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G E N O M A S Y D I V E R S I D A D D E L O S V I R U S 283 U N ID A D 2 aquellos relacionados con el DNA. La bioquímica del DNA fue más bien consecuencia de infecciones víricas. El conjunto de enzimas del metabolismo del DNA que existen en las células actuales se explica suponiendo que antepasados de las Archaea y Eukarya fueron infectados por un virus semejante que a su vez era diferente del virus que infectó a un antepasado de las Bac- teria (Figura 9.3). La hipótesis del DNA vírico también explica cómo se originó en los inicios el DNA en la célula y cómo los genomas de RNA pudieron ser remplazados gradualmente por DNA. Si esta hipó- tesis es verdadera, contiene un elemento irónico. Intentando sacar ventaja a sus hospedadores, una de las estrategias de eva- sión de los virus fue la evolución del DNA. Pero en este caso, la química de esta molécula significó una mejora con respecto a la química del RNA, que las células optaron por seguir también esta estrategia para su beneficio propio. Filogenia de los virus La diversidad de los genomas víricos —la mayoría de los genes víricos obtenidos de la naturaleza tienen funciones desconoci- das— es tan grande que no ha sido posible construir un árbol filogenético universal de los virus como se ha hecho con las célu- las ( Figura 1.6). Solamente en algunos grupos de virus ha sido posible trazar una filogenia de manera fiable, y en estos casos, los árboles se han construido a partir de secuencias de algunos genes concretos o de proteínas compartidas entre los miembros del grupo. Uno de estos ejemplos es el Mimivirus, el virus más grande conocido, y los virus emparentados con él (Figura 9.4). Las cápsidas de los Mimivirus son de múltiples capas e ico- saédricas. El virión está cubierto de espículas y tiene casi 0,75 μm de diámetro, mayor que algunas células procarióticas (Figura 9.4a). Su genoma, de 1,2 Mbp, es de DNA bicatenario- bicatenario. Esto es más del doble que el siguiente virus más grande conocido, y es mayor que el genoma de algunos proca- riotas ( Tabla 6.1). El Mimivirus infecta el protozoo Acantha- moeba y pertenece a un grupo de virus gigantes con genomas grandes conocido como los virus nucleocitoplasmáticos de DNA de gran tamaño (NCLDV, del inglés nucleocytoplasmic el RNA fue el material genético de las primeras células, y que al final fue substituido por el DNA en esa función porque es una molécula más estable que el RNA. Curiosamente, una nueva hipótesis que apuesta por la transición del RNA al DNA pone a los virus en el centro de la historia (Figura 9.3). Este escenario plantea que los virus de RNA primero evolu- cionaron a DNA como mecanismo de modificación para pro- teger su genoma de las ribonucleasas de la célula, que podrían destruirlo. Debido a que el DNA no es RNA, y que las células en el mundo de RNA habrían contenido un genoma de RNA, los virus de DNA habrían tenido que desarrollar su propia maqui- naria de replicación para replicar su genoma. Se ha sugerido ade- más que los virus de DNA debieron de infectar a los ancestros de los tres dominios celulares. Gradualmente, por intercambio genético con el DNA de los genomas víricos, cada grupo de célu- las obtuvo la maquinaria necesaria para replicar el DNA y final- mente convertir su genoma de una química basada en RNA a una basada en DNA. Además, las células con genoma de RNA que no fueron infectadas por virus de DNA nunca desarrollaron un genoma de DNA, y la selección darwiniana habría conducido estas células menos aptas a la extinción (Figura 9.3b). Es posible que una enzima parecida a la transcriptasa inversa fuera clave en este proceso de conversión del RNA en DNA, justamente como ocurre en los retrovirus hoy en día (Sección 9.11). ¿Por qué es tan atractiva esta hipótesis? La teoría de los tres dominios muestra que Archaea y Eukarya están más cercanos filogenéticamente entre ellos que cada uno de ellos con Bacte- ria ( Figura 1.6). Aunque el análisis molecular de la maquina- ria necesaria para la transcripción y la traducción respalda esta hipótesis, el análisis de la maquinaria molecular para la replica- ción, la recombinación y la reparación del DNA, el esquema de los tres dominios no lleva a la misma conclusión. Algunos pro- cesos relacionados específicamente con el DNA son similares en Bacteria y Archaea, mientras que la gran mayoría son más similares entre Archaea y Eukarya. La hipótesis del DNA vírico explica esta discrepancia proponiendo que, aunque la trans- cripción y la traducción eran procesos ya establecidos antes de que los tres dominios comenzaran a distinguirse, no lo estaban NCLDV ancestralGrandes virus de DNA nucleocito- plasmáticos (NCLDV) (a) (b) Poxvirus de cordados Poxvirus de insectos Iridovirus de peces Iridovirus de anfibios Mimivirus PhycodnavirusDi d ie r R a o u lt Figura 9.4 Filogenia de los grandes virus de DNA nucleocitoplasmáticos (NCLDV). (a) Micrografía electrónica de transmisión de Mimivirus, un miembro del grupo de los NCLDV. Cada virión tiene un diámetro de unos 750 μm. (b) Filogenia de los grupos principales de NCLDV basada en la comparación de secuencias de varias proteínas del metabolismo del DNA. https://booksmedicos.org booksmedicos.org Botón1:
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