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UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO FACULTAD DE QUÍMICA Estudio de la actividad antimicrobiana de cepas de Lactococcus aisladas de alimentos fermentados tradicionales. TESIS PARA OBTENER EL TÍTULO DE QUÍMICO DE ALIMENTOS PRESENTA CRISTOPHER MALDONADO BOLAÑOS Ciudad Universitaria, CD. MX. 2016 UNAM – Dirección General de Bibliotecas Tesis Digitales Restricciones de uso DERECHOS RESERVADOS © PROHIBIDA SU REPRODUCCIÓN TOTAL O PARCIAL Todo el material contenido en esta tesis esta protegido por la Ley Federal del Derecho de Autor (LFDA) de los Estados Unidos Mexicanos (México). El uso de imágenes, fragmentos de videos, y demás material que sea objeto de protección de los derechos de autor, será exclusivamente para fines educativos e informativos y deberá citar la fuente donde la obtuvo mencionando el autor o autores. Cualquier uso distinto como el lucro, reproducción, edición o modificación, será perseguido y sancionado por el respectivo titular de los Derechos de Autor. JURADO ASIGNADO: PRESIDENTE: Aurora Irma Ortegón Ávila VOCAL: Gloria Díaz Ruiz SECRETARIO: Francisco Ruiz Terán 1er. SUPLENTE: Aleida Mina Cetina 2° SUPLENTE: Ma. Del Carmen Wacher Rodarte SITIO DONDE SE DESARROLLÓ EL TEMA: LABORATORIO 324, DEPARTAMENTO DE ALIMENTOS Y BIOTECNOLOGÍA CONJUNTO E, FACULTAD DE QUÍMICA Asesor: Gloria Díaz Ruiz Asesor técnico: Ma. Del Carmen Wacher Rodarte Sustentante: Cristopher Maldonado Bolaños Índice 1. Introducción ......................................................................................................................... 1 2. Antecedentes ........................................................................................................................ 3 2.1 Alimentos fermentados tradicionales ....................................................................... 3 2.2 El Pozol ............................................................................................................................... 3 2.2.1 Elaboración del pozol ............................................................................................. 4 2.3Atole agrio .......................................................................................................................... 5 2.4 Bacterias acido lácticas (BAL) ........................................................................................... 6 2.4.1 Bacterias acido lácticas en los alimentos fermentados tradicionales ......... 6 2.4.2. Bacterias lácticas amilolíticas en alimentos fermentados tradicionales. .. 7 2.4.3 Uso de las BAL en la industria ................................................................................. 8 2.4.4 Clasificación de bacterias ácido lácticas ............................................................ 8 2.4.1 Lactococcus lactis ....................................................................................................... 9 2.4.5 Metabolismo .................................................................................................................. 9 2.5 Metabolitos antimicrobianos producidos por Bacterias Ácido Lácticas .................... 11 2.5.1 Ácidos orgánicos ....................................................................................................... 11 2.5.2 Ácido láctico ................................................................................................................ 11 2.5.3 Peróxido de hidrógeno ............................................................................................. 12 2.6 Bacteriocinas ........................................................................................................................ 12 2.6.1 Clasificación de las bacteriocinas ........................................................................ 13 2.6.2 Biosíntesis de las bacteriocinas................................................................................ 17 2.6.2.1 Modo de acción de las bacteriocinas .............................................................. 18 2.6.3 Aplicación de las bacteriocinas en la industria alimentaria.......................... 20 2.7 Lantibióticos y sus aplicaciones .............................................................................. 21 2.8 Bacterias patógenas presentes en los alimentos ........................................................ 23 2.8.1 Listeria monocytogenes .......................................................................................... 23 2.8.2 Escherichia coli .......................................................................................................... 24 2.9.3 Salmonella .................................................................................................................... 26 2.9.4 Staphylococcus aureus ........................................................................................... 26 2.9.5 Streptococcus mutans ............................................................................................. 27 2.9.6 P. aeruginosa .............................................................................................................. 27 3. Justificación ...................................................................................................................... 29 4. Hipótesis ............................................................................................................................. 30 5. Objetivos ............................................................................................................................. 30 6. Metodología ......................................................................................................................... 32 6.1 Microorganismos .................................................................................................................. 32 6.1.2 Microorganismos indicadores. .............................................................................. 32 6.2 Reactivación de cepas y confirmación de la pureza de las cepas a estudiar. ....... 34 6.2.1 Conservación de las cepas lácticas, patógenas y de descomposición. ... 35 6.3 Obtención de sobrenadantes. ............................................................................. 35 6.4 Preparación de medio de cultivo Infusión cerebro –corazón amortiguado (BHI-A) 37 6.4.1 Preparación de placas BHI-A .................................................................................. 37 6.4.2 Preparación de sobrecapa BHI-A .......................................................................... 37 6.5 Preparación de cepas patógenas y de descomposición ................................... 38 6.6 Método de difusión en agar. ..................................................................................... 39 6.7 Tratamiento de los sobrenadantes y ensayo de actividad antimicrobiana ............... 41 6.7.1 Neutralización de los sobrenadantes y tratamiento térmico ........................ 41 6.7.2 Neutralización, tratamiento térmico y concentración ..................................... 41 6.7.3 Determinación de la naturaleza proteica de las sustancias similares a bacteriocinas producidas BAL. ....................................................................................... 41 6.8 Identificación de bacterias ácido lácticas por comparación de secuencias del gen rRNA 16S. .................................................................................................................................... 44 6.8.1 Extracción y purificación del ADN ........................................................................ 44 6.8.2 Amplificación mediante PCR de la región V1 del gen rRNA 16S. .............. 44 6.8.3 Purificación de los productos de PCR ...............................................................45 6.8.4 Obtención y Comparación de secuencias .......................................................... 46 6.9 Prueba de reto en medio MRS de las bacterias ácido lácticas productoras de compuestos similares a bacteriocinas y Listeria monocytogenes ................. 46 6.10 Prueba de viabilidad de Listeria monocytogenes en los sobrenadantes de BAL neutralizados y tratados térmicamente. ................................................................................. 50 6.11 Cuantificación de proteína de los sobrenadantes ............................................ 51 7. Resultados y discusión ...................................................................................................... 52 7.1 Estudio de la actividad antimicrobiana de cepas de Lactococcus aisladas de alimentos fermentados tradicionales. ...................................................................... 52 7.1.1 Reactivación, confirmación de pureza y conservación de las cepas BAL y patógenas. .............................................................................................................................. 52 7.2 Conservación de las cepas ........................................................................................ 53 7.3 Evaluación de la actividad antimicrobiana de las cepas de Lactococcus aisladas del pozol y del atole agrio. Sobrenadantes sin neutralizar y sin tratamiento térmico. .. 54 7.4 Tratamiento de los sobrenadantes .......................................................................... 57 7.5 Actividad de la posible bacteriocina concentrada en los sobrenadantes ... 