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G E N Ó M I C A M I C R O B I A N A 219 U N ID A D 2 una fuente de diversidad al genoma sobre la que puede actuar la selección natural. Así, las reordenaciones cromosómicas que se acumulan en las bacterias cuando crecen en condiciones de estrés suelen estar flanqueadas por repeticiones o secuencias de inserción. En cambio, cuando una especie se establece en un nicho evolutivo estable, aparentemente la mayoría de los elementos móviles se pierden. Por ejemplo, los genomas de las especies de Sulfolobus (Archaea) tienen cantidades inusualmente altas de secuencias de inserción y muestran una alta frecuencia de translocación de genes. Por el contrario, Pyrococcus (Archaea) casi no tiene secuencias de inserción y un número proporcio- nalmente bajo de translocación de genes. Esto sugiere que, por alguna razón, quizás debido a fluctuaciones en las condiciones de su hábitat, el genoma de las especies de Sulfolobus es más dinámico que el de Pyrococcus, que es más estable. Las reordenaciones cromosómicas debidas a las secuencias de inserción parece ser que han contribuido a la evolución de varios patógenos bacterianos. En Bordetella, Yersinia y Shige- lla, las especies más patógenas muestran una frecuencia mucho más alta de secuencias de inserción. Por ejemplo, Bordetella bronchiseptica tiene un genoma de 5,34 Mbp y ninguna secuen- cia de inserción conocida. Su pariente más patógeno, Bordete- lla pertussis, que causa la tosferina ( Sección 29.3), tiene un genoma más pequeño (4,1 Mbp) pero con más de 260 secuen- cias de inserción. La comparación de estos genomas sugiere que las secuencias de inserción son responsables de reordenaciones importantes del genoma, como las deleciones que reducen el tamaño del genoma de B. pertussis. Las secuencias de inserción también tienen una función en el ensamblaje de módulos genéticos para generar nuevos plásmi- dos. Así, el 46 % del megaplásmido de virulencia de 220 kbp de Shigella flexneri consiste en secuencias de inserción de DNA. Además de las secuencias de inserción completas, en este plás- mido hay muchos fragmentos que sugieren múltiples reordena- ciones ancestrales. MINIRREVISIÓN ¿Qué clases de genes son raramente transferidos horizontalmente? ¿Por qué? Enumere los mecanismos fundamentales causantes de la transferencia horizontal de genes en los procariotas. ¿Cómo podrían los transposones ser especialmente importantes en la evolución de las bacterias patógenas? 6.13 Genoma esencial y pangenoma Uno de los conceptos más importantes que surgen de com- parar las secuencias genómicas de varias cepas de una misma especie es la distinción entre el pangenoma y el genoma esencial (core genome en inglés). El genoma esencial es aquel compartido por todas las cepas de la especie, mientras que el pangenoma incluye el esencial más todos los complementos opcionales presentes en una o más cepas, pero no en todas las cepas de la especie (Figura 6.31). Como hemos visto, es posible la transferencia horizontal de genes de elementos genéticos ente- ros como plásmidos, virus y elementos transponibles. Como consecuencia, entre cepas de una misma especie bacteriana a genes transferidos desde procariotas tras la separación de los principales linajes eucarióticos ( Sección 12.4), no a genes de posible origen procariótico que estén compartidos por todos los eucariotas en conjunto. Evolución del genoma y elementos móviles El término «DNA móvil» se refiere a los segmentos de DNA que se mueven de un sitio a otro en las moléculas de DNA hospe- dador ( Sección 10.11). La mayor parte del DNA móvil con- siste en elementos transponibles, pero también son comunes las secuencias de inserción y los genomas víricos integrados. Todos estos elementos móviles desempeñan un papel importante en la evolución del genoma (Figura 6.30). Los transposones son una forma común del DNA móvil y se pueden desplazar entre diferentes moléculas de DNA hospeda- dor, como cromosomas, plásmidos y virus, por la actividad de una enzima llamada transposasa ( Sección 10.11). En su des- plazamiento, pueden coger y transferir horizontalmente genes de unas características variadas, como la resistencia a antibió- ticos o la producción de toxinas. No obstante, los transposones también pueden mediar una serie de cambios cromosómicos a gran escala (Figura 6.30). Las bacterias que están experimen- tando cambios evolutivos rápidos a menudo contienen un gran número de elementos móviles, sobre todo secuencias de inser- ción, que son elementos transponibles sencillos cuyos genes solo codifican la transposición. La recombinación entre ele- mentos idénticos genera reordenaciones cromosómicas como deleciones, inversiones o translocaciones, lo que proporciona Figura 6.30 Los elementos móviles estimulan la evolución de los genomas. Diferentes elementos móviles se pueden desplazar de un organismo a otro, añadiendo así genes al genoma del receptor. Los más comunes de todos son los plásmidos, los bacteriófagos y los transposones. En el caso de los transposones, la actividad de la transposasa puede mediar reorganizaciones cromosómicas, tales como deleciones e inversiones de fragmentos de DNA cercanos al transposón. https://booksmedicos.org booksmedicos.org Botón1:
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