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NUCLEO CELULAR El nucleo es el deposito de la informacion genetica de la celula y el centro de control de la expresion del material genetico, en el se almacena casi todo el ADN de la celula, que constituye el genoma, el nucleo esta rodeado por una envoltura de membrana, que recluye dos actividades principales del genoma: -Replicacion y transcripcion del metabolismo celular. El nucleo esta limitado por una cubierta doble, denominada envoltura nuclear, formada por cisternas provenientes del sistema de endomembranas. Esta envoltura esta formada por poros nucleares, los cuales son mas abundantes en celulas con mayor actividad metabolica, a traves de estos poros, se movilizan proteinas y ARN entre el nucleo y el citosol. La membrana interna de la envoltura nuclear esta recubierta por una red proteica llamada lamina nuclear, que aporta estabilidad al nucleo. La aparicion de la envoltura nuclear en organismos eucariotas posibilito la separacion espacial de los procesos geneticos principales: Replicacion del ADN y Sintesis de ARN. Dentro del nucleo es posible reconocer zonas ocupadas por la cromatina y un complejo de ADN y proteinas de union al ADN, llamadas histonas. En la mayoria de las celulas se distinguen dos tipos de cromatinas: - Eucromatina: Se tiñe debilmente - Heterocromatina: Mas densa y teñida En el nucleo se sintetiza el ARN, cuyos tipos se encuentran dispersos en diferentes localizacoines, especialmente concentrados en el nucleolo que es la region mas densa y es donde se ensamblan los ribosomas. En el nucleolo estan las regiones organizadoras nucleolares (NOR) que son regiones especializadas. ORIGEN DEL NUCLEO La explicacion mas aceptada, indica que este se formo por una invaginacion de la membrana plasmatica al igual que los organulos membranosos, mientras que mitocondrias y cloroplasos se originaron por un mecanismo conocido como endosimbiosis seriada. Lynn Margulis explica el origen del nucleo a traves de su teoria de la endosimbiosis seriada, segun la cual el nucleo es la primera adquisicion en una serie de eventos sucesivos. La fusion de dos bacterias dio origen al primer eucarionte unicelular y ancestro unico de todos los pluricelulares. En esta primera celula el ADN quedo confinado en un espacio separado por una membrana del resto de la celula. ESTRUCTURA DEL NUCLEO - ENVOLTURA NUCLEAR: Es una doble membrana que encierra el genoma en las celulas eucariotas. Contiene un gran numero de proteinas propias, estas proteinas participan en la organizacion de la cromatina y la regulacion de la expresion genetica. Aunque la membrana nuclear hace posible la expresion de los genes, al confinarlos y protegerlos de las enzimas, se convierte en un obstaculo para la division celular. Sin embargo la membrana nuclear se desensambla al inicio de la division y se reorganiza al final de dicho proceso, lo cual posibilita la interaccion entre el huso mitotico y la cromatina. La envoltura nuclear es doble y se continua con el reticulo endoplasmatico, esta formada por dos membranas concentricas interrumpidas por estructuras proteicas denominadas complejo de poro nuclear (CPN) y por la lamina nuclear. La membrana externa esta en contacto con el citoplasma, tiene ribosomas adheridos, que sintetizan las proteinas que se vuelcan al espacio perinuclear. El espacio perinuclear se continua con el lumen del RE. Tanto la membrana externa como la interna presentan proteinas especificas que no se encuentran en los otros componentes del sistema de endomembranas, y se pueden agrupar de acuerdo a su localizacion en: 1) Proteinas del poro nuclear o nucleoporinas (70% de los poros nucleares) 2) Proteinas integrales de la membrana externa (proteinas integrales de membrana externa) 3) Proteinas integrales de la membrana interna (Proteinas integrales de membrana interna) 4) Proteinas de la lamina nuclear. LAMINA NUCLEAR Soporta las estructuras del nucleo. Es una malla densa y delgada de fibras que recubre la superficie interna de la envoltura nuclear proporcionando resistencia mecanica al nucleo, lo cual resulta crucial para su estabilidad, el espaciamiento de los CPN y la organizacion de la cromatina. Esta contruida a partir de filamentos intermedios llamados laminas de tipo A y B. COMPLEJO PORO NUCLEAR Cada poro es un pequeño canal cilindrico que se extiende a traves de ambas membranas de la envoltura nuclear, porporcionando continuidad entre el citosol y el nucleoplasma. En cada poro, las membranas interior y exterior de la envoltura nuclear se fusionan, formando un canal recubierto con una intrincada estructura de un conjunto de proteinas llamadas nucleoporinas. TRANSPORTE A TRAVES DEL COMPLEJO DEL PORO NUCLEAR - Las moleculas entran al nucleo y salen exclusivamente a traves de los complejos del poro nuclear. - La presencia de esta barrera impide salir a los cromosomas y evita la entrada de organelas - La envoltura nuclear protege los ARN recien sintetizados evitando la degradacion enzimatica antes de que hayan completado su procesamiento. - La presencia de la envoltura nuclear implica que todas las enzimas y otras proteinas que participan en la replicacion y transcripcion del adn en el nucleo son importadas desde el citoplasma y todas las moleculas de ARN y subunidades ribosomicas necesarias para la sintesis de proteinas en el citoplasma se exportan desde el nucleo. los CPN presentan uno o varios canales acuosos a traves de los cuales las pequeñas moleculas de agua dinfunden, las moleculas de mayor peso molecular son transportadas en forma activa por lo que requieren energia y moleculas transportadoras. El transporte activo a traves de los poros nucleares, es un proceso selectivo que requiere de la participacion de tres tipos de proteinas: Las carioferinas: Son los receptores para las moleculas a transportar. De acuerdo a la direccion en la que transportan la carga se llaman importinas o exportinas. La GTPasa Ran es una pequeña proteina G. Al igual que otras proteinas G, puede tomar dos conformaciones alternativas, unida a GTP o unida a GDP. Estas conformaciones determinaran la direccion del transporte, Y las proteinas regulatorias, mientras que las carioferinas y Ran se movilizan a traves del poro nuclear, las proteinas regulatorias RAN-GEF y Ran-GAP tienen una distribucion asimetrica entre el nucleo y el citoplasma. MECANISMO DE IMPORTACION DE MACROMOLECULAS: 1- Para el caso de las proteinas, estas poseen una o mas señales de localizacion nuclear NLS. Las NLS estan formadas por una secuencia de 8-30 aminoacidos de longitud, a menudo con prolina, lisina y arginina. 2- Las proteinas con NLS forman un complejo con la importina llamado COMPLEJO IMPORTINA/CARGA CON NLS 3- El complejo importina / carga con NLS atraviesa el canal dentro del complejo poro nuclear. 4- El complejo al entrar en contacto con las repeticiones de nucleoporinas FG2, dilata el canal central facilitando el ingreso al nucleo 5- Al llegar al nucleo la molecula de importina se asocia con la RAN-GTP y se libera la proteina importada. 6- El Ran-GTP unido a la importina es transportado de regreso al citoplasma, donde la importina se libera previa hidrolisis del Ran-GTP a Ran-DGP MECANISMO DE EXPORTACION DE MACROMOLECULAS Se realiza de manera similar, la principal diferencia es que el transporte fuera del nucleo se realiza en el caso de las moleculas de ARNt y otros ARN que se sintetizan en el nucleo. Para exportar el ARN del nucleo al citoplasma este debe unirse a proteinas con señales de exportacion (NES), formando ribonucleoproteinas. Las RNP son reconocidas por exportinas, formando un complejo con la Ran- GTP, el cual atraviesa el poro. En la cara citoplasmatica del poro, se hidrolizael GTP a GDP y se libera la RNP, mientras Ran-GDP regresa al nucleo QUE MUEVE A LAS IMPORTINAS Y EXPORTINAS EN DIRECCIONES DIFERENTES A TRAVESDEL COMPLEJO PORO NUCLEAR? La diferencia reside en la interaccion de esta con Ran. Las exportinas tienen afinidad por RAN-GTP y las importinas por RAN-GDP. De esta forma Ran GTP viaja con las exportinas y su carga hacia el citosol siguiendo su gradiente y RAN-GDP se desplaza libremente hacia el nucleo en funcion de su propio gradiente. Ran GEF: Factor intercambiador de nucleotidos de guanina, proteina unida a la cromatina que promueve el intercambio de GDP por GTP, ayudando asi a la