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BIOLOGIA CELULAR 1 Práctica 14: Genética. ESTRATEGIAS DE ENSEÑANZA-APRENDIZAJE PARA DESARROLLAR LA PRÁCTICA Fase de apertura. Tiempo: 10 min 1. Toma la asistencia en aula virtual. 2. El docente declara las capacidades a desarrollar: a. Clasifica los tipos de mutaciones según su origen, su efecto células afectadas y extensión del material genético afectado. 3. Explicación de la práctica por parte del docente. Fase de Desarrollo. Tiempo: 65 min Realización de la práctica. I. INTRODUCCIÓN. La biología molecular, entendida hoy en día como el área de estudio de las moléculas de ácido desoxirribonucleico (ADN) y de ácido ribonucleico (ARN), es un campo que vincula diferentes aproximaciones en el funcionamiento de cualquier organismo vivo. A nivel molecular, el ADN y el ARN están encargados de preservar y traducir a proteína la información necesaria para el funcionamiento celular, acompañado de los lípidos y carbohidratos, que en conjunto con las proteínas estructuran, mantienen y dinamizan el complejo molecular conocido como célula. La molécula de ADN, es un polímero cuyas subunidades son los nucleótidos adenina (A), citosina (C), guanina (G) y timina (T), puede replicarse y de esta manera permitir la conservación de la información desde la célula madre a sus células hijas. Pero la replicación no es el único proceso que sufre el ADN, también ocurren una serie de procesos que, tomando el ADN como molde, participan en la síntesis de proteínas – moléculas de extraordinaria versatilidad e importancia para la composición y funcionamiento de los organismos. Los procesos a los que se hace referencia son la transcripción y la traducción. El primero de ellos está implicado en la síntesis de otro polímero, el ácido ribonucleico o ARN, a partir del ADN, mientras que el segundo toma al ARN como molde para la síntesis de proteínas. A esta serie de procesos se le conoce como el flujo de la información genética. Es por tanto comprensible que si se produce un cambio en un nucleótido del ADN o falta un nucleótido en un gen, esto se refleje finalmente en la proteína. La mayor diferencia entre los genes de algunos organismos, como el ser humano, y los genes de otros organismos es que, en los primeros, las secuencias de los genes combinan unas secuencias que dan lugar a proteínas (exones) con otras que no lo hacen (intrones). La colocación inusual de los intrones, interrumpiendo las regiones codificadoras de los genes, y el hecho de que se requiere energía extra para mantener y procesar estas estructuras que aparentemente no tienen ninguna función, han hecho de los intrones uno de los temas de investigación más intrigantes en la biología. El término mutación suele aludir a cambios en la secuencia de bases del ADN que pueden ocurrir tanto en las regiones codificadas como en las no codificadas (principalmente en zonas próximas al sitio de corte y empalme que permite eliminar los intrones –splicing– y en zonas reguladoras que podrían afectar a la tasa de producción de proteínas). Las mutaciones pueden ser silenciosas y no tener efecto alguno en la proteína resultante o dar lugar a enormes cambios. Las mutaciones pueden ser: MUTACIONES GÉNICAS Y GENÓMICAS Semana 15 BIOLOGIA CELULAR 2 Práctica 14: Genética. 1) Mutación puntual.