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Metabolismo de Lípidos Los lípidos • Grupo heterogéneo de sustancias que comparten la propiedad común de ser solubles en solventes no polares (metanol, cloroformo) y relativamente insolubles en agua. • Los lípidos en procariotas se encuentran mayormente en las estructuras de superficie (m.citoplasmática, m. externa de gram (-), pared celular de micobacterias, pared celular de gram (+)). • Tanto en procariotas como en eucariotas los lípidos más abundantes de las membranas son los fosfolípidos. Los ácidos grasos monoinsaturados y conteniendo anillos contribuyen a la flexibilidad y fluidez que posibilitan las modificaciones de forma que acompañan el crecimiento. Los ácidos grasos saturados muestran cambios de acuerdo a las condiciones del medio. También se observan hopanoides de función similar a los esteroles. • En bacterias anaeróbicas se encuentran los plasmalógenos. Los plasmalógenos • Los plasmalógenos son fosfoglicéridos en los que el glicerol fosfato tiene en el C1 un alcohol de cadena larga unido con enlace éter. Se presentan en bacterias anaeróbicas junto o en lugar de los fosfolípidos comunes • Se les encuentra en: Bacteroides, Clostridium, Desulfovibrio, Propionibacterium, Ruminococcus, Selenomonas • Se especula que cumplen un rol en la generación de mediadores lipídicos que están involucrados en la transducción de señales. Así también se les atribuye una función antioxidante. Plasmalógenos • Lipido (Eter) Eter: R1-O-R2 Alkeno con enlace éter :CH2-O-CH=CH-(CH2)n-CH3 • Producidos en bacterias anaeróbicas y en eucariotas principalmente a nivel de los peroxisomas CH2-O-CH=CH-(CH2)n-CH3 CH-O-CO-(CH2)n-CH3 CH2-O-PO3-CH2-CH2-N(CH3) 3 (+)(-) Ciclopropano • Los ácidos grasos ciclopropano se forman a partir de los ác. grasos no saturados presentes en los fosfolípidos. • Esta modificación es frecuente al inicio de la fase estacionaria del crecimiento. La razón de este cambio puede estar explicada como una protección contra la oxidación o degradación química frecuente en esta etapa. • La sintasa de ciclopropano es inducida mediante la limitación de oxígeno abrupta y por la adición de nitrato o tiosulfato al medio. Aunque el rol preciso de los ciclopropano no está bien entendido, existe una considerable evidencia que sugiere un rol de éstos en la patogenicidad de M. tuberculosis y Helicobacter pylori. Los ácidos grasos ciclopropano se sintetizan a partir de los acidos grasos no saturados. La posición no saturada es convertida en anillo mediante la transferencia de un grupo metil de la adenosil metionina, catalizada por la ciclopropano sintasa. Esta enzima se enlaza a los fosfolípidos que contienen ac. grasos no saturados y forma ciclopropano en ambas caras de la bicapa. HOPANOIDES DIPLOTENO, un hopanoide (Zymomonas, Frankia, Streptomyces..) COLESTEROL , un esterol CICLOPROPANO Catabolismo de los lípidos • Acción de las lipasas • Degradación de ácidos grasos Microorganismos productores de lipasas Bacterias • Achromobacter • Alcaligenes • Arthrobacter • Pseudomonas • Staphylococcus • Chromobacterium Hongos • Aspergillus niger • Candida cylindraceae • Mucor miehei • Rhizopus arrhizus • Rhizopus delemar • Rhizopus japonicum • Rhizopus oryzae • Saccharomyces lipolytica • Humicola lanuginosa • Mucor pusillus Lipasas microbianas de aplicación industrial Propiedades de las lipasas • Varían ampliamente en pH óptimo, termoestabilidad, especificidad y selectividad de acuerdo a la longitud de las cadenas de ácidos grasos que hidrolizan o que utilizan para esterificación. • Catalizan las reacciones: – Hidrólisis/síntesis de enlace éster – Transesterificación – Aminólisis • 1) Hidrólisis/síntesis de enlace éster R- COOR’ + H2O R-COOH + R’-OH R-COOH + R’-OH R-COOR’ + H2O • 2) Transterificación Por acidólisis: Ra-COOR’ + Rb-COOH Rb-COOR’ + Ra-COOH Por alcohólisis: Ra-COOR’ + Rb-OH Rb-COOR’ + Ra-OH Por intercambio éster Ra-COOR’a + Rb-COOR’b Ra-COOR’b + Rb-COOR’a • 3) Aminólisis RCOORa + Rb-NH2 R-CONH-Rb + Ra-OH Reacción de transesterificación aplicada a la producción de Biodiesel Degradación de ácidos grasos Se producen sucesivas oxidaciones en el carbono β, que van separando fragmentos de dos carbonos en forma de acetil-CoA, los mismos que se incorporarán después al ciclo de Krebs. Utilización de ácidos grasos exógenos de cadena larga y de cadena corta en bacterias Degradación de ácidos grasos exógenos no saturados Síntesis de Lípidos • Síntesis de ácidos grasos saturados • Síntesis de ácidos grasos no saturados • Síntesis de fosfolípidos • Síntesis de isoprenoides , esteroles y esteroides • Síntesis de lípidos de arqueobacterias Los ácidos grasos • Son moléculas no polares de una longitud promedio de 16 a 18 carbonos en bacterias. El más abundante es el ácido palmítico (C16),le sigue el esteárico (C18) mirístico (C14) y láurico (C12) • Pueden ser saturados , monoinsaturados, ramificados , hidroxilados , metilados o conteniendo ciclopropano • Las bacterias gram positivas son mas ricas en ácidos grasos de cadenas ramificadas que las gram negativas ...(?) • No ocurren de manera libre en bacterias, se encuentran esterificados a otras moléculas: a) a derivados glicerolfosfato (fosfolípidos), b) a carbohidratos (lipido A) c) a proteinas (lipoproteína) • Los ac.grasos no saturados y los ramificados otorgan mayor fluidez a las membranas • El tipo de ácido graso que esté presente en la célula estará influenciado por las condiciones de crecimiento del cultivo (composición del medio, tenor de oxígeno, temperatura, edad del cultivo). Distribución de los ácidos grasos • Los cultivos jóvenes tienen grandes cantidades de ácidos grasos C16 y C18 monoenoicos y sólo pequeñas cantidades de ácidos grasos con anillos ciclopropano, los mismos que aumentan en la ultima etapa del crecimiento exponencial a expensas de los ácidos grasos no saturados. • En S. aureus cerca del 5% de los ácidos grasos totales son insaturados cuando el microorganismo crece en medio mínimo, incrementando hasta el 30% cuando crece en medio rico. En aireación S.aureus tiene menos porcentaje de ácidos grasos saturados. • Grandes cantidades de acidos grasos de cadenas ramificadas se presentan en Bacillus, Staphylococcus, Corynebacterium, Mycobacterium, Pseudomonas y Spirochaeta. • Muchos ácidos grasos poco comunes, están presentes en pequeñas cantidades. Äcidos grasos ramificados, hidroxilados y ciclopropanos están presentes en muchos microorganismos. El ácido corinolico (dihidroxi ácido graso ramificado con 52 C) y el ácido micólico (dihidroxi ácido graso ramificado con 87-88C) son ejemplos de ácidos grasos únicos en Corynebacterium y Mycobacterium, respectivamente Síntesis de Ac. Grasos Síntesis de Ac. grasos Biotin Carboxyl Carrier Protein Complejo Acetil CoA Carboxilasa (2) (3) (1) Reducción Reducción Condensación Deshidratación Síntesis de ácidos grasos no saturados • Se forman por dos vías: Vía Anaeróbica Vía Aeróbica Vía Anaeróbica: restringida a procariotas (Clostridium, Lactobacillus, E.coli, bact. de fotosíntesis). Vía Aeróbica: Bacillus, Mycobacterium, Corynebacterium, Micrococcus y eucariotas. Sintesis de ácidos grasos no saturados (cont..) • Vía anaerobia: Una deshidrasa desatura un hidroxiacil ACP de 10 carbonos hasta trans-α, β- decenoil-ACP que es isomerizado hasta cis-β-γ- ACP. Este derivado no es sustrato de la enoil reductasa y puede elongarse. Ejm: Ac. palmitoleico y Ac. vaccénico • Vía aerobia: Una desaturasa introduce un doble enlace en un derivado ac. graso acil-ACP en presencia de O2 y NADPH. Ejm: Ac. oleico. 