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PROPUESTA DE ADECUACIÓN DEL PROGRAMA DE DOCTORADO BIOLOGÍA 
MOLECULAR Y CELULAR (Ref. Mención de Calidad MCD-2004-00123) AL 
REAL DECRETO 1393/2007 
 
 
 
Programa de Doctorado: 
BIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR 
Unidad Proponente 
INSTITUTO DE BIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR 
Referencia Mención de Calidad: MCD-2004-00123 
Curso en el que fue otorgada: 2004-2005 
Tipo de estudios 
Interuniversitario: 
 Si No 
Interdepartamental: 
 Si No 
Ámbito: 
 Nacional 
 Internacional 
Créditos ofertados 
60 
Nº cursos: 
14 
Nº profesores que participan: 
16 
Coordinador del Programa de Doctorado: Mª Amparo Estepa Pérez 
Presentación 
La convergencia española al Espacio Europeo de Educación Superior 
conlleva una profunda transformación de la tradicional estructura de titulaciones 
universitarias en España que implica, entre otras cosas, la flexibilización de la 
organización de las enseñanzas, promoviendo la diversificación curricular y 
permitiendo que las universidades aprovechen su capacidad de innovación, sus 
fortalezas y oportunidades. De acuerdo con el REAL DECRETO 1393/2007 de 29 
de octubre por el que se establece la ordenación de las enseñanzas universitarias 
oficiales, la nueva organización de las enseñanzas universitarias responde no 
sólo a un cambio estructural sino que además impulsa un cambio en las 
metodologías docentes, que centra el objetivo en el proceso de aprendizaje del 
estudiante, en un contexto que se extiende ahora a lo largo de la vida. 
Dentro de este contexto, el Programa de Doctorado BIOLOGÍA MOLECULAR 
Y CELULAR (Referencia Mención de Calidad MCD-2004-00123), impartido 
bianualmente por el Instituto de Biología molecular y Celular de la Universidad 
Miguel Hernández (IBMC-UMH) y estructurado hasta ahora de conformidad con el 
REAL DECRETO 778/1998, aborda su adaptación y adecuación a la nueva 
ordenación de las enseñanzas universitarias oficiales reguladas por el REAL 
DECRETO 1393/2007 para cuando comience su nueva edición, que dado su 
carácter bienal, tendrá lugar en el curso 2011/12. 
Antes de presentar el plan de estudios, queremos resaltar que las 
modificaciones realizadas en la estructura y contenidos no suponen en ningún 
momento un cambio en 
-la naturaleza y objetivos del programa 
-la participación de profesores de manera que no se altera el valor del 
historial científico y técnico del grupo. 
-las condiciones por las que se obtuvo la Mención de Calidad. 
 
Todos los detalles relativos a la actual estructura, profesorado, lineas de 
investigación, resultados de investigación, mención de calidad, etc del Programa 
de Doctorado Biología Molecular y Celular pueden consultarse en la dirección 
http://ibmc.umh.es/doctorado/bienio.2008-2010/. 
ESTRUCTURA Y PLAN DE ESTUDIOS DEL PROGRAMA DE DOCTORADO 
BIOLOGÍA MOLECULAR Y CELULAR 
Propuesta para el Bienio 2010/2011 
 
Según lo dispuesto en el REAL DECRETO 1393/2007, las enseñanzas de 
Doctorado que tienen como finalidad la formación avanzada del estudiante en las 
técnicas de investigación, podrán incorporar cursos, seminarios u otras 
actividades orientadas a la formación investigadora e incluirán la elaboración y 
presentación de la correspondiente tesis doctoral, consistente en un trabajo 
original de investigación. De acuerdo con esta disposición para obtener el título 
de Doctor es necesario haber superado conjunto de actividades formativas (60 
créditos ECTS de nivel de postgrado) y de investigación denominado Programa 
de Doctorado. Además, en relación con el periodo de formación se indica que 
podrá organizarse, aunque no exclusivamente, mediante un Master Universitario 
de orientación investigadora. Como alternativa al Master Universitario de 
orientación investigadora, en el REAL DECRETO 1393/2007, se indica, entre 
otras, la posibilidad de que previo informe favorable de la ANECA, los 
departamentos/institutos de una universidad poduedan impartir periodos de 
formación no incluidos en Masteres por motivos de indole científica que 
aconsejen la formación de doctores en un ambito científico determinado. 
Dentro de este planteamiento y tras estudiar las distintas posibilidades de 
adecuación del Programa de Doctorado Biología Molecular y Celular a lo 
dispuesto en el REAL DECRETO 1393/2007, el IBMC considera que en 
consonancia con sus intereses y capacidades científicas, la opción de incluir en su 
programa de doctorado un periodo de formación de 60 créditos ECTS de nivel de 
postgrado que no estén incluidos en un Master, es muy probablemente la mas 
favorable. Entre otras, las razones que han llevado al IBMC a tal consideración 
son: 
1.-En la actualidad el IBMC ha alcanzado de manera más que satisfactoria 
la suficiente masa crítica de profesores e investigadores de reconocido prestigio 
así como el desarrollo de diferentes y exitosas líneas de investigación financiadas 
que responden a su carácter multidisciplinar. Como prueba del exito cientifico 
derivado del desarrollo de sus lineas de investigación basta señalar que en los 
últimos dos bienios (2004/06 y 2006/08) se han defendido en el IBMC 25 Tesis 
Doctorales (ver anexo III, Tesis Defendidas y publicaciones derivadas de las 
mismas), todas ellas de estudiantes, ahora doctores, formados en su programa 
de doctorado. Sin embargo y a pesar de su relevacia científica (ver anexo IV, 
breve historial investigador de los doctores que desarrollan la formación 
doctoral), los temas de investigación que desarrollan estas líneas (Tabla 2) son 
en cierta medida singulares (vacunas DNA frente a rhabdovirus de peces 
cultivados de interés comercial, sensores basados el polifluorenos fluorescentes, 
papel de la inflamación neurogénica en la patología cutánea, etc.) y por ello es a 
veces complicado captar todos los años un número suficiente de estudiantes para 
poder iniciar un nuevo periodo de doctorado. De hecho y debido a esta 
circunstancia, asi como al descenso general de alumnos matriculados en las 
universidades españolas, desde el año 2004 la oferta del Programa de Doctorado 
que imparte el IBMC es bienal. 
2.-Por la singularidad de sus líneas de inestigación, el IBMC necesita 
incorporar doctorandos con unos conocimientos muy específicos y difíciles de 
adquirir en su conjunto en un Master de investigación cuyos contenidos no esten 
expresamente configurado a la medida de la investigación que aquí se desarolla 
 3.-El IBMC pretende formar de manera preferente a los estudiantes que 
posteriormente vayan a incorporarse a sus líneas de investigación. 
 
De acuerdo con estas consideraciones, el IBMC propone estructurar su 
Programa de Doctorado Biología Molecular y Celular para sus próximas ediciones 
de acuedo con el siguiente esquema: 
 
 
Actividades Formativas no incluidas en Master Universitario 
 
Estas actividades se cursarán duran el llamado Periodo de Formación que 
tendrá una duración total de tres semestres, y constará de dos etapas, una 
docente y otra investigadora. 
 
1.-Etapa docente (40 ECTS) 
Durante esta etapa los cursaran una serie de materias introductorias a la 
investigación (Tabla 1, Anexo I). De los 48 créditos ofertados, los alumnos como 
mínimo tendrán que cursar 40 (28 tendrán carácter obligatorio y 12 serán 
optativos). Los cursos a impartir y que recogen la oferta global de créditos de la 
etapa docente (Tabla 1, Anexo I) se han estructurado de la siguiente manera: 
Actividades formativas no incluidas en Máster Universitario
(60 ECTS)
Periodo de formación
Materias introductorias a la investigación 
(40 ECTS, Dos semestres)
Trabajo de introducción a la investigación 
(20 ECTS, Un semestre)
TRES SEMESTRES
Actividades formativas no incluidas en Máster Universitario
(60 ECTS)
Periodo de formación
Materias introductorias a la investigación 
(40 ECTS, Dos semestres)
Trabajo de introducción a la investigación 
(20 ECTS, Un semestre)
Materias introductorias a la investigación(40 ECTS, Dos semestres)
Trabajo de introducción a la investigación 
(20 ECTS, Un semestre)
TRES SEMESTRES
Actividades formativas no
incluidas en Máster
Universitario (60 ECTS)
Líneas de investigación Tesis Doctoral
Actividades formativas no
incluidas en Máster
Universitario (60 ECTS)
Líneas de investigación Tesis Doctoral
PROGRAMA DE DOCTORADO BIOLOGÍA MOLECULAR Y CELULAR
3-4 años*
* Incluido el desarrollo de la Tesis Doctoral
Actividades formativas no
incluidas en Máster
Universitario (60 ECTS)
Líneas de investigación Tesis Doctoral
Actividades formativas no
incluidas en Máster
Universitario (60 ECTS)
Líneas de investigación Tesis Doctoral
PROGRAMA DE DOCTORADO BIOLOGÍA MOLECULAR Y CELULAR
3-4 años*
* Incluido el desarrollo de la Tesis Doctoral
-Contenidos fundamentales (16 créditos). Son cursos que proporcionaran 
conocimientos imprescindibles para que un estudiante pueda posteriormente 
implicarse en una linea de investigación de las desarrolladas en el IBMC y que 
siempre han estado presentes entre los créditos ofertados en el priodo docente 
del programa de doctorado Biología Molecular y celular. Por ello, su carácter es 
obligatorio y deberan ser cursados por todos los estudiantes. Incluyen 4 cursos 
de formación y un curso de Seminarios. El curso “seminarios” está encaminado 
a mostrar a los alunnos no solamente en que temas de investigación se trabaja, 
sino tambien a aprender de científicos de relevado prestigio como se elaboran y 
difunden los resultados de investigación. 
-Metodología y formación en técnicas de investigación (12 creditos), 
apartado en el que se incluyen 2 cursos de marcado carácter práctico 
encaminados a familiarizar a los futuros investigadores con técnicas 
instrumentales muy especializadas (tanto su manejo directo como la 
interpretación de sus resultados) como son resonancia magnética nuclear, 
citometría de flujo, calorimetrial diferencial de barrido, espectroescopia de 
infrarrojo, dicroismo celular etc.. Lógicamente, estos cursos son posibles por que 
el IBMC cuenta entre su equipamiento con este instrumental. Al igual que ocurria 
con los cursos de contenidos fundamentales, su carácter es obligatorio, tal y 
como lo ha sido en pasadas ediciones del programa. 
-Contenidos especializados (21 créditos de carácter optativo). Al igual que 
en pasadas ediciones junto con las enseñanzas de carácter obligatorio se ofertan 
materias optativas que dependiendo de las preferencias/necesidades de los 
estudiantes y en función de con la linea de investigación que posteriormente 
deseen desarollar, deberán cursar los estudiantes (12 créditos). Las materias 
optativan recogen contenidos especializados y directamente relacionados con los 
temas de investigación específicamente desarrollados en las lineas de 
investigación de le programa. 
Para conocer los contenidos de las materias consultar el anexo I. 
 
