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QUÍMICA MEDICINAL AGENTES ANTIBACTERIANOS Dora Boggian ◦ Patricia Cornier ◦ Carina Delpiccolo ◦ M. Á ngeles Laborde ◦ Águstina La Venia ◦ Maitena Martinez Ámezaga ◦ Ernesto Mata ◦ Noelia Medran ◦ Luciana Mendez ◦ Carla Traficante DEPARTAMENTO DE QUÍMICA ORGÁNICA ÁREA QUÍMICA MEDICINAL FACULTAD DE CIENCIAS BIOQUÍMICAS Y FARMACÉUTICAS IMPRESO EN LA ARGENTINA – PRINTED IN ARGENTINA CÁTEDRA QUÍMICA MEDICINAL – FACULTAD DE CIENCIAS BIOQUÍMICAS Y FARMACÉUTICAS UNIVERSIDAD NACIONAL DE ROSARIO Química Medicinal : agentes antibacterianos / Ernesto Gabino Mata, Dora Boggian, Patricia Cornier, Carina Delpiccolo, M. Ángeles Laborde, Agustina La Venia, Maitena Martinez Amezaga, Noelia Medran, Luciana Mendez, Carla Traficante. 1a ed. - Rosario : Ernesto Gabino Mata, 2018. 170 p. ; 29 x 21 cm. ISBN 978-987-42-9022-9 1. Química Farmacéutica. 2. Antibióticos. 3. Química Orgánica. I. Mata, Ernesto Gabino CDD 615.19 TABLA DE CONTENIDOS PREFACIO .................................................................................................................................................... 5 ABREVIATURAS ......................................................................................................................................... 7 CAPÍTULO 1 ................................................................................................................................................. 9 INTRODUCCIÓN A LA ESTRUCTURA Y FUNCIÓN DE LA CÉLULA BACTERIANA ..................... 9 1.1. UNA VISIÓN GENERAL DE LAS CÉLULAS COMO LA UNIDAD BÁSICA DE LA VIDA ...... 9 1.2. LAS CÉLULAS EUCARIOTAS Y PROCARIOTAS ............................................................... 10 1.2.1. La célula eucariota ......................................................................................................... 10 1.2.2. La célula procariota ........................................................................................................ 13 1.2.3. Comparación entre células procariotas y eucariotas ..................................................... 13 1.3. CLASIFICACIÓN DE LAS BACTERIAS ................................................................................ 16 1.3.1. Peptidoglicano ................................................................................................................ 19 CAPITULO 2 ............................................................................................................................................... 27 INTRODUCCIÓN A LOS AGENTES ANTIBACTERIANOS ............................................................ 27 2.1. AGENTES ANTIBACTERIANOS .......................................................................................... 27 2.1.1. Aspectos históricos del desarrollo de agentes antibacterianos ..................................... 27 2.1.2. Clasificación por estructura química .............................................................................. 29 2.1.3. Clasificación por el mecanismo de acción ..................................................................... 33 CAPÍTULO 3 ............................................................................................................................................... 37 ANTIBIÓTICOS β-LACTÁMICOS Y RESISTENCIA BACTERIANA ................................................ 37 3. COMPUESTOS β-LACTÁMICOS ............................................................................................ 37 3.1. ANTIBIÓTICOS β-LACTÁMICOS ......................................................................................... 37 3.1.1. Historia de los antibióticos β-lactámicos ........................................................................ 38 3.1.2. Aspectos estructurales y nomenclatura ......................................................................... 39 3.1.3. Características espectrales ............................................................................................ 40 3.1.4. Mecanismo de acción de los antibióticos β-lactámicos .................................................. 42 3.1.5. Enzimas de unión a penicilinas (PBPs) .......................................................................... 45 3.2. RESISTENCIA BACTERIANA A COMPUESTOS β-LACTÁMICOS..................................... 47 3.2.1. Enzimas β-lactamasas ................................................................................................... 47 CAPITULO 4 ............................................................................................................................................... 51 PENICILINAS Y CEFALOSPORINAS .............................................................................................. 51 4.1. PENICILINAS ........................................................................................................................ 51 4.1.1 Penicilinas Naturales ....................................................................................................... 51 4.1.2. Estabilidad Química de las Penicilinas ........................................................................... 53 4.1.3. Penicilinas semisintéticas ............................................................................................... 54 4.1.4. Penicilinas resistentes a β-lactamasas .......................................................................... 55 4.1.5. Penicilinas de espectro extendido .................................................................................. 56 4.1.6. Penicilinas antipseudomonas ......................................................................................... 57 4.2. CEFALOSPORINAS .............................................................................................................. 58 4.2.1. Cefalosporinas de uso en clínica médica ....................................................................... 59 2 4.2.2. Mecanismo de acción de las cefalosporinas ................................................................. 60 4.2.3. Clasificación de cefalosporinas en generaciones .......................................................... 60 CAPITULO 5 ............................................................................................................................................... 71 CARBAPENEMS, MONOBACTAMAS, INHIBIDORES DE β-LACTAMASAS ................................ 71 5.1 CARBAPENEMS .................................................................................................................... 71 5.1.1. Introducción .................................................................................................................... 71 5.1.2. Imipenen ........................................................................................................................ 73 5.1.3. Meropenen ..................................................................................................................... 74 5.1.4. Ertapenem ...................................................................................................................... 74 5.2. MONOBACTAMAS ............................................................................................................... 75 5.2.1. Aztreonam ...................................................................................................................... 75 5.3. INHIBIDORES DE β-LACTAMASAS .................................................................................... 77 5.3.1. Inhibidores reversibles e irreversibles ............................................................................ 78 5.3.2. Ácido Clavulánico ........................................................................................................... 79 5.3.3. Ácido Penicilánico Sulfona (Sulbactama) ...................................................................... 825.3.4. Tazobactama ................................................................................................................. 84 5.3.5. Combinaciones de un antibiótico β-lactámico y un inhibidor de β-lactamasas ............. 84 5.3.6. Sultamicilina ................................................................................................................... 84 CAPITULO 6 ............................................................................................................................................... 85 INHIBIDORES DE BIOSÍNTESIS DE PEPTIDOGLICANO NO β -LACTÁMICOS.......................... 85 6.1. GLICOPEPTIDOS ................................................................................................................. 85 6.2. USOS .................................................................................................................................... 86 6.3. QUÍMICA ............................................................................................................................... 86 6.4. MECANISMO DE ACCIÓN ................................................................................................... 88 6.5. ESPECTRO ANTIBACTERIANO DE VANCOMICINA ......................................................... 90 6.6. RESISTENCIA A GLICOPEPTIDOS .................................................................................... 90 6.7. NUEVOS ANTIBIÓTICOS GLICOPEPTÍDICOS .................................................................. 92 6.8. ANÁLOGOS DE AMINOÁCIDOS ......................................................................................... 94 6.8.1. D-clicoserina (Compuesto Natural) ................................................................................ 94 6.8.2. Fosfomicina (Compuesto Natural) ................................................................................. 