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UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO FACULTAD DE CIENCIAS CUANTIFICACIÓN DE LA EXPRESIÓN DE COLÁGENO EN CÉLULAS PULMONARES EXPUESTAS A HIPOXIA T E S I S QUE PARA OBTENER EL TÍTULO DE: BIÓLOGO P R E S E N T A : DANIEL OROZCO VARGAS DIRECTOR DE TESIS: DR. ARNOLDO AQUINO GÁLVEZ MÉXICO, D.F. 2014 UNAM – Dirección General de Bibliotecas Tesis Digitales Restricciones de uso DERECHOS RESERVADOS © PROHIBIDA SU REPRODUCCIÓN TOTAL O PARCIAL Todo el material contenido en esta tesis esta protegido por la Ley Federal del Derecho de Autor (LFDA) de los Estados Unidos Mexicanos (México). El uso de imágenes, fragmentos de videos, y demás material que sea objeto de protección de los derechos de autor, será exclusivamente para fines educativos e informativos y deberá citar la fuente donde la obtuvo mencionando el autor o autores. Cualquier uso distinto como el lucro, reproducción, edición o modificación, será perseguido y sancionado por el respectivo titular de los Derechos de Autor. JURADO ASIGNADO: PRESIDENTE: M. en C. Martha Montaño Ramírez VOCAL: Dr. Jorge Antonio García Alvarez SECRETARIO: Dr. Arnoldo Aquino Gálvez 1° SUPLENTE: Dr. José Guadalupe Cisneros Lira 2° SUPLENTE: M. en C. María de los Remedios Josefina Ramírez Rangel Este trabajo experimental fue realizado en el Departamento de Oncología Biomédica del Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Ismael Cosío Villegas. ASESOR: Arnoldo Aquino Gálvez SUSTENTANTE: Daniel Orozco Vargas DEDICATORIA A MIS PADRES Saúl y Rachel. Por sus sacrificios para sacar adelante mi devenir; por darme amor, educación, principios y valores. Por todo el apoyo moral y recursos necesarios que me ofrecieron durante el trayecto de mi carrera. Quienes por ellos soy ahora quien soy, por enseñarme sobre el valor de las cosas, y siempre esforzarse por cumplir para obtener todos los logros posibles. A MI HERMANA Sandra. Por su apoyo moral, impulso, ánimos para continuar y los buenos momentos que hemos compartido a lo largo de nuestra vida. A MIS AMIGOS Ehécatl. Por todos los momentos tan “PRO” que hemos vivido con la comunidad de la rosca hasta ahora. Verenice, Mariana, Adylene, Erika y sus respectivas familias. Por siempre recibirme en su casa y hacerme parte, además por su alegría, afecto, consejos y buenos momentos que hemos vivido. A ustedes en general por sostener una amistad tan genial y perdurable. A MIS PRIMOS Leticia, Erick y Rodrigo. Quienes gracias a ustedes tuve una infancia tan bonita, tan divertida, con todas la travesuras que un niño debe de vivir para sentirse muy bien acompañado y con muchas ganas de ir al siguiente día a visitarlos para más. A todos ustedes, solo quiero decir que tal vez me haya quedado corto de palabras, algo me dice que podría escribir más sobre ustedes, pero me tomaría muchas más páginas si quisiera desglosar todas las cosas invaluables que me han brindado. Entonces quiero decirles a todos ustedes que son personas medulares en mi vida, que me siento bendecido por tenerlos cerca y espero que así siga siendo por muchísimo tiempo y compartir nuevas experiencias. AGRADECIMIENTOS Mis compañeros de la Facultad A Teresa Beatriz, Yashir Jonathan , Karina , Janette , Armando , Lynn ; que no solo han sido mis compañeros o colegas, sino también grandes amigos de quienes también he podido extraer un valioso significado a nuestra convivencia y espero que esta amistad siga fortaleciéndose. Ana Belén CJ Por todo su apoyo incondicional, su comprensión, cariño y lecciones transmitidas, tanto en el ámbito académico como en el ámbito personal. Durante esta bonita relación contigo he vivido nuevas experiencias: muy valiosas y muy bonitas; de las cuales espero ser reciproco, y puedas obtener algo provechoso de mí. A todo esto, muchas gracias por estar a mi lado. El equipo del Laboratorio de Oncología Biomédica Dra. Georgina Gonzáles, Dr. Arnoldo Aquino (como mi tutor), QFB Rosa A. Gonzáles, Técnico Cuauhtémoc Sandoval por su apoyo, amistad y enseñanzas durante este largo proceso de concluir un pequeño proyecto de investigación. Y en especial Biólogo Javier Delgado Tello por todos sus invaluables consejos y anécdotas, por prevenirme, por sus divertidísimas pláticas y sentido del humor, y por todo su apoyo desinteresado durante mi estancia en el laboratorio. Eres una de las personas a quienes más admiro y me han transmitido un valioso ejemplo a seguir. Los equipos de investigación del: Departamento de Investigación en Fibrosis Pulmonar. Por proporcionarnos amablemente los cultivos primarios de fibroblastos y prestarnos algunos equipos necesarios para este trabajo. Departamento de Biología Molecular. Por prestarnos equipo y reactivos necesarios para los ensayos de expresión génica. Departamento de investigación en inmunología. Por prestarnos el equipo para los ensayos de expresión génica. Dr. Manuel de Jesús Castillejos López Por asesorarnos y ayudarnos a elegir el análisis estadístico más apropiado para este estudio ÍNDICE Resumen Lista de abreviaturas Antecedentes……………………………………………………………………...…...1 Fibrosis Pulmonar Idiopática……..…………………………………………..1 Hipoxia y fibrosis……………………………………………………………………....5 Factor de Transcripción Inducible por Hipoxia (HIF)……..………………..6 Factor de Crecimiento Transformante Beta 1 (TGF-β1) y α-Actina de Músculo Liso (α-SMA).…………………………………………………………………………..9 Metaloproteasa de Matriz 1 (MMP-1) e Inhibidor Tisular de Metaloproteasas 1 (TIMP-1)…...……………………………………….………………………………....11 Colágena……………………………………………………………………………...15 Síntesis de la colágena………………………………………...……………18 Fibroblasto…………………………………………………………………………….21 Miofibroblasto…………………………………………………………………23 Justificación………………………………………………………………………......25 Hipótesis……………………………………………………………………………....26 Objetivo general………………………………………………………………………27 Objetivos particulares………………………………………………………………..27 Material y métodos…………………………………………………………………...28 Cultivo celular…………………………………………………………...……28 Extracción de RNA……………………….…………………………………..28 Transcripción Inversa………………………………………………………..30 Análisis de la expresión génica por PCR en tiempo real………………………...31 Cuantificación Relativa……………………………………………………....31 Sonda TaqMan®………………………………………………………………32 Gráficas de amplificación con PCR en tiempo real……………………....33 Procedimiento de la cuantificación relativa………………………………..34 Elección del gen endógeno como normalizador de los resultados……..35 Análisis de los ensayo de la cuantificación relativa………………………36 Evaluación de genes implicados en la fibrosis pulmonar idiopática en células pulmonares expuestas a hipoxia………………………………..…37 Análisis estadístico…………………………………………………………………..39 Resultados…………..……………………………………………………………......40 Expresión de HIF-1α en fibroblastos FN y FF……….……………….…...40 Expresión de HIF-2α en fibroblastos FN y FF…………….….…………...42 Expresión de TGF-β1 en fibroblastos FN y FF……………………..….....44 Expresión de α-SMA en fibroblastos FN y FF………………………….....46 Expresión de Col-I en fibroblastos FN y FF…………………..…………...48 Expresión de Col-III en fibroblastos FN y FF………………………..…….50 Expresión de MMP-1 en fibroblastos FN y FF…………………...............52 Expresión de TIMP-1 en fibroblastos FN y FF…………………………….54 Discusión………………………………………………………………………….…..56 Conclusión………………………………..……………………………………….….66 Perspectiva……………………………...……………………………………………67 Referencias……………………………...…………………………………………....68 Imágenes…………………………………………………………………...…74 Tablas………………………………………………………………………….74 RESUMEN La fibrosispulmonar idiopática (FPI), es una enfermedad de etiología desconocida, progresiva y letal. Esta patología se considera el resultado de una compleja interrelación de factores ambientales y factores propios del paciente. Mediante ensayos de PCR en Tiempo Real, se estudió la expresión génica de 8 factores implicados en la fibrosis: HIF1α, HIF-2α, TGF-β1, α-SMA, MMP-1, TIMP-1, Col-I, Col-III; involucrados en el desarrollo de la FPI en cultivos primarios de fibroblastos de pulmón normal o control (FN) y otra de fibroblastos derivados de pacientes con FPI (FF), con el objetivo de dilucidar sí la hipoxia puede representar un cofactor en el desarrollo de la FPI. Los resultados mostraron que en ambos tipos celulares bajo condiciones de hipoxia: se manifiesta una mayor expresión de TIMP-1 comparado con MMP-1, lo cual sugiere que la hipoxia podría causar un desequilibrio en el metabolismo de la MEC; además de que se presenta una sobreexpresión de genes implicados en el desarrollo de la FPI (HIF-1α, HIF-2α, TGF-β, α-SMA, Col-I y Col-III). En este trabajo llegamos a la conclusión de que la hipoxia puede desempeñar un papel en el desarrollo de la FPI, por lo tanto puede tener una implicación en la sobreexpresión de marcadores profibróticos y proteínas de Matriz Extracelular (ECM), además de inducir un desequilibrio en la expresión de genes relacionados con el metabolismo de la ECM. LISTA DE ABREVIATURAS 18S (Conocido en inglés como “18S ribosomal RNA”) RNA ribosomal 18S ARD-1 (Conocida en inglés como “Acetyltransferase”) Acetiltransferasa ARNT (Del inglés “Aryl-hydrocarbon Receptor Nuclear Translocator”) Translocador de Receptor para Aril-Hidrocarburos bHLH/PAS (Del ingles “basic Helix-Loop-Helix/Per-Arnt-Sim) Hélice-Bucle-Hélice básica/dominio PAS Col-I (Conocida en inglés como “Collagen-I”) Colágena tipo I Col-III (Conocida en inglés como “Collagen-III”) Colágena tipo III EPID Enfermedades Pulmonares Intersticiales Difusas DMEM (Del inglés “Dulbecco’s Modified Eagle Medium”) Medio Eagle Modificado de Dulbecco DNA (Del inglés “Deoxyribonucleic Acid”) Ácido Desoxirribonucleico cDNA (Del inglés “complementary DNA”) Ácido Desoxirribonucleico complementario ECM (Del inglés “Extracelular Matrix”) Matriz Extracelular EDTA (Conocida en inglés como “Ethylenediaminetetraacetic Acid”) Ácido Etilendiaminotetra-Acético EGF (Del inglés “Epidermal Growth Factor”) Factor de Crecimiento Epidérmico EMT (Del inglés “Epithelial to Mesenchymal Transition”) Transición Epitelio Mesénquima EPO (Conocida en inglés como “Erythropoietin”) Eritropoyetina ET-1 (Del inglés “Endothelin-1”) Endotelina-1 FBS (Del inglés “Fetal Bovine Serum”) Suero Fetal Bovino GAPDH (Del inglés “Glyceraldehyde 3-Phosphate Dehydrogenase”) Gliceraldehído-3-Fosfato Deshidrogenasa Ham’s F-12 (Conocido en inglés como “Ham's F12 Nutrient Mixture”) Mezcla de Nutrientes Ham F-12 HIF (Del inglés “Hypoxia Inducible Factor”) Factor Inducible por Hipoxia HPRT (Del inglés “Hypoxanthine-guanine Phosphoribosyltransferase”) Fosforribosiltransferasa de Hipoxantina-Guanina HRE (Del inglés “Hypoxia Response Element”) Elemento de Respuesta a Hipoxia IGF-2 (Del inglés “Insulin-like Growth Factor 2”) Factor de Crecimiento Insulínico tipo 2 IL-1 (Conocida en inglés como “Interleukin-1”) Interleucina 1 IL-4 (Conocida en inglés como “Interleukin 4”) Interleucina 4 FPI Fibrosis Pulmonar Idiopática MMP (Del inglés “Matrix Metalloproteinase”) Metaloproteasa de Matriz ODDD (Del inglés “Oxygen Dependent Degradation Domain”) Dominio de Degradación Dependiente de Oxígeno OPN (Conocida en inglés como “Osteopontin”) Osteopontina PAI-1 (Del inglés “Plasminogen Activator Inhibitor”) Inhibidor del Activador de Plasminógeno 1 PCR (Del inglés “Polymerase Chain Reaction”) Reacción en Cadena de la Polimerasa PDGF (Del inglés “Platelet-Derived Growth Factor”) Factor de Crecimiento Derivado de Plaquetas PHD (Conocida en inglés como “Prolyl Hydroxylase”) Prolilhidroxilasa RER (Del inglés “Rough Endoplasmic Reticulum”) Retículo Endoplasmático Rugoso RNA (Del inglés “Ribonucleic Acid”) Ácido Ribonucleico mRNA (Del inglés “messenger RNA”) Ácido Ribonucleico mensajero RT-PCR (Del inglés “Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction”) Reacción en Cadena de la Polimerasa con Transcriptasa Inversa TAD-C (Conocida en inglés como “Terminal Transactivation Domain-C”) Dominio Terminal de Transactivación C TGF-β1 (Del inglés “Transforming Growth Factor β”) Factor de Crecimiento Transformante β1 TIMP (Del inglés “Tissue inhibitor of metalloproteinase”) Inhibidor Tisular de Metaloproteasa TNF-α (Del inglés “Tumor Necrosis Factor α”) Factor de Necrosis Tumoral α UIP (Del inglés “Usual Interstitial Pneumonia”) Neumonía Intersticial Usual VGEF (Del inglés “Vascular Endothelial Growth Factor”) Factor de Crecimiento Endotelial Vascular pVHL (Conocida en inglés como “protein Von Hippel Lindau”) proteína Von Hippel Lindau 2014 Orozco Vargas Daniel 1 ANTECEDENTES Fibrosis Pulmonar Idiopática El conocimiento de la estructura del tracto respiratorio es necesario para la identificación y el tratamiento de las diversas manifestaciones patológicas de este sistema. El sistema respiratorio de manera funcional y dicotómica lo podemos dividir en tres secciones (véase figura 1); la “parte conductora” que está compuesta por tubos (fosas nasales, faringe, laringe, tráquea, bronquios, bronquiolos y bronquiolos terminales) que conducen el aire a los pulmones; la “parte de transición” compuesta por tubos que bifurcan en tubos aún más pequeños (bronquiolos respiratorios y conductos alveolares); y la “parte respiratoria” que consiste de sacos donde se realiza el intercambio gaseoso (alvéolos) (1). Figura 1. Las principales partes del aparato respiratorio [1i] 2014 Orozco Vargas Daniel 2 La Fibrosis Pulmonar Idiopática (FPI) es la más frecuente de las Enfermedades Pulmonares Intersticiales Difusas (EPID). Esta enfermedad se caracteriza por ser la más agresiva de las EPID, siendo progresiva, irreversible y letal en un periodo breve de tiempo (≈ 3-6 años a partir del inicio de los síntomas). Ocurre habitualmente en sujetos mayores de 50 años y alcanza su pico de incidencia alrededor de los 60-65 años (2). La patogénesis de la FPI aún no se conoce con claridad pero se presume que representa una respuesta anormal de un paciente genéticamente susceptible a una agresión al endotelio y/o epitelio alveolar, producido por estímulos de variada naturaleza como contaminantes ambientales, agentes infecciosos, agentes químicos, genéticos, etc. (3). Se ha reportado que en los alveolos la activación aberrante de células epiteliales y fibroblastos juega un papel crítico en la patogénesis de la FPI; la activación epitelial es seguida por un proceso complejo y dinámico caracterizado por la migración y proliferación de los fibroblastos y su diferenciación a miofibroblastos. La proliferación de fibroblastos se presenta como una respuesta que trata de reparar el daño alveolar. Este proceso dura de 1 a 2 semanas y es seguido por depósito de colágena en los meses siguientes (3)(4). Una característica esencial para el desarrollo de la FPI es la formación de focos de fibroblastos distribuidos ampliamente en el parénquima pulmonar, que comportándose como pequeñas áreas de lesión pulmonar aguda, en los cuales se destruyen las células que recubren el alveolo (células epiteliales) y se desnuda la membrana basal; estos focos de proliferación fibroblástica también contribuyen a 2014Orozco Vargas Daniel 3 la acumulación de moléculas de la ECM (principalmente colágena) dañando la integridad de los alveolos. Todos estos cambios en el microambiente alveolar producen en consecuencia un remodelado en la arquitectura o estructura del pulmón (véase Figura 2) afectando la función de intercambio gaseoso (5). Existen al menos dos perturbaciones importantes en los pulmones fibróticos: la acumulación de ECM en los espacios intersticiales y alveolares y la desorganización de las membranas basales. En estadios avanzados, los pulmones fibróticos contienen 2 a 3 veces más ECM que los pulmones normales, incluyendo colágenas (I, III, V, VI y VII), fibronectina, elastina, y proteoglicanos (6). 2014 Orozco Vargas Daniel 4 Figura 2. Esquema histológico de un pulmón sano y uno con FPI (Imagen modificada) [2i] . (A) Ampliación de la estructura alveolar, con paredes alveolares conservadas y una capa intacta de células del epitelio bronquial y alveolar. (B) El epitelio dañado con cambios hiperplásicos y apoptóticos, con EMT, contribuyendo a la acumulación subepitelial de miofibroblastos activados. El engrosamiento pleural implica un aumento de la proliferación y migración de las células mesoteliales y pericitos, contribuyendo a la formación de focos de fibroblastos. 2014 Orozco Vargas Daniel 5 Hipoxia y fibrosis Una serie de experimentos quirúrgicos han documentado la existencia de un microambiente relativamente hipóxico dentro de zonas lesionadas (7)(8)(9). Se ha reportado que los fibroblastos dérmicos humanos sometidos a ambientes hipóxicos sobreexpresan Col-Iα un 170% más respecto de los valores basales (0 hrs en normoxia) a las 24 horas de exposición, por otro lado la expresión de MMP- 3, disminuyó a un 2.2% del valor basal (0 horas en normoxia) a las 48 horas con el estímulo; remarcando así un proceso a favor de la deposición de ECM y en contra su degradación en varios tejidos en respuesta al daño tisular y la hipoxia (10). También se ha escrito que la hipoxia incrementa la proliferación de fibroblastos en el pulmón contribuyendo así a la deposición de colágenas fibrilares y por ende, la progresión de enfermedades pulmonares asociadas con la hipoxia. La hipoxia induce la síntesis de Col-I, disminuye la MMP-2 en células epiteliales renales, y aumenta el Inhibidor del Activador de Plasminógeno-1 (PAI-1), al Inhibidor Tisular de MMPs 1 (TIMP-1), y al Factor de Crecimiento de Tejido Conjuntivo a través de la respuesta transcripcional mediada por HIF (11)(12). En un estudio realizado por Storch TM y Talley GD, se hicieron pruebas con fibroblastos humanos de epidermis fetal (línea GM6166) exponiéndolas a un ambiente hipóxico de 2.5% de O2. En el ensayo se demostró que la condición hipóxica incrementa la velocidad de división y la densidad final de los fibroblastos cultivados in vitro. En este trabajo se