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1 SEMINARIO 9 BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR 2020 PROCESOS METABÓLICOS CELULARES MITOCONDRIAS Y PEROXISOMAS 2 OBJETIVOS GENERALES COMPRENDER E INTEGRAR LOS DIFERENTES PROCESOS BIOQUÍMICOS QUE OCURREN DENTRO DEL ORGANISMO PARA METABOLIZAR LAS PRINCIPALES BIOMOLÉCULAS RELACIONÁNDOLOS CON LA PRODUCCIÓN DE ENERGÍA Y CON LOS COMPONENTES CELULARES QUE PARTICIPAN EN DICHOS PROCESOS. OBJETIVOS ESPECÍFICOS • DIFERENCIAR LAS RUTAS METABÓLICAS DE CARBOHIDRATOS (GLÚSIDOS), LÍPIDOS Y PROTEÍNAS. • CONOCER EL CONSUMO Y PRODUCCIÓN DE ENERGÍA DE ACUERDO A LA SÍNTESIS Y DEGRADACIÓN DE LAS PRINCIPALES BIOMOLÉCULAS. • ASOCIAR LAS DIFERENTES RUTAS METABÓLICAS QUE OCURREN DENTRO DE LA CÉLULA PARA EL ENTENDIMIENTO DEL ACOPLAMIENTO ENERGÉTICO Y METABÓLICO. • CONOCER LA ESTRUCTURA, CICLOS VITALES Y FUNCIONES DE LAS MITOCONDRIAS Y PEROXISOMAS. • CONOCER LOS FUNDAMENTOS Y UTILIDADES DEL FRACCIONAMIENTO SUBMITOCONDRIAL. 3 CONTENIDOS •CONCEPTO DE ENERGÍA: ENERGÍA METABÓLICA, ENERGÍA LIBRE DE GIBBS, ENTROPÍA, ENTALPÍA, PRODUCCIÓN DE ATP. •METABOLISMO DE LOS GLÚSIDOS: GLICÓLISIS Y CICLO DE KREBS. •METABOLISMO DE LÍPIDOS : BETA OXIDACIÓN. •METABOLISMO DE LAS PROTEÍNAS. •TRANSPORTE DE ELECTRONES Y FOSFORILACIÓN OXIDATIVA. •MITOCONDRIA Y PEROXISOMA: ESTRUCTURA, FUNCIONES, CICLO VITAL, TEORÍA ENDOSIMBIÓTICA. •FRACCIONAMIENTO SUBMITOCONDRIAL. 4 ENERGÍA METABÓLICA •La energía metabólica es la energía que obtienen todos los seres vivos a partir de la energía química contenida en los alimentos o nutrientes. •Los organismos transforman la energía química contenida en los enlaces químicos de los alimentos en energía útil para la célula. I. METABOLISMO 5 6 Reacción Química Las enzimas controlan la velocidad de las reacciones químicas. Las leyes de la termodinámica gobiernan el equilibrio químico y determinan la dirección energéticamente favorable en todas las reacciones químicas. Todas las reacciones químicas progresan espontáneamente en la dirección energéticamente favorable acompañadas de un descenso de la energía libre de Gibbs y de un aumento de la Entropía. Muchas de las reacciones químicas que ocurren dentro de la célula son energéticamente desfavorables y sólo pueden producirse con un ingreso adicional de energía. 7 •Energía libre de Gibbs: permite predecir la dirección en forma espontánea de las reacciones químicas . El valor de la energía libre depende de la Entropia y de la Entalpía. 8 • Todas las células animales dependen de energía para crear y mantener el orden ENTROPÍA: Magnitud termodinámica que mide el grado de desorden molecular de un sistema. Los procesos espontáneos ocurren cuando hay aumento de Entropía, mayor desorden. ENTALPÍA: Es el calor que se libra o se absorbe durante una reacción química 9 Las enzimas bajan la energía de activación de las reacciones químicas • Las enzimas (catalizadores biológicos) facilitan el inicio de las reacciones químicas y permiten que ocurran a temperaturas y tiempos compatibles con la vida 10 • La energía se almacena en la naturaleza en los enlaces químicos de las moléculas orgánicas • Las moléculas orgánicas proveen también los átomos para “armar” moléculas – ejemplo del N2 • Todos los animales dependen –al final- de la fijación del C, N2 y de la energía solar por parte de las plantas (en la fotosíntesis) 11 • Los animales se alimentan de plantas o de otros animales para obtener los “building blocks” para sus propias moléculas 12 Las células obtienen energía oxidando moléculas orgánicas • La oxidación es controlada, en pasos secuenciales, que permiten recuperar la mayor parte de la “energía” contenida en los enlaces químicos (diferencia con fuego). • La oxidación implica la pérdida de electrones de las moléculas orgánicas. En las células, estos electrones son transferidos a otras moléculas llamadas carriers. • El estadío final de más baja energía (no puede entregar más) es CO2 para el carbono y H2O para el hidrógeno. 