94 6.9. POLIPÉPTIDOS .................................................................................................................... 95 6.9.1. Bacitracina ..................................................................................................................... 95 6.10. ANTIBIÓTICOS QUE ALTERAN LA MEMBRANA CITOPLASMÁTICA DE LAS BACTERIAS ................................................................................................................................. 97 6.10.1. Polimixina B ................................................................................................................. 97 CAPITULO 7 ............................................................................................................................................... 99 ANTIBIÓTICOS INHIBIDORES DE LA SÍNTESIS PROTEICA I: AMINOGLICÓSIDOS, TETRACICLINAS ............................................................................................................................. 99 7. INTRODUCCIÓN ..................................................................................................................... 99 7.1. BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS ............................................................................................ 99 7.1.1. Etapa de iniciación ....................................................................................................... 100 7.1.2. Etapa de elongación .................................................................................................... 100 7.1.3. Etapa de terminación ................................................................................................... 102 7.2. EFECTO DE LOS ANTIBIÓTICOS SOBRE LA SÍNTESIS PROTEICA EN PROCARIOTAS ................................................................................................................................................... 103 7.3. AMINOGLICÓSIDOS .......................................................................................................... 104 7.3.1. Aminoglicósidos que contienen estreptidina como aminociclitol ................................. 105 3 7.3.2. Aminoglicósidos que contienen 2-desoxiestreptamina 4,5-disustituida como aminociclitol ............................................................................................................................ 105 7.3.3. Aminoglicósidos que contienen 2-desoxiestreptomina 4,6-disustituida como aminociclitol ............................................................................................................................ 105 7.3.4. Farmacología y toxicidad de aminoglicósidos: ............................................................. 107 7.3.5. Resistencia bacteriana ................................................................................................. 108 7.3.6. Nuevos aminoglicósidos ............................................................................................... 110 7.4. TETRACICLINAS ................................................................................................................ 111 7.4.1. Estabilidad química ...................................................................................................... 112 7.4.2. Mecanismo de acción ................................................................................................... 113 7.4.3. Efectos adversos .......................................................................................................... 113 7.4.4. Resistencia ................................................................................................................... 113 7.4.5. Nuevas tetraciclinas ..................................................................................................... 114 CAPITULO 8 ............................................................................................................................................. 117 ANTIBIÓTICOS INHIBIDORES DE LA SÍNTESIS PROTEICA II: MACRÓLIDOS, ESTREPTOGRAMINAS, LINCOSAMIDAS Y OTROS .................................................................. 117 8.1. MACRÓLIDOS ..................................................................................................................... 117 8.1.1. Introducción .................................................................................................................. 117 8.1.2. Actividad Antibiótica ..................................................................................................... 118 8.1.3. Mecanismo de acción ................................................................................................... 118 8.1.4. Clasificación .................................................................................................................. 118 8.1.5. Resistencia a macrólidos .............................................................................................. 122 8.2. NUEVOS MACRÓLIDOS .................................................................................................... 124 8.2.1. Estreptograminas ......................................................................................................... 124 8.2.2. Lincosamidas ................................................................................................................ 126 8.2.3. Cloranfenicol ................................................................................................................. 127 8.2.4. Oxazolidinonas ............................................................................................................. 129 CAPITULO 9 ............................................................................................................................................. 131 INHIBIDORES DE LA SÍNTESIS DE ÁCIDOS NUCLEICOS ........................................................ 131 9.1. INHIBIDORES DE LA ADN GIRASA: QUINOLONAS ........................................................ 131 9.1.1. Descubrimiento y evolución de las quinolonas ............................................................ 1319.1.2. Acción antimicrobiana de las quinolonas ..................................................................... 134 9.1.3. Relación estructura-actividad biológica de las quinolonas ........................................... 137 9.1.4. Farmacocinética ........................................................................................................... 140 9.1.5. Perspectivas futuras ..................................................................................................... 140 9.2. INHIBIDORES DE ARN POLIMERASA: RIFAMICINAS ..................................................... 142 CAPITULO 10 ........................................................................................................................................... 145 INHIBIDORES DE LA BIOSÍNTESIS DEL ÁCIDO TETRAHIDROFÓLICO................................... 145 10.1. INHIBIDORES DE LA DIHIDROPTEROATO SINTETASA .............................................. 145 10.1.1. Sulfonamidas o Sulfas ................................................................................................ 145 10.1.2. Antecedentes históricos ............................................................................................. 145 10.1.3. Clasificación de las sulfas .......................................................................................... 146 10.1.4. Mecanismo de acción ................................................................................................. 148 10.1.5. Espectro antimicrobiano ............................................................................................. 149 10.1.6. Resistencia ................................................................................................................. 150 10.1.7. Usos y características de algunas sulfas ................................................................... 150 10.2. INHIBIDORES DE LA DIHIDROFOLATO REDUCTASA. TRIMETOPRIMA .................... 150 4 10.2.1. Introducción ................................................................................................................ 150 10.2.2. Mecanismo de acción ................................................................................................ 151 10.2.3. Resistencia ................................................................................................................. 151 10.2.4. Usos ........................................................................................................................... 151 CAPITULO 11 .......................................................................................................................................... 153 SÍNTESIS QUÍMICA DE ANTIBACTERIANOS ............................................................................. 153 11.1. INTRODUCCIÓN .............................................................................................................. 153 11.2. MODIFICACIONES QUÍMICAS DE PENICILINAS Y CEFALOSPORINAS ..................... 153 11.2.1. Penicilinas .................................................................................................................. 153 11.2.2. Cefalosporinas ........................................................................................................... 157 11.3. INHIBIDORES DE β-LACTAMASAS ................................................................................ 159 11.4. SULFONAMIDAS O SULFAS ........................................................................................... 