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Figura 1: Seis sistemas de relaciones (a-f) entre las especies A-E. (a) Sistema que representa La Gran Cadena del Ser; los caracteres (c) ‘progresan’ desde una especie ‘inferior’ E hasta una especie ‘superior’ A; la escala del tiempo (t), ascendente y conducente a la “perfección”, o descendente y conducente a la degradación, depende de la subjetividad del autor del sistema; (b) sistema quinario circular, con relaciones de contigüidad entre las especies, en el cual no es posible trazar vectores de progresión en el tiempo o de cambio en los caracteres; (c) agrupación fenética ([a + c]e[d + b]); nótese la escala de cambio relativo de los caracteres (c) y la ausencia del vector tiempo; (d) árbol genealógico en el que se reconoce un grupo monofilético [A+C] y el grupo parafilético [B + D]; nótese la presencia de un vector para la distancia patrística (c) en el eje x, y un vector de tiempo (t) en el eje y; (e) cladograma que contiene la mayor cantidad de información jerárquica, reflejada en la monofilia de un grupo y dos subgrupos (círculos); nótese la ausencia de un vector para la distancia patrística; (f) esquema de reticulación causada por la hibridación entre A y B para formar C. En (a), (b) y (c) no es posible una subordinación de grupos y subgrupos. (c) sistematización, cuando se buscan las relaciones jerárquicas entre los grupos de organismos (MAHNER; BUNGE, 1997; STEVENS, 1994). En este sentido, sistematización no significa formación de un sistema; por ejemplo, O’Hara (1996) establece una clara diferencia entre sistema o arreglo, entendido como un todo que está hecho de partes conectadas pero no incluídas unas en otras (Fig. 1 a, b), y clasificación, entendida como un procedimiento formal de subordinación de unos grupos dentro de otros (Fig. 1 d-f). Muchos autores contemporáneos (p. ej. NELSON; PLATNICK, 1981; SATTLER, 1986) reconocen que las relaciones entre los organismos son el objeto de estudio de la sistemática, en tanto que las clasificaciones son resultado de la sistemática y, a la vez, objeto de estudio de la taxonomía. De acuerdo a Mahner & Bunge (1997), la clasificación es una operación conceptual que posee las siguientes características: (a) Cada miembro de la colección original puede ser asignado a alguna clase 1; 1 Entendida como conjunto o agrupación, no como jerarquía lineana 164 (b) hay dos tipos de clases, simples o básicas y compuestas o formadas por la unión de dos o más clases simples; (c) cada clase simple está compuesta por algunos miembros de la colección original, y no puede ser subdividida en subclases; (d) cada clase es una categoría cuya membresía está determinada por un predicado o un conjunto de predicados, es decir, que los taxones son definidos por sus caracteres intrínsecos, no extrínsecos y que por lo tanto los primeros preceden a los segundos en un sistema de clasificación biológica; (e) cada clase es discreta en la medida que posee límites definidos; (f) dos clases son o mutuamente excluyentes y por lo tanto del mismo rango, o una de ellas está contenida en la otra y por lo tanto son de rangos diferentes; (g) en biología, no hay clases vacías ni debe haber miembros sin asignación a una clase; (h) solamente dos relaciones lógicas están involucradas en la clasificación: lamembresía, la cual es irreflexiva, asimétrica e intransitiva, o la inclusión, que a difiere de la anterior en que es transitiva; (i) la unión de las clases de un mismo rango forman la totalidad de la clase del rango inmediatamente superior; (j) todas las clases de un rango determinado no se intersectan entre sí, de tal forma que ningún individuo de la colección original pertenece a más de una clase del mismo rango. La primera parte del presente capítulo recopila una breve historia de la clasificación y de los criterios de la clasificación biológica, que, a diferencia de otras ciencias, es más compleja por los atributos particulares de los seres vivos. La segunda parte del capítulo discute la aplicación de los procesos de clasificación a entidades intraindividuales (genes) y explora los retos y dificultades que afronta la biología molecular actual en cuanto a la clasificación de genes u otras secuencias de material genético. 2 Aspectos históricos de la clasificación biológica A. P. De Candolle (1813) reunió las clasificaciones existentes hasta entonces en empí- ricas y racionales. Las clasificaciones empíricas se basan en convenciones independientes de los organismos tales como el arreglo alfabético, y por lo tanto no pueden ser trata- das como biológicas. Las clasificaciones racionales son aquellas basadas en caracteres 165 Capítulos La clasificación biológica: de especies a genes Aspectos históricos de la clasificación biológica