union de Ran a GTP. Ran GAP: proteina reguladora que promueve la hidrolisis del GTP, esta unida a repeticiones de FG nucleoporinas, en la cara citosolica del complejo poro-nuclear. La accion de estas dos proteinas mantiene el gradiente de las dos formas alternativas de Ran entre el nucleo y el citoplasma. Es decir, Ran-GTP esta en alta concentracion dentro del nucleo y por lo tanto tiende a salir y Ran- GDP esta en alta concentracion en el citoplasta y tiende a ingresar. se importan dentro del nucleo: - Las proteinas sintetizadas en el citoplasma necesarias para ensamblar los ribosomas. - Los factores de transcripcion requeridos en la activacion o inactivacion de los genes. - Los factores de empalme necesarios para el proceso de maduracion de los ribosomas Las moleculas y macromoleculas ensambladas y exportadas desde el nucleo al citoplasma incluyen: *Las subunidades ribosomales *ARNm * ARN de transferencia * Factores de transcripcion que son devueltos al citoplasma para ser reutilizados. EXPORTACION DE ARNm La sintesis y procesamiento de ARNm tiene lugar de manera ordenada en el nucleo. De los Pre-ARNm que se sintetizan en el nucleo, solo una pequeña fraccion es el ARN maduro. La diferenciacion entre el ARN maduro y las secuencias intronicas a eliminar, se da por un recambio ordenado de proteinas asociadas. El ARN maduro es reconocipo por un complejo proteico, el receptor de exportacion que media el pasaje activo a traves del poro nuclear. Cuando el ARNm ingresa al citosol, el receptor se disocia y es importado al nucleo. Los factores de iniciacion de la sintesis proteica reconocen el complejo de union al cap, el cual se disocia. Si no existen errores en la codificacion u otras alteraciones, los EJC, conforme se va traduciendo el ARNm, se disocian de este por interacciones con el ribosoma hasta que finalmente se ha traducido todo el mensajero. ORGANIZACION INTERNA DEL NUCLEO La envoltura nuclear encierra: - la matriz nuclear. - la cromatina - el nucleolo. MATRIZ NUCLEAR Red fibrosa insoluble que ayuda a mantener la forma del nucleo, proporcionando un esqueleto sobre el que se organizan las fibras de cromatina. CROMOSOMAS Y CROMATINA. ORGANIZACION DENTRO DEL NUCLEO El nucleo contiene los cromosomas de la celula. cada cromosoma consiste en una molecula unica de ADN con una cantidad equivalente de proteinas. Colectivamente, el ADN con sus proteinas asociadas se denomina cromatina. La mayor parte de las proteinas de la cromatina consisten en copias multiples de cinco pares de histonas, la cromatina tambien contiene pequeñas cantidades de una amplia variedad de proteinas no histonicas y RNP, la mayoria de ellas son factores de transcripcion, estos factores regulan que parte del ADN sera transcripta en ARN. NIVELES DE ORGANIZACION DE LA CROMATINA Existen dos tipos de cromatinas: La Eucromatina o cromatina laxa, de localizacion central y la heterocromatina o cromatina densa, en la periferia del nucleo. la heterocromatina representa aproximadamente el 10% del total de cromatina y es considerada transcripcionalmente inactiva. La eucromatina se encontraria al menos en dos estados, la eucromatina accesible, que representa al rededor del 10% donde se encuentran los genes que se estan transcribiendo y la eucromatina poco accesible, mas condensada (pero menos que la heterocromaitna) donde estan los genes que la celula no esta transcribiendo. las unidades de enrollamiento de la cromatina son los nucleosomas. Los nucleosomas estan formados por un centro o core de histonas, dicho centro posee dos copias de cada una de las siguientes histonas : H2A, H2B, H1 y H4. Al rededor del centro de histonas, 146 pares de bases del ADN se enrrollan en dos vueltas. La union de las histonas al ADN no depende de una secuencia particular de nucleotidos, sino de la secuencia de aminoacidos de la histona. Al rededor de 60 pares de bases de ADN unen su nucleosoma con el proximo. Cada region de Union es el ADN espaciador. La quinta histona la H1, conecta a los nucleosomas y actua como banda de goma, manteniendolos juntos dentro de una misma cuerda enrollada, siendo este el primer grado de empaquetamiento de la cromatina. Esta estructura se conoce como Fibra de 10 nm. Los nucleosomas se organizan, a su vez, en fibras de 30nm (selenoide) girando a manera de resorte al rededor de un eje virtual. Esta estrctura es mantenida por las H1 y su interaccion de nucleosomas cercanos. En el siguiente nivel de empaquetamiento las fibras de 30 nm se organizan en una serie de bucles o asas superenrolladas, estos bucles se estabilizan gracias a la interaccion con las proteinas de la matriz nuclear o andamiaje nuclear. Cada bucle de cromatina representa un dominio funcional o unidad de replicacion. Estos dominios contienen al rededor de 100.000 pares de bases, extension de ADN suficiente para acomodar varios genes de tamaño promedio. Durante la profase, los cromosomas aparecen en forma mas condensada, alcanzando la cromatina su mayor nivel de condensacion en metafase. El grado de condesacion de los dominios de la cromatina se mantienen principalmente debido a la asociacion con la matriz nuclear y a proteinas asociadas como la topoisomerasa II o girasa, encargada de controlar el grado de superenrollamiento del ADN. La union entre la cromatina y la matriz se da a nivel de zonas altamente conservadas, denominadas secuencias SAR o MAR. Las SAR son regiones de varios cientos de pares de bases ricas en residuos de adenina y timina, abundantes en la heterocromatina. EL EMPAQUETAMIENTO DE LA CROMATINA PERMITE CONFINAR AL ADN DENTRO DEL NUCLEO La molecula de ADN de un cromosoma humano contiene 5x106 pares de nucleotidos en el cromosoma mas pequeño, midiendo extremo con extremo el total de cromosomas de una celula humana diploide, el ADN se extiende mas de 2 metros. El empaquetamiento del ADN en forma de cromatina, no solamente le permite entrar dentro de los limites del nucleo, sino tambien lo protege del ataque de las nucleasas. EL NUCLEOLO En el nucleolo tiene lugar la formacion de subunidades ribosomicas, la sintesis y procesamiento de ARNr y actualmente se considera que desempeña un importante papel en la regulacion del ciclo celular. El nucleolo es un aglomerado de fibras de cromatina de distintos cromosomas. El nucleolo aparece como una estructura simple carente de componente membranoso en la que diferenciamos dos regiones: * Una zona fibrilar central, formada por ADNribosomico y ARNr naciente. * Una zona granular periferica donde los granulos estan formados por las subunidades ribosomicas en proceso de ensamblado. Los nucleolos al igual que la envoltura nuclear desaparece en la mitosis y se reorganizan al rededor de los segmentos de ADNr, que como su nombre lo indica, codifica ARNr. siendo el ARNr el mas abundandte dentro de los tipos de ARN, existen multiples copias del gen que lo codifica. El genoma humano presenta al rededor de 200 copias del gen para ARNr. el tamaño del nucleolo varia entre celulas y en la misma celula segun su actividad. CROMOSOMA EUCARIOTA Cada cromosoma eucariota contieneen una molecula simple de ADN al rededor de 150 millones de pares de nucleotidos. La molecula de ADN en el cromosoma eucariota es lineal, por lo tanto posee dos extremos. La molecula de ADN de un cromosoma típico eucariota contiene: * Un conjunto lineal de genes que codifican para ARN y proteinas interrumpido por muchas secuencias de ADN no condificante. El ADN no codificante incluye: * Secuencias de aproximadamente 170 nucleotidos de ADN satelite, repetidas miles de veces, que corresponden al centromero. * Secuencias repetitivas en los extremos del cromosoma llamadas telomeros *Multiples secuencias señalizadoras altamente conservadas, denominadas origen de replicacion (ORI) necesarias para que se realice la duplicacion del ADN en un tiempo breve. el centromero es una contriccion primaria localizada centralmente o hacia los extremos de cada cromosoma. los telomeros son cruciales en la vida de la celula, ellos son necesarios para la duplicacion completa del cromosoma, los protegen de las nucleasas, evitan que los extremos del cromosoma se fusionen entre si y facilitan la interaccion del cromosoma con la envoltura nuclear. las telomerasas activa se encuentra solamente en: Las celulas de la linea germinal, incluyendo las celulas troncales embrionarias. Eucariotas