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204 G E N Ó M I C A , G E N É T I C A Y V I R O L O G Í A citoplasma eucariótico, desde donde se transportan hasta el orgánulo. Las proteínas codificadas en el núcleo necesarias para la traducción y la generación de energía en las mitocon- drias están mucho más relacionadas con sus correspondien- tes bacterianas que con las que cumplen estas funciones en el citoplasma eucariótico, de acuerdo con la historia evolutiva de la mitocondria. Variabilidad en el código genético La creencia original de que todas las células utilizan el mismo código genético llevó a considerar el código genético como uni- versal ( Tabla 4.5). Sin embargo, descubrimientos posteriores indicaron que algunas mitocondrias y unas pocas células usan códigos genéticos con algunas variaciones respecto al «uni- versal». Los códigos genéticos alternativos se descubrieron en el genoma de mitocondria animales. Estos códigos modifica- dos usan normalmente codones de parada como codones con sentido. Por ejemplo, las mitocondrias animales (pero no las de las plantas) usan el codón UGA para codificar el triptófano en lugar de usarlo como codón de parada. Las mitocondrias de la levadura también usan UGA para codificar el triptófano, pero además usa los cuatro codones CUN (siendo N cualquier nucleótido) para la treonina en lugar de usarlo para la leucina. Estos cambios pueden haber surgido por presión selectiva para genomas pequeños; por ejemplo, al vivir en ambientes donde muchos nutrientes necesarios ya estaban disponibles. Por tanto, los 22 tRNA producidos en las mitocondrias son insufi- cientes para leer el código genético universal, incluso teniendo en cuenta el apareamiento con balanceo ( Figura 4.32). Así pues, el apareamiento de bases entre el codón y el anticodón es todavía más flexible en las mitocondrias que en las células. Se sabe también que varios organismos usan un código gené- tico ligeramente diferente. Por ejemplo, en los géneros Myco- plasma (Bacteria) y Paramecium (Eukarya), algunos codones de parada codifican aminoácidos. Por consiguiente, estos orga- nismos tienen menos codones de parada. Ciertos hongos usan el codón para leucina CUG para codificar la serina. Sin embargo, curiosamente estos codones son algo ambiguos, ya que CUG se sorprendente variedad en cuanto a su tamaño. Los dos mayores tienen aproximadamente 7 y 11 Mbp; son mucho mayores que la mayoría de los genomas bacterianos. A diferencia de los genomas de los cloroplastos, que son todos moléculas individuales de DNA circular, entre los geno- mas mitocondriales existe bastante diversidad. Por ejemplo, algunos son lineales, como los de algunas especies de algas, pro- tozoos y hongos. En otros casos, como en la levadura S. cerevi- siae, los análisis genéticos indican que el genoma mitocondrial es circular, pero la forma f ísica consiste en moléculas grandes lineales que contienen copias múltiples del genoma. (Algunos virus como el bacteriófago T4 tiene un genoma genéticamente circular pero que f ísicamente es lineal; Sección 8.6.) Por último, las mitocondrias de muchos hongos y plantas con flo- res contienen pequeños plásmidos lineales o circulares, además del genoma mitocondrial principal. Las mitocondrias necesitan muchas más proteínas de las que codifican. Por ejemplo, para la traducción son necesa- rias muchas más proteínas de las que codifica el genoma del orgánulo. Las proteínas que se necesitan para muchas fun- ciones de los orgánulos están codificadas por genes nuclea- res. La mitocondria de la levadura contiene 800 proteínas diferentes (su proteoma, Sección 6.8). Sin embargo, solo 8 de ellas están codificadas por el genoma mitocondrial; el resto lo son por genes nucleares (Figura 6.13). Los genes de la mayoría de las proteínas de los orgánulos se encuentran en el núcleo, se transcriben allí y se traducen en los ribosomas 80S del Figura 6.12 Mapa del genoma mitocondrial humano. El genoma codifica los rRNA, 22 tRNA y varias proteínas. Las flechas indican la dirección de la transcripción para los genes de un color dado, y también se muestran, en el código de tres letras, las designaciones de aminoácidos para los genes tRNAs. Los 13 genes que codifican proteínas se muestran en verde. Cytb, citocromo b; ND1-6, componentes del complejo NADH-deshidrogenasa; COI-III, subunidades del complejo citocromo-oxidasa; ATPasa 6 y 8, polipéptidos del complejo ATPasa mitocondrial. Los dos promotores están en la región llamada bucle D, una región que también interviene en la replicación del DNA. Bucle D 12S 16S ND1 ND2 COΙ COΙΙ COΙΙΙ ND4L ND4 ND5 ND6 Cytb Pro Gln Ala Asn Cys TyrTrp Ile Met Leu Val Phe Thr Leu Ser His Ser Lys Asp Glu Arg ND3Gly ATPase 6 ATPase 8 Genoma mitocondrial humano 16.569 bp Figura 6.13 Proteomas mitocondriales. Número de proteínas localizadas en las mitocondrias de diferentes organismos eucariotas modelos. Estos valores son una buena aproximación ya que algunas proteínas están en muy baja cantidad. Los valores en las barras coloreadas son el número de proteínas codificadas en el genoma mitocondrial de cada organismo. 250 500 750 1.000 28 50 8 13 1.250 Protistas (Tetrahymena) hongos (Saccharomyces) Animales (ratón) Plantas (Arabidopsis) P ro te ín a s m it o c o n d ri a le s https://booksmedicos.org booksmedicos.org Botón1:
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