2.-Etapa de iniciación a la investigación (20 ECTS) 
Este periodo tendrá un carácter eminentemente práctico y supondrán la 
aplicación directa al trabajo de laboratorio de las enseñanzas teórico-prácticas 
obligatorias y optativas recibidas durante la etapa docente. Como final de este 
periodo, se propone la realización, presentación y defensa pública de un 
Trabajo de Investigación o Tesina que versará sobre las tareas que que los 
alumnos hayan realizado en los laboratorios. 
Las tareas de iniciación a la investigación supondrán 20 de los 60 créditos 
del periodo de formación y estarán relacionadas con las líneas de investigación 
financiadas que esos momentos estén desarrollando los 
profesores/investigadores del Programa de Doctorado (ver tabla 2, Lineas de 
investigación financiadas desarrolladas por los Profesores/investigadores del 
IBMC, Anexo II). Con ello pretendemos que este primer encuentro de los 
alumnos con el trabajo habitual de un laboratorio, sea real y responda a la que 
será muy probablemente su actividad diaria cuando desarrollen su Tesis doctoral. 
Cada una de las tareas de iniciación a la investigación constará de 20 créditos y 
estará tutelada por el profesor que la propone, que a su vez será el responsable 
de la correspondiente línea de investigación asociada a la tarea. Finalizada esta 
etapa y tras la defensa publica de la Tesina, se pretende que los estudiantes se 
incorporen en la misma línea de investigación en la que han desarrollado las 
tareas de iniciación a la investigación para desarrollar la Tesis Doctoral. 
Junto con la enseñanza que se ha descrito anteriormente se proponen 
otras actividades formativas complementarias para la etapa de desarrollo de 
la Tesis Doctoral consistentes en la discusión en grupo de trabajos de 
investigación, la asistencia a los ciclos de seminarios y a congresos, 
participación en las reuniones de los distintos grupos de investigación del IBMC, 
visitas a empresas, etc. 
 
 
 Tabla 1. PROPUESTA DE MATERIAS INTRODUCTORIAS A LA 
INVESTIGACIÓN DEL PERIODO DE FORMACIÓN 
créditos 
/horas 
Profesor 
responsable 
Contenidos 
fundamentales 
 
 Interacciones moleculares 3/75 Javier Goméz 
 Ingeniería de proteínas 3/75 Jesús Sanz 
 Biomembranas: componentes, interacciones e implicaciones en los procesos 
biológicos 
3/75 Asia Fernández 
 Análisis de bases de datos biológicos 3/75 Gregorio Fernández 
 Seminarios de actualización en biología molecular y celular 3/75 José A. Ferragut 
 Total 15 
Metodología y 
formación 
 
 Métodos instrumentales de investigación en biología molecular y celular 6/100 José A. Encinar 
 Tratamiento e interpretación de datos experimentales 6/100 Ricardo Mallavia 
 Total 12 
Materias optativas 
 Aproximación experimental a la expresión génica en eucariotas y su 
aplicaciones biomédicas 
3/75 Antonio Ferrer 
 Avances en inmunología molecular y celular 3/75 Amparo Estepa 
 Estrategias genómicas y proteómicas en la identificación y validación de 
dianas terapéuticas 
3/75 Antonio Ferrer 
 Biosensores: nuevas herramientas en biotecnología 3/75 Reyes Mateo 
 Compuestos naturales bioactivos: caracterización, actividad biológica, 
producción industrial y aplicaciones 
3/75 Vicente Micoll 
 Investigación básica y aplicada sobre la estructura e interacción de 
proteínas víricas con membranas biológicas. Metodología innovadora para 
un sistema complejo 
3/75 José Villalaín 
 Virus emergentes 3/75 Luis Pérez 
 Total 21 
 CREDITOS TOTALES 48 
Tabla 2. Lineas de investigación desarrolladas por los Profesores del Programa 
 
 
Para conocer los contenidos y actividades de la líneas de investigación 
consultar el anexo II 
 
 
LINEAS DE INVESTIGACIÓN 
 
 
Investigador 
principal 
Biología Molecular del dolor: componentes, mecanismos y modulación 
terapéutica 
Antonio Ferrer 
Bioplásticos Jesus Sanz 
Dermatología molecular: papel de la inflamación neurogénica y su 
modulación terapéutica 
Antonio Ferrer 
Desarrollo de biosensores fluorescentes e inmovilización de 
biomoléculas en matrices sol-gel 
Reyes Mateo 
Diseño y síntesis de sensores a partir de polímeros fluorescentes 
inspirados en biomoléculas 
Ricardo Mallavia 
Estructura tridimensional de complejos péptido-proteína en el sistema 
de la proteína de la capsida del HIV. 
José L Neira 
Estudio de interacciones moleculares en proteínas de membrana: 
estructura y plegamiento del canal de potasio KcsA 
José M Gonzalez 
Ros 
Estudio de la actividad biológica in vitro de extractos y compuestos 
bioactivos (Antimicrobianos, antioxidantes y antiinflamatorios) 
Vicente Micol 
Estudio de la estructura e interacción de proteínas estructuralesy no 
estructurales de virus con envuelta (HCV, SARS, HIV) con membranas 
biológicas y membranas modelo. 
José Villalaín 
Estudio de las etapas tempranas de infección de rhabdovirus y 
birnavirus 
Amparo Estepa 
Estudios farmacocinéticos de extractos y compuestos bioactivos. 
Ensayos de intervención en humanos. Aplicaciones como ingredientes 
funcionales. 
Vicente Micol 
Modelado molecular de la interacción proteína-membrana mediante la 
utilización de herramientas bioinformáticas. Desarrollo de nuevas 
moléculas bioactivas 
José Villalaín 
El módulo de unión a colina C-LytA Jesus Sanz 
Resistencia tumoral a múltiples fármacos. José A.Ferragut 
/Miguel Saceda 
Vacunas DNA frente a rhabdovirus y respuesta inmune asociada Amparo Estepa 
 
COMPETENCIAS A ALCANZAR POR LOS EGRESADOS 
Generales 
La Biología Molecular y Celular es un área multidisciplinar cuyo desarrollo 
se produce a un ritmo vertiginoso, por lo que es preciso dotar al alumno además 
de con la información más completa y actualizada en cada materia con una serie 
de competencias y perfiles que le permitan desarrollar de la manera mas eficaz 
posible sus futuras responsabilidades/tareas. Por ello, los alumnos que superen 
los estudios de formación asociados al Programa de Doctorado Biología Molecular 
y Celular habrán tambien adquirido capacidad para: 
-integrarse en grupos de trabajo y a comunicarse con los demás con el 
mayor rigor y precisión posibles. 
-el autoaprendizaje al que se verán obligados durante su ejercicio 
profesional ya que se les dotará del suficiente criterio científico para acceder a 
las fuentes de información y extraer, asimilar e interpretar correctamente los 
nuevos conocimientos. 
contrastar hipótesis de trabajo, resolver problemas y tomar decisiones 
sobre la base del planteamiento experimental más adecuado. 
-ejercer posiciones de liderazgo y en un fututro poder coordinar grupos de 
investigación 
-manejar técnicas instrumentales avanzadas en Biología Molecular y 
Celular asi como a aplicarlas a diferentes situaciones y a la resolución de 
problemas. 
Específicas 
El Periodo de Formación en Biología Molecular y Celular proporcionará la 
formación adecuada para el acceso al doctorado constituyendo por lo tanto la 
primera etapa de la carrera docente y/o investigadora para la incorporación a 
universidades o centros de investigación españoles o internacionales. 
Como expertos en cualquiera de las áreas de especialización, los alumnos 
que superen estos estudios habrán adquirido la formación adecuada para 
abordar problemas de expresión génica, cribado de moléculas con actividad 
biologica y análisis y resolución de estructura de proteínas, etc , así como para 
diseñar compuestos con nuevas propiedades/actividades terapeuticas. Habrán 
adquirido también destreza en técnicas instrumentales en Biología Molecular y 
Celular y determinación estructural, así como en el uso de programas de diseño, 
simulación y cálculos moleculares, y en el manejo de bases de datos. Serán, por 
lo tanto, excelentes candidatos para realizar una Tesis Doctoral e incorporarse 
posteriormente a organismos públicos/privados de investigación y a empresas de 
I+D. 
 
