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La química de la vida: compuestos orgánicos 67 dando lugar a una conformación más aleatoria. Este desdoblamiento, de- bido sobre todo a la rotura de enlaces de hidrógeno y iónicos, se acompaña normalmente de una pérdida del fun- cionamiento normal. Estos cambios de forma y la pérdida de actividad biológica que los acompaña se llaman desnaturalización de la proteína. Por ejemplo, una enzima desna- turalizada perdería su capacidad para catalizar una reacción química. Un ejemplo cotidiano de desnaturaliza- ción es el que ocurre cuando se fríe un huevo. La consistencia de la proteína de la clara del huevo, conocida como albúmina, se hace sólida. La desnatu- ralización suele ser irreversible (no se puede “desfreír” un huevo). Sin embargo, en condiciones específi cas, algunas proteínas desnaturalizadas se han hecho volver a su forma y ac- tividad biológica originales cuando se restauran las condiciones ambientales normales. La conformación de una proteína se estudia por diversos métodos La arquitectura de una proteína se puede determinar directamente me- diante diversos tipos de análisis, como los estudios de difracción de rayos X que se analizan en el capítu lo 12. Ya que estos estudios son largos y costosos, los investigadores han desa- rrollado procedimientos alternativos, que dependen en gran medida de las enormes bases de datos generadas por el Proyecto Genoma Humano e iniciativas relacionadas. Actualmente la estructura primaria de una proteína se puede deter- minar con rapidez mediante la aplicación de técnicas de ingeniería ge- nética (descritas en el capítulo 15) y con el uso de tecnología sofi sticada como la espectrometría de masas. Los investigadores utilizan estos datos de secuencias de aminoácidos para predecir los niveles de estructura su- periores de la proteína. Como se puede observar, las cadenas laterales interaccionan en formas relativamente predecibles, por ejemplo, a través de enlaces iónicos y de hidrógeno. Además, es más probable que regio- nes con ciertos tipos de cadenas laterales formen hélices-a o láminas plegadas-b. Los programas de computación hacen estas predicciones, pero a menudo son imprecisos debido a las muchas combinaciones po- sibles de patrones de plegamiento. Las computadoras son una parte esencial de otra estrategia. Una vez que se ha determinado la secuencia de aminoácidos de un polipéptido, los investigadores utilizan las computadoras para buscar en las bases de datos, polipéptidos de secuencias similares. Si ya se han determinado las conformaciones de cualquiera de estos polipéptidos o partes por difrac- ción de rayos X y otras técnicas, esta información se puede extrapolar para realizar correlaciones similares entre la secuencia de aminoácidos y la estructura 3-D de la proteína que se está investigando. Estas predic- ciones son más fi ables dado que se agrega más información cada día a las bases de datos. La conformación de las proteínas determina su función La estructura global de una proteína ayuda a determinar su actividad biológica. Una sola proteína puede tener más de una región estructural diferente, cada una de las cuales es llamada un dominio, con su propia función. Muchas proteínas son modulares, es decir, consisten en dos o más dominios globulares, que se conectan por las regiones menos com- pactas de la cadena polipeptídica. Cada dominio puede tener una función distinta. Por ejemplo, una proteína puede tener un dominio por el que se une a una membrana y otro que actúa como enzima. La actividad biológica de una proteína puede alterarse por un cambio en la secuencia de aminoácidos que da como resultado un cambio en su conformación. Por ejemplo, la enfer- medad genética conocida como anemia de células falciformes, se debe a una mutación que hace que el ácido glutámico de la posición 6 (el sexto aminoácido desde el extremo amino terminal) se sustituya por valina en la cadena beta de la hemoglobina. La sustitución del ácido glutámico (cuya cadena lateral tiene carga) por valina (con cadena lateral no polar) hace que la hemoglobina sea menos soluble y más propensa a formar estructuras cristaloides. Esta alteración de la hemoglobina afecta a los eritrocitos, que cambian a la forma de luna creciente u hoz que caracte- riza a la enfermedad (vea la fi gura 16-8). Los cambios en la estructura 3-D de una proteína pueden afectar su actividad biológica. Cuando una proteína se calienta, se somete a cambios signifi cativos de pH o trata con ciertas sustancias químicas, su estructura se desorganiza y los plegamientos de las cadenas peptídicas se deshacen Las proteínas con dos o más cadenas polipeptídicas presentan la estructura cuaternaria. Hemo Cadena alfa (α-globina) Cadena alfa (α-globina) Cadena beta (β-globina) Cadena beta (b-globina) (a) La hemoglobina, una proteína globular, consta de cuatro cadenas polipeptídicas, cada una de ellas unida a una molécula que contiene hierro, un hemo. (b) El colágeno, una proteína fibrosa, consiste de tres largas cadenas polipeptídicas de conformación helicoidal, que se pliegan entre sí formando una sola hebra de forma también helicoidal. FIGURA 3-22 Estructura cuaternaria de una proteína PUNTO CLAVE 03_Cap_03_SOLOMON.indd 6703_Cap_03_SOLOMON.indd 67 10/12/12 18:1710/12/12 18:17 Parte 1 La organización de la vida 3 La química de la vida: compuestos orgánicos 3.4 Proteínas La secuencia de aminoácidos de una proteína determina su conformación La conformación de las proteínas determina su función La conformación de una proteínas e estudia por diversos métodos
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