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ENZIMAS @GABRIELA_MED_ BIOQUÍMICA @gabriela_med_ Bioquímica Enzima� BIOQUÍMICA Generalidades Las enzimas son moléculas orgánicas , generalmente de naturaleza proteica. Algunas pueden ser moléculas de ARN (ribozimas). Aceleran la velocidad de las reacciones químicas que ocurren en los organismos vivos. Catalizadores biológicos Son llamadas así por la característica más importante que es : la velocidad con la que llevan a cabo su función. La palabra catalizar quiere decir : acelerar La reacción química que es catalizada por alguna enzima se acelera más de mil veces o incluso más de un millón de veces que si no estuviera la enzima. Sustrato Es el compuesto químico sobre el que actúa la enzima . La enzima es altamente específica para el sustrato en el que actúa. En la mayoría de casos solo reconocen a un sustrato , pero en pocos pueden reconocer a más de uno. Producto Es el resultado después de que la enzima se une al sustrato específico ocasionando : - Cambios estructurales @gabriela_med_ Bioquímica Regulación de las enzimas Se da en las enzimas que son importantes. - Encargadas de una vía metabólica Si la enzima está activa la vía metabólica se lleva a cabo , si no está activa la vía metabólica no funcionara. Nombres de las enzimas Generalmente se nombran con la terminación “asa”: - Ureasa - Amilasa - Lipasa - Lactasa - Sacarosa - Maltasa - Elastasa Hay enzimas que tienen nombres propios como: - Tripsina - Quimotripsina CLASES EN LAS QUE SE DIVIDEN LAS ENZIMAS Oxidorreductasas Catalizan la transferencia de electrones o átomos de hidrógeno entre diferentes sustratos Transferasas Catalizan la transferencia de grupos químicos como : fosfato , azufre , carbono o nitrógeno entre diferentes sustratos. Hidrolasas Catalizan la ruptura del enlace químico (enlace éster) , introduciendo una molécula de agua. A esta clase pertenecen las enzimas digestivas. Liasas Rompen diversos tipos de enlaces pero sin introducir agua y los productos formados tienen dobles enlaces. Isomerasas Inter Convienen isómero (compuestos que tienen la misma clase y el mismo número de átomos pero distribuidos en forma diferente). Ligasas Unen a dos moléculas utilizando la energía del ATP. @gabriela_med_ Bioquímica CENTRO ACTIVO O SITIO CATALÍTICO DE LA ENZIMA La enzima es una molécula más grande que el sustrato. Centro activo: Es la parte pequeña de la enzima es que participa en la reacción química . Esta formada por pocos aminoácidos (alrededor de 6). Los aminoácidos quedan juntos en una estructura terciaria. Estructura primaria: los aminoácidos en la proteína estarían muy alejados unos de otros. UNIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS AL CENTRO ACTIVO La llave y la cerradura Teoría propuesta por : Emilio Fisher en 1890 Explicación: El sustrato se ajusta específicamente al sitio activo de la enzima - como una llave se ajusta a su cerradura Por tanto: Cada enzima se une a un único sustrato Modelo de ajuste inducido Teoría propuesta por : Daniel Koshland en 1949 Explicación: Toma en cuenta la estructura flexible de las proteínas . El sustrato no tiene que ser completamente exacto de la enzima . Por tanto: Las diversas interacciones entre enzima y el sustrato de tipo no covalente , modifican la estructura tridimensional del centro activo para que se una al sustrato. @gabriela_med_ Bioquímica BARRERA ENERGÉTICA Las enzimas son catalizadores , es decir , aceleran la velocidad de la reacción. Para que esto suceda hay cambios en el sitio activo que hacen posible que el sustrato se transforme en producto. Al realizarse la unión enzima + sustrato : - Los enlaces químicos del sustrato empiezan a romperse - Se forman enlaces químicos