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Enzimas Son catalizadores producidos por las células, cuya función es aumentar la velocidad de las reacciones químicas, sin alterar las constantes de equilibrio. Son macromoléculas nitrogenadas biológicas con función catalítica específica Las Enzimas son proteínas AAT tripsina Glutatión sintetasa Excepción: Las Ribozimas (ARN ribosomal) Propiedades generales de las enzimas Aumentan la velocidad de las reacciones bioquímicas 106 a 1012 veces mayor Emplean condiciones de reacción moderadas: T°, presión, pH Especificidad de sustrato y de reacción Capacidad de regulación de su actividad Unen un sustrato y catalizan su conversión a un producto Características generales de las Enzimas Contenido en los enzimas regulatorias, en donde se fijan efectores o inhibidores alostéricos, que provocan un cambio conformacional en el sitio de unión al sustrato o en el sitio catalítico, regulando la actividad enzimática. SITIO DE UNIÓN AL SUSTRATO Contiene los grupos químicos (cadenas laterales de aminoácidos) que fijan al sustrato formando el Complejo Enzima – Sustrato. La unión es reversible y se establece mediante enlaces débiles (electrostáticos o salinos, puentes de hidrógeno, fuerzas hidrofóbicas y fuerzas de Van der Waals). Contiene los grupos químicos específicos implicados en la catálisis (cadenas laterales de aminoácidos), pudiendo estar cercanos o alejados en su estructura primaria. Puede integrar o no al sitio de unión al sustrato. SITIO ACTIVO SITIO ALOSTÉRICO Sitio de unión al sustrato Sustrato: H2O2 Sitio Activo Modelo molecular de la Catalasa Modelo esquemático de una enzima Sitio Activo Sustrato Sitio activo de una enzima Sitio alostérico Inhibición alostérica Activación alostérica Enzima Enzima Sustrato Sustrato Regulador Regulador Sitio alostérico Sitio activo Sitio activo Sitio Activo Sitio activo ¿QUE HACE LA ENZIMA? ENZIMA+SUSTRATO ENZIMA+ PRODUCTO Propiedades de las enzimas Especificidad de sustrato Sitio de unión del sustrato Especificidad de reacción • Complementariedad geométrica (Forma-Hendidura) • Complementariedad electrónica (Cargas iónicas) • Ajuste inducido • Especificidad geométrica (grupos químicos) • Estereoespecificidad (D-azúcares, L-aminoácidos) Especificidad de reacción Especificidad de sustrato Especificidad enzimática Relativa o variable Absoluta (alta especificidad de reacción) Cuando están presentes diferentes moléculas de sustrato, únicamente aquella que tenga la forma específica y complementaria al sitio activo de la enzima será capaz de ocupar el sitio activo. Especificidad de Sustrato Sustrato Sitio Activo Complementariedad geométrica: (a) Modelo cerradura-llave, propuesto por Emil Fisher en 1890 Modelos que explican la especificidad de sustrato La forma del sitio activo de la enzima es complementaria a la forma del sustrato que encaja completamente en éste Mathews y van Holde, 1998 Conformación del estado de transición (b) Modelo del ajuste inducido, propuesto por Daniel Koshland Jr. en 1968 Según este modelo el centro activo une el sustrato y como consecuencia de esta unión su conformación cambia, ocurre una deformación del sustrato y de la enzima para alcanzar una mejor complementariedad, lo que facilita la transformación del sustrato en producto. La enzima Hexocinasa posee una especificidad menor y además de glucosa también puede usar como sustrato a otras hexosas y algunos derivados de las mismas. La enzima Glucocinasa posee una alta especificidad para la glucosa. El grado de especificidad con respecto al sustrato es variable de una enzima a otra, por ejemplo la glucocinasa y la hexocinasa son dos enzimas diferentes que catalizan la misma reacción, fosforilación del sustrato a expensa del ATP: Especificidad Relativa 1. Oxidoreductasas 2. Transferasas 3. Hidrolasas 4. Liasas 5. Isomerasas 6. Ligasas Clasificación de las enzimas Clasificación de las enzimas Catalizan reacciones de oxido-reducción al adicionar o sustraer hidrógeno. Clase 1. Oxidorreductasas: