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1 Bioluminiscencia en Biotecnología de Plantas: Las Bananas resplandecen de luz! E. Santos, S. Remy, E. Thiry, S. Windelinckx, R. Swennen and L. Sági ACORBAT 2008, 10-14 noviembre Guayaquil-Ecuador Laboratory of Tropical Crop Improvement KATHOLIEKE UNIVERSITEIT LEUVEN 17 April 2008 2 Contenido I. Bananos genéticamente modificados II. Expresión de los genes III. Genes reporteros IV. El gen reportero de la luciferasa en biotecnología aplicada al banano V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano VI. Conclusiones y perspectivas 3 Plantas modificadas genéticamente I. Bananos genéticamente modificados • Mejoramiento convencional es un proceso largo y tedioso especialmente en banano y plátanos. Consiste en la polinización cruzada de una planta con una especie relacionada. Por tanto, el “pool” de genes está limitado a especies compatibles para cruzamiento. • Bananos del subgrupo Cavendish no se pueden mejorar convencionalmente debido a esterilidad. • Transformación genética de plantas permite la integración de genes útiles de diferentes organismos a las plantas. 4 Plantas modificadas genéticamente I. Bananos genéticamente modificados • Transformación genética en plantas puede ser definido como la inserción estable de genes en el genoma y su expresión en la planta transgénica (o cisgénica). • Plantas cisgénicas. La introducción de genes en una planta, con sus promotores originales, de una planta compatible de cruzamiento o de la misma planta (Schouten and Jacobsen, 2006) . 5 Genómica en Banano I. Bananos genéticamente modificados Genoma: 500-600 Mbp; 11 chromosomes; ploidia: 2x, 3x, 4x; grupos genómicos (AAA, AAB, ABB …) Herramientas moleculares: Sistemas de transformación genética, Secuencia de datos ‘limitada’ (EST, BAC, SAGE libraries), análisis proteómico, marcadores moleculares, … “Revolución verde” a la “revolución de los genes” (transformación genética) 6 Expresión de genes Gen mRNA Proteína TATA-box Sitio de Inicio de la Transcripción (TSS)- 30 DNA Promotor + 1 II. Expresión de los genes 7 Genes reporteros • Mediciones de la expresión de genes se realizan generalmente a través de ensayos específicos del mRNA, sin embargo requiere esfuerzo substancial. • Genes reporteros proveen información análoga más eficientemente. • Puede ser detectado mediante un ensayo visual y simple. • Es usado para confirmar transformación genética temporal o estable. Gen reportero mRNA Proteína reportera Promotor DNA II. Expresión de los genes 8 Genes reporteros III. Genes reporteros • Importantes para la prueba de la actividad de promotores. • Genes reporteros más usados en biotecnología de plantas: – β-glucuronidase (GUS) – Proteína Fluorescente Verde (GFP) – Luciferasa (LUC) 9 Sistema del gen reportero Luciferasa LUC luciferin + ATP + O2 oxyluciferin + AMP + PPi + CO2 + light (562 nm) luc Sistema de cámara CCD digital ultrasensible - Tiempo real - Sensibilidad luc+ IV. El gen reportero de la luciferasa 10 Uso de promotores en bananos modificados genéticamente Virus CaMV35S (derivados), ScBV, TaBV, BSV, BBTV Banano: actina, EFE, ACO1, ACC Emu, (ocs)3mas Arroz: actina Maíz: ubiquitina Arabidopsis: ubiquitina, tubulina Promotores heterólogos Plant Recombinante Promotores nativos Clases de promotores: Constitutivos, regulados de acuerdo al desarrollo de la planta, tejido específico, inducibles (estrés biotico/abiotico) Funcionabilidad/estabilidad, mayor aceptación por el público Bacteria nos V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 11 Aislamiento de promotores Trampeo de promotores “Promoter tagging” • Eficiencia en transformación genética • Cantidad de tejido/RNA • Alto nivel de expresión de genes Basados en técnicas de mRNA V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 12 Aislamiento de promotores en banano • Objetivo. Identificar y caracterizar promotores de banano para su uso en el desarrollo de bananos genéticamente modificados. V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 13 Trampeo de promotores a través de transformación con Agrobacterium T-DNA tagging vector Agrobacterium transformation DNA genómico Promotor gen LBRB Gene selectivoGen reportero RB LB Región 5’ Región 3’ mRNA Proteína reportera Ensayos en diferentes condiciones V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 14 400-600/Petri Dish 5,600-8,400/image Meses después de infección con Agrobacterium Fase 1 2 3 4 5 6 7 8 ... Colonias celulares Cultivo Análisis Vitroplantas