3. Regulación de la transcripción. En operones procariotas, los genes reguladores y los promotores que controlan son adyacentes, pero en eucariotas los genes reguladores rara vez son adyacentes a los promotores que controlan. Como previamente señaló, una clase de sitios de reglamentación llamado '* potenciadores 'puede ser de varios cientos de pares de bases aguas arriba o aguas abajo de los promotores que estimulan. También difícil de entender es cómo conjuntos de genes en diferentes cromosomas están regulados coordinadamente. Algunos modelos de gen-regulación en eucariotas tienen propuso que cada gen en un conjunto coordinado está precedida por la misma secuencia reguladora de manera que se todo responder a la misma señal, pero quizás no en la misma medida. También es posible que un conjunto de genes podrían responder a más de una señal o combinaciones de señales En un modelo, estas posibilidades se pueden alojar por proponen que algunos genes son adyacentes a múltiples secuencias del receptor, sólo uno de los cuales tiene que recibir una señal para la activación, o por tener receptores individuales y multicomponente moléculas de señal.