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© Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA Ramón Bordes González Catedrático de Bioquímica. Doctor en Ciencias Quí- micas. E.U. de Ciencias de la Salud. Universidad de Granada. Francisco Javier Calderón Montero Profesor Titular de Fisiología. Doctor en Medicina y Cirugía. INEF. Madrid. Fernando de Jesús Franco Profesor Titular de Farmacología. Doctor en Farma- cia. Universidad Alfonso X el Sabio. Madrid. Rosa Olmo López Profesora de Bioquímica y Biología Molecular. Es- cuela Universitaria de Enfermería y Fisioterapia. “San Juan de Dios” integrada en la Universidad Pontificia de Comillas. Doctora en Ciencias Quími- cas (Bioquímica). Belén Castel Segui Médico Adjunto del Hospital Universitario San Du- reta. Palma de Mallorca. César Teijón López Profesor de Bioquímica y Biología Molecular. Doc- tor en Medicina y Cirugía. Colaborador Honorífico Dpto. de Bioquímica. Universidad Alfonso X El Sa- bio. Madrid. Ricardo Ruiz Villaverde Doctor en Medicina y Cirugía. Facultativo Especia- lista del Complejo Hospitalario de Jaén. Jesús Javier Rojo González Profesor Titular de Anatomía. Doctor en Medicina y Cirugía. INEF. Madrid. Amando Garrido Pertierra Catedrático de Bioquímica y Biología Molecular. Doctor en Ciencias Químicas y Farmacia. Universi- dad Complutense de Madrid. Académico de la Real Academia de Doctores y de la Real Academia de Farmacia. Carmen Villaverde Gutiérrez Catedrática de Fisiología. Doctora en Medicina y Cirugía. Escuela Universitaria de Ciencias de la Sa- lud. Universidad de Granada. Mª Dolores Blanco Gaitán Profesora Titular de Universidad de Bioquímica y Biología Molecular. Doctora en Ciencias Biológicas. Universidad Complutense de Madrid. José Mª Teijón Rivera Catedrático de Bioquímica y Biología Molecular. Catedrático de Física y Química de I.B. Doctor en Ciencias Químicas. Universidad Complutense de Madrid. Carlos Mendoza Otras Catedrático de Ciencias Fisiológicas. Doctor en Ciencias Biológicas. Escuela Universitaria de Cien- cias de la Salud. Universidad de Granada. Jesús Ramírez Rodrigo Profesor de Bioquímica y Fisiología. Doctor en Ciencias Biológicas. Escuela Universitaria de Enfer- mería de Ceuta. Universidad de Granada. COLABORADORES AUTORES Amando Garrido Pertierra Catedrático de Bioquímica y Biología Molecular. Doctor en Ciencias Químicas y Farmacia. Universi- dad Complutense de Madrid. Académico de la Real Academia de Doctores y de la Real Academia de Farmacia. José Mª Teijón Rivera Catedrático de Bioquímica y Biología Molecular. Catedrático de Física y Química de I.B. Doctor en Ciencias Químicas. Universidad Complutense de Madrid. COORDINACIÓN Y DIRECCIÓN CIENTÍFICA © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial Datos de catalogación bibliográfica: FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA 3ª edición Amando Garrido Pertierra José María Teijón Rivera EDITORIAL TÉBAR, S.L., Madrid, año 2006 ISBN digital: 978-84-7360-459-8 Materias: 577, Bioquímica Formato: 165 × 240 mm Páginas: 422 www.editorialtebar.com Todos los derechos reservados. Queda prohibida, salvo excepción prevista en la Ley, cualquier forma de reproduc- ción, distribución, comunicación pública y transformación de esta obra sin contar con la autorización expresa de Editorial Tébar. La infracción de estos derechos pue- de ser constitutiva de delito contra la propiedad intelectual (arts. 270 y siguientes del Código Penal). Fundamentos de Bioquímica Metabólica 3ª edición 2009 © 2006 Editorial Tébar, S.L. C/ de las Aguas, 4 28005 Madrid (España) Tel.: 91 550 02 60 Fax: 91 550 02 61 pedidos@editorialtebar.com www.editorialtebar.com ISBN digital: 978-84-7360-459-8 Depósito legal: Diseño editorial: Rebeca Irazábal Diseño de portada: Omega Estudio Gráfico © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial Prólogo La Ciencia avanza, por una parte con nuevos conceptos y teorías y, por otra, con la invención de nuevos métodos e ins- trumentos. El afán y la curiosidad natural de los hombres por conocer la naturaleza de los seres vivos les llevó, desde los al- bores de su existencia, a la observación directa de los organis- mos enteros y sus partes más visibles y, en la mayoría de las ocasiones, se ayudaban de materiales que utilizaban en sus ta- reas domésticas como cuchillos y tijeras. Siglos después, la in- vención y el desarrollo del microscopio permitió estudiar los te- jidos y establecer el hecho general de que todos los seres están formados por un gran número de unidades vivas denominadas células y surgió la teoría celular. Estas observaciones aunque importantes no proporcionaron respuestas a cuestiones funda- mentales como ¿qué sustancias componen los seres vivos? y ¿cómo obtienen los organismos la energía y la utilizan para manifestar las propiedades de la vida? Las respuestas a estas preguntas se encuentran en la Bioquímica. La Bioquímica es una ciencia que estudia los seres vivos a nivel molecular. Uno de sus objetivos es el aislamiento de com- puestos de los seres vivos y la determinación de sus estructuras; esto es, un tipo de microanatomía que dilucida la estructura a la diminuta escala molecular. Por ello su desarrollo ha estado muy condicionado a la invención y desarrollo de nuevas técni- cas e instrumentos. Éstos han permitido a esta ciencia identifi- car las moléculas que constituyen los organismos, las reaccio- nes que transforman unas sustancias en otras y los procesos que les permiten desarrollar las actividades vitales. De esta for- ma, la descripción y el estudio de la inmensa mayoría de los procesos vitales pueden expresarse mediante conceptos, méto- dos y procedimientos bioquímicos. Se ha comprobado que a nivel molecular no hay grandes diferencias entre los organis- mos y ello ha dado lugar a la teoría de la unidad bioquímica de la vida. En los últimos años la utilización de refinadas técnicas moleculares ha permitido caracterizar la naturaleza del material hereditario. Los estudios sobre los genomas de los organismos han refrendado la utilización de moléculas para describir los © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial procesos de la vida, su evolución y su variedad. El conocimien- tos de los genes, su descripción y, sobre todo, su comprensión está posibilitando entender los aspectos morfológicos, la evolu- ción de las especies, el comportamiento de sus productos y la función y disfunción de ellos. Además está permitiendo contro- lar el desarrollo y la diferenciación de los órganos, el metabolis- mo y proliferación de las células y, lo que es muy importante, descifrar la causa y el origen de muchas enfermedades. Con la idea de facilitar la comprensión de dichos procesos y mecanismos vitales a los estudiantes de las licenciaturas y di- plomaturas de Ciencias de la Salud y, basado en la experiencia como profesores de la materia, han surgido estos libros de Bio- química. El primero se dedica a los aspectos estructurales y en él se describen las sustancias, sus propiedades y las funciones que realizan en el organismo; en el segundo se tratan los aspec- tos metabólicos, y en él se estudian las transformaciones de las sustancias las cuales sirven para el funcionamiento normal del organismo. Al inicio de cada tema se incluye una pequeña in- troducción que fija el (o los) objetivo(s) a cumplir y, al final, un resumen que repasa los conceptos más importantes y un apar- tado dedicado a aplicaciones clínicas en el que se describen al- gunos casos prácticos relativos al contenido del mismo. Losautores desean expresar su agradecimiento a todos los que han participado en la elaboración de la obra. Las críticas, sugerencias y comentarios acerca de los contenidos de la mis- ma serán bien recibidos y tenidos en cuenta en ediciones pos- teriores. Queremos agradecer la magnífica labor editorial desarrolla- da por Beatriz Heras de Editorial Tébar, y la excelente maque- tación de Rebeca Irazábal. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial Tema 1: Metabolismo ...................................................................... 13 Introducción al metabolismo ................................................. 13 Reacciones catabólicas y anabólicas: etapas ......................... 14 El flujo de energía en las células ........................................... 16 La localización de las rutas metabólicas en la célula ............. 17 Regulación del metabolismo ................................................. 18 Resumen ............................................................................... 19 Aplicaciones clínicas .............................................................. 19 Tema 2: La ruta glucolítica ............................................................. 21 La ruta glucolítica ................................................................. 21 Las rutas de los átomos de carbono, la de la energía y la de los electrones ............................................................. 27 Rutas afluentes de la glucolítica ............................................. 28 La regulación de la glucólisis ................................................. 30 Resumen ............................................................................... 31 Aplicaciones clínicas .............................................................. 31 Tema 3: El ciclo de Krebs ............................................................... 33 La reacción del complejo piruvato deshidrogenasa ............... 33 El ciclo de Krebs: reacciones y regulación ............................. 37 Reacciones anapleróticas ...................................................... 