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668 E C O L O G Í A M I C R O B I A N A Y M I C R O B I O L O G Í A A M B I E N T A L activado por la luz, que está presente en el halófilo extremo Halobacterium (Archaea); la bacteriorrodopsina actúa en la sín- tesis de ATP como una bomba de protones sencilla regulada por la luz ( Figura 16.4). La forma de rodopsina de Pelagibac- ter y otros procariotas pelágicos es estructuralmente semejante a la bacteriorrodopsina y recibe el nombre de proteorrodop- sina (el prefijo «proteo» hace referencia a las proteobacterias). Si bien la proteorrodopsina se descubrió por primera vez en especies de proteobacterias, en realidad está muy distribuida en el dominio Bacteria, incluidas muchas Gamma- y Alfapro- teobacterias, Bacteroidetes y Actinobacteria, y también se ha encontrado en especies no halófilas de Archaea, como algunas especies de Euryarchaeota marinas. Las distintas variantes de proteorrodopsina en los microorganismos marinos tienen pro- piedades de absorción que reflejan diferencias en las propieda- des espectrales de la luz a medida que aumenta la profundidad en la columna de agua; las variantes más cercanas a la superfi- cie absorben luz verde y las más profundas absorben luz azul. Algunos estudios realizados con varias bacterias marinas que poseen proteorrodopsina han demostrado, de manera con- cluyente, que estos organismos sobreviven mejor a la falta de nutrientes en presencia de luz que en la oscuridad. Es decir, las células que carecen de energía usan la producción de ATP mediada por la luz para compensar la falta de disponibilidad de energía procedente de la respiración del carbono debida a la baja concentración de carbono orgánico presente. Es curioso que en algunas aguas se ha estimado que el 80 % de las bacterias marinas poseen proteorrodopsina. Así pues, la proteorrodop- sina constituye una estrategia muy extendida para complemen- tar el metabolismo energético de los procariotas marinos de manera que no tengan que depender exclusivamente del escaso carbono orgánico para sus necesidades energéticas. Virus marinos En el mar, los virus son más abundantes que los microorganis- mos celulares, a menudo con cantidades de 107 viriones/ml en el agua marina típica ( Sección 8.11). En las aguas costeras, donde las células bacterianas son más numerosas que en los océanos, la cantidad de virus también aumenta, hasta llegar a 108 viriones/ml. La mayoría de estos virus son bacteriófagos, que infectan especies de bacterias, y virus arqueanos, que infec- tan especies de arqueas. La cantidad de viriones en el agua de mar es unas diez veces mayor que la cantidad media de célu- las procariotas, lo cual sugiere que los virus infectan de forma activa a sus hospedadores, se replican y son liberados en el mar (Figura 19.26). Solo una pequeña fracción de los virus liberados (una media de uno por brotación) consigue infectar un nuevo hospedador, mientras que la mayoría son inactivados o destrui- dos por la luz del sol o por las enzimas hidrolíticas. De esta manera, en períodos de solo unos días o unas semanas se pro- duce un recambio completo de la población vírica. En el Capí- tulo 9 ya estudiamos la diversidad de los virus bacterianos y arqueanos. Además de los protistas que se alimentan de procariotas, pro- bablemente las infecciones víricas marinas contribuyen a man- tener su número en los niveles que observamos, pero los virus pueden tener también otras importantes funciones en el ecosis- tema, como facilitar el intercambio genético entre células pro- cariotas y permitir la lisogenia, ese estado en el que un genoma recuentos de células mediante FISH ( Sección 18.4) han puesto de manifiesto una gran abundancia de organismos del grupo SAR11 en las aguas pelágicas. La población oceánica del grupo SAR11 se estima en 2,4 × 1028 células, lo que las con- vierte en el grupo microbiano de más éxito del planeta. Pela- gibacter es un oligótrofo, como la mayoría de los procariotas pelágicos. Un oligótrofo es un organismo que crece mejor a bajas concentraciones de nutrientes. Pelagibacter es un qui- mioorganótrofo y en laboratorio crece solo hasta las densida- des a las que se encuentra en la naturaleza. ¿Qué es lo que hace que Pelagibacter tenga tanto éxito en mar abierto? En parte, su éxito se debe a su pequeño tamaño. Las células de Pelagibacter son pequeños bacilos con un diámetro de entre 0,2 μm y 0,5 μm solamente, cerca de los límites de reso- lución del microscopio óptico (Figura 19.25), y un volumen de 0,01 μm3. La relación superficie/volumen resultante ( Sec- ción 2.6) facilita el transporte de nutrientes y aumenta la con- centración de sustrato y las velocidades de procesamiento en el interior de las células. Los análisis proteómicos ( Sección 6.8) también han revelado en Pelagibacter una gran abundancia de proteínas periplasmáticas de unión a sustrato para nutrientes solubles como el fosfato, los aminoácidos y los azúcares. Otra característica de Pelagibacter es su pequeño genoma, de solo 1,3 Mbp. Se trata del genoma más pequeño conocido de una bacteria de vida libre (Capítulo 6). De acuerdo con el aná- lisis proteómico, el genoma codifica un número inusualmente alto de sistemas de transporte del tipo ABC (transportadores que tienen una afinidad extremadamente alta por sus sustra- tos [ Sección 2.9]) y otras enzimas útiles para un organismo oligótrofo. Este reducido genoma también es muy «aerodiná- mico», ya que posee el menor espacio intergénico (una media de solo tres pares de bases) de todos los genomas secuenciados. La gran compactación y eficacia del genoma reduce el coste de replicación. Además de su pequeño tamaño y de su genoma compacto, Pelagibacter tiene genes que codifican una forma del pigmento visual rodopsina que puede convertir la energía lumínica en ATP. En la Sección 16.1 ya hablamos de la bacteriorrodopsina, una molécula bien estudiada que forma un complejo proteico Figura 19.25 Pelagibacter, el procariota más abundante en el mar. Micrografía electrónica tomada mediante tomografía de electrones, una técnica que produce un efecto tridimensional. Cada célula de Pelagibacter tiene un diámetro de unos 0,2 μm. D a n ie la N ic a s tr o https://booksmedicos.org booksmedicos.org Botón1:
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