CONDICIONES DE ACCESO Y ADMISIÓN 
Acceso 
Para acceder al Programa de Doctorado Biología Molecular y Celular en su 
periodo de formación, será necesario cumplir las mismas condiciones que para 
el acceso a las enseñanzas oficiales de Máster indica el artículo 16 del REAL 
DECRETO 1393/2007 en lo referente a las características de los títulos 
universitarios españoles, del Espacio Europeo de Educación Superior o de 
sistemas educativos ajenos al Espacio Europeo de Educación Superior. En 
concreto, 
-Estar en posesión de un título universitario oficial español u otro 
expedido por una institución de educación superior del Espacio Europeo de 
Educación Superior que facultan en el país expedidor del título para el acceso a 
enseñanzas de Máster. 
-Igualmente, podrán acceder los/as titulados/as conforme a sistemas educativos 
ajenos al Espacio Europeo de Educación Superior sin necesidad de la 
homologación de sus títulos, previa comprobación por la Universidad de que 
aquéllos/as, acreditan un nivel de formación equivalente a los correspondientes 
títulos universitarios oficiales españoles y que facultan en el país expedidor del 
título para el acceso a enseñanzas de postgrado. El acceso por esta vía no 
implicará, en ningún caso, la homologación del título previo del que esté en 
posesión el/la interesado/a, ni su reconocimiento a otros efectos que el de cursar 
las enseñanzas de Doctorado. 
Admisión 
Para se admitidos en este Programa de Doctorado, los/as estudiantes 
tendrán que cumplir los requisitos y méritos que a continuación especifican. La 
admisión no implicará, en ningún caso, modificación alguna de los efectos 
académicos y, en su caso, profesionales que correspondan al título previo de que 
esté en posesión. 
En cualquier caso, se promoverá y facilitará la admisión de estudiantes con 
necesidades educativas específicas derivadas de discapacidad, con una 
adaptación del contenido curricular en caso necesario a través de la Comisión de 
Actividades Formativas del IBMC. Esta Comisión está constituida por el/la 
coordinador del Programa de Doctorado, el/la director/a del IBMC, dos 
profesores/as del Programa de Doctorado, un/a representante de la unidad 
administrativa de gestión de matrícula, y un/a representante de los/as 
estudiantes de doctorado. La citada Comisión será la responsable del proceso de 
Admisión de Estudiantes. 
Requisitos 
1.- Por la afinidad de sus contenidos con los del Programa de Doctorado 
Biología Molecular y Celular, estar en posesión del titulo de licenciado/a o futuros 
graduados/as en Bioquímica, Biotecnología, Biología, Farmacia, Medicina, Ciencia 
y Tecnología de los Alimentos, Ciencias Ambientales o Ingeniero Agrónomo 
superior. Con independencia de las titulaciones anteriormente referidas, la 
coordinación del programa podrá estudiar las propuestas de estudiantes 
procedentes de otras licenciaturas así como de Diplomaturas e Ingenieras 
técnicas de temática afín. En este caso, para cursar este Programa de Doctorado 
se requerirá la verificación de una serie de requisitos que permitan la adaptación 
del/a estudiante a la normativa vigente. Estos requisitos pueden suponer la 
necesidad de cursar una formación complementaria, de acuerdo con los criterios 
de la Universidad Miguel Hernández de Elche a propuesta de la Comisión de 
actividades formativas. 
2.-Se valorará en el proceso de admisión la adecuación de la titulación a las 
enseñanzas, nota media del expediente académico, realización previa de 
prácticas internas en Departamentos universitarios, etc. 
3.-Entrevista personal si procede. 
Se contempla la posibilidad de acceder al Programa de Doctorado Biología 
Molecular y Celular en su periodo de Investigación, siempre y cuando se cumpla 
además de los requisitos establecidos a la disposición adicional cuarta del 
RD1393/2007. Por tanto, podrán ser admitidos directamente al periodo 
investigador del este Programa de Doctorado aquellos estudiantes que estén en 
posesión de la suficiencia investigadora o del Diploma de Estudios Avanzados 
(DEA). 
 
METODOS, ACTIVIDADES Y RECURSOS 
Métodos de enseñanza-aprendizaje. 
Para culminar con éxito el proceso de enseñanza no existe un medio 
docente único, sino que deben emplearse un conjunto de medios 
complementarios de acuerdo con los distintos objetivos que se pretendan 
alcanzar y es el profesor quien basándose en su preparación científica y 
pedagógica y en su experiencia y responsabilidad profesional, debe elegir los 
medios más apropiados para cada situación concreta. Sin embargo, sea cual sea 
el método empleado es necesario un cambio de mentalidad e incluir en el 
concepto de educación además de el de enseñanza transmitida unicamente por 
el profesorel de l aprendizaje por el alumno (autoaprendizaje). 
En nuestro caso, el punto de partida es el reconocimiento del carácter 
científico de la Biología Molecular y Celular y por tanto, sus vertientes teórica y 
experimental que deben estar presentes y entenderse en su enseñanza como 
facetas ligadas y no aisladas. Por ello, se impartirán clases teóricas, de 
problemas, seminarios y prácticas de laboratorio. Además, teniendo en cuenta 
que se trata de enseñanzas superiores y que por lo tanto las limitaciones 
materiales y de espacio no deberían de existir, se plantea que clases teóricas y 
prácticas se impartan simultáneamente cuando sea necesario, lo que de manera 
clara facilitará al alumno la compresión global de los procesos biológicos 
estudiados. 
Independientemente de que se trate de enseñanzas teóricas o prácticas, se 
pretende que la docencia sea en parte PRESENCIAL, (impartida en el aula y en el 
laboratorio) y en parte VIRTUAL. 
Para desarrollar la docencia virtual se prepararán materiales propios 
(contenidos de las materias, esquemas de trabajo y actividades, foros de 
discusión, direcciones sobre portales de interés etc.) en la página Web del 
programa de doctorado (http://ibmc.umh.es/) que estarán a disposición de los 
alumnos mientras dure la docencia. Como uno de los objetivos fundamentales de 
la actividad virtual será fomentar el desarrollo del autoaprendizaje, entre este 
material se incluirá el planteamiento de problemas cuya solución necesitará de 
la búsqueda de información precisa, del desarrollo conceptual de los temas 
planteados, de la puesta en común de las ideas desarrolladas y del contraste de 
opiniones. Además, se promoverá el control del autoaprendizaje con 
ejercicios/test de autoevaluación que permitan al alumno la valoración de lo 
eficaz de su procedimiento individual de instrucción. Tanto las actividades 
propuestas periódicamente a los alumnos como los ejercicios de autoevaluación 
se irán alternando en la web según vaya avanzando el temario. 
En relación con la docencia virtual, hay que señalar que desde hace varios 
años, el IBMC está involucrado en la elaboración de programas informáticos 
interactivos de apoyo a la docencia en bioquímica (BIOROM, 
http://ibmc.umh.es/biorom2005/index.html). 
Atención del alumnado 
Sea cual sea el método utilizado, la comunicación profesor-alumno debe 
ser fluida y establecida como un servicio del primero al segundo, con información 
por ambas partes de la marcha del curso y sin olvidar nunca la responsabilidad 
social que tanto profesores como alumnos deben sentir para producir un trabajo 
bien hecho y digno de la confianza depositada en ellos. 
Entre los mecanismos de atención al alumnado que se articularán 
destacamos: 
-Tutorías, que proporcionan al alumno la posibilidad de una 
comunicación más directa y personalizada con su profesor. 
-Correo electrónico: es una herramienta muy útil y por ello al estudiante 
se le proporcionará una cuenta de correo electrónico desde el momento que es 
admitido como alumno del postgrado. Mediante correo electrónico se establecerá 
un sistema de tutorías on-line y se enviarán todos los mensajes personales que 
profesores y alumnos consideren oportunos. 
-Anuncios: Esta herramienta será complementaria y podrá ser usada 
cuando un comunicado del profesor para los alumnos deba llegarles de forma 
rápida, directa y efectiva. Ejemplos: cambios en la temporización de las sesiones 
de trabajo, convocatoria al laboratorio, publicación de actividades comunes, etc. 
-Chat: se pueden organizar sesiones concretas para desarrollar los 
contenidos de algún tema, hacer sesiones de evaluación conjunta, de revisión del 
ritmo del cronograma, etc. 
 
Internalización y Movilidad 
La adaptación española al Espacio Europeo de Educación Superior entre 
otras cosas pretende suprimir las limitaciones que ahora existen a la movilidad 
de alumnos y profesores y por ello la movilidad tiene que ser entendida como un 
componente de especial relevancia en los programas de doctorado. De esta 
manera conseguiremos la pretendida internacionalización de nuestro sistema de 
educación superior, la cooperación interuniversitaria conducente a una gestión de 
recursos más eficientes y la mejora de la oferta de formación especializada 
dirigida a investigadores y profesionales de la Comunidad Valenciana. 
A grandes rasgos, dentro del programa de doctorado Biología Molecular y 
Celular esta movilidad implicará entres otras actuaciones: 
-Estancias temporales más o menos largas de estudiantes y profesores 
españoles en otras univesidades o centros de investigación españoles y/o 
internacionales (preferentemente europeos). 
-Presencia de profesores y alumnos de instituciones distintas a la UMH en 
los programas de postgrado. 
Con este fin, el programa de doctorado Biología Molecular y Celular tiene ya 
firmado un convenio marco con la Universidad italiana de Catania (ver Anexo V) 
que permitirá ya este mismo bienio (2008/2010) el intercambio de estudiantes y 
profesores. Además, se está tramitando un convenio similar con la Universidad 
de Siena (ratificado por la UMH y pendiente de firma por la universidad de Siena) 
 
PROFESORADO. 
Los profesores del Programa de Doctorado Biología Molecular y Celular son 
profesores-investigadores del IBMC que poseen amplia y contrastada experiencia 
docente (en segundo y tercer ciclo) e investigadora (participación en proyectos 
de investigación financiados en convocatorias públicas, publicaciones recientes 
en revistas internacionales, dirección de Tesis Doctorales, tramos de 
investigación reconocidos, etc) lo que garantiza la calidad de la docencia, de la 
investigación y en su conjunto de la formación del alumno. De hecho, la 
idoneidad de este profesorado ya ha sido evaluada con resultados satisfactorios 
por la ANECA cuando se otorgó la mención de calidad a este programa de 
doctorado. 
Además de este profesorado, se considerará de capital importancia la 
participación puntualla docencia de nuestro programa de Doctorado de otros 
profesores y/o investigadores de esta Universidad o de otras universidades, 
centros públicos de investigación, hospitales o empresas. 
 
Tabla 3. Relación de profesores que participan en el Programa de 
Doctorado Biología Molecular y Celular 
 
Resumen 
 
 
 
