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53 Memorias del Instituto de Biología Experimental vol.6:53-56 (2012) Ediciones IBE Era Biotecnológica: Usos y Aplicaciones de la Biología Molecular en la Tecnología de Alimentos INDIRA PEREZ 1,2 , AMARYS AGUILAR 1,2 , MARIA SOLEDAD TAPIA 2 , MARINELA BARRERO 2 Y GUILLERMINA ALONSO 1 1 Laboratorio de Biología de Plásmidos, Instituto de Biología Experimental 2 Instituto de Ciencia y Tecnología de Alimentos Facultad de Ciencias, Universidad Central de Venezuela. Calle Suapure, Colinas de Bello Monte. Caracas - Venezuela Email: guillermina.alonso@ciens.ucv.ve La Biotecnología alimentaria aprovecha el desarrollo de la microbiología y la biología molecular para innovar en la producción de alimentos de calidad más sanos y seguros, así como en el desarrollo de procesos industriales de producción y control. En Venezuela son escasas las empresas del sector alimentario que emplean la biotecnología y las herramientas moleculares para el desarrollo de este campo. Como un aporte a la industria nacional, en el laboratorio se han estandarizado y aplicado herramientas para cubrir esta deficiencia en el ámbito de la Tecnología de Alimentos. Se realizaron estudios dirigido a la caracterización e identificación molecular de bifidobacterias probióticas en productos lácteos, con el fin de cuantificar y corroborar su presencia en el alimento comercializado en Venezuela. Asimismo se estandarizaron metodologías para aislar el material genético y posterior aplicación de una PCR para la identificación de muestras de atún fresco y enlatado, comercializados en el país, creando una herramienta confiable que permita distinguir las especies que puedan ser enmascaradas bajo etiquetas falsas. Estas técnicas rápidas y confiables garantizan el control y la calidad de estos alimentos, por lo que su uso puede ser una clave potencial para los sectores empresarial y gubernamental. Introducción La biotecnología se ha valido de numerosas técnicas moleculares que pueden ser utilizadas en distintos campos de investigación relacionados con diversidad de sectores productivos como la agricultura, el sector farmacéutico, el biomédico, el químico y por supuesto el sector alimentario. La aplicación de estas tecnologías modernas permite la producción de alimentos sanos y seguros. Sin embargo, los procesos de industrialización así como la globalización de los mercados, han hecho difícil mantener un control en el procesamiento de los mismos. Las empresas del área de alimentos deben mantener la trazabilidad o la documentación de las etapas especificas de producción, transformación y distribución de un alimento para certificar la calidad, su origen y su seguridad en relación a unos estándares conocidos. Esto se dificulta y se hace necesario investigaciones que permitan ratificar la transparencia en la cadena alimentaria en cuanto al tipo o pureza de la materia prima utilizada, como la presencia y calidad de los ingredientes que lo conforman y que la industria refleja en su etiquetado. La identificación de especies de plantas o animales con fines alimentarios solo con la observación de características exteriores, tales como la forma, tamaño o apariencia, es una tarea difícil y poco fiable (3). La misma situación se presenta para la identificación de cepas bacterianas probióticas en base a sus características fenotípicas, ya que no siempre estas pruebas proporcionan resultados confiables, debido a variaciones fenotípicas que las células pueden exhibir dependiendo de las condiciones y los medios de cultivo utilizados (4). La genética molecular permite la identificación de los organismos y sus productos gracias a su propio ADN y no a una etiqueta asociada, utilizándose fundamentalmente los métodos genotípicos de tipificación basados en la amplificación de ácidos nucleícos mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), pudiendo detectarse variaciones intra-especies acoplando la reacción con el uso de enzimas de restricción (PCR-RFLP). Esta técnica es relativamente rápida, reproducible y sólida, que no requiere de equipos costosos, y podría ser usada por las agencias de inspección de alimentos para hacer cumplir las regulaciones de etiquetado (6). Alternativamente, las reacciones de PCR para detectar secuencias repetitivas de los genomas bacterianos (ERIC-PCR y REP-PCR), permite la discriminación a nivel de género, especie e incluso de cepas, basándose en el patrón electroforético de los productos de amplificación (13). En Venezuela, la Biotecnología está comenzando a ser utilizada como una