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PROBLEMAS DE RESOLUCIÓN ÁULICA Durante la clase se discutirán los temas propuestos en el temario a través de la resolución de los siguientes problemas: 1. Relación entre la Keq, ∆G° y la dirección de las reacciones químicas en condiciones estándar. En la siguiente tabla se muestran algunos valores de ∆G o’ y K´eq para distintas reacciones monomoleculares donde una sustancia (A) se transforma en otra (B). a- Escriba la fórmula que vincula ∆Go’ con la K’eq. ∆Go’ = -R.T. ln Keq’ b- Teniendo en cuenta la fórmula anterior, calcule los valores faltantes en la tabla utilizando los valores de las constantes R= 1.98cal/mol. 0K, T (250C)= 298 0K. Analice el valor de ∆Go’ y K’eq como criterio para predecir la reversibilidad de las reacciones. Keq’= e(∆Go’ /R.T) ∆Go’ = -R.T. In Keq’ Go’(kcal/mol) Keq’ 0 1 0.1 0,9 9 0.2 10 4.3x10-8 -10 1.2 -1 1 -10 2.3x107 2. Un adulto normal utiliza por día más de 80 moles de ATP a) ¿Por qué la reacción de hidrólisis de ATP es una reacción tan exergónica? Por sus 3 grupos fosfatos alfa beta y gama. El ATP es inestable por las cargas negativas en la cola del fosfato. Al hidrolizar se libera mucha energía 7,3 Kcal/mol en condiciones estándar y en condiciones no estándar 14 Kcal/mol. El ATP es inestable debido a esas cargas por lo que se repelen así: Disminuye la repulsión de cargas Estabilización por resonancia Ionización de los productos b) Indique los distintos sistemas de refosforilación del ADP y AMP. c) ¿Qué diferencias hay entre las fosforilaciones a nivel de sustrato y la fosforilación oxidativa en cuanto a la eficiencia y sustratos que puede fosforilar? La reacción a nivel de sustrato es más rápida ocurre en el citosol o citoplasma, es la producción de ATP a partir de ADP combinada a la transformación enzimática de un sustrato. No esta implicada ni la fosforilación ni una ATPsintasa. Un sustrato de alta energía cede su grupo fosfato al ADP Fosforilación oxidativa es más lenta involucra la cadena transportadora de electrones, ocurre en la membrana. Es el proceso de formas ATP mediante reacciones redox (oxido reducción). El Pi inorgánico que se acopla al ADP proviene de reacciones de oxidación biológica. Consiste en fosforilar adjuntar un Pi a cualquier sustrato orgánico que después será utilizado como combustible energético. d) ¿Qué reacción cataliza la enzima adenilato quinasa? Es una enzima reversible ¿En qué sentido estará desplazada la reacción en una fibra muscular en ejercicio intenso y en una en reposo? La adenilato quinasa cataliza la siguiente reacción: ATP + AMP 2ADP En el ejercicio intenso estará desplazada hacia Y en reposos estará desplazada hacia En la célula ambas ocurren y si es una enzima reversible 3. Fosforilaciones a nivel de sustrato Dados los ∆Go’ de las siguientes reacciones de hidrólisis ATP + H2O ADP + Pi ∆G o’ = - 7,3 kcal/mol P-creatina + H2O creatina + Pi ∆G o’ = - 10,3 kcal/mol a) Calcule el ∆Go’ de la fosforilación de ADP a expensas de la fosfocreatina, y la de la fosforilación de creatina a expensas del ATP. Fosforilación de ADP a expensas de la fosfocreatina: P-creatina + H2O + ADP + Pi creatina + ATP + H2O + Pi ∆Go’ = -10,3Kcal/mol + 7,3Kcal/mol ∆Go’ = -3Kcal/mol Fosforilación de creatinina a expensas de ATP: creatina + ATP + H2O + Pi P-creatina + H2O + ADP + Pi ∆Go’ = +10,3Kcal/mol -7,3Kcal/mol ∆Go’ = +3Kcal/mol b) ¿Cuál de las dos ocurría en condiciones estándar? La que tiene el ∆Go’ negativo la fosforilación de ADP a expensas de la fosfocreatina. c) En un organismo vivo ambas reacciones ocurren, dependiendo del estado metabólico. ¿Cómo lo explica? El metabolismo es un proceso que se utiliza para obtener energía química a partir de diversas formas de materia y energía. En un organismo vivo ocurren ambas reacciones porque de acuerdo con lo que se necesite ocurrirá una u otra reacción. Lo puede hacer acoplando reacciones para que sea una reacción exergónica etc. 4. Reacciones acopladas: En la hidrólisis