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¿Cómo clasificarlas? ¿Por su forma? ¿Por su metabolismo? ¿Por lo que produce? ¿Si es patógena o no? Las bacterias tienen pared celular De acuerdo a la composición se dividen en 2 grandes grupos: Gram + y Gram - Tinción de Gram complejo de cristal de iodo insoluble en el interior de la célula Bacterias Gram – se extrae con alcohol. El alcohol penetra rápidamente en la capa externa rica en lípidos sin que la fina capa de peptidoglucano evite el paso del solvente, permitiendo de este modo la eliminación del complejo de cristal de iodo insoluble. Bacterias Gram +. El alcohol deshidrata las bacterias porque poseen paredes celulares muy gruesas. Se cierran los poros de las paredes impidiendo el escape del complejo. En las Gram negativas No obstante, la reacción de Gram no se relaciona directamente con la química de la pared celular puesto que las levaduras, que poseen una gruesa pared celular pero una composición química completamente distinta, también se tiñen como Gram+. No son los constituyentes químicos sino la estructura física de la pared la que permite la coloración final. Las Pseudomonas Varias especies del Pseudomonas contienen plásmidos en los que se encuentran codificadas enzimas capaces de degradar, al menos parcialmente, compuestos orgánicos derivados del petróleo o compuestos organoclorados u organofosfatados. Estas enzimas suelen ser inducibles y la selección de las cepas adecuadas puede permitir reducir los niveles de contaminación por estos compuestos xenobióticos. La biodegradación de hidrocarburos y de otros compuestos orgánicos es realizada con eficiencia variable dependiendo de la estructura del hidrocarburo (lineal o ramificado, alifático o aromático) y de la presencia de átomos substituyentes. Algo similar ocurre con la biodegradación de compuestos insecticidas, herbicidas y detergentes y emulgentes. David Bergey publicó : Bergey's Manual of Determinative Bacteriology Gracilicutes (procariotas, con pared celular, Gram -) Firmicutes (procariotas, con pared celular, gram +) Tenericutes (procariotas, sin pared celular) Mendosicutes (procariotas filogenéticamente anteriores a las divisiones mencionadas, como las arquebacterias y otras) Asumiendo que se tenga un MO aislado y desea identificarlo Paso 1: La naturaleza de los esquemas de identificación bacteriana El lector debe leer el capítulo II de este libro para familiarizarse con los principios generales usados en identificación bacteriana. Paso 2: ¿El microorganismo aislado es eucariota o procariota? Este manual es usado para la identificación de bacterias (procariotas). El microorganismo a identificar debe ser una bacteria. Paso 3: ¿A qué categoría de bacterias pertenece el microorganismo? De forma práctica, las bacterias pueden dividirse en cuatro grandes categorías: I. Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular II. Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celular III. Eubacterias carentes de pared celular IV. Arqueobacterias Paso 4: ¿A qué grupo pertenece el microorganismo aislado? Tras la correcta asignación del microorganismo a su categoría bacteriana, el siguiente paso es determinar en que grupo se puede encuadrar el microorganismo. Paso 5: ¿A qué género pertenece el microorganismo aislado? Paso 6: ¿A que especie pertenece el microorganismo aislado? Volumen I: Trata del dominio Archaea, en su totalidad y de algunas bacterias Gram negativas especiales, como las Cianobacterias. En este volumen no hay casi ninguna bacteria de importancia clínica. Volumen II: Proteobacterias, bacterias Gram negativas . Dividido en cinco secciones (alfa, beta, delta, gamma y épsilon proteobacterias), el reino Proteobacteria agrupa a la mayor parte de las bacterias Gram negativas de importancia clínica. Neisseria, Brucella, Legionella, Pseudomonas, Haemophilus, Campylobacter y Enterobacterias, pertenecen a este reino. Volumen III: Tratará sobre los Gram positivos con bajo contenido en G+C (contenido de guanina y citosina). Aquí aparecerán géneros como Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus, Clostridium y Bacillus Volumen IV: Contendrá una sola sección que agrupará a todos los Gram positivos con alto contenido en G+C. Los géneros más conocidos de este volumen serán Mycobacterium y Corynebacterium. El Volumen V tratará de otras bacterias Gram negativas, agrupadas en ocho secciones diferentes. No tienen ningún factor en común. Los géneros más importantes desde el punto de vista clínico serán Chlamydia, Treponema, Borrelia o Bacteroides Borrelia burgdorferi 1- disponibilidad de nutrientes adecuados 2- consistencia adecuada del medio 3- presencia (o ausencia) de oxígeno y otros gases: Un nivel mínimo de humedad 5- Luz ambiental La mayoría de los microorganismos crecen mucho mejor en la oscuridad que en presencia de luz solar. Hay excepciones evidentes como sería el caso de los microorganismos fotosintéticos. 