herramienta útil para la Ciencia de la Tecnología de los Alimentos, motivando la cooperación entre laboratorios que ha permitido el desarrollo de la línea de Biotecnología de Alimentos, implementando las prácticas moleculares en productos alimenticios con la finalidad de crear métodos factibles que puedan ser aplicados en los ámbitos industrial y gubernamental, que sirvan de 54 instrumentos de apoyo para técnicas de control de la calidad de los alimentos comercializados en el País. Estudio microbiológico de cepas de Bifidobacterium spp. presentes en productos lácteos tipo yogurt El concepto de alimento funcional es empleado para describir aquellos alimentos modificados, que poseen en su composición ingredientes que proporcionan un efecto positivo de forma dirigida, en la salud de un individuo, más allá del valor nutricional tradicional (10). Los probióticos son un ejemplo de ingrediente funcional, ya que son suplementos alimenticios conformados por microorganismos vivos capaces de modular la inmunidad sistémica del intestino (5). Los cultivos de bacterias probióticas, como las Bifidobacterias, son cada vez más frecuentes en productos fermentados, ya que su presencia no solo favorece el equilibrio de la microflora intestinal, sino que además están involucradas en la prevención y tratamiento de trastornos como la intolerancia a la lactosa, diarreas por rotavirus, la modulación de la respuesta inmunitaria, la reducción de los niveles de colesterol y la reducción de ciertos tipos de cáncer (11). A pesar de todos estos beneficios son pocos los estudios realizados en Venezuela dirigidos a la caracterización de estos microorganismos en este tipo de producto y no existen métodos oficiales para su estudio en alimentos, por lo cual se propuso estandarizar las técnicas microbiológicas convencionales y automatizadas, que permitan evidenciar la presencia de estas bacterias en dicho tipo de productos y obtener información de interés sobre los microorganismos de este género. En el Laboratorio se realizó el estudio de dos productos tipo yogurt de la misma casa comercial, y de los cuales el yogurt I era el único producto declarado probiótico que se comercializaba en el País (8,9). Se realizó el aislamiento de 30 colonias de cada tipo de yogurt analizado para un total de 60 colonias, de las cuales sólo 27 colonias del yogurt I y 11 colonias del yogurt II concuerdan con la identificación, según las pruebas microbiológicas aplicadas, y las características del género Bifidobacterium. Los resultados fueron comparados con los obtenidos con la galería Rapid ID 32 A para anaerobios, señalando al género Bifidobacterium spp como la primera opción de identificación. Estos resultados fueron obtenidos igualmente para la cepa pura Bifidobacterium lactis Bb12, utilizada en el estudio como un control positivo (7). Se comparó el crecimiento bacteriano de estos aislados bacterianos en dos medios de cultivo (MRS- m, RCA), sembrando por profundidad en placas y en tubos Miller-Pricket, obteniéndose mejores resultados con el medio MRS-m y las siembras por profundidad en tubos. El medio de cultivo MRS con adición de HCL-cisteína y una solución de antibióticos, constituye un medio selectivo apropiado para el crecimientode las bifidobacterias proveniente de los productos lácteos tipo yogurt analizados. Se creó una atmósfera anaerobia usando una solución de Alka- seltzer®, que proporcionó buenos resultados para el desarrollo de las bifidobacterias, comparable al obtenido con los sobres comerciales, demostrando que este sistema puede constituir una alternativa económica y de fácil adquisición. Los valores de los títulos bacterianos de cada producto permiten reportar que el yogur I cumple con los requisitos necesarios de la cantidad de microorganismos que debe poseer en su composición para ser considerado un alimento funcional según los estándares a nivel mundial (7). Estudio molecular de las cepas de Bifidobacterium spp presentes en productos lácteos tipo yogurt Para complementar los estudios microbiológicos, se implementaron métodos moleculares para la identificación y la tipificación de las colonias aisladas. Utilizando el método de lisis alcalina se realizaron extracciones de ADN de cada una de las cepas aisladas, cuya calidad fue corroborada mediante la amplificación del gen rRNA16S. Comprobada la eficiencia del aislamiento, se realizó la caracterización e identificación molecular por ERIC-PCR y REP- PCR de los aislados mediante la comparación de los patrones obtenidos para los aislados y para la cepa control B. lactis. Los patrones obtenidos