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{Nucleótidos} 1 🧬 {Nucleótidos} Nucleotidos -INTRODUCCIÓN. Entre las biomoléculas más importantes, por su papel en el almacenamiento y transmisión de la información genética, se encuentran los ácidos nucleicos. Los ácidos nucleicos son macromoléculas formadas por la unión de unidades básicas denominadas nucleótidos. Dicha unión se realiza mediante un tipo de enlace conocido como puente fosfodiéster. Se puede considerar que los nucleótidos son los sillares estructurales de los ácidos nucleicos, del mismo modo que los aminoácidos lo son de las proteínas o los monosacáridos de los polisacáridos. Además de desempeñar este importante papel, los nucleótidos como tales tienen otras funciones biológicas de naturaleza energética o coenzimática. -CONSTITUYENTES QUÍMICOS DE LOS NUCLEÓTIDOS. Cuando se somete a los ácidos nucleicos a hidrólisis en condiciones suaves liberan sus 2 unidades monoméricas constitutivas: los nucleótidos. Los sillares estructurales de otras macromoléculas, como los aminoácidos o los monosacáridos, no son susceptibles de descomponerse a su vez en unidades más simples; sin embargo los nucleótidos sí pueden sufrir hidrólisis dando lugar a una mezcla de pentosas, ácido fosfórico y bases nitrogenadas. Cada nucleótido está compuesto por una pentosa, una molécula de ácido fosfórico y una base nitrogenada enlazados de un modo característico. En la Figura 1 se muestran estos tres componentes de los nucleótidos. Las pentosas que aparecen formando parte de los nucleótidos son la β-D-ribosa y su derivado, el desoxiazúcar {Nucleótidos} 2 2'-β-D-desoxirribosa, en el que el grupo hidroxilo unido al carbono 2' fue sustituido por un átomo de hidrógeno. Ambas se encuentran en forma de anillos de furanosa . Las posiciones del anillo de furanosa se numeran convencionalmente añadiendo el signo (') al número de cada átomo de carbono para distinguirlas de las de los anillos de las bases nitrogenadas. El tipo de ácido fosfórico que se encuentra en los nucleótidos es concretamente el ácido ortofosfórico, cuya estructura molecular se muestra en la Figura 1. Las bases nitrogenadas son compuestos heterocíclicos. Sus átomos de nitrógeno poseen pares electrónicos no compartidos que tienen tendencia a captar protones, lo que explica su carácter débilmente básico. Los compuestos originarios de los que derivan estas bases nitrogenadas son la purina y la pirimidina. Existen formando parte de los nucleótidos dos derivados de la purina (bases púricas), que son la adenina y la guanina, y tres derivados de la pirimidina (bases pirimídicas), que son la citosina, la timina y el uracilo. Todas ellas se obtienen por adición de diferentes grupos funcionales en distintas posiciones de los anillos de la purina o de la pirimidina. Las características químicas de estos grupos funcionales les permiten participar en la formación de puentes de hidrógeno, lo que resulta crucial para la función biológica de los ácidos nucleicos. Nucleosidos Las pentosas se unen a las bases nitrogenadas dando lugar a unos compuestos denominados nucleósidos. La unión se realiza mediante un enlace N-glucosídico entre el átomo de carbono carbonílico de la pentosa (carbono 1') y uno de los átomos de nitrógeno de la base nitrogenada, el de la posición 1 si ésta es pirimídica o el de la posición 9 si ésta es púrica. El enlace N-glucosídico es una variante del tipo más habitual de enlace glucosídico (O-glucosídico), que se forma cuando un hemiacetal o hemicetal intramolecular reacciona con una amina, en lugar de hacerlo con un alcohol, liberándose una molécula de agua. Los nucleósidos en estado libre sólo se encuentran en cantidades mínimas en las células, generalmente como productos intermediarios en el metabolismo de los nucleótidos. Existen dos tipos de nucleósidos: los ribonucleósidos, que contienen β-D-ribosa como componente glucídico, y los desoxirribonucleósidos, que contienen β-D-desoxirribosa. En la naturaleza se encuentran ribonucleósidos de adenina, guanina, citosina y uracilo, y desoxirribonucleósidos de adenina, guanina, citosina y timina. En la Figura 2 se representan dos nucleósidos. Los nucleósidos se nombran añadiendo la terminación - osina al nombre de la base nitrogenada si ésta es púrica o bien la terminación - idina si ésta es pirimídica, y anteponiendo el prefijo desoxi- en el caso de los desoxirribonucleósidos. Nucleotidos Los nucleótidos resultan de la