PROCEDIMIENTOS DE EVALUACIÓN Y MEJORA 
En los últimos años se viene dedicando una importancia creciente al 
concepto de la "evaluación" como parte substancial del proceso de calidad de la 
enseñanza-aprendizaje. Esta evaluación debe de comptemplar no solo a los 
alumnos, sino tambien a los programas y a los propios profesores, bajo la 
pretensión de una mejora dinámica del proceso educativo. Un sistema riguroso 
de evaluación que asegure la calidad debe abarcar, al menos, los siguientes 
puntos de referencia: 
Profesor: Categoría profesional 
Tramos de 
investigación 
reconocidos 
Tramos 
docentes 
(quinquenios) 
JOSÉ MANUEL GONZALEZ-ROS Catedrático Universidad 5 6 
JOSE A. FERRAGUT RODRIGUEZ Catedrático Universidad 5 6 
JOSÉ VILLALAIN BOULLÓN Catedrático Universidad 4 5 
ANTONIO FERRER MONTIEL Catedrático Universidad 3 4 
AMPARO ESTEPA PEREZ Prof. Titular Universidad 3 3 
JOSE LUIS NEIRA FELEIRO Prof. Titular Universidad 3 3 
VICENTE MICOL MOLINA Prof. Titular Universidad 3 4 
CARMEN REYES MATEO MARTÍNEZ Prof. Titular Universidad 3 4 
JESUS SANZ MORALES Prof. Titular Universidad 3 3 
FRANCISCO JAVIER GÓMEZ PÉREZ Prof. Titular Universidad 3 4 
LUIS PEREZ GARCÍA-ESTAÑ Prof. Escuela Universitaria 2 2 
RICARDO MALLAVIA MARÍN Prof. Contratado Doctor. 
JOSÉ ANTONIO ENCINAR HIDALGO Prof. Contratado Doctor 
ASIA FERNÁNDEZ CARVAJAL Prof. Contratado Doctor 
GREGORIO FERNANDEZ BALLESTER Prof. Contratado Doctor 
MIGUEL SACEDA SÁNCHEZ Prof. Asociado 
Nº Total 
Profesores 
Categoría 
Profesional Tramos de investigación Tramos Docentes 
11 Funcionarios 
(69%)16 
5 no funcionarios 
(31%) 
37 
(3,4 tramos/prof. funcionario) 
44 
(4 tramos/prof. funcionario ) 
1.-Autoevaluación de la actuación docente en relación con el logro o eficacia 
de los objetivos propuestos, materiales y procedimientos empleados. Por ello y 
para arbitrar procedimientos que incidan en la mejora y actualización continua 
del Programa se propone la revisión periódica del catálogo de las cualificaciones 
y la formación modular asociada al mismo por la Comisión de Actividades 
Formativas del Instituto de Biología Molecular y Celular presidida por el director 
del mismo. Las funciones en materia de calidad de la Comisión de Actividades 
Formativas del IBMC estan recogidas en su reglamento de regimen interno. 
2.-Evaluación de la calidad teniendo en cuenta dos estudios de opinión: 
encuesta realizada a los estudiantes sobre su calidad percibida, y encuesta 
realizada a los profesores que imparten el Programa de Doctorado. El estudio 
sobre la calidad percibida de los estudiantes y profesores a propósito de cada 
Programa de Doctorado se realiza por la UMH. Para conocer la estructura modelo 
de e estas encuestas de opinión consultar el Anexo VI. 
3.-Evaluación institucional que incluya la adecuación, eficacia y actualización 
de los programas. Certificación ISO 9001 que la UMH posee respecto de la 
elaboración de los planes de estudio y que implica que la ANECA realizará para 
cada ciclo de estudios una evaluación de los métodos y resultados docentes.
 
ANEXO I 
 
 
DESCRIPCIÓN Y CONTENIDOS DE LAS MATERIAS DE LA 
ETAPA DOCENTE DEL PROGRAMA DE DOCTORADO 
BIOLOGÍA MOLECULAR Y CELULAR 
 
 
 
 
 
TÍTULO ANÁLISIS DE BASES DE DATOS BIOLÓGICOS 
CRÉDITOS 3 HORAS 75 
TIPO 
1 OBLIGATORIA/OPTATIVA OPTATIVA 
PROFESOR RESPONSABLE GREGORIO J. FERNÁNDEZ BALLESTER NIF 27431043-R 
CRÉDITOS QUE IMPARTE 2 
DEPARTAMENTO 
INSTITUTO DE BIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR 
 
 
 
PROFESORES COLABORADORES 
 
PROFESOR DR. JOSÉ ANTONIO ENCINAR HIDALGO NIF 6564821-T 
CRÉDITOS QUE 
IMPARTE 
1 DEPARTAMENTO 
INSTITUTO DE BIOLOGIA MOLECULAR Y 
CELULAR 
 
 TAREAS COLABORACIÓN EN LOS TEMAS 1-2 Y EN LA PARTE PRÁCTICA 
 
Descripción de la asignatura 
Actualmente, una de las dificultades más importantes que afrontamos en Biología 
proviene, paradójicamente, de la enorme cantidad de datos de que disponemos: 
conocemos la secuencia de más de un millón y medio de proteínas y de más de 
100 genomas, la estructura tridimensional de más de 20.000 proteínas, sabemos 
cómo y cuándo se expresan los genes y también disponemos de muchos datos 
que indican qué proteínas interaccionan entre sí. El reto es ser capaces de 
relacionar todos estos datos, extraer conocimiento de ellos, comprender la 
Biología de los organismo, etc. La Bioinformática es el área de la Biología donde 
intentamos aplicar métodos computacionales para analizar toda esta 
información. Esta disciplina tiene un papel protagonista por dos razones: por una 
parte la enorme cantidad de datos disponibles solo puede ser analizada utilizando 
ordenadores; por otra, los datos son complejos y la información solo puede 
extraerse utilizando complejos algoritmos computacionales. Los computadores se 
han convertido, por tanto, en un componente esencial en la biología moderna 
puesto que ayudan a manejar el creciente conjunto de datos biológicos y a 
establecer nuevas relaciones entre ellos. Esta aproximación a la Biología "in 
silico" ha ayudado a hacer posible la actual revolución de las ciencias biológicas 
modernas. 
Esta asignatura se ha concebido como una parte de la Biología Molecular que 
trata de asumir el reto de abordar el análisis del Genoma y del Proteoma 
mediante el uso de las técnicas informáticas útiles disponibles hasta el momento. 
 
Objetivos fundamentales de la asignatura en el contexto del curso 
El objetivo fundamental es la adquisición por parte de los alumnos de habilidades 
bioinformáticas para que sean autosuficientes en el manejo, exploración y uso de 
aplicaciones y utilidades independientes de una manera productiva. 
Podemos distinguir principalmente dos perfiles de bioinformático: el que usa los 
métodos computacionales para resolver problemas y el que desarrolla dichos 
métodos. Teniendo en cuenta la formación previa en Biología de los futuros 
alumnos, es pretensión de este curso formarlos en el uso de las herramientas 
más que en su desarrollo. 
En esta asignatura se pretenden abordar los siguientes aspectos: a) aspectos 
básicos de búsqueda de información biológica en Internet; b) bases de datos 
biológicas, incluyendo las bases de datos primarias, secundarias y compuestas; 
c) análisis de secuencias, proporcionando una amplia colección de programas 
guía que nos resuelven la mayoría de tareas básicas en informática, como la 
similaridad de secuencia, alineamientos múltiples, análisis filogenéticos, etc., y d) 
nociones de modelado molecular y determinación teórica de la energía. 
 
Objetivos concretos 
1.- Habilidades de acceso y búsqueda de información en las bases de datos en la 
librería virtual, desde secuencias de DNA de cualquier organismo hasta la última 
bibliografía publicada. 
2.- Capacidad de solucionar problemas de biología computacional, como 
identificación y caracterización de proteínas, búsquedas por similaridad, 
búsqueda de patrones y perfiles, modificaciones post-traduccionales, predicción 
de topología, análisis de estructura primaria y secundaria de proteínas, 
alineamiento de secuencias, etc. mediante las aplicaciones ofertadas en el “world 
wide web” o las prestaciones bioinformáticas ofertadas localmente por las 
Universidades, empresas o centros de investigación donde se desarrolle la 
actividad. 
3.- Modelado de proteínas mediante homología y evaluación de energía. 
Ampliación y ejemplos de proteínas de membrana y aplicación de las técnicas de 
dinámica molecular para resolución de problemas conformacionales de las 
proteínas y de los lípidos. 
4.- Capacidad de identificar problemas aún no resueltos que podrían mejorar, 
ampliar, diversificar y simplificar el trabajo de bioinformática. 
 
Contenidos 
Tema 1. Bioinformática e Internet. Gestión y análisis de datos biológicos. 
Herramientas: INTERNET, TCP/IP, FTP, SSH, WWW, HTTP, HTML, URL. Red 
Europea de Biologia Molecular EMBNet. Centro Nacional para la información 
biotecnologica (NCBI). Bases de datos bibliograficas, taxonomicas, nucleotidicas, 
genomicas, proteinicas, microarray. (3 h) 
Tema 2. Recursos de Información sobre Genomas. Bases de datos de secuencias 
de DNA: EMBL, DDBJ, GenBank, dbEST, GSDB. Recursos genómicos 
especializados: SGD, UniGene, TDB, AceDB. (2 h) 
Tema 3. Análisis de Secuencias de DNA. Estructura génica y secuencias de DNA. 
Traducción conceptual. Detección de pautas abiertas de lectura. Intrones y 
exones. Interpretación de las búsquedas de EST. Captura de genes: clonación 
posicional y análisis de RNA transcritos. Perfil de expresión de una célula. 
Genotecas de cDNA y EST. Enfoques para el análisis de EST. (8 h) 
Tema 4. Recursos de Información sobre Proteínas. Bases de datos primarias de 
secuencias (PIR, MIPS, SWISS-PROT, TrEMBL, NRL-3D). Bases de datos 
compuestas (NRDB, OWL, MIPSX, SWISS-PROT+TrEMBL) Bases de datos 
secundarias (Prosite, Prints, Blocks, Pfam, Identify). Base de datos compuestas 
de patrones proteicos (SCOP, CATH, PDBsum). (2 h) 
Tema 5. Análisis de Secuencias de Proteínas. Expresiones regulares. Expresiones 
regulares difusas. Huellas (fingerprints). Bloques y perfiles. Modelos de Markov 
ocultos. Alineamiento de Pares de Secuencias y Secuencias Múltiples. 
Alineamiento global y alineamiento local de dos secuencias. Identidad y similitud. 
Homología y analogía. Ortología y paralogía. El problema del alineamiento 
múltiple: CLUSTALW. Búsquedas en bases de datos con alineamientos múltiples. 
(10 h) 
Tema 6. Predicción de Estructura de Proteínas. Predicción de estructura mediante 
homología. Agrupamiento de estructuras para el modelado. Modeladopor 
homología. Adición de ligandos. Refinamiento de complejos. Búsqueda en el 
espacio de secuencias. Predicción de interacciones proteína-proteína. Búsqueda 
de interacciones en el genoma. Determinación teórica de la energía. Modelado de 
proteínas de membrana. Dinámica molecular (10 h) 
 
Metodología de enseñanza y aprendizaje 
Se impartirán clases de 90 min para la presentación de los conceptos más 
importantes y relevantes para el área, hasta un total de 35h. Las clases se 
combinaran con aplicaciones practicas reales que ayuden al alumno a 
comprender la utilidad de los conceptosa adquiridos y a desarrollar habilidades 
en el uso de los programas bioinformaticos (duracion 30h). Adicionalmente los 
alumnos deberan analizar y discutir un artículo de investigacion relacionado con 
las aplicaciones biocomputacionales estudiadas (10 h) 
Asi pues, la metodología docente supone la explicación por parte del Profesor de 
los conceptos básicos, en clases de corta duración y la aplicación de los 
conocimientos adquiridos usando programas informáticos y acceso a Internet en 
los ordenadores del aula de Informática de Bioquímica y los servidores del 
Instituto de Biología Molecular y Celular localizados en la Unidad de 
Biocomputación Estructural. 
 
