RESPUESTAS A PREGUNTAS DE SEMINARIOS (30 de MARZO al 10 de ABRIL 2020)

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RESPUESTAS A PREGUNTAS DE SEMINARIOS (30 de MARZO al 10 de ABRIL 2020) 
 
PREGUNTA: Hola, mientras estudiaba me surgieron unas dudas respecto a la regulación 
transcripcional, capaz algunas son tontas pero no me terminó de quedar claro. 
Dado que los promotores son secuencias de ADN donde comienza la transcripción, los consideramos 
como secuencias de regulación? 
 
Sí, el promotor se considera como una secuencias de regulación en cis. 
Por ejemplo, en bacterias sabemos que en el promotor hay dos secuencias consenso a -10 y 
-35 (número de bases anteriores al inicio de la transcripción). Se vio que los genes con 
promotores que difieren de la secuencia consenso son transcriptos de una forma menos 
eficiente que aquellos genes cuyos promotores se asemejan más a las secuencias 
consensos. 
En eucariotas ocurre algo similar, es decir dentro de los promotores hay secuencias consenso 
que regulan la eficacia de la transcripción. El gen está regulado entonces por secuencias 
consenso en el promotor, y por otras secuencias, por ejemplo, secuencias enhancers , ambas 
secuencias serán reconocidas por proteínas que se unirán a estas secuencias regulando la 
expresión del gen. 
 
 
PREGUNTA: No entiendo por que los estimuladores o enhancers entran dentro de la clasificación de 
"secuencias de regulación en Cis" cuando en el libro dice que pueden actuar desde distintos 
cromosomas; eso no sería actuar en trans? 
Las secuencias enhancers son secuencias reguladoras en CIS únicamente. Pueden estar ubicados 
en 5’ (“río arriba”) como en 3’ (“río abajo”) del gen , pueden estar cerca del sitio de inicio de la 
transcripción como hasta 1Mpb aproximadamente y pueden estar en cualquier orientación. ​y 
además las secuencias enhancers siempre son secuencias reguladoras en cis ya que están 
presentes en la misma molécula de ADN que el gen que regulan. Estamos hablando de 
SECUENCIAS reguladoras enhancers mientras que los elementos reguladores en ​trans (ESTAMOS 
HABLANDO DE ELEMENTOS) SON ELEMENTOS DIFUSIBLES COMO LAS PROTEÍNAS QUE 
puede regular genes distantes a partir del gen por las que fueron transcritas. Pero siempre la 
secuencia reguladora enhancer está en cis respecto al gen que regula, luego este gen se transcribe 
en proteínas que pueden regular a su vez en trans otros genes distantes ubicados en otros 
cromosomas. Pero siempre las secuencias enhancers están en cis respecto al promotor del gen que 
regulan. 
 
 
PREGUNTA: Cómo es posible que la CTCF facilite la interacción entre estimuladores/promotores y 
TAD si todos ellos son secuencias de ADN y por ende ya estarían unidos por medio de enlaces 
fosfodiester?. 
 
La ​proteína CTCF se une a múltiples secuencias del ADN mediante el uso de varias combinaciones 
de sus dedos de zinc finger. CTCF se une a la secuencia de consenso CCGCGNGGNGGCAG en el 
ADN. Esta secuencia consenso está definida por 11 motivos de dedos de zinc finger en la estructura 
de la proteína CTCF. CTCF marca los límites de los dominios de asociación topológica. Es decir 
CTCF se une al ADN por sus motivos zinc finger, por otro lado las cohesinas se unen al ADN por sus 
dominios de unión y se forma la estructura que adjunto en el gráfico. 
 
Lee los distintos dominios de unión de las proteínas al ADN.. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
PREGUNTA: Hola, cuando se habla de la quinasa del TFIH, no entiendo a qué se refiere con dominio 
C-terminal y la secuencia consenso que éste tiene. 
 