llegó a la hipótesis de que un mecanismo de acción podría ser: cambios en la conjugación, agrupamiento e internalización de 2014 Orozco Vargas Daniel 6 receptores de superficie, afectando así la respuesta mitogénica a factores de crecimiento (13). Por otro lado las células endoteliales expuestas a baja tensión de oxígeno (hipoxia) han mostrado una actividad proliferativa mayor en comparación a condiciones normóxicas (~20% de O2) (14), además de que éstas sintetizan una serie de nuevas proteínas reguladas por oxígeno (15). En un trabajo reciente se analizaron perfiles de expresión génica por microarreglos de un modelo murino de fibrosis pulmonar inducida por bleomicina y se comparó estos resultados con los microarreglos de las bases de datos públicas. Se encontró que tanto en el modelo murino como en humanos con FPI la señalización por hipoxia se encuentra alterada; con base en estas observaciones se propone que la activación de HIF-1α es un evento temprano en la patogénesis de la enfermedad (16). Factor de transcripción inducible por hipoxia (HIF) El factor de transcripción inducible por hipoxia 1 alfa (HIF-1α) es una proteína requerida para la inducción de varios genes implicados en la sobrevida celular y homeostasis de oxígeno. Algunos de esos genes son Factor de Crecimiento Vascular y Endotelial (VGEF), Factor de Crecimiento Derivado de Plaquetas (PDGF), Factor de Crecimiento Transformante-β1 (TGF-β1), Eritropoyetina (EPO) y varias enzimas glicolíticas. En estudios previos se encontró que los fibroblastos expuestos a hipoxia o en altas concentraciones de lactato y 2014 Orozco Vargas Daniel 7 dentro del microambiente de la lesión incrementan la tasa de síntesis de colágena (17). La regulación de HIF-1α y de HIF-2α se opera vía hidroxilación enzimática mediante prolil-hidroxilasas (PHD1, PHD2 o PHD3). Estas enzimas contienen hierro en su sitio activo, utilizan el oxígeno molecular y el 2-oxoglutarato, para modificar los residuos prolil de las proteínas HIF-1α y HIF-2α, permitiendo su reconocimiento para ser destruidas por un proteosoma (18). HIF-1 en su forma funcional es un heterodímero compuesto por dos subunidades, HIF-α (HIF-1α, HIF-2α, o HIF-3α) que es de vida corta, y HIF-β que también es conocida como Translocador del Receptor para Aril-Hidrocarburos (ARNT), la cual es expresada constitutivamente en el núcleo. Ambas subunidades pertenecen a la familia de los factores de transcripción con dominios bHLH/PAS (basic Helix-Loop-Helix/Per-Arnt-Sim) que son determinantes para la unión al DNA (19) (20). En condiciones de normoxia las unidades HIF-α tienen una vida media muy corta, ya que las células sintetizan y degradan continuamente esta proteína HIF-α (21). Sin embargo, en virtud de la disminución de la concentración de oxígeno, la degradación de HIF-α se ve reducida (22). La interfase entre el oxígeno y la subunidad HIF-α es proporcionada por distintas reacciones enzimáticas (véase figura 3): la hidroxilación de dos residuos prolina (Pro402 y Pro564) mediante la actividad de prolil hidroxilasas (PHD’s) (23) y la acetilación de un residuo lisina (Lys-532) por medio de una Acetiltransferasa (ARD1) en el Dominio de Degradación Dependiente de Oxígeno (ODDD) de la subunidad α (24). Esta hidroxilación y acetilación dependientes de oxígeno regulan 2014 Orozco Vargas Daniel 8 la interacción de la subunidad HIF-α con la proteína supresora tumoral Von Hippel- Lindau (pVHL). pVHL es el componente de reconocimiento de un complejo ubiquitina ligasa conocida como E3 que dirige a HIF-α para su proteólisis por medio un proteasoma, conocido como 26S (22). Por el contrario, bajo condiciones de hipoxia, la prolil hidroxilación y lisil acetilación son suprimidas, HIF-α escapa de la destrucción proteasomal y es acumulada (25). Esta subunidad es translocada al núcleo celular, su dominio C terminal de transactivación (TAD-C) interactúa con un coactivador (p300/CBP) y de esta manera HIF-1α dimeriza con HIF-1β (26); entonces este complejo heterodimérico de trans-activación se une a los Elementos de Respuesta a Hipoxia (HRE) que son de esta forma promotores o inductores activos de una amplia gama de genes (27). Figura 3. Mecanismo molecular de la estabilidad de HIF-1 α en hipoxia y normoxia (imagen modificada) [3i]. El nivel de O2 regula la degradación mediada por hidroxilación (P402 y P564 mediante PHD) y acetilación (K532 medianteARD1) de sus residuos de aminoácidos. En normoxia la unidad N803 es hidroxilada y se inhibe la asociación de p300/CBP a HIF-1α, llevando a la inhibición transcripcional de HIF-1α. 2014 Orozco Vargas Daniel 9 La relevancia que tiene HIF-1 en el desarrollo de la fibrosis puede contrastarse por lo reportado en un estudio realizado por Higgins D.F. en células epiteliales renales; el cual sugiere que la hipoxia y la señalización a través de HIF- 1 contribuyen al desarrollo de fibrosis intersticial por un incremento en la expresión de factores que modifican a la ECM, un aumento en la expresión de genes para lisil-oxidasa (enzimas encargadas de la formación estable de colágena) y por potenciar el proceso conocido como Transición Epitelio Mesenquima (EMT) (28). Factor de Crecimiento Transformante Beta 1 (TGF- β1) y α-Actina de Músculo Liso ( α-SMA) TGF-β1 es una proteína perteneciente a la superfamilia de factores de crecimiento transformante beta. Es un péptido que regula una amplia variedad de funciones celulares incluyendo proliferación celular, muerte celular programada, especialización celular y algunos procesos clave en el desarrollo embrionario (29). Se sintetiza como un precursor inactivo, que debe ser escindido proteolíticamente para generar la proteína activa. Esta se une a dos receptores celulares (tipo I y II) con actividad serina-treonina kinasa, y desencadena la fosforilación de factores citoplásmicos denominados Smads. Estos Smads fosforilados se unen a Smad4 para formar heterodímeros que entran en el núcleo y se asocian a otras proteínas de unión a ADN para activar o inhibir la transcripción de genes específicos (30). Uno de sus efectos descritos en el desarrollo de la fibrosis es la estimulación en la formación de matriz extracelular (ECM), mediante la activación transcripcional de una amplia gama de genes que codifican una diversidad de 2014 Orozco Vargas Daniel 10 moléculas profibróticas (31)(32). Esta citocina se ve sobreexpresada en fibroblastos humanos dérmicos y fibroblastos de pulmón de ratón, bajo el estímulo de algún alérgeno y en un ambiente hipóxico (33)(34). Un estudio realizado por Norman J.T. et al. en fibroblastos derivados de riñón expuestos a hipoxia, demostró que se manifiesta un incremento de la síntesis de colágena en respuesta a la hipoxia de una manera dependiente de TGF-β1 (35). Se ha observado que TGF-β1 induce en las células epiteliales la EMT (28) y estimula en los fibroblastos su transdiferenciación a miofibroblastos (36) al inducir la sobreexpresión de α-actina en su citoesqueleto, así como generar un aumento en su capacidad de síntesis de proteínas de ECM (37)(38). La actina es una proteína muy abundante en prácticamente todas las células eucariotas y participa en funciones estructurales y de motilidad celular. En ensayos funcionales, todas las actinas parecen idénticas, pero a pesar de su alto grado de similitud en base a las secuencias de aminoácidos se han podido distinguir dos grupos principales de actinas: actinas específicas de músculo (actinas-α) y las actinas no musculares (actinas β y γ) (29). La α-actina de musculo liso es expresada de manera transitoria durante el desarrollo de músculo cardiaco y músculo esquelético, pero es principalmente expresada en músculo liso adulto. Mientras que las isoformas β y γ están involucradas en la regulación de la motilidad celular, la α-actina es el constituyente principal del aparato contráctil, y también es encontrada en músculo esquelético (39). 