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Metabolismo de Bases Dra. SUSANA GONZALEZ 2019 Nucleótidos • Constituyentes de los ácidos nucleicos: ácido desoxirribonucleico (ADN) y ácido ribonucleico (ARN), depositarios moleculares de la información genética • Señales químicas en las células, en respuesta a hormonas y otros estímulos extracelulares (AMPc, GMPc) • Componentes estructurales de cofactores enzimáticos (NAD, FAD, Coenzima A) • Intermediarios metabólicos de alta energía (UDP- glucosa), reguladores alostéricos y en metabolismo energético (ATP, GTP) Estructura General de un Nucleótido Se muestra un ribonucleótido; en un desoxirribonucleótido el H reemplaza al OH del C 2’ (Monosacárido de 5 C) (Base nitrogenada) (1 a 3 grupos fosfatos) Estructura de las Bases 6-aminopurina 2-amino-6-oxopurina 4-amino-2-oxopirimidina 2,4-dioxopirimidina 5-metil-2,4-dioxopirimidina Algunas estructuras importantes… ATP AMPc: Coenzima A 3’, 5’-monofosfato cíclico de adenosina Deriva de adenosina difosfato Rutas Metabólicas que conducen a la formación de nucleótidos • De Novo: a partir de precursores metabólicos (aminoácidos como fuente de C y N, formiato y CO2 como fuente de C) • De Recuperación: reciclan las bases libres y los nucleósidos liberados durante la degradación de ácidos nucleicos Síntesis de Novo: Origen de los átomos del anillo de las Purinas N1 N3 y N9 C4, C5 y N7 C6 C2 C8 La forma activada de la ribosa es necesaria para la biosíntesis de los nucleótidos de purina, pirimidina y las vías de recuperación Ribosa-5-fosfato 5-fosforribosil 1-pirofosfato (PRPP) PRPP sintetasa Ribosa-fosfato pirofosfoquinasa o PRPP sintetasa Actividad regulada por: • Mg2+ como activador • AMP, GMP y sus correspondientes dinucleótidos, ADP y GDP, como inhibidores. Vista General de la Producción de Nucleótidos de Purinas Buchanan y Greenberg describieron la ruta biosintética de Purinas (1950) La glutamina aporta el N9 del anillo, que se une al C1 de la ribosa PRPP amidotransferasa • AMP, GMP la inhiben (actúan como reguladores alostéricos que regulan su propia síntesis por retroinhibición) y también los di y trinucleótidos • PRPP la activa Vida media muy corta Adición de glicina (C4, C5 y N7 del anillo púrico): se forma una unión amida entre el carboxilo de la glicina y el amino de la fosforibosilamina Fosforribosil- glicinamido-sintetasa Introducción del grupo formilo (C8 del anillo) vía THF: Formil transferasa …el anillo ya posee sus 5 miembros (imidazol), pero antes de cerrarse… Fosforribosil-formil- glicinamido-sintetasa N3 El cierre del anillo requiere ATP Fosforribosil aminoimidazol sintetasa IMP carboxilasa C6 Se forma unión amida: Amino del aspartato y el carboxilo del C5 del anillo Se rompe N-C del aspartato Adenilo-succinato liasa IMP Biosíntesis de AMP y GMP a partir de IMP Requiere 6 ATP Requiere 7 enlaces alta E Conversión del carbonilo en C6 en amino Introducción de amino en C2 Xantosina-5´-monofosfato Requiere 8 enlaces alta E + + PRPP amidotransferasa 4 enzimas son reguladas Mecanismos de Regulación de la Biosíntesis de los Nucleótidos de Adenina y Guanina GMP, AMP se convierten en GDP, GTP y ADP por quinasas específicas (usando ATP) - AMP/GMP y los di y tri nucleótidos - GDP/ADP Degradación de los Nucleótidos de Purinas • Los nucleótidos se degradan y producen bases libres • Las bases libres pueden ser recuperadas • Si no son reutilizadas y recicladas, se degradan y sus productos finales son excretados APRTasa: adenina-fosforribosil-transferasa HGPRTasa: hipoxantina-guanina-fosforribosil-transferasa Adenina + PRPP AMP + PPi Guanina + PRPP GMP + PPi Hipoxantina + PRPP IMP + PPi APRTasa HGPRTasa HGPRTasa Las bases Púricas se reciclan a través de vías de recuperación Las bases se transforman en sus nucleósidos monofosfato en un solo paso, usando la ribosa-5-P del PRPP Adenosina + ATP AMP + ADP Adenosina quinasa Degradación de los Nucleótidos