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D I V E R S I D A D E N A R C H A E A 567 U N ID A D 3 carbono orgánico. Nanoarchaeum no puede metabolizar H 2 y S0 para obtener energía, y no está claro si genera ATP a par- tir de compuestos que obtiene de Ignicoccus o si consigue el ATP directamente de su hospedador. El aspecto de las células de Nanoarchaeum es el típico de las arqueas, con una pared celular compuesta por una capa S ( Sección 2.12), que reviste lo que parece ser un espacio periplasmático (Figura 6.16b) Aunque la secuencia de los genes del rRNA 16S sitúa a Nanoarchaeum claramente dentro del dominio Archaea, dicha secuencia se diferencia en muchos sitios de las secuencias de los genes del rRNA 16S de otras Archaea, incluso en regiones de la molécula que están muy conservadas entre las Archaea. Estas diferencias llevaron inicialmente a la conclusión que N. equitans sería un linaje que se separó pronto en el árbol filoge- nético de las Archaea ( Figura 12.13). Sin embargo, análisis filogenéticos más detallados de genes de proteínas ribosómi- cas sugieren que la divergencia de N. equitans ocurrió cuando se formaron los Euryarchaeota (Figura 16.1). Algunos análisis sugieren incluso que N. equitans pueda ser una especie de los Euryarchaeota. Sin embargo, el análisis genómico muestra que el organismo carece de varios genes que codifican el proceso de la información y la división celular en Euryarchaeota. La situa- ción filogenética definitiva de las Nanoarchaeota dependerá en gran medida del descubrimiento de más especies de este grupo. El genoma de Nanoarchaeum equitans La secuencia del genoma de N. equitans proporciona informa- ción sobre el estilo de vida de parásito estricto de este orga- nismo. Su genoma circular único solo tiene 490.885 nucleótidos; es uno de los genomas celulares más pequeños secuenciados ( Tabla 6.1). En el genoma de N. equitans faltan los genes para varias funciones metabólicas importantes, como los de la biosíntesis de aminoácidos, nucleótidos, coenzimas y lípidos. También faltan genes que codifican proteínas de rutas catabó- licas muy frecuentes, como la glicólisis. Se supone que todas estas funciones las lleva a cabo para Nanoarchaeum su hospe- dador Ignicoccus, y desde este se transfieren las sustancias nece- sarias hasta las células de Nanoarchaeum que tiene adheridas. A microbianas del suelo, y en algunos suelos llegan a ser mil veces más abundantes que las bacterias nitrificantes. Se encuentran en un amplio margen de pH, de 3,5 a 8,7. Aunque están en muchos suelos, suelen ser importantes en aquellos con pH ácido (pH < 5,5), que son más del 30 % de todos los suelos. Los nitrificantes oxidan NH 3 , pero si el pH es bajo, predomina la forma NH 4 +, que no es susceptible de nitrificación. La nitrificación se produce en sue- los ácidos, a menudo con un rendimiento elevado, pero las bac- terias nitrificantes no parecen crecer a un pH por debajo de 6,3. En cambio, la taumarquea Nitrosotalea devanaterra, aislada de suelos agrícolas ácidos, tiene su crecimiento óptimo a pH 4-5. La capacidad de las taumarqueas para crecer a bajas concentraciones de amoniaco explica su éxito en suelos ácidos, donde el NH 3 libre está presente a muy bajas concentraciones. MINIRREVISIÓN ¿Cómo obtiene energía y carbono Nitrosopumilus maritimus? ¿En qué ambientes esperaría encontrar especies de Thaumarchaeota? 16.7 Nanoarchaeota y la «bola de fuego hospitalaria» Género principal: Nanoarchaeum El filo Nanoarchaeota está representado por una sola especie, la extraña Nanoarchaeum equitans, que es uno de los organismos celulares más pequeños conocidos y que presenta el genoma menor entre las especies de Archaea (0,49 Mbp). Las células cocoides de N. equitans son muy pequeñas, de unos 0.4 μm de diámetro, y un volumen que es tan solo el 1 % del volumen de una célula de Escherichia coli. No pueden crecer en cultivo axé- nico y solo se dividen cuando están adheridas a la superficie de su organismo hospedador, Ignicoccus hospitalis (Sección 16.11), una especie hipertermófila de Crenarchaeota cuyo nombre sig- nifica «bola de fuego hospitalaria». En cada célula de Ignicoccus se desarrollan diez o más células de N. equitans, que tienen un estilo de vida aparentemente parásito (Figura 16.16); es el único caso conocido de simbionte dentro de las arqueas. Nanoarchaeum y su hospedador Nanoarchaeum equitans y su hospedador Ignicoccus se aisla- ron por primera vez de una chimenea hidrotermal submarina ( Sección 19.13) en el mar abierto frente a la costa de Islan- dia. No obstante, muestreos ambientales de genes del rRNA 16S ( Sección 18.5) indican que existen organismos pare- cidos filogenéticamente a Nanoarchaeum en otras chimeneas hidrotermales submarinas y en manantiales termales terrestres; por tanto, es probable que haya arqueas de este tipo distribui- das por todo el mundo en hábitats lo suficientemente calientes. Nanoarchaeum, al igual que su hospedador Ignicoccus, crece a temperaturas que varían entre los 70 y los 98 °C, con un óptimo alrededor de los 90 °C. El metabolismo de Nanoarchaeum no se conoce suficiente- mente, pero parece depender de su hospedador para muchas funciones metabólicas. Ignicoccus es un autótrofo que utiliza H 2 como donador de electrones y S0 como aceptor de elec- trones, por lo que probablemente proporcione a N. equitans (a) (b) R e in h a rd R a c h e l a n d H a ra ld H u b e r R e in h a rd R a c h e l a n d H a ra ld H u b e r Figura 16.16 Nanoarchaeum equitans. (a) Microfotografía con el microscopio de fluorescencia de células de N. equitans (en rojo) adheridas a células de Ignicoccus (en verde). Las células están teñidas por FISH ( Sección 18.4), empleando sondas de ácidos nucleicos específicas para cada organismo. (b) Microfotografía con el microscopio electrónico de transmisión de una sección fina de una célula de Nanoarchaeum. Obsérvese la peculiar pared celular. Las células de Nanoarchaeum miden aproximadamente 0,4 μm de diámetro. https://booksmedicos.org booksmedicos.org Botón1:
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