13 Los carriers de alta energía • La energía liberada en la oxidación de las moléculas orgánicas (alimento) se almacena temporariamente en moléculas especializadas. • Estos carriers de alta energía contienen enlaces covalentes de alta energía y pueden migrar rápidamente de un lugar a otro de la célula. • Los carriers estabilizan los electrones “quitados” al alimento y permiten su utilización en otras reacciones celulares. • Ejemplos: ATP, NADPH, NADH, Acetyl-CoA. ATP es el carrier de alta energía más utilizado y versátil • El ATP (adenosin trifosfato) se sintetiza por la adición de fosfato al ADP • Cuando se requiere, el ATP devuelve esa energía dando como productos ADP y fosfato, que se pueden reutilizar en otra ronda de fosforilación 14 Hay diferentes tipos de carriers de alta energía en la célula La energía se utiliza en la célula para reacciones energéticamente desfavorables como la síntesis de largas moléculas ordenadas 15 NADPH y NADH son carriers de alta energía para electrones ATP es el carrier de alta energía más utilizado y versátil 16 ¿Cómo las células obtienen energía de los alimentos? En este esquema el tamaño de la mitocondria no guarda relación espacial real con la superficie que representa al citosol Vamos a ir analizando el esquema que representa varios conceptos importantes 17 ¿Cómo las células obtienen energía de los alimentos? En este esquema el tamaño de la mitocondria no guarda relación espacial real con la superficie que representa al citosol 1) Hay que recordar qué biomoléculas son macromoléculas o polímeros y cuáles sus monómeros Biomoléculas: Monómeros: Polímeros: 18 ¿Cómo las células obtienen energía de los alimentos? En este esquema el tamaño de la mitocondria no guarda relación espacial real con la superficie que representa al citosol 2) En el catabolismo de los monómeros se llega a una molécula común transportadora de energía activada: Acetil COA (UBICADA EN LA MATRIZ MITOCONDRIAL) Sin embargo podemos además observar que en el caso de la GLUCOSA , antes (durante la formación del Piruvato) se producen dos moléculas transportadoras activadas: ATP y NADH 19 ¿Cómo las células obtienen energía de los alimentos? En este esquema el tamaño de la mitocondria no guarda relación espacial real con la superficie que representa al citosol 3) Observemos que hay un gran proceso cíclico (serie de reacciones concatenadas y sucesivas) de degradación oxidativa que generan la mayor proporción de moléculas transportadoras activadas: principalmente NADH, pero también se forma FADH2 Recuerdan qué es un proceso de oxidación? La oxidación es una reacción química donde un elemento pierde electrones, en este caso los electrones perdidos son transferidos a las moléculas transportadoras activadas 20 ¿Cómo las células obtienen energía de los alimentos? En este esquema el tamaño de la mitocondria no guarda relación espacial real con la superficie que representa al citosol 4) Los electrones de las moléculas transportadoras de energía son transferidas a través de complejos multiproteicos que conforman la cadena transportadora de electrones o cadena respiratoria (MEMBRANA MITOCONDRIAL INTERNA), los protones (H+) se concentran en el espacio intermembrana y la transferencia de electrones impulsa la formación de ATP ¿Cómo? Importante repasar qué características tiene la membrana mitocondrial interna respecto a la permeabilidad a H+ (es impermeable, genera diferencia de pH; los H+ pueden ingresar- moverse a través de la subunidad F0 y la rotación-movimiento de la subunidad F1 favorece la síntesis ATP), las crestas expanden la superficie de membrana aumentando la capacidad de generar ATP. 21 II. MITOCONDRIAS Y III. PEROXISOMAS 22 Organelas de importancia en el Metabolismo Oxidativo Mitocondrias Estructura (TES) Funciones (Procesos) Peroxisomas Características y funciones 23 LA MITOCONDRIAOrganización general membrana externamembrana interna crestas matriz Microscopía electrónica de una mitocondria de célula hepática espacio intermembrana ULTRAESTRUCTURA 24 1. TEORÍA ENDOSIMBIÓTICA 25 A nivel de Membranas: Doble membrana. Homología Mesosomas-Crestas. EVIDENCIAS DE LA TEORÍA ENDOSIMBIÓTICA 26 EVIDENCIAS DE LA TEORÍA ENDOSIMBIÓTICA ADN nuclear ADN AGA Arginina Terminación AGG Arginina Terminación AUA Isoleucina Metionina UGA Terminación Triptofano A nivel del ADN Código Genético ADN MITOCONDRIAL CIRCULAR Y DESNUDO TASA DE MUTACIÓN 10 VECES MAYOR QUE EL ADN NUCLEAR. MECANISMOS DE REPARACIÓN DEL ADN ausentes o menos desarrollados EN LAS MITOCONDRIAS. Humana 16kb ; codifica 13 proteínas que participan en transporte de electrones y fosforilacion oxidativa el resto de las proteínas son importadas desde citosol 27 A nivel Ribosómico: -Presencia de ribosomas con menor S. -Inhibición de síntesis proteica por cloranfenicol EVIDENCIAS DE LA TEORÍA ENDOSIMBIÓTICA 28 Inhibidores con selectividad por Procariotas o la mitocondria 29 Mecanismo de división La regulación-coordinación de las múltiples mitocondrias de una misma célula para la realización de estas funciones parece estar relacionada con la dinámica mitocondrial de fusión-fisión. Las mitoncondrias constantemente están realizando fusión y fision entre ellas de acuerdo a los requerimiento celulares. EVIDENCIAS DE LA TEORÍA ENDOSIMBIÓTICA 30 EVIDENCIAS de TEORÍA ENDOSIMBIÓTICA A nivel de ADN •1. ADN circular y desnudo. •2. El ADN no está rodeado por una envoltura. •3. Excepciones al código genético universal. •4. Tasa de mutación diez veces mayor que el ADN nuclear. •5. Mecanismos de reparación del ADN ausentes o menos desarrollados EN LAS MITOCONDRIAS. A nivel de las Membranas •6. Características de las membranas. Doble membrana. •7. Homología Mesosomas-crestas. A nivel Ribosómico: •8. Presencia de ribosomas con menor S. •9. Inhibición de síntesis proteica por cloranfenicol. A nivel del ciclo de vida: •8. Mecanismo de división. Fusión y Fisión. 31 3. MITOCONDRIAS: ESTRUCTURA Y CICLO VITAL 32 Membrana externa : Permeable a solutos del citosol Presencia de Porinas : proteínas que forman poros que dejan pasar moléculas de hasta 5000 Daltons. Ácidos grasos. ADN. ARNs. Ribosomas. Membrana interna: Presencia de Cardiolipina ( hace impermeable la membrana) Proteínas transportadoras de iones, proteínas de fosforilación oxidativa y cadena respiratoria Matriz Mitocondrial Complejo piruvatodeshidrogenasa (Decarboxilación oxidativa) Enzimas del ciclo de Krebs ( Salvo la succunatodeshidrogenasa ) Enzimas de la beta oxidación ácidos grasos. ADN. ARNs. Ribosomas. 