57 7.6 Determinación de la naturaleza proteica de los sobrenadantes con actividad antimicrobiana ............................................................................................................................. 57 7.7 Identificación de bacterias ácido lácticas por comparación de secuencias del gen rRNA 16S ..................................................................................................................................... 60 7.7.1 Extracción del ADN .................................................................................................. 60 7.7.2 Amplificación por reacción en cadena de la polimerasa del gen rRNA 16S de cepas de Lactococcus. ................................................................................................. 61 7.7.3 Purificación de los productos de PCR ................................................................ 62 7.7.4 Comparación de secuencias .................................................................................. 63 7.5 Resultado de prueba de reto de BAL frente a Listeria monocytogenes en caldo MRS .............................................................................................................................. 65 7.6 Prueba de viabilidad ..................................................................................................... 70 7.7 Cuantificación de proteína por el método de Bradford ..................................... 72 8. Conclusiones..................................................................................................................... 75 9. Perspectivas ...................................................................................................................... 76 ANEXOS ...................................................................................................................................... 77 Bibliografía ................................................................................................................................... 94 Resumen El atole agrio y el pozol son bebidas ácidas, no alcohólicas a base de maíz fermentado, han sido consumidas desde la época prehispánica en el centro y sureste de México. La microbiota de los alimentos fermentados tradicionales es compleja, siendo las bacterias lácticas el grupo más importante. Las bacterias ácido lácticas producen diversos metabolitos que además de aportar en las características sensoriales de los productos en los que se desarrollan pueden inhibir a microorganismos patógenos. Dentro de esos metabolitos se encuentran las bacteriocinas que son compuestos proteicos con actividad antimicrobiana. El género Lactococcus es uno de más importantes, ya que es capaz de producir nisina, un metabolito reconocido como GRAS. En el presente trabajo se estudiaron 26 cepas de Lactococcus lactis aisladas del pozol y del atole agrio, la presencia de posibles bacteriocinas se evaluó mediante el método de difusión en agar utilizando a 10 microorganismos indicadores: S. aureus, B. cereus, E. faecalis, L. monocytogenes, E. coli 0157: H10, S. Typhimurium, P. aeruginosa, S. oralis, S. mutans y S. sanguinis. Siete cepas de Lactococcus presentaron actividad antibacteriana contra Gram positivas. Se evaluó la naturaleza proteica de los compuestos similares a bacteriocinas de las siete cepas de Lactococcus que presentaron actividad antimicrobiana. Se verificó la identidad de las cepas de bacterias lácticas mediante la comparación de secuencias del gen rRNA 16S. Finalmente con los sobrenadantes del crecimiento de las cepas de Lactococcus se realizó una prueba de reto donde L. monocytogenes es inhibido hasta por 48 h y una prueba de viabilidad en la que L. monocytogenes se inhibió por periodos de tiempo más cortos. 1 1. Introducción. Los alimentos fermentados son aquellos en los cuales ocurren cambios microbiológicos/enzimáticos en los sustratos utilizados para su elaboración generando nuevos sabores, aromas y texturas. Algunos alimentos fermentados tradicionales se obtienen sin añadir inóculos, por lo que actúan los microorganismos naturalmente presentes en el alimento y están constituidos por microbiotas complejas. Se consumen y preparan con ingredientes disponibles en la región y muchos de ellos no se conocen fuera de las zonas de producción (Díaz y Wacher, 2003). El pozol es una bebida ácida no alcohólica, que se obtiene de la fermentación espontánea de masa de maíz nixtamalizado. La microbiota es bastante compleja, desde diversos tipos de bacterias hasta mohos y levaduras. Las principales bacterias encontradas durante todo el proceso de fermentación son las bacterias lácticas, dentro de este grupo de bacterias predominan bacterias de los géneros Streptococcus, Lactococcus y Leuconostoc. En el pozol se han encontrado bacterias ácido lácticas amilolíticas, las cuales fueron identificadas por ribotipificación y análisis de secuencias del gen rRNA 16S, como: Streptococcus bovis, Streptococcus infantarius, Streptococcus macedonicus, Lactococcus lactis y Enterococcus sulfureus (Díaz-Ruiz et al., 2003). En el estado de Tabasco diversos grupos indígenas y mestizos consumen una bebida regional, ácida no alcohólica preparada con masa elaborada con maíz de dobla, no nixtamalizado, que se conoce como atole agrio. Se le llama localmente maíz de dobla debido a que el tallo de la planta es doblado a la mitad con el fin de que el maíz pierda humedad, evitando la acción de microorganismos. El doblado del tallo se realiza alrededor de treinta días antes de cosechar. Este atole se elabora únicamente en el periodo de dobla, en los meses de mayo y septiembre. El tipo de maíz (de dobla en vez de uno maduro), sin nixtamalizar y que se puede fermentar en forma sólida o líquida son diferencias que presenta esta bebida con respecto a otras bebidas de maíz. 2 Las sustancias antagónicas que las bacterias ácido lácticas producen para dominar en su hábitat son muy diversas, y entre ellas se incluyen los ácidos orgánicos, el peróxido de hidrógeno, el diacetilo y las bacteriocinas (Savadogo et al., 2006). La aplicación de bacteriocinas en los alimentos ha tenido una importante contribución,en especial la nisina, ya que es considerada como un aditivo GRAS en la conservación de alimentos. Por tal motivo la investigación de cepas de Lactococcus productores de esta bacteriocina es de gran importancia. En el presente proyecto se determinó si las cepas de Lactococcus aisladas del pozol y del atole agrio, eran capaces de producir sustancias similares a bacteriocinas, para el control de bacterias patógenas y de descomposición presentes en los alimentos y en bacterias de cavidad oral. 3 2. Antecedentes. 2.1 Alimentos fermentados tradicionales. Algunos alimentos fermentados tradicionales se obtienen sin añadir inóculos, por lo que actúan los microorganismos naturalmente presentes en el alimento y están constituidos por una microbiota compleja (Díaz y Wacher, 2003). Algunos alimentos fermentados han trascendido sus fronteras de origen para convertirse en productos cotidianos en más de un continente; sin embargo, aquellas que se producen en forma artesanal o semi-comercial, o bien para el consumo de culturas particulares se denominan “tradicionales”. Las fermentaciones implicadas en estos alimentos revisten una enorme complejidad, y su estudio ha aportado y seguirá aportando enorme riqueza al conocimiento biotecnológico, específicamente a la biotecnología alimentaria. Estudios han revelado que estos tipos de alimentos como el pozol contiene un gran número de microorganismos benéficos, como las bacterias ácido lácticas que son las responsables de acidificar la bebida, produciendo ácido láctico impartiendo un sabor fresco y agradable al producto. Destacan las bacterias amilolíticas como Streptococcus infantarius, Díaz Ruiz et al., (2003.) Estas bacterias convierten el almidón del nixtamal en compuestos de menor peso molecular y algunos llegan a glucosa y maltosa y posteriormente en ácidos, las bacterias lácticas también ayudan a proteger el producto de bacterias patógenas y de descomposición, además aportan aromas y textura (Wacher, 1993). 2.2 El Pozol. El pozol viene del vocablo náhuatl pozolli, que significa espumoso. Es un alimento fermentado tradicional del sureste de México, que se elabora a partir de masa de maíz nixtamalizado, a la que se le puede o no adicionar algún saborizante, ya sea sal, azúcar, miel, cacao o chile (Nuraida et al., 1995). Esta bebida es a un consumida en algunos estados como Chiapas, Tabasco, Oaxaca y Campeche (Figura 1). 4 Figura 1. Pozol. Tomado de www.udual.wordpress.com 2.2.1 Elaboración del pozol. La elaboración del pozol conlleva a diferentes etapas de elaboración, ocho son las operaciones para obtener al pozol (Figura 2). El proceso comienza con la limpieza del maíz, a continuación los granos de maíz se hierven en agua con cal. El maíz cocido, llamado nixtamal se escurre y se lava con agua limpia. El nixtamal limpio se muele en metate o en molino hasta obtener una masa con la que se hacen bolas que se envuelven en hojas de plátano para mantener la humedad. En esta forma, se deja reposar a temperatura ambiente por varios días para que se lleve a cabo la fermentación (1 a 30 días). Una vez fermentada la masa, se bate en agua y se bebe. Esta bebida se puede preparar de dos formas: pozol mestizo e indígena, la diferencia es que en el pozol mestizo se realiza una segunda cocción después de nixtamalizar el maíz (Cañas et al., 1993). 