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Introducción Las células son las unidades funcionales de cualquier organismo vivo. Las instrucciones necesarias para dirigir sus actividades están contenidas en los cromosomas, que en el caso de las eucariotas se localizan en el núcleo celular y son conocidas en su conjunto como información gené- tica. Ácidos nucleicos Los ácidos nucleicos constituyen el material genético de los organismos y son necesarios para el almacenamiento y la expresión de la información genética. Existen dos tipos de ácidos nucleicos química y estructuralmente distintos: el ácido desoxirribonucleico (ADN) y el ácido ribonucleico (ARN); ambos se encuentran en todas las células procario- tas, eucariotas y virus. El ADN funciona como el almacén de la información genética y se localiza en los cromo- somas del núcleo, las mitocondrias y los cloroplastos de las células eucariotas. En las células procariotas el ADN se encuentra en su único cromosoma y, de manera extracro- mosómica, en forma de plásmidos. El ARN interviene en la transferencia de la información contenida en el ADN hacia los compartimientos celulares. Se encuentra en el núcleo, el citoplasma, la matriz mitocondrial y el estroma de cloro- plastos de cé lulas eucariotas y en el citosol de células proca- riotas. Composición de los ácidos nucleicos La unidad básica de los ácidos nucleicos es el nucleótido, una molécula orgánica compuesta por tres componentes: 1. Base nitrogenada, una purina o pirimidina. 2. Pentosa, una ribosa o desoxirribosa según el ácido nucleico. 3. Grupo fosfato, causante de las cargas negativas de los ácidos nucleicos y que le brinda características ácidas (fi gura 3-1). Las bases nitrogenadas son moléculas formadas de átomos de carbono y nitrógeno que crean anillos heterocí- clicos. Se conocen dos tipos de bases nitrogenadas: las puri- nas y las pirimidinas. Las purinas se componen de dos anillos condensados, mientras que las pirimidinas están formadas por un solo anillo. Los átomos de carbono y nitró- geno de los anillos se identifi can mediante números natura- les: del 1 al 6 para las pirimidinas y del 1 al 9 para las purinas (fi gura 3-2). Las purinas se sintetizan de novo en el hígado como mononucleótidos unidos con una molécula de ribosa 5-fosfato; las pirimidinas lo hacen como bases libres y des- pués se unen a la ribosa 5-fosfato. Es importante mencionar que el recambio de ácidos nucleicos da lugar a la liberación de bases libres, tanto de purinas como pirimidinas; estas bases se reciclan y se unen a una pentosa y un grupo fosfato para generar de nuevo el nucleótido. Las purinas características de los ácidos nucleicos son adenina (A) y guanina (G), ambas presentes en los nucleóti- dos del ADN y del ARN. Las pirimidinas características de los ácidos nucleicos son la citosina (C), la timina (T) y el uracilo (U). La C está presente en los nucleótidos que com- ponen tanto al ADN como al ARN, mientras que la T sólo forma los nucleótidos que componen al ADN y el U, única- mente los nucleótidos que componen al ARN. La pentosa que compone el nucleótido es la D-ribosa para el ARN y la D-desoxirribosa en el caso del ADN. Los nucleótidos que contienen ribosa se denominan ribonu- cleótidos, mientras que los que contienen desoxirribosa, desoxirribonucleótidos. Los carbonos de la pentosa se iden- tifi can en los nucleótidos mediante números del 1 al 5, con una comilla, y se denominan primos. La diferencia entre la ribosa y la desoxirribosa es que la primera posee un grupo OH en el carbono dos, mientras que la segunda carece de Ácidos nucleicos dicho grupo funcional y sólo cuenta con un hidrógeno (fi gura 3-3). Nucleósidos La unión de una base nitrogenada y la pentosa produce un nucleósido, mediante un enlace covalente denominado N-glucosídico que se forma entre el C-1’ de la pentosa y el N-1 de las pirimidinas o bien el N-9 de las purinas (fi gura 3-4). Si la base nitrogenada se une a una ribosa da lugar a los ribonucleósidos, y si, por