unión mediante enlace éster de la pentosa de un {Nucleótidos} 3 nucleósido con una molécula de ácido fosfórico. Esta unión, en la que se libera una molécula de agua, tiene lugar en el carbono que ocupa la posición 5'; es decir, los nucleótidos son los 5' fosfatos de los correspondientes nucleósidos. La posesión de un grupo fosfato, que a pH 7 se encuentra ionizado, confiere a los nucleótidos un carácter marcadamente ácido. En la Figura 3 se muestra la estructura de un nucleótido y el nombre de sus uniones. En este caso, ocurre lo mismo que en la estructura de nucleosidos, si la base que participa de la unión deriva de las puricas, la unión con la pentosa se establece con el Nitrogeno en posición 9, y si la base es pirimidica, lo hará con el nitrógeno en posición 1. Además de los nucleótidos monofosfato que acabamos de describir, que son los sillares estructurales de los ácidos nucleicos, existen en la naturaleza nucleótidos di~ y trifosfato, que resultan de la unión mediante enlace anhidro de 1 ó 2 moléculas de ácido fosfórico adicionales a la que se encuentra unida al carbono 5' de la pentosa. Los nucleótidos pueden también clasificarse en ribonucleótidos y desoxirribonucleótidos según contengan ribosa o desoxirribosa respectivamente. Existen diversas maneras de nombrar los nucleótidos (Ver Tabla 2). Cada nucleótido se identifica mediante tres letras mayúsculas, la primera corresponde a la base nitrogenada, la segunda indica si el nucleótido es Mono~, Di~, o Trifosfato, y la tercera es la inicial del grupo fosfato (en inglés, phosphate); en el caso de los desoxirribonucleótidos se antepone una "d" minúscula a estas tres siglas. También es habitual nombrar a los nucleótidos como fosfatos de los correspondientes nucleósidos; por ejemplo, el ATP es el trifosfato de adenosina o adenosín-trifosfato. FUNCIONES Los nucleótidos, además de integrar las cadenas de ser los monómeros de los acidos nucleicos (ADN y ARN), poseen otras funciones biológicas en estado libre: Por ejemplo el ATP (adenosin trifosfato), actúa como donador de energía química en un gran número de procesos Muchos intermediarios activados como la UDP-glucosa en la síntesis de glucógeno, contienen nucleótidos. Muchas vías metabólicas están reguladas al menos en parte por los niveles de ATP, ADP o AMP. De manera semejante, muchas señales hormonales como aquellas que controlan al metabolismo del glucógeno, son mediadas intracelularmente por las moléculas cíclicas del AMP o GMP (cAMP o cGMP) Los nucleótidos de adenina son componentes de las coenzimas NAD+, NADP+, {Nucleótidos} 4 FMN, FAD y CoA. Nucleótidos libres Nucleótidos que intervienen en las transferencias de energía: Se trata de moléculas que captan o desprenden energía al transformarse unas en otras. Así, el ATP desprende energía cuando se hidroliza, transformándose en ADP y fosfato inorgánico (Pi). Por el contrario, el ADP almacena energía cuando reacciona con el fosfato inorgánico y se transforma en ATP y agua. De esta forma se transporta energía (unas 7 kilocalorías por mol de ADP/ATP) de aquellas reacciones en las que se desprende (exergónicas) a aquellas en las que se necesita (endergónicas). Ejemplos de nucleótidos transportadores de energía: - AMP (adenosina-5'-monofosfato) A-R-P - ADP (adenosina-5'-difosfato) A-R-P-P - ATP (adenosina-5'-trifosfato) A-R-P-P-P - GDP (guanosidina-5'-difosfato) G-R-P-P - GTP (guanosidina-5'-trifosfato) G-R-P-P-P Nucleótidos que intervienen en los procesos de óxido-reducción: Estas moléculas captan electrones de moléculas a las queoxidan y los ceden a otras moléculas a las que a su vez reducen. Así, el NAD+ puede captar 2e- transformándose en su forma reducida, el NADH, y éste puede ceder dos electrones a otras sustancias, reduciéndolas y volviendo a transformarse en su forma oxidada, el NAD+. Así, se transportan electrones de aquellas reacciones en las que se desprenden a aquellas en las que se necesitan. Ejemplos de nucleótidos transportadores de electrones: NAD+/NADH (Nicotinamida-adenina-dinucleótido) oxidado y reducido, respectivamente. NADP+/NADPH (Nicotinamida-adenina-dinucleótido-fosfato), oxidado y reducido. - FAD/FADH2 (Flavina-adenina-dinucleótido), oxidado y reducido. Nucleótidos reguladores de procesos metabólicos: Algunos nucleótidos cumplen funciones especiales como reguladores de procesos metabólicos, por ejemplo el AMPc (adenosina-3',5'-monofosfato) o AMP cíclico, en el que dos OH del fosfato esterifican