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Edición de genes CRISPR-cas9 CIBIOGEM Junio 15 de 2017. Ciudad de México Dr. Xavier Soberón Instituto Nacional de Medicina Genómica Contenido 1. Edición de genes como base de la biotecnología moderna 2. La tecnología CRISPR-cas 9; adopción y potenciales 3. Discusión sobre uso responsable: consenso internacional 4. Conclusiones y perspectivas Contenido 1. Edición de genes como base de la biotecnología moderna 2. La tecnología CRISPR-cas 9; adopción y potenciales 3. Discusión sobre uso responsable: consenso internacional 4. Conclusiones y perspectivas Perspectiva histórica ADN Recombinante En 1973, con los primeros experimentos, se inicia la era de la ingeniería genética Stanley Cohen, Herbert Boyer y Paul Berg (Premio Nobel de Química 1980). Demostraron que el gen para el ARN ribosomal de la rana podía ser transferido y expresado en una célula bacteriana. Este puede considerarse como el primer ejemplo de edición genética. Llevamos 40 años de desarrollo para estas técnicas La hibridación de ácidos nucleicos Proceso fundamental en toda la tecnología genética Reconocimiento molecular “predecible” Mutagenesis dirigida Desarrollada desde 1978 por Michael Smith (Premio Nobel de Química 1993). Produce mutaciones puntuales El ADN sintético como agente para modificar genes Procedimientos IN VITRO propiedades diseñadas Insulina: En 1978 Herbert Boyer y Keiichi Itakura construyen un plásmido que codifica la insulina humana. Desde 1982 es aprobada para uso en humanos Primeros productos: la industria de los medicamentos biotecnológicos Antes de los 80’S Grandes y nuevas herramientas de los 80’s La revolución de la biotecnología del siglo XXI: secuenciación masiva (NGS) Abaratamiento de 1 millón de veces SNPs por ensayo 1997 1 2004 1,000 2007 50,000 2008 500,000 2009 1,000,000 2010 5,000,000 CRISPR-Cas9 ¿Revolucionario después de 40 años? Clustered Regulatory Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR). Sistema natural de inmunidad adaptativa de algunas bacterias La secuencia de RNA reconoce específicamente una secuencia complementaria de DNA para que actúe la nucleasa Cas9 y haga los cortes en el genoma ¡Tecnología revolucionaria después de 40 años de mejora incremental! Actualmente …. Transgénicos Primera etapa de ingeniería genética en organismos superiores La inserción del transgene ocurre en sitios no predeterminados La eficiencia es baja Se desarrollan métodos para transformar, establecer y expresar genes exógenos en plantas y animales Knockout / Knock-in Experimentos sumamente laboriosos. Tomaban meses; imposibles en muchas especies Silenciamiento génico mediado por RNA Se origina con la producción de RNA antisentido en los 80’s Tipos naturales : siRNA, small interfering RN (ARN interferente pequeño). miRNA, ( microARN ). piRNA, ARN asociados a Piwi (Piwi-interacting RNAs). Mecanismo de RNAi (maquinaria protéica participa y hace eficiente) en células superiores: revoluciona la técnica Megha Ghildiyal & Phillip D. Zamore. 2009. Nature Reviews Genetics 10, 94-108 Tipos de pequeños RNA’s silenciadores Megha Ghildiyal & Phillip D. Zamore. 2009. Nature Reviews Genetics 10, 94-108 Silenciamiento de genes mediado por ADN modificado Uso de ácidos nucleicos para modificar genes in vivo Contenido 1. Edición de genes como base de la biotecnología moderna 2. La tecnología CRISPR-cas 9; adopción y potenciales 3. Discusión sobre uso responsable: consenso internacional 4. Conclusiones y perspectivas Mecanismos de reparación de ADN Existe una maquinaria endógena de reparación celular. La edición de genes se apoya en esta maquinaria. Técnicas de edición de genes antes de CRISPR Dedos de Zinc Aparecen en el 2000 Cada dedo reconoce un triplete TALEN’s Transcription Activator Like Effector Nuclease. Proteinas secretadas por Xantomonas aparecen en 2010 y contiene dominios de unión a ADN compuesto por una serie de 33-35 aminoácidos repetidos que cada uno reconoce a un par de bases Diseñarla es mucho más fácil en comparación con dedos de Zinc , sin embargo por ser de gran tamaño suele ser complicado trabajar con ellas. CRISPR-Cas9 ¿Revolucionario después de 40 años? Clustered Regulatory Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR). Sistema natural de inmunidad adaptativa de algunas bacterias La secuencia de RNA reconoce específicamente una secuencia complementaria de DNA para que actúe la nucleasa Cas9 y haga los cortes en el genoma ¡Tecnología revolucionaria después de 40 años de mejora incremental! CRISPR-Cas9 Momentum: Adopción de la tecnología CRISPR (El mas elocuente ejemplo reciente de una tecnología que surge de la investigación básica) La increíble eficiencia de CRISPR Algunos expertos consideran que CRISPR/Cas9 es aprox. 100 veces más eficiente que los métodos anteriores Aplicaciones de CRISPR-Cas9 Aplicaciones clínicas CRISPR/Cas9 28 de octubre de 2016, Un equipo liderado por el oncólogo Lu You de la Universidad de Sichuan en Chengdu, China, suministró a células modificadas en un paciente que sufre de un agresivo cáncer de pulmón. 