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140 L O S F U N D A M E N T O S D E L A M I C R O B I O L O G Í A como el primero y contiene un fragmento corto de RNA que se puede traducir, como el segundo. Cuando el tmRNA choca con un ribosoma estancado se une al mRNA defectuoso, de manera que puede proseguir la síntesis proteica, primero añadiendo alanina al tmRNA y después traduciendo el mensaje corto del tmRNA. El tmRNA contiene un codón de parada que permite que se una el factor de liberación y desensamble el ribosoma. La proteína resultante de la operación de rescate es defectuosa y a continuación es degradada. Esto se cumple porque se añade una secuencia corta de aminoácidos codificados por el tmRNA a la proteína defectuosa; esta secuencia es una señal para una pro- teasa específica, que degrada a proteína. Así, gracias a la activi- dad de los tmRNA, los ribosomas encallados no se inactivan, sino que son liberados para participar de nuevo en la síntesis proteica. MINIRREVISIÓN ¿Cuáles son los componentes de un ribosoma? ¿Qué papel funcional ejerce el rRNA en la síntesis de proteínas? ¿Cómo se libera del ribosoma un polipéptido completo? ¿Cómo libera ribosomas atrapados el tmRNA? 4.14 Plegamiento y secreción de las proteínas Para que una proteína funcione correctamente debe plegarse adecuadamente después de su síntesis, y situarse en su ubica- ción correcta en la célula. En el interior de la célula hay muchas proteínas, pero otras deben ser transportadas fuera de la mem- brana plasmática, al periplasma o a las superficies interna o externa de la membrana para facilitar procesos como el trans- porte de iones, de azúcar o de electrones. Otras proteínas, como las toxinas y las enzimas extracelulares (exoenzimas) deben secretarse por completo para ser activas en el ambiente. ¿Cómo determina una célula la conformación y ubicación finales de las proteínas? Estudiaremos este asunto a continuación. Niveles de estructura de las proteínas Una vez formado, un polipéptido no se queda como una molé- cula lineal, sino que se pliega para convertirse en una estruc- tura más estable. Los puentes de hidrógeno, entre los átomos de oxígeno y de nitrógeno de dos enlaces peptídicos, generan la estructura secundaria (Figura 4.39a). Un tipo habitual de estruc- tura secundaria es la hélice �. Para visualizar una hélice �, ima- gínese un polipéptido lineal enrollado alrededor de un cilindro (Figura 4.39b). De esta manera, los enlaces peptídicos se sitúan lo bastante cerca como para permitir los puentes de hidrógeno. El gran número de estos enlaces que se forman da a la hélice � su estabilidad inherente. En la estructura secundaria de la lámina �, el polipéptido se pliega una y otra vez sobre sí mismo en lugar de formar una hélice. No obstante, como en la hélice �, el plega- miento en una lámina � sitúa los enlaces peptídicos de manera que pueden realizar puentes de hidrógeno (Figura 4.39c). Los polipéptidos pueden contener regiones con estructura secun- daria de hélice � o de lámina �; el tipo de plegamiento y su ubi- cación en la molécula están determinados por la estructura primaria y por las oportunidades disponibles para la creación de puentes de hidrógeno. sitios A y P, el mRNA se mantiene en su posición porque se une al rRNA 16S y a las proteínas ribosómicas. El RNA ribosómico también tiene un papel importante en la asociación de las subu- nidades ribosómicas, así como en posicionar el tRNA en los sitios A y P en el ribosoma (Figura 4.36). Aunque los tRNA car- gados que entran en el ribosoma reconocen el codón correcto por el apareamiento de bases codón-anticodón, también están unidos al ribosoma por interacciones de la estructura brazo- bucle anticodón del tRNA con secuencias específicas del rRNA 16S. Además, el extremo aceptor del tRNA (Figura 4.36) se apa- rea con secuencias del rRNA 23S. Adicionalmente, la formación real de enlaces peptídicos está catalizada por rRNA. La actividad peptidil-transferasa tiene lugar en la subunidad 50S del ribosoma, y está catalizada por el propio rRNA 23S, y no por una proteína ribosómica. El rRNA 23S también actúa en la traslocación, y las proteínas EF interac- cionan específicamente con él. Así pues, además de su función como esqueleto estructural del ribosoma, el RNA ribosómico tiene un papel catalítico importante en el proceso de traducción. Liberación de ribosomas atrapados Un mRNA defectuoso que carezca de codón de parada causa un problema en la traducción. Este defecto puede provenir, por ejemplo, de una mutación que elimine el codón de parada, de la síntesis defectuosa del mRNA o de la degradación parcial del mRNA antes de su traducción. Si un ribosoma llega al extremo de una molécula de mRNA y no encuentra un codón de parada, el factor de liberación no puede unirse y el ribosoma no puede liberarse del mRNA, así que se encuentra «atrapado». Las células bacterianas contienen una pequeña molécula de RNA llamada tmRNA que ligera los ribosomas atrapados (Figura 4.38). Las letras «tm» del nombre se refiere a su parecido con el tRNA y con el mRNA; transporta el aminoácido alanina, Polipéptido en crecimiento Sitio P tRNA mRNA defectuoso mRNA que codifica 10 aminoácidos Codón de parada Sitio A tmRNA Ribosoma Alanina Figura 4.38 Liberación por un tmRNA de un ribosoma atascado. Un mRNA defectuoso que carece de codón de parada detiene el funcionamiento de un ribosoma que tiene un polipéptido parcialmente sintetizado unido a un tRNA (azul) en el sitio P. La unión del tmRNA (amarillo) al sitio A libera el polipéptido. Después, la traducción continúa hasta el codón de parada proporcionado por el tmRNA. https://booksmedicos.org booksmedicos.org Botón1:
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