del producto Estado de transición: - Es el momento en el cual el sustrato está empezando a dejar de ser sustrato y el producto empieza a aparecer. - Es posible disminuyendo la barra energética Disminución de la barrera energética: - La diferencia de energía libre que existe entre el sustrato y el estado de transición. - Cuanto mejor hace este efecto más efectiva es la catálisis enzimática. Modelo cinético Michaelis Menten: Estudia la velocidad a la cual cada enzima puede transformar al sustrato en producto. Función: 1. Estudia la velocidad a la cual la enzima transforma el sustrato en producto . 2. Se estudia la afinidad que la enzima tiene por su sustrato. Velocidad de la enzima Complejo ES: En este complejo la enzima se une reversiblemente con sus sustrato para formar el complejo enzima- sustrato (ES) , que luego se disocia en enzima + producto. Explicación: Se dice que la enzima alcanza su velocidad máxima cuando ya no es posible formar más producto pues todos los sitios activos de la enzima estás saturados con sustratos. Afinidad de la enzima : Km Explicación: Una enzima que tiene una km muy pequeña tiene mucha afinidad por su sustrato , en cambio si una enzima tiene una km grande tiene poca afinidad por su sustrato. 𝐾𝑚 = (𝐸) (𝑆) / (𝐸𝑆) Km significa: constante de michaelis Conceptos: 1. Cantidad de sustrato que produce la mitad de la velocidad máxima 2. Afinidad de la enzima por el sustrato @gabriela_med_ Bioquímica INHIBICIÓN ENZIMÁTICA Inhibidores enzimáticos ¿Qué son? Compuestos que disminuyen la actividad catalítica de la enzima. Usos: Son utilizados como fármacos para tratar diversas enfermedades. Participan en: - Inhibición enzimática reversible - Inhibición reversible competitiva - Inhibición reversible no competitiva - Inhibición irreversible Inhibición enzimática reversible Compuesto químico + enzima La unión es por enlace no covalente. El compuesto puede o no tener semejanza estructural con el sustrato normal de la enzima. Se clasifica en : competitiva y no competitiva Inhibición reversible competitiva El sustrato y el inhibidor : - se parecen estructuralmente. - ambos compiten por unirse al sitio activo de la enzima Condicionantes: - Si se aumenta el sustrato : se anula la acción del inhibidor - Si se aumenta el inhibidor : la acción del sustrato se anula Efecto: Se afecta la Km Formación especial: - Si se agrega mucho sustrato : se anula al inhibidor - En esta la velocidad máxima de la enzima no es afectada - Solo se pueden formar complejos ES o EI Ejemplo: Inhibición de la enzima succinato deshidrogenasa Es la enzima del ciclo de krebs que cataliza la reacción que convierte al succinato en fumarato El inhibidor es el malonato que compite con el succinato por el sitio activo de la enzima. @gabriela_med_ Bioquímica Inhibición reversible no competitiva El sustrato y el inhibidor : no se parecen estructuralmente y no compiten por el sitio activo. Mecanismo : - El inhibidor se une a la enzima en el sitio alostérico y no en el sitio activo como lo era en la inhibición competitiva. Efecto: - La unión del inhibidor afecta la conformación de la enzima lo cual resulta afectando la velocidad máxima. - NO afecta la afinidad de la enzima por el sustrato. - Este tipo de inhibición si afecta la Vmax (velocidad maxima) pero no la Km (constante de Michaelis). Complejos formado: ES , EI o EIS . Inhibición irreversible Inhibidor + enzima Tipo de enlace : - Covalente - Fuerte - Difícil de romper Efecto: Cuando el inhibidor se une a la enzima por el enlace covalente ya no se separan hasta que la enzima muere. Metales pesados como el plomo y el mercurio pertenecen a este tipo de inhibición. Plomo: Inhibe la enzima “ferroquelatasa” que participa en la