de Purina 5´-nucleotidasa nucleosidasa Guanina deaminasa Adenosina deaminasa 5´-nucleotidasa nucleosidasa Xantina oxidasa Xantina oxidasa Producto final del metabolismo de purinas Nucleósido FAD, Molibdeno y centros Fe-S Síntesis de Novo: Origen de los átomos del anillo de pirimidinas Biosíntesis de Ribonucleótidos de Pirimidinas Aspartato Glutamina Síntesis de UMP • Formación de carbamil-fosfato (C2 y N3 del anillo de pirimidinas) CO2 + glutamina + 2 ATP carbamil-fosfato + glutamato +2 ADP +Pi CPS II CPS II: carbamil fosfato sintetasa II, enzima citosólica que usa glutamina. Es diferente de la CPS I, que es mitocondrial, y utiliza NH3 como sustrato e interviene en el ciclo de la urea. Síntesis de novo de los nucleótidos de pirimidinas N1, C4, C5 y C6 C2 y N3 (ácido orótico) Ya formado el anillo pirimidínico, se agrega PRPP OMP UMP Uridina monofosfato Orotidina monofosfato La síntesis de UMP requiere 6 actividades enzimáticas que se encuentran en 3 péptidos • Carbamil fosfato sintetasa II, la aspartato transcarbamilasa y la dihidroorotasa • Dihidroorotato deshidrogenasa • Orotato fosforribosiltransferasa y OMP descarboxilasa (al inhibir la OMP descarboxilasa se acumulará ácido orótico) UMP es el precursor de los nucleótidos citidínicos UTP da CTP por aminación: la glutamina actúa como dadora de grupo amino CTP UMP Regulación de la síntesis de novo de nucleótidos de pirimidina • La CPS II (carbamil fosfato sintetasa II) se inhibe por UTP, y es activada por PRPP. • La Citidilato sintasa (CTP sintasa) se inhibe por CTP Recuperación de las Bases Pirimidínicas Bases libres Nucleósido Pirimidina nucleósido fosforilasa Quinasas más específicas transforman los nucleósidos en nucleótidos Ribosa-1-fosfato Deoxiribosa-1-fosfato Timina Timidina Uracilo o Citosina Uridina o Citidina Pirimidina (Py) + PRPP PyMP +PPi Pirimidina fosforribosil transferasa Timina fosforilasa Degradación de una Pirimidina: un ejemplo Nucleótidos Nucleósidos Bases nucleotidasa nucleosidasa Nucleótidos de Citidina y Uridina dan: Uracilo (finalmente da -alanina, amonio y Co2) Nucleótidos de Timidina: dan Timina Biosíntesis de Desoxirribonucleótidos • Se forman por reducción directa de la posición 2’ de los correspondientes ribonucleótidos • Los sustratos son ribonucleósidos difosfato: ADP, GDP, CDP y UDP • La reducción tiene lugar a través de una serie de reacciones de óxido-reducción catalizadas por la tiorredoxina reductasa y la ribonucleótido reductasa. Biosíntesis de Desoxirribonucleótidos • La regulación de la enzima es compleja y asegura una reserva equilibrada de precursores para la síntesis de ADN. Tioredoxina reductasa Ribonucleótido reductasa: utiliza la tioredoxina para reducir los nucleótidos ADP: dADP GDP: dGDP CDP: dCDP UDP: dUDP…..dUTP…….dUMP----dTTP) (quinasa) (UTPasa) Conversión de dUMP en dTMP por la timidilato sintasa y la dihidrofolato reductasa Dihidrofolato reductasa Timidilato sintasa Serina hidroximetil transferasa La formación de dTMP, es blanco de drogas para el tratamiento de cáncer, ya que en esos casos las células se dividen aceleradamente y requieren activa síntesis de ADN ( Metotrexato, aminopterina = antifolatos: estructura similar al DHF, son inhibidores de la DHF reductasa, no se regenera N5,N10-metilén-THF:necesario para síntesis de dTMP) dUDP dUMP El ADN contiene timina en lugar de uracilo. El precursor inmediato de dTMP es dUMP Muchos agentes quimioterapéuticos actúan sobre la biósíntesis de nucleótidos Un antifolato: ( Metotrexato y aminopterina = son antifolatos: estructura similar al DHF, son inhibidores de la DHF reductasa, por ello no se regenera N5,N10- metilén-THF: necesario para síntesis de dTMP) El 5-Fluorouracilo (un análogo de pirimidinas) se activa a FdUMP, un inhibidor de la timidilato sintasa. FdUMP enzima enzima No se produce el desplazamiento del H Las sulfonamidas, análogos del ácido para- amino benzoico (PABA), inhiben