2014 Orozco Vargas Daniel 11 Metaloproteasa de Matriz 1 (MMP-1) e Inhibidor Tisular de Metaloproteasas 1 (TIMP-1) El tejido conjuntivo se encuentra constantemente en remodelación, esta remodelación es en respuesta al crecimiento o debido a alguna lesión del tejido (40). Las fibras de colágena se caracterizan por su resistencia a las proteasas tales como pepsina, tripsina o quimiotripsina. Estas proteínas solo pueden ser degradadas por la acción proteolítica de la familia de las Metaloproteasas de Matriz Extracelular (MMPs) (41). Las metaloproteasas componen a una superfamilia de proteasas o enzimas dependientes de zinc. Éstas participan en procesos fisiológicos (desarrollo y sanación de heridas) y patológicos (oncogénesis y metástasis). Las MMP’s se encargan de degradar los variados componentes de la ECM como: proteoglicanos, glucosaminoglicanos, proteínas estructurales y de adhesión (véase Tabla 1). Incluso tienen la capacidad de activar factores de crecimiento, receptores de superficie y moléculas de adhesión (42)(43). La MMP-1 también se le conoce como colagenasa-1 o colagenasa intersticial. Es una metaloproteasa capaz de degradar colágenas fibrilares de tipo I, II y III (las proteínas más abundantes de la MEC); tiene una estructura que consiste en un dominio “pre”, un dominio “pro”, un dominio catalítico, una región conectora y un dominio de hemopexina (6). Cabe señalar que TGF-β1 (un potente factor profibrogénico sobreexpresado en el desarrollo de la FPI) y la osteopontina (otro mediador fibrogénico) han demostrado tener un efecto inhibitorio sobre la transcripción de MMP-1; y un 2014 Orozco Vargas Daniel 12 efecto estimulante en la expresión de TIMP-1, que es el inhibidor natural de varias MMP’s, incluyendo la MMP-1 (6). Tabla 1. Metaloproteasas y respectivos sustratos [1t]. Consecuentemente, por su gran espectro de activación e inhibición, estas moléculas poseen la capacidad de alterar del destino celular e intervenir en el desarrollo del organismo. Por lo tanto, estas enzimas también llamadas matrixinas MMP (tipo) Denominación Sustrato ECM Colagenasas MMP-1 Colagenasa 1 Colágenas I, II, III, VII, VIII y X, gelatina, proteoglucanos, tenascina, entactina MMP-8 Colagenasa 2 Colágenas I, II, III, V, VIII y X, gelatina, agrecan MMP-13 Colagenasa 13 Colágenas I, II, III, IV, IX, X y XIV, gelatina, tenascina, fibronectina, agrecan, osteonectina Gelatinasas MMP-2 Gelatinasa A Colágenas I, IV, V, VII, X, XI y XIV, gelatina, elastina, fibronectina, laminina, agrecan, versican, osteonectina, proteoglucanos MMP-9 Gelatinasa B Colágenas IV, V, VII, X y XIV, gelatina, elastina, agrecan, versican, proteoglucanos, osteonectina Estromelisinas MMP-3 Estromalisina 1 Colágenas III, IV, V y IX, gelatina, agrecan, versican, proteoglucanos, tenascina, fibronectina, laminina, osteonectina MMP-10 Estromalisina 2 Colágenas III, IV y V, gelatina, caseina, agrecan, elastina, proteoglucanos MMP-11 Estromalisina 3 Caseína, laminina, fibronectina, gelatina, colágena IV, transferrina Tipo membrana MMP-14 MT1-MMP Colágenas I, II y III, caseína, elastina, fibronectina, vitronectina, tenascina, proteoglucanos, laminina, entactina MMP-15 MT2-MMP Tenascina, fibronectina, laminina MMP-16 MT3-MMP Colágena III, gelatina, caseína, fibronectina MMP-17 MT4-MMP ND MMP-24 MT5-MMP ND MMP-25 MT6-MMP ND Otras MMP-7 Matrilisina Colágenas IV y X, gelatina, agrecan, proteoglucanos, fibronectina, laminina, entactina, tenascina, caseína transferrina, integrina b4, osteonectina, elastina MMP-12 Metaloelastasa Colágenas IV y IV, gelatina, elastina, caseína, laminina, proteoglucanos, fibronectina, vitronectina, entactina MMP-20 Enamelisina Amelogenina MMP-23ª MMP-21 ND MMP-23B MMP-22 ND MMP-26 Matrilisina 2 Colágena IV, fibrinógeno, fibronectina, caseína MMP-27 ND ND MMP-28 Epilisina Caseína ECM: Matriz Extracelular; MMP: Metaloproteasas; ND: NoDeterminado 2014 Orozco Vargas Daniel 13 son precisamente moduladas bajo un estricto control durante su activación por inhibidores endógenos, α-macroglobulinas, e inhibidores tisulares de metaloproteasas (TIMPs) (43)(44). Los TIMP’s pertenecen a una familia de proteínas (véase Tabla 2) que son inhibidores naturales de las MMP’s (45). Se ha reportado que en el padecimiento de Fibrosis Pulmonar Idiopática los niveles de estos TIMP’s se manifiestan incrementados (37), de tal manera que la degradación de ECM por medio de MMP’s se ve contrarrestada, favoreciendo a un gradiente de acumulación frente a la degradación de ECM en los tejidos (45)(46). Tabla 2. Inhibición de metaloproteasas por TIMPs [2t]. Las marcas con “X” indican que se ha observado inhibición de la actividad enzimática y con “-“ que no se ha estudiado. MMP No. TIMP-1 TIMP-2 TIMP-3 TIMP-4 MMP-1 X X X X MMP-2 X X X X MMP-3 X X X X MMP-7 X X X X MMP-8 X X - - MMP-9 X X X X MMP-10 X X - - MMP-11 X - - - MMP-12 X - - - MMP-13 X X X - MMP-14 No X X - MMP-15 - X X - MMP-16 X X - - MMP-17 - - - - MMP-18 - - - - MMP-19 - X - - MMP-20 - - - - 2014 Orozco Vargas Daniel 14 Uno de los paradigmas centrales en la patogénesis de la FPI hace énfasis en el desequilibrio de la expresión de las metaloproteasas, lo cual incluye tres componentes: 1) la sobreexpresión de proteínas de matriz extracelular, 2) la inhibición de las Metaloproteasas de Matriz (MMPs) y 3) la sobreexpresión del Inhibidor Tisular de Metaloproteasas (TIMPs). Un papel importante de los MMPs en el desarrollo de la fibrosis es la activación proteolítica o inactivación de moléculas señalizadoras y receptores de membrana, con lo que se afecta casi cualquier aspecto del comportamiento celular (47). Existen algunas condiciones clínicas bajo las cuales el epitelio alveolar está expuesto a concentraciones bajas de oxígeno (hipoxia). Se ha reportado que la expresión génica de las MMPs y TIMPs cambia significativamente bajo este estímulo. Ya que la expresión enzimática y su actividad son críticas para el balance entre la acumulación de proteínas y su degradación, se ha formulado la hipótesis de que estos cambios favorecen la acumulación frente a la degradación de las colágenas (18)(10)(46). Se ha reportado que en el padecimiento de Fibrosis Pulmonar Idiopática los niveles de estos TIMP’s se manifiestan incrementados (37), de tal manera que la degradación de ECM por medio de MMP’s se ve contrarrestada, favoreciendo a un gradiente de acumulación frente a la degradación de ECM en los tejidos (45)(46). TIMP-1 es un inhibidor encontrado en células intersticiales (48), y posee un amplio espectro de supresión contra MMP’s (49). 2014 Orozco Vargas Daniel 15 Colágena La matriz extracelular está compuesta por macromoléculas que pertenecen a la familia de las colágenas, los proteoglicanos y glicoproteínas, y en algunos tejidos, las elastinas. Estas sustancias son segregadas por células del tejido conectivo como fibroblastos, condrocitos y osteoblastos (50). Se pueden distinguir varios tipos de matriz extracelular. La más generalizada es la matriz intersticial o estroma, donde las células están embebidas y sus componentes mayoritarios son las colágenas que forman fibras, la glicoproteína fibronectina y proteoglicanos del tipo condroitín y dermatán sulfato (40). La principal proteína estructural de la matriz extracelular es la colágena. Pertenece a una familia de proteínas constituida al menos por 27 miembros diferentes (véase Tabla 3). La molécula está constituida por tres cadenas polipeptídicas o dominios (con 1000 aminoácidos), agrupadas en una estructura helicoidal y estabilizadas por aminoácidos hidroxilados (lisina y prolina) que forman puentes de hidrógeno intercatenarios durante la síntesis (véase Figura 4) (51). Las colágenas son las proteínas más abundantes en mamíferos y llegan a constituir entre un 25% y 35% del contenido proteico de un animal (52). En el humano son el principal constituyente de los tejidos como: la piel en un 74%, tendones y ligamentos el 90%, córnea el 64%, cartílago el 50%, hueso cortical el 23%, aorta entre un 12-14%, pulmón el 10%, e hígado el 4% (40). 2014 Orozco Vargas Daniel 16 Los dominios de las colágenas están formados por 330 repeticiones de tripletes con la secuencia de aminoácidos Gly-X-Y. En la posición X suele aparecer la prolina (Pro), y en la posición Y la hidroxiprolina (Hyp); la glicina (Gly) constituye la tercera parte de los aminoácidos de cada cadena, lo que la diferencia de entre todas las proteínas del organismo (53)(54). Las diferentes moléculas de colágena sirven en el cuerpo en gran medida para el mantenimiento de la integridad estructural de tejidos y órganos. Gracias a su interacción con receptores especializados participan en una variedad de funciones como: adhesión, diferenciación, crecimiento, desarrollo de órganos, cicatrización y reparación tisular. De esta manera las colágenas ejercen funciones importantes en el ambiente celular y están implicados en la liberación de mediadores celulares como son los factores de crecimiento (41). En el parénquima pulmonar normal se encuentran al menos cinco tipos diferentes de colágena: En el espacio intersticial, las colágenas tipo I y III, con una relación 2:1, son las más abundantes; las colágenas tipo V y VI se encuentran en pequeñas cantidades y en las membranas basales del epitelio alveolar y endotelio capilar es muy abundante la colágena tipo IV (55). 