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REGULACION DE LA EXPRESION GENICA Los mecanismos de regulación génica determinan que genes se van a expresar (es decir, activar), y que genes no se van a expresar (es decir, no se activaran) • En un individuo pluricelular, todas las células tienen la misma información genética (ya que todas provienen de una única célula común), pero no todas utilizan la misma información. • Por ejemplo: tanto las células del páncreas como las neuronas tienen la información (genes) para fabricar insulina, pero solo las células del páncreas van a usar esa información. Las neuronas también la tienen, pero no la usan, ya que no fabrican insulina. • Entonces, decimos que las neuronas tienen genes para fabricar insulina, pero esos genes no se traducirán a proteínas • En determinadas células del páncreas, el gen para fabricar insulina se expresa • En las neuronas, el gen para fabricar insulina NO se expresa. Si prestamos atención, en el primer resumen (el de seres vivos), mencionamos que los seres vivos sufren diferenciación… ¿Qué significa esto? Que en un principio, todos fuimos una única célula, llamada cigoto. Esta célula comienza a dividirse, sus células hijas también, y así sucesivamente. A medida que ocurren esas divisiones, cada una de las nuevas células comienzan a fabricar diferentes proteínas, porque los genes se expresan de distinta forma en las diferentes células. Así, una célula se convierte en glóbulo rojo, otra en neurona, otra en miocito, otra en célula de la piel, etc. (es decir, llega un punto en el cual tenemos células totalmente distintas en estructura y función). El proceso por el cual las células se tornan diferentes (o bien se especializan en distintas funciones) se denomina “DIFERENCIACION CELULAR”. • El control de la expresión génica puede darse a distintos niveles REGULACION EN PROCARIOTAS En bacterias, los genes que codifican para la síntesis de enzimas que participan en una vía metabólica, se agrupan en el cromosoma en un complejo llamado OPERON. Todos los genes de este operon actúan de forma coordinada. Partes del operon o Genes estructurales: codifican para las enzimas de la vía metabólica. Se sitúan próximos entre sí, de forma tal que son transcriptos en una sola molécula de ARNm policistronico. Cuando este se traduce, se obtienen las diferentes enzimas de la vía metabólica o Promotor: es la secuencia de nucleótidos del ADN en donde se une la ARN polimerasa para iniciar la transcripción o Operador: secuencia de nucleótidos que se interpone entre el promotor y los genes estructurales, en donde se inserta una proteína reguladora llamada “proteína represora” La proteína represora es codificada por el gen regulador, localizado en una región distinta del cromosoma bacteriano, rio arriba del sitio operador. EJEMPLO: OPERON LACTOSA El operon lac es un conjunto de genes que intervienen en la utilización de la lactosa, por parte de la bacteria, como fuente de energía. Las bacterias utilizan la GLUCOSA como fuente de energía. También pueden usar lactosa, pero solo la usaran si no hay glucosa disponible. Entonces, si no hay glucosa y hay lactosa, recién allí se expresaran los genes para poder utilizar lactosa como fuente de energía; si hay glucosa, no se expresaran. ¿Qué ocurre si no hay lactosa? La proteína represora se une al operador, y así, la ARN polimerasa tendría bloqueado el paso. Los genes para usar lactosa no se transcriben. ¿Qué ocurre si hay lactosa? La lactosa se une a la proteína represora. Así, la proteína represora no se va a unir al operador. Por ende, la ARN polimerasa ya no tendrá el paso bloqueado, y los genes para usar lactosa se van a transcribir. ¿Qué ocurre si no hay glucosa? La ARN polimerasa sola no se une bien al promotor. Para unirse, necesita la “ayuda” de un complejo formado por una proteína “CAP” y un “AMP cíclico”. La formación de este complejo depende de la ausencia de glucosa. Cuando no hay glucosa, aumentan los niveles de AMP cíclico y el complejo se forma. Cuando hay glucosa, no se forma ese complejo, y la ARN polimerasa no podrá unirse bien al promotor. Entonces… ¿Qué condiciones necesito para que los genes que permiten usar lactosa se transcriban? ▪ NO DEBE HABER GLUCOSA: la ARN polimerasa tiene que poder unirse al promotor. Para que se cumpla esa condición, no debe haber glucosa ▪ DEBE HABER LACTOSA: si hay lactosa, el operador estará libre para que la ARN polimerasa pueda desplazarse por el ADN. La lactosa, por lo tanto, es un inductor del operón El operon lac es un ejemplo de operon inducible, es decir, que en presencia de una sustancia específica (en este caso, la lactosa), induce la transcripción de los genes estructurales. EJEMPLO 2: OPERON TRIPTOFANO Es un operon reprimible. o En ausencia de triptófano, la ARN polimerasa se une al promotor y transcribe los genes estructurales. o En presencia de triptófano en el medio circundante, este aminoácido (que funciona como molécula co-represora) se une a la proteína represora cnstituyendo el complejo represor/co- represor. Este complejo reconoce a la zona operadora a la que se fija, impidiendo que la ARN polimerasa pueda transcribir los genes estructurales. Entonces… En ausencia de triptófano: se sigue transcribiendo En presencia de triptófano: se detiene la síntesis (el mismo es su propio represor) Así, la bacteria ahorra energía, sintetizando triptófano solo cuando esta sustancia (esencial en su crecimiento) está ausente en el medio circundante. COMPARACION ENTRE OPERON LAC Y OPERON TRIPTOFANO REGULACION