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{Aminoácidos / Proteínas} 1 🍳 {Aminoácidos / Proteínas} Introducción Una de las múltiples funciones de los aminoácidos en las células, es ser las unidades estructurales de las proteínas. Las mismas están formadas por asociación de aminoácidos, en diferente proporción. Aunque existen más de 300 aminoácidos, solo un conjunto de 20 constituyen las unidades monoméricas que formara el esqueleto básico de las proteínas. El tipo, el número y el orden de los diversos aminoácidos establecen las propiedades y funciones de las miles de proteínas que existen. 1. Aminoácidos: Son las unidades básicas que forman las proteínas, Su denominación corresponde a la composición química general que presentan, en la cual un grupo amino (-NH2) y un carboxilo (-COOH) se unen aun carbono alfa (-C), las otras dos valencias quedan saturadas a un átomo de hidrogeno (-H), y un grupo químico variable llamado radical (- R). Tridimensionalmente el carbono α presenta una configuración tetraédrica en la que el carbono se dispone en el centro y los cuatro elementos que se unen a él ocupan los vértices. Según la disposición del grupo amino (-NH2) a la izquierda o a la derecha del carbono α se habla de α-L-aminoácidos o de α-D- aminoácidos respectivamente. En las proteínas sólo se encuentran aminoácidos de configuración L. (Figura 2). El átomo de carbono α, tiene sus 4 sustituyentes diferentes, lo cual lo hace un {Aminoácidos / Proteínas} 2 carbono quiral. Con excepción de la glicina, para el cual el R es otro átomo de hidrogeno, la quiralidad le confiere actividad óptica (poder rotar la luz polarizada). 1.1 Propiedades acido-base de aminoácidos: La existencia, en una misma molécula de un grupo ácido y básico, le da a los aminoácidos propiedades eléctricas especiales. En soluciones acuosas, estos compuestos se encuentran disociados, con carga negativa y positiva sobre la misma molécula, por tal características se dice que los aminoácidos son iones dipolares o anfolitos. . El carboxilo actúa como ácido: El grupo amina acepta H+ y actúa como base En soluciones ácidas fuertes el ion dipolar capta un H+ en su carboxilo que se comporta como base, a la inversa en solución básica. En soluciones básicas, el grupo amino libera un H+, el cual se comporta como acido, liberando el protón al medio. Es decir que la carga eléctrica del aminoácido varía con el pH del medio en el cual está disuelto. Hay un valor de pH en el cual la disociación de cargas + y - se iguala y por lo tanto la carga total será nula, este valor de pH es el punto isoeléctrico (PI). 1.2 Curva de titulación de los aminoácidos Los equilibrios de disociación para cada uno de los grupos ionizables serían: Una solución de un aminoácido con sólo estos 2 grupos estarán ionizados y el pH corresponderá a su PI. A partir de ahí se pueden hacer 2 titulaciones usando un ácido (por ej HCl) y un hidróxido (por ej NaOH). La representación de las titulaciones sería: O sea que a través de esta curva se puede determinar los pK de cada punto ionizables. El aplanamiento del gráfico en la zona de los pK demuestra su acción buffer en esas zonas. En general el pk1 (ácido) son siempre próximos a 2 y el pk2 (base) varía entre 9 y 10, es decir, alejados del pH fisiológico. 1.3 Clasificación de aminoácidos: Los aminoácidos se pueden clasificar según su cadena lateral: O según sean esenciales o no esenciales. Los aminoácidos esenciales son aquellos que el cuerpo humano no puede generar por sí solo. Esto implica que la única fuente de estos aminoácidos en esos organismos es la ingesta directa a través de la dieta. Las rutas para la obtención de estos aminoácidos esenciales suelen ser largas y energéticamente costosas. {Aminoácidos / Proteínas} 3 Cuando un alimento contiene proteínas con todos los aminoácidos esenciales, se dice que son de alta o de buena calidad. Solo ocho aminoácidos son esenciales para todos los organismos, algunos se pueden sintetizar, por ejemplo, los humanos podemos sintetizar la alamina a partir del piruvato. En humanos se han descrito estos aminoácidos esenciales: • Fenilalanina • Isoleucina • Leucina • Lisina • Metionina • Treonina • Triptófano • Valina • Arginina • Histidina (solo en la infancia) 1. Enlace peptídico Dos aminoácidos se unen por una unión de tipo amida, llamada UNION PEPTIDICA entre el aminoácido de uno y el carboxilo de otro con pérdida de una molécula de agua. La formación del enlace peptídico, es un ejemplo de una reacción de condensación. Dos moléculas se unen mediante un enlace de tipo covalente CO-NH con la pérdida de una molécula de agua y el producto de esta unión es un dipéptido. El grupo carboxilo libre del