2014 Orozco Vargas Daniel 17 Tabla 3. Tipos de colágena [2t] [3t] [4t]. Tipo Tipo de asociación Composición Distribución I Fibrilar [α1(I)]2 [α2(I)] Piel, hueso, tendón, ligamentos, córnea, pulmón, dentina. Supone el 90% de la colágena del cuerpo II Fibrilar [α1(I)3] Cartílago, humor vítreo, notocorda III Fibrilar [α1(II)]3 Acompaña a tipo I en fibrillas heterotípicas: vasos sanguíneos, piel, pulmón IV Reticular o formadora de redes [α1(IV)]2 [α2(IV)] α3(IV) α4(IV) α5(IV) Membranas basales V Fibrilar [α1(V)]3 [α1(V)]2 [α2(V)] α1 (VI) α2(VI) α3(V) Acompaña a tipo I en fibrillas heterotípicas, fibrillas delgadas VI Filamentosa α1(VI) α2(VI) α3(VI) Filamentos en rosario de matrices del estroma que interactúan con fibrillas VII Cadena larga asociada a redes [α1(VII)]3 Filamentos de anclaje que se unen a membranas basales epiteliales VIII Cadena corta [α1(VIII), α2(VIII)] Membranas de descemet, matrices subendoteliales IX Asociada a fibras (FACIT) α1(IX) α2(IX) α3(IX) Superficie de fibras de colágena tipo II en cartílago hialino, humor vítreo X Cadena corta [α1(X)]3 Cartílago hipertrófico XI Fibrilar α1(XI) α2(XI) α3(XI) Acompaña a la tipo II en fibras heterotípicas XII Asociada a fibras (FACIT) [α1(XII)]3 con algunas fibrilares de tipo I Tendón y piel embrionarios; acompaña algunas matrices que contienen tipo I, tendón, ligamentos XIII Transmembrana [α1(XIII)]3 Células endoteliales XIV Asociada a fibras (FACIT) [α1(XIV)]3 Piel fetal y tendón XV Multiplexina [a1(XV)]3 Fibroblastos, células de músculo liso, riñón, páncreas XVI Multiplexina [a1(XVI)]3 Fibroblastos, queratinocitos, amnios XVII Transmembrana [a1(XVII)]3 Dermis y epidermis XVIII Multiplexina [a1(XVIII)]3 Pulmones e hígado XIXAsociada a fibras (FACIT) [a1(XIX)]3 Observado en rabdomiosarcoma humano XX Asociada a fibras (FACIT) [a1(XX)]3 Epitelio de córnea, piel embrionaria, cartílago esternal, tendón XXI Asociada a fibras (FACIT) [a1(XXI)]3 Pared de vaso sanguíneo 2014 Orozco Vargas Daniel 18 Figura 4. Estructura general de la colágena [4i]. Síntesis de la colágena Los precursores polipeptídicos de colágena se forman en los fibroblastos (véase Figura 5) y son segregados a la matriz extracelular, estas proteínas contienen una secuencia de aminoácidos especial en sus extremos N-terminales. Esta secuencia actúa como una señal que marca el polipéptido a sintetizar para que sea secretado de la célula, entonces este precursor es escindido en el Retículo Endoplásmico Rugoso (RER) para proporcionar un precursor del colágena denominado procadena α (53). La siguiente etapa comprende la hidroxilación, de las procadenas α mediante una serie de eventos enzimáticos dentro del RER. Los residuos de prolina y de lisina encontrados en la posición Y de la secuencia –Gly-X-Y- pueden 2014 Orozco Vargas Daniel 19 ser hidroxilados por tres hidroxilasas diferentes, prolil 3-hidroxilasa, prolil 4- hidroxilasa, lisilhidroxilasa dentro del RER para formar residuos de hidroxiprolina e hidroxilisina, estas reacciones de hidroxilación precisan la formación de enlaces de hidrógeno entre cadenas, y con esto la creación de una triple hélice estable (56). Después de la hidroxilación y la glicosilación, las procadenas α forman la procolágena, entonces estas moléculas son transportadas al aparato de Golgi, donde se empaquetan en vesículas secretoras que las llevan al espacio extracelular y entonces ocurre la formación de la triple hélice de procolágena (57). La estabilización de esta hélice se logra mediante la formación de puentes hidrógeno que se forman entre las tres cadenas formando interacciones cooperativas entre los puentes hidrógeno: 1) los que se establecen entre los grupos amino peptídicos de los residuos glicina (Gly) y los grupos carbonilo peptídico de los residuos de la otra cadena y 2) los que se establecen entre los grupos hidroxilo de los residuos de Hidroxiprolina (Hyp) y las moléculas de agua (52). Entonces las moléculas de procolágena pasan por la escisión extracelular, las moléculas son escindidas por las N y C-procolágenopeptidasas, que retiran los propéptidos terminales y liberan las moléculas de “tropocolágena” helicoidales triples (50). Cada una de las moléculas de tropocolágena forma hélices triples en las que las cadenas polipeptídicas se enrollan estrechamente una alrededor de la otra, en disposición ordenada, en paralelo solapante (53). Por último para obtener fibras de colágena madura, las moléculas de tropocolágena se autoensamblan en fibras de colágena insoluble siendo 2014 Orozco Vargas Daniel 20 estabilizadas por la formación de entrecruzamientos intermoleculares derivados de aldehídos (50). Figura 5. Esquema general de la síntesis de colágena [5i]. 2014 Orozco Vargas Daniel 21 Fibroblasto Los fibroblastos (véase Figura 6) participan en los procesos de reparación y regeneración en casi todos los tejidos humanos. Estos son los principales constituyentes celulares de tejido conectivo. Morfológicamente tienen prolongaciones citoplasmáticas irregulares, un núcleo claro de forma ovoidal con un nucléolo evidente; el citoplasma es rico en retículo endoplasmático rugoso y un complejo de Golgi bien desarrollado (1). La función principal de los fibroblastos es secretar proteínas de la ECM que aportan un tejido de soporte para eventos normales de reparación. La disolución eventual de este andamio y la apoptosis de fibroblastos son críticos para la restauración de la arquitectura normal del tejido (58). La definición funcional de los fibroblastos se puede referir por la descripción de una población de células que; 1) sintetizan y secretan una compleja serie de moléculas de la ECM estructurales (colágenas y fibronectina) y no estructurales (trombospondina y osteopontina); 2) organizar y remodelar activamente la ECM a través de la producción de proteasas (MMP’s); 3) tener comunicación con células cercanas a través de comunicación paracrina, autocrina, y otras formas de comunicación. Finalmente, los fibroblastos a través de diversas manifestaciones, participan de manera directa e indirecta en heridas que no sanan y en enfermedades fibróticas (59). Los fibroblastos tienen múltiples orígenes embrionarios; la primera de estas poblaciones son las células madre mesenquimales, que pueden diferenciarse en múltiples tipos de células de tipo mesenquimal; una segunda población son los 2014 Orozco Vargas Daniel 22 fibrocitos, los cuales surgen a partir del hueso adulto y son caracterizados por asumir también un fenotipo similar al de fibroblastos en zonas lesionadas (60). Los fibroblastos activados adquieren un fenotipo “agresivo” y son considerados como los principales responsables de la acumulación de colágena en los pacientes diagnosticados con FPI (61). El patrón anatomopatológico de la FPI es heterogéneo; con áreas de fibrosis pulmonar que se manifiestan con focos de proliferación fibroblástica, causados por daño y activación epitelial. Los focos de fibroblastos se localizan en el intersticio pulmonar, y caracterizan por la proliferación de fibroblastos y miofibroblastos, junto con una disminución en la apoptosis e hiperrespuesta a citocinas fibrogénicas (62). Figura 6. Esquema de fibroblasto [6i]. 2014 Orozco Vargas Daniel 23 Miofibroblasto En la cicatrización de las heridas la principal célula encargada de dicho proceso es el miofibroblasto por la capacidad contráctil de esta célula, lo cual es fundamental en el cierre de la cicatriz formada. Estás células tienen morfología de fibroblasto, pero la principal propiedad de los miofibroblastos es la de expresar fibras de α-actina (proteína presente en el fenotipo de células de músculo liso) conectadas entre el citoesqueleto de estos miofibroblastos y con la ECM, además de poseer un amplio espectro de síntesis de moléculas que componen la ECM; por lo que los miofibroblastos son considerados como intermediarios entre fibroblastos y células de músculo liso (63)(64) y también son considerados como los protagonistas de la formación anormal de depósitos de colágena (37)(65). Entre las moléculas que sintetizan se encuentran diversos tipos de colágenas, pero principalmente las colágenas de tipo I y III; glicoproteínas como los proteoglicanos y fibronectina; además de otras proteínas y proteasas. Estas células además son capaces de interactuar con diversas células locales e inflamatorias por medio de diferentes mediadores químicos como las interleucinas, quimiocinas, neuropéptidos y diversos factores de crecimiento (66). TGF-β1 es el principal factor que induce la transdiferenciación de fibroblastos a miofibroblastos, confiriendo a estas células diferenciadas; protección contra apoptosis; expresión de α-actina en su citoesqueleto (característica principal de fenotipo). Además se ha observadoque esta citosina desencadena el fenómeno conocido como Transición Epitelio Mesénquima (EMT), de la cual se 2014 Orozco Vargas Daniel 24 asevera que es la causante de múltiples orígenes (véase Figura 7) de este fibroblasto “activado” (64). Figura 7. Múltiples orígenes de los miofibroblastos [7i]. 1.- Transdiferenciación de fibrocitos derivados de la médula ósea. 2.- En hígado los miofibroblastos son reclutados de las células madre hematopoyéticas, 3.- En pulmón la EMT puede proporcionar otro mecanismo para originar miofibroblastos. 4.