unicelulares Celulas cancerosas. La posicion del centromero nos permite diferenciar a los crosomas. Durante la mayor parte de la vida de la celula, los cromosomas son demasiado largos y tenues para ser vistos bajo un microscopio, antes de que una celula se divida, cada cromosoma se duplica, los cromosomas duplicados se condensan en estructuras que pueden teñirse con facilidad pudiendose obserbar bajo el MO. A primera vista los cromosomas duplicados se mantienen juntos por el centromero, mientras estan juntos es comun llamar a cada parte del cromosoma duplicado, cromatida hermana, sin embargo, cada "Cromatide hermana" es un cromosoma completo. el Cinetocoro es una estructura proteica discoidal que forma parte del centromero y ayuda a separar las cromatidas hermanas. La posicion del centromero, determina el largo de los brazos del cromsoma; en base a esto se puede clasificar a los cromosomas: * Metacentricos: El centromero en posicion central determina los brazos de igual lingitud * Submetacentricos: Un par de brazos es mas corto que el otro, pues el centromero se encuentra alejado del centro. * Acrocentricos, El centromero se halla proximo a uno de los extremos por lo tanto uno de los brazos es casi inexistente. los cromosomas acrocentricos poseen una masa de cromatina llamada satelite, en el extremo del brazo corto. El satelite se halla aislado del resto del cromosoma por la constriccion secundaria. La zona aledaña al satelite de los cromosomas acrocentricos contribuye a formar el nucleolo. El mas corto de los brazos del cromosoma se llama P y el mas largo es el brazo Q. CARIOTIPO Todas las especies tienen un numero caracteristico de pares de cromosomas homologos llamado numero diploide (2n). El numero diploide del hombre es 46. El cariotipo es una representacion grafrica o fotografica de los cromosomas presentes en el nucleo de una sola celula somatica de un individuo.Cada miembro del par de cromosomas homologos proviene de cada uno de los padres del individuo cuyas celulas examinamos. el cariotipo de una mujer contiene 23 pares de cromsomas homologos: 22 pares de autosomas y 1 par de cromosomas sexuales ambos "X". El cariotipo del hombre contiene los mimos 22 pares de autosomas y 1 par de cromosomas sexuales, uno "X" y uno "Y".Un gen en el cromosma Y designado SRY es el que pone en marcha el desarrollo de un varon, por lo tanto determina el sexo. En estos 23 pares de cromosomas homologos en el ser humano, cada par de homologo posee un representante proveniente de la mujer o el varon, aunque los cromosomas que forman un par de homologos tienen la misma forma y tamaño, no son identicos, los cromosomas homologos llevan genes que codifican los mismos caracteres, pero es posible que porten versiones distintas de estos genes. Cada version posible de un gen se denomina alelo, por ejemplo el gen que codifica el color de ojos, presenta varios alelos. Las celulas que presentan cromosomas homologos se denominan diploides de diplo, doble y se simbolizan "2n", tal es el caso de las celulas humanas a excepcion de las gametas que solo poseen un cromosoma de cada par y se denominan haploides, de haplo, simple y se simbolizan "n". Los 23 pares de cromosomas homologos presentes en cualquiera de las celulas somaticas humanas se clasifican en dos tipos: * Cromosomas somaticos o autosomas: son los cromosomas de los pares 1 al 22, los genes portados por estos cromosomas codifican rasgos somaticos, comunes a ambos sexos. *Cromosomas sexuales, gonosomas o alosomas: Son los cromosomas del par 23. en estos cromosomas se ubican los genes que determinan las diferencias entre los sexos. El par de cromosomas sexuales puede estar constituido por dos cromosomas "X" (XX) o bien un cromosoma "X" y otro "Y" (XY) Dotacion cromosomica de una celula somatica nucleada de cualquier tejido perteneciente a una mujer: Celula Somatica = 2n = 46 = 22 pares de autosomas + XX Dotacion cromosomica de una celula somatica nucleada de cualquier tejido perteneciente a un varon: Celula somatica =2n = 46 = 22 pares de autosomas + XY El analisis del cariotipo involucra la comparacion de cromosomas por su longitud, la ubicacion de los centromeros y la ubicacion y los tamaños de las bandas G. MECANISMOS DE LA INACTIVACION DEL CROMOSOMA X Y CORPUSCULO DE BARR En los organismos en los que las hembras y los machos difieren en los cromosomas sexuales, los productos de estos genes se expresan en cantidades equivalentes en hembras y machos. Este proceso recibe el nombre de compensacion de dosis genica. La compensacion de dosis genica se lleva a cabo por diferentes mecanismos. En los mamiferos, el macho es heterogametico y la hembra son homogameticas. Es decir, las hembras poseen dos cromosomas X uno aportado por la hembra y el otro por el macho. Por compesacion de la dosis, uno de los dos cromosomas X es inactivado al azar, es decir la cromatina se compacta y el cromosoma es inactivo, es decir, sus genes no se transcriben, se trata de un ejemplo de heterocromatina facultativa. El cromosoma X heterocromatico aparece entonces como un cuerpo coloreado oscuro unido a la envoltura nuclear y se denomina corpusculo de Barr. La inactivacion del cromosoma X es un evento que ocurre tempranamente en el desarrollo embrionario. En una celula determinada puede inactivarse el cromosoma X proveniente de la mujer o el varon. Generalmente la inactivacion de uno u otro ocurre al azar, aunque existen algunas excepciones- Luego de que ha ocurrido la inactivacion de un cromosoma X, todas las celulas hijas de esa celula en particular, continuan con el mismo crosmoma X inactivado. Por lo tanto, la inactivacion del cromosoma X genera lineas celulares o clones que poseen diferentes genes activos. Los organismos con estas caracteristicas se denominan mosaicos geneticos. Es decir, las mujeres son mosaicos geneticos. Mecanismo: En la inactivacion del cromosoma X actua un gen XIST que se encuentra en el mismo cromosoma X. El gen XIST codifica una gran molecula de ARN, El ARN que se copia a partir del gent XIST se acumula a lo largo del cromosoma X que contiene el gen XIST activo. Este ARN inactiva casi todos los restantes genes del cromosoma X recubiertos por el ARN de XIST. La transcripcion del gen XIST cesa en el otro cromosoma X, permitiendo la expresion de los genes que este posee. La inactivacion del gen XIST del cromosoma X activo se produce por la metilacion de sus secuencias regulatorias. Por lo tanto, el bloqueode expresion del gen XIST permite que este cromosoma continue activo. EL GENOMA El genoma es la totalidad del ADN contenido en una celula. En las celulas procariotas el ADN forma un solo cromosoma circular, mientras que en los eucariotas se reparte en varias moleculas de ADN, cada una de las cuales corresponde a un cromosoma distinto. El genoma eucariota es mucho mas extenso que el procariota, sin embargo esto no es una caracteristica directamente relacionada a la complejidad del organismo. En general, los organismos eucariotas tienen celulas diploides, pues cada cromosoma se presenta en dos versiones, uno aportado por cada padre, formando pares de cromosomas homologos. En el genoma se almacena la informacion que determina la mayoria de las caracteristicas de un individuo: el color de ojos, el color de piel, el grupo sanguineo, los rasgos fisonomicos, el color del fruto, etc. Los genes son las unidades informativas del genoma, los cuales estan separados por secuencias sin aparente informacion, llamadas regiones intergenicas. Estos codifican informacion para la sintesis de proteinas o ARN. La mayoria de los genes codifican proteinas, la mayoria de las proteinas requiere un “instructivo” que informa la secuencia de aminoacidos propia de dicha proteina, el cual se encuentra en la secuencia de bases del gen correspondiente. En el genoma procariota, los genes se disponen densamente a lo largo de la secuencia de ADN, separados por cortas secuencias intercaladas, que no codifican informacion. En el genoma eucariota, en cambio, las secuencias intergenicas son mas extensas; de hecho representan una parte mayor del genoma que la correspondiente a los genes. Las distintas regiones del ADN, genicas e intergenicas, no estan separadas por ningun limtie fisico, solamente se diferencian entre si por la secuencia de las bases nitrogenadas, la informacion genetica esta codificada en esa