Prácticamente cualquier propiedad de un microorganismo puede ser alterada por mutación. Entre los tipos de mutantes más frecuentemente estudiados están:
Mutantes cuya resistencia a agentes inhibidores está aumentada, principalmente su resistencia a los antibióticos.
Mutantes que presentan alterada alguna propiedad fermentativa, como es el caso de algunas bacterias que eran capaces de fermentar un determinado carbohidrato y dejan de hacerlo.
Mutantes cuyas vías anabólicas son alteradas perdiendo la capacidad de sintetizar algún nutriente que les es esencial, requiriendo un medio de cultivo al cual hay que añadirle dicho nutriente.
Mutantes que pierden la motilidad por incapacidad para sintetizar la proteína flagelar.
Las mutaciones no selectivas son aquellas en las cuales el carácter que ha mutado no les representa ventaja o desventaja alguna.
Una mutación selectiva le confiere a la mutante ventajas sobre ciertas condiciones ambientales, de manera que la descendencia de esa mutante puede crecer en un determinado medio mientras que las no mutantes no lo pueden hacer.
Las mutantes que han perdido la capacidad de sintetizar un nutriente que les es imprescindible, pueden también ser aisladas mediante el método de la REPLICA EN PLACA.
Las mutaciones puntuales no son siempre letales, las transiciones y transversiones son relativamente benignas porque inducen la sustitución de un solo aminoácido en la cadena peptídica que es codificada por el gen mutado, y en muchas oportunidades la proteína, aunque defectuosa, es todavía funcional, pasando inadvertida la mutación, por lo que se denomina MUTACIÓN SILENCIOSA.