El factor TFllH tiene varias subunidades con distintas funciones, Una de ellas tiene actividad 
de proteína quinasa es decir que fosforila. Fosforila determinadas secuencias repetidas en el 
dominio C terminal de la subunidad principal de la ARN pol ll, llamado dominio CTD, que 
consiste en repeticiones en tándem con una secuencia consenso , la fosforilación se produce 
en el residuo de serina en posición 5 de esta secuencia consenso, y esta fosforilación induce 
la liberación de la ARN pol ll del complejo de pre iniciación y comienza la transcripción.. 
 
PREGUNTA: Me está costando bastante entender la regulación del ciclo celular por proteínas 
quinasas y ciclinas.¿Es correcto decir que las células eucariotas tienen su ciclo celular regulado por 
proteínas quinasas o Cdk1 asociadas a ciclinas y que en conjunto forman al factor promotor de la 
maduración? 
 
Las ciclinas son una familia de ​proteínas​ involucradas en la regulación del ​ciclo celular​. 
Las ciclinas forman complejos con ​enzimas​ ​quinasas dependientes de ciclinas​ (Cdks) 
activando en estas últimas su función ​quinasa​. Las ciclinas reciben su nombre en vista 
de que sus concentraciones varían a lo largo del ciclo celular; cuando su concentración 
es baja la función de su correspondiente quinasa dependiente de ciclina es inhibida. 
Solo el complejo ciclina-CDK es activo, es decir tiene la capacidad de fosforilar 
determinadas proteínas. 
Las quinasas (o cinasas) dependientes de ciclinas (Cdk) son enzimas que fosforilan 
determinados residuos de aminoácidos, pero solamente estas enzimas están activas cuando 
están unidas a su respectiva ciclina. Las quinasas o CDK su concentración permanece 
constante a lo largo de las distintas etapas del ciclo celular. 
El factor promotor de la maduración o mitosis es un complejo ciclina/cdk que regula el paso 
de G2 a Mitosis (CDK1/B). Cada chekpoint o punto de control está regulado por complejos de 
heterodímericos cliclina/cdk diferentes. Ver grafico. El factor promotor de la maduración es el 
que controla el paso de G2 a Mitosis a través de la desaparición o rotura de la envoltura 
https://es.wikipedia.org/wiki/Prote%C3%ADnas
https://es.wikipedia.org/wiki/Ciclo_celular
https://es.wikipedia.org/wiki/Enzimas
https://es.wikipedia.org/wiki/Quinasas_dependientes_de_ciclinas
https://es.wikipedia.org/wiki/Quinasa
nuclear por fosforilación de las proteínas de la lámina por ejemplo. La alineación correcta de 
los cromosomas en el huso mitótico es otro punto de checkpoint, se degrada la ciclina B y se 
da paso a la anafase, por activación del complejo activador de la anafase (APC). 
 
 
 
 
 
 
 
PREGUNTA; Hola tengo una duda sobre la función de las polimerasas delta y epsilon (no tengo las 
letras griegas en el teléfono perdón). Estoy leyendo la 7ta edicion del Cooper y en el capítulo 7 
cuando habla de la eliminación y reemplazo de los iniciadores de ARN de la hebra tardía dice “los 
huecos resultantes son rellenados por la polimerasa delta” pero después hablando de las ADN 
polimerasas en eucariotas dice “las polimerasas delta y epsilon actúan como las principales 
polimerasas en la replicación que se ocuparían de la síntesis de las hebras conductora y tardía 
respectivamente”. no entendí si delta sintetiza en la hebra tardía, conductora o en ambas? 
 
En el libro está un poco confuso. Según la publicación ​“​Roles for DNA polymerase δ in initiating 
and terminating leading strand DNA replication”. ​Zhi-Xiong Zhou​ et al, ​Nature Communications 
10, Article number: 3992 (2019).  
  
La replicación del ADN nuclear eucariota se inicia cuando la ​ADN polimerasa α (Pol α) 
-primasa​ sintetiza cebadores cortos de ARN-ADN que posteriormente se extienden durante la 
síntesis de las dos cadenas de ADN (Fig. 1a) (Es decir que la DNA pol alpha-primasa sintetiza 
los cebadores cortos tanto de los fragmentos de okasaki como del origen de replicación). Los 
estudios de replicación de ADN, indican que​ DNA Pol δ​ conduce la mayoría de la síntesis 
discontinua de fragmentos de Okazaki de la cadena rezagada, mientras que ​DNA Pol ε​ logra la 
mayoría de la replicación de ADN de la cadena principal continua. Los fragmentos de RNA en 
la cadena rezagada son eliminados por una RNAsaH,y la síntesis de ADN es realizada por la 
DNA pol delta. 
 