EN EUCARIOTAS Cada etapa en el flujo de información “ADN----ARN----PROTEINAS” puede ser regulada. Si bien los mecanismos más importantes de control son los que actúan a nivel transcripcional, debemos decir que existen también regulaciones en otros puntos. Regulación: puede ocurrir a distintos niveles, como: 1) NIVEL TRANSCRIPCIONAL: a) FACTORES DE TRANSCRIPCION Para la transcripción de un gen eucariota necesito: ▪ Promotor: secuencias de nucleótidos necesarias para la fijación de la ARN polimerasa ▪ Secuencias reguladoras: existen dos tipos: o Intensificadoras: estimulan la transcripción o Silenciadoras: inhiben la transcripción ▪ Factores basales de transcripción: complejo proteico que interacciona con el sitio promotor. Esenciales para la transcripción, pero no pueden aumentar o disminuir su ritmo. De esto se encargan los… ▪ Factores específicos de transcripción: complejo de proteínas reguladoras (que pueden ser activadoras o represoras) ▪ Proteínas activadoras: interaccionan con las secuencias intensificadoras del gen ▪ Proteínas represoras: interactúan con las secuencias silenciadoras del gen La unión de los factores al sitio promotor provoca un cambio conformacional que pliega al ADN entre las secuencias reguladoras y promotora. Este plegamiento permite contactar a los factores específicos, unidos a las regiones reguladoras, con una o más proteínas blanco asociadas al complejo de transcripción basal. Cuando esto pasa, se estimula la transcripción por parte de la ARN polimerasa. b) ESTRUCTURA DE LA CROMATINA En cada tipo celular solo se expresan determinados conjuntos de genes, mientras el resto del genoma se mantiene “silencioso”. El grado de compactación de la cromatina desempeña un papel importante en la expresión génica. Dos tipos de cromatina: ▪ Eucromatina: más laxa, desplegada, transcripcionalmente activa ▪ Heterocromatina: más condensada, transcripcionalmente inactiva La transcripción solo ocurre cuando el ADN está desplegado. ¿Qué queremos decir con esto? Que las regiones de cromatina condensada y dispersa varían según el tipo celular, reflejando la síntesis de proteínas diferentes por los distintos tipos celulares. Por ejemplo, el gen para síntesis de insulina estaría en estado heterocromatico en laneurona (por ende, no disponible para su expresión), y en estado eucromatico en la célula del páncreas (disponible para su expresión) C) GRADO DE METILACION La mayoría de los genes que no se expresan están metilados. En las células que si utilizan esos genes, disminuyen los niveles de metilación, y así esos genes se pueden expresar. ¿Qué es “metilación”? Agregar grupos metilos (CH3) a “algo”, en este caso, a un gen. Al metilarlo, afectamos la expresión de dicho gen. 2) NIVEL: PROCESAMIENTO DEL ARNm En este caso, las regulaciones se producen a nivel del Splicing, o “corte y empalme” El mecanismo por el cual, a partir de un mismo gen, pueden obtenerse dos proteínas relacionadas se llama “corte y empalme alternativo”. Consiste en unir diferentes combinaciones de exones, obteniéndose así dos ARNm maduros con distinta información, por ende, las proteínas que se codifiquen a partir de ellos, diferirán en uno o más trapos de su secuencia de aminoácidos. 3) NIVEL: TRADUCCION Existen muchos ejemplos de regulación de la expresión génica a nivel de la traducción. Explicaremos uno de ellos: modificación de la tasa de traducción del ARNm que codifica para la proteína transferrina (proteína encargada de captar Hierro del medio intracelular, ya que en estado libre, el hierro es toxico para la célula). La traducción del ARNm para la ferritina es regulada por una proteína represora. ▪ Cuando la concentración intracelular de hierro es baja, la proteína represora se une a una secuencia específica del ARNm, bloqueando la traducción. ▪ Cuando aumenta la concentración intracelular de hierro, este se asocia a la proteína represora. Así, esta cambia su conformación y pierde afinidad por la secuencia específica del ARNm a la cual se unía y bloqueaba. Así, el ARNm se libera, retomando la traducción, es decir, la síntesis de proteína ferritina. 4) NIVEL: LUEGO DE LA TRADUCCION La vida media de una proteína en el citosol depende de: • Su correcto plegamiento • Secuencia de aminoácidos de su extremo aminoterminal o Desde el momento en que la proteína sale del ribosoma, se unen a ella proteínas denominadas chaperonas, encargadas de su correcto plegamiento. o En cuanto al extremo aminoterminal, existen secuencias aminoacidicas estabilizadoras (que asegurarían una vida media prolongada), y otras desestabilizadoras, que hacen que las proteínas se marquen en ese extremo. Esa marca conduce a su posterior degradación. o Si la proteína adquiere un plegamiento anómalo, o se desnaturaliza, o su extremo aminoterminal es desestabilizante, pasa a un proceso de “ubiquitinizacion”, que consiste en la adición de varias moléculas de ubiquitina. En otras palabras, la ubiquitina funcionaria a modo de “etiqueta” (una etiqueta que indica que esa célula debe ser destruida) o La proteína ubiquitinizada será captada por un complejo enzimático, denominado “proteasoma”, constituido por muchas proteasas (enzimas que degradan proteínas), que delimitan una cámara central. o Al ser reconocida por la partícula regulatoria del proteasoma, la proteína marcada va a perder su plegamiento (gracias a ATPasas, con gasto de energía) o Ahora, la proteína desenrollada se translocara a la cámara central, donde será degradada por las proteasas
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