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METABOLISMO Y ENZIMAS Los seres vivos son sistemas abiertos ¿Qué significa esto? QUE INTERCAMBIAN MATERIA Y ENERGIA CON EL MEDIO, DE FORMA CONTINUA ¿Qué es la energía? Es la capacidad de realizar un trabajo, o producir un cambio o un movimiento Algunos tipos de energía Cinética: es la energía que posee un cuerpo al estar en movimiento. Ejemplo: una pelota rodando, un hombre en patineta, un auto en movimiento, etc. Química: es la energía contenida en los enlaces químicos de las moléculas. Ejemplo 1: quemar madera: a medida que la madera se quema, la energía química almacenada en los enlaces de las moléculas de celulosa en la madera, liberan calor y luz. Ejemplo 2: la comida. Cuando ingerimos alimentos, estos tienen una energía química almacenada. Dentro de nuestro cuerpo se produce la reacción necesaria para poder liberar y aprovechar esa energía. Calórica: es la energía que se libera en forma de calor. Ejemplo: microondas, sistemas de calefacción, el calor que emite un radiador, estufas, etc. Lumínica: es la energía radiante que se manifiesta en forma de luz. Puede venir de fuentes naturales (sol) o artificiales (foco). Ejemplos: la fotosíntesis, calculadora solar, foco, etc. “La energía del universo se mantiene constante: puede transformarse de un tipo de energía en otro, pero no puede ser creada ni destruida” Ejemplos: La energía lumínica que se transforma en energía química durante la fotosíntesis La energía química (nafta) que se transforma en energía cinética cuando produce el movimiento de un auto “En toda conversión energética, la energía útil del estado final, es menor que la energía útil del estado inicial” Es decir, que no podemos transformar en trabajo útil toda la energía involucrada en un cambio, y todos los cambios que se producen en la naturaleza ocurren con disminución de energía útil, porque parte de esa energía pasa al ambiente como calor y es irrecuperable para poder realizar un trabajo. PRIMERA LEY DE LA TERMODINAMICA SEGUNDA LEY DE LA TERMODINAMICA Veámoslo mejor con un ejemplo: Cuando le cargamos nafta a una moto, esa nafta funciona como combustible (es decir, energía QUIMICA). Esta energía se transforma en CINETICA al darle movimiento a la moto. , pero parte de la energía de la nafta se libera como calor, que no es útil ya que no sirve para realizar el trabajo de mover el vehículo. ¿Qué es un proceso espontaneo? ¿Y un proceso no espontaneo? Proceso espontaneo: es aquel en que la energía inicial de un sistema es mayor que la energía final. En estos procesos, se libera energía. Por ejemplo: una pelota rodando desde la cima de una montaña, cayendo hasta la parte llana del suelo. Esta pelota va a tener más energía en la parte alta, que después de haber caído. La pelota, al rodar, tienen energía cinética. Proceso no espontaneo: es aquel en que la energía inicial es menor que la energía final. En estos procesos, necesito energía. Por ejemplo, si hago el proceso inverso al caso anterior: esta vez quiero mover la pelota desde la parte llana del suelo hasta la cima de la montaña, para eso voy a requerir energía. La segunda ley también nos dice que “LA ENTROPIA DEL UNIVERSO AUMENTA” ¿Qué es la entropía de un sistema? Es una medida del grado de DESORDEN de ese sistema Todos los procesos ocurren de forma tal que la entropía del sistema se incrementa. El universo evoluciona hacia un máximo grado de entropía. Todos los procesos espontáneos ocurren con un aumento de la entropía Vamos a decirlo de forma más sencilla: todos los procesos en donde hay orden, requieren energía útil. Pero a su vez, la energía tiende a degradarse (transformarse en no útil). Es decir que, el orden puede generarse y mantenerse cuando hay aporte de energía, pero al mismo tiempo, la tendencia de la energía es a degradarse, por lo tanto, la tendencia es a desorden o al aumento de la entropía, aunque temporariamente, haya orden. EJEMPLO: un aire acondicionado puede enfriar