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See discussions, stats, and author profiles for this publication at: https://www.researchgate.net/publication/344418951 MÉTODO AUTOMÁTICO PARA EL ESTUDIO DE MEDICAMENTOS EN ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS Conference Paper · November 2019 CITATIONS 0 READS 158 4 authors: Natalia Carolina Hernandez Riaño Universidad de Ibagué 9 PUBLICATIONS 4 CITATIONS SEE PROFILE Manuel G Forero Universidad de Ibagué 234 PUBLICATIONS 1,372 CITATIONS SEE PROFILE Laura Estefania Baquedano Santana 13 PUBLICATIONS 36 CITATIONS SEE PROFILE Cristian Morera Universidad de Ibagué 8 PUBLICATIONS 3 CITATIONS SEE PROFILE All content following this page was uploaded by Manuel G Forero on 02 October 2020. 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Morera Díaz, Cristian3, Baquerano Santana, Laura Estefania4, Aguilar Mendoza, Luis Ángel5 Autores: 1 Decano Facultad de Ingeniería, Universidad de Ibagué manuel.forero@unibague.edu.co 2 Estudiante Universidad de Ibagué – Facultad de Ingeniería Electrónica, miembro del semillero de procesamiento de imágenes LÚN 2420141027@estudiantesunibague.edu.co 3 Estudiante Universidad de Ibagué – Facultad de Ingeniería Electrónica, miembro del semillero de procesamiento de imágenes LÚN 2420142013@estudiantesunibague.edu.co 4 Estudiante Maestria en Salud Animal, Grupo de Cisticercosis, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Perú laura.baquedano.s@upch.pe 5 Director Laboratorio de Neurociencia, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Perú. luis.aguilar@upch.pe. Ponente: Betancourt Lozano, Juan Jose Estudiante Universidad de Ibagué – Facultad de Ingeniería Electrónica, miembro del semillero de procesamiento de imágenes LÚN Institución: Universidad de Ibagué Grupo de investigación: Semillero de investigación LUN. Área temática Procesamiento Digital de Señales. Modalidad de la Presentación Ponencia Palabras claves: Seguimiento, deterioro cognitivo, neurodegenerativa, test de Morris. Problema a resolver: La investigación para la realización de tratamientos del Alzheimer y Parkinson en la Universidad Peruana Cayetano Heredia, se ha llevado a la práctica con ratas Holtzman macho. Las ratas son divididas por grupos para analizar su comportamiento, comparando así, las ratas que poseen las enfermedades con las ratas que no tienen ninguna de estas. Cada prueba se ejecuta en una piscina de 126 cm de diámetro y 75 cm de profundidad, la cual se llena con agua hasta alcanzar una altura de 50cm. En algunas pruebas se ubicaba una plataforma, con el objetivo de que la rata la localice. En otras la rata solo se traslada de un lugar a otro, ya que no se encuentra esta plataforma o simplemente no se logra orientar de donde está situada. Finalmente, de cada prueba se toma un video como evidencia. En la actualidad ya existen software para analizar el comportamiento de roedores pero estos requieren la intervención del usuario para localizar y delimitar el área de la piscina, la plataforma, loscuadrantes en que se divide la piscina e incluso la forma de la rata. A partir de esta experiencia, se desarrollara un método que permita analizar cada uno de los videos, para así obtener resultados como: distancia, tiempo, velocidad y aceleración media. Al obtener estos datos facilitara el análisis del nivel cognitivo y motriz de la rata, y así evaluar los medicamentos. Contexto del estudio:En la actualidad han sido desarrollados distintos software con el fin de analizar el comportamiento en roedores: software comerciales: Ethovision [1], Top Scan [2], Smart Video Tracking Software [3] , VideoTrack [4] y Usetracker. software de libre acceso:Mousemodel, Tracker [5], Anymaze [6], MouBeAT[7]. El laberinto acuático de Morris (MWM) se estableció por primera vez por el neurocientífico Richard G. Morris en 1981 para poner a prueba el aprendizaje dependiente del hipocampo, incluyendo la adquisición de memoryand espacial a largo plazo la memoria espacial. El MWM es un procedimiento relativamente simple que suele estar compuesta de seis días de prueba, la principal ventaja es la diferenciación entre el espacio (plataforma oculta) y no espaciales (visible de la plataforma). Además, el entorno de prueba MWM reduce la interferencia olor ruta. Esto ha llevado a la tarea de ser utilizado ampliamente en el estudio de la neurobiología y neurofarmacología de aprendizaje espacial y la memoria. El MWM juega un papel importante en la validación de modelos de roedores para los trastornos neurocognitivos como la enfermedad de Alzheimer.[8] Resumen El estudio de fármacos para combatir enfermedades neurodegenerativas, como el Alzheimer y el Parkinson, se realiza frecuentemente en modelos animales como la rata. Una forma de evaluar la eficacia de drogas y medicamentos administrados, llamada test de Morris, consiste en grabar videos de ratas en una piscina para analizar su comportamiento. Aunque existen varios programas informáticos comerciales y de libre acceso que permiten registrar el movimiento de la rata, no lo hacen de forma automática, ya que la identificación de algunos puntos de referencia como la posición y la proporción de la piscina se hace a mano. Además, es necesario identificar el momento en que la rata es liberada. Esto hace que el estudio de estos videos sea largo, tedioso e irrepetible. Por lo tanto, en este trabajo se introduce una nueva técnica