16 palmitoil-ACP 16 palmitoleoil-ACP Cis vaccenoil - ACP Diagrama de la estructura molecular de distintos ácidos grasos Ácidos grasos saturados Ácido graso cis- insaturadoÁcido graso trans- insaturado Lista de grupos acil activados por la coenzima A Acetil-CoA Propionil-CoA Acetoacetil-CoA Cumaril-CoA (en la síntesis de flavonoides) Acil derivados de los ácidos dicarboxílicos Malonil-CoA Succinil-CoA Hidroximetilglutaril-CoA (en la síntesis de isoprenoides) Pimelil-CoA (en la síntesis de biotina) Butyryl CoA Síntesis de Coenzima A La coenzima A is sintetizada en un proceso de 5 pasos desde pantotenato: • El pantotenato es fosforilado a 4‘-fosfopantotenato por la enzima pantotenato quinasa. • Una cisteína es añadida al 4'-fosfopantotenato formando 4'-fosfo-N- pantotenoilcisteína (PPC) • PPC es descarboxilada a 4'-fosfopanteteína por una fosfopanteteína descarboxilasa • La 4‘-fosfopanteteína es adenilada para formar defosfo-CoA. • Finalmente la defosfo-CoA es fosforilada utilizando ATP hasta coenzima A. Punto de control Inhibidores de la síntesis de ácidos grasos • Cerulenina: Producto fúngico que ocasiona la inhibición irreversible de la sintasa I y II de beta ketoacil-ACP • Tiolactomicina: Inhibe sintasa I,II y III de beta ketoacil-ACP por modificación covalente del sitio de unión del malonil-CoA. También puede inhibir la síntesis de ácido micólico. • Triclosan ((2,4,4' –tricloro-2'-hidroxdifenil eter) : Inhibe la enoil-ACP reductasa. Inhibidores de la síntesis de ac. grasos FabA :Hydroxydecanoyl ACP deshidrasa FabB: Ketoacyl- ACP sintasa I FabD Malonyl- CoA:ACP transacylase FabE Acetyl-CoA carboxylase FabF Ketoacyl-ACP sintasa II FabG Ketoacyl-ACP reductase FabH Ketoacyl-ACP sintasa III FabI trans-2-enoyl- ACP reductasa FabK Enoyl-ACP reductasa Fosfolípidos de membrana • PS Fosfatidilserina • PE Fosfatidiletanolamina • PC Fosfatidilcolina (= lecitina) • PG Fosfatidilglicerol • PI Fosfatidilinositol (hongos y algunas actinobacterias) • DPG Difosfatidilglicerol (=Cardiolipina) 1.- G3P deshidrogenasa 2.- G3P aciltransferasa 3.- CDP diglicérido sintasa 4.- Fosfatidilserina sintasa 5.-Fosfatidilserina descarboxilasa 6.-PGP sintasa 7.- PGP fosfatasa 8.- CL sintasa Síntesis de Fosfolípidos Acilación del glicerol 3-P para formar el fosfoglicérido La proteína periférica PlsX cataliza la formación de un (Acil-P) desde un acil- ACP, y PlsY usa este intermediario para acilar el glicerol-3-P hasta 1-acil-glicerol- 3-P (también conocido como acido lisofosfatídico (LPA)). PlsB acila glicerol-3-P utilizando ya sea donadores acil-ACP o acil-CoA . PlsC transfiere un ácido graso a la posisión 2 del LPA para formar ácido fosfatídico (PA) el intermediario clave en la síntesis de todos los fosfolípidos de membrana. Transferencia de grupos acil en la membrana Tipos de ácidos grasos de los fosfolípidos de membrana • Los ácidos grasos saturados de cadena recta (SFA) como el ac.palmítico (16:0), son lineales y empacan juntos eficientemente produciendo una bicapa que tiene propiedades de baja permeabilidad. • Los cis-UFA introducen una pronunciada curvatura en la cadena lo cual interrumpe el orden de la bicapa y resulta en una alta permeabilidad. • La composición de los ácidos grasos de cadena ramificada