de ATP a ADP y P i la concentración de equilibrio del ATP es muy pequeña para medirse con exactitud. Una forma mejor para determinar la K’eq, y por lo tanto el ΔG°’ de esta reacción es fraccionarlo en dos etapas cuyos ΔG°’ puedan determinarse con precisión. Para ello se usó el siguiente par de reacciones (la primera la cataliza la glutamina sintasa, enzima clave en el transporte de amonio al hígado) ATP + Glutamato + NH4 + ADP + Pi + Glutamina + H+ ΔG°’= -16.3 kJ/mol Glutamato + NH4 Glutamina +H2O + H + ΔG°’= 14.2 kJ/mol ¿Cuál es el ΔG°’ de hidrólisis del ATP de acuerdo con estos datos? ATP + Glutamato + NH4 + ADP + Pi + Glutamina + H+ ΔG°’= -16.3 kJ/mol Glutamina +H2O + H + Glutamato + NH4 ΔG°’= -14.2 kJ/mol ATP + H2O ADP + Pi ΔG°’= -16.3 kJ/mol-14.2 kJ/mol ΔG°’= -36,5 kJ/mol 5. Respecto al ΔG en condiciones celulares: En el citosol de los hepatocitos de rata el cociente de acción de masas (Q) es: Q= [ATP] / [ADP] [Pi] = 5,33x102 M-1 Calcular la energía libre requerida para sintetizar ATP en el hepatocito de rata. ΔG= In(5,33x102) ΔG= 6,27 En la síntesis cambia de signo M-1 indica que es negativo pasa a ser positivo 6. Ciclo de Krebs, cadena transportadora de electrones, ATP sintasa, inhibidores y desacoplantes. Dos amigas estudiantes de biotecnología se encuentran en el buffet y una le comenta a la otra: Ana: Ya encontré la forma de bajar de peso para la fiesta de casamiento de mi hermano dentro de 15 días! Me compré estas pastillas por internet. Paula: ¡En serio! ¿Qué es? Ana: 2,4 Dinitrofenol (DNP). Tengo que tomar 1 pastilla el primer día y luego 2 pastillas por los siguientes 4 días. Y de esa manera debería bajar 5 kg en 1 semana! Paula: Que bueno! Si a vos te funciona después yo también lo pruebo. ¿Qué hace el DNP? Ana: No lo sé... ¡pero no me importa! ¡Lo importante es que voy a llegar espléndida para la fiesta! Dos días después se vuelven a encontrar estas dos amigas. Paula: ¿Ana te sentís bien? Se te nota agitada, acalorada y colorada!! ¿Estuviste corriendo? Ana: ¡No corrí! Pero estoy preocupada porque me siento temblorosa, como acelerada!! A la vez débil, se me aflojan las rodillas. Y transpiro un montón! ¿Será porque en vez de tomarme una pastilla ayer a la tarde me tomé 2 juntas para acelerar la pérdida de grasa? Porque fíjate... no se nota que haya adelgazado!! Paula: Ana no me gusta nada como te ves! Vamos a la guardia del hospital. El médico de guardia la revisó a Ana y mando a internarla inmediatamente. Al otro día los padres de Ana le piden a Paula que por favor vayan a conversar con el médico que quería hacerle unas preguntas sobre Ana. Médico: Paula ¿Vos me decís que Ana tomó algo para adelgazar? ¿Te acordas cómo se llama? Paula: “Se llama dinitrofenol, lo compró por internet”- le dice Paula compungida y llorisqueando. ¿Eso es malo Doctor? ¿Cómo puede ser? Si se compra por internet!!! Médico: Mira…medicamente el DNP es una de esas drogas cuya dosis terapéutica es muy cercana a la dosis letal (LD50). Para que las drogas estén medicamente aprobadas la LD50 debe ser bastante más alta que la dosis terapéutica, por eso esta droga dejó de utilizarse hace muchos años! El DNP produce un estado hipermetabólico ya que es un desacoplante de la cadena transportadora de electrones!! Paula: Uyy me suena eso! Lo estudié en Química biológica! Médico: Ya que lo viste repasemos un poco y veamos cómo hace la célula para obtener energía. ¿En qué organela de la célula ocurre este proceso? Mitocondria a) Ayude a Paula a contestarle al médico. Indique cuales son los pasos necesarios para producir ATP a partir de solutos como glucosa, grasas y aminoácidos. Realice un esquema del ciclo de Krebs, que incluya sus intermediarios con fórmulas y enzimas participantes. Identifiquelos sustratos y productos, así como sus principales puntos de regulación con sus moduladores. Etapa 1: las grandes moleculas de los alimentos se fragmentan en unidades mas pequeñas. Digestion, no se genera energia util. Etapa 2: las moleculas pequeñas se degradan hasta unas pocas unidades simples que juegan un papel central en el metabolismo. Se genera pequeña cantidad de ATP. Etapa 3: se oxida completamente el grupo del AcetilcoA produciendo ATP. Mediante el ciclo del acido citrico + fosforilacion oxidativa. 