formación del “hem” . Produciendo : anemiaen el envenenamiento por plomo. @gabriela_med_ Bioquímica FÁRMACOS Entre los fármacos que actúan como inhibidores podemos encontrar: 1. Antibióticos 2. Antihipertensivos 3. Analgésicos o antiinflamatorios 4. Inhibidores de la síntesis de colesterol Estatina Mecanismo de acción: Se une a la enzima hidroxi metil glutaril-CoA reductasa (HMG-CoA reductasa) que regula la síntesis del colesterol. Estatina + HMG-CoA = inhibición de la síntesis del colesterol Características : La estatina tiene una semejanza estructural con el compuesto HMG-CoA y por eso confunde a la enzima HMG-CoA reductasa. Compuestos genéricos de la estatina: - Atorvastatina - Simvastatina Mecanismo de la HMG-CoA reductasa : Cataliza la conversión del compuesto HMG-CoA en mevalonato , el cual después de varias reacciones llega a convertirse en colesterol. Antihipertensores Mecanismo de acción: Inhiben la acción de la enzima convertidora de la angiotensina (IECA) . Efecto: Al ingerir estos fármacos la persona tiene vasodilatación y no vasoconstricción. Disminuyendo la presión arterial. Enzima convertidora de angiotensina: Función: Cataliza la reacción que convierte el compuesto llamado angiotensina I en angiotensina II que es un vasoconstrictor. También se le conoce como : ECA Ejemplo de IECAS: 1. Enalapril 2. Lisinopril 3. Captopril AINES Enzima ciclooxigenasa: Es imprescindible en la síntesis de prostaglandina a partir del ácido araquidónico. Prostaglandinas: Son formadas a partir del ácido araquidónico , son llamadas proinflamatorias , porque generan: - Inflamación - Dolor - Fiebre Mecanismo de acción: Inhiben a la enzima ciclooxigenasa. (Por lo tanto ya no hay síntesis de prostaglandinas proinflamatorias). Efecto: Se alivia el dolor , la inflamación y la fiebre disminuye. Ejemplo de AINES: 1. Aspirina 2. Diclofenaco 3. Ibuprofen 4. Ketorolaco @gabriela_med_ Bioquímica Aspirina Mecanismo de acción: Se une a la forma irreversible de la enzima ciclooxigenasa. El MA es de utilidad porque en dosis pequeñas de 100mg de aspirina se puede : - Inhibir la ciclooxigenasa plaquetaria Como la plaqueta no tiene núcleo - no puede sintetizar una nueva ciclooxigenasa. Resultado: La aspirina dura (evitando la agregación plaquetaria) hasta que la plaqueta muere (alrededor de 7 días). Trimetoprim sulfa Es una combinación entre dos fármacos: Sulfonamida + trimetoprim Sulfonamida: Enzima dihidropteroato sintetasa: Cataliza la síntesis de ácido fólico a partir de PACA (ácido p-aminobenzoico) y pteridina. La síntesis de ácido fólico se da en las bacterias , las células del ser humano no lo pueden sintetizar. Ácido fólico : es imprescindible para la formación de la coenzima FH4 que participa en la síntesis de las bases púricas y pirimídicas que forman la molécula de ADN de las bacterias. Mecanismo de acción: Inhibe la enzima “dihidropteroato sintetasa”. Efecto: Al inhibir la enzima dihidropteroato sintetasa = la bacteria no forma ADN = la bacteria no puede multiplicarse = la bacteria muere. Trimetropin: Enzima dihidrofolato reductasa bacteriana : Convierte el ácido fólico en la coenzima tetrahidrofolato. Coenzima tetrahidrofolato: 1. Recibe unidades de carbono donados por los aminoácidos glicina , serina e histidina. 