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Guía práctica 2-Estadística Descriptiva Bioestadística UNM 2020 Problema 1 En los siguientes enunciados, identifique que tipo de variable es y clasifíquela (ordinales, nomina- les, discretas o continuas): 1. La materia preferida de los alumnos de la Lic. en Biotecnología de la UNM. 2. Cantidad de papers publicados por los investigadores de CONICET. 3. Diámetro de una esfera 4. Cantidad de alumnos que entraron al Campus Virtual de la UNM 5. Lugar que ocupa la Universidad de Buenos Aires en el ranking de Universidades del mundo 6. Volumen de agua dentro de un autoclave 7. Número de pétalos que tiene una flor. 8. Color de las arvejas que usó Mendel en su trabajo 9. Tiempo requerido para responder esta guía de problemas 10. Extensión de la plataforma marítima de un conjunto de países 11. Candidato al cual apoyan los estudiantes en las próximas elecciones de Centro de Estudiantes 12. Número de genes en un genoma 13. Número de secuencias en un archivo formato FASTA 14. Tiempo de gestación de un elefante 15. Marcas de enzimas que se comercializan en el país 16. Grado de mejoría de un grupo de pacientes frente a un tratamiento (medido como: no mejoró, empeoró, los síntomas disminuyeron considerablemente, los síntomas se fueron) 17. Número de materias que has cursado hasta ahora en toda la carrera 18. Peso de un hipopótamo al nacer 19. Resultado de tirar dos dados Problema 2 En cada uno de los siguientes enunciados, indique cuál es la muestra, cuál es la población de estu- dio, cual sería el Universo, cuál es la variable, de qué tipo es (cuantitativa, cualitativa….). 1. Para determinar si hay dengue en el municipio de Moreno, se realizó una inspección en algunas casas próximas a la UNM, buscando mosquitos Aedes aegypty. Se registró el número de mosquitos encontrados en cada casa. 2. Para determinar si consumir café después de las 20 hs genera problemas de sueño en adolescentes, a un grupo de 200 mujeres entre 16 y 18 años se les pidió que durante 2 semanas consuman una taza de café luego de esa hora, y que registren cuántas horas duermen por noche. Se comparó esto con la cantidad de horas dormidas las dos semanas previas a comenzar el ensayo 3. Para determinar si los alumnos de la UNM tienen COVID-19, en el mismo día se les hizo un hisopado a todos los alumnos de la Universidad (y posterior test por PCR). 4. Para determinar si ingerir maíz morado tiene efecto en el color de los huevos en aves, se alimentaron 15 patos de la raza Rouen con maíz morado durante 20 días. Se determinó el cambio en la coloración de la cáscara de los huevos que pusieron en ese período. 5. Para estudiar el efecto del agregado de nitrógeno en suelo sobre el crecimiento de las plantas, doce parcelas de un campo sembradas con soja (variedad Monsanto RR) fueron abonadas con agentes nitrógenados, mientras que otras doce parcelas, también sembradas con la misma variedad de soja, no fueron abonadas. Se midió el tiempo (en días) en que las plantas llegan a floración. 6. Para determinar la efectividad de cierto producto como agente bactericida (es decir, para matar bacterias), se agregó determinada concentración de este producto en 5 placas que contenían bacterias E. coli cepa DH5-alfa. Se registró el número de unidades formadoras de colonias antes y después del tratamiento. 7. Para determinar el antibiótico administrado a los peces en criaderos llega a la carne de los mismos, se tomaron 22 salmones de un criadero localizado en la zona del Chaitén (Chile), y se estudió la presencia de antibiótico en carne (medido como microgramos de antibiótico por gramo de carne). 8. Para determinar la tasa de crecimiento de los árboles por año (altura, en metros/año), se midieron los mismos 30 eucaliptos de un jardín botánico en noviembre de 2016, 2017, 2018, 2019. 9. Para determinar el porcentaje de pérdida de audición en ancianos, se le hizo una audiometría a hombres ancianos seleccionados al azar de 25 hogares de la localidad de Moreno. Se midió intensidad del sonido detectada por cada uno (decibeles) Problema 3 a) En estudio sobre el grupo sanguíneo realizado con n = 6313 individuos se obtuvo el siguiente gráfico. 1. ¿Qué tipo de gráfico es? 2. ¿Qué tipo de variable se está graficando? 3. Indique si el gráfico es auto-explicativo así como está o, en caso que le falte algo, indique qué dato/s le falta/n y complételo. O A B AB b) Se hizo un relevamiento sobre la edad (en años) de los alumnos que estan haciendo determinado curso. Los resultados se presentan en este gráfico. 