160 11.5. QUIRALIDAD EN LOS AGENTES ANTIBACTERIANOS. RELACIÓN ENTRE LA ESTEREOQUÍMICA Y LA ACTIVIDAD BIOLÓGICA................................................................. 161 11.5.1. Cloranfenicol .............................................................................................................. 162 11.5.2. Fluoroquinolonas: Ofloxacina .................................................................................... 163 11.6. CONCLUSIONES ............................................................................................................. 165 BIBLIOGRAFÍA GENERAL .................................................................................................................... 167 5 PREFACIO Este libro ha sido concebido como un texto introductorio relacionado con los agentes antibacterianos y su estudio desde el punto de vista de la Química Medicinal. Ofrece una visión general y concisa sobre los principales temas que permiten al estudiante conocer las bases moleculares de la interacción del agente antibacteriano con su objetivo biológico. Luego de una introducción de las características generales de las células bacterianas, se analizan los distintos agentes antibacterianos utilizando como principal fuente de clasificación su sitio de acción en la célula. Cuando sea apropiado, se incluirán detalles de mecanismos de acción de los agentes antibacterianos para ayudar a comprender los principios que subyacen en su acción sobre un objetivo biológico particular en las bacterias. Además, cada capítulo sobre un grupo y subgrupo de antibióticos o antibacterianos examina también distintos aspectos de las relaciones estructura-actividad que permiten entender cómo, variaciones estructurales determinadas, pueden afectar un efecto farmacológico. En el área de la lucha contra las bacterias, resulta fundamental la comprensión de los mecanismos de resistencia a la acción de los fármacos. Los avances producidos en los últimos años en la identificación de tales mecanismos de resistencia bacteriana, ha abierto el camino para el diseño de nuevos agentes antibacterianos adaptados para superar dicha resistencia. Otra característica que se destaca en este libro es la importancia de la síntesis industrial de antibacterianos, la cual difiere totalmente de la síntesis a escala de laboratorio y en la que deben tenerse en cuenta tanto los requerimientos económicos como ambientales. La síntesis asimétrica a gran escala es también un tema crucial para la obtención de fármacos enantioméricamente puros. Este libro ha sido confeccionado por el cuerpo docente del Área de Química Medicinal, Departamento de Química Orgánica de la Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas de la Universidad Nacional de Rosario, a partir de bibliografía actualizada y tomado como base, en algunos aspectos, los apuntes redactados por el Profesor Oreste A. Mascaretti, anterior Titular del Área. El Dr. Mascaretti fue el primer Profesor de Química Farmacéutica de la Facultad y uno de los pioneros en el desarrollo de la Química Medicinal en Argentina. El Dr. Mascaretti falleció el 27 de Noviembre de 2006 y durante sus más de veinte años en el cargo formó un gran número de docentes-investigadores que hoy en día desarrollan sus actividades tanto en el ámbito académico como industrial. En 1993 recibió el Premio Konex-Diploma al Mérito como uno de los cinco más destacados científicos en Química Orgánica de la década 1983-1993. 6 Esperamos que este libro sea de utilidad no sólo para estudiantes de Química Medicinal sino también para quienes están interesados en aprender o ampliar sus conocimientos en un aspecto fundamental de los fármacos antibacterianos como es la comprensión a nivel molecular de los procesos que explican sus efectos biológicos. Plantel Docente del Área Química Medicinal, Departamento de Química Orgánica, Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Universidad Nacional de Rosario 2018 *Ilustración de Tapa: Micrografía electrónica de un glóbulo blanco fagocitando una cepa de Staphylococcus aureus resistente a meticilina (MRSA). 7 ABREVIATURAS 6-APA ácido 6 β-aminopenicilánico 7-ACA ácido 7-aminocefalosporánico AA aminoácido ADN ácido desoxiribonucleico AMP monofosfato de adenosina ARN ácido ribonucleico ARNmácido ribonucleico mensajero ARNr ácido ribonucleico ribosómico ARNt ácido ribonucleico de transferencia ATP trifosfato de adenosina CAT cloranfenicol acetil transferasas CIM concentración inhibitoria mínima DHFR dihidrofolato reductasa FDA Administración de Alimentos y Medicamentos (del inglés: Food and drug administration) FH2 dihidrofolato FH4 ácido tetrahidrofólico fMet-ARNt N-formilmetionil- ácido ribonucleico de transferencia IC50 concentración inhibitoria 50 IM intramuscular IV intravenosa Met-ARNt metionil - ácido ribonucleico de transferencia MLEB macrólidos, lincosamidas y estreptograminas del tipo B MRSA Staphylococcus aureus resistente a la meticilina PABA ácido p-amino benzoico PBP penicillin binding protein /proteína de unión a penicilinas PEP fosfoenolpiruvato SAM 5-adenosilmetionina SAR relación estructura actividad (del inglés: Structure activity relationship) UDP uridina-5'-difosfato UDP-GNAc UDP-N-acetilglucosamina UTP uridina-5'-trifosfato VRE resistencia de enterococos a vancomicina (del inglés:vancomycin resistant enterococci) 8 9 CAPÍTULO 1 INTRODUCCIÓN A LA ESTRUCTURA Y FUNCIÓN DE LA CÉLULA BACTERIANA Existen una gran diversidad de bacterias que habitan en el cuerpo humano y se pueden encontrar como componentes normales de la flora, como patógenos oportunistas o patógenos verdaderos. Cada bacteria tiene su fisiología única y vías metabólicas propias que le permiten sobrevivir y reproducirse en su hábitat particular. La correcta identificación y la caracterización (intracelular o extracelular) de las especies de bacterias patógenas que causan infecciones en los seres humanos es crítica para el correcto tratamiento con agentes antibacterianos. La capacidad de las bacterias para cambiar rápidamente, adquirir nuevos genes, y producir mutaciones presenta continuos desafíos para el bacteriólogo en su trabajo de aislar y caracterizar a estos microorganismos que causan enfermedades en los seres humanos. La taxonomía bacteriana se refiere a la clasificación y agrupamiento de las bacterias. Se basa en similitudes y diferencias fenotípicas (observables) y genotípicas (genéticas). Los niveles formales de la clasificación bacteriana en subgrupos, cada vez más pequeños, son: reino, división, clase, orden, familia, tribu, género y especie. Para ejemplo, Staphylococcus (género) aureus (especie) pertenecen a la familia Micrococcaceae. 1.1. UNA VISIÓN GENERAL DE LAS CÉLULAS COMO LA UNIDAD BÁSICA DE LA VIDA Un examen microscópico de cualquier organismo revela que se compone de estructuras contenidas por membranas llamadas células. La célula es la unidad estructural y funcional fundamental de todos los organismos vivos. Todas las células tienen, ya sea un núcleo o un nucleoide, en que el genoma [conjunto completo de genes, compuesto de ADN (ácido desoxirribonucleico)] es almacenado y replicado. Los contenidos encerrados por la membrana plasmática constituyen el citoplasma y la porción líquida del citoplasma se llama citosol. Las células están compuestas de moléculas pequeñas, macromoléculas y organelas. De los muchos tipos diferentes de moléculas que constituyen las diversas organelas y el citosol, el agua es la más abundante. Por lo tanto, la mayoría de los componentes están esencialmente en un entorno acuoso. Excepto por el agua, la mayor parte de las moléculas que se encuentran en la célula son macromoléculas, que se pueden clasificar en cuatro diferentes categorías: lípidos, hidratos de carbono, proteínas y ácidos nucleicos. 10 1.2. LAS CÉLULAS EUCARIOTAS Y PROCARIOTAS Las células se dividen en dos clases principales, clasificadas dependiendo de la presencia o ausencia de un núcleo. Las células eucariotas tienen un núcleo en el que el material genético está separado del citoplasma. Eucariotas (del griego eu, que significa "verdadero" y karyon, que significa "núcleo") se encuentran en las algas, hongos (por ejemplo, levaduras, mohos), protozoos, plantas y animales. Las células procariotas que incluyen los diversos tipos de bacterias (eubacterias) y archae (arqueobacterias) no tienen una envoltura nuclear definida. Los procariotas (del griego pro, que significa "antes") tienen un nucleoide (la región de la célula que contiene el ADN) en lugar de un núcleo envuelto. Las procariotas tienen una estructura relativamente simple y son siempre unicelulares (aunque pueden formar colonias de células independientes). Las células eucariotas, que pueden conformar organismos tanto multicelulares como unicelulares, son más complejas que las procariotas. 1.2.1. La célula eucariota Las células eucariotas incluyen organismos multicelulares y muchas especies unicelulares. Tienen un diámetro de 10 a 100 µm y por lo tanto poseen un volumen entre mil y un millón de veces más grande que el de una célula procariota. El examen microscópico de una célula eucariota revela una membrana denominada membrana celular o membrana plasmática (Figura 1.1). 