5 Figura 2. Diagrama de elaboración del pozol. *Solo la realizan los productores mestizos (Cañas et al., 1993; Wacher et al., 1993). 2.3 Atole agrio. El atole agrio es una bebida que puede elaborarse de diferentes formas y se consume desde el centro hasta el sureste del país. Poco se sabe sobre la microbiota y las propiedades de la bebida. El atole agrio de dobla es una forma de prepararlo en Villahermosa, Tabasco, la mazorca se dobla dentro de la misma planta y se deja que pierda humedad. Una vez cosechado, el maíz se desgrana y se muele; posteriormente, el proceso se puede llevar a cabo de dos diferentes maneras: para el proceso líquido se agrega agua a la masa y se deja fermentar por 6 horas a temperatura ambiente. En cambio, para el proceso sólido, se forman bolas con la masa obtenida y se deja fermentar durante 12 horas. Al final se tamiza el producto y se coloca en ebullición hasta que espese (Valderrama, 2012). Las principales bacterias ácido lácticas encontradas en el atole agrio han sido Lactobacillus plantarum, Lactobacillus delbrueckii y Lactococcus lactis ssp. lactis, Serratia marcescens, Raoultella terrígena, Klebsiella pneumoniae spp. pneumoniae, Enterobacter cloacae, Morganella morganii spp. sibonii., Pseudomonas luteola y Pseudomonas aeruginosa (Esquivel, 2012; Valderrama, 2012). Siendo las especies de Lactobacillus y Lactococcus las bacterias ácido lácticas encargadas de acidificar la bebida, ya que esta alcanza un pH entre 4.05 y 4.46 al final de la fermentación (Valderrama, 2012). Limpieza del Maíz Nixtamalización Lavado de Nixtamal *Segunda cocción Remojo Molienda Formación de bolas Envoltura en hoja de plátano Fermentación 6 2.4 Bacterias acido lácticas (BAL). Son un grupo de microorganismos que producen como principal metabolito al ácido láctico. Son organismos nutricionalmente exigentes y son capaces de hidrolizar péptidos de la leche. Estas bacterias además de contribuir en la conservación de los alimentos, mejoran las características sensoriales (sabor, olor, textura) y aumentan la calidad nutritiva (Ramírez et al., 2011). Las BAL forman un grupo diverso de microorganismos, las de importancia en los alimentos pertenecen a los géneros: Carnobacterium, Enterococcus, Lactobacillus, Lactococcus, Leuconostoc, Pediococcus, Streptococcus, Tetragenococcus, Vagococcus y Weissella (Stiles y Holzapfel, 1997). Los principales metabolitos producidos por estas bacterias son: diacetilo, acetaldehído (aprovechados en la producción de quesos y mantequillas) y ácido láctico (aprovechado en la fermentación y preservación de productos lácteos). Además de metabolitos, las BAL producen algunas sustancias antimicrobianas, las cuales ayudan a conservar la calidad e inocuidad de los alimentos fermentados inhibiendo el crecimiento y desarrollo de microorganismos patógenos y de descomposición. Dichas sustancias pueden ser tan sencillas como el peróxido de hidrógeno hasta más complejas como las bacteriocinas (Savadogo et al., 2006). 2.4.1 Bacterias acido lácticas en los alimentos fermentados tradicionales. La fermentación del pozol es llevada a cabo por una microbiota compleja, constituida por bacterias ácido lácticas, levaduras y hongos (Wacher et al., 1993), gran parte de la microbiota del pozol son las BAL, las cuales se han encontrado y aislado durante todas las etapas de elaboración del pozol y además son las principales causantes de la acidificación de la masa. Dentro de este grupo de bacterias predominan bacterias de los géneros Streptococcus, Lactococcus y Leuconostoc (Ben Omar et al., 2000). En trabajos previos se han logrado encontrar bacterias ácido lácticas no amilolíticas: Weissella confusa, Lactobacillus delbrueckii, entre otras (Ben Omar et al., 2000) y bacterias lácticas amilolíticas como Streptococcus bovis, Streptococcus macedonicus, Lactococcus lactis y Enterococcus sulfureus (Díaz- 7 Ruiz et al. 2003). En la Tabla 1 se muestran especies de bacterias lácticas que se han identificado en el pozol y el atole agrio. Tabla 1. Bacterias ácido lácticas aisladas del pozol y del atole agrio. Aisladas del pozol Aisladas del atole agrio Streptococcus infantarius e Enterococcus saccharolyticus c Lactobacillus casei c,d Lactobacillus delbrueckii f Streptococcus macedonicus e Streptococcus bovis c,e Lactobacillusfermentum c Lactococcus lactis f Lactobacillus plantarum b,c,d Leuconostoc mesenteroides a,c Lactobacillus pentosus b Lactobacillus plantarum f Enterococcus sulfureus e Lactobacillus alimentarius d Weissella confusa c Lactobacillus delbrueckii c,d Lactococcus lactis d,e Reportados por: a) Nuraida et al., (1995); b) Ampe et al., (1999); c) Ben Omar et al., (2000); d) Escalante et al., (2001); e) Díaz-Ruiz et al., (2003); f) Valderrama et al., (2012) 2.4.2. Bacterias lácticas amilolíticas en alimentos fermentados tradicionales. Se han aislado diversas bacterias ácido lácticas amilolíticas (BALA) de diferentes alimentos fermentados tropicales elaborados con materias amiláceas, principalmente de yuca y cereales (por ejemplo, maíz y sorgo). Cepas de Lactobacillus plantarum han sido aisladas de productos a base de yuca fermentada en África (Nwankwo et al., 1989). Cepas amilolíticas de Lactobacillus fermentum se aislaron por primera vez en Benín, de una masa fermentada de maíz (ogi y mawe) por Agati et al., (1998). Sanni et al., (2002) describió cepas amilolíticas de L. plantarum y L. fermentum en varios alimentos amiláceos fermentados tradicionales de Nigeria. La forma en que la materia prima es procesada puede determinar la composición de la microbiota y en particular, la aparición de las bacterias lácticas amilolíticas (Guyot et al., 2000). Debido a la 8 capacidad de sus α-amilasas de hidrolizar parcialmente el almidón crudo (Rodríguez-Sanoja et al., 2000), BALA pueden fermentar diferentes tipos de material amiláceo, como el maíz (Nakamura, 1981), papa (Chatterjee et al., 1997), o la yuca (Giraud et al., 1991) entre otros. Estudios realizados por Díaz Ruiz et al., (2003) determinaron que Streptococcus bovis (actualmente Streptococcus infantarius subsp. infantarius) es la especie dominante entre las cepas de bacterias lácticas amilolíticas aisladas del pozol. 2.4.3 Uso de las BAL en la industria. Las funciones de las BAL en la tecnología de productos alimenticios son: formación de sabor ácido, inhibición de organismos patógenos, gelificación de la leche, reducción del contenido de lactosa, formación de aromas, proteólisis en la maduración de los quesos (Hernández, et al 2007), también han sido muy utilizadas como probióticos (Hill, 2002 y Hui, 1993). 2.4.4 Clasificación de bacterias ácido lácticas. Las bacterias ácido lácticas se clasifican por características como la morfología, vías de fermentación de la glucosa, crecimiento a diferentes temperaturas, capacidad para crecer a elevadas concentraciones de sal y tolerancia al acido o al álcali. Los acercamientos más antiguos en la taxonomía bacteriana comenzaron basándose en estas características. Posteriormente, se amplió al incluir la composición de la pared celular, ácidos grasos celulares, quinonas y algunas otras características de las células. La clasificación no es estática y es el centro de numerosos estudios taxonómicos que involucran ahora características filogenéticas y fenotipos de las bacterias lácticas (Stiles y Holzapfel, 1997, Seppo, 2004). En la naturaleza los géneros Lactococcus, Lactobacillus, Lactosphaera, Streptococcus, Leuconostoc, Pediococcus, Aerococcus, Alloinococcus, Carnobacterium, Dolosigranulum, Enterococcus, Globicatella, Oenococcus, Tetragenococcus, Vagacoccus y Weisella (Axelsson, 1998; Carr y col., 2002) son los más importantes en este grupo de bacterias. 9 2.4.1 Lactococcus lactis. Lactococcus lactis es una bacteria Gram positiva, no móvil, catalasa negativa, no esporulada, son cocos de 1.2-1.5 µm de diámetro con formas de cadenas variables, metabolismo homo-fermentativo y produce exclusivamente ácido láctico L (+) mediante la utilización de carbohidratos fermentables como fuente de energía (Roissart, 1994). Lactococcus es un importante género del grupo de las bacterias ácido lácticas, originalmente era parte del género Streptococcus pero desde 1985 tuvo el estatus de género (Nakarai et al., 2000). Durante mucho tiempo Lactococcus lactis ha sido usada en la fermentación de la leche, para operaciones tradicionales a pequeña escala, pero esta puede ser bien controlada en aplicaciones industriales (Cretenet et al., 2011). Las cepas de Lactococcus lactis son cuidadosamente seleccionadas siendo estas los principales componentes de cultivos iniciadores para la fermentación de la leche, ya que la rápida producción de ácido láctico, contribuye a la formación de la cuajada creando óptimas condiciones bioquímicas para la maduración de quesos (Parente y Cogan, 2004). L. lactis se ha aislado de productos vegetales tales como los cereales. 2.4.5 Metabolismo. La diferencia destacada entre los grupos de las bacterias ácido lácticas está entre los productos formados durante la fermentación de azúcares como homofermentativas o heterofermentativas (Figura 3). Las homofermentativas como Lactococcus, Streptococcus, Pediococcus, Vagococcus y algunos Lactobacillus, poseen la enzima aldosa y producen ácido láctico como el producto principal de la fermentación de la glucosa utilizando la vía de la glucólisis (Embden-Meyerhof) (Axelsson, 1998). Mientras que, las especies de los géneros Leuconostoc, Oenococcus, Weissella, Carnobacterium, Lactosphaera y algunos Lactobacillus son heterofermentativas no poseen la enzima aldolasa y convierten hexosas a pentosas, produciendo ácido láctico y otros productos como acetato, etanol y CO2 (Carr, 2002). 