- ✓ Si el nuevo triplete (codón) codifica el mismo aminoácido que el original esta mutación es neutra o “silenciosa”. Por ejemplo, el codón CUA que podría por una mutación convertirse en CUG, en ambos casos este codón codifica el aminoácido leucina (Leu). ✓ Si el nuevo triplete codifica un aminoácido diferente del original, tenemos varias posibilidades: ▪ Mutaciones de sentido erróneo o alterado (mutación “missense”): - El nuevo aminoácido es de un tipo químico similar. Por ejemplo, el triplete GAC (codi- fica ácido aspártico) que pasa a GAA (codifica ácido glutámico). - El nuevo aminoácido es de un tipo químico muy distinto y/o afecta a un sitio especial en la proteína, llevando a cabo o inestabilidad estructural o alteración en la estructura secundaria o inactivación. ▪ Mutaciones “sin sentido” (mutación “nonsense”): - La mutación cambia el triplete por uno de “señal de parada” de la traducción: UAG, UAA, UGA con la terminación prematura de la proteína. 2) Mutaciones de desplazamiento del marco de lectura (“frameshifts”) Se pueden originar por pérdida o ganancia de un pequeño número de nucleótidos (que no sea 3 o múltiplo de 3), de este modo se produce un cambio total en el sentido del mensaje genético, a partir del sitio de la mutación se sintetiza una proteína distinta, inactiva y a menudo truncada. II. MATERIAL. Papel bond A-4, código genético, lapiceros, borrador III. INSTRUCCIONES. Desarrolle los siguientes ejercicios. 1. Carlitos, de 7 años, concurre al consultorio acompañado de su madre. Ella relata al odontólogo que el niño padece una enfermedad hereditaria llamada Fibrosis quística (FQ), debido a la cual presenta problemas respiratorios crónicos y se encuentra bajo tratamientos destinados a paliar los efectos de la afección. Esta patología se debe a la presencia de una proteína defectuosa que interviene en el paso del cloruro a través de las membranas celulares (canal iónico de cloruro). En todas las proteínas de los organismos vivientes, como también en cualquier patología genética, existe una correspondencia entre la secuencia del ADN y la estructura primaria de la proteína en la que participa el código genético, a través de una secuencia de pasos específicos. Escribe las secuencias de ADN, ARNm y proteína de la secuencia normal y mutada. Utilice el código genético. Secuencia Normal: 5´- ACCATTAAAGAAAATATCATCTTTGGTGTTTCCTATGAT - 3 ADN 5´- A C C A T T A A A G A A A A T A T C A T C T T T G G T G T T T C C T A T G A T - 3´ 3´- - 5´ ARN Proteína Secuencia Mutada: 5´- ACCATTAAAGAAAATATCATCGGTGTTTCCTATGAT - 3 ADN 5´- A C C A T T A A A G A A A A T A T C A T C G G T G T T T C C T A T G A T - 3´ 3´- - 5´ ARN Proteína BIOLOGIA CELULAR 3 Práctica 14: Genética. 2. La dentinogénesis imperfecta es una distrofia de origen genético que afecta la estructura del diente temporal y permanente. Presenta una herencia autosómica dominante. Existen 3 tipos de esta enfermedad pero sólo en las II y III se han encontrado mutaciones en el gen DSPP. El gen DSPP está formado por cinco exones y cuatro intrones y codifica para la síntesis de dos proteínas: dentinsialoproteína (DSP) y dentinfosfoproteína (DPP). Se cree ambas que son esenciales para el desarrollo normal del diente. Estas proteínas se expresan en los odontoblastos y están involucradas en la formación normal y mineralización de la dentina. DPP se une al Calcio por lo que se cree que juega un rol clave en la nucleación de la hidroxiapatita durante la calcificación de la dentina. Dadas las secuencias de nucleótidos del gen DSPP; represente el fragmento de ARNm y la secuencia de aminoácidos correspondientes y describa el tipo de mutación que se produce en la secuencia. Secuencia Normal: 3´TACGATCAAACCTCGAAC 5´ ADN 5´ - 3´ 3´- T A C G A T C A A A C C T C G A A C - 5´ ARN Proteína Secuencia Mutada: 3´TACGATCAAACATCGAAC5´ ADN5´ - 3´ 3´- T A C G A T C A A A C C T C G A A C - 5´ ARN Proteína Tipo de mutación 3. Tomás, paciente de 15 años, presenta oligodoncia. Se le ha realizado un estudio genético en el cual se ha amplificado la región del ADN del exón 1 del gen