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I N G E N I E R Í A G E N É T I C A Y B I O T E C N O L O G Í A 353 U N ID A D 2 Cromosomas artificiales Los vectores que contienen entre 2 y 10 kbp de DNA clo- nado son adecuados para elaborar bibliotecas génicas para la secuenciación de genomas procarióticos. Los vectores del fago lambda, que pueden contener 20 kbp o más, también se utilizan mucho en proyectos de genómica. Sin embargo, cuanto mayor sea el tamaño del genoma que se desea secuenciar, mayor será el número de clones necesarios para obtener una secuencia com- pleta. Por tanto, para construir bibliotecas de DNA de organis- mos eucariotas o de eucariotas superiores, como los humanos, es útil contar con vectores que puedan contener segmentos muy largos de DNA. Esto permite que el tamaño de la biblioteca ini- cial sea manejable. Estos vectores se han desarrollado y se lla- man cromosomas artificiales. El plásmido F, que se encuentra naturalmente en E. coli, cuenta con 99,2 kbp de DNA ( Sección 10.8) y se conocen derivados llamados plásmidos F′, que pueden contener grandes cantidades de DNA cromosómico ( Sección 10.9). A causa de estas propiedades deseables, el plásmido F se ha utilizado para construir vectores de clonación llamados cromosomas artifi- ciales bacterianos (BAC, del inglés bacterial artificial chromo- somes). En la Figura 11.21 se muestra la estructura de un BAC de 6,7 kbp que contiene solo algunos genes de F necesarios para la replicación y mantener el número de copias muy bajo. El plás- mido también contiene el gen cat, que confiere al hospedador resistencia al cloranfenicol, y un MCS que incluye varios sitios de restricción para clonar el DNA. En un vector BAC como este se puede insertar y mantener estable DNA foráneo de más de 300 kbp. Los cromosomas artificiales de levadura (YAC, del inglés yeast artificial chromosomes) son vectores que se replican en levadura como si fueran cromosomas normales, pero tie- nen sitios donde se pueden insertar fragmentos muy largos de DNA. Para funcionar como cromosomas eucarióticos norma- les, los YACs tienen que tener: 1) un origen de replicación del DNA, 2) telómeros para replicar el DNA en los extremos del cromosoma, y 3) un centrómero para su segregación durante la mitosis. También deben tener un sitio de clonación y un gen plásmido. Después, se liga el DNA foráneo al vector. El plás- mido modificado, más el DNA clonado, se pueden empaquetar a continuación en viriones lambda in vitro como se ha descrito anteriormente, y las partículas fágicas se pueden utilizar para la transducción de E. coli. Una gran ventaja de los cósmidos es que pueden ser utiliza- dos para clonar fragmentos grandes de DNA, con insertos de hasta 50 kbp. Cuanto mayor sea el inserto, menos clones serán necesarios para cubrir un genoma completo. El uso de cósmidos también evita tener que transformar E. coli, que resulta espe- cialmente ineficaz con plásmidos grandes. Además, los cósmi- dos permiten el almacenamiento del DNA en viriones fágicos en lugar de en plásmidos. Puesto que los viriones son más esta- bles, el DNA recombinante se puede guardar durante largos períodos. Figura 11.20 El bacteriófago lambda como vector de clonación. (a) Inserción de DNA foráneo en el DNA de lambda modificado para que contenga un MCS dentro del gen lacZ y empaquetamiento posterior de un virión lambda infectivo recombinante. El tamaño máximo del DNA insertado es de unos 20 kbp. (b) Vista parcial de una placa de agar con X-gal en la que se muestran calvas blancas formadas por fagos lambda con DNA clonado y calvas azules formadas por el fago sin DNA clonado. J a c k P a rk e r Los fagos en las calvas claras tienen DNA clonado Los fagos en las calvas azules no tienen DNA clonado 1. Digestión con enzimas de restricción y ligación con DNA foráneo 2. Empaqueta- miento del DNA clonado en la cabeza del fago 3. Ensamblado del fago DNA foráneo lacZ MCS DNA híbrido Virión lambda infectivo (a) (b) cos cos Figura 11.21 Mapa genético de un cromosoma artificial bacteriano. El BAC que se muestra en la Figura tiene 6,7 kbp. La región de clonación tiene varios sitios de restricción únicos. Este BAC contiene solo una pequeña fracción del plásmido F de 99,2 kbp. cat oriS repE sopB sopA MCS Necesarios para la replicación Marcador seleccionable Mantienen un número de copias bajo BAC https://booksmedicos.org booksmedicos.org Botón1:
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