NAD+ NADH H+ O CH3– CH – CH2 – C – OH OH O CH3– C – CH2 – C – OH O Ejemplos: deshidrogenasas, oxidasas, oxigenasas, reductasas, peroxidasas β-hidroxibutirato Acetoacetato β-hidroxibutirato deshidrogenasa Clase 2. Transferasas: Catalizan reacciones en las que hay una transferencia de grupos de una molécula a otra. COOH O = C CH3 + COOH NH2– CH CH2 CH2 COOH COOH NH2 – CH CH3 + COOH O = C CH2 CH2 COOH Clasificación de las enzimas Ejemplos: transaminasas, transcarboxilasas, transmetilasas Piruvato Α-cetoglutarato Aminotransferasa Glutamato Alanina H – NH2 + HOH + Clase 3. Hidrolasas: Catalizan reacciones en las que se produce la ruptura de enlaces por la adición de agua. Clasificación de las enzimas COOH NH2– CH CH2 CH2 O = C – NH2 COOH NH2– CH CH2 CH2 COOH Ejemplos: esterasas, fosfatasas y peptidasas Glutamina Glutamato Glutaminasa Amoníaco Clase 4. Liasas: Catalizan reacciones de eliminación no hidrolítica de grupos (H2O, CO2 y NH3) para formar un doble enlace o se añaden grupos para romper un doble enlace. Clasificación de las enzimas + CO2 COOH O = C CH3 H O = C CH3 Ejemplos: descarboxilasas, hidratasas, deshidratasas, desaminasa y sintasas Piruvato descarboxilasa Acetato Piruvato Clase 5. Isomerasas: Catalizan varios tipos de reacciones en las que hay un reordenamiento intramolecular. O HO – C C – H H – C C – OH O O C – OH H – C H – C C – OH O Clasificación de las enzimas Ejemplos: isomerasas, epimerasas y mutasas H O H2N – C – C – OH H H O H2N – C – C – OH CH3 H H O N – C – C – OH CH3 H O H2N – C – C – H ATP ADP Pi + HOH Clase 6. Ligasas: Catalizan la formación de un enlace entre dos moléculas de sustrato. La energía para estas reacciones es aportada por la hidrólisis del ATP. Clasificación de las enzimas Ejemplos: sintetasas, carboxilasas. Nomenclatura de las enzimas Sustrato + acción catalítica + Sufijo “asa” Ejemplo: Alcohol deshidrogenasa Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular (IUBMB) Cada enzima es designada con un número De acuerdo al tipo de reacción que catalizan Clasificación IUBMB Clase Sub clase Sub sub clase Cada enzima recibe un número de clasificación EC 3.4.21.4 N° específico Nombre sistemático Número de clasificación Malato deshidrogenasa EC 1.1.5.4 Dimetil amino deshidrogenasa EC 1.5.8.1 Inositol 3 metil transferasa EC 2.1.1.39 Alanina transaminasa EC 2.6.1.2 Inositol polifosfato fosfatasa EC 3.1.3.56 Alfa amilasa EC 3.2.1.1 Arginino succinato liasa EC 4.3.2.1 Celobiosa epimerasa EC 5.1.3.11 Piruvato carboxilasa EC 6.4.1.1 Ejemplos de enzimas 1) ENZIMAS PURAS La porción no proteica se encuentra débilmente unida a la enzima La porción no proteica se encuentra unida covalentemente a la enzima Una parte no proteica (Coenzima)Una parte proteica (Apoenzima) Grupo prostético Cofactor o Cosustrato Enzimas de Naturaleza Proteica + 2) HOLOENZIMAS Apoenzima (porción proteica) Inactiva Cofactor (porción no proteica) Activador Holoenzima (enzima completa) Activa Coenzima Sustrato Moléculas que pueden asociarse a ciertas enzimas para permitir la catálisis enzimática, específicamente en reacciones de : Coenzimas Oxidoreducción Transferencia de grupos Isomerización Formación de enlaces covalentes Iones metálicos : Cu2+, Fe3+, Zn2+ Moléculas orgánicas: Asociadas de forma transitoria a la enzima (cosustratos) Asociadas de forma permanente a la enzima (grupo prostético) (cofactores) Las Coenzimas pueden ser 1. Según su origen 2. Según su estructura 3. Según su función Clasificación de las coenzimas orgánicas Vitamínicas No Vitamínicas Nucleotídicas No Nucleotídicas Transferencias de hidrógenos (Coenzimas de oxido-reducción) Transferencias de grupos diferentes al hidrógeno Vitaminas Son nutrientes orgánicos imprescindibles en la dieta en cantidades muy pequeñas, para el mantenimiento de la integridad metabólica normal. “No pueden ser sintetizadas por lo que se requieren en la dieta” Clasificación de las vitaminas Solubles en solventes orgánicos, los excesos se acumulan en el tejido adiposo, produciendo