Criterios y procedimientos de evaluación 
El 60% de la puntuación se basará en una evaluación continuada, puesto que las 
clases se impartirán delante de los equipos a utilizar y el profesor juzgará la 
destreza y la capacidad de aprendizaje por parte de los alumnos después de ser 
instruidos. El 40% restante será la nota obtenida de un proyecto de investigación 
a realizar por el alumno que consistirá en la resolución de un problema planteado 
por el profesor sobre la localización, análisis y clasificación de secuencias 
proteicas propuestas. 
 
Bibliografía 
- BIOINFORMATICS. A practical guide to the analysis of genes and proteins. 
Baxevanis, A.D. & Ouellette, B.F.F. 2001. Ed. John Wiley and Sons. 
- INTRODUCCIÓN A LA BIOINFORMÁTICA. Attwoot, T.K. & Parry-Smith, D.J. 
2002. Ed. Prentice Hall. 
- STRUCTURAL BIOINFORMATICS. Bourne, P.E. & Weissig, H. 2003. Wiley-Liss. 
New Jersey. 
- AN INTRODUCTION TO COMPUTATIONAL BIOCHEMISTRY. Tsai, C.S. 2002. 
Wiley-Liss, Inc. New York 
- INTRODUCTION TO BIOINFORMATICS (2nd edition). Lesk, A.M. 2005. Oxford 
University Press. New York. 
- COMPUTATIONAL BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS. Becker, O.M., MacKerell, 
A.D.Jr, Roux, B & Watanabe, M. (EDS) 2001. MARCEL DEKKER, INC. NEW YORK. 
- BIOINFORMATICS FOR DUMMIES (2nd edition). Claverie, J.M. & Notredame, C. 
2007. Wiley Publishing, Inc. Indianapolis. 
- DATA MINING. Multimedia, Soft Computing and Bioinformatics. Mitra, S & 
Acharya, T. 2003. John Willey and Sons Inc. New Jersey. 
- CURRENT PROTOCOLS IN BIOINFORMATICS. Bexavanis, A.D., Davison, D.B., et 
al. 2002. John Wiley and Sons, Inc. 
 
TÍTULO APROXIMACIÓN EXPERIMENTAL A LA EXPRESIÓN GENICA EN 
EUCARIOTAS Y SUS APLICACIONES BIOMEDICAS 
CRÉDITOS 1 HORAS 75 
PROFESOR 
RESPONSABLE 
ANTONIO VICENTE FERRER MONTIEL NIF 25120193 
CRÉDITOS QUE IMPARTE 1 
DEPARTAMENTO INSTITUTO DE BIOLOGÍA MOLECULAR Y CELULAR 
PROFESORES COLABORADORES 
PROFESOR MIGUEL SACEDA SÁNCHEZ 
CRÉDITOS QUE IMPARTE 2 DEPARTAMENTO BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA 
MOLECULAR 
 
 
Descripción de la asignatura 
El curso pretende exponer al alumno a las diversas situaciones, los diversos 
problemas y las aproximaciones experimentales que se utilizan para el 
estudio de la regulación de la expresión génica en eucariotas, familiarizándole 
con las ventajas y limitaciones de cada una de las técnicas, con la 
interpretación de los resultados obtenidos y con el diseño de un plan 
metódico de trabajo experimental que le conduzca desde la constatación de 
un cambio en la expresión de un gen a la disección de los mecanismos 
moleculares responsables de este cambio de la expresión génica. 
Un segundo aspecto es familiarizar al alumno con las técnicas más actuales 
que permiten abordar el estudio de la expresión génica diferencial, es decir 
situaciones en las que sabemos que se han producido cambios en la 
expresión génica, pero desconocemos la identidad de los genes afectados. 
Pretendemos que el alumno conozca las técnicas que permiten poner de 
manifiesto esta expresión génica diferencial y como abordar la identificación 
de los genes diferencialmente expresados. 
Por último mostraremos las aplicaciones prácticas de lo aprendido 
centrándolas en como los resultados obtenidos por estas técnicas permiten 
identificar nuevas dianas terapéuticas, nuevos marcadores tumorales etc. 
 
Objetivos fundamentales de la asignatura en el contexto del curso 
1. Profundizar en los acontecimientos que a nivel molecular, regulan la 
expresión génica en las células eucariotas. 
2. Familiarizar al alumno con las técnicas y el diseño experimental 
utilizados para el estudio de la expresión génica en eucariotas. 
3. Familiarizar al alumno con las técnicas y el diseño experimental 
utilizados para el estudio de la expresión génica diferencial en eucariotas. 
4. Plantear al alumno las particularidades de los diferentes niveles de 
regulación de la expresión génica en eucariotas, tales como la regulación 
transcripcional, postranscripcional, traduccional etc. 
5. Mostrar al alumno, mediante ejemplos reales en el ámbito de la 
Biomedicina, como la información obtenida con estas técnicas es utilizada en 
diferentes áreas de investigación para la mejora del diagnóstico y tratamiento 
de las enfermedades. 
 
Objetivos concretos 
El alumno habrá de ser capaz de: 
1.- Diseñar una aproximación experimental que le permita determinar a qué 
nivel se está produciendo la regulación de la expresión de un gen, 
transcripcional, postranscripcional, traduccional ect. 
2.- Diseñar aproximaciones experimentales para profundizar en el estudio de 
una regulación génica en cualquier nivel de los mencionados en el primer 
objetivo. Por ejemplo como identificar secuencias en el promotor de un gen 
responsables de una regulación transcripcional ect. 
3.- Comentar críticamente literatura científica que describa mecanismos de 
regulación de la expresión génica. 
4.- Interpretar geles, autoradiografias y demás datos de laboratorio 
relacionados con los temas de la asinatura. 
5.- Conocer ejemplos en todos los diferentes niveles de regulación de la 
expresión génica, transcripcional, postranscripcional, traduccional etc, y su 
participación en los estados patológicos. 
 
Contenidos 
Tema 1. Justificación de la asignatura. La compartimentalización de los 
eucariotas permite niveles de regulación distintos del transcripcional. (1 hora) 
Tema 2. Elaboración de un sistema de detección simultánea de los niveles de 
expresión de proteína, mRNA y tasa de transcripción que permita determinar 
si la regulación estudiada constituye un fenómeno transcripcional o 
postranscripcional. Objetivo: Familiarizar al alumno con las posibilidades que 
la combinación de diversas técnicas ya conocidos ofrece en el campo de la 
regulación transcripcional y postranscripcional en eucariotas. Se introducirán 
técnicas específicas propias de la asignatura; por ejemplo, la transcripción ¿in 
vitro¿ usando núcleos aislados, o nuclear run on. (3 horas) 
Tema 3. Aproximación a la regulación transcripcional en eucariotas. El DNA 
como integrante de la cromatina. Modificaciones de la cromatina y 
transcripción: Complejos que utilizan la hidrólisis del ATP para remodelar la 
cromatina. Complejos que modifican postraduccionalmente las histonas. (2 
horas) 
Tema 4. Modificaciones del DNA en eucariotas asociadas con el silenciamiento 
transcripcional. Metilación de islas CpG. (1 hora) 
Tema 5. Consecuencias de la regulación epigénetica de la expresión génica. 
Los inhibidores de las desacetilasas de histonas y los inhibidores de las 
metiltransferasas como fármacos antineoplásicos. (2 hora) 
Tema 6. Disección experimental de un efecto transcripcional. Objetivo: 
Enseñar al alumno a definir una estrategia experimentalque le permita 
determinar tanto las secuencias en un determinado promotor como los 
factores de transcripción que reconocen dichas secuencias y que están 
mediando el efecto transcripcional objeto de estudio. El alumno utilizará e 
interpretará los datos obtenidos con las técnicas habituales que conoce, tales 
como transfecciones transitorias con genes reporteros, retardación en gel etc, 
y las combinará con los resultados obtenidos con técnicas específicas tales 
como, ¿in vivo¿ footprinting directo o en combinación con técnicas de PCR, 
inmunoprecipitación de cromatina etc. (4 horas) 
Tema 7. Procesamiento del RNA. El procesamiento de los RNAs como nivel de 
regulación postranscripcional. Ejemplos de regulación por ¿Splicing 
alternativo¿. Ejemplos de regulación por utilización alternativa de señales 
poly A. (1 hora) 
Tema 8. El procesamiento del RNA y la transcripción suceden 
simultáneamente. Participación de la CTD de la RNA polimerasa II en la 
integración de ambos fenómenos. (1 hora) 
Tema 9. Transporte de los RNAm. El transporte como nivel de regulación 
postranscripcional. Ejemplos de localización especifica de RNAm. Ejemplos de 
regulación por acumulación nuclear de RNAm. (1 hora) 
Tema 10. Regulación de los RNAm a nivel de estabilidad. Ejemplos de control 
de calidad del RNAm en el núcleo. Estabilidad del RNAm asociada a 
secuencias en la 3'-UTR. Otros modelos de regulación a nivel de la estabilidad 
del RNAm. (2 horas). 
Tema 11. Regulación traduccional en eucariotas. Regulación mediada por 
secuencias en la 5'-UTR. Regulación mediada por secuencias en la 3'-UTR. 
IRES y otros elementos de regulación. (2 horas) 
Tema 12. Disección experimental de efectos postranscripcionales. Objetivo: 
Enseñar al alumno a definir, dentro de los efectos postranscripcionales, si 
estos ocurren a nivel del procesamiento, transporte, estabilidad de RNAm, 
efectos traduccionales o postraduccionales. Una vez determinado el nivel de 
regulación, se diseñará una estrategia experimental que les permita 
profundizar en los mismos, de nuevo se utilizará la combinación de técnicas 
básicas con otras más específicas de la asignatura como, (5 horas) 
Tema 13. Coexistencia entre regulación a nivel transcripcional y post-
transcripcional. Ejemplos de regulaciones a distintos niveles. (1 hora). 
Tema14. Ejemplos de la importancia Biomédica de la regulación 
postranscripcional. Los microRNAs y su implicación en la metastasis tumoral. 
(2 horas) 
Tema 15. Técnicas de estudio de la expresión génica diferencial: Differential 
display, Serial analysis of gene expresión (SAGE), otras aproximaciones (DNA 
microarrays). (4 horas) 
Tema 16. Aplicaciones prácticas: Marcadores tumorales, nuevas dianas 
terapéuticas, factores pronóstico, otras aplicaciones. (3 horas). 
 