el aire en una habitación. Al enfriar el aire reduce la entropía del aire de ese sistema. El calor expulsado de la habitación (el sistema) siempre contribuye más a la entropía del ambiente que la disminución de la entropía del aire de ese sistema. Por lo tanto, el total de entropía de la sala más la entropía del entorno aumenta. METABOLISMO Es el conjunto de reacciones químicas que ocurre en las células ¿Qué es una reacción química? es la transformación de una o más sustancias, en otra u otras sustancias. Ejemplo: una molécula de glucosa que se transforma en varias moléculas de dióxido de carbono. Ahora veamos que ejemplos NO constituyen una reacción química, por ejemplo: el pasaje de agua a hielo, o el pasaje de agua en estado líquido a vapor. Ninguno de estos cambios constituyen reacciones químicas, ya que la sustancia “agua” no se transforma en otra sustancia, sigue siendo agua. En una reacción química, denominamos REACTIVO a la sustancia inicial, y PRODUCTO a la sustancia resultante o final. Las reacciones metabólicas que ocurren en las células pueden ser de dos tipos: Reacciones catabólicas: son de degradación y liberan energía (exergónicas). En estas reacciones, las moléculas iniciales tienen más energía que las finales, por lo tanto, son reacciones que liberan energía. Ejemplo: una proteína que se degrada en unidades más pequeñas: los aminoácidos. Reacciones anabólicas: son de síntesis y requieren energía (endergónicas). Ejemplo: formación de moléculas complejas, como una proteína, a partir de moléculas más sencillas, como los aminoácidos. IMPORTANTE: Las reacciones catabólicas y catabólicas están acopladas, es decir, son complementarias: las reacciones catabólicas liberan energía, y esa energía se utiliza para las reacciones anabólicas. Pero ojo, debemos saber que la energía no va “directamente” de una reacción catabólica a una reacción anabólica, sino que es transportada por una molécula que actúa de intermediario energético: el ATP. Hablemos más sobre el ATP ¿Qué significa “ATP”? ADENOSIN-TRI-FOSFATO. Es un nucleótido libre. ¿Qué es un NUCLEOTIDO? Es el compuesto químico orgánico fundamental de los ácidos nucleicos (como el ADN, ARN) constituido por una base nitrogenada, un azúcar y una molécula de ácido fosfórico. Veamos la estructura del ATP. Está formado por: Un azúcar (en este caso, es una RIBOSA) Una base nitrogenada (en este caso, es una ADENINA) tres grupos fosfatos unidos entre sí. El ATP es conocido como la “moneda energética” de las células, pues con ella se “compra” energía liberada por las reacciones catabólicas, y se la “vende” a las reacciones anabólicas. La energía se transporta en las uniones entre los fosfatos del ATP, que se denominan “UNIONES DE ALTA ENERGIA”. RELACION ENTRE ATP Y METABOLISMO: ejemplo Imaginemos que en un principio tenemos una sustancia con energía química como puede ser la glucosa, y además, tenemos una molécula de ADP (adenosin mono fosfato) y un fosfato (Pi). La glucosa, al degradarse libera energía; gracias a esa energía, el fosfato se une al ADP, y así tenemos una molécula de ATP. Imaginemos ahora, que en otra parte de la célula necesito energía para unir dos sustancias (A y B). Entonces, el ATP se hidroliza transformándose en ADP más un fosfato inorgánico (Pi). La energía liberada se utiliza para la reacción anabólica, en donde A y B reaccionan y originan el producto C. ENZIMAS Para que se inicie una reacción química (ya sea catabólica o anabólica) es necesario que primero los reactivos se encuentren, es decir, “choquen”. Esta energía inicial, necesaria para que se produzca una reacción, se llama energía de activación. Por lo tanto, la energía de activación es la energía necesaria para que se desencadene una reacción química.Una forma de aumentar la velocidad de una reacción es proporcionando calor a los reactivos. Esto funcionaria perfecto, pero debemos considerar que LOS SERES VIVOS TOLERAMOS UN LIMITE DE TEMPERATURA. Si “arreglaríamos” todo con