección, efecto del observador y sensibilidad (Mellick et al., 1965; Soto and di Rocco, 1982; Figueiredo et al., 2002), mientras que la especificidad fue probada para Campylobacter spp., Arcobacter spp., Helicobacter spp., E. coli y otras bacterias de la microbiota prepucial. El límite de detección de la IFD fue 10 4 UFC/mL para PBS y lavados prepuciales sin centrifugación y 10 2 UFC/mL para lavados prepuciales centrifugados; no hubo efecto del observador y la sensibilidad y la especificidad fueron 92,59% y 88,89%, respectivamente (Figueiredo et al., 2002). Su principal limitante es la incapacidad de diferenciar las subespecies de C. fetus ya que ambas tienen antígenos comunes y el conjugado utilizado en esta técnica es a célula entera (Mellick et al., 1965; Soto and di Rocco, 1982; Figueiredo et al., 2002), por lo que no se dispone de información sobre diferenciación de estas dos subespecies a nivel regional (Baldone et al., 2014). El aislamiento y la identificación de las cepas de C. fetus contribuye al estudio epidemiológico, al monitoreo temporal y geográfico en las distintas regiones. Sin embargo, esta metodología no se realiza de forma rutinaria en todos los laboratorios diagnósticos ya que es un microorganismo de crecimiento lento con requerimientos especiales. El aislamiento de C. fetus a partir de las muestras clínicas de interés, se efectúa utilizando medios de cultivo selectivos, atmósferas microaerófilas y una temperatura de incubación adecuada. En las muestras de mucus cérvico vaginal, debido a la presencia de bacterias de la microbiota vaginal y al bajo número de campylobacterias presentes, es recomendable efectuar un pre- enriquecimiento antes de su cultivo en placas de agar selectivo, siendo de elección el medio Brucella semisólido con el agregado de antibióticos (Terzolo et al., 1992; Quinn et al., 2002; Carter, 2004; Vandamme et al., 2005; Terzolo and Catena, 2007; OIE, 2012). Por otra parte, se debe considerar que el esmegma prepucial contiene microorganismos que conforman la microbiota del prepucio y por lo tanto, “competirán” con C. fetus por los nutrientes al momento del cultivo, dificultando de esta manera el aislamiento del microorganismo de interés. La concentración de C. fetus subsp. venerealis presente en muestras prepuciales varía entre 10 2 a 10 5 UFC/mL (Clark, 1971), los cuales cohabitan con microorganismos contaminantes de rápido crecimiento como Pseudomonas spp., Proteus spp., Escherichia coli, Corynebacterium spp., Micrococcus spp. y otra especies patógenas intestinales pertenecientes al género como C. coli y C. jejuni (Ruebke, 1951) y no patógenas como C. bubulus, comensal que se limita a la 15 porción anterior del prepucio, mientras que C. fetus subsp. venerealis se encuentra comúnmente en el fondo de saco prepucial (Samuelson and Winter, 1966). Por tal motivo, para el procesamiento de este tipo de muestras se recomienda la filtración de la muestra con membranas millipore de 0,45 a 0,8µm y el uso de medios de cultivo suplementados con antibióticos como: agar Skirrow con trimetoprim, vancomicina, anfotericina B y polimixina B y agar Preston con trimetoprim, rifampicina, ciclohexamida y polimixina B (Terzolo et al., 1991; Quinn et al., 2002; Carter, 2004; Vandamme et al., 2005; Terzolo and Catena, 2007; OIE, 2012). La filtración como un método de exclusión por tamaño se ha utilizado en numerosos estudios para el aislamiento de diferentes especies de Campylobacter en laboratorios de diagnóstico humano y veterinario para muestras de sangre, contenido intestinal
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