Metodología de enseñanza y aprendizaje 
La explicación de cada uno de los temas, abarca tres aspectos: En primer 
lugar, se hace una introducción teórica acerca de los mecanismos de 
regulación abordados en el tema (por ejemplo, control transcripcional, 
estabilidad del ARN mensajero, etc). En segundo lugar, se explican en detalle 
las técnicas de laboratorio utilizadas para el estudio de cada uno de los 
mecanismos previamente introducidos, haciendo hincapié en confrontar al 
alumno con los datos reales obtenidos en el laboratorio (utilización de geles 
originales, datos de RT-PCR cuantitativa, etc), enseñándole como 
interpretarlos. Por último, se presenta un trabajo de investigación 
relacionado con el tema y las técnicas explicadas, bien extraído de la 
literatura o, en muchos casos, procedente de trabajos realizados por el 
profesorado. Se entregan al alumno artículos científicos y/o datos 
experimentales con casos paralelos a los estudiados y se le insta a leerlos, 
interpretarlos y elaborar sus propias conclusiones que comentarán con los 
profesores, en tutorías y seminarios programados, favoreciendo la interacción 
alumno-profesor bien presencialmente o a través del correo electrónico. 
La asignatura consta de 35 horas lectivas, a las que sumar 20 horas de 
trabajo alumno-profesor que incluye el tiempo de preparación por parte del 
alumno de los supuestos planteados al final de cada tema y su resolución 
conjunta con los profesores en los 3 seminarios programados al final de cada 
grupo de cinco temas y las tutorias presenciales o a través del correo 
electrónico, finalmente el alumno requerirá otras 20 horas para la selección, 
estudio y preparación del artículo científico que presentará públicamente para 
su evaluación, se incluye en este tiempo el destinado a escuchar y debatir los 
artículos presentados por el resto de los alumnos. 
 
Criterios y procedimientos de evaluación 
La evaluación consistirá en 
Presentación de un artículo de investigación. Se valorarán los aspectos 
relacionados con: oportunidad de la elección del artículo en relación a los 
objetivos de la asignatura, comprensión del diseño experimental y la 
metodología utilizada por los autores, capacidad analítica y crítica, etc. 
Valoración de la capacidad analítica y crítica demostrada en las 
presentaciones de los trabajos seleccionados por sus compañeros. 
Se valorará la aptitud mostrada por el alumno en el análisis de los 
supuestos entregados para las seminarios.. 
 
Bibliografía 
La bibliografía fundamental del curso la constituyen revisiones y artículos 
científicos de cada uno de los bloques temáticos que se seleccionaran en el 
momento de impartir el curso para asegurar su máxima actualidad y 
novedad. Algunas de las revisiones utilizadas en el presente curso son: 
- Nilsen TW. “ Mechanisms of microRNA-mediated gene regulation in 
animal cells”. Trends Genet. 23(5):243-9, (2007). 
- Ma L, Weinberg RA. “ Micromanagers of malignancy: role of microRNAs 
regulating metastasis. Trends Genet (Epub ahead of print). (2008) 
- Esteller M. “ Cancer epigenomics: DNA methylomes and histone-
modification map”. Nat Rev Genet: 8(4): 286-98, (2007). 
- Sunnerhagen P. “ Cytoplasmic post-transcriptional regulation and 
intracellular signalling”. Mol Genet Genomics 277(4): 341-55, (2007) 
- Li B, Carey M, Workman JL. “ The role of chromatin during 
transcription”. Cell 128(4): 707-19, (2007). 
- Coe BP, Lam WL. Evolving strategies for global gene expresión análisis 
of cancer. J. Cell. Physiol. (Epub ahead of print). (2008) 
Como bibliografía básica sobre técnicas de Biología Molecular se ha utilizado: 
- Current Protocols in Molecular Biology editado por Wiley Interscience 
(un manual que se actualiza constantemente con nuevas técnicas y 
variaciones en los protocolos). 
 
 
TÍTULO AVANCES EN INMUNOLOGÍA MOLECULAR Y CELULAR 
CRÉDITOS 3 HORAS 75 
 
 
PROFESOR RESPONSABLE Mª AMPARO ESTEPA NIF 50053216H 
DEPARTAMENTO 
INSTITUTO DE BIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR 
 
Descripción de la asignatura 
Con esta asignatura se pretende dar al alumno una visión actualizada de los 
temas más novedosos que están siendo objeto de intensa investigación en estos 
momentos en el campo de la inmunología molecular y celular. Dado que la 
investigación en este campo avanza vertiginosamente, y que es imposible tratar 
en un curso todos los temas de actualidad, se plantea la asignatura en forma de 
módulos independientes que puedan ser sustituidos, si procede, en próximos 
cursos por otros más actuales o de mayor relevancia en ese momento. Cada uno 
de los bloques de conocimiento, además de las clases magistrales, incluirá la 
discusión de artículos científicos y la impartición de seminarios de investigación 
por científicos especialistas, así como por los propios alumnos 
 
Objetivos fundamentales de la asignatura en el contexto del curso 
Dar una visión actualizada de los temas de investigación más novedosos en 
inmunología y del porque se investiga en ellos, al mismo tiempo que de las 
posibles aplicaciones de los resultados obtenidos en la biomedicina. Además, 
transmitir los conocimientos de la disciplina para que cualquier alumno que la 
curse pueda luego acometer con mas garantíade éxito cualquier línea de 
investigación que de alguna manera se necesite de estos conocimientos 
 
Objetivos concretos 
-Consolidar los conocimientos básicos de inmunología. 
-Puntualizar en temas específicos que no tienen cabida en el programa general 
de inmunología de una licenciatura. 
-Enseñar a los alumnos la metodología a seguir en este tipo de investigaciones. 
-Fomentar el espíritu crítico mediante la discusión de artículos de investigación 
relevantes. 
-Poner en contacto a los alumnos con investigadores de relevado prestigio 
internacional. 
 
Contenidos 
Temas DURACIÓN 5-5,30 h/bloque temático 
 
BLOQUE I: La respuesta inmune, un breve repaso: Inmunidad innata e 
Inmunidad adaptativa. Mediadores de la inmunidad. Inmunopatología. 
BLOQUE II: Células T: Base molecular la actividad de las célula T y 
reconocimiento del antígeno inmune. El receptor de la células T (TCR). Estructura 
del TCR. El complejo CD3. TCR αβ. TCRγδ. Motivos ITAM. Genes del TCR. 
BLOQUE III: Receptores de células NK : Función citotóxica de las células NK 
Función secretora de las células NK. Receptores activadores de células NK 
(Receptores CD16 y de citotoxicidad natural). Receptores NK específicos de 
antígenos HLA (Receptores NK tipos KIR, ILT y lectina). Receptores NK de 
moléculas HLA en otras células Transduccion de señales (Mecanismos de 
inhibición y activación). Activacion NK y respuesta inmune innata. 
Inmunopatologia de las células NK. 
BLOQUE IV: Nuevas estrategias para el desarrollo de vacunas: Vacunas DNA. 
Utlizacion de moleculas relacionadas con la respuesta inmune innata (citocinas y 
agonistas de los TRLs) como adjuvantes moleculares de vacunación. 
BLOQUE V: La respuesta inmune y cáncer: Antígenos Tumorales. Mecanismos de 
evasión tumoral. Inmunoterapia frente al cáncer 
BLOQUE VI:.Estado actual de las investigaciones sobre xenotrasplantes de 
órganos sólidos: Rechazo hiperagudo. Rechazo vascular agudo retardado 
Rechazo celular y crónico. Compatibilidad fisiológica de órganos porcinos 
transgénicos trasplantados. Xeozoonosis. 
BLOQUE VII: Genómica funcional en el sistema inmune. “El Linfochip”. Expresión 
génica diferencial durante la diferenciación de los linfocitos Bs. Tipaje de linfomas 
Bs utilizando patrones de expresión génica. Aplicaciones en el diagnóstico del 
cáncer. Análisis de la expresión génica diferencial de mediadores de la inmunidad 
durante el transcurso de una infección vírica utilizando como modelo 
citomegalovirus humanos. 
 
Metodología de enseñanza y aprendizaje 
Se impartirán clases de 90 min hasta un total de 40h, Al final de cada boque 
temático se organizará un seminario para la discusión de los trabajos más 
relevantes. Todos los alumnos deberán leer los trabajos seleccionados antes de 
cada seminario y se pedirá a un alumno cada vez que exponga uno de los 
artículos seleccionados. El profesor a cargo del seminario moderará y dirigirá la 
discusión. Se dedicaran 35 h a los seminarios (incluidas las tutorias 
personalizadas para ayudar a la comprensión de los artículos a leer, asistencia a 
las sesiones de seminarios y preparación del proyecto) 
 
 
Criterios y procedimientos de evaluación 
El rendimiento de los estudiantes se evaluará de forma continua durante todo 
curso. Además, para la evaluación final será necesario presentar un proyecto de 
investigación versado en uno de los bloques temáticos impartidos durante el 
curso. 
 
El proyecto constará de los siguientes apartados: 
-Resumen de la propuesta (debe de rellenarse en español y en inglés). 
-Introducción (debe de reflejar los antecedentes y estado actual del tema). 
-Referencias (> 50% de una antigüedad igual o menor a tres-cuatro años). 
-Hipótesis de partida, objetivos y resultados esperados del desarrollo del 
proyecto. 
-Metodología y plan de trabajo (no es necesario describir las técnicas de 
manera muy detallada pero si razonar por qué se emplean esas y no otras). 
 
Bibliografía 
-K. Abbas and A. H. Lichtman. March 2005. Cellular and Molecular Immunology, 
Update Edition, 5th edition. Editorial Elsevier. ISBN:0-80892-341-2 
-K. Abbas, A. H. Lichtman y J. S. Pober. 2002. Inmunología Celular y Molecular. 
(5ª Ed.) Editorial Elsevier España, S.A.. ISBN: 8481747106 
-Regueiro, J. R. Y Lopez Larrea, C. 2003. Inmunología Biología y patología del 
sistema inmune (2 Ed.). Editorial Panamericana. ISBN: 84-7903-707-5 
-Roitt I y Delves, P.J. 2003. Inmunología, Fundamentos. (10 Ed.). Editorial 
Médica panamericana. 
-C.A. Janeway, P. Travers, M- Walport y J.D. Capra Inmunobiología.2003. El 
sistema inmunitario en condiciones de salud y enfermedad. (2 Ed.). Editorial 
Masson 
-M. Sánchez Pérez. Inmunología aplicada y técnicas inmunológicas. 
1998.Editorial Síntesis 
-Revisiones de cada uno de los bloques temáticos que se seleccionarán en el 
momento de impartir el curso para asegurar su máxima actualidad y novedad. 
 