el contrario, lo hace a una desoxi- rribosa genera los desoxirribonucleósidos. Nucleótidos La unión de un grupo fosfato a un nucleósido da lugar a una molécula de nucleósido monofosfato o nucleótido, como por ejemplo la adenosina monofosfato (AMP). Si se agrega un segundo o un tercer fosfato al nucleósido monofosfato se obtiene un nucleósido difosfato (como el ADP) o bien trifosfato (como el ATP). Los nucleósidos, en su forma de monofosfato, son los componentes de los ácidos nucleicos; aunque cuando se encuentran libres lo están en su forma trifosfatada. El primer fosfato se une al nucleósido median- te un enlace éster con el OH del carbono 5’ de la pentosa. El o polinucleótidos Los nucleótidos se unen mediante enlaces fosfodiéster para dar lugar a cadenas de ácidos nucleicos o polinucleótidos. El enlace fosfodiéster tiene lugar entre el C-5’-fosfato de un nucleótido y el C-3’-hidroxilo del siguiente nucleótido. La unión sucesiva de nucleótidos mediante enlace 3,5-fosfo- diéster genera un polinucleótido polarizado; es decir, con extremos diferentes. Por un lado de la cadena se encuentra un extremo 5’-fosfato y, por el otro, un extremo 3’-hidroxilo (fi gura 3-5). Si la cadena es de ribonucleótidos, se genera un polirribonucleótido o cadena de ARN, mientras que si la cadena se forma con desoxirribonucleótidos se origina un polidesoxirribonucleótido o cadena de ADN. Los nucleótidos que constituyen las cadenas de ADN contienen las bases A, G, T y C; mientras que los nucleóti- dos que forman las cadenas de ARN están constituidos por las bases nitrogenadas A, G, C y U. Por consenso universal, la secuencia de nucleótidos en una cadena de polinucleóti- dos se escribe en dirección 5’ → 3’, y el orden exacto de nucleótidos o secuencia de la cadena se considera la estruc- NH2 CH2 N HHH OO OP O O 5 5 4 4 3 2 23 1 1 6 H OH H N O Adenina Guanina Citosina Timina Uracilo N 6 5 41 2 3 7 8 9 N N H N NH2 NH2 NH2 CH3 HN N 6 6 3 3 2 3 1 5 5 5 5 4 4 4 1 41 2 2 2 6 61 3 7 8 9 N N N N N H O O O OH N N OH H O H N OHCH 2 Ribosa Desoxirribosa HHH O 5´ 4´ 2´3´ 1´ H OH OH OH OHCH 2 HHH O 5´ 4´ 2´3´ 1´ H OH H OH Figura Estructura hemiacetal de la ribosa y desoxirribosa. segundo y el tercer fosfatos se conectan con el nucleótido mediante un enlace fosfoanhídrido que requiere un gasto de energía para su formación. Químicamente, los nucleóti- dos pueden defi nirse como ésteres monofosfato, difosfato o trifosfato de nucleósidos. Los nucleótidos son moléculas ácidas, ya que el grupo fosfato se ioniza en medio acuoso. (Para la nomenclatura completa de las moléculas nucleotí- dicas véase el cuadro 3-1.) Cadenas de ácidos nucleicos Figura Bases nitrogenadas. Grupo fosfato + Pentosa + Base nitrogenada Figura Estructura de los nucleótidos. componen los nucleótidos, y si se modifi ca alguna de estas bases o su orden se alterará la información. Estructura secundaria del ADN En células eucariotas el ADN se encuentra como una cade- na doble de polidesoxirribonucleótidos (double strand DNA, dsADN). Las dos cadenas del ADN giran alrededor de un eje de simetría imaginario y forman una estructura helicoidal, de aquí su nombre de “doble hélice del ADN” descrita por Watson y Crick en 1953. En la hélice del ADN, la columna hidrof ílica de desoxirribosa-fosfato de cada cadena está en el exterior de la molécula, mientras que las bases nitrogenadas hidrófobas se orientan hacia el interior. La relación espacial que se genera por el giro entre las dos cadenas de la hélice crea un surco mayor (ancho) y uno menor (estrecho) (fi gura 3-7). La doble cadena del ADN tiene tres características principales: • Es antiparalela. • Es complementaria. • Forma un giro helicoidal dextrógiro o levógiro. La asociación entre las dos cadenas es antiparalela; es decir, el extremo 5´ de una se asocia con el extremo 3’ de la otra. Las dos cadenas son complementarias; esto es, las bases nitrogenadas de una de lascadenas del ADN se unen mediante puentes de hidrógeno a las bases nitrogenadas de CH2 HHH O 5´ 