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344 G E N Ó M I C A , G E N É T I C A Y V I R O L O G Í A la PCR. El cebador mutágeno se diseña para aparearse con la diana con el error de apareamiento en medio, y debe tener sufi- cientes nucleótidos apareados en ambos lados del sitio de error para que se mantenga estable durante la PCR. El cebador mutá- geno es apareado luego con un cebador normal. Cuando la PCR amplifica el DNA diana, incorpora la mutación (o mutaciones) en el producto final amplificado. Aplicaciones de la mutagénesis dirigida La mutagénesis dirigida se puede utilizar para estudiar la acti- vidad de las proteínas que contienen sustituciones conoci- das de aminoácidos. Supongamos que estudiásemos el centro activo de una enzima. La mutagénesis dirigida podría usarse para cambiar un aminoácido específico de la enzima, y después podríamos ensayar la actividad de la enzima modificada y com- pararla con la de tipo salvaje. En este experimento, el vector que codifica la enzima mutante se inserta en una cepa hospeda- dora mutante incapaz de sintetizar la enzima original. Por con- siguiente, la actividad que medida será debida únicamente a la versión mutante de la enzima. Gracias a la mutagénesis dirigida, los enzimólogos pueden relacionar con la secuencia de aminoácidos específicos de la proteína prácticamente cualquier aspecto de la actividad de una enzima, como la catálisis, la resistencia o la sensibilidad a agen- tes químicos o f ísicos, o las interacciones con otras proteínas. En concreto, en un ejemplo de la ingeniería genética, la muta- génesis dirigida ha permitido modificar la afinidad del sitio de unión al receptor de la hormona de crecimiento bovino soma- totropina, de tal modo que esta estimule el crecimiento y no la producción de leche en los humanos (Sección 11.12). Mutagénesis por inserción de un casete e interrupción génica Para hacer cambios en el DNA mayores que unos pocos pares de bases o para reemplazar fragmentos de un gen de interés, se pueden usar fragmentos sintéticos llamados casetes de DNA (o cartuchos) para mutar el DNA en un proceso cono- cido como mutagénesis por inserción de casete. Estos case- tes, que se pueden sintetizar mediante la reacción en cadena de la polimerasa o por síntesis directa del DNA, podrán reempla- zar fragmentos en el DNA de interés usando sitios de restric- ción. No obstante, si no hay sitios de restricción adecuados en la ubicación que interesa, se pueden insertar por mutagénesis sólido y se repite la serie de reacciones para añadir el nucleótido siguiente. Cuando el oligonucleótido tiene la longitud deseada, se separa del soporte en fase sólida mediante un reactivo espe- cífico y se purifica para eliminar subproductos y contaminantes. Mutagénesis dirigida La mutagénesis dirigida es una herramienta potente que per- mite cambiar cualquier par de bases de un gen concreto, de modo que tiene muchas aplicaciones en genética. La mutagé- nesis dirigida se emplea para cambiar las propiedades de una proteína como la actividad enzimática o la afinidad del sitio de unión (Sección 11.12). Para esto se modifica la secuencia génica de tal modo que provoque un cambio en la secuencia de ami- noácidos. El procedimiento básico consiste en sintetizar un oligonucleótido corto de DNA que actúe como cebador y que contenga el cambio de par de bases (la mutación) deseado y per- mitir que se aparee con el DNA monocatenario que contiene el gen diana. El apareamiento será total excepto en la pequeña región del error. Entonces, usando una DNA polimerasa, se extenderá el oligonucleótido sintético y se copiará el resto del gen. A continuación, la molécula bicatenaria obtenida se inserta en una célula hospedadora por transformación. A menudo, los mutantes se seleccionan mediante algún tipo de selección posi- tiva, como la resistencia a antibióticos; en este caso, el DNA modificado también llevará un marcador de resistencia a anti- bióticos. En la Figura 11.9 se ilustra un método de mutagénesis dirigida. El proceso empieza con la clonación del gen diana en un vector plasmídico. Este vector bicatenario se desnaturaliza para pro- ducir DNA monocatenario y el oligonucleótido mutado puede unirse a continuación mediante apareamiento de bases comple- mentarias con el gen diana. Después de la extensión mediante una DNA polimerasa, la molécula de DNA tiene un error de apareamiento en una cadena. Después de la transformación en una célula hospedadora, de la replicación del DNA vector y de la división celular, las dos moléculas hijas estarán comple- tamente apareadas, pero una de ellas llevará una mutación y la otra será de tipo salvaje. Entonces se hace un cribado de las bac- terias de la nueva generación en busca de las portadoras de la mutación. La mutagénesis dirigida también puede llevarse a cabo mediante la PCR. En este caso, el oligonucleótido pequeño de DNA con la mutación de interés se utiliza como cebador en Figura 11.9 Mutagénesis dirigida usando DNA sintético. Se pueden utilizar pequeños oligonucleótidos sintéticos para generar mutaciones. Se clona el DNA de origen en un plásmido y se desnaturaliza, lo que genera el DNA monocatenario necesario para la mutagénesis dirigida. DNA de origen DNA plasmídico monocatenario Apareamiento con los genes de origen Clonación y selección de mutantes 1. Clonación en el plásmido y desnaturalización 2. Adición de oligonucleótido sintético con error en una base 3. Extensión de cadena sencilla con la DNA polimerasa 4. Transformación y selección https://booksmedicos.org booksmedicos.org Botón1:
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