 
TÍTULO INGENIERIA DE PROTEINAS 
CRÉDITOS 3 HORAS 75 
PROFESOR RESPONSABLE JESÚS MIGUEL SANZ MORALES NIF 50816247R 
CRÉDITOS QUE IMPARTE 1 
DEPARTAMENTO INSTITUTO DE BIOLOGÍA MOLECULAR Y CELULAR 
 
PROFESORES COLABORADORES 
PROFESOR JOSÉ L. NEIRA NIF 50432297J 
CRÉDITOS QUE 
IMPARTE 
1 DEPARTAMENTO INSTITUTO DE BIOLOGÍA MOLECULAR 
Y CELULAR 
 
TAREAS COLABORACION EN EL BLOQUE TEMATICO "INGENIERIA DEL 
PLEGAMIENTO", EN EL BLOQUE TEMATICO PRACTICO Y EN EL 
BLOQUE DE EVALUACION 
 
PROFESOR GREGORIO FERNÁNDEZ BALLESTER 
CRÉDITOS QUE IMPARTE 1 DEPARTAMENTO INSTITUTO DE BIOLOGÍA MOLECULAR 
Y CELULAR 
 
TAREAS COLABORACION EN EL BLOQUE TEMATICO "INGENIERIA DE LA 
INTERACCION PROTEINA-LIGANDO" , EN EL BLOQUE TEMATICO 
PRACTICO Y EN EL BLOQUE DE EVALUACION. 
 
Descripción y justificación de la asignatura 
La capacidad para poder diseñar de forma precisa nuevos péptidos, proteínas 
o en general fármacos que sean biológicamente activos encierra un 
formidable potencial tanto en Biomedicina como en industria. Si bien los 
conocimientos actuales no permiten todavía diseñar inequívocamente una 
proteína de novo, si permiten rediseñar proteínas existentes para mejorar su 
solubilidad, disminuir su tamaño, modificar sitios de unión a metales, 
manipular las interacciones proteína-proteína, cambiar la actividad 
enzimática, estudiar sus rutas de plegamiento, etc... En esta asignatura se 
muestran los más recientes avances (teóricos y experimentales) en este 
campo y se instruye al alumno en el manejo de potentes programas 
informáticos que se utilizan habitualmente para estas tareas. 
 
Objetivos fundamentales de la asignatura en el contexto del curso 
El objetivo principal de esta asignatura es que el alumno conozca las lineas 
punteras de la investigación actual sobre la ingeniería de proteínas y sus 
posibilidades. Las aplicaciones de los contenidos de la asignatura entroncan 
directamente con la mayoría de las asignaturas del Curso de Doctorado. 
 
Objetivos concretos 
1.- Conocer los procedimientos usuales de la ingenieria de proteínas y su 
base teorica. 
2.- Estudiar la aplicacion de la ingenieria de proteinas para la modificacion de 
la estabilidad, plegamiento y función de estas macromoléculas. 
3.- Analizar de manera critica los resultados que se desprenden del apartado 
anterior. 
4.- Proporcionar una base suficiente para que el alumno sea capaz de 
enfrentarse en el futuro a un problema de diseño de proteinas. 
 
Contenidos 
Bloque temático: Ingeniería de la estructura. (0,5 créditos) 
 
1.- Introducción: Necesidad de la Ingeniería de proteínas. Tipos de diseño. 
2.- Diseño de novo de estructuras secundarias: Teoría y termodinámica de la 
formación de estructura secundaria. 
3.- Ingeniería de la estabilidad de proteínas. Cálculo de la energética de 
plegamiento: Contribución de las diversas fuerzas al plegamiento. 
Procedimientos experimentales. 
4.- Diseño semirracional de miniproteinas: Ventajas de las miniproteínas. 
Técnicas de minimización. 
5.- Armazones proteicoscomo soportes rígidos de oligopéptidos. Restricción 
de la libertad conformacional de péptidos. Aplicaciones biotecnológicas. 
6.- Ingeniería de proteínas de membrana. Métodos actuales de expresión y 
purificación. El problema de la solubilidad. Reconstitución. 
 
Bloque temático: Ingeniería de la función enzimática. (0,4 créditos) 
 
7.- Creación de sitios de unión de metales. Ingeniería de la regulación de 
enzimas por medio de metales. 
8.- Modificación de los centros activos. Cambio en la especificidad de sustrato 
mediante evolución dirigida (mutagénesis al azar seguida de selección). 
 
Bloque temático: Ingenieria del plegamiento de proteínas (0,5 créditos) 
 
9.- Bases fundamentales de la aplicación de la ingeniería de proteínas a la 
elucidación de la ruta cinética del plegamiento de proteínas. Aplicación a 
proteinas monoméricas y oligoméricas. Modelos teóricos de plegamiento y 
confirmación experimental. Análisis-φ. Intermedios de plegamiento. 
 
Bloque temático: Ingeniería de la interacción proteína-ligando (0,5 créditos) 
 
10.- Modelado de la estructura de proteínas por homología. Significado de la 
similitud de secuencia. Métodos bioinformáticos. Minimización de energía de 
las estructuras finales. 
11.- Diseño computacional de ligandos basado en estructura. Técnicas de 
"docking" y refinamiento de los complejos obtenidos. 
 
Bloque temático práctico (0,6 créditos) 
 
12.- Modelado de la estructura de una proteína por homología. Cálculo 
computacional de su energética. Análisis de la interacción con ligandos. Se 
suministra una secuencia al alumno, a partir de la cual debe obtener un 
modelo de su estructura y de la interacción con ligandos. 
13.- Cinética de plegamiento de una proteína. Seguimiento del 
plegamiento/desplegamiento de una proteína por agentes químicos mediante 
técnicas de flujo detenido ("stopped-flow"). 
 
 
Bloque de evaluación: Exposición pública de los trabajos de los alumnos (0,5 
créditos). 
 
Metodología de enseñanza y aprendizaje 
El curso se impartirá siguiendo el orden mostrado en el apartado anterior. 
 
Las tareas dirigidas (40% de las horas) se estructuran de la siguiente forma: 
Cada apartado teórico se impartirá mediante clases magistrales, incluyendo 
la lectura y discusión crítica de artículos de investigación relacionados que se
repartirán a los alumnos previamente. También se contempla la posibilidad 
de algún seminario impartido por científicos externos que deberá ser 
resumido por el alumno. Por otro lado, las clases prácticas consistirán en 
primer lugar en demostraciones por parte del profesorado, seguido de la 
implicación del alumnado en la obtención de datos experimentales y/o 
análisis detallado de los mismos. Finalmente, se formarán grupos reducidos 
de alumnos a los que se encargará un trabajo bibliográfico o experimental 
que deberá ser expuesto en clase. 
 
En cuanto a las tareas compartidas (20% de las horas), además de un 
suficiente espacio temporal para tutorías personalizadas presenciales, está 
contemplado un apartado para tutorías "a distancia" mediante correo 
electrónico y/o foros de internet, así como la elaboración al final del curso de 
una encuesta de calidad en la que los alumnos podrán plasmar sus opiniones 
acerca del mismo. 
 
Por lo que respecta a las tareas autónomas (40% de las horas), se pretende 
que el alumno las emplee en el estudio y asimilación de los contenidos 
explicados en las clases magistrales, así como en la creación de informes con 
el procesamiento y discusión de los datos obtenidos en el bloque temático 
práctico, resumen de seminarios, y en la preparación de los trabajos 
expositivos en clase. 
 
Criterios y procedimientos de evaluación 
Además de la evaluación de los datos experimentales procesados y 
analizados en el bloque termático práctico por parte de los alumnos, éstos 
podrán optar entre realizar un trabajo bibliográfico sobre un tema elegido 
por el profesor y relacionado con la ingeniería de proteínas, o bien realizar un 
trabajo experimental consistente en recibir la secuencia de aminoácidos de 
una proteína, a partir de la cual deberán modelar su estructura y predecir 
mutaciones destinadas a satisfacer algún requerimiento explicado en las 
clases teóricas (p.ej., mejorar su termoestabilidad, modificar su afinidad por 
un ligando, etc...). El trabajo se expondrá en clase y a continuación se abrirá 
un turno de debate en el que participarán tanto los profesores como el resto 
de los alumnos. 
 
Bibliografía 
- Alan R. Ferhst. Enzyme Structure And Mechanism: A Guide To Protein 
Folding And Structure.(1999) New York, Freeman. 
- Protein Folding And Stability (1999). Volume 45 De La Serie Methods In 
Molecular Biology. Editor B. A. Shirley. Towota University. 
- Carlos Gomez-Moreno Y Javier Sancho Sanz (Coordinadores). Estructura De 
Proteinas. Ariel Ciencia, Barcelona, 2003. 
- Cowan, J.A.(1997) Inorganic Biochemistry. An Introduction, Wiley-Vch, 
New York. 
- Artículos científicos de actualidad que se decidirán en el momento de 
impartir la asignatura, debido a su novedad. 
 
 
TÍTULO BIOSENSORES: NUEVAS HERRAMIENTAS EN BIOTECNOLOGÍA 
CRÉDITOS 3 HORAS 75 
PROFESOR 
RESPONSABLE 
CARMEN REYES MATEO MARTÍNEZ NIF 5383200 G 
CRÉDITOS QUE IMPARTE 1.5 
DEPARTAMENTO INSTITUTO DE BIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR 
PROFESORES COLABORADORES 
PROFESOR RICARDO MALLAVIA MARÍN NIF 02213242K 
CRÉDITOS QUE 
IMPARTE 
1.5 DEPARTAMENTO INSTITUTO DE BIOLOGIA MOLECULAR Y 
CELULAR 
TAREAS COLABORACION EN LOS BLOQUES TEMATICOS 4-7 Y EN EL BLOQUE 9 
 