MSX1. Al analizar la secuencia de este exón, se ha encontrado una mutación puntual (resaltado en gris). En la parte inferior se muestra la secuencia de ADN en el sentido 5´ → 3´ del exón 1 normal (1º secuencia) y del exón 1 con la mutación encontrada (2º secuencia). a. Indica cuál será la secuencia de la otra cadena de ADN, el ARNm y aminoácidos en la proteína normal en la región del exón (comprendida entre los codones – en rojo). Secuencia normal del exón 1 del gen MSX1 obtenida de la base de datos Genebank (NG_008121- Homo sapiens). Las letras mayúsculas constituyen la secuencia del exón 1. En letras minúsculas se representan las secuencias correspondientes a la región promotora (a 5´) y al intrón 1 (a 3´). El triplete ATG, resaltado en negrita, codifica el aminoácido metionina, que es el 1º aminoácido de todas las proteínas eucarióticas. aagttctctggggagccgcggtagggcccggagccgGCGAGTGCTCCCGGGAACTCTGCCTGCGCGGCGGCAGCGACC GGAGGCCAGGCCCAGCACGCCGGAGCTGGCCTGCTGGGGAGGGGCGGGAGGCGCGCGCGGGAGGGTCC GCCCGGCCAGGGCCCCGGGCGCTCGCAGAGGCCGGCCGCGCTCCCAGCCCGCCCGGAGCCCATGCCCGG CGGCTGGCCAGTGCTGCGGCAGAAGGGGGGGCCCGGCTCTGCATGGCCCCGGCTGCTGAC ATGACTTCT TTGCCACTCGGTGTCAAAGTGGAGGACTCCGCCTTCGGCAAGCCGCCTGGGAGATCAGCGGGCCAGGCC CCCAGCGCCGCCGCGGCCACGGCAGCCGCCATGGGCGCGGACGAGGAGGGGGCCAAGCCCAAAGTGTCC CCTTCGCTCCTGCCCTTCAGCGTGGAGGCGCTCATGGCCGACCACAGGAAGCCGGGGGCCAAGGAGAGCG CCCTGGCGCCCTCCGAGGGCGTGCAGGCGGCGGGTGGCTCGGCGCAGCCACTGGGCGTCCCGCCGGGGT BIOLOGIA CELULAR 4 Práctica 14: Genética. CGCTGGGAGCCCCGGACGCGCCCTCTTCGCCGCGGCCGCTCGGCCATTTCTCGGTGGGGGGACTCCTCAA GCTGCCAGAAGATGCGCTCGTCAAAGCCGAGAGCCCCGAGAAGCCCGAGAGGACCCCGTGGATGCAGAG CCCCCGCTTCTCCCCGCCGCCGGCCAgtgagtagccagaacccaggcgcagagggagggggccgggtgggggccgggtggggt gtg ADN 5´- GAC TCC GCC TTC GGC AAG CCG CCT GGG AGA TCA GCG GGC CAG GCC – 3’ ARN Proteína b. Indica cómo se verá modificada la secuencia del ARNm y aminoácidos en la proteína mutada en la región del exón (comprendida entre los codones – en rojo). Secuencia mutada del exón 1 del gen MSX1. aagttctctggggagccgcggtagggcccggagccgGCGAGTGCTCCCGGGAACTCTGCCTGCGCGGCGGCAGCGACC GGAGGCCAGGCCCAGCACGCCGGAGCTGGCCTGCTGGGGAGGGGCGGGAGGCGCGCGCGGGAGGGTCC GCCCGGCCAGGGCCCCGGGCGCTCGCAGAGGCCGGCCGCGCTCCCAGCCCGCCCGGAGCCCATGCCCGG CGGCTGGCCAGTGCTGCGGCAGAAGGGGGGGCCCGGCTCTGCATGGCCCCGGCTGCTGAC ATGACTTCT TTGCCACTCGGTGTCAAAGTGGAGGACTCCGCCGTCGGCAAGCCGCCTGGGAGATCAGCGGGCCAGGCC CCCAGCGCCGCCGCGGCCACGGCAGCCGCCATGGGCGCGGACGAGGAGGGGGCCAAGCCCAAAGTGTCC CCTTCGCTCCTGCCCTTCAGCGTGGAGGCGCTCATGGCCGACCACAGGAAGCCGGGGGCCAAGGAGAGCG CCCTGGCGCCCTCCGAGGGCGTGCAGGCGGCGGGTGGCTCGGCGCAGCCACTGGGCGTCCCGCCGGGGT CGCTGGGAGCCCCGGACGCGCCCTCTTCGCCGCGGCCGCTCGGCCATTTCTCGGTGGGGGGACTCCTCAA GCTGCCAGAAGATGCGCTCGTCAAAGCCGAGAGCCCCGAGAAGCCCGAGAGGACCCCGTGGATGCAGAG CCCCCGCTTCTCCCCGCCGCCGGCCAgtgagtagccagaacccaggcgcagagggagggggccgggtgggggccgggtggggt gtg ADN 5´- GAC TCC GCC GTC GGC AAG CCG CCT GGG AGA TCA GCG GGC CAG GCC - 3’ ARN Proteína Tipo de mutación c. Considere que en el fragmento destacado del exón 1 normal del gen MSX1 (resaltado en gris) se produce el siguiente cambio en el ADN, una mutación sin sentido -nonsense. Establece cómo quedaría constituida, la secuencia de ADN, el ARNm y a proteína. ¿Cómo crees que afecte este cambio a la función de la proteína MSX1? ADN 5´… GCC TTC GGC AAG CCG CCT GGG AGA TGC GCG …3´ ARN Proteína d. Considere que en el fragmento destacado del exón 1 normal del gen MSX1 se produce el siguiente cambio en el ADN, mutación: inserción de 3 bases. Establece cómo quedaría constituida, la BIOLOGIA CELULAR 5 Práctica 14: Genética. secuencia de ADN, el ARNm y a proteína. ¿Cómo crees que afecta este cambio a la función de la proteína MSX1? ADN 5´… GCC TTC AGT GGC AAG CCG CCT GGG AGA TCA GCG …3´ ARN Proteína e. Considere que en el