1. Qué tipo de gráfico es? 2. Qué tipo de variable se está graficando? 3. Indique si el gráfico es auto-explicativo así como está o, en caso que le falte algo, indique qué dato/s le falta/n y complételo. c) Un grupo de trabajo generó una planta de papa transgénica de la variedad Sputnik, que se espera tenga mayor rendimiento (en cantidad de tubérculos por planta) que la misma variedad sin trans- formar. En un estudio, se tomaron 27 plantas de papa transgénica ya maduras y se contó la cantidad de tubérculos/planta. Los resultados se plasman en este gráfico. 1. ¿Qué tipo de gráfico es? 2. ¿Qué tipo de variable se está graficando? 3. Indique si el gráfico es auto-explicativo así como está o, en caso que le falte algo, indique qué dato/s le falta/n y complételo. d) Intentando determinar cuál es la tecnología de secuenciación más usada para la generación de los genomas de referencia disponibles en la base de datos GenBank, se tomaron 1650 genomas de refe- 0 1 2 3 4 5 6 7 18 19 20 21 22 23 24 25 0 0,05 0,1 0,15 0,2 0,25 7 8 9 10 11 12 13 rencia y se los clasificó de acuerdo a si habían sido secuenciado con Illumina (n=1000), PacBio (n=100), Sanger (n=500) u Oxford Nanopore (n=50). Los datos se presentan en el siguiente gráfico. 1. ¿Qué tipo de gráfico es? 2. ¿Qué tipo de variable se está graficando? 3. Indique si el gráfico es auto-explicativo así como está o, en caso que le falte algo, indique qué dato/s le falta/n y complételo. e) El mismo set de datos anterior también se graficó en este formato. 1. ¿Qué tipo de gráfico es? 2. Indique si el gráfico es auto-explicativo así como está o, en caso que le falte algo, indique qué dato/s le falta/n y complételo. Problema 4 Se probaron tres métodos de extracción de ADN de plantas: 2 kits comerciales (MachereyNagel, n=160 extracciones y Qiagen, n=240 extracciones de ADN de girasol) y el método de Dellaporta 0 10 20 30 40 50 60 70 1000 100 500 50 Illumina PacBio Sanger Oxford Nanopore (1983, n=180 extracciones de ADN de girasol de nueva generación, o NextGenerationSequencing), se necesita una c muestra. En la siguiente tabla se presentan los resultados de las extracciones de ADN con los tres métodos, y la concentración obtenida usando cada uno (baja y alta). 1. Aquí se está registrando una o dos variables? De qué 2. ¿Cuál es la muestra? Cuál la población? 3. ¿Qué proporción de las extracciones de ADN tuvieron baja concentración? 4. De los ADNs extraídos con Qiagen, 5. ¿Qué proporción de ADNs fueron extraí ción? 6. ¿Qué PORCENTAJE de ADNs fueron extraí ción? 7. Son independientes los eventos “ser extraí Demuéstrelo. 8. Haga la tabla de frecuencias marginales 9. Haga la tabla de frecuencias marginales relativas a la concentración de ADN extraído (A TA/BAJA). 10. Haga un gráfico que permita ver, fácilmente, qué método de extracción permitió extraer una mayor PROPORCIÓN de ADN de alta concentración. Agreguele todos los datos necesarios para que dicho gráfico sea auto explicativo cos, revise teórica y guía teórica 11. Haga un gráficoque permita ver, fácilmente, cuál fue el método que tuvo la mayor difere cia entre el NÚMERO de muestras con baja concentración y alta concentración (es decir, que permita comparar por método). Agreguele todos los datos necesarios para que gráfico sea auto explicativo. Problema 5 Partiendo del siguiente cuadro de Punnett, que presenta la descendencia esperada para un cruz miento de dos parentales AaBb x AaBb, haga dos gráficos (de dos tipos diferentes) que muestren claramente las proporciones esperadas de cada genotipo en la descendencia. Agregue a cada uno de los gráficos todos los elementos necesarios para que sean auto de ADN de girasol). Para hacer una secuenciación NGS (secuenciación de nueva generación, o NextGenerationSequencing), se necesita una concentración alta de ADN por muestra. En la siguiente tabla se presentan los resultados de las extracciones de ADN con los tres métodos, y la concentración obtenida usando cada uno (baja y alta). Aquí se está registrando una o dos variables? De qué tipo es/ son? Cuál es la muestra? Cuál la población? Qué proporción de las extracciones de ADN tuvieron baja concentración? dos con Qiagen, ¿qué PORCENTAJE tuvo alta concentración? proporción de ADNs fueron extraídos con Macherey-Nagel y tuvieron baja concentr PORCENTAJE de ADNs fueron extraídos con Dellaporta o tuvieron alta concentr ndientes los eventos “ser extraído con Qiagen” y “tener baja concentración”? frecuencias marginales relativas