afecta la fluidez de la membrana debido al efecto disturbador que ocasiona el grupo metil en el empaque de la cadena acilada. Los ácidos grasos anteiso promueven una mayor fluidez que los ácidos grasos iso debido a que la ramificación con el metil se encuentra más al interior de la cadena. • Las bacterias que producen este tipo de ácidos grasos modifican su tasa iso:anteiso en respuesta al estrés de temperatura y pH. Precursores de la síntesis de ácidos grasos ramificados 2 3 Biosíntesis de ácidos grasos de cadena ramificada en B.subtilis Cambios en la composición lipídica en la membrana bacteriana • Cada grupo bacteriano responde al estrés de diferentes formas pero siempre actuando sobre la composición de los ácidos grasos de membrana. • Se han propuesto mecanismos tales como desaturación, ramificación, isomerización cis-trans, elongación de la cadena de ácidos grasos y formación de ciclo propano. Síntesis de Plasmalógenos Reacciones en resumen Esqueleto = DHAP • Acilación de C1 en el DHAP mediante residuos acil CoA o acil ACP • Intercambio del alcohol por un grupo carboxílico en el C1 • Reducción mediante NADPH • Acilación mediante un segundo acil CoA en C2 • Grupo funcional unido al fosfato del C3 • Oxidación a alkeno via oxidasa de función mixta Síntesis de Plasmalógenos Sintesis de isoprenoides • Están compuestos de unidades repetidas de isopentenil difosfato (IPP) • IPP es un intermediario en la síntesis de esteroles y de los lípidos de arqueobacterias • Isoprenoides de importancia en microorganismos: Undecaprenol , Bactoprenol, Ubiquinona,Clorofila Menaquinona, Plastoquinona, Carotenos, y Esteroles • Los esteroles están presentes en hongos y son raros en bacterias, las excepciones son los micoplasmas, Streptococcus pneumoniae y los microorganismos metanotróficos. Síntesis del intermediario IPP • Ruta del Mevalonato Mycoplasma Lactobacillus Methanococcus Methanobacterium Pyrococcus Archeoglobus Streptomyces Streptococcus pneumoniae Staphylococcus aureus • Ruta del Piruvato GAP En casi todas las eubacterias La mayoría de bacterias gram negativas Chlamydia, Aquifex, Scenedesmus, Mycobacterium tuberculosis No en bacterias Ruta del Mevalonato (levaduras) Esteroles identificados en cepas bacterianas Wei JH, Yin X and Welander PV (2016) Sterol Synthesis in Diverse Bacteria. Front. Microbiol. 7:990. Lovastatina, un hipolipidemiante de origen fúngico que inhibe la síntesis de colesterol . Productores: Aspergillus terreus, Monascus ruber Acción: Inhibición competitiva de la HMG reductasa Ruta del Piruvato-GAP (vía alternativa para la producción de IPP en bacterias) DXP = Deoxi-D-Xilulosa fosfato MEP = 2C-metil D-eritritol 4P IPP = Isopentenil pirofosfato Sintesis de IPP: Ruta del Piruvato GAP http://en.wikipedia.org/wiki/File:Non-mevalonate_pathway.svg Reactantes Enzima Producto Pyruvate and glyceraldehyde 3- phosphate DOXP synthase (Dxs) 1-Deoxy-D-xylulose 5- phosphate (DOXP) DOXP DOXP reductase (Dxr, IspC) 2-C-methylerythritol 4- phosphate (MEP) MEP 4-diphosphocytidyl-2- C-methyl-D-erythritol synthase (YgbP, IspD) 4-diphosphocytidyl-2- C-methylerythritol (CDP-ME) CDP-ME 4-diphosphocytidyl-2- C-methyl-D-erythritol kinase (YchB, IspE) 4-diphosphocytidyl-2- C-methyl-D-erythritol 2-phosphate (CDP- MEP) CDP-MEP 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase (YgbB, IspF) 2-C-methyl-D-erythritol 2,4- cyclopyrophosphate (MEcPP) MEcPP HMB-PP synthase (GcpE, IspG) (E)-4-Hydroxy-3- methyl-but-2-enyl pyrophosphate (HMB- PP) HMB-PP HMB-PP reductase (LytB, IspH) IPP and DMAPP http://en.wikipedia.org/wiki/Pyruvate