permitieron determinar que 34 de los 60 aislados poseían una estrecha relación clonal entre si, que a su vez correspondían con los patrones generados por la cepa de B. lactis utilizada como control positivo (7). Estos resultados concuerdan con los reportados en la bibliografía, demostrando la correcta identificación de la especie utilizada como probiótico (12). Este estudio representa el primer trabajo que demuestra que las técnicas moleculares basadas en secuencias repetidas ERIC y REP son una clave para la detección y caracterización microbiológica de especies de bifidobacterias de una forma rápida, sin descartar los métodos tradicionales de identificación, y que las mismas pueden ser utilizadas por la industria y los entes encargados del control de la calidad en este tipo de productos para garantizar la presencia de este grupo probiótico. Se recomienda continuar con las investigaciones y el mejoramiento de las técnicas de identificación de los microorganismos probióticos, para incrementar su uso por parte de la industria alimentaria y farmacéutica, siempre manteniendo los controles para corroborar la 55 existencia de estos productos probióticos y la calidad de las cepas utilizadas en Venezuela Estandarización del método de extracción de ácidos nucleicos en muestras comerciales enlatadas de atún (Thunnus spp). El Atún (Thunnus spp) es una especie de gran valor para el sector pesquero que puede ser localizado en aguas templadas, como el atún aleta azul (T. thynnus) y la albacora o atún blanco (T. alalunga), así como en aguas cálidas el atún aleta amarilla o rabil (T. albacares) y el barrilete (K. pelamis). Tanto el atún como el salmón, son especies de gran valor comercial cuya composición química lo hace ideal para ciertos procesos, como el ahumado o enlatado. Sin embargo, existen al menos 17 tipos de pescado de menor costo que poseen una carne de textura, sabor y color similar, por lo que la adulteración de estas especies en productos enlatados, puede generar cambios en el producto final, que no son esperados ni detectados por el consumidor si la etiqueta no declara lo que en realidad contiene el producto, pudiéndose establecer así un fraude en la venta de dicho rubro. Hasta la fecha en nuestro país no se había realizado ningún estudio basado en la genética molecular para evitar fraude con los productos pesqueros. En Venezuela, se conoce muy poco acerca de las especies de túnidos que están siendo empleadas en el proceso de enlatado de este rubro alimenticio, por lo cual se desarrolló un protocolo que permitiera distinguir las especies de atún, y diferenciarlas de otros pescados que puedan ser enmascarados bajo etiquetados falsos. Uno de los problemas principales para ejecutar exitosamente estos métodos de identificación en la industria del atún, es la cantidad y la calidad del ADN extraído a partir de las muestras que han sido procesadas para el enlatado, ya que los ácidos nucleicos pueden sufrir algún proceso de degradación debido a los tratamientos térmicos a los que está sometido el músculo durante el proceso de enlatado (cocción y esterilización), y también puede influir la composición de los aditivos que se agregan para la presentación final del producto. Se inició la estandarización del método de extracción de ADN, utilizando diferentes técnicas, basadas en el uso de detergentes iónicos y fenol/cloroformo, a partir de muestras tanto de atún fresco como enlatados de distintas presentaciones, tales como atún al limón, en aceite de oliva, al natural y ahumado, utilizando como control positivo carne de músculo provenientes de atún fresco y como control negativo bagre rayado ((Pseudoplatystoma tigrinum). Las muestras fueron de lotes diferentes, obtenidos en supermercados y mercados populares de la ciudad capital (1). Este trabajo permitió estandarizar el método más adecuado para la purificación del material genético de muestras de atún, para su posterior utilización para fines de identificación. El análisis de los resultados permite proponer que el método modificado experimentalmente en el Laboratorio produce resultados satisfactorios para cualquier material biológico fresco, el cual podrá ser utilizado en pruebas moleculares posteriores para la identificación taxonómica del producto. Para los productos procesados, aun cuando el ADN puede haber sido alterado por los diversos procesamientos a los cuales es sometido el producto (calentamiento, añadido de sustancias, enlatado), es todavía factible amplificar fragmentos utilizando PCR, los cuales aportarán la información suficiente para su correcta