La DNA pol epsilon también participa en la reparación del ADN por escisión de base y por 
escisión de nucleótidos 
 
Ver gräfico (abajo) 
Componentes de replisoma y división canónica del trabajo de la polimerasa. Rojo, verde y azul 
denotan las Polimerasas α, δ y ε, respectivamente, o los tractos nacientes de ADN que 
sintetizan. Las cadenas de ADN (barras de colores) y las proteínas no se muestran a escala. 
Otros componentes replisome se omiten por simplicidad. ​b Un modelo de iniciación de 
replicación. La r​eplicación se inicia con el cebado Pol α en ambas cadenas. En la ​cadena 
https://www.nature.com/articles/s41467-019-11995-z#auth-1
https://www.nature.com/ncomms
rezagada, el cebado se repite con Pol α pasando el extremo 3 'a Pol δ para la síntesis del 
fragmento Okazaki​. ​En la cadena principal, Pol α pasa el terminal 3 'a Pol δ, que luego atrapa 
el complejo de helicasa en retroceso y pasa el terminal 3' a Pol ε​. ​c Un modelo de ​terminación 
de replicación en el que Pol ε se desconecta del término 3 'y Pol δ asume la responsabilidad 
del resto de la síntesis de la cadena principal 
 
 
 
 
 
 
PREGUNTA; Una pregunta, con respecto a la ADN polimerasa alfa. ¿Que relación tiene con la 
primasa? ¿Ambas sintetizan el cebador? ¿Ó la primasa sintetiza el cebador, luego la elonga un poco 
la ADN polimerasa alfa y luego viene su respectiva ADNpol? 
 
La iniciación es por el ​complejo primasa-ADN Pol alpha, en forma conjunta, luego la síntesis 
continua con la DNA pol delta. ​MIRAR LA RESPUESTA DE LA PREGUNTA ANTERIOR 
 
PREGUNTA; Hola, una pregunta. Quería saber con respecto al tema de procesividad de las ADN 
polimerasa: ¿La proteína PCNA va a estar asociada a q tipos de adn pol? Yo escuche en un audio 
que las ADNpol Alfa y delta. En el libro dice delta y epsilon. Además​¿Cuál va ser el grado de 
procesividad de todas las ADNpol? En un cuadro dice que las de mayor procesividad son delta y 
épsilon pero en uno que encontré dice que delta solamente y que luego sigue épsilon y gama y al 
final beta y alfa. 
 
Las DNA polimerasas replicativas son: DNA polimerasa α. Procesividad baja. Tiene actividad 
de primasa. DNA polimerasa δ. Procesividad alta en presencia de PCNA. DNA polimerasa ε. 
Procesividad alta. No requiere PCNA. 
 
 
PREGUNTA​: No termino de entender los check points, quisiera saber si me podrían corregir en caso 
de que este equivocada... 
A lo largo del ciclo celular hay 3 check points: 
• Checkpoint G1: Se encuentra al final de la fase G1, controla el paso de G1 a S. Se evalúa si el ADN 
está dañado y que el tamaño celular sea el adecuado. 
• Checkpoint G2: Se encuentra al final de la fase G2, controla el paso de G2 a M. Previene la 
iniciación de la mitosis hasta que se haya completado la replicación del ADN. Además, detecta al 
ADN sin replicar o dañado. 
• Checkpoint M: Se encuentra en la mitad de la fase M. Evalúa que los cromosomas estén 
correctamente alineados y unidos a los husos mitóticos, una vez que esto se ha producido inicia la 
anafase y se completa la mitosis. 
¿¿¿¿Existe un check point S???? ​SI 
 
hay 4 checkpoint:G1/S; S/G2, G2/M y en Mitosis para salir de la mitosis y entrar en anafase. 
Ver gráfico (ABAJO y VER LA 4ta Pregunta) 
 
 
 
 
 
PREGUNTA​: La función de la CDK2 unida a la ciclina A es dar inicio a la replicación del ADN? 
cdk2/ciclina E se requiere para el paso de G1 a S y para el inicio de la síntesis de ADN. 
los complejos cdk2/ciclina A son activados más adelante en la fase S y se requieren para la 
progresión a través de la fase S y actúan también en la fase G2. 
 