4´ 2´3´ 1´ H OH H N CH2 HHH O 5´ 4´ 2´3´ 1´ H OH H NH2 N 4 3 2 5 1 6 O Pentosa + Base nitrogenada Pentosa + Base nitrogenada N 6 5 41 2 3 7 8 9 N N N NH2 Figura Estructura de los nucleósidos. tura primaria de los ácidos nucleicos. El enlace fosfodiéster entre nucleótidos puede escindirse por las nucleasas: DNa- sas para el ADN y RNasas para el ARN. Estructura del ADN Estructura primaria del ADN Corresponde a la secuencia de nucleótidos del polinucleóti- do linearizado (fi gura 3-6). La información genética está contenida en el orden exacto de las bases nitrogenadas que Cuadro Nomenclatura de nucleótidos. Base Nucleósido Base + ribosa Nucleótido Base + ribosa 1 grupo fosfato 2 grupos fosfato 3 grupos fosfato Adenina Adenosina Ácido adenílico Adenosina difosfato (ADP) Adenosina trifosfato (ATP) Adenosina monofosfato (AMP) Guanina Guanosina Ácido guanílico Guanosina difosfato (GDP) Guanosina trifosfato (GTP) Guanosina monofosfato (GMP) Citosina Citidina Ácido citidílico Citidina bifosfato (CDP) Citidina trifosfato (CTP) Citidina monofosfato (CMP) Uracilo Uridina Ácido uridílico Uridina difosfato (CDP) Uridina trifosfato (UTP) Uridina monofosfato (UMP) Base Desoxinucleósido Base + desoxirribosa Nucleótido Base + desoxirribosa 1 grupo fosfato 2 grupos fosfato 3 grupos fosfato Adenina Desoxiadenosina Ácido desoxiadenílico Desoxiadenosina difosfato (ADP) Desoxiadenosina trifosfato (ATP) Desoxiadenosina monofosfato (AMP) Guanina Desoxiguanosina Ácido desoxiguanílico Desoxiguanosina difosfato (GDP) Desoxiguanosina trifosfato (GTP) Desoxiguanosina monofosfato (GMP) Citosina Desoxicitidina Ácido desoxicitidílico Desoxicitidina difosfato (CDP) Desoxicitidina trifosfato (CTP) Desoxicitidina monofosfato (CMP) Uracilo Desoxiuridina Ácido desoxiuridílico Desoxiuridina difosfato (UDP) Desoxiuridina trifosfato (UTP) Desoxiuridina monofosfato (UMP) la otra cadena, de manera que A siempre se une a T, y G a C. Por lo tanto, la secuencia de nucleótidos de una cadena defi ne y complementa la secuencia de nucleótidos en la otra. Así, una cadena de la doble hélice del ADN siempre es el complemento de la otra. Los pares de bases se mantienen unidos mediante dos enlaces de hidrógeno entre A y T, y tres enlaces de hidrógeno entre G y C (fi gura 3-8). El apa- reamiento específi co de bases entre las cadenas de ADN sustenta las llamadas reglas de Chargaff : en cualquier muestra de ADN de cadena doble, la cantidad de A es igual a la cantidad de T, la cantidad de G es igual a la de C, y la cantidad de purinas es igual a la de pirimidinas. CH2 Extremo 5´ HHH O O O OO 5 4 23 1 H P O H C A T G CH2 HHH O 5 4 23 1 H O H O OO P CH2 HH HO H O 5 4 23 1 H O OO P CH2 HHH O 5 4 23 1 H O OO P Extremo 3´ OH H Figura Formación de un polinucleótido o cadena de ADN. Figura Estructura primaria del ADN. Variantes de la doble cadena de ADN Se han descrito tres formas estructurales principales del ADN: la forma B, descrita por Watson y Crick, la forma A y la forma Z. La forma B es la que adopta el ADN en condicio- nes fi siológicas, por lo que es la estructura predominante en el ADN cromosómico. La forma A se produce in vitro con la deshidratación moderada de la forma B. Es probable que la conformación de los híbridos ADN-ARN y del ARN de doble cadena se asemeje a la forma A. La forma Z del ADN es característica de regiones donde se encuentra una secuencia de purinas y pirimidinas alternadas (por ejemplo, zonas de repetición de GC). La función biológica del ADN-Z es poco comprendida, pero puede estar relacionada con la regulación de la expresión génica. Las características detalladas de cada una de las variantes se describen en el cuadro 3-2. C C A A T T T G G Figura Doble hélice del ADN. ADN circular El ADN mitocondrial y el de células procariotas se encuen- tra en forma de molécula circular, sin extremos, donde no hay interrupción de los enlaces fosfodiéster. Es posible encontrar al ADN circular como una estructura relajada (fi gura 3-9A) o como una estructura superenrollada y más