Inducción de embrión Trampeo de promotores en banano Inducción para regeneración V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 15 Deteción de luciferasa en banano Colonias celulares Vitroplantas LUC Live ~42,000 346 V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 16 Detección de luciferasa en banano V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 17 26°C 8°C 26°C Detección de luciferasa en condiciones de baja temperatura en tiempo real Baja actividad LUC Alta actividad LUC V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 18 Análisis de la actividad de LUC durante regeneración V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 19 Actividad de promotores Expresión específica en raíz Expresión constitutiva Live LUC V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 20 Expresión específica en el pseudotallo Actividad de promotores V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 21 TAIL-PCR para el aislamiento de secuencias en la región 5’ 200 1500 1000 600 bp 200 2 3 1500 1000 M 600 bp2 3 AD2-1 AD2 2 3 2 3 AD2-1 1500 1000 800 400 M bp AD2 M2 3 AD2 SP2 RB pe35S-neo-T35Sluc+-Tnos LBpETKUL2 SP1 AD SP3 V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 22 Southern blot Contr. 17 85 123 34 49 82 102 156 1C 5C ET2-lines Promedio: 3.6 kb MM 21.2 5.2 3.5 2.0 Min.# copias T-DNA: 5 3 3 1 4 4 4 5 Sonda luc+ probe pETKUL2 V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 23 1 T-DNA 2 T-DNAs 3 T-DNAs …. Críptico V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 24 Cuál es la secuencia con actividad promotora? RB pe35S-neo-T35Sluc+-Tnos LB Producto amplificado Transcripción Cap Poly A mRNA RT-PCR Síntesis de cDNA cDNA RT-PCR V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 25 Análisis de la fusión transcripcional, RT-PCR Pseudostem Cormo Live LUC Pseudotallo V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 26 Clonación de promotores en el vector pCAMBIA 1391Z Banano Son los promotores identificados activos? V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 27 Validación de promotores identificados Inducción de embriones + + -+++ +++ pLS25 Ubi Colonia celular + + - + - V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 28 Actividad de promotores Colonia celular Inducción embriones Vitro planta Hoja Pseudotallo Raíz pES1 pES2 pLS25 17-1 (1.74 kb) 17-1 (1.35 kb) Ubi Non transformed 85-1 (0.60 kb)+ V. Caracterización y aislamiento de promotores y genes de banano 29 Agrobacterium-mediated transformation of banana ECS High-through put Early in vitro development stage and low temperature Late in vitro development stage and low temperature Luciferase screening Molecular characterization Southern blot analysis Isolation of T-DNA flanking sequences in silico analysis of banana sequences Transcriptional fusion analysis RT-PCR Cloning of candidate promoter sequences Back-transformation and promoter activity analysis Back- transformation Physicallinkage Low-through put 30 • Un sistema para la identificación de promotores en banano ha sido desarrollado. • El trampeo de promotores a través del T-DNA es confiable y reproducible en la caracterización y aislamiento de nuevos promotores en banano. Conclusiones 31 Perspectivas • Confirmación de expresión en diferentes estadíos de desarrollo de la planta y cultivares de banano (y plátano). • Utilización en generación de plantas de banano genéticamente modificados (bananos cisgénicos). 32 Agradecimientos • VLIR-ESPOL • Centro de Investigaciones Biotecnológicas del Ecuador (CIBE) -ESPOL 33 Laboratory of Tropical Crop Improvement KU Leuven Bioluminiscencia en Biotecnología de Plantas: Las Bananas resplandecen de luz! Contenido Plantas modificadas genéticamente Plantas modificadas genéticamente Genómica en Banano Expresión de genes Genes reporteros Genes reporteros Sistema del gen reportero Luciferasa Uso de promotores en bananos modificados genéticamente Aislamiento de promotores Aislamiento de promotores en banano Trampeo de promotores a través de transformación con Agrobacterium Deteción de luciferasa en banano Detección de luciferasa en condiciones de baja temperatura en tiempo real Actividad de promotores Actividad de promotores TAIL-PCR para el aislamiento de secuencias en la región 5’ Southern blot Cuál es la secuencia con actividad promotora? Conclusiones Perspectivas Agradecimientos Laboratory of Tropical Crop Improvement�KU Leuven
SIN SIGLA
Trinidad Lozano Mosquera
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