- Durante la formación de la placa ateromatosa, la desdiferenciación de las células madre hematopoyéticas del medio son propuestas como una importante fuente de miofibroblastos, 2014 Orozco Vargas Daniel 25 JUSTIFICACIÓN � La fibrosis tisular es una causa común de la pérdida de la función de algunos órganos. Por consiguiente, la búsqueda de los mecanismos básicos en su iniciación y progresión son un paso esencial para establecer nuevas estrategias terapéuticas. El conocimiento de la regulación génica por hipoxia sobre la expresión de algunos genes catalogados como pro- fibrosantes, tiene implicaciones relevantes para el entendimiento de la fibrosis, tal es el caso de la FPI. � Con este estudio esperamos dilucidar las diferencias en la expresión de genes relacionados con la fibrosis pulmonar en fibroblastos de pulmón normal y una línea de fibroblastos provenientes de un paciente con FPI bajo condiciones de hipoxia 2014 Orozco Vargas Daniel 26 HIPÓTESIS � La hipoxia en fibroblastos provenientes de pulmón derivado de un paciente con FPI, promueve una mayor expresión de colágenas (Col-I y Col-III) y algunos otros genes implicados en el desarrollo de la FPI (HIF-1α, HIF-2α, TGF-β1, α-SMA, MMP1 y TIMP1) en comparación con fibroblastos de pulmón normal. 2014 Orozco Vargas Daniel 27 OBJETIVO GENERAL � Determinar si en un cultivo primario de fibroblastos provenientes de pacientes con fibrosis (FF) y otro de fibroblastos normales (FN) bajo condiciones de hipoxia, producen un aumento (o desequilibrio) en la producción de factores y mediadores de degradación (MMP-1, TIMP-1) y de síntesis (Col-I y Col-III) de la ECM. OBJETIVOS PARTICULARES � Medir y describir el efecto de la Hipoxia (1% O2) en la expresión génica de HIF-1α y HIF-2α en fibroblastos de pulmón FN y FF. � Medir y describir el efecto de la Hipoxia (1% O2) en la expresión génica de TGFβ1, α-actina de músculo liso, Colágena I, Colágena III, MMP-1 y TIMP- 1 en fibroblastos de pulmón FN y FF. 2014 Orozco Vargas Daniel 28 MATERIAL Y MÉTODOS Cultivo Celular Los fibroblastos de pulmón, tanto el normal como del paciente con FPI se obtuvieron, como anteriormente se ha descrito (67)(37). Se sembraron células en placas de cultivo de 6 pozos a un 80% de confluencia con medio de cultivo Ham’s F-12 para fibroblastos (FN y FF), Suero Fetal Bovino (FBS) al 10%, 200 U/ml de Penicilina y Estreptomicina. Las placas de cultivo fueron colocadas dentro de cámaras de hipoxia, reduciendo la concentración a 1% de O2 mediante el suministro de una mezcla de gas Nitrógeno en un 5% y CO2 en un 95%, a una presión de 15 L/min. Una vez condicionadas las células a este estímulo se incubaron a 37ºC, en una atmósfera humidificada. Extracción de RNA Por cada periodo de exposición a hipoxia (0, 12, 24, 48, 72, 96 hrs), las placas de cultivo de 6 pozos con células fueron retiradas de las cámaras de hipoxia y se realizó un lisado celular con el reactivo de TRIzol® (invitrogen) para extraer RNA como a continuación se describe: 2014 Orozco Vargas Daniel 29 1. Se adicionó 1 ml de TRIzol por cada pozo de la placa, dejando actuar durante 10 segundos el reactivo y homogeneizando lo mejor posible el lisado celular por retropipeteo. 2. Se recuperó el reactivo con el lisado celular en tubos de centrifuga de 1.5 ml estériles y se guardó a -70ºC. Una vez obtenidos todos los tiempos de exposición a hipoxia se procedió a realizar la extracción de RNA de todas las muestras. 3. Se adicionó a cada tubo 200 µl de cloroformo por cada ml de TRIzol. 4. Se homogeneizó vigorosamente cada tubo a mano durante 15 segundos y se dejó incubar durante 3 minutos a temperatura ambiente. 5. Se centrifugó cada muestra a 4ºC por 15 minutos a 12,000 rpm para obtener una separación de fases de RNA, DNA y proteínas. 6. Se extrajo con una micropipeta el sobrenadante acuoso superior (contiene el RNA) evitando llevar cualquier otra fase de la suspensión para evitar la contaminación de la muestra de RNA, entonces se recuperó en un nuevo tubo de centrifuga de 1.5 ml estéril. 7. Al nuevo tubo se agregó 500 µl de Isopropanol por cada ml de TRIzol utilizado inicialmente, se homogeneizó vigorosamente el tubo a mano durante 15 segundos y se dejó incubar a temperatura ambiente durante 10 min. 8. Se centrifugó cada muestra 4ºC por 10 minutos a 12,000 rpm y se removió el sobrenadante resultante (se procuró solo dejar el precipitado o pellet de RNA para evitar la contaminación de la muestra con fenoles). 9. Se lavó el pellet con 1 ml de etanol al 75%; se homogeneizó el tubo a mano y se centrifugó a 7500 rpm, por 5 minutos a 8°C. Al final se retiró el sobrenadnte. 2014 Orozco Vargas Daniel 30 10. Se resuspendió el pellet de RNA en 40 µl agua libre de RNAsas. Transcripción inversa El RNA aislado se cuantificó en un espectrofotómetro (NanoDrop 2000® de Thermo Scientific) y se procedió a obtener el DNA complementario (cDNA) con un kit comercial (High Capacity cDNA reverse Transcription Kit - Applied Biosystems®), considerando los siguientes pasos: 1. En un tubo para centrifuga se adicionó 1µg del RNA aislado, 1µl de DNAsa, 1µl de Buffer RT 10x y se aforó a 10µl con Agua con Dietilpirocarbonto (DEPC). 2. Se incubó la DNAsa durante 30 min a 37°C en un termociclador de punto final. Posteriormente se agregó al tubo, 1µl de EDTA 50mM y se incubó a 65°C durante 10 min en un termociclador de punto final. 3. Se preparó Master Mix para RT-PCR, como se indica en la siguiente tabla: Master Mix para RT -PCR Reactivo Volumen por Reacción Buffer RT [10x] 2.0 µl dNTP’s [25mM] 0.8 µl Primers al azar [10X] 2.0 µl Inhibidor de RNAsa [40 U/µl] 1.0 µl Transcriptasa Reversa [50 U/µl] 1.0 µl H2O 2.2 µl Total 9.0 µl 2014 Orozco Vargas Daniel 31 4. Se programó el termociclador de punto final con los ciclos indicados en la tabla siguiente: 5. Se llevaron todas las muestras de cDNA a una concentración de 50 ng/ml, para posteriormente usar 200 ng totales de cDNA por reacción. Análisis de la expresión génica por PCR en tiempo real Cuantificación Relativa Es un método que permite la cuantificación precisa de ácidos nucleicos en una mezcla compleja, incluso si la muestra inicial se encuentraen una concentración muy baja. En la última década sus aplicaciones han sido herramientas ampliamente utilizadas para la cuantificación de secuencias específicas en mezclas complejas. Por ejemplo: la técnica ha sido usada para genotipificación, cuantificar la carga viral en pacientes, evaluar el número de copias de genes en tejido canceroso (68)(69). Condiciones en el termociclador de punto final 25°C durante 10 minutos 37°C durante 2 horas 85°C durante 5 segundos 4°C hasta sacar el tubo 2014 Orozco Vargas Daniel 32 Un “primer” es un oligonucleótido corto utilizado en muchas técnicas moleculares de PCR para la secuenciación de DNA. Estos cebadores son diseñados para tener una secuencia que es el complemento inverso de una región de DNA diana de interés. Se requieren para que inicie la replicación del DNA debido a que las enzimas que catalizan este proceso (taq polimerasa) sólo pueden añadir nuevos nucleótidos a una cadena existente de DNA. La polimerasa inicia la replicación en el extremo 3 'del cebador, y copia la cadena opuesta (70)(71). Para comenzar la reacción la temperatura es elevada a 95°C (a esta temperatura la doble cadena es escindida en dos cadenas simples), después la temperatura desciende a 50°C (esto permite a los “primers” unirse al gen de interés), para que la enzima trabaje más rápidamente la temperatura es elevada a 72°C. De esta manera el ciclo de cambios en temperatura (95°C, 50°C y 72°C) es repetido y dos copias se convierten en dos, le precede otro ciclo y cuatro copias se convierten en ocho, y así sucesivamente hasta efectuar 40-50 ciclos (72). Sonda Taqman ® La sonda más comúnmente utilizada es la de tipo Taqman, son fragmentos de DNA complementario al gen de interés que se encuentran marcadas con un fluoróforo de marcaje o “reportero” en un extremo (el 5’) y al otro (el 3’) una molécula inactivadora o “quencher”. El ensayo TaqMan explota la actividad 5'- exonucleasa de ciertas polimerasas termoestables (Taq o Tth por ejemplo). Durante la etapa combinada de reasociación/extensión de la reacción de amplificación, la sonda se hibrida con la secuencia diana y la actividad 2014 Orozco Vargas Daniel 33 exonucleasa específica (5’->3’) para el DNA de doble cadena de la Taq o Tth, escinde al reportero (73). La molécula “quencher” absorbe la emisión del fluoróforo reportero pero no la emite. Por lo tanto cuando el “reportero” y el “inactivador” son físicamente separados la intensidad de la fluorescencia es emitida y detectada por el termociclador de tiempo real (72). Gráficas de amplificación con PCR en tiempo real Debido a su gran sensibilidad, reproducibilidad y velocidad, la metodología de PCR en tiempo real es muy ampliamente usada en la actualidad para la realización de análisis de la expresión génica (74). La finalidad de una reacción de PCR en tiempo real es mostrar un gráfico (Figura 8) que muestra el número de ciclos, frente a la fluorescencia creciente. Esto se conoce como un gráfico de amplificación (72). Figura 8. Gráfica de amplificación de PCR [8i]. 