Biologia de los microorganismos-1068 (407)

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G E N Ó M I C A M I C R O B I A N A 193
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del DNA. Sanger introdujo varios conceptos importantes, que 
todavía se emplean en protocolos más recientes de secuen-
ciación, como la secuenciación por síntesis en oposición a la 
secuenciación por escisión o corte, usando didesoxinucleótidos 
para bloquear la extensión de la cadena de DNA, y la utilización 
de precursores marcados para la detección.
En la secuenciación del DNA por síntesis, se emplean como 
cebadores oligonucleótidos de DNA de pequeño tamaño 
Secuenciación de DNA de primera generación: 
el método didesoxi de Sanger
El primer método de secuenciación de DNA utilizado amplia-
mente fue el método didesoxi, inventado por el científico britá-
nico Fred Sanger, que obtuvo un segundo Premio Nobel por el 
desarrollo de esta técnica. Este método todavía se utiliza para 
algunas aplicaciones de la secuenciación a pesar de haber sido 
superado por tecnologías más recientes en la secuenciación 
Tabla 6.1 Selección de genomas procariotasa
Organismo Estilo de vidab Tamaño (bp) ORFc Comentarios
Bacteria
Hodgkinia cicadicola E 143.795 169 Endosimbionte degenerado de cicadas
Carsonella ruddii E 159.662 182 Endosimbionte degenerado de áfidos 
Buchnera aphidicola E 422.434 362 Endosimbionte de áfidos
Mycoplasma genitalium P 580.070 470 El menor genoma bacteriano no simbiótico 
Borrelia burgdorferi P 910.725 853 Espiroqueta, cromosoma lineal, causa la enfermedad 
de Lyme
Rickettsia prowazekii P 1.111.523 834 Parásito intracelular obligado, causa el tifus epidémico
Treponema pallidum P 1.138.006 1041 Espiroqueta, causa la sífilis
Familia Methylophilaceae, cepa 
HTCC2181
VL 1.304.428 1354 Metilótrofo marino, menor genoma de organismo de 
vida libre
Aquifex aeolicus VL 1.551.335 1544 Hipertermófilo, autótrofo
Prochlorococcus marinus VL 1.657.990 1716 El fotótrofo oxigénico marino más abundante
Streptococcus pyogenes VL 1.852.442 1752 Causa faringitis infecciosa y escarlatina
Thermotoga maritima VL 1.860.725 1877 Hipertermófilo
Chlorobaculum tepidum VL 2.154.946 2288 Bacteria verde fotótrofa modelo
Deinococcus radiodurans VL 3.284.156 2185 Resistente a las radiaciones, múltiples cromosomas
Synechocystis sp. VL 3.573.470 3168 Cianobacteria modelo
Bdellovibrio bacteriovorus VL 3.782.950 3584 Deredador de otros procariotas
Caulobacter crescentus VL 4.016.942 3767 Ciclo de vida complejo
Bacillus subtilis VL 4.214.810 4100 Modelo genético de grampositivo
Mycobacterium tuberculosis P 4.411.529 3924 Causa tuberculosis
Escherichia coli K-12 VL 4.639.221 4288 Modelo genético de gramnegativo
Escherichia coli O157:H7 VL 5.594.477 5361 Cepa enteropatógena de E. coli
Bacillus anthracis VL 5.227.293 5738 Patógeno, agente de la guerra biológica
Pseudomonas aeruginosa VL 6.264.403 5570 Patógeno oportunista metabólicamente versátil
Streptomyces coelicolor VL 8.667.507 7825 Cromosoma lineal, produce antibióticos
Bradyrhizobium japonicum VL 9.105.828 8317 Fijación de nitrógeno, produce nódulos en la soja
Sorangium cellulosum VL 13.033.799 9367 Mixobacteria, forma cuerpos fructíferos multicelulares
Archaea
Nanoarchaeum equitans P 490.885 552 El menor genoma celular no simbiótico
Thermoplasma acidophilum VL 1.564.905 1509 Termófilo, acidófilo
Methanocaldococcus jannaschii VL 1.664.976 1738 Metanógeno, hipertermófilo
Pyrococcus horikoshii VL 1.738.505 2061 Hipertermófilo
Halobacterium salinarum VL 2.571.010 2630 Halófilo extremo, bacteriorrodopsina
Sulfolobus solfataricus VL 2.992.245 2977 Hipertermófilo, quimiolitótrofo del azufre
Haloarcula marismortui VL 4.274.642 4242 Halófilo extremo, bacteriorrodopsina
Methanosarcina acetivorans VL 5.751.000 4252 Metanógeno acetótrofo
aSe puede encontrar información sobre genomas procariotas en la base de datos http://cmr.jcvi.org, un sitio web mantenido por el Instituto J. Craig Venter (Rockville, 
Maryland), y en http://www.genomesonline.org.
bE, endosimbionte; P, parásito; VL, vida libre.
cMarcos abiertos de lectura. Se incluyen los genes que codifican proteínas conocidas, así como los ORF que pueden codificar proteínas de más de 100 aminoácidos. 
Los ORF más pequeños no están incluidos a menos que muestren semejanza con el gen de otro organismo o que la preferencia de codones sea la típica del 
organismo de estudio.
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