compacta, donde la hélice del ADN (ya enrollada) gira sobre sí misma (superenrollada) y genera una superhélice (fi gura 3-9B). El superenrollamiento se produce debido a la acción Figura Estructura del ADN. de las enzimas topoisomerasas, que mediante el corte tran- sitorio de una o ambas hebras introducen un aumento o una disminución (superenrollamiento positivo o negativo, respectivamente) en el número de vueltas de hélice. El ADN circular superenrollado permite la compactación del Esqueleto de fosfato- pentosa Surco menor Surco mayor Par de bases 5´ 3´ 3´ 5´ T = A T = A T = A C = G C = G C = G A = T A = T G = C G = C CH2 Extremo 5´ Extremo 5´ Extremo 3´ HHH O O O OO 5´ 4´ 2´3´ 1´ 5´ 4´ 2´3´ 1´ 5´ 4´ 2´3´ 1´ 5´ 4´ 2´3´ 1´ 5´ 4´ 2´3´ 1´ 5´ 4´ 2´3´ 1´ 5´ 4´ 2´3´ 1´ H P H C A T G O O O CH2 HHH O H H O CH2 HHH O H H CH2 HHH O H OO P O OO P O OO P HOH CH2 HHH O O O OO H P H C A T G O O O CH2 HHH O H H O CH2 HHH O H H CH2 HHH O H OO P O OO P O OO P HOH Cuadro Características de los tipos de ADN según su estructura. Características Tipo estructural del ADN ADN A (deshidratada) ADN B (Watson-Crick) ADN Z (Rich-Dickerson) Sentido de giro de la hélice Dextrógiro Dextrógiro Levógiro Diámetro de la hélice 2.55 nm (25.5 A) 2.37 nm (23.7 A) 1.84 nm (1.84 A) Distancia entre pares de bases 0.23 nm (2.3 A) 0.34 nm (3.4 A) 0.38 nm (3.8 A) Pares de bases por vuelta 11 10.4 12 Inclinación del plano de los pares de bases 19° (gran inclinación) 1.2° (casi perpendicular al eje de la hélice) 9° (ligera inclinación) Surco mayor Estrecho, profundo Ancho, profundidad media Plano, sin profundidad Surco menor Amplio, no profundo Estrecho, profundidad media Estrecho, profundo Tipos de estructura secundaria de ADN. La molécula de ADN toma una estructura diferente según el microambiente en el que se encuentre, con ello el número de bases por giro, la inclinación y el giro de la molécula varía; estas características infl uyen en su disponibilidad como fuente de información genética de las histonas puede unirse de manera reversible a grupos acetilo, metilo o fosfato, lo que se conoce como modifi ca- ciones epigenéticas; la adición de estos grupos modifi ca la unión de las histonas al ADN y, por tanto, regula la disponi- bilidad de la información génica. Solenoide Los nucleosomas se compactan para formar un polinucleo- soma de seis unidades mediante interacciones entre las H1 de cada nucleosoma, lo que genera una estructura más compacta. Esta estructura recibe el nombre de solenoide y forma una hebra de 30 nm, conocida como cromatina, en este nivel el ADN está compactado unas 100 veces. La cro- matina puede encontrarse activa de forma transcripcional, por lo que se descompacta y entonces recibe el nombre de eucromatina. La cromatina inactiva se encuentra en su for- ma compacta y se la conoce como heterocromatina. Asas cromatínicas La fi bra de 30 nm se pliega y condensa aún más, formando estructuras de asas amplias superenrolladas, las cuales se anclan sobre proteínas de andamiaje y dan lugar una hebra de 300 nm de grosor. Cromosoma condensado Las asas cromatínicas se compactan y forman un cromoso- ma condensado de 700 nm de espesor visible durante la interfase. Cromosomas mitóticos Las cromátides hermanas visibles en la mitosis representan la última etapa de la organización del ADN y llegan a medir 1 400 nm de grosor. Los niveles de empaquetamiento del ADN se presentan esquematizados en la fi gura 3-10B. Desnaturalización y renaturalización del ADN La desnaturalización es la pérdida de la estructura helicoi- dal (estructura secundaria) característica de la molécula de ADN. El proceso de desnaturalizaciónocurre por la rotura de los puentes de hidrógeno entre las bases nitrogenadas, lo que ocasiona la separación de las dos cadenas antiparalelas sin que se altere la estructura primaria, ya que los enlaces fosfodiéster no resultan afectados. La desnaturalización puede ocurrir por exposición de los ácidos nucleicos a agentes químicos o f ísicos, cambios de pH y enzimas. Los