CLASIFICACION DE SERES VIVIENTES

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Tres Reinos: 
Sistema de Haeckel 
(1894)
Reino 
Protistas 
Reino AnimaliaClasificación 
tradicional Reino Plantae
Protistas atípicos
Protozoa
Protophyta
Reino Planta
Reino Animal
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Esquema de 
Margulis: dos 
dominios y 5 reinos 
(1988-1996)
Dominio 
Prokarya
Dominio 
Eukarya 
Reino Bacteria
Reino Protoctista
Reino Fungi
Reino Plantae
Reino Animalia
Cuatro 
Subdominios
(Mayr 1990)
Dominio 
Prokaryota
Subdominio Eubacteria
Subdominio Archaebacteria
Dominio 
Eukaryota
Subdominio Protista
Subdominio 
Metabionta 
Reino Metaphyta (Plants)
Reino Fungi
Reino AnimaliaEste archivo fue descargado de https://filadd.com
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Sistema de Copeland: cuatro 
Reinos (1956)
Reino Mychota
Reino Protoctista
Reino Plantae
Reino Animalia
Whittaker: Cinco 
Reinos (1969)
Reino Monera
Reino Protista
Reino Plantae
Reino Fungi
Reino Animalia
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Tres Dominios (Woese 1990) Dominio Bacteria
Dominio Archaea
Dominio Eucarya
Superreino Prokaryota 
Reinos Bacteria
Superreino Eukaryota
Reino Protozoa
Reino Animalia
Reino Fungi
Reino Plantae
Reino Chromista
Cavalier-Smith 1998
Suprareinos y Seis Reinos
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La línea verde indica origen bacteriano de los cloroplastos
La línea roja indica origen bacteriano de las mitocondrias
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BACTERIA ARCHEA EUKARYA
Células procariotas eucariotas
Núcleo con NO SI
Membranas 
lipídicas
enlazados por 
éster,
no ramificados
enlaces eter, 
ramificado
enlazados por 
éster,
no ramificados
organelas NO SI
ribosomas 70S 80S
DOMINIOS: Caracteres que los 
definen
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La taxonomía es la ciencia de la clasificación, agrupa y separa los 
organismos vivos de acuerdo a sus características fenotípicas o 
genéticas. Para propósitos de clasificación, los organismos usualmente 
son reconocidos en órdenes superiores, familias, géneros, especies y 
subespecies.
Es una ciencia ARTIFICIAL, influida por los avances en las 
técnicas.
SE DIVIDE 
1. CLASIFICACION
2. NOMENCLATURA
3. IDENTIFICACION
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“Es la ordenación de los microorganismos en grupos o taxones en 
función de semejanzas mutuas o de parentesco evolutivos”
El objetivo es el de ser ESTABLE, OBJETIVA Y PREDICTIVA
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“Es la asignación de un nombres específico a los grupos taxonómicos de 
acuerdo a criterios y normas preestablecidas y adminitidas 
internacionalmente”
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“Es la parte práctica de la taxonomía, dado que permite encuadrar un
determinado organismo en un grupo taxonómico previamente
establecido”
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Las distintas categorías taxonómicas se definen por las propiedades y 
características que poseen las bacterias que las integran.
Los datos reciben el nombre de caracteres taxonómicos. E incluyen 
caracteres fenotípicos, genéticos y quimiotaxonómicos.
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FENOTÍPICOS
• 1) MORFOLÓGICOS
• 2) BIOQUÍMICAS/FISIOLÓGICAS
• 3) SEROLÓGICAS
• 4) FAGOTIPIA
• 5) PRUEBAS DE INHIBICIÓN
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GENÉTICOS
• 1 ) ADN / ARN: contenido de G+C, hibridación ADN-
ADN, secuenciación del ARNr
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QUIMIOTAXONÓMICOS
• 1) MEMBRANA CITOPLASMÁTICA: ácidos grasos, tipos de 
lípidos polares, presencia de ácidos micólicos
• 2) PARED CELULAR: tipos de peptidoglucano, presencia de 
ácidos teicoicos
• 3) PROTEÍNAS: comparación perfil proteínas, secuencia de 
aminoácidos
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T
A
X
O
N
O
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Í
A
ENFOQUE
CLÁSICO
TAXONOMÍA
NUMÉRICA
ENFOQUE GENÉTICO O
MOLECULAR
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Usa las características bioquímicas, morfológicas y culturales, así como 
las susceptibilidad a los antibióticos y compuestos inorgánicos, para 
determinar el grado de similitud entre organismos.