dipéptido reacciona de modo similar con el grupo amino de un tercer aminoácido, y así sucesivamente hasta formar una larga cadena. Podemos seguir añadiendo aminoácidos al péptido, porque siempre hay un extremo NH2 terminal y un COOH terminal. Por otra parte, el carácter parcial de doble enlace del enlace peptídico (-C-N-) determina la disposición espacial de éste en un mismo plano, con distancias y ángulos fijos. Como consecuencia, el enlace peptídico presenta cierta rigidez e inmoviliza en el plano a los átomos que lo forman, no permite rotación libre de esos átomos. Esta limitación trae como consecuencia (Figura 3): I. Los cuatro átomos del enlace peptídico en el mismo plano. II. El oxígeno del C=O y el H del amino quedan en posición trans III. R y el H unidos al C se proyectan fuera del plano que contiene a los 4 átomos del enlace. {Aminoácidos / Proteínas} 4 Por otra parte, el carácter parcial de doble enlace del enlace peptídico (-C-N-) determina la disposición espacial de éste en un mismo plano, con distancias y ángulos fijos. Como consecuencia, el enlace peptídico presenta cierta rigidez e inmoviliza en el plano a Cuando un péptido está formado por más de 10 aminoácidos se llama polipéptido y si su masa molecular es superior a 6000 dalton (aproximadamente más de 50 aminoácidos) se llama proteína. Este límite es arbitrario y se relaciona con la masa de la insulina que fue la primera proteína cuya estructura completa se pudo conocer con exactitud. Toda cadena tendrá un amino libre que se toma como el comienzo de la cadena y el carboxilo libre como el final. Las propiedades ácido-base de un péptido están dadas por sus grupos terminales y por los grupos ionizables de sus cadenas laterales. También poseen un PI. Uno de los péptidos más importantes es el glutation (tripéptido que participa en sistemas enzimáticos), hay otros que forman hormonas como ej: glucagon, calcitonina, secretina, vasopresina, adrenocorticotrofina, oxitocina, etc. Proteínas En una cadena polipeptídica los grupos que participan de la unión peptídica no se disocian, sólo lo hacen los grupos libres. La ionización sola de los grupos extremos (amino y carboxilo) no tienen gran influencia en el carácter ácido-base de una macromolécula, en realidad la carga eléctrica de una proteína depende de la ionización de los grupos libres de las cadenas laterales de los aminoácidos que forman la proteína. Proteína con alta presencia de Arginina o Histidina a Molécula básica Proteína con alta presencia de Ácido aspártico, Ácido glutámico, Tirosina, Cisteína Molécula ácida. Las proteínas también poseen su PI, entonces una proteína en medio ácido tendrá carga + o – en medio básico, esto determinará la migración de una proteína en un campo eléctrico (electroforesis). Si se tiene una mezcla de 2 o + proteínas con distinto PI, migrarán de distinta forma y esto es lo que se conoce como fraccionamiento electroforético. Conociendo la masa molecular de una proteína, se pueden saber cuantos aminoácidos la forman, si su masa se divide por 120 (que es el valor promedio para los restos de aminoácidos) Solubilidad: la mayor parte de las proteínas son solubles en agua o soluciones acuosas, yaque el agua interactúa con la proteína y forma una cubierta o capa de solvatación. El agua aísla entre sí a los grupos con carga opuesta en distintas moléculas y así impiden que se agreguen y precipiten. La diferencia de solubilidad {Aminoácidos / Proteínas} 5 entre distintas proteínas se debe a su distinto grado de hidratación que se relaciona con el número de grupos polares de una molécula. Efecto de pH: la solubilidad es mínima en el PI 3.1 Estructura de las proteínas: Todas las proteínas poseen una misma estructura química central, que consiste en una cadena lineal de aminoácidos. Lo que hace distinta a una proteína de otra es la secuencia de aminoácidos de que está hecha, a tal secuencia se conoce como estructura primaria de la proteína. Esta secuencia lineal de aminoácidos puede adoptar múltiples conformaciones en el espacio que se forma mediante el plegamiento del polímero lineal. Tal plegamiento se desarrolla en parte espontáneamente, por la repulsión de los aminoácidos hidrófobos por el agua, la atracción de aminoácidos cargados y la formación de puentes disulfuro y también en parte es ayudado por otras proteínas. Podemos entonces distinguir cuatro niveles de estructuración en las proteínas: Estructura primaria: se refiere a número, identidad y ordenamiento y secuencia de los aminoácidos en la cadena. La unión peptídica sólo permite estructuras lineales sin ramificaciones. Estructura secundaria: disposición espacial regular, repetitiva que adopta la cadena mantenida en