1.2.1.1 La membrana plasmática. Todas las células, tanto procariotas como eucariotas, están rodeadas por una membrana plasmática que define los límites de la célula y separa sus contenidos internos del medio ambiente. La membrana plasmática es una lámina semipermeable compuesta de lípidos y proteínas. La estructura fundamental de la membrana es una bicapa de fosfolípidos, que es impermeable a la mayoría de las moléculas solubles en agua. Por lo tanto, el paso de los iones y la mayoría de las moléculas biológicas a través de la membrana plasmática está mediado por proteínas, que son responsables de la circulación selectiva de sustancias dentro y fuera de la célula. La superficie externa de una célula está en contacto con otras células, el fluido externo, los solutos y las moléculas de nutrientes. La membrana plasmática de todas las células eucariotas contiene muchos transportadores, o sea, proteínas que se insertan a través de la membrana y llevan nutrientes al interior de la célula y productos varios al exterior. Las células eucariotas también tienen proteínas de superficie de membrana (receptores de señal) con sitios de unión muy específicos para moléculas de señalización extracelular (ligandos del receptor). Las proteínas integrales de membrana se insertan en la bicapa lipídica, mientras que las proteínas periféricas están unidas a la membrana por interacciones proteína-proteína. La mayoría de las proteínas integrales de membrana son proteínas transmembrana, con porciones 11 expuestas en ambos lados de la bicapa lipídica. Las porciones extracelulares están generalmente glicosiladas, como lo están las proteínas de membrana periféricas. Figura 1.1. Célula eucariota 1.2.1.2. Estructuras citoplásmicas Dentro del citoplasma hay un número de macromoléculas y otras estructuras más grandes y complejas. Algunas de las estructuras son membranosas y se denominan organelas. Las organelas que se encuentran comúnmente en células animales incluyen el núcleo, las mitocondrias, el retículo endoplasmático, el aparato de Golgi, los lisosomas y peroxisomas (ver Figura 1.1). Además de las organelas, las células animales contienen una colección de estructuras filamentosas denominada el citoesqueleto, lo cual es importante en el mantenimiento de la integridad tridimensional de la célula. 1.2.1.3. Núcleo El núcleo de la célula eucariota es bastante complejo en su estructura y la actividad biológica en comparación con el relativamente sencillo nucleoide de los procariotas. La envoltura nuclear separa los contenidos del núcleo del citoplasma y proporciona el marco estructural del núcleo. El núcleo sirve tanto como depósito de información genética como de centro de control de la célula. Los genomas de la mayoría de los eucariotas son más grandes y más complejos que los de los procariotas. La comprensión de la estructura y función del gen es fundamentalpara la apreciación de la organización nuclear de los eucariotas. En términos moleculares, un gen es toda secuencia de ácido 12 nucleico que es necesaria para la síntesis de un polipéptido o un ácido ribonucleico (ARN) [por ejemplo, ARN ribosomal (ARNr) y de transferencia (ARNt)]. Dentro del núcleo, la información genética (codificada en las secuencias de bases de moléculas de ADN) se transcribe en moléculas de ARN, que son transportadas a los ribosomas donde tiene lugar la traducción del ARN en proteínas. Los cromosomas de las células eucariotas contienen macromoléculas lineales de ADN dispuestas en forma de doble hélice. El ADN de las eucariotas está asociado con proteínas llamadas histonas que se unen al ADN en forma de espiral mediante interacciones iónicas que generan una masa densa llamada cromatina. Las moléculas de ADN sólo son visibles con un microscopio común cuando la célula está sufriendo la etapa de división. Una característica única del núcleo es que se desarma y rearma cada vez que la célula se divide. En el comienzo de la mitosis la envoltura nuclear se rompe, dando por resultado la liberación de la mayor parte de los contenidos del núcleo al citoplasma. Al final de la mitosis se vuelve a formar la envoltura nuclear alrededor de los conjuntos separados de los cromosomas hijos. 1.2.1.4. Los lisosomas Los lisosomas que sólo se encuentran en células animales, son vesículas esféricas limitadas por una membrana de doble capa. Los lisosomas contienen enzimas capaces de digerir proteínas, polisacáridos, ácidos nucleicos y lípidos. Estos funcionan como centros de reciclaje celulares, destruyendo moléculas introducidas en la célula por endocitosis y fragmentos de células extrañas generadas por fagocitosis. Estos materiales entran selectivamente en el lisosoma y se degradan en componentes más simples (péptidos pequeños, aminoácidos, monosacáridos, ácidos, etc.). 1.2.1.5. Las mitocondrias Las mitocondrias (s., mitochondrium) se encuentran en la mayoría células eucarióticas y están rodeadas por dos membranas, una membrana externa separada por un espacio intermembrana de una membrana interior. La membrana interna contiene numerosos dobleces llamadas crestas que se extienden hacia el interior (o matriz) de las organelas. Las mitocondrias son los principales responsables de la generación de energía derivada de la descomposición de lípidos y carbohidratos. La principal función de las mitocondrias es la oxidación de metabolitos y la obtención de trifosfato de adenosina (ATP) mediante la fosforilación oxidativa. Además, la matriz mitocondrial contiene su ADN específico, que codifica ARNt, ARNr y algunas proteínas. El conjunto de las mitocondrias incluye proteínas codificadas por sus propios genomas y traducido en la organela, así como proteínas codificadas por el genoma nuclear, procedentes del citosol. 13 1.2.1.6. Los ribosomas Los ribosomas son los sitios de síntesis de proteínas tanto en células procariotas como eucariotas. Los ribosomas suelen ser designados de acuerdo con sus coeficientes de sedimentación, que son medidos por la unidad Svedberg, S, y reflejan la velocidad a la que una molécula sedimenta en un solvente. Los ribosomas procariotas y eucariotas están compuestos por dos subunidades distintas, conteniendo cada uno proteínas características y ARNr. Las estructuras ribosómicas generales de procariotas y eucariotas son similares, aunque difieren en algunos detalles. En la célula eucariota, los ribosomas tienen un coeficiente de sedimentación de 80S. La subunidad pequeña (40S) de los ribosomas eucariotas se compone de ARNr 18S y aproximadamente 30 proteínas. La subunidad mayor (60S) contiene el ARNr 28S, 5.8S y 5S y alrededor de 45 proteínas. En la célula eucariota, los ribosomas tienen un coeficiente de sedimentación de 70S. La subunidad grande (50S) del ribosoma de las procariotas contiene dos moléculas de ARNr: 5S y 23S, y aproximadamente 30 proteínas; mientras que la subunidad pequeña (30S) contiene un ARNr 16S y 21 proteínas. 1.2.2. La célula procariota Una célula procariota típica presenta una serie de componentes con distintas funciones. La Tabla 1.1 resumen las funciones de los componentes de la estructura bacteriana. Una célula bacteriana, como la de Escherichia coli, presenta la ventaja de su fácil cultivo en una solución acuosa de glucosa y algunos iones inorgánicos. En este medio, a 37°C, duplica su masa celular y se divide en aproximadamente 60 minutos. Las células bacterianas son extremadamente pequeñas, por lo que solamente pueden observarse al microscopio óptico y al microscopio electrónico. El tamaño de las células es ampliamente variable. En el caso de células grandes, tales como el Bacillus anthracis, el tamaño es de 1.0 a 1.3 µm x 3.0 a 10 µm; mientras que células pequeñas, tales como Pasteurella tularensis, el tamaño es de 0.2 µm x 0.2 a 0.7 µm. Las células bacterianas tienen formas características, denominadas cocos (forma esférica u ovoide), bacilos (forma cilíndrica), algunos bacilos curvados que presentan formas espiraladas se denominas espiros. A veces las células se presentan en forma de agregados (pares, cadenas, tétradas, conjuntos o “clusters”, etc). Las formas y tipos de agregados son típicas de un determinado género y se han usado como criterio para la identificación de bacterias. 1.2.3. Comparación entre células procariotas y eucariotas Las células procariotas se diferencian de las células eucariotas en una serie de aspectos, mientras que en otros presentan similitudes. Las diferencias son las que hacen posible la selectividad de acción de los antibacterianos que afectan las células procariotas sin perturbar significativamente a las células eucariotas. 14 Tabla 1.1 Funciones de los componentes de la célula procariota. Membrana citoplasmática o membrana plasmática Es la estructura celular que define el límite del citoplasma con el exterior, es una barrera selectivamente permeable que permite el paso de nutrientes y por donde se produce la eliminación de sustancias de desechos. Ribosomas Los ribosomas son pequeñas partículas compuestas de ARN y proteínas. Los ribosomas constituyen una parte esencial de la síntesis proteica. Nucleoide En las células procariotas se encuentra una única molécula de ADN. Si bien el ADN se encuentra en forma más o menos libre, visto al microscopio electrónico se detecta en una forma agregada a la que se denomina nucleoide. Espacio Periplasmático Solamente se encuentra en las bacterias Gram negativas, y contiene enzimas hidrolíticas para el procesamiento de nutrientes y que luego atravesarán la membrana citoplasmática e ingresarán al interior de la célula. Pared celular Es una estructura rígida situada por fuera de la membrana citoplasmática que confiere la forma a la célula y la protege de cambios osmóticos. Todas las bacterias con excepción de los micoplasmas, poseen pared celular y el componente común es el peptidoglicano o mureína. Cápsulas Aportan resistencia a la fagocitosis, permiten adherencia a superficies. Pilis o fimbrias Permiten la unión a las superficies, intervienen en el proceso de conjugación entre bacterias. Flagelos Muchas bacterias son capaces de desplazarse. Los flagelos son los responsables de tal movimiento. En la tabla 1.2 se realiza la comparación entre ambos tipos de células. Entre las principales diferencias tenemos que las células procariotas no contienen ribosomas 80S ni organelas como mitocondrias, lisosomas, retículo endoplasmático o el aparato de Golgi. Tampoco contienen un núcleo definido. En cambio, poseen un ribosoma 70S y un único cromosoma circular bicatenario de replicación amitótica y una pared celular (peptidoglicano). 