Biologia de los microorganismos (629)

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E V O L U C I Ó N Y S I S T E M Á T I C A M I C R O B I A N A S 397
U
N
ID
A
D
 3
12.10 Clasificación y nomenclatura
Terminamos nuestro tratamiento de la evolución y la siste-
mática microbianas con una breve descripción de la ciencia 
de la taxonomía, mediante la cual se clasifican y nombran las 
especies de Bacteria y de Archaea. También hablaremos de 
las colecciones de cultivos, que son almacenes de depósito 
científico de cultivos microbianos vivos; describiremos algu-
nos recursos taxonómicos fundamentales disponibles para la 
microbiología, y citaremos el procedimiento para nombrar 
especies microbianas nuevas. La descripción formal de una 
nueva especie microbiana y el depósito de los cultivos en una 
colección de cultivos constituyen una base importante para la 
sistemática procariótica.
Taxonomía y descripción de especies nuevas
La clasificación es la organización de los organismos en grupos 
cada vez más inclusivos según la semejanza fenotípica o las rela-
ciones evolutivas. Una especie está constituida por una o varias 
cepas, y las especies similares se agrupan en géneros. Los géne-
ros similares se agrupan en familias, las familias en órdenes, los 
órdenes en clases hasta llegar al dominio, el taxón de nivel más 
alto basado en un conjunto de información fenotípica y genotí-
pica. Este esquema jerárquico se ilustra en la Tabla 12.3.
La nomenclatura es la forma de nombrar a los organismos, 
y sigue el sistema binomial de nomenclatura diseñado por el 
médico y botánico sueco Carl Linneo (1707-1778) y utilizado 
en todos los ámbitos de la biología; los organismos se nombran 
mediante el nombre del género y el adjetivo de la especie. Los 
nombres son en latín o en derivaciones de griego latinizado; a 
menudo son descriptivos de alguna propiedad fundamental del 
organismo y se escriben en cursiva. Al clasificar los organismos 
en grupos y nombrarlos, ordenamos el mundo microbiano natu-
ral y hacemos posible la comunicación eficaz de todos los aspectos 
de organismos particulares como el comportamiento, la ecología, 
la fisiología, la patogenia o las relaciones evolutivas. La creación 
de nombres nuevos debe seguir las reglas descritas en el Código 
Internacional de Nomenclatura de las Bacterias. Dicho código 
representa el marco formal mediante el cual las bacterias y las 
arqueas se deben nombrar oficialmente y los procedimientos por 
los cuales se pueden cambiar los nombres existentes, por ejem-
plo cuando nuevos datos justifican la reordenación taxonómica.
Cuando se aísla de la naturaleza un microorganismo nuevo 
y se piensa que es único, se debe tomar una decisión acerca de 
si es lo bastante diferente de otros procariotas como para ser 
descrito como un nuevo taxón. Para conseguir la validación 
formal de la categoría taxonómica como nuevo género o espe-
cie, se debe publicar una descripción detallada de las carac-
terísticas y los rasgos distintivos del organismo, junto con el 
nombre propuesto y, como se ha indicado, hay que depositar 
cultivos viables del organismo en al menos dos colecciones de 
cultivos internacionales (Tabla 12.4). El manuscrito con la des-
cripción y el nombre de un nuevo taxón es sometido a la revi-
sión de expertos (peer review) antes de su publicación. Uno de 
los principales vehículos para la descripción de nuevos taxo-
nes es la revista Internation Journal of Systematic and Evolutio-
nary Biology (IJSEM), la publicación oficial de registro para la 
taxonomía y la clasificación de bacterias, arqueas y eucariotas 
microbianos. En cada número, IJSEM publica también una lista 
Generalmente, las características fenotípicas de las cepas 
dependen en gran medida de las condiciones de cultivo, y los 
fenotipos observados en el ambiente del laboratorio pueden no 
representar exactamente los fenotipos presentes en el medio 
natural; así pues, hay que tener cuidado al usar las característi-
cas fenotípicas en los análisis sistemáticos. El valor sistemático 
de las diferentes características fenotípicas puede variar según 
los grupos que se estén analizando.
MINIRREVISIÓN
 ¿Qué clase de genes se usan en los análisis MLST?
 ¿En qué se diferencia el ribotipado de la rep-PCR?
 ¿Qué es un análisis FAME?
Figura 12.30 Análisis de ésteres metílicos de ácidos grasos (FAME) 
en la identificación bacteriana. (a) Clases de ácidos grasos en Bacteria. 
De cada clase se da un solo ejemplo, pero en realidad se conocen más de 
doscientos ácidos grasos de origen bacteriano distintos estructuralmente. 
Un éster metílico contiene un grupo metilo (CH
3
) en lugar del protón del 
grupo carboxílico (COOH) del ácido graso. (b) Procedimiento. Cada pico del 
cromatograma es debido a un éster metílico de ácido graso concreto, y la 
altura del pico es proporcional a su cantidad.
Clase/ejemplo
Clases de ácidos grasos en Bacteria
I. Saturados:
ácido tetradecanoico
II. Insaturados:
ácido omega-7-cis-
 hexadecanoico
III. Ciclopropano:
ácido cis-7,8-
metilenhexadecanoico
IV. Ramificados:
ácido 13-metiltetradecanoico
V. Hidroxi:
ácido 3-hidroxitetradecanoico
Comparación del patrón de picos
con los patrones de las bases
de datos
IDENTIFICACIÓN
DEL ORGANISMO
Estructura del ejemplo
C
a
n
ti
d
a
d
Picos de diversos ésteres
metílicos de ácidos grasos
(a)
(b)
Cultivo bacteriano
Extracción de ácidos
grasos
Derivatización para
formar ésteres metílicos
Cromatografía de gases
C (CH2)12 CH3
O
HO
C (CH2)6 C C (CH2)6 CH3
O
HO
HH
O
H H
C (CH2)7 C C (CH2)5 CH3
HO
CH2
C (CH2)11
O
HO
C
H
CH3 
C CH2 C (CH2)10 CH3
O
HO
H
OH
CH3 
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