10 Fermentación Homofermentativa Fermentación Heterofermentativa Figura 3. Fermentación de la glucosa de las bacterias lácticas homofermentativas y heterofermentativas (Parra, 2012). ALDOLASA 11 2.5 Metabolitos antimicrobianos producidos por Bacterias Ácido Lácticas. Las bacterias lácticas convierten los azúcares en ácidos orgánicos, lo que hace que disminuya el pH. Además de estos, se reconoce que estas bacterias son capaces de producir una variedad de sustancias antimicrobianas de bajo peso molecular que incluyen: bacteriocinas, diacetilo, peróxido de hidrógeno (Niitynen et al., 2009). 2.5.1 Ácidos orgánicos. La producción de ácidos orgánicos es, sin duda, el factor determinante para aumentar la vida útil y la seguridad del producto final. La acidificación es un método muy utilizado de conservación durante la producción de muchos tipos de alimentos, como la leche, las verduras fermentadas y salchichas. La inhibición de los microorganismos patógenos y de descomposición depende también de una formación rápida y suficiente de estos ácidos orgánicos (Ammor, 2007). 2.5.2 Ácido láctico. El ácido láctico y su producción por BAL tienen una larga historia en la industria alimentaria. A principios del siglo pasado se establecieron los procesos microbianos para la producción de ácido láctico. Está presente en muchos alimentos de forma natural o como un producto de la fermentación microbiana in situ, como en aceitunas y encurtidos de hortalizas, yogurt, suero de leche y otras leches fermentadas, panes de masa fermentada y muchos otros alimentos fermentados. Se utiliza como acidulante, saborizante, agente tampón de pH y como inhibidor de deterioro bacteriano en una amplia variedad de alimentos procesados (Datta, 2006). El mecanismo de inhibición de ácido láctico está probablemente relacionado con la solubilidad del ácido láctico no disociado que atraviesa la membrana citoplasmática, que causa la acidificación del citoplasma y la pérdida de la fuerza protón motriz. Con el tiempo influye en el gradiente de pH transmembrana y disminuye la cantidad de energía disponible para que las células puedan crecer (Wee, 2006). 12 2.5.3 Peróxido de hidrógeno. En presencia de oxígeno, las BAL pueden producir peróxido de hidrógeno, el cual genera radicaleshidroxilo que causan peroxidación a los lípidos de la membrana y susceptibilidad de la célula microbiana de muchos microorganismos (Ouwehand, 1999). 2.6 Bacteriocinas. Las bacteriocinas son sustancias deseables producidas por bacterias ácido lácticas (BAL), las cuales controlan el crecimiento de poblaciones microbianas en alimentos fermentados, lo cual le confiere al alimento una mayor vida de anaquel e inocuidad. Las bacteriocinas, producidas por las BAL, son péptidos o proteínas biológicamente activas, sintetizados ribosomal mente, que tienen actividad contra otras bacterias similares (Rea et al., 2010). Las bacteriocinas producidas por BAL, incluyendo las de los géneros Lactococcus, Lactobacillus, Leuconostoc, Enterococcus, Pediococcus, Carnobacterium y Streptoccoccus han sido las más estudiadas debido a que podrían ser potencialmente usadas para la preservación y seguridad de los alimentos, en medicina humana y veterinaria (Cotter et al., 2005). La acción de las bacteriocinas depende de la composición de la membrana citoplasmática, la estructura y la expresión de la proteína además de la composición química del medio (Monroy, 2009). Son compuestos catiónicos cuya carga neta positiva es mayor a pH ácido, asimismo, sus propiedades bactericidas se acentúan a valores de pH bajos, permanecen estables a temperaturas relativamente altas y no se ven afectadas por solventes orgánicos. En este sentido, son las enzimas proteolíticas las que logran hidrolizar y, por tanto, inhibir su actividad. Son bastantes estables bajo condiciones de refrigeración y congelación, pero si contienen metionina, ésta puede oxidarse a sulfóxido de metionina, el cual reduce el poder antimicrobiano (Chen y Hoover, 2003; Savadogo, 2006; Ray y Bhunia, 2008). 13 Es importante destacar que las bacteriocinas difieren de los antibióticos en que las primeras son, como ya se mencionó anteriormente, compuestos proteicos con una especificidad inhibitoria contra bacterias del mismo género o estrechamente relacionadas; mientras que los antibióticos, además de que pueden causar reacciones alérgicas en el huésped, poseen una actividad poco específica contra células vivas, pudiendo así afectar a las mismas células o a la microbiota normal del hospedero (Riley y Wertz, 2002; Chen y Hoover, 2003); además, los antibióticos son moléculas de bajo peso molecular, no-proteicos, producidos por diferentes microorganismos como metabolitos secundarios y clasificados según su estructura química, pues pueden ser sulfonamidas, tetraciclinas y glicilciclinas entre otras (Todar, 2011). 2.6.1 Clasificación de las bacteriocinas. La clasificación de las bacteriocinas está siempre cambiando. Sin embargo, se han definido cuatro clases de bacteriocinas sobre la base de la estructura química, peso molecular y estabilidad térmica (Klaenhammer, 1993). Con respecto a las bacteriocinas producidas por las bacterias Gram-positivas, las producidas por bacterias de ácido láctico (BAL), incluyendo los géneros Lactococcus, Lactobacillus, Leuconostoc, Enterococcus, Pediococcus, Carnobacterium y algunos miembros del género Streptococcus, han sido objeto de una atención especial. Sus péptidos asociados potencialmente pueden ser empleados en una variedad de maneras, incluyendo la conservación de alimentos, la seguridad alimentaria y en la medicina humana y veterinaria (Cotter et al., 2005; Piper et al., 2009). Lactococcus lactis produce nisina A, es la más ampliamente caracterizada de todas las bacteriocinas, y el interés significativo en la investigación relacionada con la bacteriocina se puede remontar, en gran medida, al desarrollo exitoso de la nisina de la observación inicial de la actividad inhibitoria por una cepa de L. lactis contra Lactobacillus bulgaricus (Rogers y Whittier, 1928), hasta su aprobación regulatoria como un agente de bioprotección para la alimentación (Delves, 2005) 14 Klaenhammer agrupó las bacteriocinas en clases y subclases. Estas agrupaciones han formado la base de todos los esquemas posteriores de clasificación para las bacteriocinas de bacterias Gram - positivas. Klaenhammer sugirió cuatro clases de bacteriocinas como sigue a continuación: Clase I o lantibióticos: se definen como pequeños péptidos activos de membrana (<5 kDa) que contiene el aminoácido inusual lantionina o β- metil lantionina (de ahí el nombre de lantibióticos) y los residuos deshidratados. La nisina es la más caracterizada de las bacteriocinas de clase I. Clase II: definidos como pequeños péptidos activos de membrana que no contienen lantionina, termoestables y caracterizados por la presencia de un sitio de procesamiento de Gly-Gly en el precursor de bacteriocina, la presencia de hélices anfifílicas con regiones variables de hidrofobicidad y de moderada a alta estabilidad al calor. Estos se subdividen en tres subgrupos: o Subclase IIa: Péptidos activos contra Listeria, tienen la secuencia consenso en la región N-terminal de Tyr-Gly-Asn-Gly-Val-Xaa- Cy, y sus representantes característicos son la pediocina PA-1 y la sakacina P. o Subclase IIb: se refiere a dos componentes (dos péptidos separados), bacteriocinas que requieren dos péptidos para trabajar sinérgicamente con el fin de tener una actividad antimicrobiana. o Subclase IIc: péptidos que requieren residuos de cisteína para su actividad antimicrobiana. • Clase III: proteínas termolábiles grandes, a menudo con actividad enzimática. • Clase IV: proteínas complejas compuestas de uno o más restos químicos, ya sean lípidos o hidratos de carbono. 15 Esta clasificación ha sido retomada y modificada por varios autores. Rea y colaboradores (2011) presentan una clasificación actualizada: Clase I: Bacteriocinas modificadas post traducción. Este grupo se divide en: o Clase Ia: Lantibióticos o Clase Ib: Labirintopéptidos, nombrados en consecuencia de su estructura de “laberinto”, se distinguen por la presencia de labionina, un aminoácido modificado post traducción. Clase II: Bacteriocinas no modificadas. Este grupo se divide en cuatro subgrupos. o Clase IIa: Bacteriocinas similares a pediocina o Clase IIb: Bacteriocinas no modificadas de dos péptidos o Clase IIc: Bacteriocinas circulares o Clase IId: Bacteriocinas no similares a pediocina, sin modificar, lineales Bacteriolisinas, anteriormente Bacteriocinas Clase III, de hidrofobicidad variable y estabilidad al calor de moderada a alta. Esta a su vez se divide en 3 subgrupos: subclase IIa, subclase IIb, subclase IIc. Clase III: (Proteínas no modificadas), proteínas grandes, termolábiles, algunas con actividad enzimática. Clase IV: Proteínas complejas con uno o más grupos de lípidos o carbohidratos. Las bacteriocinas mejor estudiadas de las BAL son las de las clases I y II, ya que posiblemente al ser termoestables son adecuadas para ser utilizadas en la industria alimentaria (Tabla 2). 