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Molecular Biology Midterm III (Semester 2. 2020) 04/01/2021 Name: Adriana Estrella Group: BIOL602/LECTURE/3A62 Date: 04/01/2020 Professor: Nelson Santiago Vispo Of the 11 questions, only answer 10. You have 3 hours to complete the exam, sign it, convert it to pdf, and send it to me. Urkund will check the exam for plagiarism. You can answer it in English or Spanish. 1. Compare the process of transcription between prokaryotes and eukaryotes Transcripción en procariotas: Es un proceso continuo y simple que ocurre en el citoplasma. Una ARN polimerasa funcional tiene 5 subunidades de forma 2α1β1β'ω y sintetiza todos los tipos de ARN de la célula, la ARN polimerasa necesita del factor sigma para unirse y reconocer la región promotora. La terminación puede ser rho dependiente o independiente. Además, el ARNm no tiene modificaciones postranscripcionales ni tampoco posee intrones. Transcripción en eucariotas: A diferencia de las células procariotas, en las eucariotas la transcripción es un proceso discontinuo y complejo; ocurre en dos procesos separados, uno en el núcleo (transcripción) y otro en el citoplasma (traducción). Cada tipo de ARN es sintetizado por un ARN polimerasa distinto (I,II y III) mismos que varían en su número de subunidades. La región promotora contiene tanto caja TATA como CAT (ausentes en las procariotas). La terminación puede darse por la señal de poli A (modificación postranscripcional) o por secuencia de terminación. Se dan modificaciones postranscripcionales mencionadas en la pregunta 9. 2. σ Sigma factor of bacterial RNA polymerases is required to… a) Regulatory functions. b) Recognizing the promoter only at the stage of initiation. c) To form a catalytic center. d) Enzyme assembly, promoter recognition and binds some activators. 3. Complete: Eukaryotic RNA polymerases RNA polymerase I transcribes _rRNA genes_ such as _18S/28S rRNA_ in the __nucleolus_. RNA polymerase II transcribes __mRNA genes_ and __Small RNAs__ in the __nucleoplasm__. RNA polymerase III transcribes __tRNA, small RNAs and 5S ribosomal RNA in the __nucleoplasm_. rRNA genes mRNA genes tRNA 5S ribosomal RNA Small RNAs Small RNAs 18S/28S rRNA nucleoplasm nucleolus nucleoplasm 4. The 5’ end of RNA is capped during transcription in mitochondrial and chloroplast mRNA. This process is known as mRNA capping is highly regulated and vital in the creation of stable and mature messenger RNA. o True o False 5. What is the principal reason for instability of mRNA? a) Disulfide bonds connecting ribonucleotides are weak. b) The presence of the 2′–H group on the ribose sugar. c) The presence of RNA-degrading enzymes called ribonucleases. 6. Select the correct term. ________ are RNA molecules that are capable of catalyzing specific biochemical reactions, similar to the action of protein enzymes. a) Ligases b) Ribozymes c) Isomerases d) Hydrolases 7. Fill the boxes with what happens in 3 tRNA binding sites in Ribosomes. An incoming aminoacyl-tRNA binds to this site. (A site) A peptidyl-tRNA ( tRNA carrying the nascent polypeptide chain) is occupied in this site. (P site) The deacylated tRNA leaves the ribosome in this site. (E site) 8. True or False The sequence of mRNA read in triplets in the 5′ to 3′ direction is related by the genetic code to the amino acid sequence of a polypeptide read from the C-terminus to the N-terminus o True o False 9. Characterize the major post-transcriptional modifications of messenger RNA. Una de las modificaciones es que los exones son retenidos en el ARN mensajero maduro y, por otro lado, los intrones son cortados y empalmados (splicing). También puede darse un empalme (splicing) alternativo que crea ARNm diferente, con diferentes usos de las uniones del empalme, se conservan algunos intrones y eliminan algunos exones que en el splicing no-alternativo no eran incluidos o eliminados. En eucariotas, en la posición 5’ sucede que produce la protección del ARNm, esta protección (tapa o cap) termina por influir la estabilidad, splicing, exportación y traducción del ARNm, además es mayormente mono metilada, aunque en casos de arn pequeños son trimetilada. Otra de las modificaciones, que ayuda a evitar la degradación enzimática del ARNm, se da cuando la polimerasa adiciona al ARNm una cola poli A 3’. Además la cola poli A brinda señales de terminación del proceso de transcripción. 10. Compare the translation process between eukaryotes and prokaryotes. 11. Explain the genetic code and its applications. El código genético está representado por las bases del ADN (A,T,G,C), mismas que al organizarse en grupos de 3 bases (codones, mismos que no se superponen, una base no puede pertenecer a dos codones) darán como resultado un lenguaje continuo y de sentido único que se traducirá en aminoácidos y luego en proteínas. Se dice que es casi universal. Además, cada codón da como resultado uno de los 20 aminoácidos existentes, obviando que un aminoácido puede ser producido por más de un codón (es decir el código es degenerado, hay más tripletes que aminoácidos). La lectura del código genético puede variar debido a su marco de lectura, es decir, a la primera base del triplete que es leída, lo que llevará a 3 diferentes productos. Los conocimientos sobre la traducción y transcripción de proteínas posee aplicaciones en varias categorías, resaltando la medicina en donde estos conocimientos (de mutaciones, proteínas) se pueden usar para el estudio de enfermedades, desarrollo o mejoramiento de nuevas técnicas de diagnóstico, y tratamiento más eficaces y rápidos. El código genético nos permite dar una vista a nuestro pasado y conocer sobre él, con el estudio de mutaciones nos acercamos más a nuestros orígenes y el por qué de este. Cabe mencionar también, que el estudio del código genético produce grandes avances en la ganadería y agricultura, en donde las modificaciones genéticas permiten la producción de especies mejoradas o con características específicas según las necesidades del productor. Existen otras aplicaciones de la genética, pero he enlistado las que a mi me parecen las más importantes. Firma: Adriana Estrella C.I: 060547334-7
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