intoxicación. Solubles en agua, no se acumulan, se eliminan por la orina • Liposolubles: • Hidrosolubles: Vitamina C, biotina, ácido fólico, complejo B: B1 ,B2, B3, B5, B6, B12 Vitaminas A, D, E, K. La carencia de una vitamina se traduce en la inhibición de la reacción en la que está implicada, con las consecuencias biológicas previsibles. Vitaminas hidrosolubles Todas las vitaminas hidrosolubles son precursores de COENZIMAS Coenzimas según su origen Pirofosfato de tiamina B1 FMN y FAD B2 NAD+ y NADP+ Coenzima A Fosfato de Piridoxal Ácido Tetrahidrofólico Metilcobalamina Biotina Ácido ascórbico B3 B5 B6 B9 B12 B8 C Coenzima Vitamina Coenzimas de origen vitamínico Tiamina Riboflavina Niacina Ácido pantoténico Piridoxina Ácido fólico Cobalamina Biotina Vitamina C Coenzimas de origen no vitamínico Coenzima Q Tetrahidrobiopterina Ácido Lipoico o lipoamida Nucleótidos S-adenosilmetionina Grupo Hemo Coenzimas según su estructura Coenzimas de estructura nucleotídica FMN y FAD NAD+ y NADP+ Coenzima A Metilcobalamina S-adenosilmetionina Nucleótidos Coenzimas de estructura no nucleotídica Pirofosfato de tiamina Fosfato de piridoxal Biotina Ácido fólico Ácido ascórbico Coenzima Q Grupo Hemo Tetrahidrobiopterina Ácido lipoico Coenzimas según su función Coenzimas que transfieren hidrógenos FMN y FAD NAD+ y NADP+ Ácido ascórbico Coenzima Q Tetrahidrobiopterina Ácido lipoico o lipoamida Grupo Hemo (Participan en reacciones de oxido-reducción) Coenzimas que transfieren otros grupos Aldehído Pirofosfato de Tiamina Acilo Coenzima A y Ácido lipoico De un carbono Ácido fólico Metilo Metilcobalamina y S-adenosilmetionina Fosfato ATP, ADP,GTP, GDP, UTP, UDP, CTP, CDP, TTP, TDP Amino Fosfato de piridoxal Carboxilo Fosfato de piridoxal Grupo Coenzima Características de las coenzimas PIROFOSFATO DE TIAMINA Precursor vitamínico: Tiamina (Vitamina B1) Fuentes: germen de trigo, levadura, verduras, vísceras, huevos, leche. Transferencia de grupos aldehído Sitio activo: C2 del anillo de tiazol Origen: Vitamínica Estructura: NO Nucleotídica Función: Clasificación: Tiamina Pirofosfato PIROFOSFATO DE TIAMINA (difosfato de tiamina) Anillo de Tiazol Pirofosfato de tiamina (PPT) PIROFOSFATO DE TIAMINA (difosfato de tiamina) Forma cargada Forma libre Vitamina: TIAMINA (Vitamina B1) COENZIMA: Pirofosfato de Tiamina Ejemplo de reacciones donde interviene: Descarboxilación del piruvato Descarboxilación del α-cetoglutarato Poliencefalomalacia, deficiencia de vitamina B1, tiamina Afecta las neuronas de la corteza cerebral Animales domésticos que reciben alimento comercial bajo en tiamina o alimentados con pescado crudo que contienen tiaminasa. Puede ocurrir deficiencia de tiamina en: Deficiencia de tiamina Anorexia: Falta de apetito Ataxia: Pérdida de coordinación motora Paresia: Parálisis parcial o suave (pérdida leve de motricidad) Ventroflexión: Posición de la cabeza hacia el vientre Signos vestibulares:Inclinar la cabeza,caer el cuerpo hacia un lado Deficiencia de tiamina Beriberi en humanos: Neuropatía periférica, fatiga, anorexia, Degeneración muscular, neurológica y cardiovascular Deficiencia de tiamina FLAVIN MONONUCLEÓTIDO (FMN) Precursor vitamínico: Riboflavina (Vitamina B2) Fuentes: vísceras, carne, leche, huevos, levaduras,verduras Sitio activo: Anillo Isoaloxacina Es un grupo prostético de enzimas oxidoreductasas Origen: Vitamínica Estructura: Nucleotídica Función: Participa en reacciones de oxido-reducción Clasificación: Fosfato Ribitol Anillo de isoaloxacina Riboflavina FLAVIN MONONUCLEÓTIDO (FMN) Ribitol Fosfato Forma reducida Forma oxidada FMN FMNH2 FLAVIN ADENIN DINUCLEÓTIDO (FAD) Riboflavina (Vitamina B2) Fuentes: vísceras, carne, leche, huevos, levaduras, verduras Sitio activo: Anillo Isoaloxacina Precursor vitamínico: Es un grupo prostético de enzimas oxidoreductasas Origen: Vitamínica Estructura: Nucleotídica Función: Participa en reacciones de oxido-reducción Clasificación: FLAVIN ADENIN DINUCLEÓTIDO (FAD) AMP FMN Ribitol Fosfato AMP Forma reducida Forma oxidada