16 Tabla 2. Clasificación de Bacteriocinas según Klaenhammer. Clase Características Ejemplo representativo BAL productora Clase I: Lantibióticos Péptidos termoestables (<5KDa) Ia Péptidos elongados (4KDa), carga neta positiva, forma poros en la membrana celular blanco Nisina Plantaricina A Lactococcus lactis subsp lactis Lb. plantarum C11 Ib Péptidos globulares (1.8-2.1 KDa) actividad antimicrobiana por inhibición enzimática Mersacidina Bacillus sp. HILY- 85.54728 Clase II : no lantibióticos No contienen aminoácidos modificados estables al calor y al pH, peso molecular (<10KDa), IIa Alta actividad contra Listeria Formación de poros en la membrana celular Secuencia N-terminal: -Tyr-Gly- Asn-Gly-Val-Xaa-Cys Pediocina PA-1 Sakacina A Leucocina A Curvacina A Mesentericina Y105Pediococcus acidilactici y Lactobacillus plantarum WHE92 Lb. sake Lb706 Leu. gelidum UAL 187 Lactobacillus curvatus LTH1174 Leuconostoc mesenteroides IIb Necesitan dos péptidos para generar actividad Lactacina F Lactococcina G Lactococcina B Lb. acidophilus 11088 Lac. lactis LMG2081 L. lactis subsp cremoris 9B4 IIc Termoestables Acidocina G Lb. acidophilus M46 Clase III Peso molecular (>30KDa) Termo lábiles Helveticina J Lactacina B Lb. helveticus J Lb. Acidophilus N2 Clase IV Incorporan carbohidratos o lípidos en la molécula para tener actividad Leucocina S Lactocina 27 Leu. paramesenteroides Lb. helveticus LP27 Tomado y modificado de Llanos, 2015. 17 2.6.2 Biosíntesis de las bacteriocinas. Las bacteriocinas son sintetizadas como pre-propéptidos, los cuales son procesados y excretados mediante la maquinaria celular de transporte. En las bacterias ácido lácticas, la producción de bacteriocinas está asociada con el crecimiento: generalmente que se da en la fase exponencial y se detiene al término de la misma, aunque existen casos, como el de la nisina en los que la producción ocurre a la mitad de la fase log, llegando a su máximo cuando las células entran en la fase estacionaria (Riley y Wertz, 2002).Las bacteriocinas pueden sintetizarse a través del uso de distintos azúcares (sacarosa y xilosa), se ha visto que, en general, la glucosa es la mejor fuente para una producción neta mayor (Muñoz- Rojas, 2003; Savadogo et al., 2006). La mayoría de las bacteriocinas son sintetizadas como un pre-propéptido inactivo con una secuencia N-terminal líder enlazada al extremo C-terminal del propéptido; sin embargo, existen ciertas diferencias en cuanto al tipo de genes que necesitan para su liberación. Para el caso de los lantibióticos, los genes necesarios son los siguientes: Un gen estructural lanA, que codifica para el pre-propéptido Genes de inmunidad: lanI, lanE, lanF y lanG, que codifican para proteína que protegen a la célula productora del lantibiótico a formar Un gen lanT, que codifica para las proteínas relacionadas con el sistema de transporte ABC Un gen lanP, el cual codifica para una proteinasa-serina encargada de remover la secuencia terminal líder del pre-propéptido Dos genes, lanB y lanC (y en algunos casos, sólo lanM), que codifican para enzimas responsables de la formación de la lantionina y metil-lantionina. Dos genes, lanK y lanR, que codifican para las proteínas regulatorias encargadas de transmitir la señal extracelular que induce la producción de lantibióticos (Chen y Hoover, 2003; Savadogo et al., 2006). 18 El sistema de regulación de la producción de bacteriocinas se compone de tres componentes: un péptido inductor (o factor de feromona de activación), la histidina cinasa transmembranal (receptor de feromona) y un regulador de respuesta. El péptido inductor se sintetiza en el ribosoma en niveles de baja concentración como un prepéptido, que se divide y se excreta al medio. Cuando este compuesto alcanza una concentración umbral, se activa la histidina cinasa transmembranal, lo que conduce a la autofosforilación del residuo de histidina, por lo tanto, se produce la transferencia de fosfato a una proteína reguladora de respuesta. El regulador fosforilado activa la transcripción de la bacteriocina, además de los elementos que componen el sistema de regulación, iniciando una retroalimentación positiva. 2.6.2.1 Modo de acción de las bacteriocinas. Las bacteriocinas demuestran alta actividad bactericida que se relaciona principalmente con el contenido de cistina; y de acuerdo con ello, se establecen tres espectros de acción: a) Bacteriocinas con espectro inhibitorio estrecho, cuyos productos inhiben microorganismos de la misma especie. b) Bacteriocinas con espectro inhibitorio intermedio, cuyos productos inhiben otros géneros de BAL y algunas bacterias patógenas Gram-positivas presentes en alimentos. c) Bacteriocinas con amplio espectro de inhibición que actúan contra un gran número de bacterias Gram-positivas. Las bacteriocinas de bacterias Gram-positivas presentan diferentes modos de acción de acuerdo con su clasificación (Figura 5). 19 El modo de acción de los lántibioticos se atribuye a la desestabilización (debido a la formación de poros) de las funciones de la membrana citoplasmática. La estructura de estos péptidos, α-hélice o β-laminar, pueden formar dos caras, una hidrofílica y otra hidrofóbica creando oligómeros que pueden atravesar la membrana formando poros (Chen y Hoover, 2003). El lado apolar de la molécula se situará próxima a los lípidos de la membrana y el lado polar al centro del poro. Como consecuencia, se observa una pérdida de iones K+, ATP y, en algunos casos aminoácidos y moléculas pequeñas. La pérdida de estas sustancias origina a su vez una pérdida del potencial de la membrana, consumo de las reservas energéticas celulares, descenso de la síntesis de proteínas, originando la muerte celular (McAuliffe et al., 2001). Figura 5. Modo de acción de los lantibióticos (Clase I), no-lantibióticos (Clase II) y bacteriolisinas (Clase III) (Adaptado de Cotter et al., 2005). 20 Los no-lantibióticos contienen dos péptidos en su estructura principal, los cuales pueden presentar actividades duales distribuidas a través de sus dos péptidos. En general, los péptidos de esta clase tienen una estructura anfifílica helicoidal, lo que les permite orientarse e insertarse en la membrana de la célula, provocando la muerte celular. El modo de acción principal se debe a las interacciones con la membrana celular, se inicia con el reconocimiento entre la bacteriocina y el receptor de la membrana celular, seguido de una serie de interacciones electrostáticas, que le permite insertarse dentro de la membrana interfiriendo con su estructura y conduciendo a una despolarización y muerte (Hu et al., 2006). El mecanismo de acción de las bacteriocinas de la clase III “bacteriolisinas” es menos complejo con respecto a los lantibióticos y los no-lantibióticos, ya que actúan directamente sobre la pared celular de las bacterias Gram-positivas lo que conduce a la muerte y lisis de la célula (Cotter et al., 2005). Los investigadores se han centrado en realizar estudios para determinar el efecto inhibitorio que presentan las bacteriocinas sobre las bacterias Gram-negativas y han encontrado que su inhibición es menor. Esta resistencia posiblemente se debe a que éstas cuentan con la presencia de una membrana externa, que contiene lipopolisacáridos que actúa como una barrera de permeabilidad efectiva (Chung y Yousef, 2005). 2.6.3 Aplicación de las bacteriocinas en la industria alimentaria. Hoy en día, las bacteriocinas se utilizan ampliamente, especialmente en el campo de la conservación de alimentos. El uso de bacteriocinas en la industria alimentaria, especialmente en lácteos, huevo, vegetales y productos cárnicos ha sido ampliamente investigado. Entre las bacteriocinas de BAL la nisina ha demostrado ser altamente eficaz contra agentes microbianos que causan intoxicación y el deterioro de los alimentos. Además, la nisina es la única bacteriocina que se ha empleado oficialmente en la industria de los alimentos y su uso ha sido aprobado en todo el mundo (Moll et al., 1999, Deegan et al., 21 2006). Numerosos métodos de conservación, se han utilizado con el fin de prevenir el deterioro y enfermedades causadas por microorganismos presentes en los alimentos. Estas técnicas incluyen el tratamiento térmico (pasteurización, esterilización por calor), reducción en los valores de pH y de aw (acidificación, deshidratación) y adición de conservantes (antibióticos, compuestos orgánicos tales como propionato, sorbato,benzoato, lactato, y el acetato). Aunque estos métodos han demostrado ser de gran éxito, hay una demanda creciente de productos naturales, microbiológicamente seguros que proporcionan al consumidor altos beneficios para la salud (Deegan et al., 2006). 2.7 Lantibióticos y sus aplicaciones. En la actualidad se han identificado más de 95 estructuras de diversos lantibióticos y varias exhiben una actividad muy interesante que los hacen candidatos para futuras aplicaciones en diversas áreas. Además, los lantibióticos tienen muchas características y propiedades químicas, bajo peso molecular estables al calor, falta de toxicidad, baja tendencia a generar resistencia, esto los hace adecuados para aplicaciones potenciales asociadas con el cuidado de la salud como en la medicina humana y veterinaria, en la industria bioquímica, farmacéutica y la industria alimentaria agrícola. El primer lantibiótico en ser usado comercialmente fue la nisina (Figura 6), este exhibe una actividad antimicrobiana frente a bacterias Gram positivas, incluyendo los agentes que causan deterioro de los alimentos como Listeria monocytogenes (Denny, 1961) o Clostridium, por lo que se ha utilizado como conservante biológico de alimentos (E234, Nisaplin ®) en productos lácteos procesados, así como frutas y verduras por más de 50 años. La nisina también se utiliza comercialmente en productos de cuidado de los animales para la prevención de la mastitis bovina causada por Staphylococcus aureus o Streptococcus agalactiae. En la tabla 3 se muestran algunos lantipéptidos. 