PREGUNTA​: Factor promotor de la maduración y Factor promotor de la mitosis es lo mismo? 
SI 
PREGUNTA​: En caso de que el ADN este dañado en cualquier parte del ciclo, va actuar siempre la 
P53? 
 
La proteína p53 es un supresor tumoral que desempeña un papel importante en la interrupción 
de la división celular (mitosis) cuando ocurre un daño en el ADN. La proteína p53 detiene el 
ciclo celular en dos posibles puntos: antes de la replicación del ADN (entre las fases G1 y S) y 
antes de la división celular (entre las fases G2 y M). La interrupción del ciclo celular en estos 
puntos impide la división de células que contienen ADN dañado. 
 
 
 
 
 
 
 
 
PREGUNTA​: ¿Cuando hablamos de cancer que están causados por inhibiciones, alteraciones o 
mutaciones en mecanismos o proteínas de regulación del ciclo celular estos pueden ser tanto de 
aparición congénita, hereditaria o pueden surgir en cualquier estadio de la vida en una única célula 
del organismo por mutaciones causadas por agentes externos (radiacion, quimicos,etc), cierto? Es 
decir puede surgir de cualquiera de estas formas? 
Sí, exactamente 
 
PEGUNTA​: ¿Si el ciclo celular de una celula humana transcurre en 24hrs y la mutación de una 
celula (por errores en la replicacion, agentes mutagenos, cancerigenos, etc.) quiere decir que en un 
día un individuo cualquiera podria desarrollar al menos una celula cancerigena en cualquier momento 
de su vida? 
Hay dos elementos que debés considerar para reformular tu pregunta: 1. No todas las células 
humanas se dividen cada 24h. La gran mayoría de las células de un individuo adulto está en 
estado quiescente. 2- ​Una​ mutación no es suficiente para transformar a una célula en célula 
tumoral. 
 
PREGUNTA​: Si posible la incubación de células cancerigenas in vitro, ¿es factible inocular a un raton 
de laboratorio con estas Celulas de modo que desarrollara la enfermedad o la celula cancerigena 
seria degradada por los anticuerpos? 
En el contexto de la investigación básica de cáncer, las cepas de ratones que se utilizan para 
inocular células cancerosas y evaluar el desarrollo tumoral, son cepas inmunodeficientes (por 
ejemplo, la cepa de ratones SCID), que evitan así que las células tumorales inyectadas sean 
degradadas. 
 
PREGUNTA​: ¿Hay que estudiar los mecanismos de transcripción en Procariotas? 
La materia apunta a comprender los mecanismos de regulación eucariotas 
 
PREGUNTA​:¿Qué propiedades intrínsecas de los grupos fosfato permiten la activaciòn e inactivaciòn 
de proteínas? 
Los grupos fosfato poseen cargas eléctricas netas negativas. Su agregado o remoción de una 
proteína afectará la relación de atracción y repulsión con otros grupos químicos polares o con 
carga que posea esa proteína, lo que conducirá a modificaciones en la forma tridimensional 
que adoptará el péptido. Es decir, la forma tridimensional final de la proteína será diferente 
con o sin el agregado del grupo fosfato. A su vez, las modificaciones en la estructura 
tridimensional pueden influir en la funcionalidad de esa proteína. 
 
PREGUNTA​: ¿Cuáles son los mecanismos por los cuales los micro ARN regulan la transcripción 
génica? 
Los microARNs actúan fundamentalmente como reguladores post-transcripcionales. Cuando 
se unen, en conjunto con el complejo enzimático efector a un ARNm, detienen su traducción y 
favorecen su degradación. Es decir, suelen tener un efecto negativo sobre la expresión 
génica. 
 