15 Tabla 1.2 Comparación de las células procariotas y eucariotas PPRROOPPIIEEDDAADDEESS PPRROOCCAARRIIOOTTAASS ((BBAACCTTEERRIIAASS))EEUUCCAARRIIOOTTAASS Estructura nuclear y función Membrana nuclear Ausente Presente Nucléolo Ausente Presente ADN Una sola molécula que no está acomplejada con histonas (otros ADN se encuentran en plásmidos) Presente en varios cromosomas, generalmente acomplejados con histonas División No mitótica Mitosis Citoplasma (Estructura y organización) Membrana citoplasmática Carece de esteroides Esteroides presentes Ribosomas 70S 80S Organelas membranosas Ausentes Varias Sistema respiratorio No poseen mitocondrias En las mitocondrias Pigmentos fotosintéticos No poseen cloroplastos En los cloroplastos Pared celular Presente. El peptidoglicano es el componente principal Presente en plantas, algas y hongos. Ausente en animales y en la mayoría de los protozoarios Formas de movimiento Movimiento flagelar Flagelos de tamaño submicroscópico. El flagelo tiene movimiento de rotación Flagelo o cilia de tamaño microscópico. No rota Microtúbulos Ausentes Presentes Tamaño Menos de 2μm de diámetro Entre 2 y 100 μm de diámetro 16 1.3. CLASIFICACIÓN DE LAS BACTERIAS Las paredes celulares de las bacterias permiten resistir a la presión de turgencia; consecuencia de la concentración de solutos disueltos dentro de la célula, además son las responsables de la forma y rigidez de la célula. Las diferencias que existen en la estructura de las paredes celulares, permite distinguir a las bacterias en Gram positivas [Gram (+)] o Gram negativas [Gram (-)] mediante una tinción diferencial denominada tinción de Gram. El procedimiento de coloración comienza cuando se coloca con un ansa una pequeña cantidad de células bacterianas sobre un portaobjetos de vidrio y éste se pasa sobre la llama del mechero (flameado) hasta secarlo. Luego se coloca sobre el portaobjetos una solución del colorante violeta de genciana, se lava con agua y se agrega solución Lugol (IK + I2) que actúa como mordiente fijando el colorante. El portaobjeto se lava nuevamente con agua y se trata con etanol o una mezcla etanol- acetona. Las células que permanecen violeta se dice que son Gram positivas y las que se decoloran se dice que son Gram negativas. Pocos años más tarde del desarrollo de la técnica de Gram, el patólogo alemán Carl Weigert agregó una etapa más, que es la recoloración de la Gram (-) con safranina (Cuadro 1.1). En dicha tinción se forma dentro de las células un complejo cristal insoluble violeta-yodo que en el caso de las Gram (-) puede extraerse con alcohol, pero no en las Gram (+). El alcohol deshidrata las bacterias Gram (+) que poseen una pared celular muy gruesa con varias capas de peptidoglicano. Esto provoca el cierre de los poros de la pared impidiendo la salida del Cuadro 1.1. Secuencia de pasos en el procedimiento de coloración diferencial de Gram. BACTERIAS SECUENCIA Gram positivas Gram negativas 1 - Sin colorear 2 - Violeta de genciana 3 - Ioduro de potasio 4 - Decoloración con una mezcla de alcohol-acetona 5 - Coloración con safranina 17 complejo cristal violeta-yodo. En las bacterias Gram (-), el alcohol penetra rápidamente en la capa externa que es rica en lípidos y la fina capa de peptidoglicano no impide el paso del disolvente, por lo que el complejo se extrae fácilmente. La clasificación de estos dos grupos de bacterias se debe a la complejidad de la estructura celular de las bacterias Gram (-), que presentan tres capas principales (Figura 1.3): a) La membrana citoplasmática, que rodea el citoplasma de la célula y contiene proteínas y fosfolípidos. La membrana citoplasmática sirve como una barrera de permeabilidad selectiva para las sustancias que entran o salen de la célula, también se considera el sitio donde se produce la energía de la célula. Dentro del citoplasma celular también se encuentran los cromosomas, ribosomas y otras estructuras internas, b) La pared celular (peptidoglicano), es un polímero entrecruzado relativamente delgado y es responsable de mantener la forma del organismo, y está localizada dentro del espacio periplásmico. Figura 1.3. Estructura de bacterias Gram negativas El espacio periplásmico, localizado entre la membrana externa y la membrana citoplasmática contiene proteínas periplásmaticas que incluyen: proteínas de enlace para sustratos específicos, enzimas hidrolíticas y enzimas detoxificantes, y c) La capa externa o capa L (Lipopolisacárido), representa una segunda bicapa lipídica; sin embargo, hay que destacar que no consta solamente de fosfolípidos como la membrana citoplasmática, sino que contiene polisacáridos y proteínas, lo que justifica su nombre. También sirve como una barrera de permeabilidad de la célula, ya que ayuda a retener proteínas en el espacio periplasmático. Contiene proteínas embebidas, llamadas porinas o poros, 18 estos canales llenos de agua facilitan el transporte de nutrientes y sustancias de bajo peso molecular dentro de la célula, incluyendo agentes antimicrobianos. Las bacterias varían en el número y tipo de porinas que contienen. Los polisacáridos; localizados en la superficie de la célula, son los componentes esenciales de las endotoxinas (estos contribuyen a la capacidad de la bacteria para causar enfermedad), y son la causa de la carga neta de las bacterias Gram (-). Las familias representativas de este grupo de bacterias son: Enterobacteriaceae, No Enterobacteriaceae, Haemophilus spp, Neisseria/Moraxella y Anaerobios. Por otro lado, las bacterias Gram (+) son menos complejas debido a que únicamente contienen dos capas: la membrana citoplasmática y la capa de peptidoglicano (Figura 1.4). La membrana citoplasmática, el citoplasma, y otros componentes internos son similares tanto en bacterias Gram (+) como en bacterias Gram (-). Sin embargo, la pared celular es más gruesa que la de las bacterias Gram (-), y es la responsable de mantener la forma del organismo. Dentro de la pared celular se encuentran los ácidos teicoicos, que son polímeros que están entrelazados en la capa de peptidoglicano y se extiende en forma de cilios más allá de la superficie de las células Gram (+). Estos son también antígenos importantes de superficie en aquellos organismos que los poseen. Las familias representativas de este grupo de bacterias son: Staphylococcus, Enterococcus spp., y Streptococcus spp. Figura 1.4. Estructura de bacterias Gram positivas 19 1.3.1. Peptidoglicano En ambos tipos de bacterias el principal componente de la pared celular es el polímero peptidoglicano, que es el responsable de la forma, integridad e insolubilidad de las células bacterianas. En bacterias Gram (+) el peptidoglicano representa hasta el 80% del peso total de la pared celular. En cambio, en las bacterias Gram (-), si consideramos también la membrana externa, el porcentaje de peptidoglicano es mucho menor. La presencia de la membrana externa hacen a las bacterias Gram (-), menos permeables y tales propiedades de permeabilidad juegan un rol muy importante en la resistencia de muchas bacterias a los antibacterianos porque impiden el acceso de esas moléculas al interior de la célula y por ende, la llegada al sitio de acción. La función de la pared celular en ambos tipos de bacterias es formar un recubrimiento rígido por encima de la membrana plasmática. La membrana plasmática encierra generalmente un volumen hipertónico con respecto al ambiente en el que se desarrolla el microorganismo. Aunque la integridad de la membrana citoplasmática es crítica para el mantenimiento del gradiente osmótico entre el microorganismo y su medio, no es suficientemente fuerte para mantener por sí sola el contenido citoplasmático frente a un cambio osmótico, de manera que la pared celular previene la ruptura de la membrana citoplasmática. La consecuencia de la formación de una pared celular no entrecruzada conduce a que enzimas bacterianas superficiales– llamadas autolisinas- produzcan la ruptura de las paredes celulares defectuosas, creando puntos “flojos” por donde se produce el vaciamiento del contenido citoplasmático, para el caso de bacterias que crecen en medios hipotónicos (Figura 1.5). Cuando la bacteria crece en un medio isotónico con respecto al contenido citoplasmático, la exposición a un antibacteriano que inhiba la biosíntesis de la pared celular conduce a la formación de esferoplastos o protoplastos, es decir bacterias que carecen de dicha pared celular. Por consiguiente, estas bacterias no pueden reproducirse y no son viables (Figura 1.5). Se denominan protoplastos las células bacterianas a las que se ha desprovisto totalmente de pared celular [caso que ocurre con las bacterias Gram (+)], mientras que esferoplastos son aquellas células bacterianas que poseen restos de pared [caso que ocurre en bacterias Gram (-)]. 1.3.1.1. Biosíntesis del peptidoglicano La biosíntesis de una unidad de peptidoglicano procede por una serie de reacciones que se producen en el citoplasma, la membrana citoplasmática y el exterior de la célula. Si bien hay variantes menores de acuerdo al tipo de bacteria, existe una secuencia general válida tanto para Gram (+) como en bacterias Gram (-). Se pueden distinguir tres etapas en el proceso de síntesis del peptidoglicano. La primera etapa se lleva a cabo en el citoplasma y se trata de la biosíntesis del componente monomérico principal del polímero peptidoglicano: la uridina difosfato N-acetil muramil pentapéptido (UDP-MurNAc-pentapéptido). 