22 Tabla 3.Clasificacion de lantibióticos de acuerdo con Knerr y van der Donk (2012). Clase 1 Procedencia Clase 2 Procedencia Nisina A Lactococcus lactis ATCC11454 Lactacin 481 Lactococcus lactis Nisina Q Lactococcus lactis Macedocina Streptococcus macedonicus ACADC198 Nisina U Streptococcus uberis 42 Lactocina 3147 Lactococcus lactis subspec. lactis DPC3147 Nisina Z Lactococcus lactis Figura 6. Estructura de diferentes lantipéptidos (Dischinger, 2014). 23 2.8 Bacterias patógenas presentes en los alimentos. Los microorganismos patógenos son aquellos que al ingresar a un hospedero, son capaces de provocar una enfermedad o infección en ellos. Las enfermedades transmitidas por alimentos (ETA) son términos que se aplican a todas las enfermedades que se adquieren por medio del consumo de alimentos contaminados. Las causas más comunes son intoxicaciones e infecciones, se estima que en el mundo unos 600 millones de personas se enferman al año por consumir alimentos contaminados por bacterias (OMS, 2015). 2.8.1 Listeria monocytogenes. Listeria monocytogenes es una bacteria facultativa Gram-positiva, móvil mediante flagelos, anaerobio facultativo, es una de las principales causas de muerte por enfermedades transmitidas por alimentos. L. monocytogenes; es tolerante a la sal y no sólo puede sobrevivir en temperaturas de refrigeración, sino también puede crecer en estas condiciones, a diferencia de muchos otros agentes patógenos. También es notable por su persistencia en entornos de fabricación de alimentos. La bacteria es ubicua en el medio ambiente y se puede encontrar en ambientes húmedos, el suelo y la vegetación en descomposición. De las otras cinco especies del género Listeria; L. grayi, L. innocua, L. ivanovii, L. seeligeri y L. welshimeri, solamente L. ivanovii se considera patogénico, y sobre todo en los rumiantes, en lugar de en los seres humanos. Listeria afecta en mayor medida a personas de los extremos de edad de la vida, mujeres embarazadas y personas con algún tipo de inmunodepresión, fundamentalmente celular, o enfermedad debilitante, como neoplasias hematológicas, trasplantados, tratados con corticoides o antagonistas del factor de necrosis tumoral, cirrosis hepática, enfermedades por depósito de hierro (hemocromatosis), insuficiencia renal avanzada, diabetes mellitus y enfermedades autoinmunes. 24 L. monocytogenes es una de las principales causas de muerte por enfermedades transmitidas por alimentos. Un informe reciente (2011) de los Centros para el Control y Prevención de Enfermedades (CDC) estima que en los Estados Unidos, cada año 1600 personas se enferman gravemente de listeriosis y 260 de ellas mueren (CDC, 2012). 2.8.2 Escherichia coli. Este microorganismo es un bacilo Gram negativo, anaerobio facultativo, móvil por flagelos y no tiene la capacidad de formar esporas, la mayoría de las cepas de Escherichia coli no son patógenas y forman parte de la microflora entérica normal del colon humano. Sin embargo unas cuantas cepas son potencialmente patógenas y se transmiten por alimentos. Todas estas cepas son patógenos intestinales y varias de ellas se caracterizan por su capacidad de producir enterotoxinas muy potentes. Existen unas 200 cepas patógenas conocidas de E.coli. Algunas causan enfermedades diarreicas graves e infecciones del tracto urinario. Las cepas patógenas se pueden dividir según el tipo de toxina que producen (Tabla 4) y la enfermedad especifica que causan (Brock, 2009). 25 Tabla 4. Características de los grupos de Escherichia coli patogénicas. Grupo Síntomas Epidemiologia Factor de virulencia Serotipo y serogrupos más comunes Enteropatógena EPEC Diarrea secretora Lactantes Adherencia localizada, Adherencia intima O26:H11 O56:H6 O86:H32 O111:H2 0114:H O127:H9 Enterotoxigénica ETEC Diarrea secretora Mayores de 5 años Enterotoxinas ST y/o LT Factores antigénicos de colonización O6:H11 O8:H9 O11:H27 O20:NM 025:H42 O78:H11 Enteroinvasiva EIEC Diarrea inflamatoria Todas las edades Invasividad O28ac:NM O29:NM O112ac:NM O115:NM O124:H30 Enterohemorrágica EHEC Diarrea sanguinolen ta inflamatoria Todas las edades Citotoxinas similares a la toxina de shiga O26:H11 O45:H2 O111:H8 O121:H19 O157:H7 Enteroagregativa EAEC Diarrea persistente y aguda Todas las edades Adherencia, Toxinas Pet y Pic O44:H18 O55 O111 O125 O126 O128 Tomado y modificado (Eslava, 2015). 26 2.9.3 Salmonella. El género Salmonella pertenece a la familia Enterobacteriaceae, son bacilos Gram negativos, no formadores de esporas, anaerobios facultativos, provistos de flagelos y móviles (Jurado et al., 2010). Las bacterias de este género son ubicuas y resistentes, pueden sobrevivir varias semanas en ambientes secos y muchos meses en agua. Por esta razón son una causa importante de enfermedades transmitidas por alimentos en humanos. Se conoce como salmonelosis al grupo de infecciones producidas por bacterias del género Salmonella, las cuales se adquieren por la ingesta de alimentos o bebidas contaminados (Uribarren, 2014). La salmonelosis es una de las enfermedades transmitidas por alimentos más comunes a nivel mundial. Los serotipos causantes de enfermedades en humanos, a menudo lo hacen de forma invasiva y puede ser mortales si no se cuenta con el tratamiento adecuado (WHO, 2016). Se conocen tres formas clínicas de salmonelosis en el humano: gastroenteritis (causada por Salmonella enterica ser. Typhimurium, Salmonella enterica ser. Enteritidis, etc.), fiebre entérica (causada por Salmonella enterica ser. Typhi y Salmonella enterica ser. Paratyphi) y una enfermedad invasiva sistémica ocasionada por Salmonella enterica ser. cholerasuis (Romero, 2007). 2.9.4 Staphylococcus aureus. Los miembros del género Staphylococcus son cocos Gram positivos que se agrupan regularmente en racimos, inmóviles, no esporulados, dan positiva la reacción de la catalasa y por lo general producen una microcápsula de naturaleza polisacárida (Bannerman, 2003). Algunos de los miembros delgénero Staphylococcus forman parte de la microbiota de la piel en humanos. Las personas son el reservorio principal de los estafilococos involucrados en la enfermedad humana, incluyendo S. aureus. Llegan al alimento ya sea por la inoculación de este microorganismo en la preparación de alimentos, higiene deficiente en su preparación o mala limpieza de los utensilios (Doyle y Beuchat, 2007). Staphylococcus aureus, el patógeno más importante del género, produce infecciones de piel y tejidos blandos, infecciones invasoras y cuadros tóxicos, 27 genera enterotoxinas termoestables que actúan sobre el intestino delgado, causando secreción masiva de líquidos en la luz intestinal. Los síntomas de intoxicación alimentaria estafilocócica suelen ser los siguientes: náuseas, vómito, retortijones abdominales intensos, diarrea, sudoración, cefalalgia, abatimiento y un eventual descenso de la temperatura corporal. Estos síntomas, que generalmente duran de 24 a 48 horas, suelen aparecer dentro de las 4 horas siguientes a la ingestión del alimento contaminado. Este microorganismo se encuentra frecuentemente en productos lácteos y cárnicos (Brock, 2009). 2.9.5 Streptococcus mutans. Streptococcus mutans es una bacteria Gram positiva, en forma de coco, se considera el microorganismo más cariogénico de la placa bacteriana, teniendo un papel activo en el desarrollo de la caries, siendo importante en la primeras etapas de desarrollo de la lesión; éstos son eficientes fermentadores de glúcidos, además son microorganismos acidúricos (tolerantes al ácido) y acidógenos (productores de ácido); por lo que son capaces de reducir el pH de la placa bacteriana (Menaker et al, 1986). 