calor, funcionarían las reacciones químicas, pero nosotros no toleraríamos eso. Es por eso que la idea de proporcionar calor para aumentar la velocidad de una reacción química es teórica, y NO APLICABLE a nosotros. En las células, las transformaciones químicas son muy rápidas, ocurren en tiempos mucho menores a un segundo. Es por eso que, para que se produzcan las reacciones químicas en las células se requiere la presencia de enzimas; las enzimas son proteínas que catalizan (aceleran) las reacciones bioquímicas. ¿Cómo actúan las enzimas? Disminuyen la energía de activación requerida para que se produzca la reacción. Es decir, que logran que la reacción se produzca con menor energía de activación. ¿Cómo lo hacen? Las enzimas tienen una región llamada sitio activo, que “reconoce” a los reactivos (sustratos) y se une a ellos, no en forma covalente sino por complementariedad; se forma así, un complejo enzima-sustrato. De ese modo, la enzima “acomoda” a las moléculas reaccionantes para que se acerquen lo suficiente y puedan reaccionar, generando el producto. Luego la enzima libera el producto y queda disponible para catalizar una nueva reacción. E + S ←→ [ES] ←→ E + P Entonces: ¿Qué es una enzima? Es un catalizador biológico, es decir, una sustancia que acelera la velocidad de las reacciones químicas disminuyendo la energía de activación de la reacción. MODELOS QUE INTENTAN EXPLICAR COMO ES LA UNION ENZIMA-SUSTRATO Modelo de “llave-cerradura” Es el modelo más antiguo. Sostiene que los sitios activos de las enzimas son como cerraduras rígidas mientras que los sustratos son como llaves que encajan perfectamente en ellas. Modelo de “encaje inducido” Sostiene que cuando un sustrato se combina con una enzima, pueden inducirse cambios en ella, ya que los sitios activos no serían rígidos como una cerradura, sino que más bien se amoldarían al sustrato. Al mismo tiempo, los cambios en la conformación de la enzima provocarían tensiones en los enlaces del sustrato favoreciendo su transformación en producto CARACTERISTICAS DE LAS ENZIMAS Son proteínas Son específicas: recordar que la región de la enzima que se une al sustrato se conoce como sitio activo. Este sitio es sumamente específico, y determina que la enzima pueda unirse a un cierto sustrato y no a otro. La enzima no se une al sustrato mediante una unión química ni en forma permanente. Las enzimas no se consumen durante la reacción. Si en una solución hay muchas moléculas de sustrato y enzimas, las enzimas se unirán a los sustratos, liberarán a los productos, se unirán a otros sustratos, liberarán otros productos, y así sucesivamente. No modifican la reacción ni los productos: como catalizadores, las enzimas sólo aceleran la velocidad en la que ocurren estas reacciones. Pero debemos saber que estas reacciones ocurrirían también sin las enzimas, solo que de forma mucho mas lenta. Con otras palabras, y para evitar confusiones: el producto de la reacción es el mismo con o sin la participación de la enzima; lo único que modifican es la VELOCIDAD con la que la reacción ocurre. Las enzimas no aportan energía. En el caso de las reacciones anabólicas, la energía es aportada por el ATP. Las enzimas sólo aceleran la velocidad de la reacción. En general, las enzimas llevan el nombre del sustrato que modifican o el de la actividad que ejercen, más el sufijo “ASA”. Así, existen nucleasas o endonucleasas (que degradan ácidos nucleicos), fosfatasas (que sustraen fosfatos), quinasas (agregan fosfatos), etc. Actividad enzimática La actividad a la que actúan las enzimas se puede conocer determinando qué cantidad de producto producen por unidad de tiempo. Para funcionar correctamente, dependen de un entorno adecuado. Existen diversos factores que influyen en la actividad de las enzimas. TEMPERATURA: aumenta el movimiento, en este caso, la velocidad de los reactivos. Por lo tanto, las velocidades de las reacciones aumentan cuando se eleva la temperatura (esto se debe a que la temperatura