2014 Orozco Vargas Daniel 34 La línea horizontal en el gráfico representa un "umbral" establecida por el usuario. El punto en el que el gráfico de amplificación cruza este umbral se conoce como valor Ct (intersección del umbral) que es una medida relativa de la concentración de la secuencia o gen blanco. Entonces cuanto menor sea el valor de Ct para una muestra, mayor será la cantidad de partida de DNA en la muestra. Así, si dos gráficas de amplificación se comparan podemos deducir que muestra contenía la mayor cantidad de DNA de interés por el valor de Ct (72)(69). En la gráfica de amplificación se muestran dos fases, una fase exponencial seguida por una fase de meseta (no exponencial). Durante la fase exponencial, la cantidad de producto de PCR se duplica aproximadamente en cada ciclo. Conforme la reacción avanza, componentes de la reacción en cadena se consumen, y en última instancia uno o más de los componentes se hacen limitantes. En este punto, la reacción se ralentiza y entra en la fase de meseta (73). Procedimiento de la Cuantificación Relativa Se preparó el Master Mix para ensayos de expresión génica tipo “dúplex”, estos ensayos implican el manejo de dos sondas en un solo pozo dentro de la placa de reacción para PCR (sonda del gen a evaluar y sonda housekeeping o gen constitutivo). Se usaron las siguientes proporciones de reactivos por reacción o pozo: 2014 Orozco Vargas Daniel 35 Este Master Mix se depositó en los tubos de las placas para reacción de PCR en tiempo real, esto dependiendo del número de triplicados de muestras y de blancos experimentales o NTC’s (No Template Control), teniendo así un volumen de 11 µl por reacción o pozo. Entonces a las reacciones de amplificación se le agregaron 4 µl de cDNA de nuestras muestras (usando un total de 200 ng para la reacción), y en el caso de los NTC’s se le adicionó el mismo volumen pero de agua DEPC, resultando al final con 15 µl de reacción por pozo. Las placas fueron montadas en un termociclador para PCR en tiempo real de Applied Biosystems® Step One, el cual exporta los resultados en un archivo de Excel, entonces se prosiguió a hacer el análisis de expresión por el método de Ct comparativo. Elección del gen endógeno como normalizador de los resultados Una vez obtenido el cDNA, antes de hacer los ensayos de cuantificación relativa para los genes a evaluar, antes se procedió a hacer ensayos de curvas de Master Mix para e xpresión génica con PCR en tiempo real Reactivo Volumen por reacción TaqMan® Gene Expression Master Mix 7.5 µl Sonda TaqMan [20X] (Gen de interés) 0.4 µl Sonda Taqman [20X] (Gen endógeno) 0.2 µl Agua DEPC 2.9 µl Muestra cDNA [50ng/µl ] 4.0 µl Total 15.0 µl 2014 Orozco Vargas Daniel 36 inducción para elegir el gen housekeeping más adecuado para realizar los ensayos de expresión génica por PCR en tiempo real. Se hicieron ensayos para valorar la inducción de cuatro genes endógenos diferentes: β-actina, RNA ribosomal 18S, Gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa (GAPDH) y Fosforribosiltransferasa de hipoxantina-guanina (HPRT). Con base a los ensayos de inducción observamos que 18S fue el más apropiado como gen normalizador para los experimentos de exposición a hipoxia, ya que su expresión fue más constante en los diferentes tiempos de exposición al estímulo, en comparación con los otros dos genes de expresión constitutiva. Además, después de estos ensayos, se encontraron referencias que respaldan la aseveración de que 18S es el más apropiado para ensayos de PCR con hipoxia como tratamiento (75)(76)(77). Análisis de los ensayo de la cuantificación relativa Para obtener los valores de expresión relativa se empleó el método de Ct Comparativo el cual consiste en emplear la formula aritmética 2-∆∆Ct que expresa los resultados del ensayo de manera comparativa los niveles de expresión entre una muestra calibradora (muestra de referencia o sin tratamiento experimental) y una muestra tratada experimentalmente. Obtenidos los valores Ct (valores de amplificación) de un gen endógeno y un gen interés, entonces se consigue la relación conocida como ∆Ct al restar el valor Ct del gen endógeno al valor Ct del gen de interés: 2014Orozco Vargas Daniel 37 ∆Ct = Ct gen blanco – Ct gen endógeno Después se obtiene el siguiente delta, el cual se obtiene al restar el valor ∆Ct de la muestra calibradora al valor ∆Ct de la muestra tratada: ∆∆Ct = ∆Ct muestra calibradora – ∆ Ct muestra tratada Entonces se emplea la fórmula 2-∆∆Ct resultando de ella el número de veces en que se expresa nuestro gen de interés con respecto de los niveles basales de expresión, es por eso que al método se le denomina de cuantificación relativa. 2-∆∆Ct = Expresión relativa Evaluación de genes implicados en la Fibrosis Pulmonar Idiopática en células pulmonares expuestas a hipoxia Con la finalidad de comprobar si la hipoxia puede ser un factor potenciador en un proceso fibrótico, se midió la expresión de 8 genes (HIF-1α, HIF-2α, TGF- β1, α-actina, Col-I, Col-III, MMP-1 y TIMP-1) en dos líneas de fibroblastos (FN fibroblasto normal y FF fibroblasto fibrótico). Para su mejor comprensión los genes de interés se dividieron en 4 clases, como se muestra en la Tabla 4 : 2014 Orozco Vargas Daniel 38 Tabla 4. Genes en estudio clasificados de acuerdo a sus funciones. Se realizaron dos series del experimento por triplicado, a las 0, 12, 24, 48, 72 y 96 hrs, posteriormente fueron hechos “pull” por cada punto de exposición a hipoxia para facilitar el manejo de las muestras (debido también a que las células tuvieron las mismas condiciones experimentales). Las muestras fueron montadas en las placas de reacción por triplicado, y se procesaron los datos con un programa estadístico para obtener valores de significancia. Función Genes Regulación a la hipoxia celular HIF1A (HIF-1α) EPAS1 (HIF-2α) Marcadores pro -fibrosantes TGFB1 (TGF-β1) ACTA2 (α-actina) Metabolismo de la matriz extracelular MMP1 (MMP-1) TIMP1 (TIMP-1) Proteínas de ECM COL1A1 (Colágena-I) COL3A1 (Colágena III) 2014 Orozco Vargas Daniel 39 ANÁLISIS ESTADÍSTICO Se utilizó la prueba de Wilcoxon-Mann-Whitney con el paquete estadístico SPSS (versión 21.0) debido a que esta prueba nos permite comparar la mediana de dos muestras independientes que no se distribuyen de manera normal. Un valor de p menor a 0.05 significa que existe una diferencia en la mediana de los grupos (por ende que hay significancia estadística); se generaron valores de significancia (p) para confirmar la confiabilidad de los cambios en la expresión génica durante la cinética, y también para comparar las diferencias de expresión génica entre ambas líneas de fibroblastos (FN y FF). • Valor de p: de todos los puntos de exposición al estímulo (12, 24, 48, 72, 96 hrs) vs el punto de 0 hrs (o control) dentro de la misma línea celular. • Valor de p: de todos los puntos de exposición al estímulo (12, 24, 48, 72, 96 hrs) comparando entre las dos líneas celulares de fibroblastos (FN y FF). 2014 Orozco Vargas Daniel 40 RESULTADOS Expresión de HIF-1 α en fibroblastos FN y FF Se observa en los fibroblastos normales (FN) que los niveles de expresión de HIF-1α (Gráfica y tabla 1) están aumentados de manera gradual hasta las 48 horas, siendo su punto más alto de expresión, y posteriormente disminuyen a las 72 y 96 horas. Por otra parte en los fibroblastos fibróticos (FF) se presenta un aumento a las 24 horas de exposición siendo este punto el de máxima expresión, y subsiguientemente los valores de expresión disminuyen a las 48, 72 y 96 horas. 