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482 D I V E R S I D A D M I C R O B I A N A Diazótrofos de vida libre Los diazótrofos de vida libre necesitan un mecanismo para prote- ger las nitrogenasas de la acción del oxígeno ( Secciones 3.17 y 7.13). La solución más sencilla a este problema es crecer sola- mente en ambientes anóxicos. El origen de la fijación del nitró- geno es anterior al origen de la fotosíntesis oxigénica, de modo que los primeros organismos fijadores de nitrógeno eran anae- robios de vida libre. Los diazótrofos anaerobios estrictos de vida libre son habituales en ambientes anóxicos como los sedimen- tos marinos y de agua dulce o los tapetes microbianos. Estos microorganismos pertenecen a los filos bacterianos Firmicutes (p. ej., Clostridium), Chloroflexi (p. ej., Oscillochloris), Chlorobi (p. ej., Chlorobium), Spirochaetes (p. ej., Spirochaeta) y Proteobac- teria (p. ej., Desulfovibrio, Chromatium) y al filo arqueano Eur- yarchaeota (p. ej., Methanosarcina). Encontramos Desulfovibrio en los sedimentos anóxicos de marismas dominadas por la planta herbácea Spartina, y su fijación de N 2 es una fuente de nitrógeno importante para las plantas que viven en este ecosistema. Otro mecanismo sencillo para proteger las nitrogenasas del oxígeno es fijar el nitrógeno solamente cuando no hay oxígeno en el medio o bien se encuentra en concentración muy baja. Por ejemplo, con frecuencia los aerobios facultativos fijarán nitrificantes y las desnitrificantes. La fisiología de estos grupos se estudió en las Secciones 3.17, 13.10 y 13.17. Empezaremos nuestro viaje por la diversidad microbiana del ciclo del nitró- geno con las bacterias que fijan el nitrógeno atmosférico. 14.12 Diversidad de las bacterias fijadoras de nitrógeno Géneros principales: Mesorhizobium, Desulfovibrio, Azotobacter Los diazótrofos son organismos que fijan el gas dinitrógeno (N 2 ) en amoniaco (NH 3 ), que puede incorporarse como fuente de nitrógeno para las células. La fijación de nitrógeno es un proceso asimilador y requiere ATP y la enzima nitrogenasa ( Sección 3.17). Los diazótrofos normalmente fijan nitrógeno molecular únicamente cuando no hay otras formas de nitró- geno, y la expresión de la nitrogenasa se inhibe cuando las célu- las disponen de amoniaco ( Sección 3.17). El oxígeno inhibe la nitrogenasa de manera irreversible, y esta es una de las cau- sas de diversificación ecológica entre diazótrofos; veremos que diferentes organismos han desarrollado soluciones diferentes para proteger la nitrogenasa del oxígeno. La fijación de nitrógeno está muy extendida entre los mi- croorganismos, y se piensa que el último antepasado común universal ya utilizaba nitrogenasas. El gen nifH codifica el com- ponente dinitrogenasa-reductasa de la nitrogenasa, y es utili- zado como medida de la diversidad diazotrófica ( Sección 18.5). Se han descrito más de 30.000 secuencias génicas nifH diferentes distribuidas en nueve filos bacterianos y un filo arqueano (Figura 14.1). El intercambio horizontal de genes ha tenido una gran influencia en la distribución filogenética de la nitrogenasa en el árbol de la vida. Por consiguiente, la filogenia de nifH es muy incoherente con la filogenia del gen del RNA ribosómico 16S (Figura 14.30). A continuación vamos a anali- zar la diversidad de los diazótrofos simbióticos y de los de vida independiente. Diazótrofos simbióticos Los diazótrofos forman diversas relaciones simbióticas con las plantas, los animales y los hongos. Estas relaciones se definen, generalmente, porque el hospedador proporciona un entorno habitable, que incluye una fuente de carbono y energía y un sis- tema para regular la concentración de oxígeno, mientras que el simbionte microbiano aporta a su vez un suministro de nitró- geno fijado al hospedador. La simbiosis entre los rizobios y las plantas leguminosas es una de las asociaciones simbióticas de fijación de nitrógeno mejor caracterizadas ( Sección 22.3). Las bacterias que for- man nódulos radiculares pertenencen a Alphaproteobacteria (p. ej., Mesorhizobium, Bradyrhizobium, Sinorhizobium), Beta- proteobacteria (p. ej., Burkholderia), o Actinobacteria (p. ej., Frankia). Otros géneros de diazótrofos simbióticos se encuen- tran en asociación con teredínidos (Teredinibacter), con el intestino de termes (Treponema) ( Sección 22.10), con hon- gos endomicorrízicos (Glomeribacter) ( Sección 17.12) y con diversos hongos, algas y plantas (Cyanobacteria) ( Secciones 22.1 y 22.5). Estas diferentes simbiosis se han originado muchas veces de manera independiente como consecuencia de evolu- ción convergente (Figura 14.30). Filogenia a partir de genes rRNA 16S Filogenia a partir de NifH Treponema primitia Methanosarcina acetivorans Chlorobium limicola Desulfovibrio gigas Clostridium acetobutylicum Geobacter metallireducens Paenibacillus abekawaensis Frankia alni Anabaena variabilis Mesorhizobium loti Azospirillum brasilense Beijerinckia indica Bradyrhizobium japonicum Burkholderia nodosa Alphaproteobacteria Betaproteobacteria Deltaproteobacteria Firmicutes Chlorobi Spirochaetes Cyanobacteria Actinobacteria Euryarchaeota Figura 14.30 Relaciones entre bacterias diazótrofas (fijadoras de nitrógeno) deducidas de las secuencias de genes de RNA ribosómico 16S y de las secuencias de aminoácidos de NifH. Las ramas de cada árbol tienen un color que indica el filo. Las líneas de puntos indican ramas compartidas entre los dos árboles. La incongruencia entre los dos árboles es consecuencia de los muchos procesos de transferencia horizontal del gen NifH. El texto en rojo denota los anaerobios estrictos, y el subrayado indica las especies que forman simbiosis con eucariotas. https://booksmedicos.org booksmedicos.org Botón1:
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