FAD FADH2 AMP FMN y FAD Coenzimas: Vitamina: Riboflavina (Vitamina B2) Ejemplos de reacciones o rutas donde intervienen: Ciclo de Krebs, oxidación de AG, cadena de electrones Deficiencia de Riboflavina Pollito de 2 semanas de edad con síntomas de deficiencia de vitamina B2: dedos cerrados, Parálisis de las extremidades NICOTINAMINA ADENINA DINUCLEÓTIDO (NAD+) vísceras, carne, levaduras, verduras, cereales Precursor vitamínico: Niacina (Vitamina B3) Fuentes: Anillo de nicotinamida Sitio activo: Es una coenzima de enzimas deshidrogenasas Origen: Vitamínica Estructura: Nucleotídica Función: Participa en reacciones de oxido-reducción Clasificación: D-Ribosa Adenina D-Ribosa NICOTINAMIDA ADENINA DINUCLEÓTIDO (NAD+) Nicotinamida Ribosa Pirofosfato Ribosa Adenina Forma reducida Forma oxidada NAD+ NADH+H+ NICOTINAMIDA ADENINA DINUCLEÓTIDO FOSFATO (NADP+) Precursor vitamínico: Anillo de nicotinamida Sitio activo: vísceras, carne, levaduras, verduras, cereales Fuentes: Niacina (Vitamina B3) Es una coenzima de enzimas deshidrogenasas o reductasas Origen: Vitamínica Estructura: Nucleotídica Función: Participa en reacciones de oxido-reducción Clasificación: NICOTINAMIDA ADENINA DINUCLEÓTIDO FOSFATO (NADP+) Ribosa Pirofosfato Ribosa Adenina Fosfato Forma reducida Forma oxidada NADP+ NADPH+H+ NAD+ y NADP+ Coenzimas: Vitamina: Niacina (Vitamina B3) Ejemplos de reacciones o rutas donde intervienen: Ciclo de Krebs, oxidación de AG, e-, sintesis de AG Deficiencia de Niacina Pelagra: perdida de peso, dermatitis, depresión, demencia COENZIMA A SH (grupo sulfidrilo) Sitio activo: Precursor vitamínico: Ácido pantoténico (B5) vísceras, carne, huevos, leche, levaduras, cereales, leguminosas Fuentes: Origen: Vitamínica Estructura: Nucleotídica Función: Participa en reacciones de transferenciade grupos acilo Clasificación: SH Ácido pantoténico 2-m ercap to etilam in a 4- F o sf o p an te te ín a ADP 3’fosfato COENZIMA A (CoA-SH) Vitamina: Ácido pantoténico (Vitamina B5) Ejemplos de reacciones o rutas donde intervienen: Ciclo de Krebs, oxidación y síntesis de Acidos Grasos, síntesis colesterol, síntesis de cuerpos cetónicos FOSFATO DE PIRIDOXAL grupo formaldehído en el C4 Sitio activo: vísceras, carne, huevos, leche, levaduras, cereales, aguacate, plátano Fuentes: Piridoxina (vitamina B6) Precursor vitamínico: Origen: Vitamínica Estructura: NO Nucleotídica Función: Participa en reacciones de transferencia de grupos amino o carboxilo Clasificación: FOSFATO DE PIRIDOXAL Fosfato de piridoxamina Fosfato de piridoxal Coenzima: fosfato de piridoxal Vitamina: Piridoxina (vitamina B6) Ejemplos de reacciones o rutas donde intervienen: Transaminación en el metabolismo de aminoácidos, Sintesis de anticuerpos BIOTINA N1 del anillo imidazol Sitio activo: yema de huevo, vísceras, leche, carne, levaduras, cereales, verduras Fuentes: Precursor vitamínico: Biotina (vitamina B8) Origen: Vitamínica Estructura: NO Nucleotídica Función: Participa en reacciones de transferencia de grupos CO2 Clasificación: Forma cargada Forma libre BIOTINA CARBOXIBIOTINA Coenzima: Biotina vitamina B8 Ejemplo de reacciones donde intervienen: Carboxilación del piruvato a oxalacetato La clara de huevo cruda contiene avidina, Interfiere con la absorción de biotina Deficiencia de Biotina: Dermatitis, pèrdida de pelo, crecimiento lento TETRAHIDROFOLATO (ácido tetrahidrofólico) Precursor vitamínico: Ácido fólico (B9) Fuentes: vísceras, leche, carne, levaduras, cereales, verduras (hojas verdes) Sitio activo: N5, N10 Origen: Vitamínica Estructura: NO Nucleotídica Función: Participa en reacciones de transferencia de grupos de 1 carbono Clasificación: Tetrahidrofolato (THF) 5 Pteridina Ácido p-amino benzoico (PABA) Ácido glutámico Folato sustituido 5-Formil THF Folato sustituido 10-Formil THF Folato sustituido 5-Formimino THF Folato sustituido 5,10-Metilen THF Folato sustituido 5-Metil THF Folato sustituido 5,10-Metenil THF Coenzima: Tetrahidrofolato (THF) Vitamina: Ácido fólico (Vitamina B9) Ejemplo de rutas