Se calcula luego un coeficiente o porcentaje de similitud.
Se construye un dendrograma o matriz de similitudes entre los 
organismos.
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Estados 
Característicos Cepa A Cepa B Cepa C Cepa D
1 + + - 0
2 + + + +
3 + + + -
4 - + 0 0
5 + + + +
6 + + - +
7 + + - 0
8 0 - + +
9 + + + +
10 + + + -
11 + 0 - 0
12 + + + -
Ejemplo de codificación de datos
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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
1 100 50 48 56 84 49 39 51 52 51 53 48
2 50 100 50 85 51 53 43 51 93 49 48 94
3 48 50 100 52 50 34 32 86 52 93 89 50
4 56 85 52 100 57 54 39 58 93 54 52 89
5 84 51 50 57 100 51 41 52 53 52 56 59
6 49 53 34 54 51 100 89 80 55 82 87 53
7 39 43 41 39 41 89 100 29 43 29 39 44
8 51 51 85 58 52 80 29 100 80 88 78 51
9 52 93 52 93 53 55 43 80 100 51 50 89
10 51 49 93 54 52 82 82 29 88 100 81 49
11 53 48 89 52 56 87 39 78 50 81 100 48
12 48 94 50 89 59 53 44 51 89 49 48 100
Coeficiente %S dispuesto de manera arbitraria
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2
12 94
4 85 89
9 93 89 93
3 50 50 52 52
10 49 49 54 51 93
11 48 48 52 50 89 81
8 51 51 58 80 86 88 78
6 53 53 54 55 34 82 87 80
7 43 44 39 43 32 29 39 29 89
1 50 48 56 52 48 51 53 51 49 39
5 51 59 57 53 50 52 56 56 51 41 84
2 12 4 9 3 10 11 8 6 7 1
%S agrupados
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DENDROGRAMA
1
2
3
Escherichia coli
Citrobacter
C freundii
C diversus
GÉNERO Y ESPECIE
GRUPO
50 60 70 9080 100
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El significado ideal de la identificación y clasificación debe 
ser comparar la secuencia de cada secuencia de genes en una 
cepa dada, con la secuencia de genes para cada especie conocida. 
El método que se usa es la hibridización. 
Este método puede ser usado para medir el número de secuencias 
de DNA que dos organismos cualesquiera tienen en común y para 
estimar el porcentaje de divergencia dentro de las secuencias de DNA 
que están relacionadas pero no son idénticas.
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• BRINDA UN CONCEPTO MÁS UNIFICADO 
DE ESPECIE
• ES MÁS OBJETIVA Y ESTABLE
• SE PUEDEN ORGANIZAR ESQUEMAS DE 
IDENTIFICACIÓN FIDEDIGNOS
• INDICA CÓMO EVOLUCIONARON LOS 
MICROORGANISMOS Y CÓMO PUEDEN 
AGRUPARSE
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ESPECIE
Grupo taxonómico básico
Menos definido que para organismos superiores
Rasgos morfológicos no tan importantes
Puede ser considerada como una colección de cepas que
muestras muchos rasgos en común y difieren
considerablemente de otras cepas
Una CEPA de una especie es considerada como CEPA TIPO
(comparar)
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SUBESPECIE
Basada en variacionesfenotípicas y genotípicas
menores, pero constantes. Es la categoría más baja
aceptada oficialmente
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CATEGORÍAS 
INFRASUBESPECIE
Nombre preferido Sinónimo Cepas que tienen
biovar biotipo prop bioquímicas o fisiológicas 
especiales
serovar serotipo prop antigénicas distintivas
patovar patotipo prop patogénicas para ciertos 
animales 
fagovar fagotipo lisis por ciertos fagos
morfovar morfotipo rasgos morfológicos 
especiales
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TIPOS DE CLASIFICACIÓN
• 1) FENÉTICAS O FENOTÍPICAS
• 2) FILOGENÉTICAS O FILÉTICAS
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Se comparan macromoléculas que se comportan como 
“cronómetros evolutivos”. 