agentes desnaturalizantes, como la urea, la forma- mida y el formaldehído, son altamente polares, con grupos amino y carbonilo que compiten con los grupos amino y carbonilo de las bases nitrogenadas en la formación de Figura Moléculas de ADN circular. ADN para que ocupe menor espacio en la células; también permite que posiciones lejanas en la secuencia se aproxi- men, y además regula la accesibilidad a la información genética y la expresión génica, al mantenerse inaccesible para los factores de transcripción. Niveles de empaquetamiento del ADN Debido a la longitud del ADN genómico en las células euca- riotas (alrededor de 2 metros/célula) es necesaria su compac- tación, de manera que permita ocupar menos espacio y quepa dentro del núcleo de la célula. El ADN se asocia con nucleoproteínas (histonas y no-histonas) para formar la cro- matina y dar origen a los cromosomas; por ello, en el empa- quetamiento del ADN se distinguen diferentes niveles de organización, que se describen a continuación. Nucleosoma Las histonas son proteínas con carga positiva a pH fi siológi- co, debido a su alto contenido en aminoácidos básicos, como la lisina y la arginina. Esta propiedad les permite aso- ciarse a la molécula de ADN de carga negativa (conferida por los grupos fosfato). Existen cinco tipos de histonas: H1, H2A, H2B, H3 y H4. Dos moléculas de histona H2A, H2B, H3 y H4 se asocian para formar un octámero de histonas. Un segmento de ADN de doble cadena de aproximadamen- te 146 pb se enrolla dando 1.6 vueltas al octámero para for- mar una estructura llamada nucleosoma. Los diferentes fragmentos de ADN presentes en el núcleo se asocian a diversos octámeros y forman una cadena de nucleosomas conocida como “cuentas de rosario” o “cuentas de collar” por su semejanza con estas estructuras al observarse en el microscopio electrónico. Entre cada nucleosoma queda un segmento de ADN de aproximadamente 55 pb denominado ADN enlace o linker (fi gura 3-10A). La función del nucleo- soma es condensar el ADN en una fi bra de 11 nm de ancho que se asemeja al mencionado collar de perlas, donde cada nucleosoma sería una perla y el ADN de enlace, el cordón con el cual están unidas estas perlas. El ADN linker se aso- cia, entonces, con otra histona denominada H1 y ayuda al empaquetamiento del ADN, lo que facilita la formación de otra estructura, llamada solenoide, que se describirá con detalle en la siguiente sección. El extremo aminoterminal A) B) puentes de hidrógeno y dan lugar a la separación de las hebras. También un pH extremadamente alcalino o ácido puede desnaturalizar el ADN; sin embargo, este tratamien- to puede dar lugar a la rotura de enlaces fosfodiéster, y por lo tanto, a la pérdida de la estructura primaria. La tempera- tura es el agente desnaturalizante más representativo: el calentamiento gradual del ADN hasta llegar a 100°C debili- ta las fuerzas estabilizadoras de la doble hélice, de forma que las dos hebras se desenrollan hasta su separación total. La temperatura de fusión (Tm) se defi ne como la tempera- tura a la que se ha desnaturalizado el 50% de las moléculas de ADN de la muestra que se está calentando. La Tm repre- senta el punto en que la energía aplicada es sufi ciente para romper la mitad de los puentes de hidrógeno que mantie- nen unidas las dos cadenas de la molécula de ADN. Una muestra de ADN con alto contenido de G y C tiene una mayor Tm en comparación con una con alto contenido de A y T. Esto se debe a que G y C están unidas con tres puentes de hidrógeno, a diferencia de A y T, que lo están por dos puentes de hidrógeno, por lo que para disociarlas se requie- re una temperatura mayor. La pérdida de la estructura heli- coidal del ADN puede vigilarse con la medición de su absorbancia a 260 nm, ya que el ADN de cadena sencilla tiene una absorbancia relativa mayor que el ADN de cadena doble en la misma longitud de onda. Las topoisomerasas, las girasas y las helicasas son enzi- mas que pueden desenrollar (desnaturalizar) el ADN. Las