Descarga la aplicación para disfrutar aún más
Vista previa del material en texto
630 E C O L O G Í A M I C R O B I A N A Y M I C R O B I O L O G Í A A M B I E N T A L microbiana. Las medidas de actividad también proporcionan información valiosa para el diseño de cultivos de enriqueci- miento. 18.8 Ensayos químicos, métodos radioisotópicos y microelectrodos En muchos estudios, las mediciones químicas directas de las reacciones microbianas bastan para evaluar la actividad micro- biana en el medio. Por ejemplo, el destino de la oxidación del lactato por parte de las bacterias reductoras de sulfato en una muestra de sedimentos se puede rastrear fácilmente. Si en una muestra procedente de sedimentos existen y están activas bac- terias reductoras de sulfato, el lactato que se añada al sedi- mento será consumido y el SO 4 2– será reducido a H 2 S. Puesto que tanto el lactato como el SO 4 2– y el S2– se pueden medir con bastante sensibilidad mediante ensayos químicos sencillos, las Hasta aquí, en este capítulo nos hemos centrado en la medi-ción de la diversidad microbiana. Ahora pasaremos a estu- diar cómo medir la actividad microbiana; es decir, qué hacen realmente los microorganismos en su entorno. Las técnicas que vamos a analizar incluyen el uso de radioisótopos, microsenso- res, isótopos estables y varios métodos genómicos. Las mediciones de actividad en una muestra natural son estimaciones colectivas de las reacciones fisiológicas que ocu- rren en toda la comunidad microbiana, si bien diversas técni- cas de las que hablaremos más adelante (véanse las Secciones 18.10 y 18.11) permiten una evaluación más dirigida de la actividad fisiológica. Las mediciones de la actividad ponen de manifiesto los tipos y las velocidades de las principales reac- ciones metabólicas en un hábitat, y las diversas técnicas se pueden usar por sí solas o en combinación para realizar los análisis de las comunidades microbianas. Junto con las esti- maciones de biodiversidad y los análisis de expresión génica, estas ayudan a definir la estructura y el funcionamiento del ecosistema microbiano, el objetivo fundamental de la ecología phoR phoU pitA ppk pstC/pstA pstS phoA phoD phoX nifD nirB nasF amoC amoB amoA napF napD napG napH napC napB napA narI narJ narH nifH nifK narG narK amt nasD nasA/narB Conservación de la energía Crecimiento celular Transporte de Pi de alta afinidad Transporte de Pi de baja afinidad Reducción asimiladora de nitrato Transporte de amonio Oxidación de amoniaco Fijación de nitrógeno Fosfatasa alcalina Asimilación de fósforo Asimilación de nitrógeno Respiración anaerobia Quimilitotrofia Polifosfato Reducción desasimiladora de nitrato (de membrana/citoplasmática) Reducción desasimiladora de nitrato (periplasmática) Log10 transcritos/litro Límite de detección 6 7 8 9 9,4 Figura 18.20 Análisis metatranscriptómico de aguas superficiales marinas costeras. Expresión de genes de etapas fundamentales de los ciclos del N y del P en una muestra de agua marina, determinada por secuenciación de mRNA ambiental. Estos datos muestran que la comunidad microbiana estaba usando formas de fosfato (PO 4 3−) tanto inorgánicas (alta expresión de los transportadores de P) como orgánicas (fosfatasa alcalina). El bajo nivel de transcritos de genes necesarios para la asimilación de NO 3 − contrasta con la alta expresión de genes para el transporte y la oxidación quimiolitótrofa de NH 3 . También, como era de esperar para aguas superficiales óxicas marinas, hay poca expresión de genes para la respiración con NO 3 −. Datos gentileza de Mary Ann Moran. IV Medición de la actividad microbiana en la naturaleza https://booksmedicos.org booksmedicos.org Botón1:
Compartir