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Ultracentrifugación MIDL Introducción Las técnicas de ultracentrifugación son las mas complicadas de los métodos que existen para la determinación de los pesos moleculares de altos polímeros. Son por lo general, mucho mas adecuados para su aplicación a moléculas proteicas compactadas que a polímeros enrollados al azar, donde las conformaciones extendidas incrementan las desviaciones del comportamiento ideal y las oportunidades del entrelazamiento mecánico de las cadenas del polímero. Puesto que la fuerza gravitacional en una ultracentrífuga es suficiente para precipitar moléculas de polímero de acuerdo con su tamaño, la ultracentrifugación se utiliza como método para la determinación del peso molecular, especialmente para sistemas monodispersos como las proteínas. Un poco de Historia….. •El científico Theodor Svedberg inventó la primera ultracentrífuga en 1923, su trabajo de investigación se basaba en coloides y proteínas. •Su grupo de trabajo utilizaba la ultracentrífuga para determinar el peso molecular y la subunidad estructural de la hemoglobina. •El grupo de Svedberg desarrollo algunas centrífugas y los primeros modelos funcionaban a velocidades de hasta 900 000 g y cuyos rotores eran pequeños; otros modelos funcionaban a velocidades de hasta 260 000 g. ¿Qué es? •Es una técnica que consiste en someter una mezcla homogeneizada a una velocidad de rotación muy alta, de forma que, a velocidades más lentas, sedimentan los componentes más grandes, y a velocidades mayores, los componentes más pequeños. •Aunque las masas de diferentes partículas sean muy similares, sedimentan en tiempos distintos. Técnicas Experimentales • La ultracentrífuga esta formada por un rotor de aluminio de varias pulgadas de diámetro que gira a alta velocidad en una cámara a vacío. • La disolución que se centrifuga se coloca en una cubeta pequeña en el interior del rotor próxima a su periferia. • El rotor puede impulsarse eléctricamente o por una turbina de aceite o aire. • La cubeta va equipada con ventanas y la concentración del polímero a lo largo de toda ella se determina por métodos ópticos basados en medidas del índice de refracción o de absorbancia. • Los disolventes para experimentos de ultracentrifugación deben elegirse por su diferencia con el polímero en la densidad (para garantizar la sedimentación), y en el índice de refracción (para permitir la medida). • Debe evitarse el utilizar mezcla de disolventes, y son mas adecuados aquellos de baja viscosidad Ultracentrífuga Velocidad de Sedimentación En un experimento de velocidad de sedimentación las macromoléculas se someten a un campo centrífugo elevado tal que la fuerza de centrifugación es mayor que la de difusión, por lo que existe un transporte neto de material hacia el fondo de la celda. Es un método hidrodinámico de transporte que permite fraccionar las macromoléculas en base a las diferencias en coeficiente de sedimentación (una función de la masa, la densidad y la forma macromolecular). Equilibrio de Sedimentación En esta modalidad las muestras se someten a campos centrífugos moderados hasta que se igualan las fuerzas opuestas de centrifugación y difusión (condición de equilibrio). En estas condiciones, las especies macromoleculares se distribuyen formando un gradiente de concentración que se caracteriza porque a) no varía con el tiempo b) es independiente de las propiedades hidrodinámicas (forma) de las macromoléculas c) depende únicamente de la masa molecular de la especie que sedimenta. Determinación del Peso Molecular •Tanto Mw como Mz puede determinarse mediante la acción de fuerzas de ultracentrigufación en disoluciones diluidas de polímeros en disolventes adecuados. •Se deben utilizar disolventes de densidades e índices de refracción distintos a los de los polímeros para asegurar el movimiento de los polímeros y la detección óptica. •Se utilizan velocidades altas de hasta 70 000 rpm para transportar las moléculas de los polímeros a través de un disolvente en el tubo de ensayo. Peso Molecular Promedio en Peso (Mw) •La determinación del peso molecular medio en peso Mw se puede calcular a partir de la siguiente ecuación: 𝑴𝒘 = 2𝑅𝑇 𝐼𝑛 𝐶2 𝐶1 (1 − 𝑉𝜌)𝜔2(𝑟2 2 − 𝑟1 2) Donde: •r1 y r2: Distancias del centro de rotación al punto de observación en el tubo de ensayo •(𝟏 − 𝑽𝝆): factor de flotabilidad •𝝎: velocidad angular de rotación Nota: Esto solo aplica en caso de que el polímero sea heterogéneo y