topoisomerasas cortan una o ambas hebras del ADN, lo que provoca la relajación del superenrollamiento. Las girasas actúan desenrollando el ADN circular presente en las bac- terias, y las helicasas se unen al ADN cerca de la horquilla de replicación, rompen los puentes de hidrógeno y catali- zan la separación de las hebras mediante la energía liberada por hidrólisis de ATP. El ADN desnaturalizado puede renaturalizarse si se retira gradualmente el agente desnaturalizante. Por ejem- plo, si una solución de ADN desnaturalizada por calenta- miento se enfría lentamente, las dos cadenas se vuelven a asociar por complementariedad de sus bases. ARN Es el ácido nucleico más abundante en la célula eucariota, donde suele ser 10 veces más abundante que el ADN. Solenoide Fibra de 30 nm Nucleosoma Histona H1 Hebra de 10 nm Doble hélice de ADN H1 ADN enlace ADN Octámero de histonas Nucleosoma Asas cromatínicas 300 nm Cromosoma condensado (700 nm) Cromosoma en metafase H2B H3 H4 H2A Figura . Niveles de empaquetamiento del ADN. 2. Contiene uracilo en lugar de timina. 3. La pentosa que constituye a sus nucleótidos es la ribosa, en lugar de la 2-desoxirribosa del ADN (la presencia del grupo hidroxilo en el C2´ de la ribosa provoca que el ARN sea una molécula químicamente inestable). Estructura primaria del ARN Al igual que en el ADN la estructura primaria del ARN está determinada por secuencia lineal de sus ribonucleótidos, que se escriben siempre en dirección 5’-3’ (fi gura 3-11A). Estructura secundaria del ARN La estructura secundaria está dada por el apareamiento de secuencias complementarias en la misma cadena de ARN (asociación intracatenaria parcial) o por asociaciones inter- catenarias, en el caso de los ARN de doble cadena de ciertos virus. La complementariedad ocasional de bases en el ARN da origen a las estructuras de pasador (hairpin), forma- ciones típicas, en las cuales parte de la cadena de ARN es complementaria y origina puentes de hidrógeno entre ésta y la parte no complementaria da origen a un loop o asa de bases que no se unen como se aprecia en la fi gura 3-11B. Estructura terciaria del ARN La estructura terciaria del ARN no siempre se forma, sólo surge cuando las condiciones celulares propician la interac- ción entre bases nitrogenadas de diferentes regiones de una misma molécula de ARN. Los ARN de transferencia (ARNt) forman una estructura terciaria característica: en disolu- ción están plegados en forma de “L” compacta estabilizada por apareamientos de bases convencionales y por interac- ciones entre las bases de más de dos nucleótidos, como los tripletes de bases (véase el capítulo 6). Las bases nitrogena- das pueden interactuar a través de los átomos de hidrógeno para unirse al esqueleto fosfodiéster de la cadena de ARN, o bien a través del OH del carbono 2’ de la ribosa, que actúa como un importante dador y aceptor de hidrógenos. Tipos de ARN Aunque químicamente son iguales, los ARN según la fun- ción que desempeñen en la célula se agrupan en: ARN heterogéneo nuclear Es un ARN también conocido como tránscrito primario, de alto peso molecular. Es el producto inicial de la síntesis de la ARN polimerasa en el proceso de transcripción. En el núcleo de las células eucariotas actúa como precursor de los demás tipos de ARN que se encuentran en el citoplas- ma. La fragmentación del ARNhn para formar otros tipos de ARN supone la maduración o el procesamiento del ARN (véase el capítulo 5). En las células procariotas, el tránscrito primario actúa directamente como molde para la síntesis de proteínas,sin necesidad de maduración o modifi cacio- nes postranscripcionales. ARN mensajero (ARNm) El ARNm sirve de molde para la síntesis de proteínas en el proceso de traducción, ya que contiene la información génica para la formación de uno o varios polipéptidos (véa- se el capítulo 6). El ARNm se localiza en el citoplasma, su longitud es variable según la proteína para la que codifi que y contiene, además, las señales necesarias para el inicio y la