http://en.wikipedia.org/wiki/Glyceraldehyde_3-phosphate http://en.wikipedia.org/wiki/DOXP_synthase http://en.wikipedia.org/wiki/1-Deoxy-D-xylulose_5-phosphate http://en.wikipedia.org/wiki/DOXP_reductase http://en.wikipedia.org/wiki/2-C-methylerythritol_4-phosphate http://en.wikipedia.org/wiki/4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol_synthase http://en.wikipedia.org/wiki/4-diphosphocytidyl-2-C-methylerythritol http://en.wikipedia.org/wiki/4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol_kinase http://en.wikipedia.org/wiki/4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol_2-phosphate http://en.wikipedia.org/wiki/2-C-methyl-D-erythritol_2,4-cyclodiphosphate_synthase http://en.wikipedia.org/wiki/2-C-methyl-D-erythritol_2,4-cyclopyrophosphate http://en.wikipedia.org/wiki/HMB-PP_synthase http://en.wikipedia.org/wiki/(E)-4-Hydroxy-3-methyl-but-2-enyl_pyrophosphate http://en.wikipedia.org/wiki/HMB-PP_reductase http://en.wikipedia.org/wiki/Isopentenyl_pyrophosphate http://en.wikipedia.org/wiki/Dimethylallyl_pyrophosphate • Casi todas las eubacterias con excepciónde S. aureus y otros gram positivos como Bacillus burgdorferi utilizan solo la vía del piruvato GAP para la síntesis de isoprenoides. • Esta ruta ha sido también demostrada en Chlamydia trachomatis, Aquifex aeolicus, Scenedesmus, M. tuberculosis, Synecocystis Síntesis de Isoprenoides en bacterias Lípidos en Arqueobacterias Los lípidos de arqueobacterias poseen alcoholes de cadenas largas tipo isoprenoides que se enlazan al glicerol a través de enlaces éter. Monocapas y bicapas de lípidos en Archaeas Estructura del lipoglucan tetraéter de Thermoplasma acidophilum , archaea que carece de pared celular. Tiene una monocapa de lípidos en vez de bicapa. Azúcares manosa y glucosa asociados. Además Glicoproteínas. Lípidos en Arqueobacterias A. Diéteres con modificaciones en la cadena y con un anillo. Común en Euryarchaeota B. Tetraéteres pueden contener hasta 8 anillos ciclopentano (caldarchaeol) C.Lipidos de Crenarchaeotas con anillos ciclopentano y ciclohexano D.(Thaumarchaota) Derivado de Calditol, un tetraéter encontrado en Sulfolobus Síntesis de lípidos de Arqueobacterias • El núcleo glicerol es sintetizado a través de glicerol 3-P, glicerol 1-P o DHAP. El alcohol es derivado del geranil-geranil pirofosfato (GGPP)sintetizado a partir de acetil CoA vía mevalonato. • El hidroxilo del C1 del glicerol-P reacciona con el GGPP desplazando el pirofosfato. Continúa una reducción de los doble enlace, la unión con un grupo polar y la formación de lípidos tetraéter si es el caso. Bioconversiones microbianas a partir de esteroides Los esteroides pueden sufrir transformaciones químicas por acción microbiana aún cuando no sean sintetizados por éstos. Las reacciones incluyen oxidaciones, hidrólisis, reducciones, producción de ésteres. Varios procesos comerciales con esteroides utilizan microorganismos . Por ejemplo en la conversión de: Progesterona en hidroxiprogesterona por Rhizopus nigricans. Componente S en cortisol por Curvularia lunata Cortisol en Prednisona por Arthrobacter simplex Progesterona en dihidrotestololactona por Cylindrocarpon radicola Diendiol en Triendiol (precursor de prednisona) por Septomyxa affinis Un modelo de conversión del cortisol en un andrógeno a través de las bacterias de la flora intestinal Bacterias que pueden degradar esteroides • Corynebacterium, Mycobacterium, Streptomyces, • Rhodococcus, Pseudomonas, Comamonas, Burkholderia, • Chromobacterium , Schizophyllum, Arthrobacter, Brevibacterium • Stigmatella aurantiaca
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