2. Luego el tetrahidrofolato transfiere estos grupos de un carbono para sintetizar purinas y timidina monofosfato (TMP) que favorece la síntesis de ADN. Mecanismo de acción: Inhibe la enzima dihidrofolato reductasa bacteriana. Efecto: No hay síntesis de ADN Penicilina Grupo : antibiótico Transpeptidasa : Favorece la formación de enlaces cruzados , indispensables para la integridad de la pared celular. Mecanismo de acción: Inhibe la reacción catalizada por la enzima “transpeptidasa”. @gabriela_med_ Bioquímica Efecto : impide la síntesis de la pared bacteriana COFACTORES Son coenzimas o metales para llevar a cabo la actividad catalítica. Holoenzimas: Es la enzimas + coenzima o bien la enzima + cofactor no orgánico (ión metálico : Zn , Fe) . Apoenzima: Parte proteica de la holoenzima. EFECTO DEL PH Y TEMPERATURA pH Óptimo Es el pH en el cual la enzima presenta una mejor actividad. Ejemplo: Pepsina : actúa en el estomago y su pH óptimo es 1-2 Tripsina : actúa en el intestino delgado y su pH óptimo es 7-8 No óptimo Es el pH no iónico , el cual se encuentra mayor o menor (alcalino o ácido) Efectos: la enzima sufre perdida de actividad. Pérdida de actividad: Se da por dos razones: 1. Cambio de pH : desnaturaliza a la enzima (proteína) . Cambia el estadio iónico de los aminoácidos que forman la proteína , rompen los enlaces disulfuro y los enlaces de hidrógeno 2. Alterar el estadio iónico de los aa que forman el sitio activo Resultando en: - Pérdida de actividad de la enzima - Se da un cuadro clínico de desequilibrio ácido-básico siendo peligroso para el paciente. Temperatura Aumenta la energía cinética y por lo tanto aumenta el número de choques entre moléculas. @gabriela_med_ Bioquímica Al tener una temperatura óptima , las enzimas tienen una actividad normal . t optima : 35 C a 41. t alta: +45 C Efectos: - Desnaturalización de la enzima - La enzima pierde su actividad - El px sufre fiebre muy alta (hipertermia severa) y puede morir . t baja: -30C Efectos: - Son más toleradas las temperaturas bajas - El px puede sobrevivir ENZIMAS ALOSTÉRICAS ¿Qué son? Moléculas grandes formada por 2 o + subunidades. Función: Son enzimas que regulan las vías metabólicas. Ejem: - Fosfofructocinasa-1 que regula la glucólisis. Sitios: - Catalítico - Alostérico Sitios alostérico: Es en donde otra molécula llamada “regulador o modificador” puede unirse y afectar su actividad catalítica. Reguladores: Positivo : cuando el regulador o modificados al unirse a ella aumenta su actividad catalítica Negativo o inhibidor: cuando el regulador o modificados al unirse a ella disminuye su actividad catalítica @gabriela_med_ Bioquímica APLICACIÓN MÉDICA Función de las enzimas en la medicina: 1. Confirmar diagnósticos clínicos 2. Tratamiento médicos Diagnósticos clínicos Explicación: En un estado normal las enzimas se encuentran guardadas dentro de las células pues es allí donde hacen su acción catalítica. Si las células se destruyen por algún proceso patológico , las enzimas salen a la sangre y son detectadas por algún método de laboratorio. Ejemplo de enfermedades: Pancreatitis Patología: le lesionan las células pancreáticas Enzimas : amilasa y lipasa se elevan en el plasma Amilasa: Se eleva en las primeras 12 a 23 hrs después del comienzo de la enfermedad. Desciende dos días más tarde. Valor normal = 90 a 220 U/I Lipasa: Se eleva a los 4 días de la enfermedad. Permanece elevada por una semana. Valor normal = 7 a 60 U/I Hepatitis Patología : inflamación hepática (hígado). Enzimas: Se elevan las transaminasas - Transaminasa glutámica pirúvica - Transaminasa glutámica oxalacética Si hay obstrucción biliar se elevan las enzimas: - Glutamil transferasa - 5 nucleotidasa - Fosfatasa alcalina (enzima presente en los osteoblastos y canalículos biliares). Valores normales: TGP : 10 a 40 U/I TGO : 14 a 40 U/I GT : +65 U/I en hombre y +45 U/I en mujeres FA : 40 a 140 U/I en niños . En adolescentes puede llegar a 400 U/I. @gabriela_med_ Bioquímica Infarto cardiaco Patología : lesión cardiaca. Enzimas que se elevan: 1. Transaminasa glutámica oxalacética 2. Creatin fosfocinasa (CPK) 3. Deshidrogenasa láctica Según el estudio que se practique se interpretarán