donde intervienen: Síntesis de bases nitrogenadas Deficiencia de ácido fólico ANEMIA MEGALOBLASTICA Deficiencia de ácido fólico METILCOBALAMINA desoxiadenosina, metilo Sitio activo: vísceras, huevos, microorganismos intestinales Fuentes: Cobalamina (Vitamina B12) Precursor vitamínico: Origen: Vitamínica Estructura: Nucleotídica Función: Participa en reacciones de transferencia de grupos metilo (CH3) Clasificación: R puede variar para dar las diversas formas de la vitamina: R=CN- en cianocobalamina R=OH en hidroxicobalamina R= CH3 en metilcobalamina R= 5’desoxiadenosil en 5’desoxiadenosilcobalamina R COBALAMINA Coenzima: Metilcobalamina Cobalamina (Vitamina B12) Ejemplos de reacciones donde intervienen: Conversión de propionato a succinil CoA en la gluconeogenesis ANEMIA PERNICIOSA ÁCIDO ASCÓRBICO Sitio activo: C2 y C3 frutas (cítricos), hortalizas Fuentes: Precursor vitamínico: Vitamina C Origen: Vitamínica Estructura: NO Nucleotídica Función: Participa en reacciones de oxido-reducción Clasificación: ÁCIDO ASCÓRBICO Forma reducida Forma oxidada Ácido ascórbico (Ascorbato) Ácido deshidroascórbico (Deshidroascorbato) Forma reducida Forma oxidada ÁCIDO ASCÓRBICO Coenzima: ácido ascórbico Vitamina C Ejemplo de ruta metabólica donde interviene: Síntesis de: colágeno, adrenalina, ácidos biliares Ejemplos de especies animales que no pueden sintetizar la vitamina C Ejemplos de especies animales que si pueden sintetizar la vitamina C Deficiencia de vitamina C: Escorbuto: inflamación, hemorragia y ulceración de las encías pérdida de los dientes, debilidad de los huesos, fragilidad de los vasos capilares Composición: anillo de benzoquinona + radical isoprenoide Sitio activo: C1 y C4 (carbonilo) Coenzima Q (Ubiquinona) Origen: NO Vitamínica Estructura: NO Nucleotídica Función: Participa en reacciones de oxido-reducción Clasificación: Coenzima Q (Ubiquinona) (n= 4 a 8) Forma reducida Forma oxidada Composición: anillo de pteridina Sitio activo: N5 y N6 Tetrahidrobiopterina Origen: NO Vitamínica Estructura: NO Nucleotídica Función: Participa en reacciones de oxido-reducción Clasificación: Tetrahidrobiopterina 5 6 7 8 Composición: Sitio activo: Ácido 6,8 tio-octanoico “S” de los C6 y C8 Ácido lipoico (lipoamida) Origen: NO Vitamínica Estructura: NO Nucleotídica Función: Participa en transferencia de grupos acilo Clasificación: Participa en reacciones de oxido-reducción Forma reducida Forma oxidada Lipoamida Sitio activo: Composición: Anillo tetrapirrólico + Fe2+ (HEMO) Fe 2+ del grupo prostético HEMO Grupo prostético Hemo Origen: NO Vitamínica Estructura: NO Nucleotídica Función: Participan en reacciones de oxido-reducción Clasificación: Grupo prostético Hemo Forma reducida Forma oxidada Grupo prostético Hemo Origen: NO Vitamínica Estructura: Nucleotídica Función: Participa en reacciones de transferencia de grupos metilo Clasificación: S-adenosilmetionina Metionina Adenosina S-adenosilmetionina NUCLEÓTIDOS y NUCLEÓSIDOS Origen: NO Vitamínica Estructura: Nucleotídica Función: Participan en reacciones de transferencia de grupos fosfato Clasificación: Enlaces fosfato Sitio activo: Adenina Ribosa Adenosin 5’ monofosfato (AMP) Adenosin 5’ difosfato (ADP) Adenosin 5’ trifosfato (ATP) Guanina Ribosa Guanosin 5’ monofosfato (GMP) Guanosin 5’ difosfato (GDP) Guanosin 5’ trifosfato (GTP) Uracilo Ribosa Uridin 5’ monofosfato (UMP) Uridin 5’ difosfato (UDP) Uridin 5’ trifosfato (UTP) Citosina Ribosa Citidin 5’ monofosfato (CMP) Citidin 5’ difosfato (CDP) Citidin 5’ trifosfato (CTP) Mecanismos de la catálisis enzimática Sin cat. Cat Estado de transición 1 2 3 4 5 Mecanismo general de la catálisis enzimática Transcurso de la reacción E n e rg ía l ib re ( G ) La reacción más simple catalizada por una enzima se puede denotar como: E + S ES E + P Aspartato Glutamato Asparagina Glutamina Cisteina Tirosina Lisina Mecanismos químicos de catálisis Catálisis ácido-básica Mecanismos químicos de catálisis Catálisis covalente Serina Histidina Aspartato Cisteina Mecanismos