1) El C metílico del acetilo se une al carbonilo (C2)de Oxa ΔG´°= -32,2 KJ/mol La Conc. Oxa es normalmente muy baja El CoA liberado se recicla para la PDH 2) Reacción reversible ΔG´°= 13,3 KJ/mol En la célula la reacción transcurre hacia laderecha por la rapidez en el cosnumo del isocitrato 3) Require Mn2 Sede electrones al NAD+ Pedida de CO2 ΔG´°= -21 KJ/mol 4) El NAD+ acepta electrones CoA transportador del gripo succinilo Pedida de CO2 ΔG´°= -33,5 KJ/mol 5) La hidrólisis del enlace tioester del Succinil-CoA libera mucha energía que es aprovechada para fosforilación de un GDP o ADP ΔG´°= -2,9 KJ/mol 2 Isoencimas 6) Reversible La SD se encuentra unida a la mem mitocondrial interna ΔG´°= 6 KJ/mol Contiene 3 agrupaciones de Hierro-Azufre y un FAD unido covalentemente Involucrada en la cadena de transporte de electrones Inhibida por malonato 7) reversible ΔG´°= -3,8 KJ/mol 8) En células el Oxa se elimina muy ŕápido y su concentración es muy baja (uM) desplazando la reacc a la formación de Oxa ΔG´°= 29,7 KJ/mol Paula: A mí siempre me costó entender por qué el hecho de convertir O2 en H2O ayuda a generar ATP. b) Como médico, ¿le podría explicar ésto a Paula? Utilice el siguiente esquema para explicar el proceso de transporte de electrones y síntesis de ATP en la mitocondria. Los electrones (transportados por NADH y FADH2) de la glucolisis y el ciclo de Krebs alimentan la cadena transportadora de electrones. La cual bombea protones (H+) hacia afuera de la mtriz rumbo al espacio intermembrana. El bombeo de protones genera un gradiente de H+ y de cargas entre el espacio intermembrana y la matriz mitocondrial. i) Identifique los cuatro complejos que forman la cadena respiratoria. I: NADH Q oxidorreductasa /proteína / bomba de H+ II: succinato deshidrogenasa / proteína /conexión con el ciclo de Krebs III: Q citocromo c oxidorreductasa / proteína / bomba de H+ IV: citocromo c oxidasa / proteína / bomba de H+ Q: ubiquinona o coenzima Q / quinona Citocromo c: proteína/ transportador móvil ii) Nombre los componentes que aceptan y donan electrones en cada complejo. NAD+ + 2 H+ + 2 e- NADH + H+ 1 H+ y 2 e- FAD + 2 H+ + 2 e- FADH2 2 H+ y 2 e- FMN + 2 H+ + 2 e- FMNH2 2 H+ y 2 e- UQ + 2 H+ + 2 e- UQH2 2 H+ y 2 e- Cyt-Fe3+ + e- Cyt-Fe2+ Solo 1 e- S-Fe3+ + e- S-Fe2+ Solo 1 e- Estos transportadores se hallan organizados en COMPLEJOS que se localizan en la membrana mitocondrial interna (los respirosomas). iii) Identifique los complejos que producen suficiente energía para bombear protones. Complejo I, III, IV iv) Explique cómo se forma el gradiente de pH y de carga e indique como contribuyen a formar la fuerza protomotriz. Al bombear protones al espacio intermembrana genera un gradiente que se produce entre la concentración de protones de la matriz y la del espacio intermembrana y tiene dos componentes, una energía química por la diferencia de concentraciones y una energía eléctrica por el cruce de cationes sin un contra catión (se acumula una gran cantidad de cargas positivas en el espacio intermembrana) v) Describa la estructura de la ATP sintasa y explique la función de cada una de sus subunidades. Escriba la reacción que cataliza esta enzima. F1 tiene 9 subunidades y 3 sitios cataliticos F0 proteina integral, canal transmembrana para protones y tiene 3 subunidades a, b y muchas c que forman un anillo giratorio asociado al tallo. vi) Explique en qué consisten los sistemas de transporte de nucleótidos y fosfato a través de la membrana mitocondrial interna. Agréguelos al dibujo e indique el sentido en el que se transportan dichos compuestos. Es un sistema de dadores y aceptores de electrones que funcionan espontáneamente hacia el aceptor final el O2. Los sistemas de transporte