secuencia de bases. Se denomina expresion genetica a la forma como la informacion contenida en un gen es utilizada y decodificada hasta obtener un producto. Los genes de proteinas se expresan en dos pasos: Transcripcion: Consiste en la sintesis de un ARN mensajero que copia la secuencia de bases del gen. Traduccion: Posteriormente en los ribosomas, el mensaje que porta el ARNm es decodificado o traducido para enlazar los aminoacidos en la secuencia que da como resultado la cadena proteica. El genoma contiene genes de otros tipos de ARN ademas del mensajero, como el ribosomico, el de transferencia, los ARN pequeños nucleares y citoplasmaticos y los de interferencia, estos se transcriben pero no se traducen ya que carecen de informacion para codificar proteinas. Los genes tienen regiones señalizadoras llamadas promotores y terminadores, que actuan como signos de puntuacion marcando el inicio y el final de un gen. Un gen no solo incluye a las regiones que codifican una proteina o un ARN, sino tambien a las secuencias requeridas para transcribirlo, en este sentido un gen constituye una “unidad de transcripcion”. Los genes no se transcriben y traducen todos al mismo tiempo, en la regulacion de la expresion genetica intervienen las regiones del ADN llamadas secuencias reguladoras, cuya funcion consiste en regular la transcripcion de los genes, lo que requiere la interaccion de las regiones reguladoras con proteinas activadoras o represoras, como factores de transcripcion. En conclusion, se puede decir que el ADN regula la expresion genica, dentro de otras funciones que tambien cumple. Como se menciono, gran parte del genoma consiste en secuencias intergenicas, en general estas son regiones de ADN no condificante, entre las secuencias intergenicas se encuentran los elementos transponibles, los seudogenes y el ADN satelite. Los elementos transponibles o transposones, son secuencias que pueden cambiar de posicion dentro del genoma, algunos tipos de transposones codifican enzimas necesarias para su propia transposicion, estos forman parte de las secuencias denominadas ADN moderadamente repetitivo, junto con secuencias codificantes como los genes de ARNr y ARNt. Los seudogenes son secuencias originadas en duplicaciones fallidas de ciertos genes, que resultan en copias no funcionales El ADN satelite son secuencias de ADN que aparecen repetidas desde cientos a millones de veces en un genoma, algunas de ellas forman los centromeros y los telomeros, pero la mayoria no tiene funcion conocida. CONCLUSION Tipo de secuencias Funcion Transcripcion Traduccion Nª de copias Genes de proteinas Codifican proteinas Se transcribe en ARNm Se traducen en proteinas Unica, con excepcion de los genes de histonas. Genes de ARNr Codifican ARN que se incorpora a los ribosomas Se transcriben en un precursor del cual derivan los diferentes ARNr. No ADN modearademente repetitivo Genes de ARNt Codifican las diferentes especies de ARNt Se transcriben en un precursor que luego madura dando origen a cada ARNt. No ADN moderadamente repetitivo Genes de otros ARN Codifican ARN pequeños y de interferencia Se transcriben No No especificado Secuencias Reguladoras Regulan la transcripcion de otros genes en interaccion con factores de transcripcion No No ADN moderadamente repetitivo Seudogenes Copias fallidas de genes No No ADN moderadamente repetitivo Transposonas No tiene funcion conocida No No ADN altamente repetitivo ADN satelite En el centromero intervienen en la union del cromosoma al aparato mitotico. En el telomero estabiliza y protege los extremos del cromosoma. No No EL PROCESO DE TRANSCRIPCION La transcripcion es el proceso de sintesis de ARN dependiente de un molde de ADN. Los genes presentan una region promotora o promotor, cuya secuencia de bases señala el nucleotido donde se inciara la transcripcion, a su vez, otras secuencias llamadas terminadores indican el punto final de la transcripcion. La transcripcion de un gen requiere la participacion de una enzima de la familia de las ARN polimerasas (ARN pol). Cada ARN pol reconoce principalmente ciertas regiones del promotor, con secuencias de bases muy conservadas en la evolucion, llamadas secuencias consenco. La ARN pol se una a dichas secuencias y da inicio a la transcripcion. En Eucariotas, la union de las ARN polimerasas al promotor esta mediada por un grupo de proteinas llamadas factores basales de transcripcion. Una vez unida al promotor, la ARN polimerasa queda correctamente posicionada para copiar una de las cadenas del gen, la cadena molde. A medida que avanza, la enzima separa transitoriamente a la cadena molde de su complementaria, la cadena antimolde. Las cadenas de ADN desapareadas forman una “burbuja de Transcripcion”. De esta manera se exponen los nucleotidos del molde, a cada uno de los cuales la ARNpol empareja un ribonucleotido complementario. Los ribonucleotidos se aparean con los desoxirribonucleotidos segun las mismas reglas de complementariedad que rigen para el ADN con la sola excepcion de que la timina es reemplazada por uracilo. Conforme los ribonucleotidos se aparean con el molde de ADN, la ARNpol cataliza la formacion de los puentes fosfodiester que enlazan entre si a los ribonucleotidos trifosfato de A, G, C, y U. Durante la polimerizacoin se elimina un grupo pirofosfato de cada monomero, que a su vez es escindido inmediatamente en dos fosfatos por una enzima pirofosfatasa. El transcripto de ARN resulta complementario y antiparalelo al molde, el transcripto se mantiene un breve lapso apareado con el molde, conformando ambos una doble helice transitoria. Mientras el transcripto de ARN crece, la burbuja de transcripcion se desplaza junto con la polimeraza, pues la doble helice de ADN se abre con el avance de la enzima y se cierrapor detras de la misma, asi el molde ya transcripto vuelve a aparearse con el antimolde. El proceso concluye cuando la ARNpol sobrepasa la secuencia terminadora, que tambien es transcripta. Una vez concluido el proceso de copia, el extremo 3`del ARN sintetizado se desaparea de su molde y se liberam mientras se cierra la burbuja de transcripcion. El ARN se sintetiza por complementariedad con respecto al molde y antiparalelo al mismo, por lo cual su direccion y secuencia de bases coinciden con las del antimolde. Es por esta razon que el antimolde es tambien llamado hebra positiva o codificante, mientras que el molde es denominado hebra negativa o no codificante. TRANSCRIPCION EN PROCARIOTAS El Proceso de la transcripcoin consta de tres etapas: Iniciacion: Consiste en el reconocimiento del promotor por la ARN polimerasa, la formacion de la burbuja de transcripcion y el inicio de la nueva cadena de ARN. Elongacion: Es el alargamiento del ARN en la burbuja de transcripcion. El avance de la burbuja genera una supertorsion o superenrollamiento del ADN rio abajo, que requiere la participacion de la enzima topisomerasa 1 para su correccion. Terminacion: La transcripcion culmina cuando la ARNpol sobrepasa una secuencia terminadora. Los terminadores son transcriptos pero poseen secuencias que favorecen la separacion de la ARNpol. Hay dos clases de terminadores: Independientes de la proteina rbo y dependendientes de la proteina rbo TRANSCRIPCION EN EUCARIOTAS Aunque poseen las mismas etapas que los procariotas existen algunas caracteristicas que las distinguen. 1. El proceso de transcripcion esta confinado al nucleo, donde los transcriptos sufren posteriormente un proceso de maduracion. 2. El ADN esta asociado a histonas, formando la cromatina. La accesibilidad del ADN a las enzimas de la transcripcion requiere modificaciones transitorias de las histonas y de la arquitectura de la cromatina 3. Existen tres especies de ARN polimerasas, que reconocen ciertos tipos de promotores y se encargan, por ende, de la transcripcion de genes especificos. Tipo de ARNpol Transcribre.. ARNpol I ARNr 45 S ARNpol II ARNm, algunos ARN pequeños ARNpol III ARNt, algunos ARN pequeños 4. La union de cada ARNpol al correspondiente promotor se realiza en presencia de factores proteicos especificos para cada polimerasa, llamados factores de transcripcion. La interaccion de estos elementos, que conforman una “maquinaria” basal de la transcripcion, posibilita una tasa de transcripcion minima. 