los OH en posiciones 3 y 5 de la ribosa formando un ciclo. Este compuesto químico actúa en las células como intermediario de muchas hormonas. Polinucleotidos: Ácidos nucleicos Dos o más nucleótidos se unen, para formar ACIDOS NUCLEICOS. Esta unión es a través de un enlace fosfodiester. {Nucleótidos} 5 Este enlace se forma entre el OH del ácido fosfórico de un nucleótido y el OH del carbono número 3 de la pentosa de otro nucleótido, con formación de una molécula de agua. Debemos destacar que en toda cadena de nucleótidos, habrá dos extremos. En uno de ellos, estará libre el OH de la pentosa en posición 3, este será el extremo 3´. En el otro extremo se encontrara libre el ácido fosfórico, este será el extremo 5´. Ácidos nucleicos Acido desoxirribonucleico: ADN Son macromoléculas formadas por desoxirribonucleótidos de adenina, guanina, citosina y timina (nunca uracilo) que se unen entre sí mediante enlaces fosfodiéster 5´-3´. Su pentosa es la desoxirribosa. Está formado por dos cadenas de nucleótidos y tienen un gran peso molecular. Están enrolladas (dextrógiro) en espiral alrededor de un eje imaginario originando una doble hélice. Las cadenas no son iguales, cada una de ellas está formada por bases complementarias de la otra. Están enfrentadas por sus bases nitrogenadas, el enfrentamiento es siempre entre una base púrica (A y G) y una base pirimidínica (C y T): A-T y G-C. Las dos cadenas se unen mediante enlaces por puentes de hidrógeno, que se establecen entre los grupos polares de las bases complementarias: dos entre la A-T y 3 entre G-C. Todas las cadenas tienen polaridad y se pueden diferenciar dos extremos: el extremo 5´que es el que lleva al grupo fosfato libre unido al carbono 5´de la pentosa y el extremo 3´que es el que lleva el OH del carbono 3´ de la pentosa libre. Organización del ADN En las células eucariotas, la macromolécula de ADN se encuentra dentro del núcleo, la cual se encuentra compactada y organizada a través de su plegamiento alrededor de proteínas globulares llamadas histonas. Este empaquetamiento forma estructuras globulares llamados nucleosomas. Este complejo generado por la combinación de proteínas y ADN se denomina cromatina (nombre derivado de sus propiedades de tinción celular), siendo una de sus principales funciones compactar el ADN para que quepa dentro del núcleo, a través de sucesivos niveles de empaquetamiento. Cuando la célula se alisa (antes de que la célula se divida) la cromatina se condensa hasta alcanzar su máximo grado de compactación, el cual forma cromosomas. Ácido ribonucleico: ARN Son macromoléculas formas por ribonucleótidos: adenina, guanina, citosina y uracilo (nunca timina), que se unen mediante enlaces fosfodiéster. Su pentosa es ribosa. El ARN es monocatenario, sus cadenas son más cortas y de menor peso molecular respecto al ADN. Pueden localizarse tanto en el núcleo como en el citoplasma, y se {Nucleótidos} 6 diferencias varios tipos: ARNr, ARNt y ARNm. ARNm (mensajero) Formado por una sola cadena de ribonucleótidos representa el 5% del total del ARN. Juega un papel importante durante la síntesis de proteínas y su función es copiar la información genética del ADN (trascripción) y una vez copiada sale del núcleo a través de los poros de la membrana nuclea y lleva dicha información hasta los ribosomas del citoplasma para que se sinteticen las proteínas, por eso se llama mensajero. Cada ARNm será complementario con la cadena del fragmento del ADN que sirvió como molde para su síntesis. ARNt (trasferencia) Es un tipo de ARN cuyas moléculas son pequeñas, contienen de 80 a 100 nucleótidos y representan un 15% de todo el ARN. Está formado por una sola cadena de ribonucleótidos que esta doblada y en algunas zonas las bases complementarias se encuentran enfrentadas (A-U, C-G) y se unen por uniones puente de hidrógeno. Su función es la de captar aminoácidos en el citoplasma y trasportarlos a los ribosomas, colocándolos según indica la secuencia de ARNm para sintetizar proteínas. ARNr (ribosomal) Es el más abundante de todos y representa un 80% del total. Está formado por moléculas de diferentes tamaños que están constituidas por una sola cadena de ribonucleótidos, en algunas zonas presentan estructura secundaria en doble hélice. Participa en la estructura de los ribosomas y en la formación del enlace peptídico que ensambla los aminoácidos durante la síntesis de proteínas
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