aumenta la velocidad de los sustratos, y por lo tanto, aumentan los choques con las enzimas) Pero esto ocurre dentro de ciertos límites, ya que por encima de los 50º o 60º C las enzimas se desnaturalizan y pierde su actividad .Por el contrario, cuando la temperatura es baja, la frecuencia de choques es mínima y presentan poca o ninguna actividad. PH: La mayoría de las enzimas actúan a un determinado pH en el cual su actividad es máxima; por encima o por debajo de ese pH, la actividad disminuye. INHIBIDORES: La actividad de la mayoría de las enzimas puede modificarse por inhibición, es decir, por reducción parcial o total de la capacidad catalítica. Esto es causado por agentes químicos llamados inhibidores, que se unen a la enzima en forma irreversible o reversible. INHIBIDORES IRREVERSIBLES: se unen covalentemente a la enzima y la inactivan permanentemente. Ejemplos: muchos venenos, insecticidas y antibióticos. La inhibición irreversible también puede deberse a la desnaturalización de la enzima. INHIBIDORES REVERSIBLES: se unen a las enzimas mediante interacciones no covalentes. Existen dos tipos de inhibición reversible: competitiva y no competitiva. o Inhibición competitiva: una molécula similar al sustrato de una enzima puede unirse al sitio activo de esta, “imitando” al sustrato; pero como no es el sustrato, la reacción no se producirá. Decimos que es “competitiva” ya que sustrato e inhibidor “compiten” por el sitio activo de la enzima. Este tipo de inhibición puede revertirse con concentraciones altas del sustrato. o Inhibición no competitiva: el inhibidor se fija a la enzima en un sitio que no es el activo. Esos inhibidores pueden modificar la conformación de la enzima de manera tal, que la enzima no pueda unirse al sustrato. También puede ocurrir que la enzima pueda igualmente unirse al sustrato, pero que no se forme el producto. Decimos que es “no competitiva” ya que el inhibidor no compite con el sitio activo. CONCENTRACION DEL SUSTRATO: a medida que aumenta la concentración de sustrato, aumentará la actividad de las enzimas. Explicaremos esto con la ayuda de un gráfico, el cual está dividido en tres partes: 1, 2 y 3. o Parte 1 del gráfico: supongamos que tenemos pocas moléculas de sustrato (4, por decir un número), y muchas enzimas (12, por decir otro número). ¿Qué es lo que ocurre? Algunas enzimas van a poder “trabajar”, (solo 4), mientras que las restantes no van a poder hacerlo, ya que no hay suficiente sustrato para todas, entonces las enzimas, en conjunto, trabajan a baja velocidad. o Parte 2 del gráfico: Imaginemos que ahora seguimos teniendo 12 enzimas disponibles, pero esta vez, tenemos disponibles 7 moléculas de sustrato. Esto implica que en vez de funcionar solo 4 enzimas, ahora van a funcionar 7. En fin, a medida que la concentración de sustrato aumenta, más enzimas podrán trabajar, por lo tanto, su velocidad aumenta. o Parte 3 del gráfico: Imaginemos que ahora tenemos 12 moléculas de sustrato, y las mismas 12 enzimas del ejemplo anterior. Se dice entonces que las enzimas están saturadas con su sustrato. Esto implica que todas las enzimas están catalizando, y por más que se disponga de mucho sustrato (es decir, que por más que agregue 5, 10 o 1000 moléculas de sustrato, solo tengo 12 enzimas, y solo esas 12 se unirán a 12 sustratos a la vez, no a más, no pueden). Estas enzimas no podrán trabajar más rápido de lo que lo hacen, por lo tanto, llegan a una velocidad máxima de la reacción. Nuevamente aclaramos: pormás que agregue más sustrato, la velocidad máxima NO SE MODIFICARA porque las enzimas ya están saturadas Todas las enzimas se saturan a altas concentraciones de sustrato, pero los distintos tipos de enzimas se saturan a distintas concentraciones de sustrato, ya que algunas tienen alta afinidad por su sustrato. ¿Cómo conozco el grado de afinidad que una enzima posee por su sustrato? Para eso, se utiliza un parámetro llamado Km. En el gráfico se observa que las enzimas estarán trabajando