terminación de la traducción. En eucariotes el ARNm pre- senta características especiales: en su extremo 5’ muestra Figura Estructura primaria y secundaria del ARN. En cuanto a su estructura tres características diferen- cian al ARN del ADN: 1. El ARN suele ser monocatenario (una sola cadena). CH2 Extremo 5´ A) B) Extremo 3´ HHH O O C C C CC C G G G G G G U U U U U U A A A A A AA A O OO 5´ 4´ 2´3´ 1´ H P O H C A U G CH2 HHH O H O H O OO P CH2 HH H HOH O H O H O OO P CH2 HHH O H O OO P 5´ 4´ 2´3´ 1´ 5´ 4´ 2´3´ 1´ 5´ 4´ 2´3´ 1´ una capucha (cap) y en su extremo 3’, una cadena de polia- deninas (cola poliA) de longitud variable (fi gura 3-12). Estas modifi caciones tienen por objeto aumentar la vida media de esta molécula en el citoplasma y permitir su disponibili- dad en el proceso de traducción proteica. La presencia de la cola de poliA en el extremo 3´ facilita su purifi cación cuan- do se emplea cromatograf ía en columna de afi nidad, ya que forma híbridos con residuos de poliuridinas (poli U) unidos a una resina empaquetada en el interior de la columna. ARN ribosomal (ARNr) El ARNr forma parte de los ribosomas, estructuras intrace- lulares en que se realiza la síntesis de proteínas (fi gura 3-13). Sus estructuras secundaria y terciaria presentan un plega- miento complejo que le permite asociarse tanto a las proteí- nas de los ribosomas como a otros ARNr y participar en el proceso de síntesis proteica. ARN de transferencia (ARNt) Las moléculas de ARNt tienen entre 75 y 90 nucleótidos, y su peso molecular es de unos 2.5 kDa. Se conocen unos 32 ARNt distintos y se encuentran en todas las células. Éstos intervienen en la síntesis de proteínas, ya que van unidos a un aminoácido que liberarán en el ribosoma durante el pro- ceso de traducción. Suelen presentar bases nitrogenadas inusuales, como la inosina, la dihidrouridina, etc., e incluso la timina. Su estructura secundaria presenta un plegamien- to complejo donde se encuentran zonas con apareamiento de secuencias complementarias y otras sin apareamiento de secuencias complementarias, y en donde se pueden distin- guir regiones críticas, como la de unión al aminoácido y el Figura Secuencia de un ARN mensajero. 1 ttttgtagat aaatgtgagg attttctcta aatccctctt ctgtttgcta aatctcactg 61 tcactgctaa attcagagca gatagagcct gcgcaatgga ataaagtcct caaaattgaa 121 atgtgacatt gctctcaaca tctcccatct ctctggattt ctttttgctt cattattcct 181 gctaaccaat tcattttcag actttgtact tcagaagcaa tgggaaaaat cagcagtctt 241 ccaacccaat tatttaagtg ctgcttttgt gatttcttga aggtgaagat gcacaccatg 301 tcctcctcgc atctcttcta cctggcgctg tgcctgctca ccttcaccag ctctgccacg 361 gctggaccgg agacgctctg cggggctgag ctggtggatg ctcttcagtt cgtgtgtgga 421 gacaggggct tttatttcaa caagcccaca gggtatggct ccagcagtcg gagggcgcct 481 cagacaggca tcgtggatga gtgctgcttc cggagctgtg atctaaggag gctggagatg 541 tattgcgcac ccctcaagcc tgccaagtca gctcgctctctg tccgtgccca gcgccacacc 601 gacatgccca agacccagaa gtatcagccc ccatctacca acaagaacac gaagtctcag 661agaaggaaag gttggccaaa gacacatcca ggaggggaac agaaggaggg gacagaagca 721 agtctgcaga tcagaggaaa gaagaaagag cagaggaggg agattggaag tagaaatgct 781 gaatgcagag gcaaaaaagg aaaatgaagg acaggaggat taaacagaca gaggcaagga 841 tgatgagaga ggagcagaca gcaagaatga aaagcagaaa atacaataga ggaaatgaag 901 aaaagtaggc ctgctggagc tagatgatga tgtgatggaa atagaagta CH2 HHH O O O OO 5´ 4´ 2´3´ 1´ 5´ 4´ 2´3´ 1´ H P O OH C ACH2 HHH O H O OH O O OO P OO P O OO P 5´ 2 2 4´ 2´3´ 1´ CH2 CH2 HHH O H O OH N 7-metilguanosina Secuencia del ARNm del Factor de crecimiento tipo insulina de humano (IGF1) ARNm Poli A B) 6 5 41 2 3 7 8 9 N N N NH2 CAP 5 CGACCAUGAACGGAUACUGACAAGUUAUUGAGUGGAGGAUU AAAAAAAAAAAAAA-3´ 28s 5.8 S 5 S 18 S Ribosoma ARNr Figura Esquema de un ribosoma donde se observa el ARN ribosomal. brazo donde se ubica la secuencia del anticodón que reco- noce los codones del ARNm (fi gura 3-14). ARN pequeño nuclear (ARNsn) Es el ARN presente en el núcleo eucariote y está implicado en los procesos de maduración del ARNhn. En este proce- so, el ARNsn se asocia a