al método de extracción. de frecuencias marginales relativas a la concentración de ADN extraído (A Haga un gráfico que permita ver, fácilmente, qué método de extracción permitió extraer una mayor PROPORCIÓN de ADN de alta concentración. Agreguele todos los datos necesarios para que dicho gráfico sea auto explicativo (si tiene alguna duda de cómo encarar revise teórica y guía teórica). Haga un gráfico que permita ver, fácilmente, cuál fue el método que tuvo la mayor difere cia entre el NÚMERO de muestras con baja concentración y alta concentración (es decir, que permita comparar por método). Agreguele todos los datos necesarios para que gráfico sea auto explicativo. Partiendo del siguiente cuadro de Punnett, que presenta la descendencia esperada para un cruz miento de dos parentales AaBb x AaBb, haga dos gráficos (de dos tipos diferentes) que muestren orciones esperadas de cada genotipo en la descendencia. Agregue a cada uno de los gráficos todos los elementos necesarios para que sean auto-explicativos. ). Para hacer una secuenciación NGS (secuenciación oncentración alta de ADN por muestra. En la siguiente tabla se presentan los resultados de las extracciones de ADN con los tres Qué proporción de las extracciones de ADN tuvieron baja concentración? qué PORCENTAJE tuvo alta concentración? y tuvieron baja concentra- dos con Dellaporta o tuvieron alta concentra- tener baja concentración”? relativas al método de extracción. de frecuencias marginales relativas a la concentración de ADN extraído (AL- Haga un gráfico que permita ver, fácilmente, qué método de extracción permitió extraer una mayor PROPORCIÓN de ADN de alta concentración. Agreguele todos los datos necesarios (si tiene alguna duda de cómo encarar los gráfi- Haga un gráfico que permita ver, fácilmente, cuál fue el método que tuvo la mayor diferen- cia entre el NÚMERO de muestras con baja concentración y alta concentración (es decir, que permita comparar por método). Agreguele todos los datos necesarios para que dicho Partiendo del siguiente cuadro de Punnett, que presenta la descendencia esperada para un cruza- miento de dos parentales AaBb x AaBb, haga dos gráficos (de dos tipos diferentes) que muestren orciones esperadas de cada genotipo en la descendencia. Agregue a cada uno de Problema 6 En el inciso a los estudios que ya están planteados. Vea si es conveniente o no tomar muestra (es decir, si es necesario tomar una muestra de la población, o si se puede estudiar la población en su totalidad), dependiendo de cada caso. En el inciso b hay más lugar para la creatividad. a) Estudio estadístico población ¿Se necesita muestra? Variable Tipo de variable Goles realizados por cada jugador de un equipo en un determi- nado torneo Comida preferida por los clientes de un res- taurante Número de zapato de los miembros de una familia Cantidad de crías/ camada de la especie Ratus norwegicus (rata) Distancia promedio de la UNM a las casas de los alumnos de la Universidad b) Estudio estadístico población ¿Se necesita muestra? Variable Tipo de variable Gallinas de la raza Sussex armiñada Problema 7 Se les realizó la siguiente pregunta a estudiantes universitarios ‘‘En los últimos 12 meses, ¿el estrés ha afectado negativamente tus resultados académicos?” La Figura (a) muestra un gráfico de barras apiladas para las respuestas como la Figura (b) muestra un gráfico de barras apiladas para las porcentajes (barras que llegan al 100%). Las posibles respuestas fueron "No he tenido ningún estrés" (rojo), "He tenido estrés pero no ha afectado mis calificaciones" (verde), o "He tenido estrés y sí ha afectado mis calificaciones" (azul) 1. ¿Respondieron más hombres o más mujeres a la encuesta? ¿o participaron aproximadamente el mismo número de hombres y mujeres? ¿Qué gráfico, (a) o (b), es más útil para esta pregunta? 2. Un mayor número de hombres dijeron que no tenían estrés o de mujeres? ¿o es aproxim damente igual entre hombres y mujeres? ¿Qué gráfico, (a) o (b), es más útil para responder esta pregunta? Gallinas de la Sussex armiñada no altura (en centí- metros) si Se les realizó la siguiente pregunta a estudiantes universitarios ‘‘En los últimos 12 meses, ¿el estrés ha afectado negativamente tus resultados académicos?” La Figura (a) muestra un gráfico de barras apiladas para las respuestas como la Figura (b) muestra un gráfico de barras apiladas para las frecuencias relativas porcentajes (barras que llegan al 100%). Las posibles respuestas fueron "No he tenido ningún estrés" (rojo), "He tenido estrés