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BIOENERGETICA Conceptos Básicos de termodinámica: Termodinámica La termodinámica es una rama de la física que se ocupa del estudio de las transformaciones de la energía, la temperatura y la entropía en sistemas físicos a nivel macroscópico. En términos más generales, la termodinámica trata de la relación entre el calor y el trabajo, y cómo estos conceptos se relacionan con otros aspectos del universo, como la energía, la entropía, la temperatura y la presión. En la termodinámica se estudian los procesos que ocurren en sistemas físicos, desde los cambios de temperatura y presión en un motor de combustión interna, hasta la transferencia de energía térmica en una reacción química o en un sistema biológico. Esta rama de la física se divide en dos áreas principales: la termodinámica clásica y la termodinámica estadística. Bioenergética La bioenergética es una rama de la biología que se enfoca en el estudio de la energía en los sistemas biológicos. Se ocupa de los procesos que transforman la energía en los seres vivos, incluyendo la captación, almacenamiento, transferencia y liberación de energía. La bioenergética se relaciona directamente con la respiración celular y la fotosíntesis. En la respiración celular, los organismos utilizan la energía almacenada en los alimentos para generar ATP (adenosín trifosfato), la molécula que suministra energía a las células. Por otro lado, en la fotosíntesis, las plantas y otros organismos fotosintéticos utilizan la energía solar para producir carbohidratos y oxígeno. La bioenergética también es importante en el contexto de la nutrición y el metabolismo. Los nutrientes que se consumen en la dieta son transformados en energía mediante procesos bioquímicos en el cuerpo. La bioenergética también tiene aplicaciones en campos como la medicina, la biotecnología y la ecología, donde se estudian los procesos energéticos en organismos y ecosistemas. Energía La energía es una propiedad fundamental del universo que se define como la capacidad de un sistema para realizar trabajo. La energía se puede manifestar en muchas formas, tales como energía cinética (energía en movimiento), energía potencial (energía almacenada en un sistema), energía térmica (energía relacionada con la temperatura), energía eléctrica, energía radiante (como la luz y las ondas electromagnéticas), energía química, entre otras. La energía no se crea ni se destruye, sino que se transforma de una forma a otra. Trabajo biológico El trabajo biológico se refiere a los procesos energéticos que ocurren en los sistemas biológicos, en los que la energía es utilizada para realizar una tarea específica. En los seres vivos, el trabajo biológico es esencial para el mantenimiento de la vida y el funcionamiento de los sistemas biológicos. Funciones de estado Las funciones de estado son propiedades termodinámicas que dependen únicamente del estado actual del sistema y no de la forma en que el sistema llegó a ese estado. Estas funciones son importantes en la termodinámica porque permiten describir y analizar los cambios de estado de los sistemas, independientemente de cómo se realizan. Las funciones de estado incluyen la energía interna, la entalpía, la entropía y la función de Gibbs. Cada una de estas funciones tiene una definición matemática precisa y se relaciona con diferentes aspectos de los sistemas termodinámicos. La energía interna se refiere a la energía total del sistema, incluyendo su energía cinética y potencial. La entalpía se relaciona con la cantidad de calor que fluye hacia o desde el sistema a presión constante. La entropía se relaciona con la cantidad de desorden o aleatoriedad en el sistema. Y la función de Gibbs, que es una combinación de la entalpía y la entropía, se utiliza para predecir la espontaneidad de los procesos químicos y físicos. Las funciones de estado son útiles para predecir y analizar los cambios de estado en los sistemas termodinámicos, y se utilizan en una amplia variedad de aplicaciones, desde la ingeniería hasta la química y la física. Sistemas: abierto, cerrado, aislado Sistema: Fracción de materia del universo en la cual se observarán los cambios energéticos que puedan ocurrir durante una transformación química o física. Este debe estar delimitado dependiendo lo que se quiera estudiar. Un sistema puede ser una reacción química, una célula, una mitocondria, un órgano, un ser vivo completo o un planeta. Sistemas aislados: Son aquellos sistemas que no intercambian ni energía ni materia con su entorno. Sistemas cerrados: Son sistemas que son capaces de intercambiar energía con su entorno más no materia. Sistemas abiertos: Son sistemas capaces de intercambiar energía y materia con su entorno. La célula es un sistema abierto ya que intercambia energía y materia con su entorno a través de la membrana plasmática. Los sistemas aislados son más que todo de interés