20 Figura 1.5. Acción de las autolisinas o inhibidores de la síntesis de la pared celular sobre la célula bacteriana. En la segunda etapa la unidad precursora es llevada a la membrana citoplasmática, produciéndose allí una serie de modificaciones que completan la estructura del monómero y la unen a la cadena polimérica en crecimiento para formar la estructura lineal del polímero. La tercera etapa se lleva a cabo en el periplasma (exterior de la membrana citoplasmática) y en ella se produce el entrecruzamiento de las cadenas poliméricas para darle rigidez a la estructura de la pared celular. Primera etapa: La primera etapa es catalizada por enzimas solubles en el citoplasma. La reacción inicial es la formación de la UDP-N-acetilglucosamina (UDP-NAcG) a partir de N-acetilglucosamina-1- fosfato y uridina-5'-trifosfato (UTP) (Esquema 1.1). A continuación, el fosfoenolpiruvato (PEP) se une a la posición 3 del residuo de N-acetilglucosamina, en una reacción catalizada por una transferasa (UDP-NAcG transferasa), para producir UDP-N- acetilglucosamina-3-piruvil éter. En una reacción subsiguiente, el resto enolpiruvil éter se reduce al D- lactato correspondiente, bajo catálisis de una reductasa, para producir ácido UDP-N-acetilmurámico 21 (UDP-MurNAc) (Esquema 1.2). La conversión a UDP-N-acetilmuramil tripéptido se produce por adición secuencial al grupo lactil de L-alanina (L-Ala), ácido D-glutámico (D-Glu), L-lisina (L-Lis). En cada caso, la adición es catalizada por una ligasa específica lo que requiere un catión divalente (Mn2+ o Mg2+) y la hidrólisis de ATP para su actividad. En el siguiente paso, el UDP-N-acetilmuramil pentapéptido se obtiene por adición del dipéptido preformado D-alanil-D-alanina. Para la síntesis de este dipéptido, es necesario primero la conversión de L-alanina en D-alanina, lo cual es catalizado por la enzima alanina racemasa; seguida del acoplamiento entra las dos unidades de D-alanina, catalizada por la D-alanil- D-alanina sintetasa para obtener la D-alanil-D-alanina. Esquema 1.1. Secuencia de reacciones iniciales de la primera etapa de la biosíntesis de la pared celular de las bacterias (Representada por S. aureus) Finalmente, la adición de D-alanil-D-alanina al UDP-N-acetilmuramil tripéptido, catalizada por una ligasa lleva a la obtención del UDP-N-acetil muramil pentapéptido, compuesto con el que termina la etapa citoplasmática de la biosíntesis de la pared celular. Segunda etapa: La segunda etapa de la biosíntesis del peptidoglicano implica la transferencia del UDP-N-acetil muramil pentapéptido desde los sitios intracelulares a la membrana citoplasmática donde 22 se producirá la incorporación del peptidoglicano en crecimiento. Los pasos en la membrana implican primero una translocasa que cataliza la transferencia del UDP-N-acetil muramil pentapéptido al aceptor undecaprenil pirofosfato unido a la membrana citoplasmática, generando el undecaprenil pirofosfato- N-acetil-muramil pentapéptido (Esquema 1.3) El undecaprenol o bactoprenol es un compuesto de once unidades de isopreno cuyo hidroxilo terminal está esterificado por un fosfato inorgánico. Este fosfolípido está anclado a la membrana citoplásmica a través de su extremo no polar, actuando como un vehículo lipofílico que juega un papel central en esta segunda etapa. A continuación se añade una unidad de N-acetilglucosamina al undecaprenil pirofosfato-N-acetil- muramil pentapéptido, para formar la unidad disacárida [undecaprenil pirofosfato-N-acetil-muramil pentapéptido-β-(1-4)-N-acetil glucosamina]. En el caso de S. aureus esta estructura es modificada por la adición al grupo amino de la cadena lateral de la L-lisina, de cinco moléculas de glicina, de manera secuencial. De esta manera se completa la unidad disacárida para añadirse al peptidoglicano en crecimiento. En el paso siguiente, la molécula del disacárido se separa del fosfolípido y se une covalentemente a una molécula del peptidoglicano en crecimiento. Esta reacción es catalizada por una transglicosilasa. Durante este proceso las unidades monoméricas se van uniendo una a otra para formar el polímero lineal. Se ha postulado que la función del lípido intermediario es transportar las unidades monoméricas a través de la membrana celular hacia el exterior de la célula donde se completa la biosíntesis por el entrecruzamiento entre las cadenas de peptidoglicano. Tercera etapa: La tercera etapa del proceso de biosíntesis de la pared celular tiene lugar en el exterior de la membrana celular. La enzima transpeptidasa cataliza el entrecruzamiento de las cadenas lineales del peptidoglicano. Sólo cuando estos entrecruzamientos se llevan a cabo el peptidoglicano se convierte en una matriz insoluble capaz de mantener la integridad estructural de la pared celular. Estudios detallados sobre la acción de las transpeptidasas de una serie de bacterias han establecido que la reacción de transpeptidación comienza con la escisión del enlace entre D-alanil-D-alanina para formar una acil enzima, liberando la unidad terminal de D-alanina. Esta reacción es seguida por una segunda reacción en la que esta acil enzima reacciona con el grupo amino terminal de la glicina de la pentaglicina (ataque nucleofílico) para formar un nuevo enlace peptídico, uniéndose de esta manera dos cadenas lineales de polímero peptidoglicano (reacción de transpeptidación) (Esquema 1.4). La compleja serie de reacciones catalizadas por enzimas que están implicadas en la biosíntesis de peptidoglicano entrecruzado proporcionan muchos sitios potenciales para la inhibición mediante antibacterianos específicos. Varios de estos agentes antibacterianos serán discutidos en los próximos capítulos de este libro. 23 Esquema 1.2. Secuencia de reacciones finales de la primera etapa de la biosíntesis de la pared celular de las bacterias (Representada por S. aureus) 24 Esquema 1.3. Secuencia de reacciones de la segunda etapa de la biosíntesis de la pared celular de las bacterias (Representada por S. aureus) 25 Esquema 1.4. Secuencia de reacciones de la tercera etapa de la biosíntesis de la pared celular de las bacterias (Representada por S. aureus) 26 27 CAPITULO 2 INTRODUCCIÓN A LOS AGENTES ANTIBACTERIANOS 2.1. AGENTES ANTIBACTERIANOS Los agentes antibacterianosson sustancias químicas capaces de inhibir el desarrollo de las bacterias (bacteriostáticos), o causar su muerte (bactericidas). Estos agentes comprenden a: Antibióticos: Son sustancias producidas por microorganismos (hongos, bacterias), que como tal o modificadas químicamente, inhiben el crecimiento bacteriano (bacteriostáticos) o su supervivencia (bactericidas). Generalmente son selectivos y ejercen su acción sobre las células procariotas (bacterias) sin afectar las células del paciente (eucariotas). Ej: Tetraciclinas, aminoglicósidos, β- lactamas, etc. Antibacterianos sintéticos: Son compuestos químicos que se obtienen por síntesis total, es decir no han sido descubiertos de fuentes naturales o por modificación de compuestos obtenidos de fuentes naturales y que inhiben el crecimiento bacteriano (bacteriostáticos) o su supervivencia (bactericidas). Ej: Sulfas, fluoroquinolonas, trimetoprima, etc. Desinfectantes: Son compuestos químicos que se utilizan para eliminar o inhibir el crecimiento de diversos microorganismos y que se aplican sobre objetos y materiales inanimados, como instrumentos y superficies (pisos, paredes, etc.). Se caracterizan por ser tóxicos, irritantes, corrosivos. Por este motivo no pueden utilizarse interna ni externamente en seres vivos. Antisépticos: son sustancias que destruyen o inhiben el crecimiento de microorganismos y que se aplican sobre tejidos vivos (uso externo). Ej: agua oxigenada, yodo, alcohol, etc. 2.1.1. Aspectos históricos del desarrollo de agentes antibacterianos La historia de las enfermedades infecciosas desde el comienzo hasta el final del Siglo XX estuvo íntimamente relacionada con los compuestos que se utilizaron para su erradicación. Particularmente, los agentes antibacterianos evolucionaron desde los compuestos organoarsenicales, como el salvarsan, más tarde las sulfas, y posteriormente en la década del cuarenta, el inicio de la comercialización de las penicilinas, dio comienzo a la llamada “Era de los antibióticos” (Figura 2.1). Desde la década del cuarenta hasta el fin de siglo no se produjeron descubrimientos significativos en esta lucha contra las bacterias. Sólo pueden mencionarse las quinolonas y fluoroquinolonas como 28 nuevas estructuras químicas con actividad antibacteriana. Esto tiene que ver con el hecho de que, a partir de la segunda mitad del siglo pasado, se expandió la idea de que las enfermedades infecciosas habían dejado de ser la principal causa global de mortalidad en los países desarrollados. Sin embargo, durante los últimos treinta años surgieron una serie de hechos que no permitieron seguir manteniendo la ideología de una ‘batalla definitiva” contra las bacterias: algunas infecciones extrahospitalarias no sólo han aumentado, sino que han sufrido una auténtica metamorfosis que las hace más variadas y de diagnóstico más difícil. Ciertas infecciones nosocomiales, producidas por auténticos “acorazados microbianos”, están en aumento y la aparición incesante de cepas resistentes, como consecuencia del uso masivo e indiscriminado de los antibióticos, ha adquirido ya proporciones alarmantes en muchos casos. Esto ha llevado a que se recomiende, por un lado, un uso más racional de los agentes antibacterianos, y por el otro el desarrollo de nuevos, más potentes y selectivos agentes terapéuticos para la lucha contra las bacterias. Los avances logrados en las últimas décadas en biología molecular y tecnología genética han producido cambios importantes en las ciencias biomédicas. Los desarrollos en el área de la genómica y proteómica han llevado a la identificación de un sinnúmero de nuevos objetivos terapéuticos y han mejorado significativamente nuestro entendimiento sobre los mecanismos a nivel molecular que las bacterias utilizan en defensa de su integridad estructural y celular frente a la Figura 2.1. Evolución histórica de los agentes antibacterianos 29 presencia de agentes antibacterianos. Las compañías farmacéuticas y los laboratorios académicos han comenzado desde hace algunos años una serie de programas dirigidos al descubrimiento, diseño y desarrollo de nuevos agentes antibacterianos que afecten diferentes objetivos biológicos relacionados con procesos vitales para la supervivencia y/o diseminación de las células bacterianas. 