La humedad es el factor más importante para un buen desmote. El algodón no debe sobrepasar el 11% de humedad; porcentajes mayores disminuyen el rendimiento de la fibra. Los algodones inmaduros recolectados se reconocen por sus fibras de color brillante y por tener un menor tamaño de lóbulos. La presencia de gran cantidad de neps, naps, motes y algodones grises afecta la resistencia y longitud de la fibra. Las materias extrañas, como restos del cultivo, brácteas, peciolos, cacotas, hojas, tabaquillo, arena, tierra, cabuya y excremento, también afectan la calidad de la fibra. La melaza y fumagina son características que afectan la calidad de la fibra y reducen la eficiencia del desmote. Las manchas causadas por insectos como los chinches del género Dysdercus sp. son otra causa importante que afecta la calidad de la fibra; otros insectos atacan las cápsulas deteriorando las semillas y la fibra.
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