Descripción y justificación de la asignatura 
Cada día aparecen en la bibliografía nuevos biosensores para aplicaciones en 
medicina, medioambiente y alimentación, que son mucho más rápidos, 
sensibles y específicos que los métodos convencionales de análisis. La 
mayoría de los grandes avances en este tema se han adaptado a dispositivos 
basados en el control de un determinado proceso. Esta asignatura aporta las 
definiciones y terminología básica para la comprensión de los diferentes 
biosensores que están apareciendo. Así, se introduce a los alumnos con 
preguntas clave: ¿Qué es un biosensor?; ¿Dónde y cuando podemos 
emplearlo ?; ¿Qué significan los términos especificidad, sensibilidad, 
selectividad o bioafinidad?. A continuación se explican los componentes de un 
biosensor y sus características, así cómo los tipos de procesos que pueden 
intervenir para su control. A partir de estas premisas, se clasifican los tipos de 
biosensores que podemos encontrar en función de la biomolécula, del tipo de 
reacción o de la señal/respuesta obtenida. Los biosensores ópticos se 
explicarán en detalle empleando ejemplos recientes de biosensores basados 
en respuestas fluorescentes o biosensores incorporados en terminales de 
fibras ópticas. Este apartado nos llevará al estudio de los diferentes 
materiales para la inmovilización de los componentes biológicos del biosensor, 
como los materiales sol-gel. Dado que la asignatura pretende mostrar la gran 
potencialidad del uso de biosensores, el siguiente tema profundizará en 
distintas aplicaciones de los mismos en áreas de gran relevancia como son la 
proteómica, la genómica, la salud, la monitorización de tóxicos y 
contaminantes, etc. La asignatura continuará con un tema en el que se 
explican las aplicaciones más comunes de los biosensores y los requisitos de 
éstos para poder salir al mercado, y se finaliza con un tema, que se irá 
renovando año tras año, en el que se describirán los progresos más recientes 
y los nuevos retos y tendencias en la tecnología de los biosensores. Durante 
el desarrollo de la asignatura, el alumno realizará una práctica en el 
laboratorio que consistirá en la fabricación de monolito o película delgada de 
silicio donde se encapsule una biomolécula que genere una respuesta óptica 
según un modelo conocido. Además, el alumno deberá realizar el diseño 
teórico de un nuevo biosensor, y exponer un trabajo científico, relacionado 
con la asignatura. Parte de los contenidos de estaasignatura entroncan 
directamente con la mayoría de las asignaturas del Curso de Doctorado. 
 
Objetivos fundamentales de la asignatura en el contexto del curso 
- Pretende ser un tutorial de conceptos, metodologías y ejemplos en el 
estudio de biosensores. 
- Explorar el presente y el futuro de las aplicaciones de los sensores en 
procesos que implican biomoléculas. 
- Interiorizar al estudiante de la gran complejidad requerida en el diseño de 
un biosensor, el cual debe basarse en una interrelación de áreas tan distintas 
como la química, ´biología, medicina, física, ciencia de matriales, electrónica, 
etc. 
- Ayudar en la compresión de los ejemplos y capacidad de entender los 
trabajos científicos relacionados en este tema. 
 
Objetivos concretos 
- Definir el concepto de biosensor, bioreceptor y transductor. 
- Conocer los campos de aplicación de un biosensor. 
- Identificar los componentes de un biosensor. 
- Conocer las limitaciones de un dispositivo sensorial. 
- Describir los diferentes tipos de biosensores en función de sus componentes. 
- Conocer los materiales base para preparar una matriz en un biosensor. 
- Ser capaz de idear o construir un biosensor y capacitar de crítica en la 
lectura de artículos especializados. 
 
Contenidos 
 
BLOQUE 1: Definición de biosensor y campos de aplicación. (0.12 créditos) 
Visión histórica de los biosensores. 
Definición y características de un biosensor 
Áreas de desarrollo y explotación de los biosensores. 
 
BLOQUE 2: Componentes de un biosensor. (0.12 créditos) 
Esquema de un biosensor: Receptor, transductor y sistema de detección 
Funcionamiento de un biosensor 
Criterios de clasificación 
 
BLOQUE 3 Clasificación de los biosensores: (0.12 créditos) 
Tipo de interacción. 
Elemento de reconocimiento. 
Sistema de transducción 
 
BLOQUE 4 Biosensores electroquímicos (0.12 créditos) 
Tipos de transductores electroquímicos. 
Ventaja e inconvenientes. 
 
BLOQUE 5: Biosensores ópticos (0.3 créditos) 
Biosensores colorimétricos (fotométricos) 
Biosensores fluorescentes 
Otros biosensores ópticos (fosforescentes, dispersión Raman, etc.) 
Comparación entre biosensores ópticos y electroquímicos. 
 
BLOQUE 6: Tecnología de Inmovilización. (0.3 créditos) 
Adsorción física 
Entrecruzamiento 
Enlace covalente 
Atrapamiento 
Ventajas, inconvenientes y comparación entre ellos. 
 
BLOQUE 7: Uso y aplicaciones de los biosensores (0.2 créditos). 
Aplicaciones en diagnóstico clínico, medioambiente y alimentación. 
Implementación de un biosensor: desarrollo, puesta a punto y salida al 
mercado. 
Ejemplos de biosensores comerciales y patentes. 
 
BLOQUE 8. Últimos avances en tecnología de biosensores (0.12 créditos) 
 
BLOQUE 9: Preparación práctica de un biosensor (1 crédito). 
Desarrollo en el laboratorio de un biosensor para cuantificar peróxido de 
hidrógeno. 
 
BLOQUE 10 Selección de un artículo de investigación y exposición del trabajo. 
(0.4 créditos). 
 
BLOQUE 11. Proyecto de diseño teórico de un biosensor. (0.2 créditos). 
 
 
Metodología de enseñanza y aprendizaje 
El 40% de los créditos de la asignatura se impartirán mediante la utilización 
de clases magistrales utilizando medios audiovisuales con imágenes, 
esquemas, transparencias e incluso videos del tema en cuestión. 
Familiarizados con la terminología los alumnos pasarán a fabricar su propio 
biosensor, que desarrollarán en el laboratorio. Los alumnos serán capaces de 
realizar medias del analito objeto de estudio en instrumentos de investigación 
como un fluorímetro y/o espectrofotómetro de absorción. Cada alumno 
realizará un pequeño proyecto sobre el diseño de un nuevo biosensor y 
comentará un trabajo reciente de investigación (posterior al 2000) que ha de 
sacar de la hemeroteca (del tipo “Biosensor”, “Biosensor & Bioelectronics”, 
“Sensor and Actuators”. El resto de los créditos (∼ 20%) se destinarán a 
tutorías personalizadas y a distancia que incluyen la supervisión y el 
asesoramiento de los diferentes trabajos prácticos y bibliográficos a realizar 
por los alumnos. 
 
Criterios y procedimientos de evaluación 
Como criterio de evaluación se tendrá en cuenta la asistencia a clase, el 
trabajo práctico de laboratorio, el proyecto que cada alumno elaborará sobre 
el diseño de un nuevo biosensor y la exposición que realizará con relación a 
un artículo científico previamente seleccionado. 
 
Bibliografía 
- Brian R. Eggins “Biosensor, an introduction”, John Wiley & Sons, Portland, 
1997. (http://www.chipsbooks.com/biosens.htm ). 
 - F. S. Ligler and C.A. Rowe Taitt, Optical biosensor: present and future, 
Elsevier Science, 2002. 
 - Graham Ramsay, “Commercial Biosensors :Applications in Clinical, 
Bioprocess, and Environmental Samples”, John Wiley & Sons, Canada, 1998 
 (http://www.chipsbooks.com/commbios.htm). 
- Erika Kress Rogers, “Handbook of Biosensors and Electronic Noses: 
Medicine, Food, and the Environment” CRC Press, 1996. 
- Lucilene Dornelles Mello and Lauro Tatsuo Kubota. “Review of the use of 
biosensors as analytical tools in the food and drink industries”. Food 
Chemistry, vol. 77, pp: 237-256. 2002. 
- Lucilene Dornelles Mello and Lauro Tatsuo Kubota. “Biosensors as a tool for 
the antioxidant status evaluation”. Talanta, vol. 72, pp: 335-348. 2007. 
- R. Gupta and N.K. Chaudhury. “Entrapment of biomolecules in sol–gel 
matrix for applications in biosensors: Problems and future prospects.” 
Biosensors and Bioelectronics,Vol. 22,pp: 2387-2399 2007. 
- John H.T. Luong, Keith B. Male, Jeremy D. Glennon. Biosensor technology: 
Technology push versus market pull. Biotechnology Advances, vol. 26, Issue 
5, pp 492-500. 2008. 
 
 
TÍTULO BIOMEMBRANAS: COMPONENTES, INTERACCIONES E 
IMPLICACIONES EN LOS PROCESOS BIOLÓGICOS 
CRÉDITOS 3 HORAS 75 
PROFESOR RESPONSABLE ASIA FERNÁNDEZ CARVAJAL NIF 11 792 983 D 
CRÉDITOS QUE IMPARTE 1 
DEPARTAMENTO INSTITUTO DE BIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR 
 
PROFESORES COLABORADORES 
PROFESOR JOSÉ VILLALAÍN BOULLON NIF 14 244 023P 
CRÉDITOS QUE 
IMPARTE 
1 DEPARTAMENTO INSTITUTO DE BIOLOGIA MOLECULAR Y 
CELULAR 
PROFESOR JOSÉ MANUEL GONZÁLEZ ROS NIF 51 960 561 
CRÉDITOS QUE 
IMPARTE 
1 DEPARTAMENTO INSTITUTO DE BIOLOGIA MOLECULAR Y 
CELULAR 
 
 
Descripción de la asignatura 
Las membranas biológicas no constituyen únicamente una barrera que aísla el 
interior del exterior celular sino que conforman estructuras altamente dinámicas 
constituidas por diversos tipos de lípidos y proteínas de cuya interacción 
dependen muchas de las funciones biológicas. De este modo, las interacciones 
moleculares que siempre han sido un cuerpo central en la biología moderna, 
adquieren ahora un protagonismo aún mayor y su conocimiento, un interés 
estratégico adicional por cuanto que la interacción en si misma se contempla en 
la actualidad como una nueva diana potencial de actuación farmacológica. Así, la 
búsqueda sistemática de interacciones de moléculas en biomembranas se ha 
traducido en la aparición de ensayos genéticos de doble o triple híbrido en 
bacterias y levaduras, tan en boga en la actualidad, como en ensayos de alto 
rendimiento para el descubrimiento de nuevos fármacos. 
El interés científico creciente en este campo es un aliciente para diseñar y 
proponer un curso de doctorado que dote a los alumnos de los conocimientos 
básicos y específicos derivados del progreso espectacular de nuestro 
conocimiento de las interacciones moleculares en el entorno de la membrana 
celular. El curso se centrará en los conocimientos recientes de estas 
interacciones, en su papel modulador de una respuesta biológica dada, y en 
como estos conocimientos pueden ser aplicados en el desarrollo de nuevas 
estrategias de interés biotecnológico y /o biomédico. 
 
Objetivos fundamentales de la asignatura en el contexto del curso 
El objetivo fundamental de la asignatura es enseñar a los alumnos la importancia 
de las interacciones lípido-proteína o proteína-proteína en la funciones 
biológicas; los últimos avances en