PREGUNTA​: ¿Qué significa que la regulación de la expresión génica tenga un efecto de corto o de 
largo plazo? 
Los mecanismos de regulación de la expresión génica pueden clasificarse por la temporalidad 
de sus efectos. Es decir, por el tiempo necesario entre la actuación del mecanismo de 
regulación y la aparición de efectos biológicos que son consecuencia de ese mecanismo. Así, 
los mecanismos que regulan el grado de condensación de la cromatina suelen ser tener 
efectos en el largo plazo (rango de días u horas) porque sus efectos sólo serán ostensibles 
luego de que la transcripción y traducción se produzcan. En cambio, las modificaciones 
postraduccionales, por ejemplo, mediadas por fosforilaciones de proteínas, pueden generar 
cambios en las células en el rango de los segundos y minutos,y por ellos son de corto plazo. 
 
PREGUNTA​: En cuanto la quinasa TFHI. ¿Qué significa “dominio C- terminal”? ¿A qué se refiere con 
“secuencia consenso”? 
Hay una confusión en la pregunta: Probablemente te refieras al dominio C-terminal de la 
enzima ARN polimerasa II, cuya actividad es regulada por la fosforilación efectuada por la 
kinasa TFIIH, que a su vez es un factor de transcripción basal. El dominio C-terminal hace 
referencia a un sector de una proteína ubicado en el extremo carboxi-terminal. En el caso de la 
ARN polimerasa II, que está compuesta por 12 subunidades peptídicas, ese dominio 
C-terminal es el la subunidad 1, y es importante por los efectos que tiene su fosforilación: 
permite que la ARN polimerasa se vuelva activa. Las fosforilaciones ocurren sobre residuos 
de serina, pero sólo si están rodeados de un “contexto” particular de aminoácidos. A este 
“contexto” aminoacídico en el que está el aminoácido que será fosforilado se lo denomina 
secuencia consenso. Puede pensarse, entonces, como la secuencia que será reconocida por 
la kinasa como sustrato de la reacción de fosforilación. 
 
PREGUNTA​: Hola! Queria saber si los silencers (o aisladores) son lo mismo que los elementos 
barrera. Por otro lado no entiendo qué son las secuencias reguladoras de efecto negativo, en el 
Cooper me cuesta encontrar la información sobre esto último. Gracias! 
Los silenciadores (silencers) NO son lo mismo que los aisladores. Los silenciadores son un 
ejemplo de secuencias regulatorias de efecto negativo, ya que la unión de factores de 
transcripción específicos sobre los mismos tienden a compactar localmente la cromatina y/o 
disminuir la frecuencia de inicio de transcripción del gen que está siendo regulado. Los 
aisladores, por otra parte, son secuencias que tienden a restringir espacialmente el efecto de 
otras regiones regulatorias. 
 
PREGUNTA: Hola buenos días, tenía una consulta acerca del seminario dos. Estoy leyendo del 
Copper y aparece medio confuso el tema de la anafase y las cinasas Aurora y tipo Polo. En un primer 
momento dice que son degradadas por la APC/C al comienzo de la anafase , pero una página 
después dice que estas quinasas son muy importantes para que se generé la citocinesis que 
comienza recién en la anafase tardía. No entiendo cual sería el orden de los sucesos, ¿Me lo podrían 
aclarar? Muchas gracias 
Al inicio de la profase la maduración del centrosoma, y su separación, el ensamblaje del huso 
están producidos por las quinasas aurora A y tipo Polo situadas en los centrosomas. 
En el punto de control del ensamblaje se chequea el alineamiento de los cromosomas en el 
huso, si esta todo OK, se activa el complejo APC/C ubiquitina ligasa por fosforilación de 
cdk/ciclina B, degradándose la ciclina B. En la anafase tardía las quinasas aurora y tipo Polo 
permanecen activas ya que participan en la división del citoplasma (citocinesis). 
Luego APC/C aún activo degrada las quinasas aurora y tipo polo permitiendo que la célula 
pase de la mitosis a la interfase. .