Sus característcias son:
1. distribución universal
2. realizar la misma función en todos los seres vivos
3. sus secuencias deben permitir la identificación de 
regiones de homología y heterogeneidad
4. la tasa de cambio de la secuencia de la 
macromolécula debe estar en correlación con la 
distancia evolutiva
EL USADO ES EL ARNr, Y DENTRO DE ELLOS EL 16S 
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A. TINCIÓN: Gram, AAR, Cápsula
B. MÉTODOS BIOQUÍMICOS: actividad enzimática, medios selectivos
C. MÉTODOS SEROLÓGICOS: aglutinación en porta, ELISA, IFI
D. TIPIFICACIÓN POR BACTERIÓFAGOS: altamente específicos (placa)
E. SECUECIACIÓN DE AMINOÁCIDOS
F. PERFIL DE ÁCIDOS GRASOS
G. COMPOSICIÓN DE BASES DEL DNA: % de G+C
H. HIBRIDIZACIÓN DEL DNA
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CULTIVO PURO
MORFOLOGÍA DE COLONIA Y GRAM
PROPIEDADES 
BIOQUÍMICAS
PROPIEDADES 
ANTIGÉNICAS
CARACTERÍSTICAS DE 
CRECIMIENTO
CARACTERÍSTICAS GENÉTICAS O MOLECULARES
PORCENTAJE DE G+C HIBRIDACION ESTABILIDAD TÉRMICA
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DIFICULTADES EN LA 
IDENTIFICACIÓN
• Asegurarse que se trabaja con un cultivo PURO
• Trabajar desde categorías mayores a menores
• APLICAR EL SENTIDO COMÚN EN CADA PASO
• Usar el menor número de pruebas
• Comparar el aislamiento con cepas tipo o de
referencia
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DIFICULTADES EN LA 
IDENTIFICACIÓN
CUANDO NO SE LOGRA IDENTIFICAR EL 
AISLAMIENTO:
• Controlar pureza
• Asegurarse que se han realizado las pruebas
apropiadas
• Controlar que los métodos sean confiables
• Que se han usado correctamente las distintas claves y
tablas
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CLASIFICACION DEL DOMINIO BACTERIA (Bergey 2001)
El Manual Bergey categoriza a las bacterias en taxones basados en la secuencia 
de ARNr
Por otra parte lista características identificatorias de las bacterias tales como: 
morfología celular, coloración de Gram, requerimientos de oxígeno
las bacterias del phylum Proteobacterias son Gram negativas
Alfa Proteobacterias: los integrantes de este sub-phylum crecen 
con niveles bajos de nutrientes (oligotróficos), algunos poseen 
prostecas (prolongaciones celulares) . Incluye a fijadores de 
nitrógeno, quimioautotrofos y quimioheterotrofos
Beta Proteobacterias: los integrantes de este sub-phylum habitan 
en el agua y suelo. Algunos son patógenos humanos, incluyen 
quimioautotrofos y quimioheterotrofos. Bordetella, Burkholderia, 
Neisseria
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Gama Proteobacterias: incluye los ordenes Pseudomonadales, 
Legionellales, Vibrionales, Enterobacteriales, Pasteurellales, 
Francisella
Delta Proteobacterias: incluye los géneros Myxococcus y 
Bdellovibrio, parásitos de otras bacterias y el género Desulfovibrio
Epsilon Proteobacterias: incluye los patógenos humanos 
Campylobacter y Helicobacter
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Bacterias Gram negativas No-proteobacterias
Las phyla de bacterias Gram negativas no relacionadas filogeneticamente a 
Proteobacteria se clasifican en varios phyla de Gram negativas no 
Proteobacterias
1. El phylum Cyanobacteria corresponde a los fotoautotrofos que utilizan la 
luz como fuente de energía y CO2 como fuente de carbono y producen 
O2 durante la fotosíntesis
2. Los quimioheterotrofos incluyen Chlamydia (phylum Planctomyces), 
Bacteroides (phylum Bacteroides), Fusobacterium (phylum 
Fusobacteria) y Treponema, Borrelia y Leptospira (phylum Spirochetes). 