2.1.2. Clasificación por estructura química Los antibióticos y antibacterianos sintéticos fueron agrupados sobre la base de su estructura química y su mecanismo de acción. 2.1.2.1. Antibióticos Esta clasificación es la más útil para establecer las relaciones entre la estructura química y la actividad biológica (SAR). Frecuentemente un grupo se subdivide en subgrupos con respecto a características estructurales similares. Las clases y estructuras químicas de antibióticos y antibacterianos sintéticos de gran importancia clínica que se discuten en este apunte son los siguientes: Los β-Lactámicos: Todos los antibióticos β-lactámicos se caracterizan estructuralmente por tener una amida cíclica (lactama) de cuatro miembros. Dentro de este grupo se encuentran las peniclinas y cefalosporinas (Figura 2.2). Los aminoglicósidos: Estructuralmente, los antibióticos aminoglicósidos contienen dos o más aminoazúcares y aminociclitoles unidos por puentes glicosídicos. Miembros representativos son estreptomicina, neomicina, kanamicina, gentamicina (Figura 2.3), tobramicina y amicacina entre otras. Los macrólidos: Los antibióticos macrólidos son lactonas macrocíclicas que están unidas a dos monosacáridos (uno de ellos es un azúcar amino). Los antibióticos macrólidos son sub-agrupados de acuerdo al tamaño del anillo de la lactona macrocíclica, es decir si son de 14, 15 o 16 miembros. Son representantes de los macrólidos de 14 miembros la eritromicina A (Figura 2.4), roxitromicina, claritromicina y fluoritromicina. Los macrólidos de 16 miembros incluyen la miocamicina y midecamicina. La Penicilinas Cefalosporinas Figura 2.2. Ejemplos de antibióticos β-lactámicos Gentamicina Figura 2.3. Ejemplo de antibiótico aminoglicósidos 30 azitromicina pertenece al subgrupo de 15 miembros. Los antibióticos designados genéricamente como tetraciclinas son derivados del sistema tetracíclico naftacenocarboxamida. Pertenecen a este grupo la tetraciclina (Figura 2.5), clorotetraciclina, etc. Tetraciclinas: Lincomicinas o Lincosamidas: Pertenecen a este grupo la lincomicina y la clindamicina (Figura 2.6), las cuales se caracterizan por poseer en sus estructuras un anillo pirrólinico sustituido y unido a un derivado azufrado de una octosa. Ansamacrólidos: Este grupo de antibióticos se caracteriza por poseer una cadena lateral alifática macrocíclica que conecta dos posiciones no adyacentes de un núcleo aromático. El término “ansa” proviene del griego y significa manija o agarradera. A este grupo pertenece la Rifampicina (Figura 2.7) y Rifamicina. Eritromicina A Figura 2.4. Ejemplo de antibióticos macrólidos Tetraciclina Figura 2.5. Ejemplo de antibiótico tetraciclina Clindamicina Figura 2.6. Ejemplo de Lincomicina Figura 2.7. Ejemplo de antibiótico Ansamacrólido, Rifampicina 31 Glicopéptidos: Todos los antibióticos de este grupo poseen una estructura peptídica cíclica y azúcares unidos a la unidad peptídica. La vancomicina y la teicoplanina que pertenecen a este grupo son los únicos que se usan en clínica médica (Figura 2.8). Peptídicos: Este nombre deriva del hecho de que estos antibióticos poseen una estructura cíclica formada por aminoácidos unidos a través de uniones amida. En este grupo se encuentran las polimixinas y la bacitracina (Figura 2.9). Vancomicina Figura 2.8. Ejemplo de antibiótico glicopeptídico Figura2.9. Ejemplo de antibiótico peptídico Cloranfenicol: Este antibiótico tiene la peculiaridad, entre los compuestos naturales, de que contiene una fracción nitrobenceno y proviene del ácido dicloroacético. La forma biológicamente activa es la levorrotatoria (Figura 2.10). Figura 2.10. Cloranfenicol 32 Estreptograminas: Estos antibióticos son macrolactonas y contienen algunos aminoácidos no naturales en su estructura. Entre ellos se encuentran la quinupristina y la dalfopristina (Figura 2.11) D-cicloserina: La cicloserina es la D-4-amino-3-isoxazolidona. Es un antibiótico de amplio espectro producido por Streptococcus orchidaceous. Es un antibiótico estructuralmente análogo al aminoácido D-alanina (Figura 2.12). Fosfomicina: Es el ácido 2R- (3-metil-2-oxiranil)fosfónico. Es un antibiótico activo contra Gram (+) y Gram (-) (Figura 2.12). 2.1.2.2. Antibacterianos sintéticos Como ya dijimos, los antibacterianos sintéticos son compuestos que se obtienen totalmente por procesos de síntesis. Entre los más destacados podemos incluir (Figura 2.13): Sulfas: Son estructuralmente derivados N-monosustituidos de la 4-aminobenceno sulfonamida, por ejemplo, sulfametoxazol. Diaminopirimidas: En este grupo se encuentra la trimetoprima. O N H CH3 N O NO O O S OH O H3C H3C H3C N CH3 H3C O O H SO3CH3 N OH NH HN O N O O N CH3 O N N H3C CH3 H N O O O CH3 O CH2CH3 O S N H SO3CH3 Quinupristina Dalfopristina Figura 2.11. Ejemplos de estreptograminas Figura 2.12. 33 Nitrofuranos: Son 5-nitrofuranos-2-sustituidos, por ejemplo furazolidona. Quinolonas: Las quinolonas o fluoroquinolonas son agentes antibacterianos sintéticos (Figura 2.14). El ácido nalidíxico fue descubierto en la década de 1960 como un subproducto de la purificación del fármaco antimalárico, la cloroquina. Las fluoroquinolonas se introdujeron en clínica a mediados de los años 1980. Oxazolidinonas: Las oxazolidinonas representan una nueva clase de agentes antibacterianos sintéticos. El Linezolid fue aprobado en abril de 2000 para su comercialización por la Administración de Alimentos y Medicamentos (FDA) en los Estados Unidos (Figura 2.15). Por primera vez en muchos años una nueva estructura química era utilizada en terapias antibacterianas. 2.1.3. Clasificación por el mecanismo de acción Los procesos metabólicos bacterianos (es decir, de las células procariotas) son diferentes de los procesos bioquímicos de las células eucariotas y por esa razón se explica el concepto de toxicidad selectiva de muchos antibióticos que son tóxicos para el microorganismo pero no para los seres humanos o animales. Las bacterias para crecer y multiplicarse necesitan sintetizar biomoléculas tales como proteínas y ácidos nucleicos. Los agentes antibacterianos interfieren con procesos específicos Sulfametoxazol Trimetoprima Furazolidona Figura 2.13. Antibacterianos sintéticos destacados Ácido Nalidíxico Ciprofloxacina (QUINOLONA) (FLUOROQUINOLONA) Figura 2.14. Ejemplo de Quinolonas Figura 2.15. Linezolid 34 que son esenciales para el crecimiento o división celular bacteriana y, en base a su mecanismo de acción, pueden agruparse de acuerdo a lo que se indica en la Figura 2.16. Los mecanismos de acción más comunes son: Inhibición de la biosíntesis de la pared celular bacteriana Inhibición de la biosíntesis de proteínas Inhibición de la biosíntesis de ácidos nucleicos, ARN o ADN Inhibición de la síntesis del ácido tetrahidrofólico La inhibición de la biosíntesis de la pared celular bacteriana: Dado que las células bacterianas tienen una alta presión osmótica interna, requieren de una estructura rígida para protegerse de la lisis, específicamente esta estructura es un polímero entrecruzado llamado peptidoglicano. Algunos de los antibióticos que interfieren con la biosíntesis del peptidoglicano son los β-lactámicos (penicilinas, cefalosporinas, cefamicinas, monobactamas, carbapenems, etc.), glicopéptidos (vancomicina y teicoplanina), D-cicloserina, fosfomicina y bacitracina. Los agentes antibacterianos más selectivos son aquellos que interfieren con la biosíntesis de la pared celular bacteriana. Estos agentes antibacterianos tienen un índice terapéutico alto (la relación entre la dosis tóxica y la dosis terapéutica), debido a que Figura 2.16. Agentes antibacterianos en base a su mecanismo de acción 35 interfieren en un proceso biosintético que es exclusivo de las células procariotas (biosíntesis de la pared celular). La inhibición de la biosíntesis de proteínas: Los antibióticos que interactúan con la unidad 70S del ribosoma bacteriano alteran la síntesis de proteínas bacterianas. Los aminoglicósidos, tetraciclinas, cloranfenicol, macrólidos, lincosamidas, quinupristina, dalfopristina y mupirocina inhiben la síntesis de proteínas mediante la unión al ribosoma de las células procariotas. La selectividad de los inhibidores de la biosíntesis de proteínas bacterianas surge principalmente a partir de su capacidad para unirse selectivamente al ribosoma de las células procariotas o para interferir con algún paso en la biosíntesis proteica bacteriana. Inhibición de la biosíntesis de ácidos nucleicos: El crecimiento y la división de la célula bacteriana dependen, entre otros factores, de la síntesis de ADN y ARN. Los agentes antibacterianos que pueden alterar la síntesis de ácidos nucleicos en forma directa son, por ejemplo, las fluoroquinolonas que inhiben la ADN girasa. La inhibición de la síntesis del ácido tetrahidrofólico: En este grupo encontramos a las sulfonamidas y trimetoprima que inhiben el metabolismo del ácido fólico. La inhibición de la síntesis del ácido tetrahidrofólico afecta la síntesis de aminoácidos (y por lo tanto de proteínas) y de los ácidos nucleicos (ADN y ARN). 