general por enlaces de hidrógeno. Mediante estudios de difracción por rayos x se confirmaron los modelos teóricos antes expuestos y a partir de ellos se propusieron 2 tipos de estructuras secundarias periódicas: la hélice y la hoja plegada o lámina ß. Hélice : cadena enrollada sobre un eje central (como si se envolviese un cilindro). Una vuelta tiene una distancia de 5,4 Aº a lo largo del eje y requiere 3,6 aminoácidos. El giro es en sentido horario y por eso se habla de hélice dextrógira o derecha. Este tipo de estructura se mantiene unida por puente de hidrógeno. Cada grupo C=O forma un puente de hidrógeno con el =NH del resto aminoácido ubicado 4 lugares más adelante en la cadena, cuando se dió una vuelta completa y los grupos quedan vecinos (la disposición trans es lo que permite la unión). Si bien el enlace H es débil, la existencia de gran cantidad a lo largo de la hélice hace que se vuelva una estructura estable y compacta. Para esta disposición secundaria, la primaria debe tener algunas condiciones; por ej. la presencia de prolina es incompatible con la hélice (su núcleo pirridolina no permite la rotación), la presencia de grupos voluminosos con carga localizados próximos entre sí originan fuerzas electrostáticas que pueden dificultar la formación de la hélice. Lámina ß: la cadena polipeptídica está más extendida que en la hélice . Si 2 o + {Aminoácidos / Proteínas} 6 cadenas así extendidas se aparean, puede establecerse entre ellas puente de H; formando estructuras laminares que presentan un plegamiento en zigzag. Puede existir otro tipo de disposición secundaria como ocurre en el colágeno (hélice del colágeno) o bien puede ser la estructura que no sea regular y en ese caso se habla de disposición o enrollamiento al azar, esto implica adoptar la orientación espacial que termodinámicamente sea la más favorable. Una misma molécula puede tener distintos tipos de estructura secundaria, se podría decir que las proteínas globulares tienen segmentos en hélice, al azar y láminas ß o bien toda la molécula al azar, en cambio las proteínas fibrosas tienen casi exclusivamente estructura en hélice o en lámina ß. Estructura terciaria: Es la disposición tridimensional completa de la proteína de acuerdo a la forma final se las clasifica: en globulares y fibrosas. La disposición final no es fortuita, se mantiene gracias a uniones e interacciones que establecen las cadenas laterales de los aminoácidos; teniendo además en cuenta que deberá ser la forma más apropiada desde el punto de vista termodinámico. Fuerzas que contribuyen a mantener la estructura terciaria: 1. Fuerza de atracción o repulsión electrostática 2. Enlaces de hidrógeno 3. Puentes disulfuros 4. Presencia de cadenas hidrofóbicas: tienden a alejarse del agua y pliegan estos grupos hacia el interior de la molécula, que hacen más intensa las fuerzas de atracción de Van der Walls. Tienden a disponerse hacia el exterior de la molécula, en contacto con el solvente polar. Estructura cuaternaria: sólo aplicable a proteínas formadas por dos o más cadenas polipeptídicas (proteínas oligoméricas) y se refiere a la disposición espacial de esas cadenas y a los enlaces que entre ellas se establecen (puentes de hidrógeno, atracciones electrostáticas, interacciones hidrofóbicas, puentes disulfuro, etc.). A medida que se ha podido avanzar en el conocimiento de la estructura de las proteínas se ha determinado la existencia de sectores de la molécula con estructuras y plegamientos definidos, a los que se llama dominios y, que frecuentemente se relacionan con misiones específicas dentro de la función de la proteína. Clasificación de las proteínas Proteínas simples: por hidrólisis total sólo dan origen a aminoácidos: albúminas (proteínas de tipo globular), globulinas (forma ovoidal, proteína globular), {Aminoácidos / Proteínas} 7 histonas (presente en el núcleo celular, asociadas al ADN), gluteninas y gliadinas (presentes en granos de cereal), escleroproteínas (forman parte de tejidos animales de sostén o de gran resistencia física y las más importantes son queratina -tejido epidérmico-, colágeno –tejido conjuntivo- y elastina –fibras elásticas del tejido conjuntivo-). Proteínas conjugadas: formada por la asociación de una proteína simple (apoproteína) y una porción no proteica (grupo prostético) formando una unidad molecular. Ej. nucleoproteínas (histonas+ácidos nucleicos), cromoproteínas (grupo prostético hemo como hemoglobina y citocromos, flavoproteínas), glicoproteínas (grupo prostético: hidratos de carbono), fosfoproteínas (grupo prostético: ácido fosfórico), lipoproteínas (grupo prostético: lípidos), metaloproteínas (grupo prostético: metal). Propiedades de las