proteínas, formando las ribonu- cleoproteínas pequeñas nucleares (RNPsn) que se encargan de eliminar intrones (fragmentos de ARNhn que no apare- cen en el ARNm) (véase el capítulo 5). Cuando las RNPsn se G U 5´ 3´ Brazo aceptor Brazo D Brazo anticodón ARNt Figura Estructura secundaria del ARN de transferencia. Brazo T C A A A A A A A A AAA A A A U U U U U U U U C C C C C C C C CCC C C C C I C G G G G GG G G G G GGG G G D D D unen al precursor del ARNm para eliminar los intrones se forma un complejo ARN-proteína de gran tamaño, visible en el microscopio electrónico, y que recibe el nombre de espliciosoma (spliceosome). Enzimas de ARN (ribozimas) Estos ácidos ribonucleicos funcionan como catalizadores biológicos. Poseen, al igual que las enzimas, un sitio activo, uno de unión para el sustrato y uno de unión para un cofactor que puede ser un ion metálico. Los ARNsn involucrados en maduración del ARNhn son un ejemplo clásico de ribozimas. siARN Moléculas de ARN de doble cadena de 20 a 25 nucleótidos que a través de la vía de interferencia de ARN de células suprimen la expresión de un gen específi co. El siARN se une a una secuencia complementaria del ARNm, la unión del siARN con el ARNm produce la degradación enzimática del ARNm en células eucariotas de mamíferos y plantas. Las descubrió el grupo de David Baulcombe en Inglaterra, en 1999, y originalmente los describieron como parte del meca- nismo de regulación génica postranscripcional en plantas. miARN Se trata de moléculas de ARN de cadena sencilla de 21-23 nucleótidos en longitud encargadas de regular la expresión génica. Los miARN se unen a una secuencia complementa- ria del ARNm y bloquean la traducción. El miARN no es totalmente complementario a la secuencia del ARNm; en este caso, el ARNm no se degrada pero tampoco puede uti- lizarse para la síntesis de proteínas. Originalmente los des- cribió el grupo de Victor Ambros en 1993 como small ARNs. El término micro-ARN fue introducido en 2001 por Ruvkun por la capacidad de los siARNs y miARNs para silenciar genes. 1. Escriba las caracter ísticas principales de la doble hélice de ADN. 5´ 3´ 3´ 5´ T = A T = A T = A C = G C = G C = G A = T A = T G = C G = C Ejercicios de integración Alberts B., Bray D., Hopkin K., Johnson A., Lewis J., Raff M., et al. DNA y cromosomas. En: Alberts B., editor. Introducción a la Biología Celular, 3ª ed. Madrid: Editorial Médica Panamericana, 2010:171-193. Chandar N., Viselli S. Organización del genoma eucariótico y expre- sión génica. En: Harvey R., editor. Biología molecular y celular, 1ª ed. Barcelona: Lippincott Williams and Wilkins, 2011:58-126. Harvey R., Ferrier D. Almacenamiento y expresión de la informa- ción genética. En: Harvey R., (ed). Bioquímica, 5ª ed. Barcelona: Lippincott Williams and Wilkins, 2011:395-465. Karp G. Biología celular y molecular: conceptos y experimentos, 6ª ed. México: McGraw-Hill, 2011:379-497. Kutter C., Svoboda P. miRNA, SiRNA, piRNA. RNA Biology, 2008;5:181-188. Lodish H., Berk A., Matsudaira P., Kaiser C., Krieger M., Scott M., et al. Mecanismos genéticos moleculares básicos. En: Lodish H (ed). Biología celular y molecular, 5ª ed. Buenos Aires: Editorial Médica Panamericana, 2006:101-123. Luque J., Herráez A. Texto ilustrado de Biología Molecular e Ingenie- ría Genética: conceptos, técnicasy aplicaciones en ciencias de la salud, 1ª ed. Madrid: Harcout, 2001:10-88. Bibliografía 2. Mencione el tipo de enlace que une la pentosa con el grupo fosfato y el tipo de enlace que une la pentosa con la base nitrogenada. NH2 CH2 N HHH O O OP O O 5 5 4 4 3 2 23 1 1 6 H H N O 3. De acuerdo con la estructura, identifi que las variantes de la doble molécula de ADN: A, B y Z. 4. Dibuje la hebra complementaria de ADN con los puentes de hidrógeno correspondientes para cada base. CH2 Extremo 5´ Extremo 3´ HHH O O O OO 5 4 23 1 H P O H C A T G CH2 HHH O 5 4 23 1 H O H O OO P CH2 HH H HOH O H O 5 4 23 1 H O OO P CH2 HHH O 5 4 23 1 H O OO P
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