5. Los promotores, segun el tipo de gen, pueden ubicarse rio arriba o rio abajo del punto de inicio de la transcripcion. Por ejemplo, los promotores de los genes que codifican proteinas se ubican rio arriba, de manera que no son copiados en el transcripto. Los promotores de los genes de ARNr, en cambio se situan dentro de la region transcripta. Las secuencias consenso en eucariotas guardan cierta similitud con las de promotores procariotas, aunque no son identicas. 6. Las regiones reguladoras del ADN interaccionan con proteinas llamadas factores de transcripcion especificos y ambas regulan la “maquinaria” de transcripcion basal. Dicha regulacion modula la velocidad y frecuencia de transcripcion de un gen EL CODIGO GENETICO En la secuencia de bases de los ARNm esta codificada la informacion para la sintesis de proteinas. El codigo o idioma de los genes esta constituido por tripletes de nucleotidos, las cuatro bases (A, G,C,T,U) pueden formar 64 tripletes diferentes segun el roden en que se combinen. Cada triplete funciona como una palabra del codigo genetico. Los tripletes una vez transcriptos al ARNm, reciben el nombre de codones el cual significa “unidad de codigo”. De los 64 tripletes o codones existentes 61 codifican aminoacidos y 3 son codones stop o de terminacion. Cada uno de los 61 codones que codifican aminoacidos “nombra” a uno y solo un aminoacido particular, eso evita errores en el momento de la traduccion. El codigo genetico tiene, para cada codon, una interpretacion unica: no es ambiguo. Existen 61 codones para codificar aminoacidos, los cuales son solo 20 presenten en la proteina, ¿Que ocurre con los codones restantes? Los codones restantes funcionan como sinonimos, es decir que cada aminoacido esta codificado por mas de un codon, con excepcion de metionina y triptofano que estan nombrados por un unico codon cada uno. La existencia de diferentes codones sinonimos que codifican a un mismo aminoacido es una caracteristica del codigo que se conoce como “degeneracion” o “redundancia”. Incluir cuadro codigo genetico Los codones stop o de terminacion son UGA, UAG y UAA y no codifican aminoacidos, estos ofician como punto final del mensaje. La traduccion del ARNm es realizada en direccion 5`a 3`. El primer codon traducido es siempre un codon con la secuencia AUG, llamado por ello “Codon de iniciacion” dicho codon, codifica al aminoacido metionina en eucariotas y a una variante en procariotas llamado formil-metionina, una vez encontrado el AUG mas cercano al extremo 5 la traduccion progresa hacia el extremo 3. Este codon determina el marco de lectura para la traduccion, durante la traduccion, el mensaje que porta el ARNm se lee de corrido, significa que las tres bases que siguen AUG en sentido 53 seran interpretadas como el segundo codon y asi sucesivamente hasta alcanzar un codon stop. El codigo genetico es universal, lo que significa que es el mismo para todos los seres vivos, esta universalidad es lo que ha permitido la creacion de organismos “transgenicos” Resumiendo: Consta de 64 tripletes o codones, 61 de los cuales codifican aminoacidos, mientras que los 3 restantes funcionan como señales de terminacion de la traduccion Es degenerado o redundante, pues existen codones sinonimos No es ambiguo, ya que cada codon solamente codifica un aminoacido Sus codones se traducen de corrido, el codigo no se solapa Es universal Excepciones a la universalidad del codigo genetico Se ha encontrado que ciertos codones pueden tener significados diferentes al comparar ADN de distintos origenes. La mayor parte de las excepciones a la universalidad del codigo se verifican en los codones stop y en el ADN mitocondrial. Se ha afirmado que el codigo genetico no se solapa, sin embargo se ha encontrado que ciertos virus portan en su genoma mensajes solapados. En estos genomas, determinadas secuencias de nucleotidos codifican mas de una secuencia de aminoacidos, esto se logra modificando el marco lectura. LA MAQUINARIA TRADUCCIONAL ARNm Eucariota Son moleculas lineales de cadena simple en donde residen las instrucciones para la elaboracion de un producto proteico. Los ARNm procariotas y eucariotas son escencialmente iguales, ya que cuando estan listos para la traduccion su secuencia de codones dicta con exactitud la secuencia lineal de aa de una cadena polipeptidica particular. Se lee en sentido 53 el codon iniciador generalmente es AUG y el codon stop puede ser UGA, UAA, UAG. El ARNm presenta sectores denominados secuencias no codificantes 5 y 3 respectivamente, estas regiones no se traducen en proteina aun cuando forman parte del ARNm transcripto del gen. El ARNm eucariota presenta secuencias codificadoras interrumpidas, es decir coexisten a lo largo de la molecula sectores que codifican proteinas, llamados exones con secuencias intercaladas denominadas intrones. Los ARNm transcriptos primarios sufren una serie de modificaciones antes de salir al citoplasma como ARN maduro, algunos de los cambios es el agregado de moleculas en sus extremos llamadas capping y poliadenilacion. Capping: proceso por el cual se adiciona en el extremo 5 una molecula de 7 metil.guanosina a la que se conoce como CAP.La cap impide la degradacion del ARNm inmaduro por enzimas como nucleasas y fosfatasas nucleares, tambien participa en la remocion de intrones y en el inicio de la traduccion. Poliadenilacion: Agregado de unas 250 adenosinas cuyas funciones son: proteger el extremo 3`de la degradacion y ayudar a los ARNm a salir del nucleo, los ARNm de las histonas carecen de cola poli A, pues no presentan señal de poliadenilacion. Corte y empalme: modificacion significativa que afecta la secuencia codificadora, sufriendo un acortamiento producto de la eliminacion de los intrones, quedando como producto final los exones empalmados en una secuencia continua. ARNm PROCARIOTA Presentan secuencias codificadoras continuas, pues carecen de intrones No sufren modificaciones pos transcripcionales Muchos ARNm procariotas son policistromicos, es decir que una sola molecula de ARNm contiene informacion para varias proteinas. ARNt (transferencia) Moleculas “Adaptadoras” ya que interactuan por un lado con la cadena polinucleotida (ARNm) y por el otro con los aa que formaran parte de la cadena polipeptidica. Asi alimentan a los aa siguiendo el orden de los codones del ARNm. Esta formado por 70 a 93 ribonucleotidos con enlaces puentes de hidrogeno entre sus bases los cuales repliegan la molecula dando origen a una disposicion espacial en forma de trebol. En esta molecula se distinguen dos extremos: El extremo 3 o extremo aceptor de la molecula que representa el sitio de union donde se liga el aa. El extremo opuesto al sitio aceptor del aa, se localiza un triplete de nucleotidos conocido como anticodon, cuya secuencia varia en cada tipo de ARNt.. Todos los ARNt presentan un porcentaje significativo de bases poco frecuentes que surgen por modificacion post-transcripcional de los cuatro ribonucleotidos estandar. El ARNt debe poseer varias propiedades especificas: Debe ser reconocido por una aminoacil ARNt sintetasa que lo una al aa correcto. Debe tener una region que actue como sitio de union para el aa Debe tener una secuencia complementaria (anticodon) especifica para el codon del ARNm correcto. ARNr (ribosomico) Junto con las proteinas, son los componentes de los ribosomas, los ribosomas y los ARNr intervienen en la traduccion de la informacion codificada en el ARNm por lo cual los primeros son considerados fabricas de proteinas Cada ribosoma consta de dos subunidades : Subunidad mayor y subunidad menor. Dentro de cada ribosoma hay tres huecos llamados sitios A (aminoacidico) P (Peptidico) y E (Exit) para el ingreso de los ARNt, unidos a sus correspondientes aminoacidos y el agreso de los ARNt descargados. Las subunidades ribosomicas trabajan conjuntamente en la sintesis proteica, la Subunidad menor aloja al ARNm sobre el cual se acomodan los ARNt junto con los aa que transportan. La subunidad mayor cataliza la union peptidica de los aa gracias a la accion de la peptidil transferasa. ARN pequeños Forman complejos con proteinas especificas dando lugar a la formacion de particulas ribonucleoproteicas (RNP). Varios de estos complejos participan en el procesamiento del ARNm formando un complejo multienzimatico denominado espliceosoma, encargado de realizar cortes y empalmes en los ARNm primarios. La funcion mas conocida de cualquier RNPpc (localizadas en el citoplasma) es la que desempeña el complejo ARN/proteinas que componen la particula de reconocimiento de la señal o SRP. Estas particulas participan en el reconocimiento de secuencias especificas de las proteinas de secrecion, proteinas de membrana y de los lisosomas, deteniendo su traduccion, hasta que el ribosoma en el que se estan sintetizando contacte con la membrana del reticulo endoplasmatico granular, donde finalizan su traduccion. EL PROCESO DE LA TRADUCCION O SINTESIS PROTEICA La traduccion es el proceso por el cual se construye una cadena polipeptidica con una secuencia especifica, a partir de la informacion codificada en la secuencia de nucleotidos del ARNm. ADNARN Cadena polipeptidica La sintesis proteica incluye las siguientes etapas: Activacion de los aminoacidos o aminacilacion Traduccion del ARNm ACTIVACION DE LOS AMINOACIDOS O AMINOACILACION La aminoacilacion consiste en la union de cada ARNt con su aminoacido correspondiente. Este proceso esta catalizado por 20 variantes de la enzima aminoacil ARNt sintetasa (una para cada aminoacido) de estas enzimas depende la fidelidad con la cual los aminoacidos se enlazan a sus ARNt especificos. En esta etapa, la actividad correctora de las enzimas aminoacil ARNt sintetasa minimizan los errores en la seleccion del aminoacido correcto. La reaccion de aminoacilacion ocurre de la siguiente manera: En la primera fase de la reaccion se utiliza la energia de la hidrolisis del ATP para unir cada aminoacido a un AMP, con un enlace de alta energia, Esta reaccion da origen a un complejo intermediario denominado aminoacil-AMP. Sin abandonar la enzima, se transfiere el aminoacido del complejo aminoacil- AMP al ARNt especifico con lo cual se origina la molecula final: aminoacil- ARNt. TRADUCCION DEL ARNm el mecanismo por el cual se traduce el mensaje genetico contenido en el ARNm puede describirse en tres etapas: Iniciacion Elongacion Terminacion En todas las fases se requiere la presencia de un complejo sistema de proteinas citoplasmaticas conocidas como factores de iniciacion, factores de elongacion y factores de terminacion. Dichos factores son diferentes en procariotas y eucariotas aunque sus funciones son semejantes. Iniciacion de la traduccion En esta etapa se reunen los componentes que constituyen el complejo de iniciacion, el complejo esta compuesto por una molecula de ARNm, una subunidad mayor, una subunidad menor, el ARNt iniciador y factores proteicos de iniciacion. Dicho complejo comienza a formarse cuando se acoplan el ARNm y la subunidad menor del ribosoma. El ARNt iniciador ingresa al sitio P uniendose por complementariedad de bases al codon AUG mas proximo al extremo 5`del ARNm. Este evento consitituye una etapa crucial de la etapa de iniciacion, pues garantiza que el mensaje genetico se lea en sentido 5`a 3` en el marco de lectura correcto para el resto de los codones que contenga la region codificadora del ARNm, la incorporacion posterior de la subunidad mayor cierra el complejo de iniciacion, originando un ribosoma completo y funcional. En conclusion, tres clases de interacciones determinan el inicio de la sintesis proteica: Reconocimiento del codon de iniciacion del AUG en la subunidad menor del ribosoma Acomplamiento de bases del codon AUG con el ARNt iniciadror Acomplamiento de la subuidad mayor del ribosoma cerrando el complejo de iniciacion Elongacion de la cadena polipeptidica Este proceso se inicia cuando una nueva molecula de aminoacil-ARNt ingresa al sitio A vacante del ribosoma acoplandose por complementareidad de bases al segundon codon del ARNm expuesto en ese lugar. Esta reaccion requiere la intervencion de un factor de elongacion y GTP. Durante la elongacion, como durante la aminoacilacion, se ponen en marcha mecanismos correctores. En esta etapa se garantiza que el apareamiento de bases codon-anticodon sea correcto. El ciclo de Elongacion de la sintesis se caracteriza por: La union del aminoacil-ARNt (reconocido por el codon) La formacion del enlace peptidico La translocacion del ribosoma Terminacion de la sintesis proteica la finalizacion de la sintesis proteica ocurre ante la llegada al sitio A del ribosoma, de uno de los tres codones stop o de terminacion: UGA, UAG, UAA. Estos son reconocidos por un factor de terminacion o liberacion. El factor de liberacion se une al codon stop, estimulandola hidrolisis del enalce entre la cadena polipeptidica y el ARNt ubicado en el sitio P. Como consecuencia de esta reaccion el polipeptido se desacopla del ARNt, liberandose en el citoplasma. El ARNm se separa del ribosoma y se disocian las dos subunidades, las cuales podran volverse a ensamblar sobre otra molecula de ARNm reiniciandose el proceso de traduccion. Los acontecimientos que caracterizan la terminacion de la sintesis son: El reconocimiento del codon stop La disociacion de las subunidades ribosomicas, el ARNm y la cadena polipeptidica El costo energetico de la sintesis proteica La sintesis proteica requiere mas energia que cualquier otro proceso anabolico. Para formar cada enlace peptidico se consumen en total 1 ATP y 2 GTP, los que aportan cuatro enlaces de alta energia: Dos en la activacion del aminoacido El tercero en la union del aminoacil-ARNt a la subunidad menor del ribosoma El cuarto en la translocacion del ribosoma Polirribosomas Grupo de ribosomas que traducen simultaneamente el mismo mensaje, cada ribosoma en esta unidad estructural opera independientemente sintetizando una molecula de la misma cadena polipeptidica en distintos grados de crecimiento. Diferencias en la traduccion en procariotas y eucariotas En eucariotas la envoltura nuclear y la maduracion que sufren los ARNm impiden su traduccion inmediata. El ARNm es “leido” despues de que haya abandonado el nucleo a traves de los poros nucleares. La traduccion es por lo tanto post- transcripcional. En procariotas, la traduccion es simultanea a la transcripcion, esto es, mientrasa se esta terminando de transcribir el extremo 3`, el extremo 5`libre del ARNm se asocia a un ribosoma y al ARNt iniciador comenzando la traduccion. Regulacion de la expresion genetica Regulacion en procariotas El operon de iac El operón lac es un operón requerido para el transporte y metabolismo de la lactosa en la bacteria Escherichia coli, así como en algunas otras bacterias entéricas. Presenta tres genes estructurales adyacentes, un promotor, un regulador y un operador. El operón lac es regulado por varios factores, incluyendo la disponibilidad de glucosa y de lactosa. La regulación génica del operón lac fue el primer mecanismo regulatorio de la expresión genética en ser elucidado, y es utilizado a menudo como un ejemplo clásico de la regulación génica en procariotas. Un operon es un conjunto de genes agrupados en el cromosoma bacteriano que codifican la sintesis de proteinas que participan en una determinada via metabolica. Los genes de un operon no se transcriben en forma independiente, funcionan como una unidad de transcripcion bajo control de las mismas secuencias reguladoras. El operon Iac consta de: Regulador: Segmento de ADN que codifica una proteina represora que reconoce al segmento operador https://es.wikipedia.org/wiki/Oper%C3%B3n https://es.wikipedia.org/wiki/Metabolismo https://es.wikipedia.org/wiki/Escherichia_coli https://es.wikipedia.org/wiki/Enterococcus https://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Gen_estructural&action=edit&redlink=1 https://es.wikipedia.org/wiki/Promotor_del_ADN https://es.wikipedia.org/wiki/Gen_operador https://es.wikipedia.org/wiki/Glucosa https://es.wikipedia.org/wiki/Lactosa https://es.wikipedia.org/wiki/Regulaci%C3%B3n_g%C3%A9nica https://es.wikipedia.org/wiki/Procarionte Promotor: Segmento de ADN en donde se une la ARNpol identificando el inicio de la transcripcion Operador: Segmento de ADN reconocido por la proteina represora controla la transcripcion de los genes. Genes estructurales: Codifican tres proteinas: Z=B galactosidasa (cataliza la hidrolisis de la lactosa en galactosa y glucosa), y = permeasa (transporta a la lactosa en la celular) a = transacetilasa (no se conoce su funcion en el metabolismo de la lactosa) El operon Iac es un ejemplo de sistema inducible bajo control negativo: la induccion se produce cuando el sustrato sobre el que actuara la proteina provoca la sintesis de la proteina. El control