químicos de catálisis Catálisis por iones metálicos Aproximadamente el 30 % de las enzimas requieren la presencia de iones metálicos para su actividad. De acuerdo a la fuerza de unión con la enzima se distinguen dos tipos : Ión metálico fuertemente unido a la apoenzima, estas enzimas requieren metales de transición como Fe+2, Fe+3, Cu+2, Zn+2, Mn+2 ó Co+3 Metaloenzimas: Enzimas activadas por metal para estas enzimas basta con la presencia del metal en solución o que se encuentre débilmente unido a la enzima. Emplean metales alcalinos o alcalinotérreos (Na+, K+, Mg+2, Ca+2) Participación de los iones metálicos en la catálisis • En la unión con el sustrato, para su orientación en el sitio activo. • Mediando en las reacciones de oxidoreducción. • Por estabilización electrostática o protección de cargas negativas Mecanismos químicos de catálisis Efectos de proximidad y orientación Las enzimas ejercen estas acciones sobre el sustrato: Orientaciónadecuada para la reacción Estabiliza el estado de transición Disminuye los movimientos de rotación relativos Contacto con sus grupos catalíticos Cinética Enzimática Velocidad de una reacción Es el cambio de la concentración de un sustrato o del producto de la reacción, por unidad de tiempo. Cinética enzimática: Es el estudio cuantitativo de la catálisis enzimática, proporciona información sobre las velocidades de reacción, los factores que la afectan y la afinidad de las enzimas por los sustratos e inhibidores. Unidades de medida de la actividad enzimática Micromoles de sustrato transformado por minuto por miligramo de enzima (μmol/min/mg enzima) Unidad Internacional (UI) Micromoles de sustrato transformado por minuto por miligramo de proteína (μmol/min/mg proteina) Actividad Específica Katal Moles de sustrato transformado por segundo (mol/seg) Factores que afectan la velocidad de la reacción enzimática pH Temperatura Concentración del sustrato Concentración de la enzima Efecto de la concentración de enzima sobre la velocidad de la reacción V e lo c id a d , V ( n m o le s /m in ) Concentración de la enzima [E] (mM) 0 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 0,6 0,7 0 1 3 5 10 15 Efecto de la concentración de sustrato sobre la velocidad de la reacción Cinética de primer orden Cinética de orden cero V e lo c id a d , V Temp. óptima Temp. ºC Vmáx 0 10 20 30 40 50 Efecto de la Temperatura sobre la velocidad de la reacción V e lo c id a d , V pH Vmáx pH óptimo 0 pH óptimo 2 4 6 8 10 12 Enzimas: Pepsina Quimotripsina Efecto del pH sobre la velocidad de la reacción Cinética de Michaelis - Menten ¿ Quienes fueron Michaelis y Menten ?? https://scientiablog.com/2011/06/14/%C2%BFquien-era-michaelis-menten/ Cinética de Michaelis - Menten En cinética enzimática la velocidad de las reacciones se expresa en función de la variación de la concentración de sustrato, por ello la ecuación que defina una reacción enzimática debe relacionar estos dos parámetros, siguiendo este principio Michaelis-Menten formularon una ecuación basada en cuatro supuestos: 1. La enzima tiene un único sustrato. 2. El complejo ES se encuentra en estado estacionario. 3. Bajo condiciones de saturación, todas las moléculas de enzima intervienen en la formación del complejo ES. 4. Cuando toda la enzima se encuentra en forma del complejo ES, la velocidad de la reacción es máxima. En 1913, Michaelis y Menten propusieron un modelo donde las reacciones catalizadas enzimáticamente ocurren en dos etapas: En la primera etapa se forma el complejo enzima-sustrato (ES) En la segunda etapa, el complejo enzima - sustrato da lugar a la formación del producto (P), liberando la enzima libre (E). El sustrato (S) se habrá transformado en producto (P). Equilibrio rápido E + S ES E + P k1 kcat Paso lento irreversible k-1 Concentración de sustrato [S ] (mM) V e lo c id a d i n ic ia l, V o ( M /m in ) Concentración de sustrato [S ] (mM) V e lo c id a d i n ic ia l, V o ( M /m in ) Cinética enzimática de Michaelis - Menten Pendiente Representación de