40 Resumen ............................................................................... 42 Aplicaciones clínicas .............................................................. 43 Tema 4: La ruta de las pentosas fosfato ...................................... 45 La ruta de las pentosas fosfato .............................................. 45 Etapa I .................................................................................. 45 Etapa II ................................................................................. 46 Rendimiento energético ........................................................ 49 Regulación de la ruta ............................................................ 51 Resumen ............................................................................... 51 Aplicaciones clínicas .............................................................. 52 Tema 5: Gluconeogénesis Glucogénesis-glucogenólisis ............ 53 Gluconeogénesis ................................................................... 53 Regulación de la ruta gluconeogénica ................................... 57 Glucogénesis y glucogenólisis ................................................ 59 Los ciclos de substrato .......................................................... 65 Resumen ............................................................................... 67 Aplicaciones clínicas .............................................................. 67 Tema 6: Metabolismo Lipídico ....................................................... 71 Digestión, movilización y transporte de los lípidos ................ 71 �-oxidación de los ácidos grasos ........................................... 75 Rendimiento energético de la oxidación de los ácidos grasos ............................................................................. 81 Control de la oxidación de los ácidos grasos ......................... 86 Resumen ............................................................................... 88 Aplicaciones clínicas .............................................................. 89 Índice © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial Tema 7: Formación de cuerpos cetónicos. Cetosis o cetogénesis .................................................................. 91 Formación de cuerpos cetónicos. Cetosis o cetogénesis ........ 91 Resumen ............................................................................... 96 Aplicaciones clínicas .............................................................. 97 Tema 8: Biosíntesis de ácidos grasos ........................................... 99 Biosíntesis de ácidos grasos .................................................. 99 Biosíntesis de ácidos grasos saturados a partir de Acetil-CoA ...................................................................... 100 El complejo ácido graso sintasa ............................................ 110 Control de la síntesis de ácidos grasos .................................. 111 Resumen ............................................................................... 113 Aplicaciones clínicas .............................................................. 113 Tema 9: Metabolismo de acilgliceroles y esfingolípidos ........... 115 Metabolismo de triacilgliceroles ............................................. 115 Hidrólisis y movilización de triacilgliceroles ........................... 117 Metabolismo de glicerofosfolípidos ........................................ 118 Metabolismo de esfingolípidos .............................................. 123 Resumen ............................................................................... 126 Aplicaciones clínicas .............................................................. 127 Tema 10: Metabolismo del colesterol ............................................. 129 Biosíntesis del colesterol ........................................................ 129 Transporte y excreción de colesterol ...................................... 132 Regulación de la biosíntesis de colesterol .............................. 133 Resumen ............................................................................... 134 Aplicaciones clínicas .............................................................. 135 Tema 11: Metabolismo de los derivados del colesterol ............... 137 Síntesis de hormonas esteroideas .......................................... 137 Síntesis de ácidos biliares ...................................................... 139 Circulación enterohepática de las sales biliares ..................... 141 Síntesis de vitamina D ........................................................... 141 Resumen ............................................................................... 142 Aplicaciones clínicas .............................................................. 143 Tema 12: Lipoproteínas ..................................................................... 145 Lipoproteínas ........................................................................ 145 Receptores de lipoproteínas .................................................. 147 Metabolismo de las lipoproteínas .......................................... 148 Regulación de los depósitos de colesterol en el organismo .... 153 Resumen ............................................................................... 155 Aplicaciones clínicas .............................................................. 156 Tema 13: Aspectos bioquímicos de la nutrición ........................... 157 Requerimientos proteicos de la dieta ..................................... 158 Digestión de las proteínas. Activación de enzimas proteolíticas ....................................................................160 Absorción de péptidos y aminoácidos ................................... 164 Resumen ............................................................................... 165 Aplicaciones clínicas .............................................................. 166 Tema 14: Degradación de los aminoácidos ................................... 169 Transaminación y degradación oxidativa .............................. 169 Destino de los esqueletos carbonados de los aminoácidos .... 173 Resumen ............................................................................... 190 Aplicaciones clínicas .............................................................. 191 Tema 15: Excreción del nitrógeno proteico ................................... 193 Excreción del nitrógeno proteico ........................................... 193 Ciclo de la urea ..................................................................... 196 Conexión entre el ciclo de la urea y el ciclo de Krebs ............ 198 © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial Resumen ............................................................................... 198 Aplicaciones clínicas .............................................................. 199 Tema 16: Biosíntesis de aminoácidos ............................................. 203 Biosíntesis de amioácidos no esenciales ................................ 203 Biosíntesis de amioácidos esenciales ..................................... 208 Resumen ............................................................................... 215 Aplicaciones clínicas .............................................................. 216 Tema 17: Biosíntesis de porfirinas .................................................. 217 Biosíntesis de porfirinas y del grupo hemo ............................ 217 Regulación ............................................................................ 220 Formación de pigmentos biliares ........................................... 221 Resumen ............................................................................... 223 Aplicaciones clínicas .............................................................. 223 Tema 18: Metabolismo de los nucleótidos: biosíntesis y degradación ........................................................................ 225 Digestión de purinas y pirimidinas: vías de recuperación o salvamento ..................................................................... 226 Biosíntesis de novo de los nucleótidos de purina .................. 228 Biosíntesis de novo de nucleótidos de pirimidina .................. 234 Síntesis de desoxirribonucleótidos ......................................... 237 Biosíntesis de los desoxirribonucleótidos de timina ............... 242 Degradación de purinas: síntesis de ácido úrico .................... 243 Degradación de pirimidinas .................................................. 246 Fármacos anticancerosos que bloquean las vías de biosíntesis de nucleótidos ............................................... 246 Resumen ............................................................................... 249 Aplicaciones clínicas .............................................................. 251 Tema 19: Integración del metabolismo en mamiferos ................. 255 Absorción, transporte y regulación ........................................ 255 Bases bioquímicas de la nutrición ......................................... 261 Resumen ............................................................................... 266 Aplicaciones clínicas .............................................................. 267 Tema 20: Características metabólicas de los principales órganos ............................................................................... 269 Hígado .................................................................................. 