fragmento destacado del exón 1 normal del gen MSX1 se produce el siguiente cambio en el ADN, mutación: inserción de 1 base. Establece cómo quedaría constituida, la secuencia de ADN, el ARNm y a proteína. ¿Cómo crees que afecta este cambio a la función de la proteína MSX1? ADN 5´… GCC TTC GGC AAG ACC GCC TGG GAG ATC AGC G …3´ ARN Proteína 4. El gen de la tropomiosina humana, una proteína estructural, por splicing alternativo produce cinco versiones distintas de esta molécula, que se expresan en cinco tejidos diferentes del cuerpo: el músculo esquelético, el músculo liso, los fibroblastos, el hígado y el cerebro. Las células, en cada tipo de tejido, ensamblan de forma diferente los 11 exones que conforman el gen, produciendo las distintas formas de la proteína. Tomando hipotéticamente la secuencia del gen mostrada abajo, realiza el splicing alternativo y verifica la síntesis de dos diferentes proteínas que podrían formarse a partir de una misma secuencia en el ADN. En la secuencia hipotética se resaltan en gris las secuencias correspondientes a los exones 1, 2, 3 y 4, intercalados por la secuencia de los intrones 1, 2 y 3. En ese caso, la proteína resultante correspondería a los exones 1, 2, 3 y 4. 5´… TTTCCACGTACG AGCGCCTGG GAGATC AGCGGCAACCTG CAGGCA CCGAT AGTCTTGCC …3´ 3´… AAAGGTGCATGC TCGCGGACC CTCTAG TCGCCGTTGGAC GTCCGT GGCTA TCAGAACGG…5´ exón 1 intrón 1 exón 2 intrón 2 exón 3 intrón 3 exón 4 a. Considere que la proteína resultante corresponde a la secuencia hipotética los exones 1, 3 y 4. ADN ARN Proteína b. Considere que la proteína resultante corresponde a la secuencia hipotética los exones 2 y 4. ADN ARN Proteína BIOLOGIA CELULAR 6 Práctica 14: Genética. 5. Jaimito es un niño de 11 años, que padece Síndrome de Down. Asiste junto a su madre al consultorio externo de la posta de su barrio para realizarse un control. La forma más frecuente de Síndrome de Down ocurre por una no disyunción o disyunción incompleta del material genético de uno de los progenitores, que ocurre durante la gametogénesis. Realiza un gráfico con referencias del par 21, que te permita analizar los diferentes gametos que se formarán si ocurre una no disyunción durante la primera o la segunda división meiótica (anafase I versus anafase II). 6. Utilizando los dos cromosomas. Represente lo siguiente. a. Una deleción intersticial del crom. 1 (mayor tamaño) b. Una duplicación en el cromosoma 2 (menor tamaño) c. Una inversión pericéntrica en cromosoma 1 d. Una translocación recíproca entre cro. 1 y cro. 2 Fase de cierre. Tiempo: 25 min ✓ Se concluye la práctica con una retroalimentación docente-alumno y el docente refuerza cualquier duda de los estudiantes. ✓ El docente señala que la siguiente clase será el examen parcial, recomienda a los estudiantes estudiar para dicho examen. Evidencia. - Informe de la práctica. Instrumento de evaluación. - Rúbrica para evaluar el informe. Fuentes de Consulta Páginas WEB de apoyo. BECKER W. HARDIN J. KLEINSMITH L. El Mundo de la Célula. 6ª ed. Editorial Pearson Prentice Hall. COOPER G. La Célula. 6° ed. Cápitulo 13: Membrana Plasmática. Editorial Marbán. 2014:794p. LODISH H., et. al. Biología Celulary Molecular. 5ª. ed. Madrid: Editorial Médica Panamericana S.A.. Biología Celular en Odontología. https://rdu.unc.edu.ar/bitstream/handle/11086/15915/Biolog%C3%ADa%20celular%20e n%20odontolog%C3%ADa.pdf?sequence=3&isAllowed=y https://rdu.unc.edu.ar/bitstream/handle/11086/15915/Biolog%C3%ADa%20celular%20en%20odontolog%C3%ADa.pdf?sequence=3&isAllowed=y https://rdu.unc.edu.ar/bitstream/handle/11086/15915/Biolog%C3%ADa%20celular%20en%20odontolog%C3%ADa.pdf?sequence=3&isAllowed=y
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