2.9.6 P. aeruginosa. Pseudomonas aeruginosa son bacilos Gram negativos, móviles con flagelos polares, aerobios estrictos, metabolismo oxidativo no fermentativo. La principal especie es la Pseudomona aeruginosa, crecen entre 10 y 42ºC, se encuentra ampliamente distribuida en la naturaleza, se puede aislar de muestras de suelo, aguas contaminadas, así como de plantas y animales. Esta bacteria es capaz de utilizar una enorme variedad de compuestos orgánicos como sustrato para crecer, capacidad que le permite colonizar nichos en los que son escasos los nutrimentos que otros organismos pueden asimilar, P. aeruginosa presenta problemas en la industria alimentaria ya que puede descomponer los alimentos que se mantienen en refrigeración al mantener un metabolismo basal en estas condiciones y producir enzimas hidrolíticas. P. aeruginosa representa un problema importante de salud. Una vez que se establece la infección, P. aeruginosa produce una serie de compuestos tóxicos Entre las proteínas que 28 intervienen en la infección de P. aeruginosa encontramos toxinas, como las exotoxinas A y S, así como enzimas hidrolíticas que degradan las membranas y el tejido conjuntivo de diversos órganos. Esta situación se ve agravada por la dificultad para tratar las infecciones por P. aeruginosa, ya que esta bacteria presenta una muy alta resistencia natural a distintos antibióticos y a desinfectantes (Microbios en línea. (s.f.). Recuperado 12 Agosto del 2015, de http://www.biblioweb.tic.unam.mx/libros/microbios/index.html) 29 3. Justificación. En los últimos años ha habido un aumento en los métodos de conservación de alimentos, los métodos biológicos como el uso de microorganismos antagonistas y sus metabolitos antimicrobianos que pueden tener uso potencial como conservador natural, como regulador del crecimiento y como antimicrobiano de microorganismos indeseables en los alimentos, son una opción muy utilizada. Las bacterias ácido lácticas (BAL) forman parte de un gran número de alimentos fermentados, ya sean los producidos a gran escala o alimentos fermentados tradicionales, como lo son el pozol y el atole agrio, las BAL no solo imparten seguridad alimentaria también le dan calidad organoléptica a los alimentos. La aplicación de bacteriocinas en los alimentos ha tenido una importante contribución, en especial la nisina ya que es considerada como un aditivo GRAS en la conservación de alimentos, por tal motivo la investigación de cepas de Lactococcus productores de esta bacteriocina es de gran importancia. 30 4. Hipótesis. Si los sobrenadantes neutralizados y tratados térmicamente de las cepas de Lactococcus aisladas del pozol y del atole agrio son capaces de inhibir a algunas bacterias patógenas y de descomposición presentes en alimentos, entonces estas sustancias podrían ser bacteriocinas. 5. Objetivos. Objetivo general Determinar si las cepas de Lactococcus aisladas del pozol y del atole agrio, son capaces de producir sustancias similares a bacteriocinas, para el control de bacterias patógenas y de descomposición presentes en los alimentos. 31 Objetivos particulares 1. Identificar mediante la comparación de secuencias del gen rRNA 16S a las bacterias lácticas que presentaron actividad antimicrobiana. 2. Comprobar la naturaleza proteica de las sustancias antimicrobianas producidas por las cepas de Lactococcus aisladas del pozol y del atole agrio. 3. Evaluar el potencial antimicrobiano de las cepas de Lactococcus aisladas del pozol y del atole agrio frente a bacterias patógenas y de descomposición presentes en alimentos mediante el método de difusión en agar. 4. Determinar el efecto antimicrobiano de las cepas de Lactococcus aisladas del pozol y del atole agrio frente a bacterias del género Streptococcus presentes en cavidad oral, por el método de difusión en agar. 5. Observar la viabilidad de Listeria monocytogenes en sobrenadantes tratados térmicamente y neutralizados de cepas de Lactococcus con actividad antimicrobiana. 6. Estudiar la interacción entre Listeria monocytogenes y las bacterias ácido lácticas aisladas del pozol y del atole agrio productoras de compuestos con actividad antimicrobiana, mediante una prueba de reto. 32 6. Metodología. 6.1 Microorganismos. 6.1.1 Bacterias Ácido Lácticas usadas en el experimento Las BAL empleadas en el estudio pertenecen a la colección de cepas del laboratorio 324, Conjunto E, Facultad de Química, UNAM y hasta el momento fueron identificadas como bacterias pertenecientes al género Lactococcus. Las cepas fueron aisladas de diferentes muestras de pozol originario de Tabasco y Chiapas, además de atole agrio originario de Tabasco. Dichas cepas se mantuvieron conservadas en caldo MRS al 20% de glicerol a -70ºC (Tabla 5). 6.1.2 Microorganismos indicadores. Para evaluar la posible producción de bacteriocinas de las BAL, se utilizaron las siguientes bacterias que se denominaron indicadoras. Se evaluaron tanto Gram positivas como Gram negativas. Dichas cepas se mantuvieron conservadas en caldo BHI OXOID® al 20% de glicerol a -70ºC. En la Tabla 6 se indican las cepas utilizadas, las claves y el origen. 33 Tabla 5. Bacterias Ácido Lácticas utilizadas en el presente estudio. Clave interna Clave en el presente trabajo Alimento de origen Procedencia de la muestra Clave interna Clave en el presente trabajo Alimento de origen Proceden cia de la muestras *334 33 Pozol Villahermosa, Tab. 22SnC1 22SnC Pozol1 Chiapas A45212 2 A45212 Pozol Villahermosa, Tab. A1MS3 5 A1MS3 Atole agrio Villaherm osa, Tab. 54ch6 54ch Pozol Villahermosa, Tab. 105 10 Atole agrio Villaherm osa, Tab. 673 67 Pozol Villahermosa, Tab. IIL6i25 44 Atole agrio Villaherm osa, Tab. 833 83 Pozol Villahermosa, Tab. IIS4i2580 Atole agrio Villaherm osa, Tab. 933 93 Pozol Villahermosa, Tab. IIS6i35 84 Atole agrio Villaherm osa, Tab. 253 25 Pozol Villahermosa, Tab. IIS12i15 91 Atole agrio Villaherm osa, Tab. SnC151 SnC15 Pozol Chiapas IL4A25 103 Atole agrio Villaherm osa, Tab. SnC231 SnC23 Pozol Chiapas IL6A15 108 Atole agrio Villaherm osa, Tab. SnC251 SnC25 Pozol Chiapas IS6A15 113 Atole agrio Villaherm osa, Tab. 4SnC1 4SnC Pozol Chiapas IS6A35 115 Atole agrio Villaherm osa, Tab. 21SnC1 21SnC Pozol Chiapas IS10A2 5 119 Atole agrio Villaherm osa, Tab. 18SnC1 18SnC Pozol Chiapas IS12A1 5 120 Atole agrio Villaherm osa, Tab. 13SnC1 13SnC Pozol Chiapas (1) Nuraida, 1995, (2) Díaz-Ruiz et al, 2003, (3) Becerril, 2010, (4) Tavera, 2010, (5) Valderrama, 2012,(6) Pilatasig, comunicación personal (*) Cepa usada como control positivo (Tavera, 2010) para las pruebas de difusión en agar, para el ensayo con Listeria monocytogenes 34 Tabla 6. Cepas indicadoras patógenas o de descomposición utilizadas en la prueba de difusión en agar. Cepa Clave de la cepa Origen de la muestra G ra m + S. aureus ATCC 25923 Cepario de la Facultad de Química B. cereus 11778 Cepario de la Facultad de Química E. faecalis ATCC 29212 Cepario de la Facultad de Química L. monocytogenes CFQ-103 Cepario de la Facultad de Química Streptococcus oralis S/clave Cepario de la Facultad de Química Streptococcus mutans ATCC 10449 Colección de microorganismos del Dr. Fausto Rivero. Streptococcus sanguinis S/clave Colección de microorganismos de la Facultad de Medicina G ra m - E.coli 0157 : H10 27377 Colección de microorganismos del Laboratorio 324 Salmonella Typhimurium ATCC 14028 Cepario de la Facultad de Química P. aeruginosa ATCC 27853 Cepario de la Facultad de Química 6.2 Reactivación de cepas y confirmación de la pureza de las cepas a estudiar. La reactivación de las cepas de BAL (Tavera, 2010), se realizó en 5 ml de medio (MRS DifcoTM), a partir de las cepas conservadas en medio MRS con glicerol al 20 % a -70ºC. Se inocularon 50 µl, en el caso de las cepas conservadas en medio líquido, en el caso de las cepas conservadas en perlas de vidrio se utilizó solo una perla para la reactivación y se incubaron a 30°C por 24 h. Las bacterias patógenas o de descomposición se reactivaron, 50 µl de cultivo en 5 mL de medio BHI OXOID® y se incubaron a 37ºC durante 24 horas. Para la determinación de pureza se realizó una prueba de catalasa y una tinción de Gram, tanto para las BAL y las bacterias patógenas o de descomposición. Se esperaba que la morfología fuera uniforme al observarse al microscopio y que la prueba catalasa fuera negativa para las BAL y positiva para las bacterias indicadoras. 35 6.2.1 Conservación de las cepas lácticas, patógenas y de descomposición. Para conservar las cepas se inoculó una colonia de cada cepa en 5 mL de medio MRS para bacterias lácticas y BHI para los microorganismos patógenos o de descomposición, los cultivos se incubaron durante 24 h a 30ºC para BAL y 37ºC para bacterias patógenas o de descomposición luego se separaron las células del medio de cultivo, esto se realizó tomando 1 mL de cada cultivo, en un microtubo de 1.5 mL y se centrifugó a 8000 rpm durante 10 minutos, esto se realizó dos veces. El pellet de las células se lavó con 1 mL de solución salina al 0.85%, el cual posteriormente se centrifugó para volver a separar las células de la solución salina. Una vez que las células se habían lavado, se resuspendió el pellet en medio MRS o BHI con glicerol al 20% según el caso, se transfirió el cultivo a un criotubo para así ser conservado en un ultracongelador (Puffer Hubbard TM) a -70ºC. 6.3 Obtención de sobrenadantes. Se reactivaron las cepas seleccionadas en 5 ml de medio MRS, con una alícuota de 50 µL de cada cepa de Lactococcus conservadas en congelación. Se incubó cada cultivo durante 24 h a 30°C. Después se tomó una alícuota de 1 mL de cada cultivo y se colocó en un microtubo de 1.5 mL, se centrifugó a 8000 rpm durante 10 minutos (Centrífuga Eppendorf 5417R). Esto para separar las células del medio de cultivo. Se separó el sobrenadante, transfiriéndolo a otro microtubo de 1.5 mL para poder conservarlo en refrigeración (5ºC para pruebas a corto plazo y -20º para pruebas a largo plazo), realizar el tratamiento y realizar las pruebas de difusión en agar. Figura 7. Las bacteriocinas son compuestos extracelulares, se recomienda el uso de medios libres de células (Vignolo et al. 1993; Alvarado et al. 2006; Vallejo et al. 2009). 36 Reactivación de BAL, 50 µL en 5 mL de caldo MRS Realizar un pase a las 1 mL de BAL 24 h de incubación de 50 µL BAL conservada a -70°C 5 mL caldo MRS 5 mL caldo MRS 100 mL MRS Incubación 24 h, 30C° Incubación 24 h, 30°C Incubació n 24 h, 30°C Tubo de centrifuga Centri -fugar 10000 rmp 15 min 4°C Transferir a un matraz estéril. 