negativo lo ejerce el represor, proteina que unida al ADN inhibe la transcripcion. En este sistema inducible, la transcripcion normalmente esta reprimida y debe inducirse su encendido El operon iac tambien se encuentra bajo control positivo, en este caso, otras moleculas se unen al ADN estimulando la transcripcion. Este tipo de control es dependiente de los niveles de glucosa en el medio. Las bacterias, como otras celulas, optan por la glucosa como el combustible celular por excelencia. En presencia de este monosacarido, la celula ignora cualquier otra fuente de energia, aun cuando se trate de lactosa. Teniendo en cuenta esta situacion, para que el operon Iac se exprese, no solo debe estar presente la lactosa, sino que ademas debe estar ausente la glucosa. En conclusion: Si no hay lactosa y hay glucosa: la transcripcion se detiene porque el represor activo se une al operador y porque los niveles de Cap-AMPc estan reducidos. La bacteria utiliza glucosa como fuente de carbonos. Si hay lactosa y no hay glucosa: la transcripcion se reduce al minimo porque si bien el represor en presencia de lactosa se inactiva, los niveles de Cap-AMPc estan reducidos. La bacteria utiliza glucosa como fuente de carbonos. Si hay lactosa y no hay glucosa: la transcripcion alcanza su maxima expresion porque el represor se inactiva y porque el nivel de Cap-AMPc es elevado. La bacteria utiliza lactosa como fuente de carbonos. El operon triptofano El trp operon es un operón — un grupo de genes que es empleado o transcrito en conjunto — que codifica para los componentes necesarios para producción de triptófano. El operón trp se encuentra en muchas bacterias, pero fue caracterizado primero en Escherichia coli. El operón se encuentra regulado de modo que cuando el triptófano está presente en el medio, los genes para la síntesis del triptófano no son expresados. El operón fue un https://es.wikipedia.org/wiki/Oper%C3%B3n https://es.wikipedia.org/wiki/Tript%C3%B3fano https://es.wikipedia.org/wiki/Bacteria https://es.wikipedia.org/wiki/Escherichia_coli https://es.wikipedia.org/wiki/Escherichia_coli importante sistema experimental para aprender acerca de la regulación de los genes, y es generalmente empleado para enseñar regulación génica. Este sistema consiste en 5 genes estructurales (E, O, C , B, A) que codifican las enzimas involucradas en la biosintesis del aminoacido triptofano. Dichos genes se agrupan en una unidad de transcripcion con un solo promotor y un operador. Un gen regulador se localiza fuera del operon y codifica la sintesis de una proteina represora. En ausencia del triptofano, la ARN polimerasa se une al promotor y transcribe los genes estructurales en un ARNm policistronico. En presencia del triptofano, el operon no se transcribe. En presencia del triptofano en el medio circundante, el triptofano, se une a la proteina represora constituyendo el complejo represor/co-represor. Con este mecanismo de regulacion, la bacteria ahorra energia sintetizando triptofano solamente cuando esta sustancia esencial en su crecimiento esta ausente en el medio. REGULACION EN EUCARIOTAS Las celulas eucariotas presentan estrategias mas complejas que las bacterias para regular la actividad de sus genes. Si bien los mecanismos mas importantes de control son los que actuan a nivel transcripcional, es importante destacar que pueden producirse regulaciones durante el procesamiento o maduracion del ARNm ya sea controlando su pasaje a citoplasma o bien su supervivencia en el citosol. En algunos casos, los controles actuan a nivel traduccional o regulando la actividad de la proteina. MECANISMOS DE CONTROL A NIVEL TRANSCRIPCIONAL En la regulacion de la transcripcion participan: El nivel de condensacion de la cromatina: Eucromatina/ heterocromatina El nivel de metilacion de los genes Las ARN polimerasas (I,II,III), factores de transcripcoin (basales y especificos: activadores y prepresores), las secuencias reguladoras (intensificadoras y silenciadores) La estructura de la cromatina y la expresion genica la compactacion de la cromatina afecta la capacidad de union de las enzimas y factores transcripcionales a genes especificos. Existen dos tipos de cromatina: la eucromatina, transcripcionalmente activa, desplegada y la heterocromatina, inactiva, mas condensada. La transcripcion solo ocurre cuando el ADN esta desplegado. Como la heterocromatina no puede ser transcripta, la expresion genetica en los eucariotas se puede reprimir por condensacion de eucromatina en heterocromatina. Por lo tanto, las regiones de cromatina condensada y dispersa varian segun el tipo celular reflejando segun cree, la sintesis de proteinas diferentes por distintos tipos celulares. El grado de enrollamiento de la cromatina es regulado por el agregado o remocion de grupos acetilo, metilo o fosfatos a las porciones de las histonas que se proyectan fuera del nucleosoma. A estos cambios se los denomina epigeneticos; son cambios que afectan la expresion de los genes y una vez establecidos pueden ser transmitidos a la descendencia celular, sin modificar la secuencia de bases del gen. El grado de metilacion del ADN y la expresion Genetica La metilacion del ADN es un proceso epigenetico que partipa en la regulacion de la expresion genica de dos maneras, directamente al impedir la union de factores de transcripcion e indirectamente propiciando la estructura “Cerrada” de la cromatina. Factores de transcripcion y expresion genetica Cada gen esta compuesto por secuencias de nucleotidos que determinan una o mas regiones reguladoras, un promotor, una region codificadora y una secuencia de terminacion. La secuencia promotora es el sitio de union de las ARNpol y de los factores basales de transcripcion, que forman un complejo proteico escencial para el comienzo de la transcripcion A miles de nucleotidos de distancia se encuentran las secuencias reguladoras, existen dos tipos de regiones reguladoras: secuencias intensificadoras y secuencias silenciadoras que interaccionan respectivamente con dos tipos de factores de transcripcion especficos: Activadores y represores. La interaccion fisica entre cada enhancer y su activador estimula la velocidad de la transcripcion, lo cual redunda en un aumento en la cantidad de ARNm transcripto y de la proteina codificada por el. Cuando las proteinas represoras se unen a las secuencias silenciadoras se inhibe la transcripcion. Para iniciar la transcripcion de los genes que codifican proteinas, la ARNpol II requiere la presencia de factores basales de transcripcion unidos al promotor. Para que dicha union ocurra, las secuencias reguladoras deben ser activadas previamente por factores de transcripcion especificos. Se considera que los factores basales son constitutivos, ya que son los mismo para casi todos los genes. En cambio los factores de transcripcion son particulares para cada gen y por ello se los clasifica como facultativos. Dimerizacion de los factores de transcripcion Los factores de transcripcion encajan de pares en regiones simetricas contiguas de ADN Dichas regiones presentan secuencias palindromas, es decir que se leen igual en ambos sentidos Cada proteina del par se une no covalentemente con la mitad del palindromo, ocupando la estructura dimerica simetrica asi formada, dos vueltas de la helice de ADN. Esta propiedad de dimerizacion permite a los factores de transcripcion interactuar con el promotor y las secuencias reguladoras. La transcripcion de un gen depende de la actividad conjunta de los factores de transcripcion unidos a las secuencias reguladoras. Cada gen tiene una combinacion particular de intensificadores y silenciadores. La diferencia entre los distintos tipos celulares se deben a que cada celula transcribe distintos genes y expresa distintas proteinas. Esto es consecuencia en parte, de que cada tipo celular contiene distintos conjuntos de factores de transcripcion que detemrinan la expresion de diferentes genes. La union de los FTE provoca un cambio conformacional del ADN que al curvarse formando un asa determina una aproximacion entre las secuecnias reguladoras y promotora. Este plegamiento permite contactar a los factores especificos, unidos a las regiones reguladoras, con una o mas proteinas asociadas al complejo de transcripcion basal. Cuando ocurre, se estimula la transcripcion por parte de la ARN polimerasa, la que se