33 Respuestas frente al daño del ADN mitocondrial 34 Visión global de los procesos de expresión génica en Eucariotas 35 Direccionamiento, vías de internalización de proteínas en la mitocondria. Proteínas de matriz mitocondrial. Transporte de proteínas de codificación nuclear hacia la mitocondria por medio de chaperonas que mantienen su estructura no plegada. Presentación a los translocadores mitocondriales externos e internos para pasar hacia la matriz donde chaperonas mitocondriales pliegan la estructura terciaria. Proteínas transmembrana. Mediante sus regiones hidrofóbicas pueden translocarse a los lípidos de las membranas externas e internas y participar en funciones mitocondriales Proteínas del espacio intermembrana. Pueden ser translocadas al espacio intermembrana luego de pasar por TOM o reingresar luego de ser plegadas en la matriz mitocondrial Refiere a seminario 7 de direccionamiento de proteínas en la célula 36 MITOCONDRIAS: DISTRIBUCIÓN Y NÚMERO La misma célula fijada y marcada con anticuerpos anti-tubulina, unidos a un fluoróforo Las mitocondrias teñidas con un marcador fluorescente suelen estar asociadas a elementos del citoesqueleto Microscopía electrónica de diferentes células para observar su distribución y localización según las demandas energéticas de la célula. 37 Dinámica mitocondrial y relación con sus funciones La regulación-coordinación de las múltiples mitocondrias de una misma célula para la realización de sus funciones parece estar relacionada con la dinámica mitocondrial de fusión-fisión. 38 Moléculas participantes en los procesos de fusión- fisión mitocondrial (diapo optativa) 39 Herencia mitocondrial: ?? Recordando Fecundación Se reconstituye la diploidía. Ambas gametas aportan sus pronúcleos haploides al cigoto (factor nuclear). El ovocito aporta el factor citoplasmático (mitocondrias) 40 4. Las mitocondrias pueden aislarse mediante fraccionamientos subcelulares clásicos 41 Fraccionamiento sub-mitocondrial 42 5. FUNCIONES MITOCONDRIALES: 1.ENERGÉTICA. SINTESIS DE ATP. 2.PARTICIPACION EN LA ESTEROIDOGÉNESIS. 3.ALMACENAMIENTO DE CALCIO. 4.SINTESIS DE ALGUNOS AMINOACIDOS. 5.PARTICIPACIÓN EN LA APOPTOSIS. 43 5.1.METABOLISMO CELULAR y SÍNTESIS DE ATP Catabolismo de los hidratos de carbono. 1-Glucólisis 3-Ciclo de Krebs (ciclo del ácido citrico) 4-Cadena de transporte de electrones y fosforilación oxidativa Ocurren en las mitocondrias Glucosa a piruvato (en el citoplasma ) 2-Decarboxilación oxidativa. 44 La glucólisis 6 carbonos 2 compuestos de 3 carbonos Los piruvatos entran a las mitocondrias Ocurre en el citoplasma Resultado de la glucólisis: 2 NADH 2 ATP 45 2 e- H+ NAD+ (forma oxidada) NADH (forma reducida) Las coenzimas participan como aceptores temporarios de electrones e- 46 Descarboxilación del piruvato y formación de acetil-CoA piruvat o Acetil-Co A co 2 NAD NADH Decarboxilación oxidativa . Complejo multienzimático que actúa: Piruvatodeshidrogenasa El acetil CoA entra en el ciclo de Krebs 47 Ciclo de Krebs Por cada vuelta del ciclo se obtienen. 2 CO2 1 ATP 3 NADH 1FADH succinato Fumarato * *succinatodeshidrogenasa en la membrana interna 48 Teoría quimiosmótica: Transporte de electrones desde NADH 49 Cadena de transporte de electrones 50 Fosforilación oxidativa 51 A) Síntesis de ATP y B) Bombeo de protones contra un gradiente de protones con hidrólisis de ATP 52 Las grasas pasan a ácidos grasos en el tubo digestivo Los ácidos grasos entran en la célula y las mitocondrias y se degradan por β-oxidación en la matriz mitocondrial CATABOLISMO DE LOS LÍPIDOS Catabolismo de los ácidos grasos: β-oxidación Antes que las proteínas puedan incorporarse a las rutas catabólicas deben experimentar hidrólisis completa hasta transformarse