21 de junio de 2016, EE.UU. aprobó una propuesta para utilizar CRISPR-Cas9 en la mejora de terapias contra el cáncer; basadas en reclutar células T. Cerdos resistentes a síndromes respiratorios En 2017, Investigadores de la Universidad de Edinburgh, demostraron que con CRISPR desactivaron el gen CD163. Los cerdos no produce la proteína CD163, encargada de propagar el virus por el cuerpo del animal. Cuando los animales libres de CD163 han sido expuestos a los principales subtipos de los SRRP, no se han enfermado. Hasta la fecha, ninguna vacuna ha mostrado efectividad para esta enfermedad que cuesta cada año más de 660 millones de dólares Cerdos con doble musculatura En 2015, científicos de Corea del Sur y de China utilizando TALEN modificaron el gen de la miostatina (MSTN) en cerdos. La MSTN inhibe el crecimiento de las células musculares, controlando el tamaño del músculo, sí la MSTN es interrumpida las células musculares proliferaran, creando un volumen anormal de fibras musculares. Ganado vacuno con resistencia a la tuberculosis En 2017, Estudio en la Universidad Northwest en China utilizaron una versión modificada de CRISPR/Cas9 para insertar un gen de resistencia a la tuberculosis (NRAMP1) en el genoma de la vaca. Hasta ahora sin efectos no deseados. Naranjos de Florida inmunes al enverdecimiento Enfermedad de Huanglongbing (HLB), destruye la producción, apariencia y valor de los árboles cítricos; produce frutos amargos no comestibles y muerte progresiva del árbol. La enfermedad apareció en Florida en 2005 y desde entonces la producción ha caído hasta los 104,4 millones de cajas de naranjas en 2014, su nivel más bajo en los últimos 30 años. En las Universidades de Texas y Florida se están desarrollando árboles modificados que puedan hacer frente al enverdecimiento. En busca del tomate perfecto Un equipo del Cold Spring Harbor Laboratory Buscan diseñar plantas más productivas, utilizando CRISPR para desarrollar con ramas y flores optimizados para el tamaño del fruto, mejorando los rendimientos. Este enfoque se puede aplicar a la mejora de cultivos en general y no sólo en el tomate. Champiñones resistentes al pardeamiento En 2013, Yinong Yang, utilizó CRISPR/Cas9 Deleciones (1 a 14 bp) en los 6 genes que codifican para la enzima polifenol oxidasa en Agaricus bisporus El servicio de Inspección de Salud Animal y Vegetal (APHIS) declaró a los champiñones blancos modificados por CRISPR/Cas9 como cultivos exentos de regulación aplicable a la importación,el movimiento o la liberación de organismos modificados genéticamente en USA. Modificación genética vs. Edición genética La edición precisa permite modificar atributos sin introducir genes exógenos. El desafortunado término OGM es, de alguna manera, sinónimo de transgénico. Muchas formas de edición genética precisa serían no-transgénicos (e.g. eliminación de genes, sustitución de alelos, modificación de genes sobre diseños teóricos, etc..) Clasificación de los productos por edición genética Gene Drive usando CRISPR Ledford H., 2015. Nature, 522(4), 20:24 Gantz, V.M. & Bier, E. 2015. Science, 348: 442-444 Contenido 1. Edición de genes como base de la biotecnología moderna 2. La tecnología CRISPR-cas 9; adopción y potenciales 3. Discusión sobre uso responsable: consenso internacional 4. Conclusiones y perspectivas Regulaciones Actualmente se debate sobre la manera como se deben de regular el uso de este tipo de tecnologías Preocupaciones Debate internacional en la edición de genes Diciembre 1-3 de 2015; Washington D.C., USA. Expertos mundiales, convocados para discutir cuestiones científicas, legales y bioéticas Se elaboró un reporte al respecto durante el 2016 Pronunciamiento al final de la cumbre 1. Investigación básica y preclínica sujeta a una adecuada supervisión legal y ética. 2. Uso clínico (somático); usar en células somáticas para tratar enfermedades como el cáncer y la anemia de células falciformes autorizada dentro de los marcos legales existentes 3. Uso clínico (línea germinal); se deben de resolver de seguridad y deberá de existir un amplio consenso social sobre las aplicaciones propuestas 4. Necesidad de un foro continuo; a fin de establecer normas de uso en humanos 14 de febrero de 2017 Se debe de actuar con: Responsabilidad, seguridad y transparencia. El empleo en terapia génica somática es muy promisorio y debe regularse conforme a las mismas normas ya bien establecidas Las personas deben tener voz en la discusión sobre la utilización de las técnicas de edición genómica en humanos. Únicamente en el caso de enfermedades graves y bajo estricta vigilancia podrían permitirse los ensayos clínicos en los que se incluya edición del genoma en la línea germinal. Informe de la Academia Nacional de Ciencias y la Academia Nacional de Medicina Contenido 1. Edición de genes como base de la biotecnología moderna 2. La tecnología CRISPR-cas 9; adopción y potenciales 3. Discusión sobre uso responsable: consenso internacional 4. Conclusiones y perspectivas Oportunidades de desarrollo La habilidad para modificar eficientemente cualquier secuencia genómica ha creado la oportunidad de revitalizar drásticamente el mejoramiento de …… Perspectivas Oportunidades Riesgos/ precauciones Terapia genica Abuso de la tecnología Aumento de las desigualdades Zootecnia Zoonosis Control biológico Alteración de las poblaciones salvajes Mejoramiento de cultivos Cambios no planeados www.inmegen.gob.mx Síguenos en http://on.fb.me/qaNj1Z #!/INMEGENhttp://bit.ly/pcl2Zo http://bit.ly/rbUslB www.inmegen.gob.mx Síguenos en http://on.fb.me/qaNj1Z #!/INMEGENhttp://bit.ly/pcl2Zo http://bit.ly/rbUslB Gracias Modificación genética vs. Edición genética Huang, S. et al. 2016. NATURE GENETICS, 48(2): 109-111 Nucleasas Khatodia, S. et al. 2016. Frontiers in Plant Science, 7: article 506. Nueva base tecnológica para la discusión
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