Lineweaver - Burk Hans Lineweaver Dean Burk Inhibición de las enzimas se unen covalentemente a la enzima. se unen no covalentemente a la enzima. Competitivos: Poseen una estructura semejante a la del sustrato, siendo reconocidos por el centro activo de la enzima. Su efecto puede ser contrarrestado al incrementar la concentración del sustrato. Disminuyen la afinidad de la enzima por el sustrato. Mixtos: Se unen a la enzima por un sitio diferente al que lo hace el sustrato, por lo que puede unirse tanto a la enzima libre, como al complejo ES. No afecta la afinidad de la enzima por el sustrato. Acompetitivos: Se unen al complejo ES formando un complejo ternario ESI catalíticamente inactivo. Aumentan la afinidad de la enzima por el sustrato. Inhibidores irreversibles: Inhibidores reversibles: Productos Sustrato e inhibidor pueden unirse al lugar activo Inhibidor impide la unión del sustrato Sitio activo de la enzima Inhibidor Sustrato Inhibidor competitivo Sin inhibidor Con inhibidor competitivo Kmi S (mM) Sin inhibidor Con inhibidor competitivo 1/S (1/mM) -1/Km 1/Vmax 1/V V Vmax Vmax/2 Inhibidor competitivo ES + I EI E + S P + E Km -1/Kmi V S (mM) Sin inhibidor Con inhibidor acompetitivo Kmi Sin inhibidor Con inhibidor acompetitivo -1/Kmi 1/Vmax Vmax V m a x /2 Inhibidor Acompetitivo P + E EIS + I 1/Vmaxi Vmaxi Vmaxi /2 -1/Km E + S ES Km 1/S (1/mM) 1/V Productos Sustrato unido al lugar activo El Inhibidor no impide la unión del sustrato Sitio activo de la enzima Inhibidor Sustrato Inhibidor acompetitivo En ausencia del inhibidor se forman los productos Sitio alostérico de la enzima Sin inhibidor Con inhibidor mixto Km S (mM) Sin inhibidor Con inhibidor mixto 1/S (1/mM) -1/Km 1/Vmax 1/V V Vmax Vmax/2 Inhibidor Mixto (no competitivo) E + S + I EI + I 1/Vmaxi Vmaxi Vmaxi /2 ES P + E + S ESI Características 1. Son proteínas con múltiples subunidades y con múltiples sitios activos (oligoméricas) 4. Presentan cooperatividad de unión del sustrato. 3. Su actividad está regulada por metabolitos activadores o inhibidores. 2. Presentan en su superficie un sitio catalítico y un sitio alostérico. 5. Presentan una ubicación específica dentro de una ruta metabólica 6. No cumplen con la cinética de Michaelis - Menten, la gráfica Vo vs [ S ] tiene forma sigmoidea. Enzimas alostéricas a) Modelo concertado Estado T Estado R b) Modelo secuencial Estado T Estado R Modelos de interacción alostérica Cinética de las enzimas alostéricas Control enzimático Los seres vivos poseen mecanismos sofisticados para regular las rutas bioquímicas a través del control enzimático. La regulación permite: 1. Mantenimiento de un estado ordenado: Producción de metabolitos requeridos para el mantenimiento de la estructura y el funcionamiento celular sin desperdicio de recursos 2. Conservación de la energía: Las reacciones que generan energía solo son activadas para satisfacer los requerimientos energéticos de las células. Control enzimático 1. Regulando el número de moléculas de enzimas a) Inducción - Represión de la síntesis enzimática b) Degradación de las enzimas. 2. Regulando la eficiencia catalítica de las enzimas a) Disponibilidad de sustratos y cofactores. - Asociaciones multienzimáticas. b) Regulación alostérica. c) Modificación covalente. - Compartimentación. - Homoalosterismo. - Heteroalosterismo. - Zimógenos o proenzimas - Fosforilación y desfosforilación Control enzimático 1. Regulando el número de moléculas de enzimas a) Inducción - Represión de la síntesis enzimática. Inducción Represión Control enzimático 1. Regulando el número de moléculas de enzimas b) Degradación de las enzimas. Proteasa Enzima desnaturalizada Productos de la degradación (péptidos y aminoácidos) Enzima nativa 2. Regulando la eficiencia catalítica de las enzimas a) Disponibilidad de sustratos y cofactores. - Compartimentación. Control enzimático 2. Regulando la eficiencia catalítica de las enzimas a) Disponibilidad de sustratos y cofactores. - Asociaciones multienzimáticas. Control enzimático 