Tarea_clase_4_2020

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Actividades para resolver usando UNIPROT 
 
Este año, el viernes 08/05/2020, se conmemoró el 40 aniversario de la erradicación oficial 
de la VIRUELA. La única enfermedad humana eliminada y que durante alrededor de 3.000 años 
afectó a unos 300 millones de personas en el mundo y que sólo en el siglo XX, mató a unos 4 
millones anualmente. 
El fin de esta enfermedad se confirmó el 9 de diciembre de 1979, y cinco meses más tarde, 
el 8 de mayo de 1980, la 33ª Asamblea Mundial de la Salud emitió su declaración oficial de que "el 
mundo y todos sus pueblos" se habían "liberado de la viruela". 
En conmemoración, realice los siguientes problemas: 
 
Problema 1: 
Vamos a trabajar con la proteína “DNA topoisomerase 1” del virus “Variola virus”. 
a) Haga una búsqueda avanzada de UniprotKB y pegue aquí la traducción (búsqueda en texto 
con operadores lógicos). 
b) ¿Cuántos resultados obtuvo? ¿Cuántos de curado manual (Swiss-prot) y cuantos de 
traducción automática (trEMBL)? 
c) Vaya a la salida de Swiss-prot para esta búsqueda. ¿Cuál es la función de esta proteína? 
Escríbala con sus palabras muy brevemente. 
d) Mire la estructura 3D de esta proteína. ¿Con qué estrategia se obtuvo dicha estructura 3D? 
¿Tiene alfa hélices? ¿Tiene láminas beta? ¿Cuántas láminas beta cuenta? 
e) Mire la estructura 3D de esta proteína. ¿Qué es eso que se ve de color azul y blanco? (pista, 
relaciónelo con la función de dicha proteína). 
f) Busque si hay alguna variante de esta proteína asociada con patología. Qué tipo de cambio 
aminoacídico es? En qué posición se da dicho cambio? Hay alguna publicación que de 
evidencia de este cambio? Si es así, escriba título del artículo, apellido del primero autor y 
año de publicación 
 
Problema 2: 
Busque el proteoma del Variola virus 
a) ¿Cuántos proteomas encuentra? 
b) ¿Cuántas proteínas hay en el proteoma de referencia? 
c) ¿Cuál es el ID del proteoma de referencia?