2014 Orozco Vargas Daniel 41 Gráfica y tabla 1. Expresión relativa de HIF-1 α en fibroblastos FN y FF al 1% de O 2. En FN, HIF-1α incrementa con el tiempo hasta las 48 horas ( 12hrs=1.91, p(12hrs vs 0hrs)= 0.031; 24hrs=3.15, p(24hrs vs 0hrs)=0.047), aunque solo este es el punto que no cumple con suficiente significancia estadística respecto a las 0 horas ( 48hrs= 8.26p(48hrs vs 0hrs) = 0.054); en los subsiguientes puntos de la cinética, la expresión decrementa y con valores estadísticamente significativos ( 72hrs=<0.001; 96hrs=0.013). En FF, HIF-1α se presenta considerablemente incrementado desde las 24 horas ( 24hrs=16.59, p(24hrs vs 0hrs)=<0.001), posteriormente los niveles de expresión decrementan, siendo estadísticamente significativos respecto del tiempo 0 ( 48hrs=5.28, p(48hrs vs 0hrs)=<0.001; 72hrs=7.51, p(72hrs vs 0hrs)=<0.001; 96hrs=1.12, p(96hrs vs 0hrs)=0.013). Respecto a la significancia estadística entre ambos linajes celulares todos los puntos de la cinética presentan diferencias significativas, a excepción del punto a las 48 hrs (p48hrs(FN vs FF)= 0.296). FN FN vs FF FF HIF-1α DE ± p (Xhrs vs 0hrs) p (FN vs FF) HIF-1α DE ± p (Xhrs vs 0hrs) 12 h 1.91 0.48 0.031* 0.025* 12 h 1.20 0.07 0.001* 24 h 3.15 1.32 0.047* <0,001* 24 h 16.59 0.43 <0,001* 48 h 8.26 4.72 0.054 0.296 48 h 5.28 0.48 <0,001* 72 h 0.20 0.07 <0,001* <0,001* 72 h 7.51 0.08 <0,001* 96 h 1.51 0.29 0.013* 0.046* 96 h 1.12 0.11 0.013* (Media); DE ± (Desviación estándar); p (significancia estadística) 2014 Orozco Vargas Daniel 42 Expresión de HIF-2 α en fibroblastos FN y FF. Al comparar HIF-2α (Gráfica y tabla 2) con HIF-1α en FN, se observa que HIF-2α aumenta de manera gradual hasta las 72 horas, siendo éste su punto más alto de expresión; finalmente la expresión de HIF-2α disminuye a las 96 horas pero sin llegar a niveles iguales o menores que HIF-1α. Por otra parte, cuando comparamos HIF-2α con HIF-1α en FF, se puede notar que HIF-2α manifiesta una inducción más sostenida; puesto que las 24, 48 y 72 horas son los puntos más altos de expresión; posteriormente a las 96 horas disminuye sin llegar a valores iguales o menores que HIF-1α. 2014 Orozco Vargas Daniel 43 Gráfica y tabla 2. Expresión relativa de HIF-2 α en fibroblastos FN y FF al 1% de O 2. En FN, HIF-2α se observa aumentando de manera gradual hasta las 72 horas de exposición, sin embargo solo se presenta significancia estadística a las 12 y 72 horas ( 12hrs=3.25, p(12hrs vs 0hrs)=0.001; 72hrs=8.97, p(72hrs vs 0hrs)=0.025); posteriormente se observa un decremento pero sin llegar a niveles basales ( 96hrs=3.33, p(96hrs vs 0hrs)=0.028). En FF, HIF-2α se observa aumentado de manera considerable y estadísticamente significativa en los periodos de 24, 48 y 72 horas ( 24hrs=12.14, p(24hrs vs 0hrs)=<0.001; 48hrs=7.99, p(48hrs vs 0hrs)=0.002; 72hrs=12.99, p(72hrs vs 0hrs)=<0.001); posteriormente se observa un decremento a las 96 horas pero sin llegar a niveles basales ( 96hrs= 4.24, p(96hrs vs 0hrs)=0.004). Respecto a la significancia estadística entre ambos linajes celulares solo los primeros dos puntos de la cinética presentan diferencias significativas ( 12hrs(FN vs FF)=0.012; 24hrs(FN vs FF)=0.002). FN FN vs FF FF HIF-2α DE ± p (Xhrs vs 0hrs) p (FN vs FF) HIF-2α DE ± p (Xhrs vs 0hrs) 12 h 3.25 0.78 0.001* 0.012* 12 h 1.18 0.13 0.075 24 h 3.21 2.24 0.144 0.002* 24 h 12.14 0.85 <0,001* 48 h 5.28 3.91 0.116 0.235 48 h 7.99 1.26 0.002* 72 h 8.97 3.81 0.025* 0.088 72 h 12.99 1.00 <0,001* 96 h 3.33 1.62 0.028* 0.355 96 h 4.24 0.83 0.004* (Media); DE ± (Desviación estándar);p (significancia estadística) 2014 Orozco Vargas Daniel 44 Expresión de TGF- β1 en fibroblastos FN y FF. Se puede apreciar que TGF-β1 (Gráfica y tabla 3) en FN se sobreexpresa gradualmente hasta las 48 horas, siendo este punto el de máxima expresión; posteriormente a las 72 y 96 horas la expresión de TGF-β1 decae sin llegar a niveles basales. En el caso de los FF se puede notar que TGF-β1 se presenta sobreexpresado a las 24 horas, siendo este punto el de máxima expresión; posteriormente se ve un decremento a las 48, 72 y 96 horas, manteniéndose a niveles similares de expresión y sin regresar a niveles basales. 2014 Orozco Vargas Daniel 45 Gráfica y tabla 3. Expresión relativa de TGF- β1 en fibroblastos FN y FF al 1% de O 2. En FN, TGF-β1 se observa una sobreexpresión significativa solo a las 96 horas ( 96hrs=3.43, p(96hrs vs 0hrs)=0.02). En FF, TGF-β1 se expresa de manera considerable hasta las 24 horas de exposición, siendo este punto el de máxima expresión ( 24hrs= 5.58, p(24hrs vs 0hrs)=0.02); posteriormente se observa un decremento a las 48, 72 y 96 horas, pero sin llegar a niveles basales ( 48hrs=3.52, p(48hrs vs 0hrs)=0.009; 72hrs=3.75, p(72hrs vs 0hrs)=<0.001; 96hrs=4.16, p(96hrs vs 0hrs)=0.001). Respecto a la significancia estadística entre ambos linajes celulares, se puede ver que no hay diferencias estadísticamente significativas. FN FN vs FF FF TGF-β1 DE ± p (Xhrs vs 0hrs) p (FN vs FF) TGF-β1 DE ± p (Xhrs vs 0hrs) 12 h 1.43 0.86 0.393 0.901 12 h 1.37 0.13 0.01* 24 h 5.67 5.84 0.208 0.979 24 h 5.58 2.00 0.02* 48 h 17.09 12.02 0.075 0.109 48 h 3.52 0.83 0.009* 72 h 2.54 1.30 0.099 0.121 72 h 3.75 0.32 <0,001* 96 h 3.43 1.07 0.02* 0.268 96 h 4.16 0.54 0.001* (Media); DE ± (Desviación estándar); p (significancia estadística) 2014 Orozco Vargas Daniel 46 Expresión de α -SMA en fibroblastos FN y FF. Se puede ver que α-actina (Gráfica y tabla 4) en FN tiene la tendencia de aumentar su expresión hasta las 48 horas, siendo este punto su pico de expresión; posteriormente los niveles de expresión decrecen en los últimos periodos de exposición (72 y 96 horas). Por otra parte α-actina en FF se observa en niveles muy altos de expresión a partir de las 24 horas de exposición al estímulo. 2014 Orozco Vargas Daniel 47 Gráfica y tabla 4. Expresión relativa de α-SMA en fibroblastos FN y FF al 1% de O 2. En FN, α-SMA se observa con la tendencia de incrementar con diferencias significativas sus niveles de expresión hasta las 48 horas ( 12hrs=10.58, p(12hrs vs 0hrs)=0.001; 24hrs=5.44, p(24hrs vs 0hrs)=0.001; 48hrs=27.28, p(48hrs vs 0hrs)=<0.001); posteriomente se observa un decremento en los periodos de 72 y 96 horas ( 72hrs=9.53, p(72hrs vs 0hrs)=0.4; 96hrs=2.48, p(96hrs vs 0hrs)=<0.001). En FF, con diferencias significativas en todos los puntos de la cinética, α-SMA se expresa a niveles muy elevados a partir de las 24 horas, ( 24hrs=80.16, p(24hrs vs 0hrs)=<0.001; 48hrs=63.81, p(48hrs vs 0hrs)=<0.001; 72hrs=101.57, p(72hrs vs 0hrs)=<0.001; 96hrs=57.4, p(96hrs vs 0hrs)=<0.001). Respecto a la significancia estadística entre ambos linajes celulares, se puede ver que en todos los puntos de la cinética hay diferencias significativas. FN FN vs FF FF α-SMA DE ± p (Xhrs vs 0hrs) p (Xhrs vs 0hrs) α-SMA DE ± p (Xhrs vs 0hrs) 12 h 10.58 2.84 0.001* 0.005* 12 h 4.31 0.58 0.001* 24 h 5.44 0.57 0.001* <0,001* 24 h 80.16 4.77 <0,001* 48 h 27.28 3.09 <0,001* <0,001* 48 h 63.81 5.79 <0,001* 72 h 9.53 4.90 0.4 <0,001* 72 h 101.57 6.98 <0,001* 96 h 2.48 0.26 <0,001* <0,001* 96 h 57.40 5.43 <0,001* (Media); DE ± (Desviación estándar); p (significancia estadística) 2014 Orozco Vargas Daniel 48 Expresión de Col-I en fibroblastos FN y FF. Podemos observar que Col-I (Gráfica y tabla 5) en FN se ve aumentanda de manera gradual hasta las 48 horas, siendo este punto su pico de expresión; posteriormente se muestra un decremento a las 72 y 96 horas sin llegar a niveles basales. En cambio Col-I en FF se expresa en niveles muy altos a partir de 24 horas y se mantiene elevado hasta las 96 hrs de exposición. 2014 Orozco Vargas Daniel 49 Gráfica y tabla 5. Expresión relativa de Col-I en fibroblastos FN y FF al 1% de O 2. En FN, con diferencias significativas en todos los puntos de la cinética, Col-I incrementa su expresión hasta las 48 horas ( 12hrs=2.04, p(12hrs vs 0hrs)=0.03; 24hrs=4.48, p(24hrs vs 0hrs)=<0.001; 48hrs=5.77, p(48hrs vs 0hrs)=0.002); subsiguientemente se observa un decremento a las 72 y 96 horas sin llegar a niveles basales ( 72hrs=2.23, p(72hrs vs 0hrs)=0.001; 96hrs=3.17, p(96hrs vs 0hrs)=0.022). En FF, con diferencias significativas en todos los puntos de la cinética, Col-I se sobreexpresa en gran medida desde de las 24 hasta las 96 horas ( 24hrs=41.81, p(24hrs vs 0hrs)=<0.001; 48hrs=34.65, p(48hrs vs 0hrs)=<0.001; 72hrs=32.72, p(72hrs vs 0hrs)=<0.001; 96hrs=20.08, p(96hrs vs 0hrs)=<0.001). Respecto a la significancia estadística entre ambos linajes celulares, se puede observar que hay diferencias significativas en todos los puntos de la cinética. FN FN vs FF FF Col-I DE ± p (Xhrs vs 0hrs) p (FN vs FF) Col-I DE ± p (Xhrs vs 0hrs) 12 h 2.04 0.53 0.03* 0.009* 12 h 3.57 0.61 0.003* 24 h 4.48 0.26 <0,001* <0,001* 24 h 41.81 2.35 <0,001* 48 h 5.77 0.88 0.002* <0,001* 48 h 34.65 2.08 <0,001* 72 h 2.23 0.16 0.001* <0,001* 72 h 32.72 0.70 <0,001* 96 h 3.17 0.99 0.022* <0,001* 96 h 20.08 2.17 <0,001* (Media); DE ± (Desviación estándar); p (significancia estadística) 2014 Orozco Vargas Daniel 50 Expresión de Col-III en fibroblastos FN y FF. En relación a Col-III (Gráfica y tabla 6), podemos observar que en FN hay un aumento considerable a las 48 horas, y posteriormente decae su expresión a las 72 y 96 horas sin llegar a niveles basales. Por otra parte se puede ver que Col- III en FF presenta un comportamiento similar a HIF-2α sobre estás células fibróticas. 2014 Orozco Vargas Daniel 51 Gráfica y tabla 6. Expresión relativa de Col-III en fibroblastos FN y FF al 1% de O 2. En FN, Col-III se muestra incrementado frente al estímulo con hipoxia, sin embargo solo los periodos de 12 y 96 horas presentan diferencias significativas ( 12hrs=2.35, p(12hrs vs 0hrs)=0.004; 96hrs=4.34, p(96hrs vs 0hrs)=<0.001). En FF, con diferencias significativas en todos los puntos de la cinética, Col-III se sobreexpresa en gran medida de 24 a 96 horas ( 24hrs= 44.83, p(24hrs vs 0hrs)=<0.001; 48hrs=31.35, p(48hrs vs 0hrs)=<0.001; 72hrs=43.93, p(72hrs vs 0hrs)=<0.001; 96hrs=21.10, p(96hrs vs 0hrs)=<0.001). Respecto a la significancia estadística entre ambos linajes celulares, se puede notar que solo los periodos de 24, 72 y 96 horas
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