para la evaluación de la prueba de Morris, la cual detecta y localiza automáticamente la piscina y la rata reduciendo notablemente el tiempo consumido en la evaluación. Para la identificación de la piscina se realiza un método de segmentación, basado en la proyección de los fotogramas de vídeo, eliminando la rata, conservando la forma de la piscina. Luego, la transformación de Hough se utiliza para reconocer la posición y el radio de la piscina. El momento en que la rata es liberada se encuentra usando técnicas de morfología matemática. La herramienta fue desarrollada como un plugin del software de acceso libre imageJ. Los resultados obtenidos fueron validados, lo que permitió verificar la calidad del método propuesto. Resultados El complemento desarrollado se probó en 117 videos, obteniendo automáticamente la ruta seguida por la rata en cada ocasión, sin intervención del usuario. El complemento permite el análisis automático de la prueba de comportamiento de Morris en ratas. Es un programa amigable y fácil de usar; desarrollado para el programa ImageJ, por lo que se puede utilizar en cualquier plataforma informática. También se desarrolló una herramienta que permite ejecutar la aplicación con una gran cantidad de videos, de modo que es posible dejar el complemento en ejecución con todos los videos y luego volver a analizar los resultados obtenidos, que son almacenados por el programa. En la Universidad Peruana Cayetano Heredia han logrado una satisfactoria implementación del software ayudándolos en su investigación permitiéndoles mejorar en la etapa de validación de datos. Conclusiones En este trabajo hemos presentado una nueva técnica automática para la detección y monitoreo de una rata en una piscina para la evaluación del laberinto de agua de Morris (MWM). Los resultados muestran que la técnica funciona en todos los casos, reduciendo el tiempo de análisis y la intervención del usuario. El método es altamente confiable y preciso, lo que permite que se ejecute en un grupo completo de videos sin intervención del usuario. El método permite detectar el desplazamiento de la rata y la posición de la piscina de forma automática, lo que permite evaluar el nivel cognitivo y motor del roedor. El algoritmo desarrollado utiliza la transformación de Hough para localizar el grupo. Una vez que se obtiene el camino seguido por la rata, se calculan los datos utilizados para el análisis del comportamiento de la rata, como la distancia, el tiempo, la aceleración y la velocidad. Estos datos se utilizan para comparar el comportamiento de las ratas y evaluar los medicamentos en desarrollo para el tratamiento de diferentes enfermedades. El método se comparó con los resultados obtenidos manualmente y con otros programas disponibles. Al detectar automáticamente tanto el roedor como la posición del grupo, el complemento desarrollado permitió resultados más rápidos y reproducibles que los obtenidos con otras aplicaciones. Referencias Bibliográficas [1] Noldus, L. P., Spink, A. J., and Tegelenbosch, R. A. (2001). EthoVision: a versatile video tracking system for automation of behavioral experiments. Behav. Res. Methods Instrum. Comput. 33, 398–414 [2]TopScan Suite - CleverSys Inc. (2019). Recuperado de http://cleversysinc.com/ CleverSysInc/csi_products/topscan-suite/ [3] Smart Video Tracking Software. (2019). Recuperado de https://www.panlab.com/es/ productos/smart-video-tracking-software-panlab [4] VideoTrack - Rodent Behavior Tracking Software - ViewPoint. (2019). Recuperado de http://www.viewpoint.fr/en/p/software/videotrack [5] Tracker., “Use Tracker,” https://sites.google.com/site/usetrackerac/ (2019). [6] Neuroscience Physiology Research Equipment Psychological Assessment Stoelting Co. (2019). Recuperado de https://www.stoeltingco.com/anymaze/video-tracking/software.html [7] Bello-Arroyo, E., Roque, H., Marcos, A., Orihuel, J., Higuera-Matas, A., Desco, M., & Gómez-Gaviro, M. V. (2018). MouBeAT: a new and open toolbox for guided analysis of behavioral tests in mice. Frontiers in behavioral neuroscience, 12. [8]Bromley-Brits, K., Deng, Y., & Song, W. (2019). Morris Water Maze Test for Learning and Memory Deficits in Alzheimer's Disease Model Mice | Protocol (Translated to Spanish). Retrieved 28 October 2019, from https://www.jove.com/video/2920/agua-morris-laberinto-de-prueba-para-los-dficits- de-aprendizaje-y?language=Spanish [8] Martinez, T. (2019). [online] Porprofesionalmic.files.wordpress.com. Available at: http://www.viewpoint.fr/en/p/software/videotrack http://www.viewpoint.fr/en/p/software/videotrack https://www.stoeltingco.com/anymaze/video-tracking/software.htmlhttps://www.stoeltingco.com/anymaze/video-tracking/software.html https://www.jove.com/video/2920/agua-morris-laberinto-de-prueba-para-los-dficits-de-aprendizaje-y?language=Spanish https://www.jove.com/video/2920/agua-morris-laberinto-de-prueba-para-los-dficits-de-aprendizaje-y?language=Spanish https://www.jove.com/video/2920/agua-morris-laberinto-de-prueba-para-los-dficits-de-aprendizaje-y?language=Spanish https://porprofesionalmic.files.wordpress.com/2015/09/investigacion-documental-tr ansformada-hough.pdf [Accessed 20 Mar. 2019]. [9] Hough, P. V. C. Method and means for recognizing complex patterns. U. S. Patent 3, 069 654, December 18, 1962. View publication stats https://www.researchgate.net/publication/344418951
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