36 37 CAPÍTULO 3 ANTIBIÓTICOS β-LACTÁMICOS Y RESISTENCIA BACTERIANA 3. COMPUESTOS β-LACTÁMICOS Químicamente los compuestos β-lactámicos son amidas cíclicas de cuatro miembros. Este tipo de moléculas comprenden dos grupos de agentes terapéuticos de considerable importancia clínica, los antibióticos β-lactámicos y los inhibidores de β-lactamasas. 3.1. ANTIBIÓTICOS β-LACTÁMICOS Los antibióticos β-lactámicos abarcan una variedad de compuestos naturales y semisintéticos que poseen como rasgo en común el anillo β-lactámico. La historia comenzó con el descubrimiento del primer antibiótico β-lactámico, una penicilina, en el año 1929, y el posterior aislamiento, producción masiva de la penicilina G en la década del ’40. Las cefalosporinas se detectaron por primera vez en el año 1945, cuando se descubrió un nuevo compuesto β-lactámico aislado de hongos, llamado cefalosporina C. Este grupo, penicilinas y cefalosporinas constituyen lo que se conocen como antibióticos β-lactámicos clásicos. Desde 1971 hasta el presente se han descubierto una serie de estructuras β-lactámicas mono- y bicíclicas de origen natural o semisintético, las que hoy se denominan antibióticos β-lactámicos no-clásicos o no-tradicionales. Este grupo incluye las cefamicinas, carbapenems y monobactamas, entre otros (Figura 3.1). Figura 3.1. Antibióticos β-lactámicos clásicos y no clásicos 38 3.1.1. Historia de los antibióticos β-lactámicos Alexander Fleming era un bacteriólogo que trabajaba en el St. Mary’s Hospital Medical School de Paddington, Londres, Inglaterra que era algo desordenado (Figura 3.2.). En el año 1929, después de regresar de unas vacaciones de 3 semanas, Fleming se percató de algo extraño en una pila de placas de petri olvidadas antes desu partida. En ellas había sembrado cepas de estafilococos, una bacteria que produce ampollas, abscesos y, a veces, infecciones generalizadas y fatales. Durante sus vacaciones, esporos de un hongo (quizás provenientes del laboratorio de micología vecino al de Fleming o de la calle cercana) contaminaron las placas y ese hongo había segregado una sustancia que producía la inhibición del crecimiento de la bacteria. Fleming aisló el hongo y, luego de cierto tiempo, lo identificó como Penicillium notatum. Este hongo liberaba un compuesto que, de alguna manera, inhibía el crecimiento bacteriano. Fleming probó esa sustancia en varios tipos de bacterias y halló que algunas se veían afectadas y otras no. Los historiadores de la ciencia señalan que no puede afirmarse que Fleming haya “descubierto” la penicilina. Las evidencias muestran que ni él ni ningún otro investigador del laboratorio manifestó interés en el uso terapéutico de esa sustancia; sólo les interesaba como medio para liberar a sus cultivos de bacterias no deseadas, con el propósito de hacer más eficaz la producción de vacunas que, de alguna manera, aseguraban el financiamiento del laboratorio. Recién diez años más tarde, otros investigadores de la Universidad de Oxford, entre ellos el alemán Ernst Chain (1906- 1979), el australiano Howard Florey (1889-1968) y el inglés Edward Abraham (1913-1999) prosiguieron estos estudios y lograron aislar la penicilina y luego usarla como antibiótico. La purificación de la penicilina se llevó a cabo en 1939, y estuvo a cargo del bioquímico Heatley, utilizando grandes volúmenes de filtrado mediante un sistema a contracorriente y extracción con acetato de amilo. Edward Abraham terminó de eliminar el resto de impurezas por cromatografía en columna de alúmina. Posteriormente se probó la sustancia en ratones infectados con Streptococcus. El primer ser humano tratado con penicilina purificada fue el agente de policía Albert Alexander en el Hospital John Radcliffe de Oxford, el 12 de febrero de 1941. El paciente falleció porque no se le pudo administrar suficiente cantidad del fármaco. A partir de estas investigaciones, en 1939 se pensó en desarrollar la producción industrial de la penicilina, pero Europa estaba en apuros económicos debido Figura 3.2. Alexander Fleming http://es.wikipedia.org/wiki/1939 http://es.wikipedia.org/wiki/Bioqu%C3%ADmica http://es.wikipedia.org/wiki/Filtraci%C3%B3n http://es.wikipedia.org/wiki/Extracci%C3%B3n http://es.wikipedia.org/wiki/Cromatograf%C3%ADa http://es.wikipedia.org/wiki/Al%C3%BAmina http://es.wikipedia.org/wiki/Mus_musculus http://es.wikipedia.org/wiki/Infecci%C3%B3n http://es.wikipedia.org/wiki/Streptococcus http://es.wikipedia.org/wiki/Polic%C3%ADa http://es.wikipedia.org/wiki/Hospital_John_Radcliffe http://es.wikipedia.org/wiki/12_de_febrero http://es.wikipedia.org/wiki/1941 39 al comienzo de la Segunda Guerra Mundial. Los científicos británicos buscaron ayuda en los Estados Unidos, específicamente en los laboratorios de Peoria, Illinois donde sus científicos estaban trabajando en métodos de fermentación para acelerar el crecimiento de cultivos de hongos. El 9 de julio de 1941 Florey y Heatley partieron de la Universidad de Oxford con una pequeña cantidad del hongo que producía penicilina hacia los Estados Unidos. Bombearon aire dentro de enormes cubas llenas de maíz fermentado con otros ingredientes y aditivos claves lo que demostró poder hacer crecer rápidamente grandes cantidades del hongo en comparación con los antiguos métodos de crecimiento sobre superficies planas. La cepa de Penicillium que tuvo el mejor rendimiento no fue la importada por los científicos británicos sino una cepa que crecía sobre un melón en uno de los mercados de Peoria (Penicillium chrysogenum), mejorando la cantidad de producción en las condiciones de la nueva técnica de inmersión del laboratorio estadounidense, aproximadamente 70-80 unidades de penicilina por mililitro de cultivo. Así, hacia fines de 1941 se había logrado mejorar 10 veces la producción de penicilina, con lo cual se transformaba en un fármaco que podía ser obtenido en cantidad suficiente para su uso masivo en clínica. Para ese tiempo Estados Unidos había entrado en la guerra y las Fuerzas Armadas, tanto británicas como norteamericanas, comenzaron a utilizar Penicilina, todo en un estado de extremo secreto, para evitar que cayera en manos del enemigo. Asimismo, en Inglaterra se creó la llamada Comisión de la Penicilina, y el propio Florey viajó al norte de África para poner a prueba los efectos de la penicilina en los soldados heridos. Sus ensayos se consideraron un milagro. En lugar de amputar las extremidades heridas, sugirió que las heridas de los soldados se debían limpiar y coser, y luego suministrarles penicilina. Gracias a Florey y su equipo, se lograron salvar miles de vidas tanto en el desembarco de Normandía, como en la campaña de Italia y el frente del pacifico. Poco tiempo después, en 1945, Fleming, Chain y Florey compartieron el Premio Nobel de Medicina. A partir de la Segunda Guerra Mundial, y en ulteriores conflictos bélicos, el empleo sistemático de la penicilina como antibiótico profiláctico hizo que la mionecrosis clostridiana (gangrena gaseosa) dejara de ser la primera causa de muerte en los heridos. Durante la Primera Guerra Mundial la mortalidad provocada por heridas fue del 8,1% (de ello, la mitad por mionecrosis clostridiana). En la Segunda Guerra Mundial fue del 4,5% y durante la guerra de Corea la frecuencia disminuyó hasta el 2,5%. En la guerra de Vietnam, la tasa de mionecrosis clostridiana fue prácticamente de cero. 3.1.2. Aspectos estructurales y nomenclatura Con la excepción de las monobactamas (aztreonam y norcardicinas), los antibióticos β-lactámicos están fusionados, a través del átomo de nitrógeno y del átomo de carbono tetrahédrico adyacente, a un segundo ciclo, que puede ser de 5 miembros (por ejemplo, una tiazolidina en penicilinas o una tetrahidropirrolidina en carbapenems) o de 6 miembros (por ejemplo, una dihidrotiazina en cefalosporinas y cefamicinas). El anillo β-lactámico se lo designa también como azetidin-2-ona o simplemente azetidinona. Las penicilinas están constituídas por un sistema bicíclico correspondiente a la fusión entre un anillo de azetidinona y otro de tiazolidina, lo que en conjunto forman el núcleo http://es.wikipedia.org/wiki/Segunda_Guerra_Mundial http://es.wikipedia.org/wiki/Estados_Unidos http://es.wikipedia.org/wiki/Estados_Unidos http://es.wikipedia.org/wiki/Peoria_(Illinois) http://es.wikipedia.org/wiki/Illinois http://es.wikipedia.org/wiki/Fermentaci%C3%B3n http://es.wikipedia.org/wiki/Fungi http://es.wikipedia.org/wiki/9_de_julio http://es.wikipedia.org/wiki/Universidad_de_Oxford http://es.wikipedia.org/wiki/Mililitro 40 penam (Figura 3.3). Cuando el núcleo penam tiene dos grupos metilos unidos al átomo de carbono de la posición 2, y un grupo ácido carboxílico como sustituyente del átomo de carbono en posición 3, el compuesto es el ácido penicilánico, de acuerdo a la nomenclatura tradicional de las β-lactamas. Por analogía, en la nomenclatura usada para el núcleo penam, los nombres triviales de cefem, carbapenem y clavan se usan para las estructuras mostradas en la Figura 3.4. Mediante estudios de Rayos X se ha demostrado que la conformación del núcleo penam es la que se aprecia en la Figura 3.5. Los sustituyentes que se ubican sobre la cara cónvaca (por encima del plano imaginario) se los designa como sustituyentes “beta”, mientras que a los que se encuentran sobre la cara convexa, se los designa como sustituyentes “alfa”. Así, el ácido 6 β-aminopenicilánico (6- APA), es el ácido penicilánico con un grupo amino sustituyendo la posición 6 y con una configuración “beta”, es decir por encima del plano del núcleo penam. La conformación del núcleo penam tiene suma importancia
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