2. Regulando la eficiencia catalítica de las enzimas b) Regulación alostérica. Control enzimático Inhibición alostérica Activación alostérica Enzima Enzima Sustrato Sustrato Regulador ReguladorSitio alostérico Sitio activo Sitio activo Sitio Activo Sitio activo 2. Regulando la eficiencia catalítica de las enzimas c) Modificación covalente. - Zimógenos o proenzimas Control enzimático Zimógeno (enzima inactiva) Enzima activa 2. Regulando la eficiencia catalítica de las enzimas c) Modificación covalente. - Fosforilación y desfosforilación (Modificación covalente reversible) Control enzimático Cinasa Fosfatasa 1. Actúan en secuencias organizadas, catalizando miles de reacciones, permitiendo que la velocidad de estas sean compatibles con la vida Importancia de las Enzimas 2. Permiten un control coordinado de las rutas metabólicas 3. Tienen gran importancia en la medicina: • Algunas enfermedades pueden ser consecuencia de la ausencia parcial o total de una o más enzimas. • Algunas enfermedades pueden producirse por actividad excesiva de una enzima. • La medición de las concentraciones en plasma de enzimas pueden ser utilizadas en el diagnóstico clínico. • Muchas drogas o medicamentos ejercen su efecto biológico a través de la interacción con alguna enzima en particular. 4. Tienen utilidad en la industria química, procesamiento de alimentos, en la agricultura y, en general, en la biotecnología Enzimas en el diagnóstico clínico Alanina aminotransferasa (ALT) ó transaminasa glutámico-pirúvica (TGP), se distribuye en orden decreciente en hígado, riñón, corazón, músculo esquelético Marcadores hepáticos Aspartato aminotransferasa (AST) ó transaminasa glutámico-oxaloacética (TGO), se distribuye en orden decreciente en corazón, hígado, músculo esquelético y riñón. Ornitina carbamiltransferasa (OCT), se encuentra en hígado, su concentración en suero aumenta en pacientes con lesión hepatocelular. Fosfatasa alcalina hepática. Su concentración en suero se encuentra aumentada en obstrucciones de conductos biliares. 5-nucleotidasa (5-NT) Su concentración en suero aumenta en las alteraciones hepatobiliares. Leucina amidopeptidasa (LAP) se distribuye en hígado, riñón e intestino delgado. Su concentración en suero aumenta en las alteraciones hepatobiliares. Marcadores pancreáticos Amilasa Su concentración en suero aumenta en la pancreatitis aguda, en pacientes con insuficiencia renal. Lipasa Su concentración en suero aumenta en la pancreatitis aguda, también en pacientes con insuficiencia renal, o con trastornos inflamatorios biliares. Tripsina Se detectan altas concentraciones en suero en la pancreatitis aguda, y en el 50 % de los casos de carcinoma pancreático. Marcadores cardíacos Creatinfosfocinasa (CK-MB) muy específica para el diagnóstico de daño al miocardio. Deshidrogenasa láctica (LDH) se encuentra en hígado, músculo esquelético, músculo cardíaco, eritrocitos, suero, riñón y cerebro, se emplea en el diagnóstico de daño al miocardio y meningitis. Marcadores musculares Creatinfosfocinasa (CK-MM) Su concentración en suero aumenta en la poliomielitis, distrofias musculares, y algunos trastornos metabólicos (hipotiroidismo, acromegalia, miopatía relacionada con alcoholismo e hipertermia maligna. Aldolasa (ALS) se distribuye en orden decreciente de frecuencia, en músculo esquelético, hígado y cerebro. Fosfatasa alcalina (ALP) Su concentración en suero aumenta en la osteoporósis, raquitismo y osteomalacia por deficiencia de vit D y en la mestátasis ósea por cáncer de próstata, pulmonar o glándula mamaria, también se encuentra elevada en las fracturas . Marcadores diversos Fosfatasa ácida (ACP) Se distribuye en próstata, plaquetas, eritrocitos, hígado, bazo, riñón y médula ósea. Su concentración en suero aumenta en los estadios finales de cáncer próstatico metatastásico. Enzima Específica de la próstata (PSA) Su concentración en suero aumenta en la hipertrofia prostática y en el adenocarcinoma de próstata.
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