teórico. Entorno Todo aquello que rodea al sistema. Universo Comprende tanto al sistema como al entorno. Clasificación de los seres vivos: De acuerdo a la fuente de carbono que utilizan: Organismo autótrofos y heterótrofos De acuerdo a la fuente de energía que utilizan: organismos fotótrofos y quimiótrofos la clasificación de los seres vivos puede realizarse en diferentes niveles y criterios, y uno de ellos es según su fuente de carbono y energía. De acuerdo con la fuente de carbono, se pueden clasificar en organismos autótrofos y heterótrofos. Los organismos autótrofos son aquellos que pueden sintetizar su propia materia orgánica a partir de sustancias inorgánicas como el dióxido de carbono (CO2) y el agua, utilizando la energía de la luz solar o de reacciones químicas (como en la quimiosíntesis). Por otro lado, los organismos heterótrofos obtienen su materia orgánica a partir de otros organismos, ya sea a través de la ingesta de alimentos o de la descomposición de materia orgánica. De acuerdo con la fuente de energía, se pueden clasificar en organismos fotótrofos y quimiótrofos. Los organismos fotótrofos utilizan la energía de la luz solar para sintetizar su materia orgánica y llevar a cabo sus procesos metabólicos. Los organismos quimiótrofos, por otro lado, utilizan la energía liberada por reacciones químicas, como la oxidación de compuestos orgánicos o inorgánicos, para llevar a cabo sus procesos metabólicos. Es importante destacar que algunos organismos pueden presentar características de ambos tipos de clasificación, por ejemplo, algunos organismos pueden ser autótrofos y quimiótrofos, como ciertas bacterias que realizan quimiosíntesis utilizando compuestos inorgánicos como fuente de energía. Esquema del flujo de energía de los seres vivos Leyes de la termodinámica: Primera Ley de la termodinámica: Enunciado. La primera ley de la termodinámica, también conocida como la ley de conservación de la energía, establece que la energía no se puede crear ni destruir, sino que solo se puede transformar de una forma a otra o transferirse de un sistema a otro. En otras palabras, la cantidad total de energía en un sistema aislado permanece constante, y la energía no puede ser creada ni destruida por procesos termodinámicos. El enunciado formal de la primera ley de la termodinámica es el siguiente: "La energía total de un sistema aislado es constante. La energía solo se puede transferir o transformar, pero no se puede crear ni destruir". Definición: Entalpía(H) y variación de la entalpía (ΔH) Significado de la positividad y negatividad de ΔH La entalpía (H) es una función termodinámica que describe la cantidad de energía que un sistema termodinámico contiene en forma de calor a presión constante. La entalpía se define como la suma de la energía interna del sistema y el producto de la presión y el volumen del sistema. La variación de la entalpía (ΔH) se refiere al cambio en la entalpía de un sistema entre dos estados termodinámicos. La variación de la entalpía se puede calcular restando la entalpía final del sistema a la entalpía inicial del sistema: ΔH = Hfinal - Hinicial. La positividad o negatividadde la variación de la entalpía (ΔH) indica si un proceso termodinámico es exotérmico (ΔH negativo) o endotérmico (ΔH positivo). Un proceso exotérmico es aquel en el que el sistema libera calor hacia el entorno, lo que se traduce en una disminución de la entalpía del sistema y una variación de la entalpía negativa (ΔH < 0). Por otro lado, un proceso endotérmico es aquel en el que el sistema absorbe calor del entorno, lo que se traduce en un aumento de la entalpía del sistema y una variación de la entalpía positiva (ΔH > 0). La variación de la entalpía es una cantidad importante en la termodinámica, ya que permite predecir y analizar los cambios de energía en los procesos termodinámicos y es una medida de la cantidad de calor liberada o absorbida por un sistema en un proceso. Segunda ley de la termodinámica: Definición de entropía y de variación de entropía (ΔS): Significado de la positividad y negatividad de ΔS Energía libre de Gibbs: Relación entre ΔH, ΔS y ΔG La segunda ley de la termodinámica establece que la entropía de un sistema aislado siempre tiende a aumentar con el tiempo, es decir, que los sistemas tienden a evolucionar hacia un estado de mayor desorden o aleatoriedad. También se puede expresar como que es imposible que un proceso termodinámico tenga un rendimiento del 100% en la conversión de energía en trabajo útil. La entropía (S) es una función termodinámica que se relaciona con el grado de desorden o aleatoriedad de un sistema. La entropía se define como la cantidad de energía que no se puede utilizar para realizar trabajo útil en un sistema a una determinada temperatura. La variación de entropía (ΔS) se refiere al cambio en la entropía de un sistema entre dos estados termodinámicos. La variación de la entropía se puede calcular