los resultados.Colorimetría: valor normal de CPK - Hombres 235 U/I - Mujer 190 U/I Electroforesis : valor normal de la CK - CK-MM : 97 a 100% total - CK-MB : -3% del total - CK-BB : 0% del total El diagnóstico de infarto al miocardio es cuando el valor de CK-MB es mayor al 40%. Resultados de la deshidrogenasa láctica Electroforesis LD-1 : 20 a 36% del total LD-2 : 31 a 50% del total LD-3 : 15 a 25% del total LD-4 : 2 a 10% del total LD-5 : 3 a 13% del total Colorimetría: El valor normal es hasta 270 U/I. Carcinoma de próstata Normalmente la próstata es un tejido rico en enzimas fosfato ácida. Esta enzima sirve para confirmar el diagnóstico. Valor normal: Inmunoanálisis : no mayor a 2.5 ng/ml Colorimetría : no mayor a 5.8 U/I Anemia hemolítica inducida por fármacos Se investiga cuando hay deficiencia de la enzima : Glucosa 6-fosfato deshidrogenasa Fibrosis quística Cuando un niño tiene insuficiencia pancreática como en el caso de la fibrosis quística tiene mala secreción de enzimas pancreáticas. @gabriela_med_ Bioquímica La mala secreción de esas enzimas ocasiona: - Mala digestión de sus nutrientes como carbohidratos , grasa y proteínas Sintomatología : - Flatulencias - Diarrea - Retraso de crecimiento Tratamiento : enzimas digestivas Px intolerantes a la lactosa (leche) Se da en px que tiene deficiencia de la enzima lactasa. Sintomatología: - Náuseas - Diarrea - Vómitos - Flatulencias Tratamiento : dar enzima lactasa antes de ingerir la leche Zimógenos Son enzimas que se encuentran en el plasma , pero están en forma inactiva. Función : participan en la coagulación sanguínea o en la activación del complemento. Importancia : su medición también es útil en la clínica. @gabriela_med_ Bioquímica APLICACIÓN CLÍNICA Isoenzimas en el dx Generalidades Son enzimas que son sintetizadas en distintos órganos. Tienen diferente estructura química Catalizan la misma reacción. Ejemplo: 1. LDH : deshidrogenasa láctica 2. CK : creatina cinasa Deshidrogenasa láctica Enzima que cataliza la conversión reversible de ácido láctico en ácido pirúvico Formada por dos subunidades: - H = heart - M = muscle Subunidades H Sintetizadas en el músculo cardíaco Subunidades M Sintetizadas por el músculo esquelético e hígado Sub H + Sub M : forman 5 isoenzimas Resultados de las isoenzimas LDH 1: - Se eleva en el infarto cardiaco - Se eleva después de 24 hrs del infarto - La máxima elevación se alcanza a las 48 a 72 horas - Permanece elevada por varios días - Se eleva en anemias hemolíticas LDH 2: - Se encuentra en personas sanas LDH 3 : - Se eleva en problemas pulmonares y neoplasias LDH 4 y 5: - Se eleva en problemas hepáticos y musculares (distrofia muscular). CK : creatina cinasa Cataliza la conversión reversible de fosfato de creatina más ADP en creatina y ATP. Aplicación: 1.En el infarto cardiaco , ya que es la primera enzima que se eleva en esta patología. - Máxima concentración 14 a 24 hrs después del infarto. 2.Distrofia de Duchenne Creatina P En las células musculares lleva a cabo su mayor actividad. Función: Actúa como reservorio de energía para los momentos de contracción muscular. Tejidos en los que se encuentra : - Sistema nervioso - Vejiga urinaria - Intestino - Tiroides - Riñones - Pulmones @gabriela_med_ Bioquímica - Próstata - Bazo - Hígado - Páncreas - Placenta La CK está formada por dos subunidades: 1. M = muscle 2. B = brain Forma 3 isoenzimas: a. MM b. MB c. BB Resultados : MM y MB se elevan en: - Infarto cardiaco - Distrofia muscular MB se eleva en: - Accidente cerebro vascular BIBLIOGRAFÍA Ochaeta López , Francisco Ramón. “Bioquímica Clínica”. Editorial Universitaria de la Universidad de San Carlos de Guatemala.
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