269 Cerebro ................................................................................. 272 Corazón ................................................................................ 273 Riñón .................................................................................... 273 Músculo esquelético .............................................................. 273 Resumen ............................................................................... 276 Aplicaciones clínicas .............................................................. 276 Tema 21: La regulación hormonal del metabolismo .................... 279 La acción de las hormonas ................................................... 279 Hormonas activas en la superficie celular ............................. 280 Receptores ............................................................................ 280 Segundos mensajeros ............................................................ 282 Hormonas activas en el interior de la célula .......................... 282 Efectos biológicos .................................................................. 283 Resumen ............................................................................... 285 Aplicaciones clínicas .............................................................. 286 Tema 22: Estructura de cromosomas y genes ............................... 289 Cromosomas ......................................................................... 289 Genes ................................................................................... 292 ADN: estructura y propiedades ............................................. 293 Mutaciones ............................................................................ 296 Resumen ............................................................................... 299 Aplicaciones clínicas .............................................................. 300 © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial Tema 23: Replicación y transcripción del ADN ............................ 301 Replicación del ADN ............................................................. 301 ADN polimerasas .................................................................. 308 Transcripción ......................................................................... 311 Polinucleótido fosforilasa ....................................................... 316 Transcriptasa inversa y replicasas .......................................... 316 Resumen ............................................................................... 317 Aplicaciones clínicas .............................................................. 318 Tema 24: Síntesis de proteínas ........................................................ 321 Ribosomas ............................................................................ 322 Activación de aminoácidos ................................................... 323 Iniciación y ciclo de elongación ............................................. 325 Inhibidores de la síntesis de proteínas ................................... 329 El código genético ................................................................. 330 Resumen ............................................................................... 333 Aplicaciones clínicas .............................................................. 334 Tema 25: Tecnología de ADN recombinante ................................. 337 Fundamentos de la clonación ............................................... 337 Vectores de clonación ........................................................... 341 Estrategia de la clonación ..................................................... 346 Aplicaciones a las ciencias médicas ....................................... 350 Resumen ............................................................................... 351 Aplicaciones clínicas .............................................................. 352 Tema 26: Regulaciónde la expresión génica ................................. 353 El modelo del operón ........................................................... 353 Genomas eucarióticos ........................................................... 357 Proteínas reguladoras de la transcripción .............................. 361 Resumen ............................................................................... 364 Aplicaciones clínicas .............................................................. 365 Tema 27: Introducción a la inmunología molecular ..................... 367 Sistema Inmunitario .............................................................. 367 Inmunoglobulinas: estructura y función ................................. 376 Clases de inmunoglobulinas .................................................. 378 Resumen ............................................................................... 380 Aplicaciones clínicas .............................................................. 382 Tema 28: Estructura molecular del músculo ................................. 383 Estructura de la fibra muscular esquelética ............................ 383 Estructura molecular del músculo esquelético ....................... 384 Mecanismo de la contracción muscular ................................. 386 Control de la contracción muscular por calcio ....................... 389 El músculo cardíaco .............................................................. 392 El músculo liso ...................................................................... 393 Fuentes de energía en el músculo ......................................... 395 Resumen ............................................................................... 396 Aplicaciones clínicas .............................................................. 397 Tema 29: Estructura y función del nervio ...................................... 399 Estructura y función del nervio ............................................. 399 Sinapsis y neurotransmisores ................................................ 405 Resumen ............................................................................... 410 Aplicaciones clínicas .............................................................. 411 Tema 30: Bioquímica de la visión ................................................... 413 Fotorreceptores ..................................................................... 413 Resumen ............................................................................... 419 Aplicaciones clínicas .............................................................. 419 Bibliografía ........................................................................................... 421 © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial En la bioquímica estructural hemos examinado las propie- dades y estructura de las moléculas que constituyen las células. En esta parte, Bioquímica metabólica, vamos a estudiar cómo interaccionan esas moléculas para originar y mantener la pro- piedad que denominamos vida. Para ello, las células realizan un conjunto de reacciones catalizadas por enzimas que se de- nomina metabolismo. Estas reacciones se llevan a cabo de for- ma constante desde la absorción de nutrientes, su degradación para obtener energía, la utilización de ésta, la síntesis de nue- vos componentes y la liberación de productos de deshecho. To- dos estos procesos los realiza la célula manteniendo un equili- brio dinámico, autorregulándose y cumpliendo con el principio de máxima economía. INTRODUCCIÓN AL METABOLISMO El metabolismo se puede definir como el conjunto de reac- ciones catalizadas enzimáticamente que tienen lugar en la célu- la viva. En él se pueden distinguir cuatro funciones específicas: 1. Obtener la energía química de los nutrientes. 2. Transformar las moléculas de los nutrientes en unidades constitutivas o sillares, precursores de los componentes macromoleculares de las células. 3. Unir o ensamblar los sillares en proteínas, ácidos nu- cleicos y lípidos, polisacáridos y otros componentes ce- lulares. 4. Sintetizar y degradar las biomoléculas con funciones es- pecializadas. TEMA 1 Metabolismo Introducción al metabolismo. Reacciones catabóli- cas y anabólicas: etapas. El flujo de energía en las células. La localización de las rutas metabólicas en la célula. Regulación del metabolismo. El metabolismo es el conjunto de reaccio- nes que tiene lugar en las células vivas. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial Estas funciones no se realizan de forma aislada o inde- pendiente sino de forma coordinada y organizada. Cada orgánulo o subunidad celular posee funciones específicas para establecer y mantener la vida de la célula. Así, algunas están comprometidas en generar energía para la absorción de sustancias nutritivas, otras en la movilidad celular o en la síntesis de biomoléculas. En los organismos superiores, como el hombre, existen determinadas células o tejidos especializa- dos en funciones como los glóbulos rojos para el transporte de oxígeno, las células musculares para la locomoción, las células glandulares endocrinas para la secreción de hormo- nas y las células nerviosas (neuronas) para la coordinación intercelular. Las secreciones metabólicas están controladas con precisión por sistemas intrínsecos y extrínsecos, estrechamente interrela- cionados. El estado dinámico del metabolismo y sus mecanis- mos reguladores son las características más excepcionales de la vida, por ello su comprensión es primordial en el entendimien- to e interpretación de los procesos vitales. REACCIONES CATABÓLICAS Y ANABÓLICAS: ETAPAS El metabolismo tiene lugar a través de secuencias de reac- ciones consecutivas en las que se transforman los intermedia- rios químicos o metabolitos. El metabolismo se divide en catabolismo y anabolismo. El catabolismo es la fase degradativa del metabolismo en la que los nutrientes (carbohidratos, lípidos, proteínas) provenientes del medio externo o de los depósitos de la misma célula pue- den degradarse generalmente por reacciones oxidativas en pro- ductos más sencillos como ácido láctico, ácido acético, amonía- co, urea o CO2. El catabolismo va acompañado de liberación de la energía inherente en la estructura compleja de las grandes moléculas orgánicas. La energía es transformada en forma de adenosina trifosfato (ATP). El anabolismo es la fase constructiva o de síntesis del meta- bolismo. También se denomina biosíntesis. En el anabolismo las pequeñas moléculas precursoras de las células se ensam- blan para originar componentes celulares como polisacáridos, ácidos nucleicos, proteínas y lípidos. Puesto que del proceso de biosíntesis resultan moléculas de mayor tamaño y complejidad estructural, requiere energía libre, la cual es proporcionada por la hidrólisis del ATP. El catabolismo y el anabolismo tienen lu- gar simultáneamente en la célula. 14 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA El metabolismo com- prende el anabolismo o conjunto de reac- ciones de síntesis y el catabolismo o con- junto de reacciones de degradación. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial El metabolismo se puede organizar en etapas: tres para el catabolismo y tres para el anabolismo (Fig. 1.1). En la etapa I del catabolismo los nutrientes de la célula (lípidos, carbohidra- tos y proteínas) son degradados a sus unidades constituyentes: grasas, monosacáridos y aminoácidos. En la etapa II estos pro- ductos se convierten en moléculas más sencillas que convergen en su intermediario común: acetil-CoA. En la etapa II el grupo acetilo del acetil-CoA entra en el ciclo de Krebs para ser oxida- do a CO2 y H2O, los productos finales del proceso catabólico. METABOLISMO 15 La etapa III del cata- bolismo es la misma quela etapa I del anabolismo y se de- nomina anfibólica. Figura 1.1.– Las etapas del catabolismo y del anabolismo. La etapa III del catabolismo y I del anabolismo coinciden, por ello se denomina anfibólica. El anabolismo también transcurre en tres etapas. Co- mienza con las pequeñas moléculas de la etapa III del cata- bolismo, como son los intermediarios del ciclo de Krebs, los cuales son aminados o transformados en aminoácidos, áci- © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial dos grasos o monosacáridos. En la etapa III del anabolismo estas moléculas se ensamblan para formar proteínas, lípidos y polisacáridos. Hay que destacar dos hechos: 1º. Cada etapa en el catabolismo o en el anabolismo im- plica una serie de reacciones catalizadas enzimática- mente. 2º. La etapa III del catabolismo coincide con la etapa I del anabolismo, por eso debido a su función doble se de- nomina anfibólica. EL FLUJO DE ENERGÍA EN LAS CÉLULAS Cuando una molécula como la glucosa es degradada a CO2 y H2O, proporciona por cada mol 686 kcal; ésta es la misma cantidad de calor que se libera cuando se quema en un calorí- metro; y es que las oxidaciones biológicas son en esencia com- bustiones. El calor no puede ser utilizado como fuente de energía por los organismos vivos, los cuales son esencialmente isotermos, por eso se dice que es energía degradada o degene- rada. Como se sabe, el calor sólo puede producir trabajo desde un recipiente a otro con menor temperatura. Por ello, la energía contenida en los nutrientes celulares se conserva en forma de energía química que puede realizar trabajo en condiciones iso- termas. La energía química de los combustibles metabólicos se transforma en adenosina trifosfato (ATP), el cual se forma a partir de ADP y fosfato inorgánico mediante reacciones en- zimáticas acoplados a reacciones oxidativas específicas durante el catabolismo. El ATP puede difundir a aquellos lugares de la célula en que se requiere. El ATP es en realidad una forma de transpor- te de energía química que se libera al hidrolizarse el fosfato terminal y es transferido a aceptores específicos los cuales se “energizan” y pueden reaccionar con facilidad y/o unirse a otras moléculas para originar grandes moléculas durante el anabolismo. Hay otra forma de transferir energía química desde las reac- ciones del catabolismo a aquellas que requieren energía de sín- tesis y es mediante la forma de átomos de hidrógeno o electro- nes. Estas moléculas portadoras son coenzimas como el NADH, NADPH o FMNH2 y actúan reduciendo a otras molé- culas o, en ocasiones, transformando su capacidad reductora en moléculas de ATP. 16 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA El NAD+ es la coenzi- ma de la mayoría de las reacciones de oxi- dación. El NADPH, la coenzima de la ma- yoría de las reaccio- nes de reducción. El ATP es la forma universal de transpor- te de la energía que transfiere al hidroli- zarse en ADP y Pi. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial LA LOCALIZACIÓN DE LAS RUTAS METABÓLICAS EN LA CÉLULA En las células de los organismos superiores las rutas me- tabólicas se realizan en orgánulos o compartimentos, lo que fa- cilita el desarrollo de las mismas y su regulación. Esta conclu- sión se ha obtenido de trabajos de investigación en los que se han separado los orgánulos o subfracciones y, a partir de ellos, aislado y purificado las enzimas correspondientes. Se ha com- probado, por ejemplo, que las enzimas que catalizan la conver- sión de glucosa en ácido láctico se encuentran en el citosol, que es la porción soluble del citoplasma, mientras las del ciclo de Krebs se localizan en las mitocondrias. De la misma forma se ha comprobado que las enzimas del transporte electrónico se encuentran en la membrana interna de las mitocondrias y las que intervienen en la síntesis de las proteínas, en los riboso- mas. Una visión más amplia de la localización de las enzimas en una célula hepática se puede observar en la figura 1.2. METABOLISMO 17 Las enzimas de glu- cólisis se encuentran en el citosol y las del ciclo de Krebs, en las mitocondrias. Figura. 1.2.– Localización de las enzimas de algunas rutas metabólicas en una célula de hígado. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial REGULACIÓN DEL METABOLISMO Como se ha indicado anteriormente, la célula realiza todos los procesos con la máxima eficacia y utilizando el menor con- sumo de energía posible. Por ello, el metabolismo celular se en- cuentra regulado de forma precisa y constante. En realidad y de forma general se puede establecer que el ritmo del metabo- lismo se controla por las necesidades energéticas de la célula, esto es, las células oxidan las moléculas combustibles a la mis- ma velocidad que requieren energía. La regulación de las rutas metabólicas se puede efectuar mediante tres clases diferentes de mecanismos. La primera y más inmediata respuesta es a través de las enzimas regulado- ras. Estas enzimas ejercen su acción próxima a la cabecera de las rutas metabólicas catalizando la reacción limitante de la secuencia. En las rutas catabólicas que conducen a la for- mación de ATP o NADH estos compuestos son los inhibido- res alostéricos, mientras en las rutas anabólicas es el produc- to final de la ruta el que actúa de inhibidor. Como se ha des- crito en el tema 16 de la Parte 1ª, las enzimas alostéricas suelen ser activadas o estimuladas por moduladores positivos específicos como ADP y NAD�. El segundo nivel de regulación metabólica se ejerce a través del control de la concentración de una enzima. La concentra- ción de una enzima en cualquier momento es el resultado de un equilibrio entre la velocidad de síntesis y su degradación. La velocidad de la síntesis de las enzimas varía dependiendo de las condiciones. Las enzimas que se encuentran presentes en cantidades constantes en la célula se denominan constitutivas. Las que son sintetizadas en respuesta a la presencia de algunos substratos se denominan inducibles. Los genes que especifican la síntesis de las inducidas están generalmente reprimidas y actúan únicamente solo en respuesta a la presencia de substra- tos específicos. El control metabólico se ejerce también a un tercer nivel en los organismos superiores. Las hormonas, sintetizadas y secretadas por varias glándulas endocrinas, son mensajeros químicos que estimulan o inhiben actividades metabólicas en otros órganos y tejidos. Por ejemplo, la deficiencia de la se- creción de insulina por el páncreas origina un defecto en el transporte de glucosa en las células del músculo y del hígado, lo cual conduce a una serie de efectos metabólicos secunda- rios como un descenso en la biosíntesis de ácidos grasos a partir de glucosa y una excesiva formación de cuerpos cetóni- cos por el hígado. La administración de insulina repara estos defectos. 18 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA Existen tres mecanis- mos por los que se regula el metabolis- mo en células de or- ganismos superiores. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial APLICACIONES CLÍNICAS Las células animales no pueden llevar a cabo un metabolis- mo completo como les sucede, por ejemplo, a las células bacte- rianas, debido a que a lo largo de la evolución han perdido la capacidad de sintetizar todos los compuestos que requieren para la vida. Por ello dependen de otros organismos para el su- ministro de dichos compuestos. Pero, además, en ocasiones las células humanas sintetizan enzimas defectuosas o defectivas, o bien producen cantidades insuficientes de una enzima que se traduce en un suministro insuficiente de un compuesto me- tabólico esencial. Por ello, una enfermedad metabólica puede derivar de la incorrecta expresión de una enzima.La determinación de la actividad de una enzima en los lí- quidos biológicos o tejidos constituye un indicador valioso de una determinada enfermedad metabólica. METABOLISMO 19 RESUMEN El metabolismo es el conjunto de reacciones cataliza- das enzimáticamente que tienen lugar en las células vivas. Cumple con cuatro funciones específicas que se realizan de forma coordinada: obtener energía química de los nu- trientes, transformar estos en moléculas sencillas, unir y transformar estos para obtener los componentes celulares y sintetizar y degradar las biomoléculas especializadas. El metabolismo se puede dividir en catabolismo o procesos degradativos y anabolismo o procesos biosintéticos. Tanto el catabolismo como el anabolismo se pueden ordenar en tres etapas que implica cada una, una serie de reacciones enzimáticas. La energía química que se obtiene de los nu- trientes se transforma en ATP que es el compuesto porta- dor de energía para los procesos que lo requieren: trabajo mecánico, biosintético y de transporte. En las células ani- males los procesos bioquímicos se localizan en diferentes orgánulos o compartimentos, lo que facilita la regulación que se realiza a tres niveles; mediante las enzimas alostéri- cas, la síntesis de enzimas y las hormonas. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial 20 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA Actividad enzimática disminuida Diagnóstico probable Amilasa Enfermedad pancreática Alanina aminotransferasa Enfermedad cardíaca Aspartato aminotransferasa Enfermedad cardíaca Glutamato aminotransferasa Enfermedad cardíaca Fosfatasa ácida Carcinoma prostático Fosfatasa alcalina Enfermedad ósea Creatina Enfermedad cardíaca o muscular Glucosa 6-fosfato deshidrogenasa Anemia hemolítica Lactato deshidrogenasa Enfermedad cardíaca Hexosa 1-P uridil transferasa Galactosemia Glutatión reductasa Anemia Elastasa Enfermedad del colágeno Tabla 1.1.– Algunos ensayos enzimáticos que se utilizan en el diagnóstico de enfermedades. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial La glucólisis (hidrólisis de azúcar) es el proceso por el que los organismos escinden la glucosa en ácido láctico en ausencia de oxígeno molecular con el propósito de obtener energía. Otros hidratos de carbono utilizan esta ruta para degradarse, por eso se denomina también la ruta central del metabolismo de carbohidratos, la ruta de Embden-Meyerhof o la fermenta- ción glucolítica. Hay otros tipos de fermentación en que el pro- ducto final no es el ácido láctico, como las fermentaciones al- cohólicas o acética. Los hidratos de carbono constituyen la principal fuente de energía en la dieta humana (aprox. el 47%) y la mayor parte corresponde a polisacáridos como glucógeno y al- midón, el resto a la glucosa y disacáridos como lactosa, glu- cosa y maltosa. LA RUTA GLUCOLÍTICA Los carbohidratos de la dieta son digeridos y absorbidos en el intestino delgado pasando por vía portal a la sangre. En un período de 30-60 minutos después de la comida se alcan- za en sangre, generalmente, un nivel máximo de 130 mg/dl (7,2 mol/L) que disminuye a las dos o dos horas y media a 70-90 mg/dl. Por la sangre la glucosa llega al hígado donde se metaboliza más del 60%. En condiciones normales el hígado contiene poca glucosa libre ya que bien la convierte en glucó- geno o la fosforila a glucosa 6-fosfato, que como es impermea- ble a la membrana plasmática la mantiene retenida en la célula y en el tejido muscular. TEMA 2 La ruta glucolítica La ruta glucolítica. Las rutas de los átomos de car- bono, la de la energía y la de los electrones. Rutas afluentes de la glucolítica. La regulación de la glucólisis. La glucólisis anaeró- bica (fermentación) y la glucólisis aerobia originan piruvato. Después el destino de este compuesto es diferente. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial En el hígado y en el tejido muscular la glucosa se degrada mediante una serie de intermediarios fosforilados que se deno- mina ruta glucolítica o ruta de Embden-Meyerhof. En la ruta glucolítica se pueden considerar dos etapas. La primera sirve de preparación y en ella varias hexoras pueden entrar median- te fosforilación a expensas de ATP. Estos compuestos se con- vierten en fructosa 1,6-bisfosfato que se excinde para dar dehi- doxiacetona fosfato y gliceraldehído 3-fosfato. Fosforilación de la glucosa. Es la primera reacción de la primera etapa y en ella la glucosa se fosforiza a glucosa 6-fosfa- to a expensas de ATP. Esta reacción que es irreversible en con- diciones intracelulares es catalizada por la hexoquinasa: *D-glucosa � ATP D-glucosa-6-fosfato � ADP �G 0� � �4,0 kcal/mol La hexoquinasa cataliza también la fosforilación de otras hexosas como fructosa y manosa. La enzima requiere iones Mg2� que se combinan con ATP para formar el verdadero subs- trato Mg ATP2�, es inhibida por su propio producto y algunos reactivos sulfhidrilos. El hígado funciona como un regulador de la glucosa sanguí- nea: cuando los niveles de glucosa son elevados, ésta se meta- boliza a través de la ruta glucolítica o almacenada como glucó- geno; cuando los niveles son bajos, se moviliza a partir de hexoquinasa�������� Mg2� 22 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA La glucoquinasa ac- túa cuando el nivel de glucosa es alto en la sangre. * A partir de ahora y mientras no se especifique lo contrario todos los mono- sacáridos y sus derivados son D. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial glucógeno. En el hígado hay una segunda enzima que fosforila la glucosa en el hígado, la glucoquinasa, que es específica de la glucosa; esta enzima tiene menor afinidad por la glucosa que la hexoguinasa y actúa únicamente cuando el nivel de glucosa sanguínea es anormalmente alto, como ocurre en la enferme- dad diabetes mellitus. Isomerización de la glucosa 6-fosfato. La conversión de glucosa 6-fosfato a fructosa 6-fosfato es catalizada por la fosfogluco isomerasa: glucosa 6-fosfato fructosa 6-fosfato �G 0� � �0,4 kcal/mol La reacción transcurre rápidamente en ambas direcciones debido a su pequeña variación de energía libre. La enzima re- quiere para su actividad Mg2� o Mn2�. Fosforilación de fructosa 6-P. Es la segunda reacción de fosforilación por otra molécula de ATP y catalizada por la fosfo- fructoquinasa (Fig. 2.1). fructosa 6-fosfato � ATP fructosa 1,6-bisfosfato � ADP �G 0� � �3,40 kcal/mol fosfofructo quinasa������� fosfogluco isomerasa�������������� Mg2� LA RUTA GLUCOLÍTICA 23 Figura 2.1.– La primera etapa de la glucólisis. En ella se utiliza ATP para fosforilar los azúcares. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial La fosforilación de la fructosa 6-P es una reacción esen- cialmente irreversible como corresponde al valor de �G 0� y es un punto clave en la ruta glucolítica. La fosfofructoquinasa es una enzima reguladora alostérica, con un peso molecular alto (360.000); es activada por moduladores positivos como ADP, AMP y fructosa 2,6-bisfosfato, e inhibida por moduladores negativos como ATP y citrato. La fructosa 1,6-bisfosfato au- menta la afinidad de la enzima por la fructosa 6-fosfato y dis- minuye la inhibición por ATP; además, su activación es sinér- gica con el AMP. Escisión de fructosa 1,6-bisfosfato. Esta reacción es catalizada por la aldolasa: fructosa 1,6-bisfosfato dihidroxiacetona fostato � � gliceraldehído 3-fosfato �G 0� � �5,73 kcal/mol Aunque esta reacción tiene un �G 0� muy positivo en condi- ciones fisiológicas, la reacción transcurre hacia la formación de las triosas fosfato porque el gliceraldehído 3-fosfato desaparece rápidamente al seguir metabolizándose en la ruta glucolítica.Interconversión de las triosas fosfato. Puesto que únicamente el gliceraldehído 3-fosfato es metabolizado en la glucólisis toda la dihidroxiacetona fosfato se transforma en gliceraldehído 3-fosfato mediante la enzima triosa fosfato iso- merasa: dihidroxiacetona fosfato gliceraldehído 3-fosfato �G 0� � 1,83 kcal/mol La segunda etapa de la glucólisis. La segunda etapa de la glucólisis incluye las reacciones de oxido-reducción y aquellas de fosforilación en las que se genera ATP. Puesto que, como hemos visto, una molécula de glucosa se escinde en dos de gliceraldehído 3-fosfato que siguen la misma ruta, por lo que se considera sólo una molécula. Oxidación de gliceraldehído 3-fosfato. Esta reacción está catalizada por la gliceraldehído 3-fosfato deshidrogenasa que requiere como coenzima NAD�. gliceraldehído 3-fosfato � NAD� � Pi �� 1,3-bisfosfoglicerato � NADH �G 0� � 1,5 kcal/mol gliceraldehído 3-fosfato deshidrogenasa�������� triosa fosfato isomerasa���������� aldolasa�������� Mg2� 24 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA La gliceraldehído 3- fosfato deshidrogena- sa cataliza la reac- ción de oxidación de la glucólisis. La aldolasa rompe la fructosa 1,6-bifosfato en condiciones intra- celulares a pesar de su DG0' positivo en condiciones estándar. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial Ésta es una de las reacciones más importantes de la secuen- cia glucolítica puesto que se conserva la energía de oxidación del grupo aldehído del gliceraldehído 3-fosfato en la forma de un compuesto rico en energía como es el 1,3-bisfosfoglicerato. La función de NAD� es la de portador de electrones o átomos de hidrógeno. El mecanismo de acción de la enzima es bastan- te complejo ya que el substrato primeramente se combina con un grupo �SH del centro activo de la enzima y ésta reacciona con el NAD�. El complejo acil-enzima reacciona posteriormente con el fosfato para producir 1,3-bisfosfoglicerato. Un hecho que apoya este mecanismo es que la enzima es inhibida por aquellos reactivos que bloquean el grupo �SH. Transferencia del fosfato de 1,3-bisfosfoglicerato. El 1,3-bisfofoglicerato transfiere el fosfato al ADP mediante la en- zima fosfoglicerato quinasa (Fig. 2.2). 1,3-bisfofoglicerato � ADP 3-fosfoglicerato � ATP �G 0� � �4,50 kcal/mol fosfoglicerato quinasa�������� LA RUTA GLUCOLÍTICA 25 Figura 2.2.– La etapa segunda de la ruta de la glucólisis. Transformación de gliceraldehído 3-fosfato en lactato y formación de 2 moléculas de ATP. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial Ésta es la primera reacción glucolítica en que se forma ATP y, aunque este proceso requiere 7,3 kcal/mol, la reacción global es exergónica porque el 1,3-bisfoglicerato es un componente muy rico en energía y su hidrólisis aporta suficiente energía para la síntesis de ATP: 1,3-bisfosfoglicerato � H2O �� 3-fosfoglicerato � Pi �G 0� � �11,8 kcal/mol ADP � Pi �� ATP � H2O �G 0� � 7,3 kcal/mol Suma de las dos reacciones: 1,3-bisfosfoglicerato � ADP �� 3-fosfoglicerato � ATP �G 0�total � �4,5 kcal/mol Isomerización del 3-fosfoglicerato. Esta reacción es ca- talizada por la fosfoglicerato mutasa y requiere Mg2�: 3-fosfoglicerato 2-fosfoglicerato. �G 0� � 1,06 kcal/mol Deshidratación de 2-fosfoglicerato. Esta es la segunda reacción de la secuencia glucolítica en la que se genera un en- lace fosfato rico en energía; la enzima que cataliza la reacción es la enolasa que requiere Mg2� o Mn2� para su actividad: 2-fosfoglicerato fosfoenolpirato � H2O �G 0� � 0,44 kcal/mol Transferencia del fosfato de fosfoenolpirato. El fosfato rico en energía del fosfoenolpirato es transferido al ADP por la piruvato quinasa: fosfoenolpirato � ADP pirurato � ATP �G 0� � �7,5 kcal/mol La enzima requiere Mg2� o Mn2� y K�, y es una enzima regu- ladora alostérica con la que actúa como modulador positivo la fructosa 1,6-bisfosfato y como moduladores negativos el ATP, el Ca2� y la alanina. Reducción del piruvato. En el último paso de la glucóli- sis el piruvato es reducido a lactato a expensas de los electro- nes donados por el gliceraldehído 3-fosfato a NAD�. Estos elec- piruvato quinasa���������� enolasa�������� Mg2� fosfoglicerato mutasa���������������� Mg2� 26 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA La piruvato quinasa cataliza la segunda reacción de la ruta glucolítica que pro- porciona ATP. La fosfoglicerato qui- nasa es la primera re- acción de la glucóli- sis que proporciona ATP. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial trones son transferidos por NADH y las reacciones catalizadas por la lactato deshidrogenasa: piruvato � NADH � H� lactato � NAD� �G 0� � �6,0 kcal/mol En el organismo humano existen al menos cinco formas di- ferentes de lactato deshidrogenasa o isoenzimas. El corazón, hí- gado y riñones son especialmente abundantes en isoenzimas del tipo H, que tienen relativamente baja afinidad por piruvato, mientras el músculo esquelético es rico en isoenzimas del tipo M, que tienen gran afinidad por piruvato y tienden hacia la for- mación de ácido láctico. LAS RUTAS DE LOS ÁTOMOS DE CARBONO, LA DE LA ENERGÍA Y LA DE LOS ELECTRONES En la ruta glucolítica existen tres transformaciones químicas que están interconectadas: La transformación por la que el esqueleto carbonado de la glucosa se transforma en el del ácido láctico, esto es, el destino de los átomos de carbono; la de la energía, donde y cómo se utiliza y forma ATP, y la de los electrones, las reacciones de óxi- do-reducción. 1º. Destino de los átomos de C de glucosa. La molécula de glucosa de seis átomos de carbono en la ruta glucolítica se transforma en dos moléculas de ácido láctico. Si se enumeran los carbonos asignando el nº 1 al del grupo aldehído, al escindirse la fructosa 1,6-bisfosfato, los car- bonos 1, 2 y 3 se confunden con los 6, 5 y 4, respecti- vamente, en el gliceraldehído 3-fosfato y la posición en el ácido láctico será: lactatogliceraldehído 3-fosfato glucosa CH3 l COH l COOH (6)(3) 2 H(5)(2) (1)(4)� �� COH l C�OH l CH2OPO3 2� (1)(4) 2 (2)H(5) (3)(6) �� 1COH l 2C�OH l 3C�H l 4C�OH l 5C�OH l 6CH2OH H� HO� H� H� lactato deshidrogenasa������������ LA RUTA GLUCOLÍTICA 27 En la glucólisis anae- robia no hay un cam- bio neto del estado de oxidación de la glucosa en compara- ción con el lactato. La lactato deshidroge- nasa cataliza la reac- ción de reducción de la glucólisis. En con- diciones anaerobias o aerobias insuficientes oxida el NADH para que la glucólisis con- tinue funcionando. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial 2º. La secuencia de reacciones en las que se utiliza y se forma ATP: glucosa � ATP �� glucosa 6-P � ADP fructosa 6-P � ATP �� fructosa 1,6-bisfosfato � ADP 2 1,3 bisfosfoglicerato � 2 ADP �� �� 2 3-fosfoglicerato � 2 ATP 2 fosfoenolpiruvato � 2 ADP �� 2 piruvato � 2 ATP 3º. La secuencia de reacciones de óxido-reducción: 2-gliceraldehído 3-fosfato � 2 NAD� � 2 Pi �� �� 2 1,3 difosfoglicerato � 2 NADH � 2 ATP piruvato � NADH � H� �� lactato � NAD� Teniendo en cuenta estos procesos, la ecuación global de la glucólisis es: glucosa � 2 ATP � 2 NAD� � 2 Pi � 4 ADP � � 2 NADH � 2 H� �� 2 lactato � 2 ADP � 2 NADH � � 2 H� � 2 NAD� � 4 ATP � 2 H2O cancelando los términos iguales en los dos miembros: glucosa � 2 Pi � 2 ADP �� 2 lactato � 2 ATP � 2H2O Hay que destacar que, aunque existen dos reacciones de óxido-reducción, no hay un cambio neto en el estado de oxi- dación. RUTAS AFLUENTES DE LA GLUCOLÍTICA Además de la glucosa, otros carbohidratos entran en la ruta glucolítica para ser degradados.La glucosa de los polisacáridos glucógeno y almidón entran en la ruta a través de enzimas que degradan las cadenas unitariamente y mediante procesos per- fectamente regulados. Los disacáridos maltosa, lactosa y sacarosa no se encuen- tran en la sangre de los organismos superiores. Cuando se in- gieren con la dieta, son hidrolizados enzimáticamente en el in- testino delgado en sus componentes hexosas antes de pasar por vía portal al corriente sanguíneo: maltosa � H2O glucosa � glucosa maltasa���� 28 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial lactosa � H2O galactosa � glucosa sacarosa � H2O fructosa � glucosa Como la glucosa, la manosa es fosforilada en el hígado: manosa � ATP manosa 6-fosfato � ADP La manosa es isomerizada a fructosa 6-fosfato por la fosfo- manosa isomerasa: manosa 6-fosfato fructosa 6-fosfato En el hígado de vertebrados la fructosa entra en la glucólisis por otra ruta. La fructoquinasa cataliza la fosforilación de la fructosa: fructosa � ATP fructosa 1-fosfato � ADP La fructosa 1-fosfato se escinde en gliceraldehído y dihidro- xiacetona fosfato mediante la fructosa 1-fosfato aldolasa, una enzima semejante a la aldolasa de la ruta glucolítica: fructosa 1-fosfato �� gliceraldehído � dihidoxiacetona fosfato La dihidroxiacetona fosfato es un intermediario de la glucó- lisis y el otro producto el gliceraldehído es fosforilado a gliceral- dehído 3-fosfato, otro intermediario de la glucólisis, mediante la reacción: gliceraldehído � ATP gliceraldehído 3-fosfato � ADP La galactosa 1-fosfato es convertida en glucosa 1-fosfato a través de las siguientes reacciones: UTP � galactosa 1-fosfato UDP-galactosa � PP UDP-galactosa UDP-glucosa UDP-glucosa � PP UTP � glucosa 1-P Como se puede observar, el UTP tiene, en estas reacciones, una función muy importante como transferidor de grupos glu- cosílicos. glucosa 1-fosfato-uridil transferasa�������� UDP epimerasa������������ galactosa 1-fosfato uridil transferasa������������ gliceraldehído quinasa����� fructosa 1-fosfato aldolasa������������������ fructoquinasa����� fosfomanosa isomerasa���������������� hexoquinasa����� invertasa���� lactasa���� LA RUTA GLUCOLÍTICA 29 Todos los carbohidra- tos en último término se transforman en fructosa 6-fosfato © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial LA REGULACIÓN DE LA GLUCÓLISIS En la ruta glucolítica existen tres puntos importantes de con- trol (Fig. 2.3). El primero es aquel en que la glucosa se fosforila a glucosa 6-fosfato por ATP y la hexoquinasa. Otro importante punto de control es la reacción catalizada por la fosfofructoqui- nasa. Esta enzima reguladora es activada por AMP y ADP e in- hibida por ATP y citrato. El tercer punto de regulación es la reacción catalizada por la piruvato quinasa, que es activada por fructosa 1,6-bisfosfato y AMP. Como se puede observar, las tres enzimas de control están reguladas por un intermediario metabólico, pero de una manera especial por la concentración de AMP, ADP y ATP. De una manera simplificada se puede afir- mar que la relación ADP/ATP regula el flujo metabólico de la ruta. Si esta relación es alta porque la concentración de ATP es baja, la glucólisis se activa para formar ATP. Si, por el contrario, la relación ADP/ATP es baja, la célula inhibe la fosfofructoqui- nasa y se interrumpe la glucólisis para no producir más ATP. 30 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA La hexoquinasa, fosfo- fructoquinasa y piru- vato quinasa son los principales centros de control de la glucóli- sis. Figura 2.3.– Las tres reacciones de control de la glucólisis y sus efectores positivos y negativos. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial APLICACIONES CLÍNICAS Diabetes mellitus y glucólisis La insulina y el glucagón son dos hormonas esenciales en el control homeostático del nivel de glucosa sanguínea. Nor- malmente después de cada comida experimentamos un au- mento de glucosa en sangre. Las células de los islotes de Langerhaus del pancreas perciben estos niveles de glucosa cir- culante y liberan insulina que disminuye el nivel de glucemia principalmente estimulando el transporte activo de la glucosa a través de las membranas celulares de los tejidos muscular y adiposo. Esto es así porque la insulina se fija a una proteína re- ceptora específica de la membrana celular y facilita la entrada de glucosa. En la enfermedad de diabetes mellitus se produce un nivel insuficiente de insulina o una hormona defectuosa con una afinidad disminuida por los centros receptores. Debi- do a que la glucosa no puede ser captada por las células de los diabéticos, una característica de estos enfermos es que el nivel de glucosa en sangre permanece alta y esto va acompañado LA RUTA GLUCOLÍTICA 31 RESUMEN La glucólisis es un proceso para obtener energía de la glucosa en ausencia de oxígeno. Tiene lugar en dos etapas y están implicadas 11 reacciones catalizadas enzimática- mente. En la primera etapa la glucosa es fosforilada por ATP y, posteriormente, escindida en dos moléculas de D- gliceraldehído 3-fosfato. Otras hexosas, pentosas y glicerol entran en la ruta mediante otras reacciones en esta etapa para converger también en D-gliceraldehído 3-fosfato. En la segunda etapa el D-gliceraldehído 3-fosfato es oxidado por NAD� para formar un compuesto rico energé- ticamente, el 1,3-difosfoglicerato, que cede su fosfato al ADP para obtener ATP y 3-fosfoglicerato; este compuesto se isomeriza a 2-fosfoglicerato, el cual se deshidrata a fos- foenolpiruvato, que nuevamente dona su fosfato al ADP para formar ATP y piruvato. El piruvato se reduce a lacta- to por NADH procedente de la deshidrogeneración de la triosa-fosfato. En la ruta glucolítica entran dos moles de ATP en la primera etapa y se forman cuatro de ATP en la segunda. Existen en la ruta tres puntos de regulación, uno en la entrada y otros dos en la ruta, los cuales sirven de re- acciones limitantes de la velocidad glucolítica. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial de una mayor excreción de orina (poliuria) con una constante deshidratación. En la diabetes no hay un control de la lipasa, por lo que se produce una movilización excesiva de ácidos grasos que llegan a acumularse en el hígado. La ausencia de insulina favorece la glucogenólisis y la gluconeogénesis por lo que el estado hiperglucémico se ve exacerbado. El organismo intenta compensar la falta de glucosa intracelular aumentando su disponibilidad mediante la gluconeogénosis, aun cuando haya un suministro adecuado de carbohidratos. Como el orga- nismo es incapaz de utilizar la glucosa para obtener energía, ésta debe ser obtenida de los lipidos. Los ácidos grasos son movilizados y convertidos en acetil-CoA en el hígado, pero este compuesto no puede ser oxidado a CO2 y H2O en el ciclo de Krebs debido al inadecuado suministro de oxalacetato. Por ello, el acetil-CoA es dirigido hacia la conversión de cuerpos cetónicos como ácido acetoacético y -hidroxibutírico. El teji- do muscular puede utilizar los cuerpos cetónicos para su meta- bolismo energético, pero generalmente su producción es tan excesiva que hay una pérdida de estas sustancias por vía pul- monar y renal. El aceto-acetato se degrada fácilmente a aceto- na, que es exhalada con el aliento. La excreción urinaria de acetoacetato y -hidroxibuterato produce pérdida de Na� ge- nerándose un estado de acidosis. La administración de insulina revierte estos efectos, aunque se requiere un ajuste de la dieta y una dosis de insulina ade- cuada. 32 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorialLas células aerobias obtienen la mayor parte de su energía de la respiración, esto es, de la transferencia de electrones desde las moléculas combustibles hasta el oxígeno molecular. La respiración implica la mayoría de las reacciones de la ruta glicolítica, hasta el piruvato, pero el proceso oxidativo con- tinúa hasta la transformación en dióxido de carbono y agua. En este tema comenzaremos con la descripción de la reacción catalizada por la piruvato deshidrogenasa, un complejo en- zimático que transforma el piruvato en acetil-CoA. Éste es el compuesto por el que la mayoría de los átomos de carbono procedentes del catabolismo de carbohidratos, ácidos grasos y aminoácidos entran en el ciclo de Krebs. El ciclo tiene como funciones primordiales, el ser la ruta final de la oxidación de las moléculas combustibles y el de proporcionar moléculas precursoras para las rutas biosintéticas. Cuando actúa con este último objetivo, requiere de reacciones denominadas anapleróticas que le proporcionan metabolitos y evitan que deje de funcionar. LA REACCIÓN DEL COMPLEJO PIRUVATO DESHIDROGENASA En el tema anterior hemos estudiado la vía glicolítica en que la glucosa se convierte en piruvato. Para que este compuesto sea oxidado completamente a dioxido de carbono y agua en el ciclo de Krebs se requiere: a) Que el piruvato pase al interior de la mitocondria. b) Que se transforme en acetil-CoA. TEMA 3 El ciclo de Krebs La reacción del complejo piruvato deshidrogenasa. El ciclo de Krebs: reacciones y regulación. Reac- ciones anapleróticas. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial Las enzimas del ciclo de Krebs se localizan de forma orde- nada en el interior de la mitocondria. La membrana mitocon- drial es impermeable a los compuestos fosforilados y al acetil- CoA, por lo que el piruvato de la ruta glicolítica, que se origina en el citosol, es transportado, mediante difusión facilitada, al interior de la mitocondria (Fig. 3.1). Posteriormente, el piruva- to, a través de una descarboxilación oxidativa, se transforma en acetil-CoA, según la ecuación global: piruvato � NAD� � CoA-SH �� acetil-CoA � � NADH � H� � CO2 �G0� � �8,0 kcal 34 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA Figura 3.1.– El piruvato procedente de la glicólisis atraviesa la membrana mi- tocondrial para ser oxidado y descarboxilado a acetil-CoA en la matriz mito- condrial. La reacción transcurre con una gran variación negativa de energía libre estándar, lo que indica que en la célula viva es esencialmente irreversible. La reacción está catalizada por el La oxidación del pi- ruvato es una reac- ción irreversible en la que intervienen tres enzimas y cinco co- enzimas. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial complejo piruvato deshidrogenasa (PDH) constituido por tres enzimas: piruvato deshidrogenasa, dihidrolipoil transacetilasa y dihidrolipoil deshidrogenasa y cinco coenzimas: pirofosfato de tiamina (TPP), ácido lipoico, coenzima A (CoA-SH), nicotinamina adenina dinucleótido (NAD�), y flavinadenina dinucleótido (FAD�). Este complejo multienzimático ha sido aislado y purificado de varios organismos. El de la especie humana tiene un peso de 8,5 � 106 daltons y está constituido por 30 moléculas te- traméricas de la piruvato deshidrogenasa, que contiene unida una molécula de TPP, 60 moléculas de dihidrolipoil transaceti- lasa cada una con una molécula de ácido lipoico y seis de dihi- drolipoil deshidrogenasa, cada una de las cuales se encuentra unida a una molécula de FAD�. El proceso enzimático se es- quematiza en la figura 3.2. Se ha postulado que la cadena late- ral del ácido lipoico (lipoil-lisina) actúa como un brazo oscilan- te para transferir grupos acetilo y átomos de hidrogeno (o los electrones equivalentes), desde una enzima a la siguiente den- tro del complejo enzimático. EL CICLO DE KREBS 35 Figura 3.2.– Descarboxilación oxidativa del piruvato a acetil-CoA por el com- plejo piruvato deshidrogenasa. Las sustancias que entran y salen del complejo aparecen enmarcadas. Las enzimas que intervienen son: E1 � piruvato deshi- drogenasa, E2 � dihidrolipiol transacetilasa, E3 � Dihidrolipoil deshidrogenasa. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial La reacción catalizada por el complejo piruvato deshidroge- nasa se encuentra en una posición clave del metabolismo, no sólo porque sirve de conexión entre la ruta glicolítica y el ciclo de Krebs sino porque el piruvato y el acetil-CoA son compo- nentes de varias rutas biosintéticas y degradativas (Fig. 3.3). Así, el piruvato, además de ser el producto final de la ruta gli- colítica, se forma en el catabolismo de aminoácidos, en la oxi- dación del lactato, y es un precursor de la síntesis de aminoáci- dos, de la glucosa y del lactato. El acetil-CoA se forma en la de- gradación de los ácidos grasos y de aminoácidos y es un precursor de la síntesis de ácidos grasos, cuerpos cetónicos, co- lesterol y otros lípidos de gran importancia biológica. 36 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA Figura 3.3.– La reacción catalizada por el complejo PDH se encuentra en una posición clave del metabolismo. El piruvato y el acetil-CoA son productos fina- les de varias rutas catabólicas y precursores de otras anabólicas. No es de extrañar que, dada la posición tan estratégica del complejo piruvato deshidrogenasa en el metabolismo, su activi- dad se encuentre regulada con precisión. Exiten dos niveles de regulación sobre el complejo: uno rápido, en el que los produc- tos de la reacción (acetil-CoA y NADH) actúan de inhibidores (Fig. 3.4) y otro lento mediante modificación covalente y en el que participan dos enzimas más: la PDH quinasa y la PDH fos- fatasa (Fig. 3.5). Estas enzimas, que también constituyen parte integral del complejo PDH, regulan la actividad del mismo a través de un mecanismo de fosforilación y desfosforilación. Va- Figura 3.4.