restando la entropía final del sistema a la entropía inicial del sistema: ΔS = Sfinal - Sinicial. La positividad o negatividad de la variación de entropía (ΔS) indica si un proceso termodinámico es espontáneo (ΔS positivo) o no espontáneo (ΔS negativo). Un proceso espontáneo es aquel en el que la entropía del sistema aumenta, es decir, en el que el sistema evoluciona hacia un estado de mayor desorden. Un proceso no espontáneo es aquel en el que la entropía del sistema disminuye, es decir, en el que el sistema evoluciona hacia un estado de menor desorden. La energía libre de Gibbs (G) es una función termodinámica que combina la entalpía y la entropía de un sistema y se utiliza para predecir la espontaneidad de los procesos termodinámicos. Se define como G = H - TS, donde H es la entalpía, T es la temperatura absoluta y S es la entropía del sistema. La relación entre la variación de entalpía (ΔH), la variación de entropía (ΔS) y la energía libre de Gibbs (ΔG) se puede expresar mediante la ecuación ΔG = ΔH - TΔS. Si ΔG es negativo, el proceso es espontáneo y exergónico (libera energía). Si ΔG es positivo, el proceso no es espontáneo y endergónico (requiere energía para ocurrir). Si ΔG es igual a cero, el proceso está en equilibrio termodinámico. Cambio de Energía libre de Gibbs Estándar biológico(ΔGº´) y real.(ΔGr) Definición Significado de la positividad y negatividad de ΔGº´y ΔGreal El cambio de energía libre de Gibbs estándar biológico (ΔGº´) es la variación de energía libre de Gibbs que se produce en una reacción bioquímica cuando todas las sustancias involucradas se encuentran en sus estados estándar (1 M, 1 atm, 25°C). Es decir, es la variación de energía libre de Gibbs que se produce cuando la reacción se lleva a cabo bajo condiciones estándar. El cambio de energía libre de Gibbs real (ΔGr) es la variación de energía libre de Gibbs que se produce en una reacción bioquímica cuando las sustancias involucradas no se encuentran en sus estados estándar, sino en sus concentraciones y condiciones reales. Es decir, es la variación de energía libre de Gibbs que se produce cuando la reacción se lleva a cabo bajo condiciones reales. La positividad o negatividad de ΔGº´ y ΔGr indica si una reacción bioquímica es espontánea (ΔG negativo) o no espontánea (ΔG positivo). Si ΔG es negativo, la reacción es exergónica y espontánea, lo que significa que se produce una liberación neta de energía. Si ΔG es positivo, la reacción es endergónica y no espontánea, lo que significa que se requiere una entrada neta de energía para que la reacción se produzca. Si ΔG es igual a cero, la reacción está en equilibrio termodinámico y no hay un cambio neto en la energía libre de Gibbs. Es importante destacar que la energía libre de Gibbs no solo depende de las propiedades intrínsecas de las sustancias involucradas en la reacción, sino también de las condiciones ambientales, como la temperatura, la presión y la concentración de las sustancias. Por lo tanto, ΔGº´ y ΔGr pueden ser diferentes en función de las condiciones en las que se lleva a cabo la reacción bioquímica. Realización de procesos no espontáneos: Los procesos no espontáneos son aquellos que no ocurren de forma natural y requieren de una entrada neta de energía para que se produzcan. Ejemplos de procesos no espontáneos son la síntesis de moléculas complejas a partir de moléculas simples y la elevación de un objeto a una altura mayor a la que se encuentra en reposo. Para realizar procesos no espontáneos, es necesario proporcionar una fuente de energía externa al sistema para que se produzca la reacción deseada. Esta energía puede ser suministrada en forma de calor, luz, electricidad, entre otros. En los sistemas biológicos, el proceso de realización de procesos no espontáneos se lleva a cabo mediante la utilización de ATP (adenosín trifosfato), que es una molécula de alta energía utilizada como fuente de energía en las células. El ATP se hidroliza para liberar energía y producir ADP (adenosín difosfato) y fosfato inorgánico, lo que proporciona la energía necesaria para llevar a cabo procesos no espontáneos en la célula. Además del ATP, los organismos también pueden utilizar otras moléculas de alta energía, como el NADH (nicotinamida adenina dinucleótido reducido) y el FADH2 (flavina adenina dinucleótido reducido), para realizar procesos no espontáneos. Estas moléculas actúan como donadores de electrones y proporcionan la energía necesaria para llevar a cabo reacciones químicas que, de otra manera, no serían posibles sin una entrada neta de energía. Acoplamiento de reacciones: Definición Condiciones en que se puede realizar Eficiencia del acoplamiento El acoplamiento de reacciones es un proceso en el que se combinan dos o más reacciones para que la energía liberada por una reacción se utilice para impulsar una reacción que de otra manera no sería espontánea. Este proceso se lleva a cabo mediante