soluciones ideales Si los datos se procesan en función del incremento de refracción ñ, diferencia entre los índices de refracción de la disolución y disolvente se puede calcular el peso molecular promedio centrifugal por medio de la siguiente ecuación 𝑴𝒛 = 𝑅𝑇 (1 − 𝑉𝜌)𝜔2 1 𝑟 𝑑ñ 𝑑𝑟 2 1 𝑟 𝑑ñ 𝑑𝑟 1 ñ2 − ñ1 Donde: ñ1: índice de refracción del solvente ñ2: índice de refracción de la solución Peso Molecular Promedio Centrifugal (Mz) Ultracentrifugación Analítica •La ultracentrifugación analítica consiste en someter una dispersión coloidal o una disolución molecular; a la acción de la fuerza centrífuga. •Esto se realiza con el fin de causar cambios de concentración, los cuales son constantemente medidos a lo largo del tiempo por elementos ópticos acoplados a la ultracentrífuga. Los elementos ópticos pueden captar señales, en forma de absorbancia e interferencia.. Aspectos Prácticos La absorbancia de la muestra frente a su correspondiente tampón ha de ser menor de 1,3 (unidades de absorción a la longitud de onda de trabajo). Es necesario poner en cada celda de la ultracentrífuga el tampón de muestra (que se usa como referencia). Se recomienda hacer el experimento a varias concentraciones Volumen de muestra: 300-400 µL. Tiempo aproximado del experimento: 2 h. Aspectos Prácticos • La absorbancia de cada muestra en la celda, medida frente a su correspondiente tampón, ha de estar en el intervalo de 0.1-0.6 unidades de absorción a la longitud de onda elegida (preferiblemente en un máximo de absorción, en el intervalo entre 220 y 600 nm). Es necesario poner en cada celda de medida de la ultracentrífuga el tampón de muestra (que se usa como referencia). • La medida de la absorbancia se suele realizar en un espectrofotómetro con una cubeta de paso óptico de 1 cm. Para correlacionar esta medida con la señal que se detectará en las celdas de la ultracentrífuga debe tenerse en cuenta el paso óptico de dichas celdas. A) Las piezas centrales que se emplean más habitualmente tienen un paso óptico de 1.2 cm. En este caso, una absorbancia de 1.0 en el espectrofotómetro daría 1.2 en la ultracentrífuga. B) Si las muestras dan una absorbancia superior a 0.6 pueden emplearse celdas de paso óptico de 0.3 cm (donde una absorción de 1.0, medida espectrofotométricamente, daría una señal en la ultracentrífuga de 0.3 • Se recomienda hacer el experimento a varias concentraciones de muestra (al menos tres) y a varias velocidades angulares (al menos dos). • Volumen de muestra: normalmente 80 µL, aunque puede ser de 60-120 µL (a mayor volumen mayor precisión en el análisis, pero a costa de que el tiempo necesario para alcanzar el equilibrio de sedimentación aumenta considerablemente). • Tiempo aproximado del experimento: 15-24 h (80 µL). Muestras lábiles: se pueden reducir estos tiempos usando procedimientos experimentales específicos. Aplicaciones • Determinación del peso molecular de las especies macromoleculares que sedimentan • Obtención del grado de homogeneidad o heterogeneidad de las especies macromoleculares que sedimentan. • Detección y cuantificación de la estequiometria y la afinidad de complejos macromoleculares. • Estimación de la forma aproximada de macromoléculas en disolución. • Separación de proteínas y ácidos nucleicos (ADN) Bibliografía •Seymour, R., & Carraher, C. (2002). Introducción a la química de los polímeros. Barcelona, España: Reverté. •Billyemer, F. (2004). Ciencia de lospolímeros. Barcelona, España: Reverté. •MÉTODOS DE ULTRACENTRIFUGACIÓN ANALÍTICA EN EL CIB: Consideraciones generales y aspectos prácticos.. (s.f.). Recuperado 29 agosto, 2019, de https://www.cib.csic.es/sites/default/files/inline-files/UCA-CIB.13oct2005.pdf https://www.cib.csic.es/sites/default/files/inline-files/UCA-CIB.13oct2005.pdf Diapositiva 1: Ultracentrifugación Diapositiva 2: Introducción Diapositiva 3 Diapositiva 4: Un poco de Historia….. Diapositiva 5: ¿Qué es? Diapositiva 6: Técnicas Experimentales Diapositiva 7: Ultracentrífuga Diapositiva 8: Velocidad de Sedimentación Diapositiva 9: Equilibrio de Sedimentación Diapositiva 10 Diapositiva 11: Determinación del Peso Molecular Diapositiva 12: Peso Molecular Promedio en Peso (Mw) Diapositiva 13: Peso Molecular Promedio Centrifugal (Mz) Diapositiva 14: Ultracentrifugación Analítica Diapositiva 15: Aspectos Prácticos Diapositiva 16: Aspectos Prácticos Diapositiva 17 Diapositiva 18: Aplicaciones Diapositiva 19: Bibliografía
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