pero no ha ificaciones" (verde), o "He tenido estrés y sí ha afectado mis calificaciones" (azul) ¿Respondieron más hombres o más mujeres a la encuesta? ¿o participaron aproximadamente el mismo número de hombres y mujeres? ¿Qué gráfico, (a) o (b), es más útil para Un mayor número de hombres dijeron que no tenían estrés o de mujeres? ¿o es aproxim damente igual entre hombres y mujeres? ¿Qué gráfico, (a) o (b), es más útil para responder cualitativa cuantitativa cualitativa nomi- nal cuantitativa dis- creta í- Se les realizó la siguiente pregunta a estudiantes universitarios ‘‘En los últimos 12 meses, ¿el estrés La Figura (a) muestra un gráfico de barras apiladas para las respuestas como conteos, mientras que frecuencias relativas de respuesta como Las posibles respuestas fueron "No he tenido ningún estrés" (rojo), "He tenido estrés pero no ha ificaciones" (verde), o "He tenido estrés y sí ha afectado mis calificaciones" (azul) ¿Respondieron más hombres o más mujeres a la encuesta? ¿o participaron aproximadamente el mismo número de hombres y mujeres? ¿Qué gráfico, (a) o (b), es más útil para responder Un mayor número de hombres dijeron que no tenían estrés o de mujeres? ¿o es aproxima- damente igual entre hombres y mujeres? ¿Qué gráfico, (a) o (b), es más útil para responder 3. ¿Un mayor porcentaje de hombres dijo que no tenían estrés o de mujeres? ¿o es aproxima- damente igual entre hombres y mujeres? ¿Qué gráfico, (a) o (b), es más útil para responder esta pregunta? 4. ¿Un mayor porcentaje de hombres dijo que el estrés afectaba sus calificaciones o mujeres? ¿o es aproximadamenteigual entre hombres y mujeres? ¿Qué gráfico, (a) o (b), es más útil para responder esta pregunta? Problema 8. Uso de notación Para cada uno de los siguientes enunciados, indique si la proporción es muestral (�̂) o poblacio- nal (p) 1. Para determinar la proporción de alumnos de la UNM que tienen COVID-19, en el mismo día se les hizo un hisopado a todos los alumnos de la Universidad (y posterior test por PCR). 2. Es sabido desde hace tiempo que las poblaciones de koalas de Nueva Gales del Sur y Que- ensland se han visto afectados por la clamidia, una enfermedad que les causa infertilidad y ceguera. Para determinar qué proporción de la población de koalas de estas regiones aun son fértiles, se capturaron 100 hembras al azar y se contabilizó cuántas tienen cría en este mo- mento. 3. Para determinar la proporción de hembras existentes actualmente de orca (Orsinus orca), se registraron datos del sexo de 150 orcas. 4. Para determinar la proporción de animales del Parque Temaikén que son suricatas (Suricata- suricatta), se contó el número de animales del parque y el número de suricatas que allí vi- ven. 5. La enfermedad de tumores faciales del demonio de Tasmania es un cáncer contagioso que afecta tanto a hembras como a machos de la especie. Para determinar qué porcentaje de es- tos animales tiene la enfermedad, se capturaron aleatoriamente 205 individuos y se deter- minó si tienen o no la enfermedad. Problema 9 Piedra, papel, tijera es un popular juego, en el cual piedra gana a tijera, tijera gana a papel y papel gana a piedra. Intentando determinar si entre los jugadores hay alguna preferencia de elección de algunas de estas tres opciones cuando se está jugando, y si esta elección tenia alguna relación con el hecho de que el jugador fuera diestro o zurdo, se hizo un experimento: se observaron 155 personas mayores jugando en el partido de Moreno, y en cada caso se registró si eran diestras o zurdas y qué opción (piedra, papel o tijera) era la primera que jugaban. Los datos se plasman en esta tabla de contingencia: diestro zurdo total piedra 35 29 64 papel 18 20 38 tijera 26 27 53 total 79 76 155 1. ¿Aquí se está registrando una o dos variables? ¿De qué tipo es/ son? 2. ¿Cuál es la muestra? ¿Cuál la población de estudio? ¿Cuál el Universo? 3. ¿Qué proporción de personas eligió “piedra”? 4. Del conjunto de jugadores diestros, ¿qué proporción eligió tijera? 5. ¿En qué PORCENTAJE de casos se eligió papel O el jugador era zurdo? 6. ¿Qué proporción fue tijera elegida por zurdos O papel elegida por diestros? 7. Haga la tabla de frecuencias marginales relativas al tipo de jugada (piedra-papel, tijera) 8. Haga una tabla de frecuencias marginales relativa a si el jugador fue zurdo o diestro. 9. Habiendo visto este estudio, ¿qué opción debería jugar (piedra, papel o tijera) si quisiera te- ner más chances de ganar este juego?
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