la utilización de moléculas de alta energía, como el ATP, el NADH y el FADH2, que se utilizan para acoplar reacciones endergónicas a reacciones exergónicas. Para que se pueda llevar a cabo el acoplamiento de reacciones, las reacciones deben tener lugar en un mismo compartimento celular y las condiciones deben ser adecuadas para que se produzca una transferencia eficiente de energía. Además, las reacciones deben estar acopladas de manera que la energía liberada en una reacción sea suficiente para impulsar la otra reacción. La eficiencia del acoplamiento de reacciones depende de varios factores, como la energía liberada en la reacción exergónica, la energía requerida en la reacción endergónica, la concentración de las moléculas de alta energía y la eficiencia de los sistemas enzimáticos que catalizan las reacciones. Si el acoplamiento de reacciones es eficiente, la energía liberada en la reacción exergónica se utiliza de manera eficiente para impulsar la reacción endergónica, lo que permite que las células utilicen la energía de manera eficiente. En resumen, el acoplamiento de reacciones es un proceso fundamental en la bioquímica que permite que las células utilicen la energía de manera eficiente. Para que se produzca un acoplamiento eficiente, las reacciones deben tener lugar en un mismo compartimento celulary las condiciones deben ser adecuadas para que se produzca una transferencia eficiente de energía. La eficiencia del acoplamiento de reacciones depende de varios factores y puede ser mejorada mediante la regulación de las concentraciones de las moléculas de alta energía y la optimización de los sistemas enzimáticos que catalizan las reacciones. Mecanismos de síntesis del ATP : Fosforilación unida al sustrato Existen dos mecanismos principales para la síntesis de ATP en las células: la fosforilación unida al sustrato y la fosforilación oxidativa. La fosforilación unida al sustrato ocurre cuando una enzima transfiere un grupo fosfato de un sustrato de alta energía, como el fosfocreatina o la glucosa-6-fosfato, a una molécula de ADP para formar una molécula de ATP. Este proceso se produce durante la glucólisis, la vía de la pentosa fosfato y el ciclo de Krebs. Los compuestos fosforilados de alta energía, como el fosfocreatina y la glucosa-6-fosfato, tienen una alta cantidad de energía almacenada en sus enlaces fosfato. Esta energía se libera cuando los enlaces fosfato son hidrolizados, lo que produce una molécula de ATP y una molécula de ADP. El potencial de transferencia de grupo fosfato es una medida de la cantidad de energía almacenada en un enlace fosfato. Los enlaces fosfato de alta energía tienen un alto potencial de transferencia de grupo fosfato y pueden ser utilizados para sintetizar ATP. El ATP es un intermediario energético en el metabolismo celular. Es utilizado por las células para almacenar y transportar energía en forma de enlaces fosfato de alta energía. El ATP es utilizado como fuente de energía para procesos celulares como la síntesis de macromoléculas, el transporte de iones y la contracción muscular. Además, el ATP es utilizado como fuente de energía para impulsar reacciones endergónicas y acoplar reacciones exergónicas a reacciones endergónicas. Compuestos fosforilados de alta energía: Definición Potencial de transferencia de grupo Fosfato ATP como intermediario energético en el metabolismo Los compuestos fosforilados de alta energía son moléculas que contienen enlaces fosfato de alta energía, capaces de liberar una gran cantidad de energía cuando se hidrolizan. Estos compuestos son importantes en el metabolismo celular porque pueden actuar como donantes de energía para la síntesis de ATP, que es la principal molécula de almacenamiento de energía en las células. El potencial de transferencia de grupo fosfato es una medida de la cantidad de energía almacenada en un enlace fosfato. Los enlaces fosfato de alta energía tienen un alto potencial de transferencia de grupo fosfato y pueden ser utilizados para sintetizar ATP. El ATP es un intermediario energético en el metabolismo celular. Es utilizado por las células para almacenar y transportar energía en forma de enlaces fosfato de alta energía. El ATP es utilizado como fuente de energía para procesos celulares como la síntesis de macromoléculas, el transporte de iones y la contracción muscular. Además, el ATP es utilizado como fuente de energía para impulsar reacciones endergónicas y acoplar reacciones exergónicas a reacciones endergónicas. Entre los compuestos fosforilados de alta energía se encuentran el fosfato de creatina, la glucosa-6-fosfato, la fructosa-6-fosfato, el 1,3-bifosfoglicerato y el fosfoenolpiruvato. Estas moléculas se utilizan para acoplar reacciones endergónicas a reacciones exergónicas mediante la transferencia de un grupo fosfato de alta energía a una molécula de ADP para formar ATP.
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