desplaza copiando la region codificadora del gen. MECANISMOS A NIVEL DEL PROCESAMIENTO DEL ARNm En la maduracion de los ARNm eucariotas, el corte de intrones y el empalme de exones posibilita la obtencion de una secuencia codificadora continua en el ARNm maduro. El empalme alternativo permite que a partir de un mismo gen puedan obtenerse dos o mas proteinas diferentes. En estos casos, existe mas de una via de procesamiento del transcriptoprimario que dan como resultado proteinas estructural y funcionalmente diferentes o bien isoformas de una misma proteina. Durante el empalme diferentes combinaciones de exones se unen y generan una amplia gama de ARNm a partir de un solo pre-ARNm. Puede ocurrir que uno o mas exones sean removidos o que uno o mas intrones no sean exluidos o ambos acontecimientos simultaneamente. Los ARNm maduros resultantes podrian dar lugar a proteinas que diferen en uno o mas tramos de su secuencia aminoacidica, con diferentes actividades y funciones. MECANISMO A NIVEL DEL TRANSPORTE DEL ARN AL CITOPLASMA Para salir del nucleo, los ARN deben pasar previamente por el proceso de maduracion. Aquellos que carezcan de capuchon, cola poliA o no hay sufrido remocion de intrones no superaran el control nuclear y seran rapidamente degradados. MECANISMO A NIVEL DE LA PERMANENCIA DEL ARNm EN EL CITOPLASMA La vida media de un ARNm esta determinada principalmente por la longitud de la cola poli A. En el citoplasma, la cola poli A comienza a acortarse y esto inestabiliza a los ARNm. Cuando la cola es muy corta, los ARNm son rapidamente degradados. MECANISMOS DE CONTROL A NIVEL DE LA TRADUCCION Existen mecanismos generales e inespecificos de control de la traduccion. Por ejemplo los factores de iniciacion de la traduccion se controlan por fosforilacion. Tambien es importante la disposicion espacial en extremo 5`del ARNm, donde es fundamental la presencia de la cap para que el ARNm pueda interactuar con la subunidad menor del ribosoma e iniciar la traduccion. Otro mecanismo especifico importante es el control de la estabilidad del ARNm. Control de traduccion por proteinas reguladoras: se conocen casos especificos o control particular de la traduccion de ciertos ARNm. Estos mecanismos dependen de proteinas reguladoras que modifican la configuracion de la secuencia de nucleotidos no traducibles, localizados en el extremo 5 entre la cap y el codon de iniciacion. Interferencia por ARN Los ARN interferentes pequeños (siARN) y los microARN (miARN) participan en un fenomeno llamado interferencia por ARNt. Tanto los siARN como los miARN son cadenas cortas de ARN que se aparean en forma perfecta o imperfecta con regiones de los ARNm, induciendo la degradacion de estos ultimos por ARNasas o bien impidiendo su traduccion. Por otr aparte, la sintesis de ARN interferente de diseño podria permitir el silenciamiento de genes especificos, convirtiendose en una herramienta util para diversos propositos tales como identificar la funcion de determinados genes. Mecanismos de control post traduccionales los mecanismo de regulacion postraduccionales incluyen modificaciones que afectan la vida media de las proteinas o su actividad biologica. La vidamedia de las proteinas tambien puede ser considerada una forma indirecta de regular la expresion genica. Dos factores son determinantes de la vida media de una proteina citosolica: su correcto plegamiento y la secuencia aminoacidica de su extremo aminoterminal. Desde el momento en que una proteina emerge del ribosoma libre, otras proteinas citosolicas de diversos tipo se unen a la cadena en sintesis, ayudandola a adquirir la conformacion nativa. Estas proteinas se denominana chaperonas moleculares. Esta union transitoria evita que las proteinas recien sintetizadas se plieguen de forma anomala. Las proteinas que adquieren un plegamiento anomalo o se han desnaturalizado, o bien poseen su extremo aminoterminal desestabilizante, sufren un proceso de ubiquitinizacion, este consiste en la adicion de varias moleculas de ubiquitina, la proteina ubiquitinazada es captada por un complejo enzimatico denominado proteosoma donde la proteina es degradada Existe otra via que compite con la ubiquitinizacion. Las proteinas desnaturalizadas son conducidas por chaperonas moleculares hasta una chaperona oligomerica. Estas pueden recuperar el plegamiento nativo de la proteina evitando su destruccion. Esto solo es posible cuando el encuentro entre la chaperona y la proteina desnaturalizada se da en una etapa previa o temprana de la ubiquitinizacion. ESTABILIDAD DEL GENOMA el dogma de la biologia molecular dice: Adn--transcripcioon-->ARNm---Traduccion--> Proteina Esto quiere decir que la informacion genetica almacenada en el ADN se transcribe en ARN y se traduce en proteinas. La replicacion del ADN garantiza la transferencia vertical de dicha informacion. La estabilidad del ADN es debida al particular mecanismo de replicacion y a los sistemas de reparacion que actuan sobre la molecula de ADN, ambos sumamente eficientes para asegurar la fidelidad en las copias de la informacion genetica y su perpetuacion. Mecanimos que introducen variaciones en el genoma: mutaciones Se denomina mutacion, a todo cambio espontaneo o inducido en la secuencia de nucleotidos del ADN. Si una mutacion ocurre en una celula somatica su funcionamiento puede ser afectado en mayor o menor medida, pero este cambio no sera transmitido a las generaciones siguientes. En cambio si la mutacion ocurre o involucra de algun modo a las celulas germinales, a partir de las cuales se originan las gametas, existe una probabilidad elevada de que la misma sea transmitida a las siguientes generaciones. Segun la extension que abarque un determinado cambio en el genoma, las mutaciones pueden considerarse genicas o puntuales, cuando afectan a uno o unos pocos nucleotidos o aberraciones cromosomicas, cuando afectan a la estructura o al numero de cromosomas propio de una especie. Existen distintos tipos de mutaciones genicas, en cualquiera de los casos el cambio de la informacion que contiene un gen puede llevar o no a la produccion de una proteina diferente de la original e incluso puede llegar a impedir su sintesis. las mutaciones genicas mas comunes se originan a partir de alguno de los sigueitnes fenomenos: Sustitucion: Consiste en el reemplazo de un nucleotido por otro, pudiendo producir un cambio en el significado o la codificacion del triplete. como resultado, la estructura primaria o secuencia aminoacidica del polipeptido resultante se vera modificada, pudiendo ello generar o no trastornos funcionales en la proteina sintetizada. La sustitucion de un nucleotido que conlleva a una modificacion de un codon por otro que codifica un aminoacido distinto se denomina mutacion de cambio de sentido, como consecuencia de este tipo de mutacion, la estructura primaria de la proteina sintetizada difiere de la estructura primaria original. Insercion: Consiste en el agregado de uno o mas nucleotidos en el gen. este tipo de mutacion induce a un corrimiento en el orden de lectura de los codones. Como resultado del cambio, los codones situados a continuacion del agregado del nucleotido informan una secuencia de aminoacidos completamente distinta. Deleccion: consiste en la perdida de uno o mas nucleotidos en un gen. Este tipo de mutacion al igual que las inserciones, induce un corrimiento en el marco de lectura de los codones y da como resultado una cadena de aminoacidos distinta de la original. Las diferencias entre el polipeptido original y el que resulta de este tipo de mutaciones, no solo involucran la calidad de los aa sino tambien el numero de los mismos. CONCLUSIONES Una de las primeras sorpresas que deparo el creciente conocimiento del genoma fue el hallazgo de que, asi como el ARN se sintetiza copiando un molde de ADN, tambien es posible el proceso inverso. La aparicion en escena de la retrotranscriptasas o transcriptasas inversa viral, puso en evidencia que la informacion genetica puede fluir desde el ARN al ADN. En los ultimos tiempos ha sido el ARN el gran protagonista en ucanto a añadir complehidad a la genetica molecular a causa de que distintos hallazgos relacionados con esta molecula y sus modificaciones protranscripcionales obligan a concebir un modelo mucho mas dinamico del viejo "dogma"
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