se hacen mediante NAD+ nicotiamida adenina dinucleótido pasa de su estado oxidado a su estado reducido NADH. Es una coenzima que interacciona con la enzima por uniones débiles. Y por FAD flavina adenina dinucleótido que de su estado oxidado pasa a su estado reducido FADH2, unido a la enzima por unión covalente. vii) Defina “fosforilación a nivel de sustrato” y “fosforilación oxidativa”. ¿A qué se denominan “compuestos con elevado potencial de transferencia de grupos fosfato”? Dé ejemplos. Fosforilación oxidativa a nivel de sustrato ya esta respondida en puntos anteriores Son aquellos que tiene n un elevado potencial de transferir su grupo fosfato así formar ATP por ejemplo Médico: ¿Te quedó claro Paula cómo se acopla la cadena transportadora de electrones con la síntesis de ATP? Paula: Sí sí con ese esquema lo entendí perfecto!! Médico: Bien. Ahora pensemos que pasaría si le agregamos a un tubo, que contiene mitocondrias aisladas, cianuro. Por supuesto que aparte de mitocondrias tenemos ADP, Pi y algún sustrato dador de electrones como el succinato, todo en un buffer adecuado. c) ¿Qué efecto produce el cianuro? ¿Cómo será el consumo de O2 de esas mitocondrias? ¿Y la producción de ATP? Inhibe la transferencia de electrones al unirse a la citocromo oxidasa (IV) inhibiéndola. El consumo de O2 aumenta y no se produce ATP Inhiben la disipación del gradiente electroquímico que evita la transferencia de energía necesaria para la síntesis de ATP, al mantenerse elevado el gradiente el transporte de electrones se detiene. Médico: Perfecto. Ahora pensemos que ocurre si agregamos el antibiótico oligomicina al tubo con mitocondrias. ¿Qué ocurre? d) ¿Qué efecto produce la oligomicina? ¿Cómo será el consumo de O2 de esas mitocondrias? ¿Y la producción de ATP? La oligomicina inhibe a la ATPsintasa actuando sobre la subunidad F0 transportador de protones el consumo de O2 aumenta y no se produce ATP. Inhiben la disipación del gradiente electroquímico que evita la transferencia de energía necesaria para la síntesis de ATP, al mantenerse elevado el gradiente el transporte de electrones se detiene. Médico: Como verás no es tan directa la respuesta. Y aquí están las bases que explican porque la cadena transportadora de electrones esta acoplada a la fosforilación oxidativa. Paula: Pero no me queda muy claro cómo se sintetiza ATP e) Con la ayuda del siguiente gráfico ayude al médico a explicarle a Paula cómo funciona la ATP sintasa Cuando el tallo rota se genera un cambio conformacional en la cabeza, cuando este tallo vuelve a su estado libera energía que es la que se utiliza para la síntesis de ATP Médico: Paula, con todo esto en mente, retomemos con el DNP. Te acordás que te dije que es un desacoplante de la fosforilación oxidativa. ¿Cómo crees que funcionan los desacoplantes? f) Ayudá a Paula a contestar esta pregunta. Si volvemos al experimento de tener mitocondrias aisladas en un tubo de ensayo con todos los sustratos y condiciones necesarias para estar activas, como sería el consumo de O2 de las mismas y la producción de ATP en presencia de DNP? El DNP es apolar atraviesa tranquilamente la membrana se une ya que es muy liposoluble rompe el gradiente de protones. El consumo de O2 es mayor y no hay producción de ATP g) Explique el mecanismo de acción de DNP En el espacio intermembrana la base conjugada se convino con los protones generando el ácido débil que atraviesa la matriz mitocondrial interna y en la matriz se disocia la base y el hidrogeno por el pH ligeramente alcalino. Es decir,disipan el gradiente electroquímico al facilitar la entrada de protones a la matriz. Hay transporte de electrones, pero no la fosforilación oxidativa. Médico: Bien Paula! ¿Ahora entendés por qué la viste a Ana agitada, débil y sudorosa cuando la trajiste al hospital? Paula: Siii!!! h) Explique por qué Ana presentaba esos síntomas por el consumo de DNP Porque se disipa la energía en forma de calor entonces hay hipertermia no puede controlar el calor