proteínas Especificidad La especificidad se refiere a su función; cada una lleva a cabo una determinada función y lo realiza porque posee una determinada estructura primaria y una conformación espacial propia; por lo que un cambio en la estructura de la proteína puede significar una pérdida de la función. Desnaturalización. Consiste en la pérdida de la estructura terciaria, por romperse los puentes que forman dicha estructura. Todas las proteínas desnaturalizadas tienen la misma conformación, muy abierta y con una interacción máxima con el disolvente, por lo que una proteína soluble en agua cuando se desnaturaliza se hace insoluble en agua y precipita. La desnaturalización se puede producir por cambios de temperatura, (huevo cocido o frito), variaciones del pH. En algunos casos, si las condiciones se restablecen, una proteína desnaturalizada puede volver a su anterior plegamiento o conformación, proceso que se denomina renaturalización. Funciones Las funciones de las proteínas son de gran importancia, son varias y bien diferenciadas. Las proteínas determinan la forma y la estructura de las células y dirigen casi todos los procesos vitales. Las funciones de las proteínas son específicas de cada tipo de proteína y permiten a las células defenderse de agentes externos, mantener su integridad, controlar y regular funciones, reparar daños, etc. Las funciones principales de las proteínas son las siguientes: Estructural La función de resistencia o función estructural de las proteínas también es de gran importancia ya que las proteínas forman tejidos de sostén y relleno que confieren elasticidad y resistencia a órganosy tejidos. Ejemplo de ello es el colágeno del tejido conjuntivo fibroso, reticulina y elastina del tejido conjuntivo elástico. Con este tipo de {Aminoácidos / Proteínas} 8 proteínas se forma la estructura del organismo. Algunas proteínas forman estructuras celulares como las histonas, que forman parte de los cromosomas que regulan la expresión genética. Las glucoproteínas actúan como receptores formando parte de las membranas celulares o facilitan el transporte de sustancias. También es una proteína con función estructural la queratina de la epidermis. Enzimática Las proteínas cuya función es enzimática son las más especializadas y numerosas. Actúan como biocatalizadores acelerando las reacciones químicas del metabolismo. En su función como enzimas, las proteínas hacen uso de su propiedad de poder interaccionar, en forma específica, con muy diversas moléculas. Hormonal Algunas hormonas son de naturaleza proteica, como la insulina y el glucagón que regulan los niveles de glucosa en sangre. También hormonas segregadas por la hipófisis como la hormona del crecimiento directamente involucrada en el crecimiento de los tejidos y músculos y en el mantenimiento y reparación del sistema inmunológico, o la calcitonina que regula el metabolismo del calcio. Defensiva Las proteínas crean anticuerpos y regulan factores contra agentes extraños o infecciones. Toxinas bacterianas, como venenos de serpientes o la del botulismo son proteínas generadas con funciones defensivas. Las mucinas protegen las mucosas y tienen efecto germicida. El fibrinógeno y la trombina contribuyen a la formación coágulos de sangre para evitar las hemorragias. Las inmunoglobulinas actúan como anticuerpos ante posibles antígenos. Transporte Las proteínas realizan funciones de transporte. Ejemplos de ello son la hemoglobina y la mioglobina, proteínas transportadoras del oxígeno en la sangre en los organismos vertebrados y en los músculos respectivamente. Reserva Si fuera necesario, las proteínas cumplen también una función energética para el organismo pudiendo aportar hasta 4 Kcal. de energía por gramo. Reguladoras Las proteínas tienen otras funciones reguladoras puesto que de ellas están formados los siguientes compuestos: Hemoglobina, proteínas plasmáticas, hormonas, jugos digestivos, enzimas y vitaminas que son causantes de las reacciones químicas que suceden en el organismo. Contracción muscular La contracción de los músculos través de la miosina y actina es una función de las proteínas contráctiles que facilitan el movimiento de las células constituyendo las {Aminoácidos / Proteínas} 9 miofibrillas que son responsables de la contracción de los músculos. En la función contráctil de las proteínas también está implicada la dineina que está relacionada con el movimiento de cilios y flagelos. Función homeostática Las proteínas funcionan como amortiguadores, manteniendo en diversos medios tanto el pH interno como el equilibrio osmótico. Es la conocida como función homeostática de las proteínas.
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