la síntesis de folato en bacterias Las sulfanilamidas se usan para tratar ciertas infecciones bacterianas, y son análogos del PABA. El PABA es necesario para la síntesis de folato en bacterias. Las sulfamidas interfieren con la síntesis de folato en las bacterias (lo usan en vez de PABA). Las sulfamidas no afectan a las células humanas porque no sintetizan folato, usan fólico preformado (de la dieta). Las bacteria no pueden usar preformado Implicancias clínicas de alteraciones en el metabolismo de Bases • Síndrome de Lesch-Nyhan • Gota • Aciduria Orótica Síndrome de Lesch-Nyhan • Enfermedad Neurológica infantil hereditaria (se manifiesta a los 2 años, varones) • Severa o completa deficiencia de la actividad de la HGPRTasa: las purinas guanina e hipoxantina que se forman continuamente por degradación de ácidos nucleicos no pueden recuperarse • Se caracteriza por la excesiva producción de ácido úrico porque aumenta síntesis de bases púricas y su catabolismo • Retraso mental, mala coordinación, conductas agresivas y de automultilación (labios y dedos)-el cerebro depende de vías de recuperación- GOTA: alteración del metabolismo de las purinas. • Se caracteriza por: elevados niveles de ácido úrico en sangre (hiperuricemia) y se manifiesta por depósitos de cristales de la sal sódica de ácido úrico en los tejidos. Las articulaciones se inflaman y duelen, a causa de depósitos anormales de urato de sodio (se visualizan cristales de urato de sodio en leucocitos PMN y macrófagos en el líquido articular). Valores normales: Hombre: 3.5-6.5 mg%, Mujer: 2.5-5.5 mg% Una hiperuricemia aislada no es el único determinante de gota. Los riñones pueden verse afectados por depósitos de cristales en los túbulos renales Múltiples causas debidas a defectos en la síntesis de purinas (1. PRPP sintetasa no se regula, y aumenta PRPP; 2. déficit parcial de HGPRtransferasa: aumenta producción de purinas que no se recuperan. 3. secundaria y asociada a otros defectos metabólicos (déficit de glucosa-6-fosfatasa: la Glu-6-P va a via pentosas y aumenta PRPP) Tratamiento de la gota: • Nutricional (evitar alimentos ricos en purinas: hígado, riñón, sesos; evitar el alcohol) • Farmacológico (alopurinol) El alopurinol, un inhibidor de la xantina oxidasa Aciduria Orótica Enzima bloqueada en la aciduria orótica hereditaria • Enfermedad hereditaria, baja incidencia • Defecto en la enzima que convierte ácido orótico en uridina monofosfato (orotatofosforribosiltransferasa-OMP descarboxilasa) • Anemia severa, retardo en crecimiento (no sintetiza pirimidinas) • Excreción de grandes cantidades de ácido orótico •Administrar uridina (nucleósido) por vía oral para tratar esta condición (se transforma en nucleótidos) Repasando…. • ¿Qué aminoácidos participan en la síntesis de bases? Purinas:………………….. Pirimidinas:…………………. • ¿Cómo se forma el PRPP? • ¿Cómo se regula la síntesis de nucleótidos de purina? • ¿Cuáles son las reacciones de recuperación de bases púricas preformadas? • ¿Qué consecuencias presentaría la inhibición de la OMP decarboxilasa? • ¿Por qué se utiliza el alopurinol en el tratamiento de la gota? El alopurinol es un análogo de la………………. El alopurinol es sustrato de la…………………….., se transforma en………………, producto que se une a la enzima e inhibe su acción. Disminuye la producción de…………………. y aumentan los niveles de hipoxantina y xantina, que se excretan y alivian los síntomas El Metotrexato posee una estructura parecida al …….., inhibe a la ……………………………e impide que se regenere el………………………………….., necesario para la conversión de dUMP a dTMP, esencial para la biosíntesis de ADN. Consecuencia: las células de crecimiento rápido, como las células tumorales, perecen. El desarrollo de fármacos no hubiera sido posible sin comprender en detalle las bases bioquímicas de la síntesis de purinas y pirimidinas y sus vías de recuperación
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