por lo que produce que transpire mucho lo cual la deshidratación, incrementa el ritmo respiratorio porque aumenta el consumo de O2 porque al no producir ATP la célula se esfuerza cada vez mas por aumentar el ritmo respiratorio para producir ATP. Esta cansada porque el metabolismo aumenta mucho y además consume constantemente las reservas energéticas. Paula: Doctor ¿Ana se va a recuperar? Médico: Sí, yo creo que sí. Pero ese es el peligro de las drogas con una dosis terapéutica cercana a la LD50, un leve cambio en la dosis, como consumir 2 pastillas a la vez puede ser letal ya que hay mucha variación fisiológica entre individuos. No nos olvidemos que existen desacoplantes fisiológicos, como la termogenina. i) ¿Qué función tiene la termogenina y en qué tejido se expresa? Esquematice La termogenina es un desacoplante natural es en la grasa parda para obtener calor es común en los bebes Médico: Los pacientes con hipertiroidismo se caracterizan por tener un elevado metabolismo basal. Los pacientes normalmente pierden peso a pesar de tener apetito, y poseen aumentada sudoración. j) ¿Cómo justificaría esta sintomatología? ¿Cómo actúan las hormonas tiroideas? Porque en los personas con hipertiroidismo hay hipertermia porque hay mucho catabolismo trabaja mucho la T3 ya que hay una producción mayor de estas hormonas tiroideas y de esa forma genera la síntesis de una proteína desacoplante la UCP1 que es la termogenina Médico: Bueno Paula a causa de la sobredosis con DNP de tu amiga repasamos un montón de temas! Suerte y ojo con lo que consumen. 7. Toxicidad del oxígeno y daño oxidativo La terapia suplementaria de O2 puede utilizarse para el tratamiento de los pacientes con hipoxemia, dificultad respiratoria o tras la exposición a monóxido de carbono. En condiciones normobáricas, la fracción de O2 en el aire puede incrementarse a casi 100%. Luego de pocas horas de exposición, los pacientes desarrollan dolor de pecho, tos y daño alveolar, luego edema y la función pulmonar queda afectada. Sin embargo, experimentos en ratas en las que les fueron incrementando gradualmente la presión parcial de O2 durante varios días, mostraron una protección efectiva al daño pulmonar. a) ¿Por qué es necesario el aumento inmediato en la presión parcial de O2 ante una exposición a CO? La hemoglobina presenta una mayor afinidad por el monóxido de carbono, que, por el oxígeno, desplazando a éste fácilmente. A causa de la afinidad del monóxido de carbono por la hemoglobina, hay una formación progresiva de COHb; esta formación depende del tiempo que dure la exposición al CO, de la concentración de este gas en el aire inspirado y de la ventilación alveolar. Por eso es necesario el aumento inmediato de O2 para que compita con CO al ser mayor la cantidad de oxigeno b) ¿Cómo explica el daño producido por el O2? El O2 si se reduce en forma incompleta puede formar radical hidroxilo OH altamente inestable y que va a tender a producir la reacción OH +RH ------ H2O +R lo que a su vez genera que R+O2 ---------RO2. El anion superóxido se produce en varios pasos de la cadena transportadora de electrones, este puede dañar a toda clase de moléculas orgánicas incluyendo el ADN mitocondrial produciendo Estrés oxidativo ocurre cuando se altera la homeostasis de óxido-reducción celular y provoca daño de biomoléculas En los organismos aerobios bajo ciertas condiciones el oxígeno puede ser tóxico por la formación de las especies reactivas (ERO) c) ¿Cuál es la razón de la protección al daño tisular en respuesta al aumento progresivo de la presión parcial de O2? Porque al ser progresivo el aumento permite adaptarse al mismo y generar diferentes formas para lidiar con los radicales libres ejemplos. Enzimática: SOD, CAT, GPx No enzimática: vitaminas E y C, GSH, CoQ, ácido úrico cuyo ∆G°’ es + 7,0 kcal/mol. ¿Cómo puede explicar el hecho de que, en la célula, la reacción proceda en la dirección de la producción de oxalacetato?
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