Muchos de ellos patógenos humanos
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El Manual Bergey divide a las bacterias Gram Positivas de 
acuerdo a su contenido de G+C
1. Bacterias Gram Positivas de alto contenido de G+C (phylum Actinobacteria) 
incluye el importante género Mycobacterium y los géneros filamentosos 
Actinomyces y Streptomyces, formadores de conidiosporas. Los no 
formadores Nocardia y Frankia también se incluyen aquí. Corynebacterium, 
Propionibacterium
2. Bacterias Gram Positivas de bajo contenido de G+C (phylum Firmicutes) 
incluye a las bacterias del suelo, las lácticas y numerosos patógenos. Los 
órdenes Clostridiales (Clostridium), Bacillales (Bacillus) Lacobacilalles 
(Staphylococcus, Streptococcus, Listeria y Lactobacillus). También incluye a 
Micoplasmas (todavía clasificados como Gram negativos), pero como se 
tiñen débilmente por su falta de pared, se incluyen entre las bacterias Gram 
positivas de bajo contenido de G+C 
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Las bacterias fotosintetizadoras verdes (sulfúreas y no sulfúreas) y las púrpuras 
(sulfúreas y no sulfúreas) son fotoautotrofas gram negativas que usan energía 
luminosa y CO2 como fuente de carbono y no producen O2 (anoxigénicas). Se las 
clasifica por una parte dentro de dos sub-phyla diferentes de las Proteobacterias 
y por otra dentro de las no Proteobacterias
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“El estudio científico de los tipos y diversidad de 
organismos y de cualquiera y todas las relaciones 
entre ellos " (Simpson, 1961)
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REINOS
Animalia
• 1753 C. Linnaeus 2 Reinos
Plantae
Animalia
• 1800´s E. Haeckel 3 Reinos Plantae
Protista
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REINOS
Animalia
Plantae
• 1969 H.R. Whitaker 5 Reinos Protista
Fungi
Monera
Eukaryotes
• 1977 C. Woese 3 Reinos Archaebacteria
Eubacteria
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REINO Procaryotae
DIVISIÓN I: Gracilicutes
CLASE I: Scotobacteria
CLASE II: Anoxyphotobacteria
CLASE III: Oxyphotobacteria
DIVISIÓN II: Firmicutes
CLASE I: Firmibacteria
CLASE II: Thallobacteria
DIVISIÓN III: Tenericutes
CLASE I: Mollicutes
DIVISIÓN IV: Mendosicutes
CLASE I: Archaobacteria
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REINO REINO
Animalia Procaryotae
Phylum: Cordata Gracilicutes
Clase: Mammalia Scotobacteria
Orden: Primates Spirochaetales
Familia: Hominidae Spirochaetaceae
Género: Homo Treponema
Especie: sapiens pallidum
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Las Proteobacterias son uno de los principales grupos de bacterias. 
Patógenas y de vida libre, e incluyen muchas de las bacterias responsables
de la fijación del nitrógeno.Gram negativas, con una pared celular formada 
principalmente de lipopolisacáridos. Muchas se mueven utilizando flagelos. 
La mayoríade las proteobacterias son anaerobias, pero hay muchas
excepciones. La nutrición es usualmente heterótrofa,pero hay grupos que 
realizan fotosíntesis. Las proteobacterias se dividen en cinco grupos, usualmente 
considerados clases, según los estudios de las secuencias de ARNr. 
Estos grupos se denominan según las letras griegas de alpha a epsilon
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http://es.wikipedia.org/wiki/Bacteria
http://es.wikipedia.org/wiki/Bacteria_Gram_negativa
http://es.wikipedia.org/wiki/Lipopolisac%C3%A1rido
http://es.wikipedia.org/wiki/Flagelo
http://es.wikipedia.org/wiki/Anaerobia
http://es.wikipedia.org/wiki/Heter%C3%B3trofa
http://es.wikipedia.org/wiki/Fotos%C3%ADntesis
http://es.wikipedia.org/wiki/ARNr
Proteobacterias alpha
Las proteobacterias alpha abarcan la mayoría de los géneros fototrofos,
pero también varios géneros que metabolizan componentes C1, 
simbiontes de plantas (por ejemplo, rhizobia) y de animales y un 
grupo de patógenos peligrosos, Rickettsiaceae. Por otra parte, se 
piensa que los precursores de las mitocondrias de la células 
eucariotas se han originado en este grupo bacteriano.