en aminoácidos ya que las moléculas proteicas intactas y la mayoría de los péptidos no pueden atravesar la membrana celular, mientras que los aminoácidos libres son absorbidos fácilmente Metabolismo de las Proteínas Para la oxidación de los 20 aminoácidos diferentes existen 20 secuencias multienzimáticas distintas. En último término todas convergen en unas pocas rutas terminales que conducen al ciclo de los ácidos tricarboxílicos 56 RESUMEN METABOLISMO LÍPIDOS, POLISACÁRIDOS Y PROTEINAS La energía es medida en kilocalorías o kcal. Cantidad de energía que aporta 1 g es distinta en cada caso: 4 kcal por gramo de hidratos de carbono o proteína 9 kcal por gramo de grasa Rapidez con que proporcionan la energía.: los hidratos de carbono son los más rápidos y las grasas son las más lentas 57 5.2. Mitocondria y la Esteroidogénesis Participa en el pasaje de colesterol a pregnenolona y en la última etapa de la síntesis de hormonas esteroides. 58 Mitocondria y la esteroidogénesis Participa en el pasaje de colesterol a pregnenolona y en la última etapa de la síntesis de hormonas esteroides. 5.3. MITOCONDRIA Y ALMACENAMIENTO DE CALCIO La mitocondria juega un papel fundamental en la homeostasis de calcio. El calcio (Ca2+) es un catión muy importante en los organismos actúa comosegundo mensajero en diversas cascadas de señalización y media muchas funciones dentro de las células La acumulación de Ca2+ en la mitocondria se ve contrarrestada por los intercambiadores mitocondriales Na+ /Ca2+ (mNCX) y H+ /Ca2+ Por otro lado, el incremento en la [Ca2+]mit junto con la acumulación de especies reactivas de oxígeno (ROS) favorecen la liberación al citosol de factores mitocondriales, como el citocromo c o el factor inductor de apoptosis (AIF), que forman con las caspasas efectoras una maquinaria macromolecular (apoptosoma) que lleva a las células a la muerte celular apoptótica 61 5.4. PARTICIPACION DE LA MITOCONDRIA EN LA MUERTE CELULAR PROGRAMADA O APOPTOSIS La mitocondria participa mediante la liberación de citocromo C del espacio intermembranoso y de la Proteína SMAC/diablo. La primera forma estabiliza el apoptosoma que estimula el pasaje de procaspasa 3 a caspasa 3. Muerte celular programada donde la célula forma cuerpos apoptóticos envueltos en membrana (globos) sin liberación de contenido al extracelular ni activación de respuestas inflamatorias 62 PARTICIPACION DE LA MITOCONDRIA EN LA MUERTE CELULAR PROGRAMADA O APOPTOSIS La segunda a través de la proteína Smac/Diabolo inhibe a la proteína IAP (Proteína Inhibitoria de la Apoptosis) reduciendo la capacidad de inhibir la apoptosis. 63 6. Organos más afectados en disfunciones mitondriales y/o en alteraciones de procesos de fision-fusion 64 III. Los peroxisomas Poseen enzimas (D-aminoácido oxidasa, urato oxidasa) que oxidan distintos sustratos, produciendo peróxido de hidrógeno (H2O2) como subproducto. Además, poseen la enzima catalasa que degrada el H2O2 Son sitios en donde ocurre β-oxidación En los peroxisomas animales ocurren las primeras reacciones que conducen a la formación de los plasmalógenos (fosfolípidos presentes en la mielina). Las enzimas peroxisomales provienen del citosol y sus membranas del REL. 65 Peroxisomas Microscopía electrónica de peroxisomas en una célula hepática. Las formaciones electrodensas corresponden a la enzima urato oxidasa Crecimiento y división de los peroxisomas. 66 Oxidación de ácidos grasos en los peroxisomas y rol de la catalasa. Estructura de un plasmalógeno.
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