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Página 1 de 7 LABORATORIO FUNDAMENTOS DE BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR ENZIMAS 1. FACTORES QUE REGULAN LA ACTIVIDAD Y VELOCIDAD ENZIMÁTICA Temperatura La temperatura óptima (más eficiente) de una enzima normalmente está cerca de la temperatura normal del organismo del cual proviene. El incremento de actividad que se observa cuando la temperatura está por encima de la temperatura óptima, es de corta duración pues la enzima se desnaturaliza, lo que termina su actividad. (Purves et al., 2010). pH El valor de pH al que la actividad de una enzima es máxima se denomina pH óptimo y varía considerablemente según la enzima. Los cambios de pH ejercen sobre las enzimas un doble efecto: 1) producen una alteración de carácter iónico en los grupos amino (-NH2) y carboxilo (-COOH) de los aminoácidos del centro activo, importantes en la catálisis y en la unión del sustrato; 2) modifican la estabilidad y estructura terciaria (plegamiento) de las enzimas, lo cual afecta su unión al sustrato, y si se alcanzan valores extremos de pH por fuera del rango óptimo, la enzima se desnaturaliza (Stryer et al. 2009). Concentración de sustrato Inicialmente, un incremento en la concentración de sustrato produce un aumento rápido de la velocidad de reacción. Sin embargo, altas concentraciones de sustrato no modifican la velocidad de reacción, pues en ese punto los centros activos de la enzima se encuentran saturados (Stryer et al. 2009). Concentración de la enzima Una reacción enzimática depende, entre otras cosas, de la concentración de la enzima presente. La cantidad de una enzima en una célula puede incrementar debido a un aumento en su velocidad de síntesis, una disminución en su velocidad de degradación o por ambas cosas. Esto quiere decir que existe una relación lineal entre la velocidad de la reacción y la concentración de la enzima (Muller-Sterl, 2009). Productos finales Los productos finales de la reacción tienen una influencia decisiva sobre la actividad enzimática. Si se permite que aumente su concentración sin eliminarlos del medio de reacción, producen un decaimiento en la actividad enzimática. Algunos productos finales, Página 2 de 7 cuando son de naturaleza ácida o alcalina, pueden afectar el pH del medio, y por lo tanto, la velocidad de la reacción (Routh et al., 1990). 2. ACTIVIDAD OXIDATIVA DE LA ENZIMA POLIFENOL OXIDASA La enzima polifenol oxidasa (PFO) se encuentra ampliamente distribuida en plantas y hongos. La PFO contiene dos átomos de cobre en su centro activo, que catalizan dos tipos de reacciones usando O2 como agente oxidante: 1) la o-hidroxilación de mono fenoles para producir o-difenoles (actividad monofenol monoxigenasa); y 2) la posterior oxidación de o- difenoles a o-quinonas (Figura 1). En la reacción general, la enzima cataliza la formación de quinonas altamente reactivas que reaccionan con grupos amino o sulfhidrilo de proteínas. Estas reacciones generan cambios en las características físicas, químicas y nutricionales en frutos y vegetales (tubérculos). Las quinonas se oxidan a hidroxiquinonas, estas pueden dar lugar a polímeros y/o reaccionar con otras moléculas como proteínas generando pigmentos de color rojizo, proceso conocido como “pardeamiento enzimático” (Muñoz et al., 2007). Figura 1. Oxidación de o-difenoles (Catecol) a o-quinonas (1,2 Benzoquinona) mediada por la enzima PFO (Garcia-Vallvé, 2010). Observaciones: Tenga en cuenta que la solución de papa no puede considerarse como una muestra pura de la enzima a estudiar. Es decir, la solución de papa contiene la enzima PFO y muchas otras enzimas y sustancias. Página 3 de 7 PROCEDIMIENTOS ¡PRECAUCIONES! En este laboratorio se usarán algunos compuestos considerados tóxicos. Es importante conocer los riesgos que implica el manejo de estos compuestos, para lo cual se recomienda leer cuidadosamente la siguiente información: COMPUESTO RIESGOS/PELIGROS PRECAUCIONES DESECHO DEL COMPUESTO Catecol -Provoca quemaduras graves. -Altamente irritante. -Muy peligroso si se ingiera o se inhala. Guantes y gafas de seguridad. Todos los residuos que contengan Catecol, Fenol o Hidroquinona SOLO deben ser descartados en el contenedor plástico que indique el profesor. Fenol Altamente inflamable e irritante. Muy buena ventilación, Guantes y Gafas de Seguridad. Hidroquinona Fácilmente inflamable, provoca quemaduras graves, altamente irritante, muy peligroso si se ingiere o se inhala. Guantes y muy buena ventilación Página 4 de 7 1. PREPARACIÓN DE LAS ENZIMAS 1.1. Preparación enzima PFO (Lo realiza el profesor y monitor antes de la clase) 1.2. Preparación de controles Página 5 de 7 1.3. Efecto de la concentración de sustrato en la enzima PFO Página 6 de 7 1.5. Evaluación de la especificidad de la enzima PFO 1.6. Efecto de la temperatura sobre la actividad enzimática 1. Aliste 3 tubos para el grupo control negativo [-] y 3 tubos para el grupo experimental. Agregue 3 mL de agua más 1 mL de PFO a cada uno de los 6 tubos de ensayo, no sin antes marcarlos. 2. Por parejas, ubique los tubos en cada uno de los tratamientos de temperatura (Hielo, temperatura ambiente, a 37°C) por 10 minutos. Página 7 de 7 1.7. Efecto del pH sobre la actividad de la enzima 3. Agregue 1 muestra de papa a los grupos experimentales. Agite vigorosamente y permita la reacción por 5-10 minutos. 1. Prepare 3 tubos de ensayo con 2ml de buffer pH4,7 y 10 y agregue a cada una muestra de PFO. 2. Agregue 2ml de enzima PFO a cada tubo. 3. Ubique los tubos en una rejilla dentro de la incubadora a 37°C durante 5-10 minutos y observe los resultados.
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