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http://es.wikipedia.org/wiki/Clasificaci%C3%B3n_nutricional_b%C3%A1sica
http://es.wikipedia.org/wiki/Rhizobia
http://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Rickettsiaceae&action=edit
http://es.wikipedia.org/wiki/Mitocondria
Proteobacterias beta 
Las proteobacterias beta abarcan varios grupos de las bacterias aerobias 
o facultativas que son a menudo altamente versátiles en sus capacidades
de degradación, pero también contienen géneros quimiolitotróficos
y algunos fototrofos. Las Proteobacterias beta juegan un papel importante en la 
fijación de nitrógeno en varios tipos de plantas, oxidando amonio para producir
nitrito, un producto químico importante para la función de las plantas. 
Muchas de ellas se encuentran en muestras ambientales, tales como aguas residuales
o el suelo. Especies patógenas dentro de esta clase son Neisseriaceae
(que causa gonorrea y meningoencefalitis) y las especies del género Burkholderia. 
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http://es.wikipedia.org/wiki/Aut%C3%B3trofo
http://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Neisseriaceae&action=edit
http://es.wikipedia.org/wiki/Gonorrea
http://es.wikipedia.org/wiki/Meningoencefalitis
http://es.wikipedia.org/wiki/Burkholderia
Proteobacterias gamma 
Las proteobacterias gamma abarcan varios grupos de bacterias importantes para 
la ciencia y la medicina tales como Enterobacteriaceae, Vibrionaceae y 
Pseudomonadaceae.
Este grupo incluye varios patógenos importantes, como por ejemplo, Salmonella
(enteritis y fiebre tifoidea), Yersinia (peste), Vibrio (cólera), Pseudomonas aeruginosa
(infecciones del pulmón en pacientes hospitalizados o con fibrosis quística).
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http://es.wikipedia.org/wiki/Enterobacteriaceae
http://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Vibrionaceae&action=edit
http://es.wikipedia.org/wiki/Pseudomonadaceae
http://es.wikipedia.org/wiki/Salmonella
http://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Enteritis&action=edit
http://es.wikipedia.org/wiki/Fiebre_tifoidea
http://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Yersinia&action=edit
http://es.wikipedia.org/wiki/Peste
http://es.wikipedia.org/wiki/Vibrio
http://es.wikipedia.org/wiki/C%C3%B3lera
http://es.wikipedia.org/wiki/Pseudomonas_aeruginosa
http://es.wikipedia.org/wiki/Fibrosis_qu%C3%ADstica
Proteobacterias delta
Abarcan un grupo de géneros predominante aerobios, myxobacteria, que 
forman cuerpos fructíferos y un grupo de géneros estrictamente anaerobios, 
que contienen la mayor parte de las bacterias reductoras de sulfato y de las
bacterias reductoras de sulfuro junto con otras bacterias anaerobias con 
diferente fisiología.
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http://es.wikipedia.org/wiki/Myxobacteria
Proteobacterias epsilon 
Comprenden solamente unos pocos géneros, principalmente Wolinella, Helicobacter y
Campylobacter,que tienen forma helicoidal. La mayor parte de las especies conocidas 
habitan en el tracto digestivo de seres humanos y animales y proporcionan servicio como
simbiontes (Wolinella en el ganado vacuno) o son patógenos (Helicobacter en el 
estómago, Campylobacter en el duodeno). También se han recuperado numerosas 
secuencias ambientales de respiraderos fríos e hidrotermales.
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http://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Wolinella&action=edit
http://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Helicobacter&action=edit
http://es.wikipedia.org/wiki/Campylobacter
http://es.wikipedia.org/wiki/Simbionte
http://es.wikipedia.org/wiki/Respiradero_hidrotermal