6- pH La concentración de iones hidrógeno es muy importante para el crecimiento de los microorganismos. La mayoría de ellos se desarrollan mejor en medios con un pH neutro, aunque los hay que requieren medios más o menos ácidos. No se debe olvidar que la presencia de ácidos o bases en cantidades que no impiden el crecimiento bacteriano pueden sin embargo inhibirlo o incluso alterar sus procesos metabólicos normales. 7- Temperatura Los microorganismos mesófilos crecen de forma óptima a temperaturas entre 15 y 43ºC. Otros como los psicrófilos crecen a 0ºC y los temófilos a 80ºC o incluso a temperaturas superiores (hipertemófilos). En líneas generales, los patógenos humanos crecen en rangos de temperatura mucho más cortos, alrededor de 37ºC, y los saprofítos tienen rangos más amplios. 8- Esterilidad del medio Todos los medios de cultivo han de estar perfectamente estériles para evitar la aparición de formas de vida que puedan alterar, enmascarar o incluso impedir el crecimiento microbiano normal del o de los especimenes inoculados en dichos medios. El sistema clásico para esterilizar los medios de cultivo es el autoclave (que utiliza vapor de agua a presión como agente esterilizante) Halófilos extremos: sólo pueden vivir en condiciones de salinidad extremas (su requerimiento de sal es muy alto En ocasiones se encuentran en salmueras para curar peces, haciéndose notar por la formación de manchas rojas. A pesar de la salinidad del entorno, la presión osmótica del citoplasma de los halófilos se encuentra en el rango normal para la mayoría de las bacterias. Algunos son capaces de realizar fotosíntesis, capturando la energía solar en un pigmento llamado bacteriorrodopsina. Una definición general es que el organismo requiere al menos NaCl 1,5M (8,8%) para su crecimiento; la mayoría requiere NaCl 3–4 M (17-23%) y prácticamente todos pueden desarrollar en NaCl 5,5M (32%, límite para saturación), aunque algunas crecen con gran lentitud a esta salinidad. Metanógenos Producción biológica de metano se efectúa a partir de CO2 e H2 únicamente en condiciones estrictamente anaerobias Habitan en aguas de drenajes y pantanos y son comunes en el conducto digestivo del hombre y otros animales. En este hábitat el material orgánico se descompone en condiciones anaerobias extremas. Están restringidos a una dieta relativamente limitada de sustratos. Utilizan amonio como fuente de nitrógeno, requieren trazas de níquel, también trazas de hierro y cobre, únicos metales traza que se ha demostrado son requeridos necesariamente para el desarrollo de estos organismos. Termoacidófilos: son organismos unificados por su requerimiento metabólico de compuestos reducidos de azufre y su naturaleza extremadamente termofílica. Son capaces de desarrollar a temperaturas sobre el punto de ebullición del agua. Han sido aislados de manantiales azufrados calentados geotérmicamente que contienen azufre elemental. En los ambientes terrestres,los manantiales ricos en azufre y los depósitos de lodo pueden tener temperaturas de hasta 100°C y generalmente son de mediana a extremadamente ácidos por la producción de SO4H2 a partir de la oxidación biológica del SH2 y del S°. El término solfatara se ha utilizado para describir estos ambientes calientes, ricos en azufre, que se encuentran en distintas partes del mundo: Italia, Nueva Zelanda, Parque Nacional de Yellowstone. Dependiendo de la geología de los alrededores, estos ambientes pueden ser de ligeramente alcalinos a moderadamente ácidos (pH 5 – 8), o extremadamente ácidos, con valores de pH inferiores a 1. Los termófilos extremos se han obtenido de ambos tipos de ambientes, pero la mayoría de estos organismos están en hábitat neutros o moderadamente ácidos. Además se desarrollan también en hábitat térmicos artificiales como las salidas hirvientes de las plantas geotérmicas de energía.
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