– El complejo PDH está regulado de m a n e r a r á p i d a p o r NADH y acetil-CoA que lo hacen como efectores negativos. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial lores elevados de las proporciones NADH/NAD, acetil-CoA/ CoA-SH y/o ATP/ADP actúan como efectores positivos de la PDH quinasa, favoreciendo la formación de la PDH activa, no fosforilada, en PDH fosforilada, poco activa. El resultado neto de este proceso es el descenso del ritmo en la transformación piruvato-acetil-CoA. EL CICLO DE KREBS: REACCIONES Y REGULACIÓN El ciclo del ácido cítrico, de los ácidos tricarboxílicos, del ácido tricarboxílico o, simplemente, de Krebs, en honor de su descubridor Hans Krebs, fue la consecuencia de propuestas, experimentos y deducciones brillantes que han marcado un hito en la historia y el desarrollo de la Bioquímica. Krebs basó sus estudios en los realizados previamente por Thumberg, Szent Gyorgyi, Martius, Knoop y Ochoa y sus primeros resulta- dos los publicó en 1937 en las revistas Enzymologia y Lanzet. El carácter cíclico se debe a que, después de una serie de reacciones, se regenera el compuesto de partida, el oxalacetato. En cada vuelta del ciclo de Krebs una molécula de acetilo (del acetil-CoA) de dos átomos de carbono se condensa con una molécula de ácido oxalacético de cuatro átomos de carbono para formar ácido cítrico, un compuesto de seis átomos de car- bono. Este último se oxida mediante una secuencia de reaccio- nes, de tal modo que se liberan dos moléculas de CO2 y se re- genera una molécula de ácido oxalacetato. Este compuesto puede combinarse con otra molécula de acetilo, iniciando el ci- clo otra vuelta. En cada vuelta se incorpora una molécula de EL CICLO DE KREBS 37 Figura 3.5.– El complejo PDH está regulado de manera lenta por un sistema de fosforilación/desfosforilaciónen el que intervienen la PDH-quinasa y la PDH- fosfatasa. El ciclo de Krebs es la ruta de oxidación de todos los combus- tibles metabólicos en condiciones aeróbi- cas. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial acetilo y se eliminan dos de CO2. Cuando el ciclo está funcio- nando con fines energéticos, una molécula de ácido oxalacéti- co sería suficiente para lograr la oxidación de un número infi- nito de moléculas de acetilo. En estas condiciones, por cada vuelta se liberan cuatro pares de hidrógeno (o sus electrones equivalentes), los cuales pasarán al oxígeno molecular para ob- tener energía en forma de ATP. El conjunto de reacciones del ciclo se muestra en la figura 3.6. Del funcionamiento del ciclo de Krebs se puede destacar los siguientes hechos: 1. La primera reacción del ciclo es la condensación de una molécula de acetil-CoA con otra de ácido oxalacético por la acción catalítica de la citrato sintasa. La reacción 38 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA Figura 3.6.– Reacciones del ciclo de Krebs. Los números corresponden a las siguientas enzimas: (1) Citrato sintasa. (2) Aconitasa. (3) Aconitasa. (4) Isocitrato deshidrogenasa. (5) Complejo -cetoglutarato deshidro- genasa. (6) -cetoglutarato deshidrogenasa. (7) Succinil CoA sintetasa. (8) Succinato deshidrogenasa. (9) Fumarasa. (10) Malato deshidrogenasa. Los átomos de carbono del acetil-CoA aparecen en color naran- ja para que pueda observarse que después de las dos descarboxilaciones permanecen integrados en la molécula de succinato. En el ciclo entran dos átomos de carbono con el acetil-CoA y se pierden dos en las re- acciones y .54 © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial es irreversible porque la hidrólisis del enlace tioéster del acetil-CoA implica la liberación de una gran cantidad de energía (�G0� � �7,5 kcal) (Fig. 3.6). 2. Hay cuatro reacciones catalizadas por deshidrogenasas que reducen tres moléculas de NAD� y una de FAD�: iso- citrato deshidrogenasa, complejo -cetoglutarato deshi- drogenasa, succinato deshidrogenasa y malato deshidro- genasa. En las dos primeras también se producen des- carboxilaciones. 3. El complejo -cetoglutarato deshidrogenasa que catali- za la transfomación del -cetoglutarato en succinil-CoA tiene una estructura similar al de la piruvato deshidro- genasa; como éste, está constituido por tres enzimas y las mismas coenzimas: TTP, ácido lipoico, CoA-SH, FAD y NAD. 4. La reacción catalizada por la succinil-CoA genera un en- lace fosfato de alta energía en forma de GTP (equivalen- te a ATP). 5. Los átomos de carbono que se liberan en forma de CO2 por cada vuelta del ciclo no son los mismos que los cap- tados como acetilos. 6. Algunas sustancias inhiben el funcionamiento del ciclo de Krebs, generalmente porque compiten con los sustra- tos por las enzimas del ciclo. Así, el malonato inhibe la succinato deshidrogenasa y el fluoracitrato la aconitasa. Las sales de arsénico inhiben el complejo -cetoglutara- to deshidrogenasa. La reacción neta del ciclo es: acetil-CoA � 3 NAD� � FAD� � GDP � Pi � H2O �� �� 2CO2 � 3 NADH � FADH2 � GTP � 2H� � CoA-SH Las tres moléculas de NADH y la de FADH2 se oxidan en la cadena de transporte electrónico, como hemos visto en el tema 28 de Fundamentos de Bioquímica Estructural. El oxí- geno molecular no participa directamente en el ciclo de Krebs, pero éste sólo funciona en condiciones aeróbicas por- que el NADH y el FADH2 únicamente transfieren sus electro- nes al oxígeno molecular en la cadena respiratoria (Fig. 3.7). El ciclo está regulado por la acción de enzimas alostéricas que responden a las concentraciones de metabolitos celulares y que son limitantes en la velocidad metabólica del ciclo. En ter- minos estrictos, el complejo PDH no forma parte del ciclo, pero su regulación potencia la sensibilidad del sistema de regulación del ciclo al controlar la cantidad de acetil-CoA que se incorpora al mismo. En el ciclo existen tres reacciones que se pueden EL CICLO DE KREBS 39 Cada vuelta del ciclo de Krebs genera un fosfato de alta ener- gía por una fosforila- ción a nivel de sus- trato, 3 del NADH y 1 del FADH2. Estos úl- timos se reoxidarán en la cadena respira- toria. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial Figura 3.7.– El ciclo de Krebs y la cadena respiratoria están acoplados por los electrones que fluyen desde los intermediarios del ciclo a través de la cadena al oxígeno molecular. considerar claves en la regulación y que son catalizadas por las siguientes enzimas (Fig. 3.8): • Citrato sintasa. Cuando aumentan los niveles de NADH y/o ATP por encima de lo normal, actúan dis- minuyendo la actividad de la enzi- ma y, por tanto, la formación de citrato. • Isocitrato deshidrogenasa. Esta enzima alostérica es, como la an- terior, inhibida por el NADH y ATP y estimulada por NAD�, ADP y Ca2�. • -Cetoglutarato deshidrogenasa. Este complejo enzimático, como se ha indicado, es análogo en su estructura al del piruvato deshi- drogenasa. Como este, es inhibi- do por los productos finales de la reacción que cataliza, que en el caso del complejo -cetoglutarato deshidrogenasa, son: el succinil- CoA y el NADH. Se puede subrayar que la velocidad metabólica del ciclo está regulada de forma general por el producto final de las reacciones de obtención de energía de la respiración, el ATP, y el producto final de las etapas de deshidrogenación del ciclo, el NADH. REACCIONES ANAPLERÓTICAS Aunque el ciclo de Krebs es la vía de- gradativa más importante para generar ATP, el ciclo es esencial para la biosín- tesis de compuestos celulares. Así, mu- chos aminoácidos derivan del -cetoglutarato y del oxalaceta- to, y la mayoría de los átomos de carbono de las porfirinas pro- ceden del succinil-CoA. Cuando esos metabolitos son extraídos del ciclo de Krebs, éste deja de funcionar, puesto que se inte- rrumpe la formación de oxalacetato. 40 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABÓLICA El ciclo de Krebs se controla fundamen- talmente por tres re- acciones y por las concentraciones in- tramitocondriales de NAD+ y NADH. © Editorial Tébar. Prohibida la reproducción sin la autorización expresa de la editorial Para que el ciclo siga actuando a un ritmo normal, existen reacciones denominadas anapleróticas (“de relleno”) que rees- tablecen los niveles de los intermediarios del ciclo. La más im- portante es la carboxilación del ácido piruvico para formar áci- do oxalacético; catalizada por la piruvato carboxilasa piruvato � CO2 � ATP oxalacetato � ADP � Pi �G0� � �0,5 kcal La piruvato carboxilasa, que se encuentra en el hígado y riñón, es una enzima alostérica de peso molecular elevado (al- rededor de 650.000 daltons) y un elevado número de subuni- dades proteicas. Su modulador positivo es el acetil-CoA (Fig. 3.9). Cuando esta sustancia alcanza un nivel por encima de lo normal, activa la reacción favoreciendo la formación de oxala- cetatato, el cual se condensa con el acetil-CoA acumulado para formar citrato y de esta forma permitir que el ciclo siga funcio- nando. En el corazón y en el tejido muscular actúa principalmente la enzima málica (malato deshidrogenasa dependiente de NADP�) y que cataliza la reacción: piruvato � CO2 � NADPH � H� L-malato � NADP� enzima malica���� ��� piruvato carboxilasa���� EL CICLO DE KREBS 41 Figura 3.8.– Regulación del flujo metabólico a través del ciclo de Krebs. Las tres enzimas alostéricas están controladas por los niveles de varios efectores po- sitivos y negativos. Los intermediarios del ciclo de Krebs que se utilizan en otras rutas biosintéti- cas deben reponerse para que el flujo me- tabólico a través del ciclo no se detenga. © Editorial Tébar. Prohibida
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