identificación. Evaluación de la técnica de PCR para la identificación molecular de especies de atún (Thunnus spp) comercializadas en Venezuela En el laboratorio se propuso como objetivo evaluar, mediante técnicas de PCR, la identificación molecular de algunas muestras de atún, tanto fresco como enlatado, que son comercializados en Venezuela. Se realizó la reacción de PCR asociada a Polimorfismo de la Longitud de Fragmentos de Restricción (PCR- RFLP), utilizando dos juegos de cebadores, para amplificar un fragmento del gen mitocondrial que codifica para el citocromo b y diferentes enzimas de restricción, empleando una modificación del método descrito por Pardo y Pérez-Villareal (6). La técnica de PCR-RFLP empleada fue lo suficientemente específica como para identificar molecularmente las especies de túnidos, utilizando el material genético obtenido de muestras de atún fresco y enlatado. Este trabajo representa uno de los primeros estudios de trazabilidad molecular en Venezuela, como método para la autentificación de especies como forma de inspección de la calidad de los alimentos. Se identificó que una de las especies empleadas para el proceso de enlatado es el atún blanco o T. alalunga (2) El ADN purificado a partir de muestras tomadas en cualquier punto a lo largo de la cadena de producción puede ser confrontado con la historia del organismo, estableciendo, de este modo, las bases para un sistema individualizado de control. Así, el trazado mediante el análisis del ADN puede ligar el producto final (atún enlatado, fileteado, ahumado, entre otros) hasta su origen, a través de todos los pasos del proceso. Este trabajo representa un avance científico importante para Venezuela, ya que métodos como estos no han sido aplicados con el fin de la autentificacióncomo forma de inspección de la calidad de los alimentos. 56 Consideraciones Finales Las técnicas moleculares ofrecen en esta nueva era biotecnológica un desarrollo acelerado e innovador de gran utilidad para la producción y control de diversos productos alimenticios que se comercializan en el País, en comparación a otras técnicas convencionales que si bien son útiles deben ser complementadas. La autenticidad del alimento es un término que se refiere simplemente a si el alimento adquirido por el consumidor corresponde con su descripción. Las metodologías implementadas en el laboratorio proporcionan las herramientas para comprobar la autenticidad de estos productos. Este conocimiento puede ser transferido tanto a las empresas como a los organismos encargados de monitorear el control de calidad de la industria de alimentos en el País. Agradecimientos Estos trabajos fueron financiados por el Consejo de Desarrollo Científico y Humanístico (CDCH) a GA (PG-03-7327-2008), y MB (PG 03.6506.2006/2) y por el proyecto del Fondo Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación (FONACIT) MT (G- 200001538) Referencias 1. Aguilar, A., Alonso, G. y Barrero, M. (2011). Estandarización del método de extracción de ácidos nucleicos en muestras comerciales enlatadas de atún (Thunnus sp.). Rev. Venez. Cienc. Tecnol. Aliment. 2(1): 061-072. 2. Aguilar, A., Alonso, G. y Barrero, M. (2012). Identificación de especies de atún (Thunnus spp) en Venezuela utilizando la técnica de PCR. En revisión, Rev. Científ. FCV-LUZ. 3. López. M., Mallorquín. P. y Vega M. (2003). Tecnologías Moleculares de Trazabilidad Alimentaria. Informe de Vigilancia Tecnológica. Genoma España. Sector Agroalimentario. GEN-ES03001: 07-34. 4. Mitsuoka, T. y Kaneuchi, CH. (1977). Ecology of the Bifidobacteria. Am. J. Clin. Nutr. 30: 1799-1810. 5. 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Estudio Microbiológico de cepas de Bifidobacterias aisladas de productos lácteos tipo yogurt. XIX Congreso Latino Americano y VI Ecuatoriano de Microbiología. 10. Roberfroid, M.B. (2000). Concepts and strategy of functional foods science: the European perspective. Am. J. Clin. Nutr. 71(Suppl 6): S1660-1664. 11. Russell, D., Ross, R., Fitzgerald, G. y Stanton, C. (2011). Metabolic activities and probiotic potential of Bifidobacteria. Int. J. Food Microbiol. 149(1): 88-105. 12. Ventura, M., Meylan, V. y Zink, R. (2003). Identification and tracing of Bifidobacterium species by use of Enterobacterial Repetitive Consensus Sequences. Appl. Environ. Microbiol. 69(7): 4296-4301. 13. Vilchez, G. y Alonso, G. (2009). Alcances y limitaciones de los métodos de epidemiología molecular basados en el análisis de ácidos nucleicos. Rev. Soc. Ven. Microbiol. 29: 6-12.
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