a su velocidad máxima (saturadas) a una determinada concentración de sustrato. En ese momento, todos los sitios activos de todas las enzimas están ocupados. o Si cuando las enzimas trabajan a la velocidad máxima el cien por ciento de los sitios activos están ocupados, podemos deducir que a la mitad de la velocidad máxima, estarán ocupados la mitad de los sitios activos. o Las enzimas trabajaran a la mitad de la velocidad máxima (con la mitad de los sitios activos ocupados) a una determinada concentración de sustrato. o Entonces… ¿Qué ES EL KM? Es la concentración de sustrato necesaria para que la enzima trabaje a la mitad de la velocidad máxima o El valor del K M de una enzima indica el grado de afinidad de ésta por su sustrato, es decir, cuánta cantidad de sustrato necesita una enzima para actuar a una velocidad media. Importante: la afinidad y el valor del Km son INVERSAMENTE PROPORCIONALES. Esto quiere decir que: A alta afinidad, bajo Km A baja afinidad, alto Km ¿Qué ES UNA VIA METABOLICA? Es una secuencia de reacciones químicas en las que el producto de la primera reacción es sustrato de la reacción siguiente, y así sucesivamente, hasta llegar a un producto final que ya no es transformado por otra enzima. Las enzimas que participan en una vía metabólica forman un SISTEMA MULTIENZIMATICO, y en general se encuentran físicamente juntas (compartimentalizadas). Este sistema multienzimático puede estar en una organela (compartimiento). Por ejemplo, las enzimas para la respiración se encuentran principalmente en la mitocondria; las enzimas hidrolíticas en los lisosomas; las ADN polimerasas en el núcleo, y así sucesivamente. REGULACION ENZIMATICA MODIFICACION COVALENTE REVERSIBLE: algunas enzimas se activan cuando esta se fosforila. ¿Qué significa “fosforilar? Básicamente, añadir un grupo fosfato (el grupo fosfato es añadido por otra enzima). Esto se debe a que cuando se une un grupo fosfato, la enzima cambia de conformación, y se activa. Cuando otra enzima le saca el grupo fosfato, se inactiva. Este mecanismo de regulación se llama modificación covalente, porque el fosfato se une mediante ese tipo de unión. MODIFICACION COVALENTE IRREVERSIBLE: CIMOGENOS: algunas enzimas se sintetizan en una forma inactiva llamada cimógeno; luego, otra enzima produce un corte (hidrólisis) en algún punto específico de la cadena del cimógeno, lo que hace que la proteína inactiva cambie de conformación y se active. EJEMPLO: el cimógeno tripsinógeno, que es una enzima digestiva inactiva fabricada en el páncreas; tras ser fabricada pasa el intestino delgado, donde una enzima produce un corte y convierte el tripsinógeno en tripsina, que es la enzima activa. MODULACION ALOSTERICA: Las enzimas alostéricas son un grupo de enzimas que poseen, además del sitio activo al que se une el sustrato, otro sitio al que se une, de modo reversible y no covalente, otra molécula llamada efector o modulador alostérico. En general, el sitio alostérico es tan específico para la unión del modulador como el sitio activo lo es para la unión del sustrato. Existen dos tipos de moduladores alostericos: o POSITIVOS: activan a la enzima (temporariamente) o NEGATIVOS: inhiben a la enzima (temporariamente) COENZIMAS Y COFACTORES: las enzimas se dividen en: o Simples: consisten sólo en una parte proteica o Conjugadas: además de la parte proteica, presentan una parte no proteica. Estos componentes no proteicos pueden ser: Iones metálicos, como Mg++, Mn++, Fe++, etc. En este caso, se denominan “COFACTORES”. Molécula orgánica, no proteica. En este caso, se denominan “COENZIMA” Debemos saber que, algunas enzimas necesitan tanto de cofactor como de coenzima para tener actividad catalítica. Ejemplos: NADP: actúa como coenzima en la fotosíntesis NAD y FAD: actúan como coenzimas en la respiración. VITAMINA C: actúa como coenzima en una de las reacciones durante la síntesis del colágeno Modelo de “llave-cerradura”
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