100-105°C 10 min Ajustar pH a 6-7 Sobrenadante listo. Concentrar al 50% con rota vapor 55°C, 60-100 rpm, 70 mbar. Sobrenadante concentrado al 50%. Figura 7. Esquema de la metodología empleada para obtener los sobrenadantes concentrados y sin concentrar para su posterior utilización. 37 6.4 Preparación de medio de cultivo Infusión cerebro –corazón amortiguado (BHI-A). Se preparó un medio tamponado con medio BHI OXOID®, esto con el fin de eliminar el efecto inhibitorio de los ácidos orgánicos producidos por las bacterias lácticas, de igual forma se preparó una sobrecapa de medio tamponado tal como se describe en la Tabla 7. Tabla 7. Formulación de medio BHI amortiguado (1000 mL). Placa (BHI-A) Sobrecapa (BHI-A) BHI OXOID® 37 g BHI OXOID® 15 g Agar bacteriológico 17 g Agar bacteriológico 8 g Fosfato monobásico de sodio 4.3 g Fosfato monobásico de sodio 4 g Fosfato dibásico de sodio 10 g Fosfato dibásico de sodio 10 g Agua destilada 1000 mL Agua destilada 1000 mL 6.4.1 Preparación de placas BHI-A. Para la preparación de placas se mezclaron los componentes en un matraz Erlenmeyer según lo describe la Tabla 7. El medio se esterilizó a 121º C durante 15 min. Enfriado el medio a 40-45ºC se procede a verter 15 mL del medio en cajas Petri estériles, una vez solidificadas se mantuvieron a 30ºC por 24 horas para evaluar su esterilidad. 6.4.2 Preparación de sobrecapa BHI-A. El uso de una sobrecapa semisólida es para que el compuesto a estudiar se pueda difundir con más facilidad. Para la preparación de la sobrecapa se mezclaron los componentes en un matraz Erlenmeyer según lo describe la Tabla 5. Se homogenizó el medio con agitación hasta la ebullición, se vertieron 10 mL del medio en tubos de ensaye con tapón de rosca y se esterilizaron a 121º C durante 15 min, se mantuvieron a 30ºC por 24 horas para asegurar su esterilidad. Los medios y los reactivos se muestran en el Anexo A. 38 6.5 Preparación de cepas patógenas y de descomposición. Las cepas se reactivaron en 5 mL de medio BHI un día antes de realizar la prueba. Se utilizó un inoculo de 50 µL del cultivo congelado en 5mL medio BHI y se incubaron a 37°C durante 24 horas Tabla 8. Tabla 8. Condiciones de trabajo de bacterias patógenas y de descomposición presentes en alimentos y bacterias patógenas de cavidad oral. Microorganismo indicador Inóculo µL Tiempo de incubación al reactivar (h) Dilución para realizar la prueba Inóculo en sobrecapa µL Tiempo de incubación de la prueba (h) Enterococcus faecalis 50 24 10-3 40 18-24 Staphylococcus aureus 50 24 10-3 40 18-24 Escherichia coli 0157H10 50 24 10-3 40 18-24 Salmonella Typhimurium 50 24 10-3 40 18-24 Bacillus cereus 50 24 10-3 40 18.24 Pseudomonas aeruginosa 50 24 10-3 40 18-24 Listeria monocytogenes 50 24 10-2 40 18-24 Streptococcus oralis 50 72 - 40 18-24 Streptococcus mutans 50 24 10-2 40 18-24 Streptococcus sanguinis 50 24 10-1 100 18-24 Tabla tomada y modificada de (Llanos, 2015) 39 6.6 Método de difusión en agar. Para el método de difusión en agar se utilizaron torres de vidrio para hacer los pozos en el medio de cultivo. Primero se colocaron las torres en el medio tamponado, posteriormente se fundió la sobrecapa y se inoculó con 40 µL 0 100 µL, de la dilución correspondiente, según el microorganismo como se muestra en la Tabla 8. La sobrecapa ya inoculada se vertió sobre la placa de medio tamponado, cuidando de no derramar el medio de cultivo en el centro de las torres, para asegurar que los pozos queden bien definidos. Una vez que la sobrecapa se enfría y solidifica, se procedió a retirar las torres. Una vez que se retiraron las torres, se colocó en cada pozo 80 µL del sobrenadante de cada cepa de BAL que se prepararon previamente, después de 24 h de incubación a 37ºC se reportó el radio de los halos de inhibición Figura 8. 40 . Reactivación de Patógeno 50 µL en 5 mL de caldo BHI, 24 h, 37°C Patógeno con 24 h de crecimiento 6-24h, 37°C Pase de 50 µL en 5 mL de caldo BHI estéril Patógeno reactivado 10 mL de sobrecapa BHI tamponado o sin tamponar según el ensayo realizar Vortex Verter sobrecapa Placa de BHI tamponado Remover torres de vidrio Sobrenadante sin tratamiento, con tratamiento según el ensayo. Incubar 37°C 18-24 h Control (-) H2O destilada estéril Figura 8. Esquema de la metodología empleada para realizar el ensayo de difusión en agar utilizando los sobrenadantes neutralizados y tratados térmicamente (NTT) o Concentrados Neutralizados y Tratados Térmicamente CNTT), empleando las cepas seleccionadas como patógeno indicador. 41 6.7 Tratamiento de los sobrenadantes y ensayo de actividad antimicrobiana. 6.7.1 Neutralización de los sobrenadantes y tratamiento térmico. Solo los sobrenadantes de las cepas que presentaron actividad antimicrobiana, se neutralizaron ajustando el pH con NaOH 1M con un potenciómetro (Oakton pH700) a un valor de pH de 6.5-7.0 y se les dio un tratamiento térmico de 100- 105°C por 10 minutos. Los sobrenadantes se conservaron en refrigeración a 5°C. Después de los tratamientos se realizaron ensayos de actividad antimicrobiana mediante el método de difusión en agar, se reportó el radio de los halos de inhibición. 6.7.2 Neutralización, tratamiento térmico y concentración. Las cepas que conservaron su actividad antimicrobiana se concentraron hasta un 50 %, en un rotavapor (BUCHI) con bomba de vacío (BUCHI), la concentración se realizó a 55ºC, 80 rpm, 65 mbar por 1.5 h. Estos sobrenadantes también fueron neutralizados y tratados térmicamente, los concentrados se guardaron en congelación a -4°C Después de los tratamientos se realizaron ensayos de actividad antimicrobiana mediante el método de difusión en agar, se reportaron los radios de los halos de inhibición. 6.7.3 Determinación de la naturaleza proteica de las sustancias similares a bacteriocinas producidas BAL. Solo las cepas que fueron capaces de mantener su actividad después de ser concentradas se sometieron a un tratamiento enzimático con una proteasa de Bacillus licheniformis (las características de la proteasa se muestran en el Anexo B), para comprobar su naturaleza proteica, las condiciones se describen en la Tabla 9, dichas condiciones fueron las mismas para cada sobrenadante de las 3 cepas seleccionadas. Después de los tratamientos se realizaron ensayos de actividad antimicrobiana mediante el método de difusión en agar, se reportaron los radios de los halos de inhibición, Figura 9. 42 Tabla 9. Condiciones del ensayo enzimático de los sobrenadantes de BAL productoras de posibles bacteriocinas. Enzima Tiempo de incubación Agitación Temperatura de incubación Relación de volumen Proteasa 2 h 300 rpm 37ºC 0.5 mL SNTT/0.5 mL solución de proteasa 1 mg/mL 43 SNTT (5 mL) Buffer Glicina-NaOH pH9 + 5 mg de proteasa. 5 mL de proteasa 1 mg/mL Microtubo con 0.5 ml de CNTT o SNTT Incubar 2 h a300 rpm, 37°C Ensayo de difusión en agar 80 µL 80µL de SCNTB o SNTB sin tratamiento enzimático Sobre capa de BHI con bacteria patógena de ensayo Figura 9. Esquema utilizado para realizar el ensayo enzimático utilizando los sobrenadantes Neutralizados y Tratados Térmicamente (NTT) o concentrados neutralizados y tratados térmicamente (CNTT). 0.5ml de solución de proteasa 1mg/mL 44 6.8 Identificación de bacterias ácido lácticas por comparación de secuencias del gen rRNA 16S. 6.8.1 Extracción y purificación del ADN. Las cepas aisladas de bacterias ácido lácticas provenientes del pozol y del atole agrio se reactivaron de la misma manera que se muestra en la sección 5.2. Después de 24 h de crecimiento se tomaron 1.5 mL del cultivo en microtubos del kit de extracción de Fast ID, se centrifugaron a 8000 rpm por 15 minutos a 10ºC, se retira el sobrenadante y se lava el pellet con solución salina estéril al 0.85%, el proceso se realiza dos veces y el pellet se utiliza para la extracción del ADN utilizando el kit de extracción de Fast ID como se describe en Anexo B.5. 6.8.2 Amplificación mediante PCR de la región V1 del gen rRNA 16S. Para la amplificación mediante PCR se realizó el siguiente procedimiento: Se preparó una mezcla de reacción en microtubos como se muestra en la Tabla 11. En la Tabla 12 se indican los cebadores utilizados, la reacción se llevó a cabo en un termociclador (Biometra® Tpersonal). En la Tabla 13 se muestran las condiciones para la amplificación. Tabla 11. Reactivos para la mezcla de reacción para la amplificación por PCR de la región V1 del gen rRNA 16S. Reactivo Volumen (µL) Buffer [10x] 5 MgCl2 [25mM] 5 dNTPs [10mM] 1 Primer pA [20ng/ µL] 0.5 Primer 3 [20ng/ µL] 0.5 Taq polimerasa [1u/ µL] 1 Templado [10ng/ µL] 10 Agua destilada estéril 27 Total 50 45 Tabla 12. Cebadores utilizados para la amplificación por PCR de la región V1 del gen rRNA 16S Cebador Secuencia 5’- 3’ Posición Orientación pA AGAGTTTGATCCTGGCTCAG 9-28 Reversa 3 GTTGCGCTCGTTGCGGGACT 1109-1090 Hacia adelante Gamma* ACTGCTGCCTCCCGTAGGAG 358-339 Hacia adelante *Se utiliza solo en la secuenciación del fragmento Tabla 13. Condiciones de PCR para amplificar la región V1 del gen rRNA 16S. Temperatura (ºC) Tiempo (min) Ciclos Desnaturalización inicial 94 3 1 Desnaturalización 94 1 34 Alineamiento 65 1.5 34 Extensión 72 2 34 Extensión final 72 15 2 Después de la reacción de PCR se realizó una electroforesis en gel de agarosa al 2% a 70 volts por 60 min. De inmediato, al término de la electroforesis se revelo el gel en una solución de bromuro de etidio al 3% por 15 min. El gel se observó a través del equipo (Chemidoc TM MP Imaging System) y se utilizó el programa
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